專利名稱:生產(chǎn)D-N-氨基甲?;粒被岬姆椒?br>
本申請是申請日為1995年12月26日、申請?zhí)枮?2103158.4、發(fā)明創(chuàng)造名稱為“生產(chǎn)D-N-氨基甲酰基-α-氨基酸的方法”的申請的分案申請。而申請02103158.4是申請95197132.8的分案申請。
本發(fā)明涉及一種生產(chǎn)D-N-氨基甲?;?α-氨基酸的方法。更具體地講,本發(fā)明涉及用一種新型轉(zhuǎn)化體生產(chǎn)D-N-氨基甲?;?α-氨基酸的方法,該轉(zhuǎn)化體具有編碼一種酶的基因,該酶能通過不對稱裂解水解作用將5-取代乙內(nèi)酰脲轉(zhuǎn)化成相應(yīng)的D-N-氨基甲?;?α-氨基酸(以下將所述酶稱作乙內(nèi)酰脲酶)。
旋光D-N-氨基甲酰基-α-氨基酸可被轉(zhuǎn)化成相應(yīng)的D-α-氨基酸,而旋光D-α-氨基酸是重要的制藥用中間化合物。具體地講,工業(yè)用化合物包括用作生產(chǎn)半合成青霉素和半合成頭孢菌素的中間化合物的D-苯基甘氨酸和D-(P-羥苯基)甘氨酸。
為了生產(chǎn)D-N-氨基甲?;?α-氨基酸,已知采用能通過不對稱裂解水解作用將5-取代乙內(nèi)酰脲轉(zhuǎn)化成相應(yīng)的D-N-氨基甲?;?α-氨基酸的微生物酶促反應(yīng)的方法,所述方法披露于JP-A 53-91189、JP-A 53-44690、JP-A 53-69884、JP-A53-133688等中。
此外,由嗜熱微生物獲得了一種與乙內(nèi)酰脲酶有關(guān)的基因(所述酶是一種能將5-取代的乙內(nèi)酰脲轉(zhuǎn)化成相應(yīng)的D-N-氨基甲酰基-α-氨基酸的酶)并將該基因插入中溫微生物中以產(chǎn)生具有乙內(nèi)酰脲酶活性的轉(zhuǎn)化型微生物。另外,在WO 94/00577中,乙內(nèi)酰脲酶基因片段是從屬于農(nóng)桿菌屬(Agrobacterium)的微生物中提取,并將其導(dǎo)入大腸桿菌(E.Coli)或農(nóng)桿菌屬的一種微生物中,以表達(dá)這種酶的活性。
上述利用微生物酶促反應(yīng)的方法具有以下缺陷已知為所述酶的來源的微生物的酶產(chǎn)量不足,而且,培養(yǎng)基昂貴。
另外,就JP-A 62-87089中所披露的轉(zhuǎn)化型微生物而言,其酶促活性僅比具有乙內(nèi)酰脲酶活性的孢子形成嗜熱微生物高幾倍,而且酶的產(chǎn)量仍然不足。
此外,現(xiàn)有技術(shù)中尚沒有用上述轉(zhuǎn)化型微生物對5-取代乙內(nèi)酰脲進(jìn)行不對稱裂解水解以便產(chǎn)生和積累相應(yīng)的D-N-氨基甲?;?α-氨基酸的先例。
本發(fā)明就是為了解決上述問題,而且涉及創(chuàng)造一種具有極高的酶產(chǎn)量的微生物,還涉及用由此所獲得的酶源有效地生產(chǎn)D-N-氨基甲?;?α-氨基酸。
JP-A 62-87089和WO 94/00577披露了通過重組DNA技術(shù)獲得乙內(nèi)酰脲酶生產(chǎn)微生物的方法。不過,用于提供乙內(nèi)酰脲酶基因的來源微生物完全不同于在本發(fā)明中被用于獲得乙內(nèi)酰脲酶基因的微生物。另外,所述乙內(nèi)酰脲酶基因的核苷酸序列和氨基酸序列明顯不同于本發(fā)明的有關(guān)序列本發(fā)明提供了一種用于生產(chǎn)D-N-氨基甲?;?α-氨基酸的方法,該方法包括在一種含水介質(zhì)中使5-取代乙內(nèi)酰脲與乙內(nèi)酰脲酶反應(yīng),該乙內(nèi)酰脲酶是由一種轉(zhuǎn)化體產(chǎn)生,而轉(zhuǎn)化體又是通過用含有源自芽胞桿菌KNK245(FERMBP-4863)、農(nóng)桿菌KNK712(FERM BP-1900)或假單胞菌KNK003A(FERM BP-3181)的乙內(nèi)酰脲酶編碼基因的一種DNA片段和一種載體DNA的重組DNA轉(zhuǎn)化一種宿主微生物,如屬于埃希氏菌屬(Escherichia)、假單胞菌屬、黃桿菌屬、芽胞桿菌屬、沙雷菌屬(Serratia)、農(nóng)桿菌屬、棒狀桿菌屬或短桿菌屬(Brevibacterium)的微生物而獲得的。
迄今為止,現(xiàn)有技術(shù)中尚未見具有極高乙內(nèi)酰脲酶生產(chǎn)能力的轉(zhuǎn)化體,如在本發(fā)明中所得到的轉(zhuǎn)化體,而且,通過利用該轉(zhuǎn)化體的酶的反應(yīng)能夠極為有效和經(jīng)濟(jì)地生產(chǎn)D-N-氨基甲?;?α-氨基酸。
隨后,將結(jié)合附圖對本發(fā)明做詳細(xì)說明。
圖1是質(zhì)粒pAH1043的限制酶圖。
圖2是質(zhì)粒pTH102的限制酶圖。
圖3是質(zhì)粒pTH103的限制酶圖。
圖4是質(zhì)粒pTH104的限制酶圖。
圖5是質(zhì)粒pPHD301的限制酶圖。
圖6是質(zhì)粒pTHB301的限制酶圖。
可以從芽胞桿菌KNK245、農(nóng)桿菌KNK712或假單胞菌KNK003A獲得帶有用于本發(fā)明的基因的DNA片段。
農(nóng)桿菌KNK712和假單胞菌KNK003A已由本發(fā)明人保藏于NIBH(National Institute of Bioscience and Human Technology),A-gency of Industrial Science & Technology,Ministry of internationalTrade & Industry,保藏編號分別為FERM BP-1900和FERM BP-3181,這些菌株詳細(xì)披露于Wo 92/10579中。芽胞桿菌KNK245是由本發(fā)明人新發(fā)現(xiàn)的菌株,并于1994年11月2日提交NIBH保藏,保藏編號為FERM BP-4863。
