專利名稱：：鑒定大豆中的大豆蚜蟲抗性數(shù)量性狀基因座的方法及其組合物的制作方法
技術(shù)領(lǐng)域：
：本發(fā)明屬于植物育種領(lǐng)域。更具體地說，本發(fā)明包括使用與涉及大豆植物中的蚜蟲抗性的數(shù)量性狀基因座相關(guān)的標記篩選大豆屬植物的方法和組合物。本發(fā)明進一步包括用于篩選與蚜蟲抗性相關(guān)的大豆屬植物的方法和基因組區(qū)域組合物。
背景技術(shù)：
：大豆，Glycinemax(L.)Merril，是世界上的一種重要的經(jīng)濟作物，并且是植物油和蛋白質(zhì)的主要來源(Sinclair和Backman，CompendiumofSoybeanDiseases,3rdEd.APSPress,St.Paul,MN,p.106.(1989)。對低膽固醇和高纖維飲食的越來越多的需求也提高了大豆作為健康食物的重要性。在美國種植的大豆品種具有很窄的遺傳基礎(chǔ)。六個引入種，‘Mandarin’、‘Manchu，、‘Mandarin，(Ottawa)、“Richland，、‘AK，(Harrow)和‘Mukden，，貢獻了136個栽培種形式中代表的幾乎70%的種質(zhì)。迄今為止，現(xiàn)代栽培種可以回溯到這6個來自中國的大豆株。在Cox等人，CropSci.25=529-532(1988)進行的研究中，大豆種質(zhì)包含90%的適應(yīng)化的材料、9%的未適應(yīng)的材料，只有來自外來物種。外來物種可以加寬栽培的大豆的遺傳基礎(chǔ)。另外，外來物種可以具有關(guān)鍵的性狀，如抗病性、應(yīng)激抗性和昆蟲抗性。大豆蚜蟲，AphisglycinesMatsumura，在2001年被確定為大豆的新的昆蟲害蟲，并且到2003年在美國和加拿大的3個省擴大到超過21個狀態(tài)(Vermette等人ArmEntomolSocAm97:217-226(2004))。高產(chǎn)量對于農(nóng)民的利潤率是關(guān)鍵的。大豆蚜蟲可以引起超過50%的產(chǎn)量損失(Wang等人，PlantProtect20:12—13(1994))。除了產(chǎn)量降低之外，殺蟲劑使用的增多也可能降低農(nóng)民的利潤率。在2003年，美國中北部有超過700萬英畝大豆噴灑殺蟲劑以控制大豆蚜蟲；2003年僅在中北部地區(qū)，估計殺蟲劑處理費用即達8400-10500萬美兀(Landis等人NCR_125Arthropodbiologicalcontrol:statereportsfor2003；Li等人，MolBreedingl9:25_34(2007))。大豆蚜蟲可以通過除去明顯量的水和營養(yǎng)物，導(dǎo)致葉子變黃和萎蔫，而直接損害植物。另外，蚜蟲向葉子和植物上排出蜜露一一種富含糖的粘性物質(zhì)。蜜露通常導(dǎo)致煙霉的發(fā)展，煙霉影響光合作用，引起顯著的產(chǎn)量損失(Gomez等人，EnvironExpBot55:477-86(2006))。大豆蚜蟲攜帶大量的病毒，這些病毒可以阻礙植物生長、使葉子變形、引起葉子和莖的斑紋化、減少豆莢數(shù)和引起種子褪色。通過大豆蚜蟲傳播的病毒包括大豆花葉病毒、黃花葉病毒、煙草蝕紋病毒和煙草葉脈斑點病毒(Wang等人PlantDis90:920-926(2006))。宿主植物對昆蟲的抗性通常是數(shù)量遺傳的性狀，并且不是主要的抗性基因。堆積的數(shù)量抗性比主要的抗性基因更持久，但是難以鑒定多個數(shù)量抗性和將其引入一個大豆品種中。與昆蟲抗性相關(guān)的分子標記給育種者提供了更有效的用于數(shù)量性狀和昆蟲抗性的方法。大豆中的蚜蟲抗性基因和QTL是已知的。它們的實例，包括Ragl，在大豆品種Dowling中鑒定，并且定位于連鎖群M上(美國專利申請11/158,307)。另外，與蚜蟲抗性相關(guān)的數(shù)量性狀基因座在植物引入種(PI)567598B中鑒定，并且定位于連鎖群B2、Dlb、J和K(PCT/US2006/019200)。植物育種領(lǐng)域需要鑒定大豆中與蚜蟲抗性相關(guān)的另外的數(shù)量性狀基因座。另外，需要快速、經(jīng)濟的測定大豆中是否存在蚜蟲抗性基因座的方法。本發(fā)明提供一種使用單核苷酸多態(tài)性(SNP)技術(shù)篩查和選擇包含與蚜蟲抗性相關(guān)的數(shù)量性狀基因座的大豆植物的方法。
發(fā)明內(nèi)容本發(fā)明提供在大豆植物中產(chǎn)生蚜蟲抗性的方法。本發(fā)明涉及確定大豆植物(包括但不限于外來種質(zhì)、群體、品系、優(yōu)良品系、栽培種和品種)中是否存在提供蚜蟲抗性的數(shù)量性狀基因座的方法。本發(fā)明不限于任一種類型的蚜蟲抗性性狀，如蚜蟲的抗生作用、排拒作用或驅(qū)性。更具體地說，本發(fā)明涉及關(guān)于鑒定與蚜蟲抗性數(shù)量性狀基因座(QTL)相關(guān)的分子標記的方法。本發(fā)明涉及分子標記用來篩選和選擇大豆植物(包括但不限于外來種質(zhì)、群體、品系、優(yōu)良品系、栽培種和品種)內(nèi)的蚜蟲抗性的應(yīng)用。在一個優(yōu)選實施方案中，本發(fā)明進一步提供與對一種或多種節(jié)肢動物的抗性相關(guān)的數(shù)量性狀基因座，所述節(jié)肢動物包括但不限于鞘翅目(Coleoptera)，例如Cerotoma的種，如大豆葉甲(Cerotomatrifurcata),Diabrotica的種，如黃+一MOf甲(Diabroticaundecimpunctatahowardi),ii7ti^M(Epicauta)白勺種，如原野豆芫菁(Epicautapestifera)，弧麗金龜屬(Popilli)的種，如日本弧麗金龜(Popilliajaponica)，臥毛天牛屬(Dectes)的種，如大豆莖天牛(Dectestexanustexanus)和Colaspis的種，如葡萄肖葉甲(Colaspisbrunnea)，等等；直翅目(Orthoptera)，例如黑4皇屬(Melanoplus)的種，如紅足黑4皇(Melanoplusfemurrubrum),和沙漠蝗屬(Shistocerca)的種，如美洲沙漠蝗(ShistocercaAmericana)，等等；鱗翅目(Lepidoptera),例如Plathypen的禾中，如綠夜娥(Plathypenascabra),Pseudoplusia的禾中，如大豆夜娥(Pseudoplusiaincludens),Anticarsia的禾中，如黎豆夜娥(Anticarsiagemmatalis),Epargyreus的禾中，如銀星弄蝶(Epargyreusclarus)，頂燈蛾屬(Estigmene)的種，如鹽澤頂燈蛾(Estigmeneacrea)，灰翅夜蛾屬(Spodoptera)的種，如甜菜夜蛾(Spodopteraexigua)，實夜蛾屬(Heliothis)的種，如玉米夜蛾(Heliothiszea)禾口豆小卷娥屬(Matsumuraeses)的種，如豆小卷娥(Matsumuraesesphaseoli)；半翅目(Hemiptera),例如Acrosternum的禾中，如擬綠蟲春(Aerosternumhilare),美洲蟲春屬(Euschistus)的種，如褐美洲蝽(Euschistusservus)，綠蝽屬(Nezara)的種，如稻綠蝽(Nezaraviridula)；同翅目(Homoptera)，例如Spissistilus的種，如三角苜蓿跳蟲(Spissistilusfestinus)和蚜屬(Aphis)的種，如大豆蚜(Aphisglycines)；纓翅目(Thysanoptera)，例如Sericothrips白勺禾中，如大豆莉馬(Sericothripsvariabilis)。在一個優(yōu)選實施方案中，本發(fā)明進一步提供與線蟲抗性相關(guān)的基因座，所述線蟲包括但不限于異皮線蟲屬(Heterodera)的種，如大豆囊泡線蟲(Heteroderaglycines),刺線蟲屬(Belonolaimus)的禾中，如刺線蟲(Belonolaimuslongicaudatus),腎狀線蟲屬(Rotylenchulus)的種，如腎形線蟲(Rotylenchulusreniformis)，根結(jié)線蟲屬(Meloidogyne)的種，如南方根結(jié)線蟲(Meloidogyneincognita)、花生根結(jié)線蟲(Meloidogynearenaria)禾口日本根結(jié)線蟲(Meloidogynejavanica)。本發(fā)明涉及產(chǎn)生蚜蟲抗性植物、群體、品系、優(yōu)良品系和品種。更特別地，本發(fā)明包括將蚜蟲抗性等位基因滲入大豆植物中的方法，包括(A)使至少一個包含選自SEQIDNO81至SEQIDNO120的核酸序列的第一大豆植物與至少一個第二大豆植物雜交，以形成分離群體，(B)用一種或多種核酸標記篩查該分離群體，以確定一個或多個來自該分離群體的大豆植物是否含有該核酸序列，和(C)從該分離群體中選擇一個或多個包含選自SEQIDNO81至SEQIDNO120的核酸序列的大豆植物。本發(fā)明包括一種將等位基因滲入大豆植物中的方法，包括(A)使至少一個蚜蟲抗性大豆植物與至少一個蚜蟲敏感性大豆植物雜交，以形成分離群體，(B)用一種或多種核酸標記篩查該分離群體，以確定一個或多個來自所述分離群體的大豆植物是否含有蚜蟲抗性等位基因，其中所述蚜蟲抗性等位基因是選自以下的等位基因蚜蟲抗性等位基因1、蚜蟲抗性等位基因2、蚜蟲抗性等位基因3、蚜蟲抗性等位基因4、蚜蟲抗性等位基因5、蚜蟲抗性等位基因6、蚜蟲抗性等位基因7、蚜蟲抗性等位基因8、蚜蟲抗性等位基因9、蚜蟲抗性等位基因10、蚜蟲抗性等位基因11、蚜蟲抗性等位基因12、蚜蟲抗性等位基因13、蚜蟲抗性等位基因14、蚜蟲抗性等位基因15、蚜蟲抗性等位基因16、蚜蟲抗性等位基因17、蚜蟲抗性等位基因18、蚜蟲抗性等位基因19、蚜蟲抗性等位基因20、蚜蟲抗性等位基因21、蚜蟲抗性等位基因22、蚜蟲抗性等位基因23、蚜蟲抗性等位基因24、蚜蟲抗性等位基因25、蚜蟲抗性等位基因26、蚜蟲抗性等位基因27、蚜蟲抗性等位基因28、蚜蟲抗性等位基因29、蚜蟲抗性等位基因30、蚜蟲抗性等位基因31、蚜蟲抗性等位基因32、蚜蟲抗性等位基因33、蚜蟲抗性等位基因34、蚜蟲抗性等位基因35、蚜蟲抗性等位基因36、蚜蟲抗性等位基因37and蚜蟲抗性等位基因38、蚜蟲抗性等位基因39和蚜蟲抗性等位基因40。本發(fā)明包括一種優(yōu)良大豆植物，其包含選自SEQIDN0:81至SEQIDN0:120的核酸序列。核酸薛列的簡要說明SEQIDNO是用于擴增SEQIDNO81的正向PCR引物。SEQIDNO2是用于擴增SEQIDNO81的反向PCR引物。SEQIDNO3是用于擴增SEQIDNO82的正向PCR引物。SEQIDNO4是用于擴增SEQIDNO82的反向PCR引物。SEQIDNO5是用于擴增SEQIDNO83的正向PCR引物。SEQIDNO6是用于擴增SEQIDNO83的反向PCR引物。SEQIDNO7是用于擴增SEQIDNO34的正向PCR引物。SEQIDNO8是用于擴增SEQIDNO34的反向PCR引物。SEQIDNO9是用于擴增SEQIDNO35的正向PCR引物。SEQIDNO10是用于擴增SEQIDNO85的反向PCR引物。SEQIDNO11是用于擴增SEQIDNO86的正向PCR引物。SEQIDNO12是用于擴增SEQIDNO86的反向PCR引物。SEQIDNO13是用于擴增SEQIDNO87的正向PCR引物。SEQIDNO14是用于擴增SEQIDNO87的反向PCR引物。SEQIDNO15是用于擴增SEQIDNO88的正向PCR引物。SEQIDNO16是用于擴增SEQIDNO88的反向PCR引物。SEQIDNO17是用于擴增SEQIDNO89的正向PCR引物。SEQIDNO18是用于擴增SEQIDNO89的反向PCR引物。SEQIDNO19是用于擴增SEQIDNO90的正向PCR引物。SEQIDNO20是用于擴增SEQIDNO90的反向PCR引物。SEQIDNO21是用于擴增SEQIDNO91的正向PCR引物。SEQIDNO22是用于擴增SEQIDNO91的反向PCR引物。SEQIDNO23是用于擴增SEQIDNO92的正向PCR引物。SEQIDNO24是用于擴增SEQIDNO92的反向PCR引物。SEQIDNO25是用于擴增SEQIDNO93的正向PCR引物。SEQIDNO26是用于擴增SEQIDNO93的反向PCR引物。SEQIDNO27是用于擴增SEQIDNO94的正向PCR引物。SEQIDNO28是用于擴增SEQIDNO94的反向PCR引物。SEQIDNO29是用于擴增SEQIDNO95的正向PCR引物。SEQIDNO30是用于擴增SEQIDNO95的反向PCR引物。SEQIDNO31是用于擴增SEQIDNO96的正向PCR引物。SEQIDNO32是用于擴增SEQIDNO96的反向PCR引物。SEQIDNO33是用于擴增SEQIDNO97的正向PCR引物。SEQIDNO34是用于擴增SEQIDNO97的反向PCR引物。SEQIDNO35是用于擴增SEQIDNO98的正向PCR引物。SEQIDNO36是用于擴增SEQIDNO98的反向PCR引物。SEQIDNO37是用于擴增SEQIDNO99的正向PCR引物。SEQIDNO38是用于擴增SEQIDNO99的反向PCR引物。SEQIDNO39是用于擴增SEQIDNO100的正向PCR引物。SEQIDNO40是用于擴增SEQIDNO100的反向PCR引物。SEQIDNO41是用于擴增SEQIDNO101的正向PCR引物。SEQIDNO42是用于擴增SEQIDNO101的反向PCR引物。SEQIDNO43是用于擴增SEQIDNO102的正向PCR引物。SEQIDNO44是用于擴增SEQIDNO102的反向PCR引物。SEQIDNO45是用于擴增SEQIDNO103的正向PCR引物。SEQIDNO85是來源于大豆的對應(yīng)于蚜蟲抗性基因座2的基因組序列。0104]SEQIDNO86是來源于大豆的對應(yīng)于蚜蟲抗性基因座3的基因組序列。0105]SEQIDNO87是來源于大豆的對應(yīng)于蚜蟲抗性基因座4的基因組序列。0106]SEQIDNO88是來源于大豆的對應(yīng)于蚜蟲抗性基因座5的基因組序列。0107]SEQIDNO89是來源于大豆的對應(yīng)于蚜蟲抗性基因座6的基因組序列。0108]SEQIDNO90是來源于大豆的對應(yīng)于蚜蟲抗性基因座7的基因組序列。0109]SEQIDNO91是來源于大豆的對應(yīng)于蚜蟲抗性基因座8的基因組序列。0110]SEQIDNO92是來源于大豆的對應(yīng)于蚜蟲抗性基因座8的基因組序列。0111]SEQIDNO93是來源于大豆的對應(yīng)于蚜蟲抗性基因座9的基因組序列。0112]SEQIDNO94是來源于大豆的對應(yīng)于蚜蟲抗性基因座10的基因組序列。0113]SEQIDNO95是來源于大豆的對應(yīng)于蚜蟲抗性基因座11的基因組序列。0114]SEQIDNO96是來源于大豆的對應(yīng)于蚜蟲抗性基因座12的基因組序列。0115]SEQIDNO97是來源于大豆的對應(yīng)于蚜蟲抗性基因座13的基因組序列。0116]SEQIDNO98是來源于大豆的對應(yīng)于蚜蟲抗性基因座14的基因組序列。0117]SEQIDNO99是來源于大豆的對應(yīng)于蚜蟲抗性基因座15的基因組序列。0118]SEQIDNO100是來源于大豆的對應(yīng)于蚜蟲抗性基因座16的基因組序列。0119]SEQIDNO101是來源于大豆的對應(yīng)于蚜蟲抗性基因座16的基因組序列。0120]SEQIDNO102是來源于大豆的對應(yīng)于蚜蟲抗性基因座16的基因組序列。0121]SEQIDNO103是來源于大豆的對應(yīng)于蚜蟲抗性基因座17的基因組序列。0122]SEQIDNO104是來源于大豆的對應(yīng)于蚜蟲抗性基因座18的基因組序列。0123]SEQIDNO105是來源于大豆的對應(yīng)于蚜蟲抗性基因座19的基因組序列。0124]SEQIDNO106是來源于大豆的對應(yīng)于蚜蟲抗性基因座20的基因組序列。0125]SEQIDNO107是來源于大豆的對應(yīng)于蚜蟲抗性基因座21的基因組序列。0126]SEQIDNO108是來源于大豆的對應(yīng)于蚜蟲抗性基因座21的基因組序列。0127]SEQIDNO109是來源于大豆的對應(yīng)于蚜蟲抗性基因座22的基因組序列。0128]SEQIDNO110是來源于大豆的對應(yīng)于蚜蟲抗性基因座23的基因組序列。0129]SEQIDNO111是來源于大豆的對應(yīng)于蚜蟲抗性基因座23的基因組序列。0130]SEQIDNO112是來源于大豆的對應(yīng)于蚜蟲抗性基因座24的基因組序列。0131]SEQIDNO113是來源于大豆的對應(yīng)于蚜蟲抗性基因座25的基因組序列。0132]SEQIDNO114是來源于大豆的對應(yīng)于蚜蟲抗性基因座26的基因組序列。0133]SEQIDNO115是來源于大豆的對應(yīng)于蚜蟲抗性基因座26的基因組序列。0134]SEQIDNO116是來源于大豆的對應(yīng)于蚜蟲抗性基因座27的基因組序列。0135]SEQIDNO117是來源于大豆的對應(yīng)于蚜蟲抗性基因座28的基因組序列。0136]SEQIDNO118是來源于大豆的對應(yīng)于蚜蟲抗性基因座28的基因組序列。0137]SEQIDNO119是來源于大豆的對應(yīng)于蚜蟲抗性基因座28的基因組序列。0138]SEQIDNO120是來源于大豆的對應(yīng)于蚜蟲抗性基因座28的基因組序列。0139]SEQIDNO121是用于檢測SEQIDN0:81的SNP的探針。0140]SEQIDNO122是用于檢測SEQIDN0:81的SNP的探針。0141]SEQIDNO123是用于檢測SEQIDNO82的SNP的探針。SEQIDNO124是用于檢測SEQIDNO82的SNP的探針。SEQIDNO125是用于檢測SEQIDNO83的SNP的探針。SEQIDNO126是用于檢測SEQIDNO83的SNP的探針。SEQIDNO127是用于檢測SEQIDNO84的SNP的探針。SEQIDNO128是用于檢測SEQIDNO84的SNP的探針。SEQIDNO129是用于檢測SEQIDNO85的SNP的探針。SEQIDNO130是用于檢測SEQIDNO85的SNP的探針。SEQIDNO131是用于檢測SEQIDNO86的SNP的探針。SEQIDNO132是用于檢測SEQIDNO86的SNP的探針。SEQIDNO133是用于檢測SEQIDNO87的SNP的探針。SEQIDNO134是用于檢測SEQIDNO87的SNP的探針。SEQIDNO135是用于檢測SEQIDNO88的SNP的探針。SEQIDNO136是用于檢測SEQIDNO88的SNP的探針。SEQIDNO137是用于檢測SEQIDNO89的SNP的探針。SEQIDNO138是用于檢測SEQIDNO89的SNP的探針。SEQIDNO139是用于檢測SEQIDNO90的SNP的探針。SEQIDNO140是用于檢測SEQIDNO90的SNP的探針。SEQIDNO141是用于檢測SEQIDNO91的SNP的探針。SEQIDNO142是用于檢測SEQIDNO91的SNP的探針。SEQIDNO143是用于檢測SEQIDNO92的SNP的探針。SEQIDNO144是用于檢測SEQIDNO92的SNP的探針。SEQIDNO145是用于檢測SEQIDNO93的SNP的探針。SEQIDNO146是用于檢測SEQIDNO93的SNP的探針。SEQIDNO147是用于檢測SEQIDNO94的SNP的探針。SEQIDNO148是用于檢測SEQIDNO94的SNP的探針。SEQIDNO149是用于檢測SEQIDNO95的SNP的探針。SEQIDNO150是用于檢測SEQIDNO95的SNP的探針。SEQIDNO151是用于檢測SEQIDNO96的SNP的探針。SEQIDNO152是用于檢測SEQIDNO96的SNP的探針。SEQIDNO153是用于檢測SEQIDNO97的SNP的探針。SEQIDNO154是用于檢測SEQIDNO97的SNP的探針。SEQIDNO155是用于檢測SEQIDNO98的SNP的探針。SEQIDNO156是用于檢測SEQIDNO98的SNP的探針。SEQIDNO157是用于檢測SEQIDNO99的SNP的探針。SEQIDNO158是用于檢測SEQIDNO99的SNP的探針。SEQIDNO159是用于檢測SEQIDNO100的SNP的探針。SEQIDNO160是用于檢測SEQIDNO100的SNP的探針。SEQIDNO161是用于檢測SEQIDNO:101的SNP的探針。SEQIDNO162是用于檢測SEQIDNO:101的SNP的探針。SEQIDNO202是用于檢測SEQIDNO82的SNP的探針。SEQIDNO203是用于檢測SEQIDNO83的SNP的探針。SEQIDNO204是用于檢測SEQIDNO83的SNP的探針。SEQIDNO205是用于檢測SEQIDNO84的SNP的探針。SEQIDNO206是用于檢測SEQIDNO84的SNP的探針。SEQIDNO207是用于檢測SEQIDNO100的SNP的探針。SEQIDNO208是用于檢測SEQIDNO100的SNP的探針。SEQIDNO209是用于檢測SEQIDNO111的SNP的探針。SEQIDNO210是用于檢測SEQIDNO111的SNP的探針。SEQIDNO211是用于檢測SEQIDNO117的SNP的探針。SEQIDNO212是用于檢測SEQIDNO117的SNP的探針。SEQIDNO213是用于檢測SEQIDNO119的SNP的探針。SEQIDNO214是用于檢測SEQIDNO119的SNP的探針。SEQIDNO215是用于檢測SEQIDNO120的SNP的探針。SEQIDNO216是用于檢測SEQIDNO120的SNP的探針。SEQIDNO217是用于檢測SEQIDNO82的SNP的探針。SEQIDNO218是用于檢測SEQIDNO83的SNP的探針。SEQIDNO219是用于檢測SEQIDNO84的SNP的探針。SEQIDNO220是用于檢測SEQIDNO100的SNP的探針。SEQIDNO221是用于檢測SEQIDNO111的SNP的探針。SEQIDNO222是用于檢測SEQIDNO117的SNP的探針。SEQIDNO223是用于檢測SEQIDNO119的SNP的探針。SEQIDNO224是用于檢測SEQIDNO120的SNP的探針。發(fā)明詳述本發(fā)明提供28個位于大豆基因組中的連鎖群々1、81、82、(1、013、0113』、？、6、!1、1和0上的蚜蟲抗性基因座，它們以前沒有與蚜蟲抗性相關(guān)聯(lián)(表1)。本發(fā)明還提供能夠賦予大豆蚜蟲抗性的數(shù)量性狀基因座(QTL)等位基因。提供了位于蚜蟲抗性基因座1、蚜蟲抗性基因座2、蚜蟲抗性基因座3、蚜蟲抗性基因座4、蚜蟲抗性基因座5、蚜蟲抗性基因座6、蚜蟲抗性基因座7、蚜蟲抗性基因座8、蚜蟲抗性基因座9、蚜蟲抗性基因座10、蚜蟲抗性基因座11、蚜蟲抗性基因座12、蚜蟲抗性基因座13、蚜蟲抗性基因座14、蚜蟲抗性基因座15、蚜蟲抗性基因座16、蚜蟲抗性基因座17、蚜蟲抗性基因座18、蚜蟲抗性基因座19、蚜蟲抗性基因座20、蚜蟲抗性基因座21、蚜蟲抗性基因座22、蚜蟲抗性基因座23、蚜蟲抗性基因座24、蚜蟲抗性基因座25、蚜蟲抗性基因座26、蚜蟲抗性基因座27和蚜蟲抗性基因座28處的等位基因。在本發(fā)明中，蚜蟲抗性基因座1位于連鎖群J上。用來監(jiān)測蚜蟲抗性基因座1的滲入的SNP標記是SEQIDNO81至SEQIDNO:84。與蚜蟲抗性基因座1相關(guān)的SNP標記DNA序列(SEQIDNO81至SEQIDNO84)可以使用如SEQIDNO:1至SEQIDNO8所示的引物擴增，并且使用如SEQIDN0:121至SEQIDNO128,SEQIDN0:201至SEQIFNO:206和SEQIDNO217至SEQIDNO219所示的探針檢測。在本發(fā)明中，蚜蟲抗性基因座2位于連鎖群E上。用來監(jiān)測蚜蟲抗性基因座2的滲入的SNP標記是SEQIDNO:850與蚜蟲抗性基因座2相關(guān)的SNP標記DNA序列(SEQIDNO:85)可以使用如SEQIDNO:9至SEQIDNO10所示的引物擴增，并且使用如SEQIDNO129至SEQIDNO130所示的探針檢測。在本發(fā)明中，蚜蟲抗性基因座3位于連鎖群E上。用來監(jiān)測蚜蟲抗性基因座3的滲入的SNP標記是SEQIDNO:860與蚜蟲抗性基因座3相關(guān)的SNP標記DNA序列(SEQIDNO:86)可以使用如SEQIDN0:11至SEQIDNO12所示的引物擴增，并且使用如SEQIDNO131至SEQIDNO132所示的探針檢測。在本發(fā)明中，蚜蟲抗性基因座4位于連鎖群E上。用來監(jiān)測蚜蟲抗性基因座4的滲入的SNP標記是SEQIDNO:870與蚜蟲抗性基因座4相關(guān)的SNP標記DNA序列(SEQIDNO:87)可以使用如SEQIDN0:13至SEQIDNO14所示的引物擴增，并且使用如SEQIDNO133至SEQIDNO134所示的探針檢測。在本發(fā)明中，蚜蟲抗性基因座5位于連鎖群B1上。用來監(jiān)測蚜蟲抗性基因座5的滲入的SNP標記是SEQIDNO:880與蚜蟲抗性基因座5相關(guān)的SNP標記DNA序列(SEQIDNO:88)可以使用如SEQIDN0:15至SEQIDNO16所示的引物擴增，并且使用如SEQIDNO135至SEQIDNO136所示的探針檢測。在本發(fā)明中，蚜蟲抗性基因座6位于連鎖群N上。用來監(jiān)測蚜蟲抗性基因座6的滲入的SNP標記是SEQIDNO:890與蚜蟲抗性基因座6相關(guān)的SNP標記DNA序列(SEQIDNO:89)可以使用如SEQIDN0:17至SEQIDNO18所示的引物擴增，并且使用如SEQIDNO137至SEQIDNO138所示的探針檢測。在本發(fā)明中，蚜蟲抗性基因座7位于連鎖群G上。用來監(jiān)測蚜蟲抗性基因座7的滲入的SNP標記是SEQIDNO:90o與蚜蟲抗性基因座7相關(guān)的SNP標記DNA序列(SEQIDNO:90)可以使用如SEQIDN0:19至SEQIDNO:20所示的引物擴增，并且使用如SEQIDNO139至SEQIDNO140所示的探針檢測。在本發(fā)明中，蚜蟲抗性基因座8位于連鎖群N上。用來監(jiān)測蚜蟲抗性基因座8的滲入的SNP標記是SEQIDN0:91至SEQIDNO92。與蚜蟲抗性基因座8相關(guān)的SNP標記DNA序列(SEQIDNO:91至SEQIDN092)可以使用如SEQIDNO:21至SEQIDNO24所示的引物擴增，并且使用如SEQIDN0:141至SEQIDNO144所示的探針檢測。在本發(fā)明中，蚜蟲抗性基因座9位于連鎖群N上。用來監(jiān)測蚜蟲抗性基因座9的滲入的SNP標記是SEQIDNO:930與蚜蟲抗性基因座9相關(guān)的SNP標記DNA序列(SEQIDNO:93)可以使用如SEQIDNO25至SEQIDNO:26所示的引物擴增，并且使用如SEQIDNO145至SEQIDNO146所示的探針檢測。在本發(fā)明中，蚜蟲抗性基因座10位于連鎖群A1上。