芽胞桿菌KNK245的微生物學(xué)特征如下芽胞桿菌 KNK245形狀 棒狀,絲狀大小 0.5-0.8×3-10(μm)革蘭氏染色 +孢子 +游動性 -生長溫度 37-60℃生長pH 5.0-8.9生長于5%NaCl中 -生長于7%NaCl中 -生長于0.02%疊氮化物中 -生長于0.001%溶菌酶中-硝酸還原 -淀粉水解 +酪蛋白分解 +酪氨酸分解 -過氧化氫酶 -氧化酶 +吲哚產(chǎn)生 -
鼠李糖 -萄萄糖 +果糖 +棉子糖 -蔗糖 +麥芽糖 +乳糖 -為了從所述菌株中獲取乙內(nèi)酰脲酶基因,通常采用以下方法。
首先,從一種微生物細(xì)胞中提取基因組DNA,然后用合適的限制酶,如Sau3AI等對該DNA進(jìn)行部分水解。將所得到的片段連接到載體DNA上,以得到具有各種基因組DNA片段的重組DNA分子作為基因文庫(見JP-A 58-126789和US 4,237,224)。
然后,從該基因文庫中選擇帶有所需基因的重組體。例如,可以通過檢測表達(dá)蛋白的酶促活性進(jìn)行選擇,或通過分析蛋白的N-末端序列,合成相應(yīng)的DNA探針并通過菌落雜交等檢測目的基因的存在。另外,可以采用DNA引物通過菌落雜交或聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)方法獲得所需要的基因,所述DNA引物是合成的已知乙內(nèi)酰脲酶堿基序列的合適部分。一旦得到目的基因,即分析其核苷酸序列。另外,對一種乙內(nèi)酰脲酶生產(chǎn)微生物和一種含有該酶基因的重組體進(jìn)行培養(yǎng)。純化所得到的酶,并測定所得蛋白的分子量。同時,用一臺氣相蛋白測序儀或類似裝置測其N-末端部分的氨基酸序列。
接著,通過比較所述DNA核苷酸序列和N-末端氨基酸序列,確定編碼乙內(nèi)酰脲酶蛋白的核苷酸序列部分翻譯成蛋白的起始位點(diǎn),而且,通過考慮其與該蛋白分子量的關(guān)系證實(shí),該酶蛋白是由所述基因上從該起始位點(diǎn)至終止密碼子的部分編碼,從而證實(shí)了所述目的基因(Molecular Cloning,A Laboratory Manual,2nd Ed.,ColdSpring Harbor Laboratory Press,Chapter 4和13)。因此,從農(nóng)桿菌KNK712和芽胞桿菌KNK245中獲得了序列1和2的DNA片段。眾所周知,編碼由此獲得的酶的基因和/或目的基因(Molecular Cloning,A Laboratory Manual,2nd Ed.,ColdSpring Harbor Laboratory Press,Chapter 4和13)。因此,從芽胞桿菌KNK245、農(nóng)桿菌KNK712和假單胞菌KNK003A中獲得了序列1、2和3的DNA片段。眾所周知,編碼由此獲得的酶的基因和/或帶有該基因的DNA片段與具有編碼相應(yīng)于上述基因和/或DNA片段的氨基酸序列的另一種核苷酸序列的DNA片段相同,因?yàn)橐粋€氨基酸通常相應(yīng)于若干個堿基密碼子。
可用于本發(fā)明的載體包括質(zhì)粒、噬菌體或其衍生物,它們源于微生物,并能夠在屬于埃希氏菌屬、假單胞菌屬、黃桿菌屬、芽胞桿菌屬、沙雷菌屬、棒狀桿菌屬或短桿菌屬的細(xì)菌細(xì)胞中自主生長。
例如,可以采用披露于“Guidelines on Recombinant DNA Experi-ments,-Commentation,Q and A-”(The life Science Section of theResearch Development Office in the Science and Technology Agency,Ed.,revised Sept.16,1987)的第25至27頁和第36至38頁上的宿主—載體系統(tǒng)。另外,可將重組DNA用于提高待生產(chǎn)的酶的量的目的,該重組DNA具有一個與一種載體的適當(dāng)位置連接的翻譯起始位點(diǎn),對該載體作過修飾,使其具有強(qiáng)結(jié)構(gòu)啟動子。用一種限制酶對該片段的兩端進(jìn)行切割,以形成與合適載體的重組體。通過直接轉(zhuǎn)化屬于埃希氏菌、假單胞菌、黃桿菌、芽胞桿菌、沙雷桿菌、農(nóng)桿菌、棒狀桿菌或短桿菌屬的微生物可以產(chǎn)生乙內(nèi)酰脲酶生產(chǎn)重組微生物。
無須直接轉(zhuǎn)化上述屬的微生物也可獲得乙內(nèi)酰脲酶生產(chǎn)重組微生物;即,一旦用其它微生物,如大腸桿菌將目的基因克隆到宿主載體系統(tǒng)中,此后便產(chǎn)生了具有合適載體的重組DNA。
以下文獻(xiàn)所披露的內(nèi)容可廣泛用于生產(chǎn)重組體授予S.N.Cohen等的美國專利US4,237,244說明書;Idenshi-SousaJikken-hou(Experimental Method of Gene Manipulation)”[Ed.,Yasuyuki TAKAGI,Kohdan-sha Scientific(1980)];Method in En-zymology,68,Recombinant DNA[Ed.,Ray Mv,Academic Press(1979)],JP-A58126789說明書等。
克隆目的基因,并除去其不必要的DNA。可以用其翻譯起始位點(diǎn)與一個載體上的合適位置連接的重組DNA轉(zhuǎn)化上述宿主細(xì)胞,以便提高待生產(chǎn)的酶產(chǎn)量,對所述載體作過修飾,使其具有強(qiáng)結(jié)構(gòu)啟動子。