用來監(jiān)測蚜蟲抗性基因座10的滲入的SNP標記是SEQIDNO:94。與蚜蟲抗性基因座10相關(guān)的SNP標記DNA序列(SEQIDNO:94)可以使用如SEQIDN0:27至SEQIDNO28所示的引物擴增，并且使用如SEQIDNO147至SEQIDNO148所示的探針檢測。在本發(fā)明中，蚜蟲抗性基因座11位于連鎖群A1上。用來監(jiān)測蚜蟲抗性基因座11的滲入的SNP標記是SEQIDNO:95。與蚜蟲抗性基因座11相關(guān)的SNP標記DNA序列(SEQIDNO:95)可以使用如SEQIDN0:29至SEQIDNO30所示的引物擴增，并且使用如SEQIDNO149至SEQIDNO150所示的探針檢測。在本發(fā)明中，蚜蟲抗性基因座12位于連鎖群Dla上。用來監(jiān)測蚜蟲抗性基因座12的滲入的SNP標記是SEQIDNO:96。與蚜蟲抗性基因座12相關(guān)的SNP標記DNA序列(SEQIDNO:96)可以使用如SEQIDN0:31至SEQIDNO:32所示的引物擴增，并且使用如SEQIDNO151至SEQIDNO152所示的探針檢測。在本發(fā)明中，蚜蟲抗性基因座13位于連鎖群C2上。用來監(jiān)測蚜蟲抗性基因座13的滲入的SNP標記是SEQIDNO:97。與蚜蟲抗性基因座13相關(guān)的SNP標記DNA序列(SEQIDNO:97)可以使用如SEQIDN0:33至SEQIDNO34所示的引物擴增，并且使用如SEQIDNO153至SEQIDNO154所示的探針檢測。在本發(fā)明中，蚜蟲抗性基因座14位于連鎖群H上。用來監(jiān)測蚜蟲抗性基因座14的滲入的SNP標記是SEQIDNO:98。與蚜蟲抗性基因座14相關(guān)的SNP標記DNA序列(SEQIDNO:98)可以使用如SEQIDN0:35至SEQIDNO36所示的引物擴增，并且使用如SEQIDNO155至SEQIDNO156所示的探針檢測。在本發(fā)明中，蚜蟲抗性基因座15位于連鎖群H上。用來監(jiān)測蚜蟲抗性基因座15的滲入的SNP標記是SEQIDNO:99。與蚜蟲抗性基因座15相關(guān)的SNP標記DNA序列(SEQIDNO:99)可以使用如SEQIDN0:37至SEQIDNO38所示的引物擴增，并且使用如SEQIDNO157至SEQIDNO158所示的探針檢測。在本發(fā)明中，蚜蟲抗性基因座16位于連鎖群D2上。用來監(jiān)測蚜蟲抗性基因座16的滲入的SNP標記是SEQIDNO100至SEQIDNO:102。與蚜蟲抗性基因座16相關(guān)的SNP標記DNA序列(SEQIDN0:100至SEQIDNO102)可以使用如SEQIDNO39至SEQIDNO:44所示的引物擴增，并且使用如SEQIDN0:159至SEQIDNO162、SEQIDNO207至SEQIDNO208和SEQIDNO220所示的探針檢測。在本發(fā)明中，蚜蟲抗性基因座17位于連鎖群F上。用來監(jiān)測蚜蟲抗性基因座17的滲入的SNP標記是SEQIDN0:103。與蚜蟲抗性基因座17相關(guān)的SNP標記DNA序列(SEQIDNO103)可以使用如SEQIDNO45至SEQIDNO:46所示的引物擴增，并且使用如SEQIDNO165至SEQIDNO166所示的探針檢測。在本發(fā)明中，蚜蟲抗性基因座18位于連鎖群F上。用來監(jiān)測蚜蟲抗性基因座18的滲入的SNP標記是SEQIDN0:104。與蚜蟲抗性基因座18相關(guān)的SNP標記DNA序列(SEQIDNO104)可以使用如SEQIDNO47至SEQIDNO:48所示的引物擴增，并且使用如SEQIDNO167至SEQIDNO168所示的探針檢測。在本發(fā)明中，蚜蟲抗性基因座19位于連鎖群I上。用來監(jiān)測蚜蟲抗性基因座19的滲入的SNP標記是SEQIDN0:105。與蚜蟲抗性基因座19相關(guān)的SNP標記DNA序列(SEQIDNO105)可以使用如SEQIDNO49至SEQIDNO50所示的引物擴增，并且使用如SEQIDNO169至SEQIDNO170所示的探針檢測。在本發(fā)明中，蚜蟲抗性基因座20位于連鎖群Dlb上。用來監(jiān)測蚜蟲抗性基因座20的滲入的SNP標記是SEQIDNO:106。與蚜蟲抗性基因座20相關(guān)的SNP標記DNA序列(SEQIDNO106)可以使用如SEQIDN0:51至SEQIDNO:52所示的引物擴增，并且使用如SEQIDN0:171至SEQIDNO:172所示的探針檢測。在本發(fā)明中，蚜蟲抗性基因座21位于連鎖群Dlb上。用來監(jiān)測蚜蟲抗性基因座21的滲入的SNP標記是SEQIDN0:107至SEQIDNO.108。與蚜蟲抗性基因座21相關(guān)的SNP標記DNA序列(SEQIDNO107至SEQIDNO.108)可以使用如SEQIDNO53至SEQIDNO:56所示的引物擴增，并且使用如SEQIDN0:173至SEQIDNO176所示的探針檢測。在本發(fā)明中，蚜蟲抗性基因座22位于連鎖群0上。用來監(jiān)測蚜蟲抗性基因座22的滲入的SNP標記是SEQIDN0:109。與蚜蟲抗性基因座22相關(guān)的SNP標記DNA序列(SEQIDNO109)可以使用如SEQIDN0:57至SEQIDNO58所示的引物擴增，并且使用如SEQIDNO177至SEQIDNO178所示的探針檢測。在本發(fā)明中，蚜蟲抗性基因座23位于連鎖群0上。用來監(jiān)測蚜蟲抗性基因座23的滲入的SNP標記是SEQIDN0:110至SEQIDNO:111。與蚜蟲抗性基因座23相關(guān)的SNP標記DNA序列(SEQIDNO110至SEQIDNO111)可以使用如SEQIDNO59至SEQIDNO:62所示的引物擴增，并且使用如SEQIDN0:179至SEQIDNO:182、SEQIDNO:209至SEQIDNO210和SEQIDNO221所示的探針檢測。在本發(fā)明中，蚜蟲抗性基因座24位于連鎖群C1上。用來監(jiān)測蚜蟲抗性基因座24的滲入的SNP標記是SEQIDN0:112。與蚜蟲抗性基因座24相關(guān)的SNP標記DNA序列(SEQIDNO112)可以使用如SEQIDNO63至SEQIDNO:64所示的引物擴增，并且使用如SEQIDN0:183至SEQIDNO184所示的探針檢測。在本發(fā)明中，蚜蟲抗性基因座25位于連鎖群C1上。用來監(jiān)測蚜蟲抗性基因座25的滲入的SNP標記是SEQIDN0:113。與蚜蟲抗性基因座25相關(guān)的SNP標記DNA序列(SEQIDNO113)可以使用如SEQIDNO65至SEQIDNO:66所示的引物擴增，并且使用如SEQIDNO185至SEQIDNO186所示的探針檢測。在本發(fā)明中，蚜蟲抗性基因座26位于連鎖群C1上。用來監(jiān)測蚜蟲抗性基因座26的滲入的SNP標記是SEQIDN0:114至SEQIDNO:115。與蚜蟲抗性基因座26相關(guān)的SNP標記DNA序列(SEQIDN0:114至SEQIDNO115)可以使用如SEQIDNO67至SEQIDNO70所示的引物擴增，并且使用如SEQIDNO187至SEQIDNO190所示的探針檢測。在本發(fā)明中，蚜蟲抗性基因座27位于連鎖群K上。用來監(jiān)測蚜蟲抗性基因座27的滲入的SNP標記是SEQIDN0:116。與蚜蟲抗性基因座27相關(guān)的SNP標記DNA序列(SEQIDNO116)可以使用如SEQIDN0:71至SEQIDNO:72所示的引物擴增，并且使用如SEQIDNO191MSEQIDNO192所示的探針檢測。在本發(fā)明中，蚜蟲抗性基因座28位于連鎖群B2上。用來監(jiān)測蚜蟲抗性基因座28的滲入的SNP標記是SEQIDN0:117至SEQIDNO120。與蚜蟲抗性基因座28相關(guān)的SNP標記DNA序列(SEQIDN0:117至SEQIDNO120)可以使用如SEQIDNO73至SEQIDNO:80所示的引物擴增，并且使用如SEQIDNO:193至SEQIDNO:200、SEQIDNO-.211-216和SEQIDNO:222-223所示的探針檢測。本發(fā)明還提供了一種包含選自SEQIDN0:81至SEQIDNO120及其互補序列的核酸序列的大豆植物。在一方面，所述大豆植物包含1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27或28個選自SEQIDN0:81至SEQIDN0:120、其片段和其互補序列的核酸序列。本發(fā)明還提供了一種包含1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27或28蚜蟲抗性基因座的大豆植物，其中在其一個或多個基因座處的一個或多個等位基因選自蚜蟲抗性等位基因1、蚜蟲抗性等位基因2、蚜蟲抗性等位基因3、蚜蟲抗性等位基因4、蚜蟲抗性等位基因5、蚜蟲抗性等位基因6、蚜蟲抗性等位基因7、蚜蟲抗性等位基因8、蚜蟲抗性等位基因9、蚜蟲抗性等位基因10、蚜蟲抗性等位基因11、蚜蟲抗性等位基因12、蚜蟲抗性等位基因13、蚜蟲抗性等位基因14、蚜蟲抗性等位基因15、蚜蟲抗性等位基因16、蚜蟲抗性等位基因17、蚜蟲抗性等位基因18、蚜蟲抗性等位基因19、蚜蟲抗性等位基因20、蚜蟲抗性等位基因21、蚜蟲抗性等位基因22、蚜蟲抗性等位基因23、蚜蟲抗性等位基因24、蚜蟲抗性等位基因25、蚜蟲抗性等位基因26、蚜蟲抗性等位基因27、蚜蟲抗性等位基因28、蚜蟲抗性等位基因29、蚜蟲抗性等位基因30、蚜蟲抗性等位基因31、蚜蟲抗性等位基因32、蚜蟲抗性等位基因33、蚜蟲抗性等位基因34、蚜蟲抗性等位基因35、蚜蟲抗性等位基因36、蚜蟲抗性等位基因37、蚜蟲抗性等位基因38、蚜蟲抗性等位基因39和蚜蟲抗性等位基因40。這些等位基因可以是純合的或雜合的。本文使用的蚜蟲是指同翅目(Homoptera)、進一步是指蚜科的各種吸吮植物的小的軟體昆蟲中的任何一種，其中蚜科的例子包括但不限于以下屬Acyrth0Siph0n、奇圓尾蟲^M(Allocotaphis)>Amphorophora>^SiiifM(Anoecia)>(Anuraphis)屬(Aphidoounguis)、Aphidoura、蟲牙屬(Aphis)、Asiphonaphis、舞蟲牙屬(Astegopteryx)>fi客頁蟲^M(Aulacorthum)>(Betacallis)>M(Betulaphis)>Boernerina>短尾蟲牙屬(Brachycaudus)、小管蟲牙屬(Brachycorynella)、短棒蟲牙屬(Brevicoryne)、長角斑蚜屬(Calaphis)、帶斑蚜屬(Callipterinella)、Callipterus,二尾蚜屬(Cavariella)、堅蟲牙屬(Cerataphis)、㈣角蟲牙屬(Ceratovacuna)、Chaetomyzus>中瘤釘毛蚜屬(Chaetosiphon)、毛蚜屬(Chaitophorus)、毛角蚜屬(Chaitoregma)、黑斑蚜屬(Chromaphis)、長足大蚜屬(Cinara)、刻斑蚜屬(Clethrobius)、Clydesmithia、卡蚜屬(Coloradoa)、Cornaphis>β急瘤蟲牙屬(Cryptomyzus)、Crypturaphis>Doralis>一條角蟲牙屬(Doraphis)>Drepanaphis>Drepanosiphoniella>ixIftiWifM(Drepanosiphum)>Hf圓H蟲牙屬(Dysaphis)>Eomacrosiphum>Epipemphigus、石冠蟲牙屬(Ericolophium)、綿蟲牙屬(Eriosoma)、Essigella、綿斑蟲牙屬(Euceraphis)、長大蟲牙屬(Eulachnus)>Eumyzus>真毛管蟲牙屬(Eutrichosiphum)、縷蟲牙屬(Fimbriaphis)、Fullawaya>Geopemphigus、周隹蟲牙屬(Glyphina)、Gootiella、毛管蟲牙屬(Greenidea)、GrylloprociphiIus>五節(jié)扁蟲牙屬(Hamamelistes)、Hannabura>Im^M(Hormaphis)、_蟲牙M(Hyadaphis)、雙;蟲牙屬(Hyalomyzus)、大尾蟲牙屬(Hyalopterus)、Hyperomyza、超瘤蟲牙屬(Hyperomyzus)、尾草蚜屬(Hysteroneura)、伊州蚜屬(Illinoia)、印蚜屬(Indiaphis)、印馬蚜屬(Indomasonaphis)、卡基米蟲牙屬(Kakimia)、大蟲牙屬(Lachnus)、賴毛蟲牙屬(Laingia)、Lambersaphis>Latgerina>ixH,M(Longicaudus)(Longistigma)、蚜屬(Macromyzus)、小長管蚜屬(Macrosiphoniella)等，甚至進一步以下屬種中的任何一種或多種蚜科，例如大豆蚜Aphisglycines、菜豆蟲牙Aphisfabae、棉蟲牙Aphisgossypii、J^MifMacrosiphunrosae(―蟲牙)、杉匕蟲^Myzuspersicae>57|tBf^Rhopalosiphummaidis、斑點紫花苜猜蟲牙Therioaphismaculata、蘋果棉蟲牙EriosomaIanigerum等。本文使用的大豆蟲牙Aphisglycines禾口AphisglycinesMatasamura是指以大豆為食的蚜蟲。但是，任何在大豆植物上發(fā)現(xiàn)并且以此為食的蚜蟲，如菜豆蚜Aphisfabae,是大豆中蚜蟲抗性的目標，并且在本發(fā)明的范圍內(nèi)。本發(fā)明的大豆植物可以抵抗一種或多種侵襲大豆植物的蚜蟲。一方面，本發(fā)明提供蚜蟲抗性植物以及根據(jù)對蚜屬引起的蚜蟲的抗性或敏感性篩選大豆植物的方法和組合物。在一個優(yōu)選方面，本發(fā)明提供根據(jù)對大豆蚜(Aphisglycines)的抗性或敏感性篩選大豆植物的方法和組合物。一方面，植物選自大豆屬(Glycine)。大豆植物，包括但不限于外來種質(zhì)、群體、品系、優(yōu)良品系、栽培種和品種。如本文使用的大豆植物是指豆科(Fabaceae)的植物，在此以最廣義的范圍使用，包括但不限于大豆的任何種，例如大豆屬的種。大豆植物可以是Glycinearenaria,Glycineargyrea、Glycinecanescens>Glycineclandestine>Glycinecurvata、Glycinecyrtoloba、Glycinefalcate、Glycinelatifolia、Glycinelatrobeana、Glycinemax、Glycinemicrophylla>Glycinepescadrensis、Glycinepindanica、Glycinerubiginosa、野大豆(Glycinesoja)、大豆屬的禾中(Glycinesp.)、Glycinestenophita、Glycinetabacina禾口短絨里予大豆(Glycinetomentella)。本發(fā)明的植物可以是具有非常高的抗性、抗性、基本抗性、中度抗性、相當?shù)目剐浴⒉糠挚剐?、中度敏感的或敏感的大豆植物。如本文所用的術(shù)語抗性的、抗性和宿主植物抗性是指宿主植物預(yù)防或減少選自昆蟲、線蟲、病原體、真菌、病毒和病害的害蟲侵擾和損害的能力。如本文所用的術(shù)語排拒作用或非偏好抗性是指植物排斥昆蟲、引起產(chǎn)卵和進食減少的能力。如本文所用的術(shù)語抗生作用是指植物降低以該植物為食的昆蟲的存活力、生長或繁殖的能力。如本文所用的術(shù)語耐受性是指當給予相似數(shù)量的昆蟲時，宿主植物比其它植物產(chǎn)生具有良好質(zhì)量的更大產(chǎn)量的能力。在一個優(yōu)選方面，本發(fā)明提供一種大豆植物，將要通過任何方法測定該大豆植物的蚜蟲抗性或敏感性，以確定該大豆植物是否具有非常高的抗性、抗性、中度抗性、中度敏感性或敏感性。在該方面，通過目視估計植物上的蚜蟲數(shù)測定植物的蚜蟲抗性或敏感性(Mensah等人CropSci25:2228-2233(2005))。如本文所用的蚜蟲抗性是指預(yù)防或抑制蚜蟲引起宿主植物損害的能力，如減少進食、延遲生長和發(fā)育、降低繁殖力等。在另一方面，大豆植物可以顯示與非抗性對照大豆植物相當?shù)目剐浴Ｔ诖朔矫?，對照大豆植物除了所述一個或多個蚜蟲抗性等位基因以外，優(yōu)選地是遺傳上相似的。這些植物可以在相同或接近相同的害蟲暴露的類似條件下生長。在此方面，與已知的敏感植物相比，一個或多個抗性植物在每株植物上具有顯著較少的蚜蟲，或者每株抗性植物具有較少的損害，并且每株植物上具有與已知抗性植物相等的蚜蟲數(shù)或損害。如本文所用的術(shù)語數(shù)量性狀基因座和QTL是指影響連續(xù)變化的性狀如產(chǎn)量或抗性的表型變化的基因組區(qū)域。QTL可以包括多個基因或其它遺傳因素，甚至在連續(xù)基因組區(qū)域或連鎖群內(nèi)。如本文所用的術(shù)語單核苷酸多態(tài)性和SNP是指兩個DNA序列之間的單堿基差異。如本文所用的術(shù)語寡核苷酸是指由兩個或多個脫氧核糖核苷酸或核糖核苷酸組成的分子。如本文所用的術(shù)語引物是指與給定核苷酸序列互補的并且是啟動聚合酶的復(fù)制所需的寡核苷酸。如本文所用的術(shù)語探針是指能夠與另一目標寡核苷酸雜交的寡核苷酸。探針可以是單鏈或雙鏈的寡核苷酸。探針可用于特定核苷酸序列的檢測、鑒定或分離。如本文所用的術(shù)語基因是指包含內(nèi)含子、非翻譯區(qū)和控制區(qū)和產(chǎn)生RNA、多肽或多肽的前體所需的編碼序列的核酸序列。如本文所用的術(shù)語標記、DNA標記和遺傳標記是指性狀，包括遺傳性狀，如DNA序列基因座等位基因染色體特征同工酶，和形態(tài)特征，它可以用來檢測個體或群體中的基因或性狀的存在或位置。如本文所用的診斷標記是指可以檢測或鑒定性狀的遺傳標記，例如蚜蟲抗性、銹菌抗性和產(chǎn)量。本發(fā)明的抗性QTL可以被引入到優(yōu)良大豆品系中。在此，“品系”是指來自相似的譜系、具有相似的性狀的一組個體植物?！皟?yōu)良品系”指通過對較好的農(nóng)藝學(xué)表現(xiàn)進行育種和選擇而產(chǎn)生的任何株系。另外，優(yōu)良品系足夠同源和純合，能夠用于商業(yè)生產(chǎn)。優(yōu)良品系可以用于進一步的育種工作以開發(fā)新的優(yōu)良品系。本發(fā)明的蚜蟲抗性QTL也可以被引入包含一種或多種轉(zhuǎn)基因的大豆品系中，該轉(zhuǎn)基因植物包含編碼以下性狀的一種或多種基因除草劑耐受性、產(chǎn)量增加、昆蟲控制、真菌病抗性、病毒抗性、線蟲抗性、細菌病抗性、支原體病抗性、油產(chǎn)生改變、高產(chǎn)油量、高蛋白質(zhì)產(chǎn)量、發(fā)芽和幼苗生長的控制、動物和人類營養(yǎng)增強、低棉子糖、環(huán)境應(yīng)激抗性、可消化性提高、工業(yè)酶、藥用蛋白質(zhì)、肽和小分子、加工性狀改善、風味改善、固氮、雜種種子的產(chǎn)生、變應(yīng)原性降低、生物聚合物和生物燃料等。這些農(nóng)藝學(xué)性狀可通過植物生物技術(shù)方法在大豆中作為轉(zhuǎn)基因提供。一種或多種蚜蟲抗性QTL等位基因可以從任何包含該等位基因的植物(供體)引入到任何接受體大豆植物中。一方面，接受體大豆植物可以包含另外的蚜蟲抗性基因座。另一方面，接受體大豆植物可以包含轉(zhuǎn)基因。另一方面，在保持引入的QTL的同時，可以通過回交或其它合適的方法來減少提供蚜蟲抗性QTL的植物的遺傳貢獻。一方面，來自大豆植物中的供體材料的核遺傳物質(zhì)可能少于或是大約50%、少于或是大約25%、少于或是大約13%、少于或是大約5%、3%、2%或1%，但該遺傳物質(zhì)包含一種或多種感興趣的蚜蟲抗性基因座。含有所述的一個或多個蚜蟲抗性基因座的植物可以是供體植物。含有抗性基因座的蚜蟲植物可以是，例如通過使用能夠檢測與抗性相關(guān)的標記多態(tài)性的核酸分子進行篩選。在一方面，供體植物是PI594427C。在優(yōu)選的一方面，供體植物是蚜蟲抗性基因座1、2、4、6、7、8、9、11、13、15、16、17、18、19、20、21、22、23、27和28的來源。在另一方面，供體植物是大豆品種MV0031。在另一優(yōu)選的方面，供體植物是蚜蟲抗性基因座2、5、8、10、25和26的來源。在另一方面，供體植物是大豆品種CNS(PI548445)。在另一優(yōu)選的方面，供體植物是蚜蟲抗性基因座3、12、14和24的來源。供體植物是可以是敏感系。在一方面，供體植物也可以是接受體大豆植物。如本文所用的成熟期組是指基于植物最佳適應(yīng)和最大生產(chǎn)能力的緯度范圍對品種組的工業(yè)劃分。大豆品種被分類為13個認可的成熟期組，命名為成熟期組000、00、0和I至X，其中OOO表示最早熟的品種，X代表最晚熟的品種。成熟期組000至IV中的大豆植物具有不確定的植物習性，而成熟期組V至X中的大豆植物具有確定的生長習性。在本文中，確定的生長習性是指在主莖終止于一簇成熟豆莢后停止營養(yǎng)生長。在本文中，不確定的生長習性是指葉和花在其生殖期的一部分中同時發(fā)育，在頂端處具有1至3個豆莢。早熟品種(000至IV)適應(yīng)具有較長日長的北方緯度，在具有較短日長的南方緯度成熟期代碼增大。在本文中，相對成熟期是指將成熟期組以十分之一為單位細分的大豆植物成熟期組，例如III.5。相對成熟期提供更精確的成熟期。小數(shù)點之后的數(shù)字是指成熟期組的相對早熟或晚熟，例如IV.2是早熟組IV品種，IV.9是晚熟組IV。進一步理解，本發(fā)明的大豆植物可以顯示任何相對成熟期組的特征。一方面，相對成熟期組選自組000.1-000.9,00.1-00.9,0.1-0.9、I.1-1.9、II.1-II.9、III.1-111.9、IV.1-IV.9、V.1-V.9、VI.1-VI.9、VII.1-VII.9、VIII.1-VIII.9、IX.1-IX.9和Χ.1-X.9。選擇的大豆植物的花粉可以低溫貯藏，并且用于與來自其它成熟期組的大豆品系雜交，以使蚜蟲抗性基因座滲入到正常情況下無法用于自然雜交的品系中?；ǚ鄣蜏刭A藏技術(shù)是本領(lǐng)域公知的(Tyagi和Hymowitz，Cryoletters24:119_124(2003)，Liang等人ActaBotanicaSinica35:733-738(1993))。QTL的蚜蟲抗性效果可能隨親本基因型和測定蚜蟲抗性的環(huán)境因素而變化。植物育種領(lǐng)域的技術(shù)人員不需要過多的實驗就可以使用此處所述的方法從植物群體或親本基因型集合中選擇那些當含有蚜蟲抗性基因座時導(dǎo)致蚜蟲抗性比親本基因型增強的植物。在此，侵擾可以是由昆蟲、真菌、病毒、細菌或無脊椎動物引起的。已經(jīng)報道了大豆的大量分子遺傳圖譜(Mansur等人，CropSci.361327-1336(1996)，Shoemaker等人，Genetics144:329-338(1996)；Shoemaker等人，CropScience321091-1098(1992)，Shoemaker等人，CropScience35:436-446(1995)；Tinley和Rafalski，J.CellBiochem.Supp1.14E291(1990),)；Cregan等人，CropScience39:1464-1490(1999)。大豆(Glycinemax)、野大豆(Glycinesoja)和Glycinemaxχ.Glycinesoja具有共同的連鎖群(Shoemaker等人’Genetics144329-338(1996))。連鎖群(LG)是傾向于從一代向另一代共同遺傳的一組基因。此處使用的大豆的連鎖群(LG)，J、E、Bi、N、Al、DlaQ、H、D1、F、IDlb+W、0Cl和B2是指對應(yīng)于大豆遺傳圖譜的連鎖群J、E、Bi、N、Al、Dla_Q、H、D1、F、IDlb+W、0Cl和B2的連鎖群(Mansur等人，CropScience361327-1336(1996)；Cregan等人，CropScience391464-1490(1999)禾口Soybase,AgriculturalResearchService,UnitedStatesDepartmentofAgriculture)。QTL的等位基因當然可以包含多個基因或其它遺傳因素，甚至在連續(xù)基因組區(qū)域或連鎖群如單元型內(nèi)。連鎖群是在同一染色體上攜帶的一組基因座。單元型是與一條染色體上的DNA區(qū)段緊密連鎖并且傾向于作為單位遺傳的一組遺傳標記。如本文所用的，抗性基因座的等位基因可以包含一個以上的基因或其它遺傳因素，其中，每個單獨的基因或遺傳組分也能夠顯示等位基因變異，并且其中每個基因或遺傳因素也能夠引發(fā)對所述數(shù)量性狀的表型效應(yīng)。在本發(fā)明的一方面，QTL的等位基因包含也能夠顯示等位基因變異的一個或多個基因或其它遺傳因素。術(shù)語“QTL的等位基因”的使用并不排除包含一個以上的基因或其它遺傳因素的QTL。特別是，本發(fā)明中的“QTL的等位基因”可以表示單元型窗口中的單元型，其中表型可以是害蟲抗性。單元型窗口是可以用一組一個或多個多態(tài)性標記定義和示蹤的連續(xù)的基因組區(qū)域，其中，多態(tài)性指示譜系同一性。該窗口中的單元型可以通過每個標記處的等位基因的獨特指紋確定。如本文所用的，等位基因是占據(jù)染色體上給定基因座的基因的幾種替代形式之一。當染色體上的給定基因座處存在的所有等位基因相同時，該植物在該基因座處是純合的。如果染色體上的給定基因座處存在的等位基因不同，該植物在該基因座處是雜合的。本發(fā)明的植物在任何特定的蚜蟲抗性基因座處或?qū)τ谔囟ǖ亩鄳B(tài)性標記，可能是純合或雜合的。本發(fā)明也提供了本發(fā)明的植物的部分。植物部分包括但不限于，種子、胚乳、胚珠和花粉。在本發(fā)明的特別優(yōu)選的方面，植物部分是種子。本發(fā)明的植物或其部分可以在培養(yǎng)基中培養(yǎng)和再生。從各種組織類型再生大豆植物的方法和大豆的組織培養(yǎng)方法是本領(lǐng)域已知的(參見，例如，Widholm等人，InVitroSelectionandCulture-inducedVariationinSoybean,InSoybean:Genetics,MolecularBiologyandBiotechnology,Verma禾口Shoemaker編，CABInternational,Wallingford,Oxon,England(1996))。如大豆的植物的再生技術(shù)可以使用多種組織或細胞類型作為起始原料。尤其是對于大豆，已經(jīng)開發(fā)了再生方法，其開始于某些分化的組織類型，如，分生組織(Cartha等人，Can.J.Bot.591671-1679(1981))、下胚軸節(jié)(Cameya等人，PlantScienceLetters21.:289_294(1981))和蓮節(jié)點段(Saka等人，PlantScienceLetters,19193-201(1980)；Cheng等人，PlantScienceLetters,19:91_99(1980))。