在常規(guī)營養(yǎng)培養(yǎng)基中培養(yǎng)轉(zhuǎn)化體,以表達(dá)導(dǎo)入的重組DNA。當(dāng)來自基因DNA或載體DNA的一個性狀被賦予重組DNA之后,可根據(jù)具體性狀將一種合適的成分加入培養(yǎng)基中。
為了將由此所得的轉(zhuǎn)化體作為酶的生產(chǎn)源,可以用常規(guī)培養(yǎng)基培養(yǎng)這種轉(zhuǎn)化體。如果必要,還可以進(jìn)行一種處理,以便誘導(dǎo)酶的產(chǎn)生,如添加乙內(nèi)酰脲化合物、尿嘧啶、異丙基-1-硫基一β-D-半乳糖苷(IPTG)等,并提高溫度。通常,用于培養(yǎng)轉(zhuǎn)化體的培養(yǎng)基可以是含有碳源、氮源和無機(jī)離子的培養(yǎng)基。在很多場合,通過進(jìn)一步添加有機(jī)微量養(yǎng)分,如維生素、氨基酸等可以獲得理想的結(jié)果。通常,可將諸如葡萄糖和蔗糖之類的碳水化合物、諸如乙酸之類的有機(jī)酸、和醇等用作碳源。作為氮源,可以采用氨氣、氨水、銨鹽等。作為無機(jī)離子,可以采用磷酸根離子、鎂離子、鉀離子、鐵離子、錳離子、鈷離子、鎳離子、銅離子、鋁離子、鉬離子等。
如果在需氧條件下培養(yǎng)1~10天,同時,分別將pH和溫度調(diào)整至4-8和25-60℃的合適范圍,可以獲得理想結(jié)果。
由轉(zhuǎn)化體所產(chǎn)生的酶促活性可以如下形式表現(xiàn),如轉(zhuǎn)化體的培養(yǎng)液、其微生物細(xì)胞、自該微生物細(xì)胞中提取的酶、固定化微生物細(xì)胞等。
作為微生物細(xì)胞,可以采用任何培養(yǎng)液,在結(jié)束培養(yǎng)液的培養(yǎng)之后,從培養(yǎng)液中分離微生物細(xì)胞,洗滌微生物細(xì)胞,然后即可使用。作為處理過的微生物細(xì)胞,可以采用凍干的微生物細(xì)胞、丙酮干燥的微生物細(xì)胞、與甲苯或洗滌劑接觸的微生物細(xì)胞、溶菌酶處理過的微生物細(xì)胞、超聲處理過的微生物細(xì)胞、機(jī)械研磨的微生物細(xì)胞等。另外,可以使用獲自上述處理過的微生物細(xì)胞、固定化微生物細(xì)胞、不可溶化處理的微生物細(xì)胞的具有乙內(nèi)酰脲酶活性的酶提取物,固定在用于固定化的支持物(如陰離子交換樹脂)上的酶蛋白。固定化的方法可以參考JP-A63-185382等的說明書。
作為固定化用的支持物,適用的有酚醛陰離子交換樹脂,如Duolite A568或DS17186(Rohm & Haas Co.注冊商標(biāo));以及含有各種胺、銨鹽、或二羥乙基胺類官能團(tuán)類的各種陰離子交換樹脂,例如聚苯乙烯樹脂,如Amberlite IRA935、IRA945、IRA901(Rohm& haas Co.注冊商標(biāo))、Lewatit OC1037(Bayer A.G.注冊商標(biāo))和Diaion EX-05(Mitsubishi Chemical Industries,Ltd.注冊商標(biāo))。其它支持物,如DEAE-纖維素也可以采用。
另外,為了獲得更強(qiáng)、更穩(wěn)定的酶吸收,通常采用交聯(lián)劑,交聯(lián)劑的優(yōu)選例子為戊二醛。所使用的酶不僅可以是純化酶,而且可以是具有不同純化度的酶,如部分純化的酶、解離的微生物細(xì)胞的懸浮液和無細(xì)胞提取液。固定化酶的制備可以按常規(guī)方法進(jìn)行,例如,將酶吸附在一種支持物上,隨后進(jìn)行交聯(lián)處理。
對用作本發(fā)明酶促反應(yīng)的底物的5-取代乙內(nèi)酰脲無特殊限制,可以是通常用于此類反應(yīng)的任何化合物。其例子包括由以下通式(1)所代表的化合物 式(1)化合物的取代基的選擇范圍很寬。為了提供工業(yè)用制品,如藥物的中間化合物,優(yōu)選的R為苯基、由羥基取代的苯基、烷基、取代烷基、芳烷基或噻吩基。對于由羥基取代的苯基來說,羥基數(shù)可以為一個或幾個,而且可以位于鄰-、間-和對-位中的任一位置上,其典型例子為對羥苯基。烷基是1-4個碳原子的基團(tuán),相應(yīng)的D-N-氨基甲?;?α-氨基酸是D-N-氨基甲酰基-丙氨酸、D-N-氨基甲?;i氨酸、D-N-氨基甲?;涟彼帷-N-氨基甲?;惲涟彼岬?。所述取代烷基為用羥基、烷基硫基、羧基、氨基、苯基、羥基取代的苯基、酰胺基等取代的1-4個碳原子的烷基,其相應(yīng)的D-N-氨基甲?;被釣镈-N-氨基甲酰基-絲氨酸、D-N-氨基甲酰基蘇氨酸、D-N-氨基甲?;鞍彼?、D-N-氨基甲?;腚装彼帷-N-氨基甲?;於0?、D-N-氨基甲?;劝滨0?、D-N-氨基甲?;野彼?、D-N-氨基甲酰基-色氨酸、D-N-氨基甲?;於彼?、D-N-氨基甲酰基谷氨酸、D-N-氨基甲酰基組氨酸、D-N-氨基甲?;嚢彼帷-N-氨基甲?;彼?、D-N-氨基甲酰基瓜氨酸等。芳烷基是具有7-8個碳原子的基團(tuán),例如芐基或苯乙基,相應(yīng)的D-N-氨基甲?;?α-氨基酸為D-N-氨基甲酰基-苯丙氨酸等。
作為含水介質(zhì),可以使用含有水、緩沖液或有機(jī)溶劑,如乙醇的介質(zhì)。另外,必要時還可向該含水介質(zhì)中加入微生物生長所需的營養(yǎng)物、抗氧化劑、洗滌劑、輔酶、羥胺、金屬等。