已報道了由未成熟大豆胚的外植體產(chǎn)生的體細胞胚再生完整的性成熟的大豆植物(Ranch等人，InVitroCellular&DevelopmentalBiology21:653-658(1985))。也已報道了通過器官發(fā)生和胚發(fā)生從組織培養(yǎng)物再生成熟大豆植物(Barwale等人，Planta167473-481(1986)；Wright等人，PlantCellReports5:150-154(1986))。本發(fā)明也提供一種通過針對大豆植物中的蚜蟲抗性或敏感性進行篩查而選擇的蚜蟲抗性大豆植物，所述選擇包括探詢基因組核酸中是否存在與大豆植物中的蚜蟲抗性相關(guān)的QTL的等位基因遺傳連鎖的標記分子，其中QTL的等位基因也位于與蚜蟲抗性大豆相關(guān)的連鎖群上。本發(fā)明包括一種將蚜蟲抗性等位基因滲入大豆植物中的方法，包括(A)使至少一個包含選自SEQIDNO81至SEQIDNO120的核酸序列的第一大豆植物與至少一個第二大豆植物雜交，以形成分離群體，(B)用一種或多種核酸標記篩查該分離群體，以確定來自該分離群體的一個或多個大豆植物是否含有該核酸序列，和(C)從該分離群體中選擇一個或多個包含選自SEQIDNO81至SEQIDNO120的核酸序列的大豆植物。本發(fā)明包括一種將等位基因滲入大豆植物中的方法，包括(A)使至少一個蚜蟲抗性大豆植物與至少一個蚜蟲敏感性大豆植物雜交，以形成分離群體，(B)用一種或多種核酸標記篩查所述分離群體，以確定來自所述分離群體的一個或多個大豆植物是否含有蚜蟲抗性基因座，其中所述蚜蟲抗性等位基因是選自蚜蟲抗性等位基因1、蚜蟲抗性等位基因2、蚜蟲抗性等位基因3、蚜蟲抗性等位基因4、蚜蟲抗性等位基因5、蚜蟲抗性等位基因6、蚜蟲抗性等位基因7、蚜蟲抗性等位基因8、蚜蟲抗性等位基因9、蚜蟲抗性等位基因10、蚜蟲抗性等位基因11、蚜蟲抗性等位基因12、蚜蟲抗性等位基因13、蚜蟲抗性等位基因14、蚜蟲抗性等位基因15、蚜蟲抗性等位基因16、蚜蟲抗性等位基因17、蚜蟲抗性等位基因18、蚜蟲抗性等位基因19、蚜蟲抗性等位基因20、蚜蟲抗性等位基因21、蚜蟲抗性等位基因22、蚜蟲抗性等位基因23、蚜蟲抗性等位基因24、蚜蟲抗性等位基因25、蚜蟲抗性等位基因26、蚜蟲抗性等位基因27、蚜蟲抗性等位基因28、蚜蟲抗性等位基因29、蚜蟲抗性等位基因30、蚜蟲抗性等位基因31、蚜蟲抗性等位基因32、蚜蟲抗性等位基因33、蚜蟲抗性等位基因34、蚜蟲抗性等位基因35、蚜蟲抗性等位基因36、蚜蟲抗性等位基因37、蚜蟲抗性等位基因38、蚜蟲抗性等位基因39和蚜蟲抗性等位基因40的等位基因。本發(fā)明包括核酸分子。這些分子包括那些能夠檢測與蚜蟲抗性基因座遺傳或物理連鎖的多態(tài)性的核酸分子。這些分子可以被稱為標記。可以通過現(xiàn)有技術(shù)獲得與蚜蟲抗性基因座1、蚜蟲抗性基因座2、蚜蟲抗性基因座3、蚜蟲抗性基因座4、蚜蟲抗性基因座5、蚜蟲抗性基因座6、蚜蟲抗性基因座7、蚜蟲抗性基因座8、蚜蟲抗性基因座9、蚜蟲抗性基因座10、蚜蟲抗性基因座11、蚜蟲抗性基因座12、蚜蟲抗性基因座13、蚜蟲抗性基因座14、蚜蟲抗性基因座15、蚜蟲抗性基因座16、蚜蟲抗性基因座17、蚜蟲抗性基因座18、蚜蟲抗性基因座19、蚜蟲抗性基因座20、蚜蟲抗性基因座21、蚜蟲抗性基因座22、蚜蟲抗性基因座23、蚜蟲抗性基因座24、蚜蟲抗性基因座25、蚜蟲抗性基因座26、蚜蟲抗性基因座27和蚜蟲抗性基因座28連鎖的另外的標記。一方面，核酸分子能夠檢測是否存在位于距離蚜蟲抗性基因座小于50、40、30、20、10、5、2或1厘摩(centimorgans)的標記。另一方面，使用QgeneVersion2.23(1996)和默認參數(shù)進行蚜蟲抗性測定，標記顯示2或更高、3或更高、4或更高的L0D得分。另一方面，核酸分子能夠檢測選自蚜蟲抗性基因座1、蚜蟲抗性基因座2、蚜蟲抗性基因座3、蚜蟲抗性基因座4、蚜蟲抗性基因座5、蚜蟲抗性基因座6、蚜蟲抗性基因座7、蚜蟲抗性基因座8、蚜蟲抗性基因座9、蚜蟲抗性基因座10、蚜蟲抗性基因座11、蚜蟲抗性基因座12、蚜蟲抗性基因座13、蚜蟲抗性基因座14、蚜蟲抗性基因座15、蚜蟲抗性基因座16、蚜蟲抗性基因座17、蚜蟲抗性基因座18、蚜蟲抗性基因座19、蚜蟲抗性基因座20、蚜蟲抗性基因座21、蚜蟲抗性基因座22、蚜蟲抗性基因座23、蚜蟲抗性基因座24、蚜蟲抗性基因座25、蚜蟲抗性基因座26、蚜蟲抗性基因座27和蚜蟲抗性基因座28的基因座中的標記。在進一步的方面，核酸分子選自SEQIDN0:81至SEQIDNO:120、其片段、其互補物和能夠與這些核酸分子中的一種或多種特異性雜交的核酸分子。在一個優(yōu)選方面，本發(fā)明的核酸分子包括在中度嚴格條件下(例如在大約2.OxSSC和大約65°C下)與SEQIDNO81至SEQIDNO120所示的一種或多種核酸分子或其互補序列或其中任一個的片段特異性雜交的核酸分子。在特別優(yōu)選的一方面，本發(fā)明的核酸分子在高嚴格條件下與SEQIDN0:81至SEQIDNO120所示的一種或多種核酸分子或其中任一個的互補分子或片段特異性雜交。在本發(fā)明的一方面，本發(fā)明的優(yōu)選的標記核酸分子具有SEQIDN0:81至SEQIDNO120所示的核酸序列或其互補序列或其中任一個的片段。在本發(fā)明的另一方面，本發(fā)明的優(yōu)選的標記核酸分子與SEQIDN0:81至SEQIDNO120所示的核酸序列或其互補序列或其中任一個的片段共有80%-100%或90%-100%的序列同一性。在本發(fā)明的進一步的一方面，本發(fā)明的優(yōu)選的標記核酸分子與SEQIDN0:81至SEQIDNO:120所示的核酸序列或其互補序列或其中任一個的片段共有95%-100%的序列同一性。在本發(fā)明的更優(yōu)選的一方面，本發(fā)明的優(yōu)選的標記核酸分子與SEQIDN0:81至SEQIDNO:120所示的核酸序列或其互補序列或其中任一個的片段共有98%-100%的序列同一性。核酸分子或其片段在某些情況下能夠與其它核酸分子特異性雜交。如本文所用，如果兩個核酸分子能夠形成反平行雙鏈核酸結(jié)構(gòu)，那么這兩個分子能夠彼此特異性雜交。如果它們表現(xiàn)出完全的互補性，則一核酸分子與另一核酸分子“互補”。如本文所用，當一個分子的每個核苷酸都與另一分子的核苷酸互補時，這兩個分子顯示“完全互補”。如果兩個分子在至少常規(guī)的“低嚴格”的條件下能互相雜交，具有足夠的穩(wěn)定性，從而允許它們保持彼此退火，那么這兩個分子是“最低限度互補的”。類似地，如果兩個分子在常規(guī)的“高嚴格”的條件下能互相雜交，具有足夠的穩(wěn)定性，從而允許它們保持彼此退火，那么這兩個分子是“互補的，，。Sambrook等人，In:MolecularCloning，ALaboratoryManual，2ndEdition，ColdSpringHarborPress，ColdSpringHarbor，NewYork(1989)與Haymes等人，In:NucleicAcidHybridization,APracticalApproach,IRLPress，Washington，DC(1985)描述了常規(guī)的嚴格條件。因而偏離完全互補性是允許的，只要這種偏離沒有完全消除該分子形成雙鏈結(jié)構(gòu)的能力。為了使核酸分子作為引物或探針，只需要在序列上充分互補，以在所采用的特定的溶劑和鹽濃度下能夠形成穩(wěn)定的雙鏈結(jié)構(gòu)。如本文所用，基本上同源的序列是在高嚴格條件下與所比較的核酸序列的互補序列特異性雜交的核酸序列。本發(fā)明的核酸探針和引物可以在嚴格條件下與靶DNA序列雜交。術(shù)語“嚴格的雜交條件”定義為在該條件下，探針或引物特異性地與靶序列雜交而不與非靶序列雜交，這可以根據(jù)經(jīng)驗確定。術(shù)語“嚴格的條件”是功能上的定義，涉及通過Sambrook等人，1989，9.52-9.55所述的具體的雜交程序，核酸探針與靶核酸(S卩，與感興趣的特定核酸序列)的雜交。也參見Sambrook等人，19899.47-9.52，9.56-9.58；Kanehisa1984Nucl.AcidsRes.12:203_213；Wetmur等人1968J.Mol.Biol.31:349_370。促進DNA雜交的合適的嚴格條件是，例如，大約45°C、6.Ox氯化鈉/檸檬酸鈉(SSC)，接著50°C、2.OxSSC洗滌，這是本領(lǐng)域的技術(shù)人員已知的，或可以在CurrentProtocolsinMolecularBiology,JohnWiley&Sons,N.Y.，1989,6.3.1-6.3.6中找到。例如，洗滌步驟中的鹽濃度可以從大約2.OxSSC、50°C的低嚴格條件到大約0.2xSSC、50°C的高嚴格條件中選擇。另夕卜，洗滌步驟中的溫度可以從低嚴格條件的室溫大約22°C增加到高嚴格條件的大約65°C。溫度和鹽都可以變化，或者，溫度或鹽濃度可以保持不變，而另一個變量發(fā)生變化。對于高嚴格性，例如使用DNA或RNA探針或引物的雜交可以在65°C下在6xSSC，0.5%SDS，5xDenhardt，s，100μtg/mL非特異性DNA(例如，超聲處理的鮭精DNA)中進行，于65°C用0.5xSSC，0.5%SDS洗滌。本發(fā)明考慮，如果保持探針或引物與靶序列結(jié)合的特異性，可以使用如較低的雜交和/或洗滌溫度的較低嚴格雜交條件，來確認具有較低的序列相似性的相關(guān)的序列。因此，本發(fā)明的核苷酸序列可用于選擇性地與DNA、RNA或cDNA片段的互補延伸形成雙鏈分子的能力。核酸分子片段可以是任何大小的片段，且示例性的片段包括SEQIDNO:81至SEQIDNO:120所示的核酸序列及其互補序列的片段。一方面，片段可以是15-25、15-30、15-40、15-50、15-100、20-25、20-30、20-40、20-50、20-100、25-30、25-40、25-50、25-100、30-40、30-50及30-100。另一方面，片段可以是大于10、15、20、25、30、35、40、50、100或250個核苷酸。另外的遺傳標記可以用來選擇具有與本發(fā)明大豆的蚜蟲抗性相關(guān)的QTL的等位基因的植物。公共標記數(shù)據(jù)庫的例子包括，例如Soybase，AgriculturalResearchService,UnitedStatesDepartmentofAgriculture。一種遺傳標記是在染色體上具有已知位置并且與特定性狀或基因相關(guān)的DNA序列。與蚜蟲抗性相關(guān)的遺傳標記可以用來確定個體植物是否是蚜蟲抗性的。本發(fā)明的遺傳標記包括“顯性”或“共顯性”標記?！肮诧@性標記”揭示兩個或多個等位基因的存在(每個二倍體個體中有兩個)?！帮@性標記”揭示只存在一個等位基因。顯性標記表型(例如，DNA帶)的存在表明在純合或雜合條件下存在一個等位基因。不存在顯性標記表型(例如，不存在DNA帶)僅能證明存在“某些其它”不明確的等位基因。在群體中的個體主要是純合的且基因座主要是二態(tài)性(dimorphic)的情況下，顯性和共顯性標記可能具有同樣的價值。隨著群體變得越來越雜合和多等位基因化(multiallelic)，共顯性標記往往比顯性標記提供更多的基因型信息?？梢允褂门c本發(fā)明的QTL的等位基因遺傳連鎖或相關(guān)的標記，如單序列重復(fù)標記(SSR)、AFLP標記、RFLP標記、RAPD標記、表型標記、SNP、同工酶標記、微陣列轉(zhuǎn)錄概況(Walton,1993；Burow等人1988)。分離這些標記的方法是本領(lǐng)域中已知的。通過使用核酸擴增方法可有利于DNA、RNA或cDNA樣品中的多態(tài)性位點的檢測。這些方法特異性地增加了跨越多態(tài)性位點或包含該位點和位于其遠端或近端的序列的多核苷酸的濃度。這些擴增的分子可以通過凝膠電泳、熒光檢測方法或其它方法很容易地檢測。實現(xiàn)這種擴增的一種方法采用聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)(Mullis等人1986ColdSpringHarborSymp.Quant.Biol.51:263_273；歐洲專利50，424；歐洲專利84，796；歐洲專禾Ij258，017；歐洲專利237，362；歐洲專利201，184；美國專利4，683，202；美國專利4，582，788；和美國專利4，683，194)，其中使用能夠與以雙鏈形式限定多態(tài)性的近端序列雜交的引物對。為了QTL作圖，包括的標記應(yīng)當是來源特征性的，以對隨后的群體作出推斷。SNP標記對于作圖是理想的，因為特定的SNP等位基因源自特定物種的現(xiàn)存群體中的獨立來源的可能性較低。因此，SNP標記可用于示蹤和輔助QTL的滲入，特別是在單元型的情況下?？梢酝ㄟ^基因作圖模型建立另外的標記分子的遺傳連鎖，所述基因作圖模型例如，但不限于，Lander等人(Lander等人，Genetics,121:185_199(1989))報道的側(cè)翼標記模型，和區(qū)間作圖(intervalmapping)，其基于其中所述的最大似然法，并用軟件包MAPMAKER/QTL執(zhí)行(Lincoln禾口Lander,MappingGenesControllingQuantitativeTraitsUsingMAPMAKER/QTL,WhiteheadInstituteforBiomedicalResearch,Massachusetts,(1990))。另夕卜的軟件包括Qgene，Version2.23(1996),DepartmentofPlantBreedingandBiometry,266EmersonHall,CornellUniversity,Ithaca,NY。使用Qgene軟件是一種特別優(yōu)選的方法。對于標記的存在，計算最大似然估計值(MLE)，以及假設(shè)沒有QTL效應(yīng)的MLE，以避免假陽性。然后計算優(yōu)勢率的Iogltl(LOD)=LOD=Iogltl(存在QTL的MLE/假定沒有連鎖QTL的MLE)。LOD得分基本上指示，假定存在QTL，相對于不存在QTL，數(shù)據(jù)增大的可能性有多大。對于給定的置信度，比如95%，為了避免假陽性的L0D閾值取決于標記的數(shù)量和基因組的長度。Lander等人(1989)說明了顯示L0D閾值的曲線圖，且Artis和Moreno-Gonzdlez，PlantBreeding,Hayward,Bosemark,Romagosa(編)Chapman&Hall,London,第314-331頁(1993)進一步對其描述?？梢允褂昧硗獾哪Ｐ?。已經(jīng)報導(dǎo)了對于區(qū)間作圖的許多修改和可供選擇的方法，包括使用非參數(shù)法(Kruglyak等人，1995Genetics,1391421-1428)。也可以使用多元回歸方法或模型，其中，在大量標記上對性狀進行回歸(Jansen，BiometricsinPlantBreed,vanOijen,Jansen(編)ProceedingsoftheNinthMeetingoftheEucarpiaSectionBiometricsinPlantBreeding,TheNetherlands,第116-124頁(1994)；Weber禾口Wricke,AdvancesinPlantBreeding,Blackwell,Berlin,16(1994))。Jansen等人(Jansen等人，1994Genetics，1361447-1455)和Zeng(Zeng，1994Geneticsl361457-1468)報道了組合了區(qū)間作圖與回歸分析的程序，由此將表型回歸到給定的標記區(qū)間的單個假定的QTL上，且同時回歸到作為'輔助因素'的標記數(shù)量上。一般來說，輔助因素的使用減少了估計的QTL位置的偏差和抽樣誤差(Utz和Melchinger，BiometricsinPlantBreeding,vanOijen,Jansen(編)ProceedingsoftheNinthMeetingoftheEucarpiaSectionBiometricsinPlantBreeding,TheNetherlands，第195—204頁(1994))，從而提高了QTL作圖的精度和效率(Zeng1994)。這些模型可以擴展到多環(huán)境實驗，以分析基因型-環(huán)境的相互作用(Jansen等人，1995Theor.Appl.Genet.91:33_3)。合適的作圖群體的選擇對于圖譜的構(gòu)建是重要的。合適的作圖群體的選擇取決于所用的標記系統(tǒng)的類型(Tanksley等人，Molecularmappinginplantchromosomes,chromosomestructureandfunction:ImpactofnewconceptsJ.P.Gustafson禾口R.Appels(編).PlenumPress,NewYork，第157-173頁(1988))。必須考慮在作圖群體中所用的親本的來源(適應(yīng)的相對于外來的)。染色體配對和重組率在遠緣雜交(適應(yīng)的X外來的)中會受到嚴重干擾(抑制)，且一般產(chǎn)生大大降低的連鎖距離。與近緣雜交(適應(yīng)的X適應(yīng)的)的后代相比，遠緣雜交通常會提供具有相對較大的多態(tài)性陣列的分離群體。F2群體是產(chǎn)生雜種種子之后的自交的第一代。通常一個&植物自交，產(chǎn)生所有基因都以孟德爾(121)方式分離的群體。使用共顯性標記系統(tǒng)從完全分類的F2群體中獲得最大遺傳信息(Mather，MeasurementofLinkageinHeredity:MethuenandCo.，(1938))。在顯性標記的情況中，需要后代測試(例如F3，BCF2)來確定雜合子，從而使其等同于完全分類的&群體。但是由于后代測試的成本和時間原因，這一程序通常是不可行的。F2個體的后代測試通常在其中表型不能一貫地反映基因型(例如害蟲抗性)或性狀表達受QTL控制的圖譜構(gòu)建中使用。來自后代測試群體(例如的分離數(shù)據(jù)可以在圖譜構(gòu)建中使用。然后可以基于標記_性狀圖譜關(guān)聯(lián)(F2，F(xiàn)3)，對雜交后代進行標記輔助的選擇，其中連鎖群沒有被重組事件完全分離(即最大不平衡)。重組近交系(RIL)(遺傳相關(guān)的系，通常是>F5，從繼續(xù)自交的F2系向純合性發(fā)展)可以作為作圖群體使用。通過使用RIL可以將從顯性標記獲得的信息最大化，因為所有的基因座都是純合的或接近純合。在緊密連鎖的條件下(即，大約<10%的重組)，對于每個個體，在RIL群體中評估的顯性和共顯性標記比在回交群體中的每個標記類型提供更多的信息(Reiter等人，1992Proc.Natl.Acad.Sci.(USA)89:1477_1481)。然而，由于標記之間的距離增大(即，基因座變得更加獨立)，RIL群體中的信息明顯減少。回交群體(例如，通過成功的品種(輪回親本)和攜帶前者不具有的性狀的另一品種(供體親本)之間雜交產(chǎn)生)可作為作圖群體來使用?？梢耘c輪回親本進行一系列回交，以恢復(fù)大部分其需要的性狀。因此，產(chǎn)生由幾乎類似于輪回親本的個體組成的群體，但每個個體攜帶不同量的或嵌合的來自供體親本的基因組區(qū)域。如果輪回親本中的所有基因座都是純合的，且供體親本和輪回親本具有截然不同的多態(tài)性標記等位基因，回交群體可以用于對顯性標記作圖(Reiter等人1992)。使用共顯性或顯性標記從回交群體獲得的信息少于從F2群體獲得的信息，因為從每株植物采集一個而不是兩個重組配子。然而，與RIL相比，回交群體提供更多的信息(在低標記飽和度時)，因為RIL群體中的連鎖的基因座之間的距離增加(即，大約0.15%的重組)。增加的重組對于緊密連鎖的分析是有益的，但在構(gòu)建具有低標記飽和度的圖譜時可能是不需要的。為了產(chǎn)生除了接受探詢的性狀或基因組區(qū)域之外在遺傳組成上幾乎相同的個體的陣列，通過多次回交產(chǎn)生的接近等基因的品系(NIL)可用作作圖群體。在用NIL作圖時，預(yù)計僅有一部分多態(tài)性基因座將定位于選定的區(qū)域。集群分離分析法(BSA)是為快速鑒定標記與感興趣的性狀之間的連鎖而開發(fā)的方法(Michelmore等人1991Proc.Natl.Acad.Sci.(U.S.A.)88:9828_9832)。在BSA中，從一次雜交產(chǎn)生的分離群體中抽取兩個集群DNA樣品。這些集群包含特定性狀(對特定病害具有抗性或易感性)或基因組區(qū)域相同但在非連鎖的區(qū)域是任意的(即，雜合的)個體。與靶區(qū)域不連鎖的區(qū)域在BSA中的許多個體的集群樣品之間沒有差異。傳統(tǒng)QTL作圖的一種替代方法包括通過相對于各種標記對單元型作圖以實現(xiàn)較高的分辨率(Fan等人2006Genetics172:663_686)。該方法追蹤如由多態(tài)性標記限定的、被稱為單元型的DNA組塊，假定它們在作圖群體中譜系相同。這種假設(shè)導(dǎo)致較大的有效樣本大小，提供較高的QTL分辨率。確定表型與基因型(在此情況下為單元型)之間相關(guān)性的統(tǒng)計學(xué)顯著性的方法可以通過任何本領(lǐng)域已知的統(tǒng)計學(xué)檢驗并且使用需要的任何公認的統(tǒng)計學(xué)顯著性閾值來確定。特定方法和顯著性閾值的應(yīng)用在本領(lǐng)域普通技術(shù)人員的能力范圍之內(nèi)。本發(fā)明的植物可以是育種計劃的一部分或由育種計劃產(chǎn)生。育種方法的選擇取決于植物繁殖方式、待改善的性狀的遺傳性以及商業(yè)使用的栽培種的類型(例如，&雜種栽培種、純系栽培種等)。栽培種是已經(jīng)產(chǎn)生或有意挑選并通過栽培維持的植物種的生理小種或品種。下文說明了用于培育本發(fā)明的植物的選擇的、非限制性的方法。對任何雜交的后代使用標記輔助的選擇(MAS)可以提高育種計劃。可以理解本發(fā)明核酸標記可以在MAS(育種)計劃中使用。進一步可以理解可以在育種計劃中使用任何商業(yè)和非商業(yè)的栽培種。例如，如發(fā)芽活力、植物生長活力、應(yīng)激抗性、抗病性、分枝、開花、結(jié)實、種子的大小、種子密度、直立性(standability)和脫粒性(threshability)等各種因素通常指導(dǎo)選擇。對于高度遺傳的性狀，在單一位置評估優(yōu)良的單株植物的選擇是有效的，而對于具有低遺傳性的性狀，選擇應(yīng)該基于通過相關(guān)植物的科的反復(fù)評估獲得的平均值。流行的選擇方法通常包括系譜選擇、修改的系譜選擇、混合選擇(massselection)和輪回選擇。在優(yōu)選的一方面，采取回交或輪回育種計劃。遺傳的復(fù)雜性影響了育種方法的選擇。可以利用回交育種將一個或少數(shù)高度遺傳性狀的有利基因轉(zhuǎn)移到希望的栽培種中。這種方法已經(jīng)廣泛用于培育抗病性和昆蟲抗性栽培種。利用各種輪回選擇技術(shù)改善由大量基因控制的數(shù)量遺傳的性狀?？梢詫τN系進行測試，且可以將其與代表商業(yè)目標區(qū)域的環(huán)境中合適的標準比較兩代或更多代。最好的品系是新的商業(yè)栽培種的候選品系；那些仍然為性狀缺陷的品系可用作親本，以產(chǎn)生新的群體用于進一步選擇。新的優(yōu)良大豆雜種的開發(fā)需要優(yōu)良近交系的開發(fā)和選擇、這些品系的雜交和優(yōu)良雜種的選擇。雜種種子可以通過選擇的雄性能育親本之間的人工雜交或者使用雄性不育系統(tǒng)來產(chǎn)生。關(guān)于親本系的另外的數(shù)據(jù)以及雜種的表型影響育種者關(guān)于是否繼續(xù)特定雜種雜交的決定。系譜育種和輪回選擇育種方法可用于從育種群體中開發(fā)栽培種。育種計劃將來自兩個或多個栽培種或各種廣泛的來源的理想性狀組合為育種池，從育種池中通過自交和所需的表型的選擇開發(fā)栽培種?？梢栽u估新栽培種以確定哪些具有商業(yè)潛力。回交育種已被用來將簡單遺傳的、高度遺傳的性狀的基因轉(zhuǎn)移到作為輪回親本的需要的純合栽培種或自交系中。待轉(zhuǎn)移的性狀的來源稱為供體親本。在初始雜交后，選擇具有供體親本的表型的個體，并與輪回親本反復(fù)雜交(回交)。產(chǎn)生的植物預(yù)計具有輪回親本(例如，栽培種)的大部分屬性，此外，還有從供體親本轉(zhuǎn)移來的理想的性狀。嚴格意義上說，單種子遺傳程序是指種植分離群體，每株植物收獲一個種子的樣品，并使用這一個種子樣品種植下一代。當群體已從F2提高到理想的近交水平時，作為該品系的來源的植物均回溯到不同的F2個體。由于一些種子不能發(fā)芽或一些植物不能產(chǎn)生至少一個種子，種群中的植物數(shù)量每一代都在下降。結(jié)果，當完成了世代進步時，并非全部原先在群體中取樣的F2植物都有后代代表。對于通常用于不同性狀和農(nóng)作物的其它育種方法的描述可在以下幾種參考書中找至IJ(Allard,PrinciplesofPlantBreeding,JohnWiley&Sons，NY,U.ofCA,Davis,CA,50—981960；Simmonds,Principlesofcropimprovement,Longman,Inc.,NY,369-3991979；Sneep禾口Hendriksen,Plantbreedingperspectives,Wageningen(編)，CenterforAgriculturalPublishingandDocumentation1979；Fehr,In:SoybeansImprovement,ProductionandUses,2ndEdition,Manograph.,162491987；Fehr,"Principlesofvarietydevelopment,"TheoryandTechnique，(Vol.1)禾口CropSpeciesSoybean(Vol.2)，IowaStateUniv.，MacmillanPub.Co.，NY,360—376，1987)。進一步理解，本發(fā)明提供包含本發(fā)明的核酸分子的細菌、病毒、微生物、昆蟲、哺乳動物和植物細胞。如本文所用，“核酸分子”，無論是自然產(chǎn)生的分子還是在需要時以其它方式“基本上純化的”分子，指的是從基本上全部其它通常與其天然狀態(tài)相關(guān)的分子中分離的分子。更優(yōu)選地，基本上純化的分子是制劑中存在的主要的種類?；旧霞兓姆肿涌梢源笥?0%、優(yōu)選75%、更優(yōu)選90%且最優(yōu)選95%地不含天然混合物中存在的其它分子(不包括溶劑)。術(shù)語“基本上純化的”并非意在包括以其天然狀態(tài)存在的分子。本發(fā)明的材料優(yōu)選是“生物活性的”，無論是在結(jié)構(gòu)屬性方面，如核酸與另一種核酸分子雜交的能力，還是在蛋白質(zhì)被抗體結(jié)合(或與另一種分子競爭這種結(jié)合)的能力方面?；蛘?，這種屬性可以是催化性的，因此涉及該材料介導(dǎo)化學(xué)反應(yīng)或應(yīng)答的能力。本發(fā)明的材料也可以是重組的。如本文所用的術(shù)語重組是指通過核酸分子的人工操作間接產(chǎn)生的任何材料(例如，DNA、肽等)。