當(dāng)在水溶性介質(zhì)中培養(yǎng)上述微生物的微生物細(xì)胞時,讓該微生物細(xì)胞接觸一種特定的5-取代乙內(nèi)酰脲的情況下,采用一種不僅含有5-取代乙內(nèi)酰脲,而且含有微生物生長所需的營養(yǎng)物,如碳源、氮源和無機(jī)離子源的含水介質(zhì)。如果再向其中加入諸如維生素和氨基酸之類的有機(jī)微量營養(yǎng)物,在多數(shù)情況下會取得理想效果。作為碳源,通常采用諸如葡萄糖、蔗糖之類的碳水化合物,諸如乙酸之類的有機(jī)酸;醇等。作為氮源,可以采用氨氣、氨水、銨鹽等。作為無機(jī)離子,可以采用磷酸根離子、鎂離子、鉀離子、鐵離子、錳離子、鈷離子、鎳離子、銅離子、鋁離子、鉬離子等。
培養(yǎng)是在有氧條件下進(jìn)行,同時,分別將pH和溫度調(diào)至4-8和25~60℃的適當(dāng)范圍內(nèi)。如果培養(yǎng)進(jìn)行1~10天,能高效地將5-取代的乙內(nèi)酰脲僅轉(zhuǎn)化為D-N-氨基甲?;?α-氨基酸。
另一方面,當(dāng)讓上述微生物的培養(yǎng)液原樣與培養(yǎng)的微生物細(xì)胞、處理過的微生物細(xì)胞、酶提取物、固定化微生物細(xì)胞、不可溶化的微生物細(xì)胞或固定的酶蛋白在含有溶解的或懸浮的5-取代乙內(nèi)酰脲的含水介質(zhì)中反應(yīng)時,可將反應(yīng)混合物靜置一段時間或攪拌,同時維持10-80℃的適當(dāng)溫度和pH4-9.5的適當(dāng)pH值。因此,如果將反應(yīng)進(jìn)行5-100小時,由乙內(nèi)酰脲酶進(jìn)行底物的D-特異性水解反應(yīng),而且底物發(fā)生化學(xué)外消旋,所有D-,DL-或L-5-取代乙內(nèi)酰脲轉(zhuǎn)化成相應(yīng)的D-N-氨基甲?;?α-氨基酸,從而在所述含水介質(zhì)中積累大量的氨基酸。另外,可以隨著反應(yīng)的進(jìn)行,以單獨(dú)部分加入5-取代乙內(nèi)酰脲。
可以分離所產(chǎn)生的D-N-氨基甲?;?α-氨基酸,并通過常規(guī)分離方法提純。
通過采用按上述方法獲得的分離并純化的D-N-氨基甲?;?α-氨基酸或由乙內(nèi)酰脲酶反應(yīng)所獲得的反應(yīng)混合物可很容易地獲得D-α-氨基酸,通過化學(xué)作用或具有脫甲氨酰酶活性的酶促作用將D-N-氨基甲?;?α-氨基酸轉(zhuǎn)化成相應(yīng)的D-α-氨基酸。
下面的實(shí)施例將對本發(fā)明作進(jìn)一步的詳細(xì)說明。
例1從土壤中分離具有乙內(nèi)酰脲酶活性的微生物將0.5g土壤樣品懸浮于2ml生理鹽水中之后,靜置該懸浮液,然后將1滴上清液涂在一種分離瓊脂板培養(yǎng)基(1.0%肉膏,1.0%胨,1.0%酵母提取物,0.3%氯化鈉,2.0%瓊脂;pH7.5)上。將其在50℃下培養(yǎng)2天,并將所得菌落轉(zhuǎn)移到添加了0.1%尿嘧啶和20ppm氯化錳的同一分離平板培養(yǎng)基上,并在50℃下再培養(yǎng)1天。將所獲得的微生物細(xì)胞懸浮于100μl反應(yīng)底物溶液[DL-(對羥苯基)乙內(nèi)酰脲30mM,亞硫酸鈉0.1%,碳酸緩沖液50mM]中,并讓其在50℃下反應(yīng)2小時。然后,將反應(yīng)混合物點(diǎn)滴在TLC板上,用展開溶劑丁醇∶乙酸∶水(4∶1∶1)展開,接著用在濃鹽酸中配制的10%對二甲氨基苯甲醛溶液顯色,檢測黃色斑點(diǎn),以便選擇能產(chǎn)生N-氨基甲?;?對羥苯基甘氨酸的微生物菌株。這樣,從2740個菌落中分離得到具有高乙內(nèi)酰脲酶活性的芽胞桿菌KNK245(FERM BP-4863)。
例2得自芽胞桿菌KNK245的乙內(nèi)酰脲酶的N-末端氨基酸測序?qū)⒁徽h(huán)的芽胞桿菌KNK245接種到盛于500ml體積的Sak-aguchi燒瓶中的100ml接種培養(yǎng)基(1.0%肉膏、1.0%胨、0.5%酵母提取物;pH7.5)里,并在55℃下培養(yǎng)19小時。然后將2%的該培養(yǎng)物接種到盛于2L Sakaguchi燒瓶中的500ml主培養(yǎng)基(1.0%肉膏,1.0%胨,0.5%尿嘧啶,20ppm氯化錳四水合物;pH7.5)里,并在55℃下培養(yǎng)19小時。通過離心從由此獲得的9升培養(yǎng)液中收集微生物細(xì)胞。將其懸浮于含有20mM硫酸錳的0.2M Tris-HCl(pH8.0)中,超聲波破碎并離心,以獲得無細(xì)胞提取物。然后,通過硫酸銨沉淀分級分離、DEAE-Sepharose和苯基-Sepharose將該提取物純化32倍。此外,用硫酸銨獲得乙內(nèi)酰脲酶結(jié)晶。將該結(jié)晶溶于水中,并用A470A Model Gas Phase Protein Sequencer(由AppliedBiosystems生產(chǎn))進(jìn)行分析。結(jié)果發(fā)現(xiàn),該乙內(nèi)酰脲酶的N-末端的氨基酸序列為1 5 10Met-Lys-Lys-Ile-Ile-Lys-Asn-Gly-Thr-Ile-Val-Thr-例3獲得帶有源于農(nóng)桿菌KNK712(FERM BP-1900)的編碼乙內(nèi)酰脲酶基因的質(zhì)粒通過以下方法進(jìn)行的研究業(yè)已發(fā)現(xiàn),乙內(nèi)酰脲酶基因位于克隆于質(zhì)粒pADH101中的DNA片段上,該質(zhì)粒披露于WO 92/10579中。用常規(guī)方法由pAHD101轉(zhuǎn)化大腸桿菌JM109,接種到含有100mg/l氨芐青霉素的50ml的L-液(10g/l胨,5g/l酵母提取物、5g/l氯化鈉;pH7.0)里,并在37℃培養(yǎng)16小時。然后,收集50ml培養(yǎng)液,除去上清液,將微生物細(xì)胞懸浮于50ml底物溶液(0.5% 5-(對羥苯基)乙內(nèi)酰脲,0.05% Triton x-100,0.05M磷酸緩沖液;pH8.7)里,在37℃下,在氮?dú)饬髦蟹磻?yīng)3小時。將反應(yīng)混合物點(diǎn)滴到TLC板上,展開,并用在氫氯酸中配制的對二甲氨基苯甲醛顯色,以便檢測與真實(shí)樣品相符合的D-N-氨基甲?;?(對羥苯基)甘氨酸斑點(diǎn)。關(guān)于前者,我們證實(shí)pAHD101轉(zhuǎn)化體能表達(dá)編碼乙內(nèi)酰脲酶的基因。