本發(fā)明的材料可以用便于檢測該材料的試劑標記(例如熒光標記(Prober等人，1987Science238:336_340；Albarella等人，歐洲專利144914)、化學(xué)標記(Sheldon等人，美國專利4，582，789；Albarella等人，美國專利4，563，417)、修飾的堿基(Miyoshi等人，歐洲專利119448)?，F(xiàn)已一般性地描述了本發(fā)明，通過參考以下的由舉例的方式提供的，并且除非另外指定，不限制本發(fā)明的實施例，會更容易理解本發(fā)明。實施例實施例1鑒定PI594427C中的排拒作用型蚜蟲抗性大豆育種者評價了大豆種質(zhì)的賦予對蚜蟲攻擊和傷害的抗性的遺傳性狀。宿主植物抗性被分類為排拒作用、抗生作用或耐受性。排拒作用也被稱為非偏好性，是植物排斥昆蟲從而引起產(chǎn)卵或攝食減少的能力。Dowling,CNS(PI548445)。評價了Jackson、PI597727C、PI594403和Williams的排拒作用型抗性。排拒作用抗性是典型評價的選擇實驗，其中昆蟲可以在至少兩種宿主植物之間選擇。在密歇根州立大學(xué)經(jīng)過三個季節(jié)進行的選擇田間測試中，PI594427C被確定為具有蚜蟲抗性。在選擇田間測試中，種植Dowling、CNS、Jackson、PI597727C、PI594403和Williams，并且裝在一個籠子中。每個植物上放置兩個從野外采集的蚜蟲。蚜蟲能夠從植物到植物自由移動，因此該研究評價蚜蟲的植物偏好性。在侵擾后2、3、4或5周，根據(jù)何時第一次觀察到癥狀對植物分別評分。給予植物從0到4的目測等級(表1)。表1用于蚜蟲抗性表型分型的等級量表的描述<table>tableseeoriginaldocumentpage27</column></row><table>每周，也確定植物的損害指數(shù)(DI)，損害指數(shù)是使用下式計算的<formula>formulaseeoriginaldocumentpage27</formula>較高的損害指數(shù)對應(yīng)于較敏感的植物。在三年的田間測試中，與已知的蚜蟲抗性品種Jackson和Dowling相比，PI594427C一貫地顯示相等的或較低的蚜蟲等級和損害指數(shù)(表2)。CNS和Williams對蚜蟲侵擾敏感。表2.在密歇根州立大學(xué)經(jīng)過3年在田間籠中一式三份測試的蚜蟲抗性和敏感性大豆基因型的平均大豆蚜蟲等級和損害指數(shù)<table>tableseeoriginaldocumentpage28</column></row><table>實施例2鑒定PI594427C中的抗生作用型蚜蟲抗性宿主植物抗性被分類為排拒作用、抗生作用或耐受性?？股饔檬侵参锝档鸵栽撝参餅槭车睦ハx的存活力、生長或繁殖的能力?？股饔猛ǔＪ怯芍参锂a(chǎn)生毒性化學(xué)物質(zhì)引起的?？股饔眯椭参锟剐酝ǔＴ诜沁x擇研究中評價，其中給昆蟲提供一種食物來源。在非選擇實驗中評價了Pana.PI594403,PI71506、Williams、PI594403、PI594427C、CNS、Jackson和Dowling的抗生作用抗性。在伊利諾伊州大學(xué)進行的非選擇實驗中鑒定了PI594427C中的抗生作用抗性。植物在選擇情況下種植在分離的籠子中。每個植物上放置三個蚜蟲蛹。接種后14、17和21天計數(shù)蚜蟲數(shù)(表2)。每個項目進行4個重復(fù)。在排拒作用條件下，蚜蟲能夠容易地在CNS上繁殖(表2)，但是在抗生作用條件下不能。與在抗生作用評價時的蚜蟲侵擾和年齡范圍相比，在排拒作用評價時的蚜蟲侵擾水平較高，并且蚜蟲年齡范圍較寬。蚜蟲侵擾水平和蚜蟲成熟度的差異可以說明在抗生作用和排拒作用評價時在CNS上觀察到的差異。此外，來自伊利諾伊州和密歇根州的地理蚜蟲生物型可以說明CNS上的反應(yīng)的差異。表3在伊利諾伊州大學(xué)測試的蚜蟲抗性和蚜蟲敏感性大豆基因型的大豆蚜蟲的平均數(shù)<table>tableseeoriginaldocumentpage29</column></row><table>*之后為不同字母的平均值在0.05水平上有顯著性差異。實施例3蚜蟲作圖研究為了將推斷的QTL對蚜蟲抗性作圖，將抗性品系(PI594427C)與CNS或MV0031雜交。為了對與蚜蟲抗性連鎖的推定QTL進行作圖，開發(fā)了兩個作圖群體PI594427C(蚜蟲抗性)XMV0031和PI594427C(蚜蟲抗性)XCNS.在EastLansing,MI評價封閉籠子中的F3:PI594427CXMV0031和F4:PI594427CXCNS群體的蚜蟲抗性表型。每個植物上放置3個蚜蟲蛹，接種后3、4、5周評定蚜蟲密度。等級量表為0-5(表1)。鑒定了28個蚜蟲抗性基因座(表6和表7)。使用來自QTL作圖研究的第4周評價的表型數(shù)據(jù)(表4和表5)。在第4周，蚜蟲抗性親本PI594427C被評定為1.5，而蚜蟲敏感性親本MV0031和CNS被評定為3.5。除了上述表型分型以外，用SNP標記對每個群體進行基因型分型181個多態(tài)性SNP用于F3PI594427CXMV0031群體，164個多態(tài)性SNP用于F4:PI594427CXCNS群體。進行單一標記和標記回歸分析以確定調(diào)節(jié)蚜蟲抗性的QTL區(qū)域。表6和表7列出了基因組區(qū)域和蚜蟲抗性以及診斷標記之間的顯著相關(guān)性。表4接種后第4周F4:PI594427CXCNS的表型<table>tableseeoriginaldocumentpage29</column></row><table>表5接種后第4周F3:PI594427CXMV0031的表型<table>tableseeoriginaldocumentpage30</column></row><table>表6;與測定的蚜蟲抗性相關(guān)的標記的結(jié)果(ns-沒有顯著性)<table>tableseeoriginaldocumentpage31</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage32</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage33</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage34</column></row><table>表7用于蚜蟲抗性基因座1-28的SNP標記的列表(續(xù))<table>tableseeoriginaldocumentpage34</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage35</column></row><table>確定與區(qū)域1相關(guān)的SNP標記是SEQIDNO81至SEQIDNO:84。用于區(qū)域1的SNP標記定位于連鎖群J上的區(qū)域。表7列出了如SEQIDNO:1至SEQIDNO8所示的PCR擴增引物和如SEQIDN0:121至SEQIDNO128所示的探針的序列。確定與區(qū)域2相關(guān)的SNP標記是SEQIDNO:85。用于區(qū)域2的SNP標記定位于連鎖群E上的區(qū)域。表7列出了如SEQIDNO:9至SEQIDNO10所示的PCR擴增引物和如SEQIDN0:129至SEQIDN0130所示的探針的序列。確定與區(qū)域3相關(guān)的SNP標記是SEQIDNO:86。用于區(qū)域3的SNP標記定位于連鎖群E上的區(qū)域。表7列出了如SEQIDN0:11至SEQIDNO12所示的PCR擴增引物和如SEQIDNO131至SEQIDN0132所示的探針的序列。確定與區(qū)域4相關(guān)的SNP標記是SEQIDNO:87。用于區(qū)域4的SNP標記定位于連鎖群E上的區(qū)域。表7列出了如SEQIDN0:13至SEQIDNO14所示的PCR擴增引物和如SEQIDNO133至SEQIDN0134所示的探針的序列。確定與區(qū)域5相關(guān)的SNP標記是SEQIDNO:88。用于區(qū)域5的SNP標記定位于連鎖群B1上的區(qū)域。表7列出了如SEQIDN0:15至SEQIDNO16所示的PCR擴增引物和如SEQIDN0:135至SEQIDN0136所示的探針的序列。確定與區(qū)域6相關(guān)的SNP標記是SEQIDNO:89。用于區(qū)域6的SNP標記定位于連鎖群N上的區(qū)域。表7列出了如SEQIDN0:17至SEQIDNO18所示的PCR擴增引物和如SEQIDN0:137至SEQIDN0138所示的探針的序列。確定與區(qū)域7相關(guān)的SNP標記是SEQIDNO:90。用于區(qū)域7的SNP標記定位于連鎖群G上的區(qū)域。表7列出了如SEQIDNO:19至SEQIDNO20所示的PCR擴增引物和如SEQIDN0:139至SEQIDN0140所示的探針的序列。確定與區(qū)域8相關(guān)的SNP標記是SEQIDNO91至SEQIDNO:92。用于區(qū)域8的SNP標記定位于連鎖群N上的區(qū)域。表7列出了如SEQIDNO21至SEQIDNO24所示的PCR擴增引物和如SEQIDN0:141至SEQIDNO144所示的探針的序列。確定與區(qū)域9相關(guān)的SNP標記是SEQIDNO:93。用于區(qū)域9的SNP標記定位于連鎖群N上的區(qū)域。表7列出了如SEQIDN0:25至SEQIDNO:26所示的PCR擴增引物和如SEQIDN0:145至SEQIDN0146所示的探針的序列。確定與區(qū)域10相關(guān)的SNP標記是SEQIDNO:94。用于區(qū)域10的SNP標記定位于連鎖群A1上的區(qū)域。表7列出了如SEQIDN0:27至SEQIDNO:28所示的PCR擴增引物和如SEQIDN0:147至SEQIDN0148所示的探針的序列。確定與區(qū)域11相關(guān)的SNP標記是SEQIDNO:95。用于區(qū)域11的SNP標記定位于連鎖群A1上的區(qū)域。表7列出了如SEQIDN0:29至SEQIDNO:30所示的PCR擴增引物和如SEQIDNO:149至SEQIDNO150所示的探針的序列。確定與區(qū)域12相關(guān)的SNP標記是SEQIDNO:96。用于區(qū)域12的SNP標記定位于連鎖群Dla上的區(qū)域。表7列出了如SEQIDNO:31至SEQIDNO:32所示的PCR擴增引物和如SEQIDNO151至SEQIDN0152所示的探針的序列。確定與區(qū)域13相關(guān)的SNP標記是SEQIDNO:97。用于區(qū)域13的SNP標記定位于連鎖群C2上的區(qū)域。表7列出了如SEQIDN0:33至SEQIDNO:34所示的PCR擴增引物和如SEQIDNO153至SEQIDN0154所示的探針的序列。確定與區(qū)域14相關(guān)的SNP標記是SEQIDNO:98。用于區(qū)域14的SNP標記定位于連鎖群H上的區(qū)域。表7列出了如SEQIDN0:35至SEQIDNO:36所示的PCR擴增引物和如SEQIDN0:155至SEQIDN0:156所示的探針的序列。確定與區(qū)域15相關(guān)的SNP標記是SEQIDNO:99。用于區(qū)域15的SNP標記定位于連鎖群H上的區(qū)域。表7列出了如SEQIDN0:37至SEQIDNO:38所示的PCR擴增引物和如SEQIDN0:157至SEQIDN0:158所示的探針的序列。確定與區(qū)域16相關(guān)的SNP標記是SEQIDN0:100至SEQIDN0:102。用于區(qū)域16的SNP標記定位于連鎖群D2上的區(qū)域。表7列出了如SEQIDNO39至SEQIDNO42所示的PCR擴增引物和如SEQIDN0:159至SEQIDNO164所示的探針的序列。確定與區(qū)域17相關(guān)的SNP標記是SEQIDNO:103。用于區(qū)域17的SNP標記定位于連鎖群F上的區(qū)域。表7列出了如SEQIDN0:45至SEQIDNO:46所示的PCR擴增引物和如SEQIDNO165至SEQIDN0166所示的探針的序列。確定與區(qū)域18相關(guān)的SNP標記是SEQIDNO:104。用于區(qū)域18的SNP標記定位于連鎖群F上的區(qū)域。表7列出了如SEQIDN0:47至SEQIDNO:48所示的PCR擴增引物和如SEQIDNO167至SEQIDN0168所示的探針的序列。確定與區(qū)域19相關(guān)的SNP標記是SEQIDNO:105。用于區(qū)域19的SNP標記定位于連鎖群I上的區(qū)域。表7列出了如SEQIDN0:49至SEQIDNO:50所示的PCR擴增引物和如SEQIDN0:169至SEQIDN0:170所示的探針的序列。確定與區(qū)域20相關(guān)的SNP標記是SEQIDNO:106。用于區(qū)域20的SNP標記定位于連鎖群Dlb上的區(qū)域。表7列出了如SEQIDN0:51至SEQIDNO:52所示的PCR擴增引物和如SEQIDNO171至SEQIDNO172所示的探針的序列。確定與區(qū)域21相關(guān)的SNP標記是SEQIDN0:107至SEQIDN0:108。用于區(qū)域21的SNP標記定位于連鎖群Dlb上的區(qū)域。表7列出了如SEQIDN0:53至SEQIDNO56所示的PCR擴增引物和如SEQIDNO173至SEQIDNO176所示的探針的序列。確定與區(qū)域22相關(guān)的SNP標記是SEQIDNO:109。用于區(qū)域22的SNP標記定位于連鎖群0上的區(qū)域。