將通過用Sac I和Sal I裂解質(zhì)粒pAHD101縮短插入的片段而獲得的2.1kbp片段連接到用Sac I和Sal I裂解的pUC18片段上,以獲得質(zhì)粒pAH1043(見圖1)。
另外,用DNA測序試劑盒(由Applied Biosystems生產(chǎn))對乙內(nèi)酰脲酶基因進(jìn)行核苷酸測序。結(jié)果示于序列1中。
用質(zhì)粒pAH1043轉(zhuǎn)化大腸桿菌HB101,以便獲得大腸桿菌HB101 pAH1043(FERM BP-4865)轉(zhuǎn)化體。
例4制備芽胞桿菌KNK245基因組DNA與載體DNA的重組DNA將芽胞桿菌KNK245(FERM BP-4863)放在2升培養(yǎng)液(10g/l肉膏、10g/l胨、5g/l酵母提取物;pH7.5)中,在45℃下培養(yǎng)24小時,收集微生物細(xì)胞。從按照Marmur方法獲得的微生物細(xì)胞中提取基因組DNA。將10單位BamH I加入1μg基因組DNA中,并讓其在37℃下反應(yīng)16小時。
另一方面,用BamH I對質(zhì)粒pUC19進(jìn)行徹底裂解,并用T4DNA連接酶將其連接到上述所得到的基因組DNA片段上,以便得到各種重組質(zhì)粒的混合物。
例5獲得源于芽胞桿菌KNK245的乙內(nèi)酰脲酶基因根據(jù)源于例3的農(nóng)桿菌KNK712(FERM BP-1900)和披露于JP-A 62-87089中的Lu1220菌株的乙內(nèi)酰脲酶基因的核苷酸序列,合成兩種引物,引物1和引物2(見表1),各種引物具有上述核苷酸序列互補(bǔ)鏈的序列,并且從1155bp間斷核苷酸序列起取向相反。用兩種引物進(jìn)行聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR),引物是以在例4中制備的源于芽胞桿菌KNK245的基因組DNA為模板合成的,以獲得約1.2kbp的片段。用DNA測序試劑盒(由Applied Biosystems生產(chǎn))對所述片段進(jìn)行核苷酸測序。結(jié)果發(fā)現(xiàn),它對已知的乙內(nèi)酰脲酶基因有很高的互補(bǔ)度,而且發(fā)現(xiàn)所獲得的PCR片段是乙內(nèi)酰脲酶基因的一部分。然后,合成兩個引物,引物3和引物4(表1),其具有相應(yīng)于該片段互補(bǔ)鏈的反向取向的序列。
另外,合成具有例4的重組DNA上的載體部分序列的引物5(表1),通過采用上文合成的引物和后一種引物,并以例4的重組DNA為模板進(jìn)行PCR,以獲得分別含有乙內(nèi)酰脲酶基因的前半部分和后半部分的兩類DNA片段。對所得到的DNA片段進(jìn)行核苷酸測序。根據(jù)由例2中乙內(nèi)酰脲酶蛋白的N-末端氨基酸序列預(yù)計(jì)的核苷酸序列,確定翻譯密碼子。與上述確定的核苷酸序列一起確定編碼乙內(nèi)酰脲酶的基因的整個核苷酸序列。
然后,根據(jù)由此獲得的核苷酸序列,合成具有乙內(nèi)酰脲酶基因起始密碼子和Nde I限制位點(diǎn)的序列的引物6(表1)和具有乙內(nèi)酰脲酶基因上的Pst I限制位點(diǎn)的序列的引物7(表1),并以例4的基因組DNA為模板進(jìn)行PCR,以獲得1.2kb的片段1。然后合成在上述Pst I限制位點(diǎn)上具有反向序列的引物8(表1)和具有相應(yīng)于終止密碼子的下游的序列和Hind III限制位點(diǎn)的引物9(表1),并以例4的基因組DNA為模板進(jìn)行PCR,以便獲得0.25kb的片段2。用NdeI和Pst I對片段1進(jìn)行限制性酶切,用Pst I和Hind III對片段2進(jìn)行限制性酶切,并用Nde I和Hind III對pUCNT進(jìn)行限制性酶切,pUCNT是披露于WO 94/03613中的pUC19的改進(jìn)載體質(zhì)粒。用T4DNA連接酶將上述限制片段連接在一起,以便獲得含有乙內(nèi)酰脲酶基因的質(zhì)粒pTH102(見圖2)。
Table 1引物1 引物2 引物35’-T A A C A T C C T T T T G C A T C A A C C A C T T C-3’引物45’-A A A A A A G G A A G A A T C A C G T T A A A-3’引物55’-G T T T T C C C A G T C A C G A C-3’引物65’-T A C G A G C A T A T G A A A A A G A T C A T T A A G A A C G GA A C-3’引物75’-G T G T G T T T C T G C A G A A A T T A C C C G T T C-3’引物85’-T A A T T T C T G C A G A A A C A C A C C A T A T-3’引物95’-G C T G A A A G C T T C G A A A T A A G C C A T T T T C G A G CA G-3’引物105’-T A A T T T C T G C A G A A A C A C A C C A C A T G G C C G TC G-3’引物115’-C G A G C A A G C T T C T A C T A A A T G G T T A A T T T C T CA T-3’引物125’-G G A A G C T T T C A T T A A A T G G T T A A T T T C T C A T CT T G T T-3’引物135’-T A C G A G G G A T C C T A T A A A T T C C A A C A A G T G CT A T A-3’
例6制備用于表達(dá)芽胞桿菌KNK245乙內(nèi)酰脲酶基因的重組DNA按照與獲得例5的片段2相同的方法進(jìn)行PCR,以便得到0.25kb的片段3,所不同的是,不采用用于產(chǎn)生片段2的、具有Pst I限制位點(diǎn)的引物,而是采用合成的引物10(表1)代替具有終止密碼子序列的引物,其中,靠近Pst I限制位點(diǎn)的Nde I限制位點(diǎn)上的一個核苷酸被取代,以阻止Nde I的裂解作用,并采用合成的引物11(表1),基中,在終止密碼子下游的核苷酸數(shù)目進(jìn)一步減少。然后,按照獲得例5中pTH102相同的方法由片段1和3和pUCNT(見圖3)獲得質(zhì)粒pTH103。
此外,以與獲得pTH103相同的方法獲得pTH104,所不同的是,不采用具有終止密碼子下游序列的引物11,而采用引物12(表1)。
由pTH104轉(zhuǎn)化的大腸桿菌HB101被命名為大腸桿菌HB101pTH104。該菌株已于1994年11月2日保藏于NIBH,保藏編號為FERM BP-4864。
例7獲得含有源于假單胞菌KNK003A(FERM BP-3181)的乙內(nèi)酰脲酶編碼基因的質(zhì)粒按照例3所述方法發(fā)現(xiàn),乙內(nèi)酰脲酶基因位于WO 92/10579中所披露的質(zhì)粒pPHD301上。
用pPHD301轉(zhuǎn)化大腸桿菌HB101,以獲得大腸桿菌HB101pPHD301(FERM BP-4866)。pPHD301的限制酶圖如圖5所示。
按照與例3相同的方法對乙內(nèi)酰脲酶基因進(jìn)行核苷酸測序。結(jié)果如序列2所示。
例8用所獲得的轉(zhuǎn)化體將5-(對羥苯基)乙內(nèi)酰脲轉(zhuǎn)化成D-N-氨基甲?;?(對羥苯基)甘氨酸。
將在例6中得到的轉(zhuǎn)化體大腸桿菌HB101pTH104接種到含有100μg/ml氨芐青霉素和400ppm氯化錳四水合物的50ml 2YT培養(yǎng)液(16g/l多胨(polypeptone),10g/l酵母提取物,5g/l氯化鈉;pH7.0)里,并在37℃培養(yǎng)24小時。以50ml上述培養(yǎng)液中收集微生物細(xì)胞,并懸浮于0.05M的碳酸緩沖液(pH8.7)中,定容至50ml。以0.05%的終濃度加入Triton x-100。向該溶液中添加1.5g 5-(對羥苯基)乙內(nèi)酰脲,在40℃溫度下,在氮?dú)饬髦蟹磻?yīng)3小時,同時攪拌,用6N NaOH將pH調(diào)至8.7。反應(yīng)結(jié)束后,對反應(yīng)混合物進(jìn)行離心,取上清液,用在濃氫氯酸配制的10%對二甲氨基芐醛溶液顯色,對其中的D-N-氨基甲?;?(對羥苯基)甘氨酸進(jìn)行比色測定。結(jié)果,以97.5%的轉(zhuǎn)化率獲得了D-N-氨基甲?;?(對羥苯基)甘氨酸。
用氫氯酸將反應(yīng)混合物的pH調(diào)至5。離心以后,濃縮上清液,用濃氫氯酸調(diào)至pH2,并于4℃下保存。濾除沉淀的結(jié)晶,并從水-乙醇中再結(jié)晶,以獲得970mg D-N-氨基甲?;?(對羥苯基)甘氨酸,m.p.176-177℃,[α]D20=-177.0°(C=0.5,5%乙醇)。
例9制備固定化乙內(nèi)酰脲酶從1升按例7所述方法獲得的大腸桿菌HB101 pTH104培養(yǎng)液中收集微生物細(xì)胞,懸浮于1mM硫酸錳水溶液中,定容至60ml,將pH調(diào)至8.5,并通過超聲波破碎。向由此獲得的酶溶液中加入20g陰離子交換樹脂Duolite A-568,平衡至pH8.5,并在15℃下攪拌該混合物20小時,以吸附所述酶。向該混合物中加入戊二醛,使其終濃度為0.1%,攪拌混合物1小時,以便進(jìn)行交聯(lián)反應(yīng)。然后收集樹脂并洗滌,以獲得20g固定化乙內(nèi)酰脲酶。
例10用固定化酶將5-(對羥苯基)乙內(nèi)酰脲轉(zhuǎn)化成D-氨基甲?;?(對羥苯基)甘氨酸將5g在例9中獲得的固定化乙內(nèi)酰脲酶加至溫度為40℃的100ml 1mM硫酸錳水溶液中,該溶液中用氮?dú)馄鹋?。向該溶液中?g 5-(對羥苯基)乙內(nèi)酰脲,在40℃下,在攪拌條件下反應(yīng)3小時,同時用氮?dú)馄鹋?。反?yīng)結(jié)束后,靜置反應(yīng)混合物,并吸取收集反應(yīng)混合物。按照與例8相同的方法純化上述氨基甲?;被嶂破?,獲得2.2g D-N-氨基甲?;?(對羥苯基)甘氨酸。
例11在枯草桿菌(Bacillus subtilis)中表達(dá)芽胞桿菌KNK245乙內(nèi)酰脲酶基因按照與例5相同的方法進(jìn)行PCR,以芽胞桿菌KNK245基因組DNA為模板,并采用引物12和13(表1),以便獲得1.7kb的片段。用BamH I和Hind III裂解該片段,并將其連接到以類似方法裂解過的質(zhì)粒pHY300PLK(Takara Shuzo)上,獲得質(zhì)粒pTHB301。其限制酶圖如圖6所示。