表7列出了如SEQIDN0:57至SEQIDNO:58所示的PCR擴增引物和如SEQIDNO177至SEQIDNO178所示的探針的序列。確定與區(qū)域23相關(guān)的SNP標記是SEQIDN0:110至SEQIDN0:111。用于區(qū)域23的SNP標記定位于連鎖群0上的區(qū)域。表7列出了如SEQIDNO59至SEQIDNO62所示的PCR擴增引物和如SEQIDN0179至SEQIDNO180所示的探針的序列。確定與區(qū)域23相關(guān)的SNP標記是SEQIDNO:111。用于區(qū)域23的SNP標記定位于連鎖群C1上的區(qū)域。表7列出了如SEQIDNO61至SEQIDNO62所示的PCR擴增引物和如SEQIDNO181至SEQIDNO182所示的探針的序列。確定與區(qū)域24相關(guān)的SNP標記是SEQIDNO:112。用于區(qū)域24的SNP標記定位于連鎖群C1上的區(qū)域。表7列出了如SEQIDN0:63至SEQIDNO:64所示的PCR擴增引物和如SEQIDNO183至SEQIDNO184所示的探針的序列。確定與區(qū)域25相關(guān)的SNP標記是SEQIDNO:113。用于區(qū)域25的SNP標記定位于連鎖群C1上的區(qū)域。表7列出了如SEQIDNO65至SEQIDNO66所示的PCR擴增引物和如SEQIDNO185至SEQIDNO186所示的探針的序列。確定與區(qū)域26相關(guān)的SNP標記是SEQIDN0:114至SEQIDN0:116。用于區(qū)域26的SNP標記定位于連鎖群C1上的區(qū)域。表7列出了如SEQIDNO67至SEQIDNO70所示的PCR擴增引物和如SEQIDN0187至SEQIDNO190所示的探針的序列。確定與區(qū)域27相關(guān)的SNP標記是SEQIDNO:116。用于區(qū)域27的SNP標記定位于連鎖群K上的區(qū)域。表7列出了如SEQIDN0:71至SEQIDNO:72所示的PCR擴增引物和如SEQIDNO191MSEQIDNO192所示的探針的序列。確定與區(qū)域28相關(guān)的SNP標記是SEQIDNO:117。用于區(qū)域28的SNP標記定位于連鎖群B2上的區(qū)域。表7列出了如SEQIDN0:73至SEQIDNO:80所示的PCR擴增引物和如SEQIDNO193至SEQIDNO200所示的探針的序列。實施例4.用于檢測具有蚜蟲抗性基因座的大豆植物的寡核苷酸雜交探針通過基于雜交的SNP檢測方法，寡核苷酸也可用于檢測與本文所公開的蚜蟲抗性相關(guān)的多態(tài)性或?qū)ζ溥M行分型。本發(fā)明提供了能夠與包含多態(tài)性的分離的核酸序列雜交的寡核苷酸。本領(lǐng)域的技術(shù)人員能夠設(shè)計具有經(jīng)實驗確定的嚴格性的試驗，以區(qū)別本文提出的多態(tài)性的等位基因狀態(tài)。示例性的試驗包括Southern印跡法、Northern印跡法、微陣列、原位雜交和其它基于雜交的多態(tài)性檢測方法。表8提供了示例性的用于基于雜交的SNP檢測的寡核苷酸?？梢杂梅派湫詷擞?、熒光團或其它化學(xué)發(fā)光手段可檢測地標記這些寡核苷酸，以有助于使用本領(lǐng)域已知的方法檢測與源自一種或多種大豆植物的基因組或擴增核酸的樣品的雜交。表8.寡核苷酸雜交探針標記標記SEQIDSNP位置雜交探針SEQIDNS01221518262CCTTGCAAGTCATGCT201NS01221518262CCTTGCATGTCATGCT202NS012509683139AAGTTTATGATTTGAA20337<table>tableseeoriginaldocumentpage38</column></row><table>實施例5.用于通過單堿基延伸方法檢測具有蚜蟲抗性基因座的大豆植物的寡核苷酸探針通過基于單堿基延伸(SBE)的SNP檢測方法，寡核苷酸也可用于檢測與本文所公開的大豆蚜蟲抗性相關(guān)的多態(tài)性或?qū)ζ溥M行分型。表9提供了示例性的用于基于SBE的SNP檢測的寡核苷酸。SBE方法基于與鄰近多態(tài)性的序列雜交的核苷酸引物的延伸，以在引物延伸時摻入可檢測的核苷酸殘基。也預(yù)期SBE方法可以使用3種合成的寡核苷酸。其中兩種寡核苷酸作為PCR引物發(fā)揮作用，并與位于包含待測多態(tài)性的區(qū)域兩翼的基因座的序列互補。在表7的標注為“正向引物SEQID”和“反向引物SEQID”的欄中提供了可用于對本發(fā)明公開的多態(tài)性進行分型的示例性的PCR引物。在包含多態(tài)性的區(qū)域擴增之后，將PCR產(chǎn)物與延伸引物雜交，該延伸引物與鄰近該多態(tài)性的擴增的DNA退火。然后提供DNA聚合酶和兩種差別標記的雙脫氧核苷三磷酸。如果模板上存在該多態(tài)性，可以在單堿基鏈延伸中將一種標記的雙脫氧核苷三磷酸添加到引物中。然后通過確定兩種差別標記中的哪一種添加到延伸引物中推斷存在的等位基因。純合的樣品將導(dǎo)致兩種標記的堿基中只有一種被摻入，因此兩種標記中只有一種被檢測到。雜合的樣品存在兩個等位基因，因此將直接摻入兩種標記(進入延伸引物的不同的分子)，因此這兩種標記都被檢測到。表9.用于單堿基延伸(SBE)分析的探針(延伸引物)<table>tableseeoriginaldocumentpage39</column></row><table>實施例6選擇的蚜蟲抗性等位基因的證實在非選擇田間研究中根據(jù)抗生作用篩查40個大豆育種系。將每個育種系10個植物種植在樣地中。各個樣地用一個小的昆蟲籠子覆蓋。當大豆植物達到VI期時向籠子中接種大豆蚜蟲。每周如表1所述對植物進行等級評定。每周確定植物的損害指數(shù)(DI)。表8列出了具有各種蚜蟲抗性等位基因的大豆系的平均DI等級。另外，在非選擇溫室研究中針對抗生作用篩查40個品系。40個大豆育種系各有幾個植物在溫室中栽培。從每個植物上切下葉子，在封閉的容器中用2個大豆蚜蟲接種。7天后計數(shù)每個葉子上的蚜蟲數(shù)。表10列出了具有各種蚜蟲抗性等位基因的大豆系上的蚜蟲的平均數(shù)。表10蚜蟲抗性等位基因1、16、23和28的證實。在非選擇溫室和田間實驗中根據(jù)對大豆蚜蟲的抗生作用篩查大豆系。<table>tableseeoriginaldocumentpage40</column></row><table>蚜蟲抗性等位基因1在非選擇田間和溫室測試中都賦予蚜蟲抗性。另外，蚜蟲抗性基因座16在非選擇田間測試中賦予抗性。而且，蚜蟲抗性等位基因23提高了由蚜蟲抗性等位基因1提供的蚜蟲抗性。類似地，蚜蟲抗性等位基因28提高了由蚜蟲抗性等位基因1提供的蚜蟲抗性。具有三個蚜蟲抗性等位基因的大豆植物比具有一個或兩個抗性等位基因的大豆植物具有更高水平的蚜蟲抗性。此外，具有四個蚜蟲抗性等位基因的大豆植物具有最高水平的蚜蟲抗性。宿主植物抗性控制方法可能屬于以下三種類別(1)順序地部署單抗性等位基因，(2)通過種子混合物或輪作部署多個具有不同的單抗性等位基因的品種，(3)將不同的抗性等位基因堆積或組合到一個大豆系中?？梢詾榱藛为毣蚪M合的蚜蟲抗性等位基因1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28培育大豆植物，這取決于地理區(qū)域的蚜蟲壓力和宿主植物抗性控制計劃。已經(jīng)說明和描述了本發(fā)明的原理，本領(lǐng)域的技術(shù)人員應(yīng)該明白，在不背離這些原理的情況下，可以在排列和細節(jié)上修改本發(fā)明。我們要求保護在所附的權(quán)利要求書的精神和范圍之內(nèi)的所有修改。權(quán)利要求一種將等位基因滲入大豆植物中的方法，包括A)提供大豆植物群體，B)相對于選自SEQIDNO81至SEQIDNO120的大豆基因組核酸標記，對該群體中的至少一個大豆植物進行基因型分型，C)從所述群體中選擇至少一個包含至少一個與蚜蟲抗性相關(guān)的等位基因的大豆植物。2.如權(quán)利要求1所述的方法，其中，所述選擇的大豆植物顯示至少部分的蚜蟲抗性。3.如權(quán)利要求1所述的方法，其中，所述選擇的大豆植物顯示至少基本的蚜蟲抗性。4.如權(quán)利要求1所述的方法，其中所述基因型通過選自單堿基延伸(SBE)、等位基因特異性引物延伸測序(ASPE)、DNA測序、RNA測序、基于微陣列的分析、通用PCR、等位基因特異性延伸、雜交、質(zhì)譜法、連接、延伸-連接和瓣核酸內(nèi)切酶介導(dǎo)的測定的分析方法來確定。5.如權(quán)利要求1所述的方法，其中，所述大豆基因組核酸標記選自SEQIDN0:81-82。6.通過權(quán)利要求1的方法獲得的優(yōu)良大豆植物。7.一種將等位基因滲入大豆植物中的方法，包括A)使至少一個蚜蟲抗性大豆植物與至少一個蚜蟲敏感性大豆植物雜交，以形成分離群體，B)用一種或多種核酸標記篩查所述分離群體，以確定來自所述分離群體的一個或多個大豆植物是否含有蚜蟲抗性等位基因，其中所述蚜蟲抗性等位基因是選自1、2、3、4、5、6、7、8、9、10，11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27和28蚜蟲抗性基因座的等位基因，其中在其一個或多個基因座處的一個或多個等位基因選自蚜蟲抗性等位基因1、蚜蟲抗性等位基因2、蚜蟲抗性等位基因3、蚜蟲抗性等位基因4、蚜蟲抗性等位基因5、蚜蟲抗性等位基因6、蚜蟲抗性等位基因7、蚜蟲抗性等位基因8、蚜蟲抗性等位基因9、蚜蟲抗性等位基因10、蚜蟲抗性等位基因11、蚜蟲抗性等位基因12、蚜蟲抗性等位基因13、蚜蟲抗性等位基因14、蚜蟲抗性等位基因15、蚜蟲抗性等位基因16、蚜蟲抗性等位基因17、蚜蟲抗性等位基因18、蚜蟲抗性等位基因19、蚜蟲抗性等位基因20、蚜蟲抗性等位基因21、蚜蟲抗性等位基因22、蚜蟲抗性等位基因23、蚜蟲抗性等位基因24、蚜蟲抗性等位基因25、蚜蟲抗性等位基因26、蚜蟲抗性等位基因27、蚜蟲抗性等位基因28、蚜蟲抗性等位基因29、蚜蟲抗性等位基因30、蚜蟲抗性等位基因31、蚜蟲抗性等位基因32、蚜蟲抗性等位基因33、蚜蟲抗性等位基因34、蚜蟲抗性等位基因35和蚜蟲抗性等位基因36。8.如權(quán)利要求7所述的方法，其中所述一種或多種標記中的至少一種位于所述抗性等位基因的30cM以內(nèi)。9.如權(quán)利要求7所述的方法，其中所述一種或多種標記中的至少一種位于所述抗性等位基因的20cM內(nèi)10.如權(quán)利要求7所述的方法，其中所述一種或多種標記中的至少一種位于所述抗性等位基因的2cM內(nèi)。11.如權(quán)利要求7所述的方法，其中所述一種或多種標記中的至少一種位于所述抗性等位基因的lcM內(nèi)。12.通過權(quán)利要求9的方法獲得的優(yōu)良大豆植物。13.如權(quán)利要求12所述的優(yōu)良大豆植物，其中，所述優(yōu)良大豆植物顯示轉(zhuǎn)基因性狀。14.如權(quán)利要求12所述的優(yōu)良大豆植物，其中，所述轉(zhuǎn)基因性狀選自除草劑耐受性、害蟲抗性、油組成等。15.如權(quán)利要求12所述的優(yōu)良大豆植物，其中，所述除草劑耐受性選自草甘膦、麥草畏、草丁膦、磺脲、溴苯腈和達草滅除草劑的耐受性。16.如權(quán)利要求12所述的優(yōu)良大豆植物，其中，所述核酸序列在所述優(yōu)良大豆植物中以單拷貝存在。17.如權(quán)利要求12所述的優(yōu)良大豆植物，其中，所述核酸序列在所述優(yōu)良大豆植物中以兩個拷貝存在。18.如權(quán)利要求12所述的優(yōu)良大豆植物，其中，所述優(yōu)良大豆植物顯示至少部分的蚜蟲抗性。19.如權(quán)利要求16所述的優(yōu)良大豆植物，其中，所述優(yōu)良大豆植物顯示至少基本的蚜蟲抗性。20.一種用于檢測與蚜蟲抗性相關(guān)的基因座的基本純化的核酸分子，其包含選自SEQIDNO:1至SEQIDNO175及其互補序列的核酸序列。21.包含權(quán)利要求20的核酸片段的載體。22.在與權(quán)利要求21的載體相容的宿主中表達的權(quán)利要求21的載體的表達產(chǎn)物。23.權(quán)利要求22的表達產(chǎn)物的抗體。24.一種鑒定大豆植物中的蚜蟲抗性等位基因的方法，包括檢測與選自SEQIDNO81至SEQIDNO120的SNP標記相關(guān)的基因座。25.一組寡核苷酸，包括A)一對寡核苷酸引物，其中所述引物中的每一個包含至少12個連續(xù)核苷酸，并且其中所述引物對允許PCR擴增包含與表6和表7中鑒定的蚜蟲抗性基因座相關(guān)的大豆基因組DNA多態(tài)性的DNA區(qū)段；和B)至少一個檢測寡核苷酸，其允許檢測所述擴增的區(qū)段中的多態(tài)性，其中所述檢測寡核苷酸的序列與包括或直接鄰近步驟(A)的所述多態(tài)性的玉米DNA區(qū)段任一條鏈中相同數(shù)目連續(xù)核苷酸的序列至少95%相同。全文摘要本發(fā)明屬于植物育種和蚜蟲抗性的領(lǐng)域。更具體地說，本發(fā)明包括用于培育含有與蚜蟲-大豆蚜-抗性相關(guān)的數(shù)量性狀基因座的大豆植物的方法。本發(fā)明進一步包括在育種計劃中監(jiān)測賦予蚜蟲抗性的數(shù)量性狀基因座(QTL)向優(yōu)良種質(zhì)內(nèi)的滲入的方法。文檔編號A01H5/10GK101801175SQ200880106337公開日2010年8月11日申請日期2008年8月8日優(yōu)先權(quán)日2007年8月8日發(fā)明者H·R·伯爾瑪,J·納費爾,J·耶茨,V·康希比多申請人:孟山都技術(shù)公司;喬治亞大學(xué)研究基金會