通過電擊法(用Shimadzu公司的GTE-10型,10KV/cm,2ms)將質(zhì)粒pTHB 301導(dǎo)入枯草桿菌ISW 1214(可從Takara Shuzo獲得)、枯草桿菌YS-11(IAM12019)或枯草桿菌3115(IAM12020),并在添加了0.02g/l氯化鎂四水合物的例4的培養(yǎng)基中、在37℃下培養(yǎng)20小時。通過收集微生物細(xì)胞并通過超聲波將其破碎,以制備無細(xì)胞提取物。結(jié)果,各種乙內(nèi)酰脲酶的活性比在相同條件下培養(yǎng)芽胞桿菌KNK245所獲得的活性高大約2.2倍。
例12在嗜熱生物中表達(dá)芽胞桿菌KNK245乙內(nèi)酰脲酶基因用J.Bacteriol,149,824(1982)中披露的原生質(zhì)體法,由在例11中制備的質(zhì)粒pTH301轉(zhuǎn)化嗜熱脂肪芽胞桿菌(Bacillus Stearother-mophilus)IFO12550,并以與例11相同的方法培養(yǎng),以制備無細(xì)胞提取物。乙內(nèi)酰脲酶的活性比在相同條件下制備的芽胞桿菌KNK245的乙內(nèi)酰脲酶的活性高大約3.6倍。
如上所述,按照本發(fā)明可以創(chuàng)造一種具有極高的乙內(nèi)酰脲酶活性的微生物,以其為酶源可以有效生產(chǎn)D-N-氨基甲?;?α-氨基酸。
微生物保藏已按照布達(dá)佩斯條約分別將有關(guān)微生物保藏在下述保藏機(jī)構(gòu)。農(nóng)桿菌KNK712,保藏日1988年5月31日,保藏號為FERM BP-1900;假單胞菌KNK003A,保藏日1990年12月1日,保藏編號為FERM BP-3181;芽胞桿菌KNK245,保藏日1994年11月2日,保藏編號為FERM BP-4863;大腸桿菌HB101 pAH1043,保藏日1994年11月2日,保藏編號為FERM BP-4865;大腸桿菌HB101pTH104,保藏日1994年11月2日,保藏編號為FERM BP-4864;大腸桿菌HB101 pPHD301,保藏日1994年11月2日,保藏編號為FERM BP-4866。
保藏機(jī)構(gòu)名稱National Institute of Bioscience andHuman-Technology(以前的Fermentation Research Institute),Agency of Industrial Science & Technology,Ministry of InternationalTrade & Industry。
地址1-3,Higashi 1 Chome Tsukuba-shi Ibaraki-ken 305,日本。
序列表序列1序列長度2105序列類型核酸序列102030405060GTCGACTTCAACTCGTTCCGCCTCGAACGAGAGCGCTCTGCACAGAATCGTCTTCGCTAG708090 100 110 120GCCGCCGTTCCGCTTGACAGCTTCAAAACACCATGCAAACTTGTATAAAGAATTACATTC130 140 150 160 170 180CATATACGGAACAAACTCTTCAATCCTGAGAGCGACATCATGGACATCATTATCAAAAACMetAspIleIleIleLysAsn190 200 210 220 230 240GGAACCATCGTGACCGCGGATGGCATTTCTCGCGCCGATCTCGGGATCAAGGATGGCAAGGlyThrIleValThrAlaAspGlyIleSerArgAlaAspLeuGlyIleLysAspGlyLys
250 260 270 280 290 300ATCACCCAGATCGGCGGCGCGCTCGGCCCAGCGGAGCGGACGATCGACGCGGCCGGCCGCIleThrGlnIleGlyGlyAlaLeuGlyProAlaGluArgThrIleAspAlaAlaGlyArg310 320 330 340 350 360TACGTCTTTCCGGGCGGCATAGACGTTCACACGCATGTCGAAACGGTCAGCTTCAACACGTyrValPheProGlyGlyIleAspValHisThrHisValGluThrValSerPheAsnThr370 380 390 400 410 420CAGTCGGCCGACACGTTCGCAACAGCGACGGTCGCGGCCGCCTGTGGCGGAACGACAACCGlnSerAlaAspThrPheAlaThrAlaThrValAlaAlaAlaCysGlyGlyThrThrThr430 440 450 460 470 480ATCGTCGATTTCTGTCAGCAGGATCGCGGCCACAGCCTGGCGGAACCCGTCCCCAAGTGGIleValAspPheCysGlnGlnAspArgGlyHisSerLeuAlaGluProValProLysTrp490 500 510 520 530 540GACGGTATGGCCGGCGGCAAGTCGGCGATCGATTACGGCTACCACATCATCGTGCTCGACAspGlyMetAlaGlyGlyLysSerAlaIleAspTyrGlyTyrHisIleIleValLeuAsp550 560 570 580 590 600CCGACCGACAGCGTGATTGAGGAGCTGGAGGTGCTTCCCGATCTTGGCATTACCTCCTTCProThrAspSerValIleGluGluLeuGluValLeuProAspLeuGlyIleThrSerPhe
610 620 630 640 650 660AAGGTCTTCATGGCCTATCGCGGCATGAACATGATCGACGACCTGACGCTGCTGAAGACGLysValPheMetAlaTyrArgGlyMetAsnMetIleAspAspValThrLeuLeuLysThr670 680 690 700 710 720CTCGACAAGGCGGTCAAGACCGGATCGCTCGTCATGGTGCACGCGGAAAACGGCGACGCCLeuAspLysAlaValLysThrGlySerLeuValMetValHisAlaGluAsnGlyAspAla730 740 750 760 770 780GCCGACTATCTGCGCGACAAGTTCGTGGCCGAGGGCAAAACCGCGCCGATCTACCACGCGAlaAspTyrLeuArgAspLysPheValAlaGluGlyLysThrAlaProIleTyrHisAla790 800 810 820 830 840CTCAGCCGCCCGCCCCGGGTCGAAGCCGAGGCAACCGCGCGGGCCCTCGCCCTGGCCGAALeuSerArgProProArgValGluAlaGluAlaThrAlaArgAlaLeuAlaLeuAlaGlu850 860 870 880 890 900ATCGTCAACGCCCCGATCTACATAGTCCATGTGACCTGCGAGGAGTCCCTTGAGGAGGTGIleValAsnAlaProIleTyrIleValHisValThrCysGluGluSerLeuGluGluVal910 920 930 940 950 960ATGCGCGCAAAATCGCGAGGCGTCCGCGCTCTGGCGGAAACCTGCACGCATTACCTTTACMetArgAlaLysSerArgGlyValArgAlaLeuAlaGluThrCysThrHisTyrLeuTyr
970 980 990 1000 1010 1020CTCACCAAGGAAGACCTGGAGCGGCCGGATTTCGAAGGTGCGAAATACGTTTTCACACCGLeuThrLysGluAspLeuGluArgProAspPheGluGlyAlaLysTyrValPheThrPro1030 1040 1050 1060 1070 1080CCGGCCCGCGCGAAGAAAGACCATGACGTTCTCTGGAACGCACTCAGAAACGGTGTGTTCProAlaArgAlaLysLysAspHisAspValLeuTrpAsnAlaLeuArgAsnGlyValPhe1090 1100 1110 1120 1130 1140GAAACGGTTTCCTCCGACCATTGCTCCTGGCTCTTCAAGGGGCACAAGGACCGGGGCCGGGluThrValSerSerAspHisCysSerTrpLeuPheLysGlyHisLysAspArgGlyArg1150 1160 1170 1180 1190 1200AACGACTTTCGCGCCATCCCGAACGGCGCGCCGGGCGTCGAGGAACGGTTGATGATGGTCAsnAspPheArgAlaIleProAsnGlyAlaProGlyValGluGluArgLeuMetMetVal1210 1220 1230 1240 1250 1260TATCAGGGCGTCAACGAAGGCCGGATTTCCCTTACCCAGTTCGTGGAACTGGTCGCCACGTyrGlnGlyValAsnGluGlyArgIleSerLeuThrGlnPheValGluLeuValAlaThr1270 1280 1290 1300 1310 1320CGCCCGGCCAAGGTCTTCGGAATGTTTCCGCAAAAGGGGACGATCGCGGTCGGTTCGGACArgProAlaLysValPheGlyMetPheProGlnLysGlyThrIleAlaValGlySerAsp
1330 1340 1350 1360 1370 1380GCCGACATCGTCCTTTGGGACCCCGAGGCCGAAATGGTGATCGAACAGACCGCCATGCACAlaAspIleValLeuTrpAspProGluAlaGluMetValIleGluGlnThrAlaMetHis1390 1400 1410 1420 1430 1440AACGCCATGGATTACTCCTCCTACGAGGGACACAAGGTCAAGGGCGTGCCGAAGACGGTGAsnAlaMetAspTyrSerSerTyrGluGlyHisLysValLysGlyValProLysThrVal1450 1460 1470 1480 1490 1500CTCCTGCGTGGCAAGGTTATCGTCGACGAAGGTTCCTATGTCGGCGAACCGACGGACGGGLeuLeuArgGlyLysValIleValAspGluGlySerTyrValGlyGluProThrAspGly1510 1520 1530 1540 1550 1560AAATTCCTGAAACGTCGCAAATACAAGCAGTAAACCGGCATTCTACGAGAACGATGATGALysPheLeuLysArgArgLysTyrLysGln***1570 1580 1590 1600 1610 1620CAATACACACTTCGACAAGTGTCGTCGCGCCTGACGGCGACAGCGTTGCAAGCGGCTTCG1630 1640 1650 1660 1670 1680ACAGGCGTTACGGCGCACCGACATTCAATCAGATACCATCGGGCGAACGGCTGGTGTCGG1690 1700 1710 1720 1730 1740ACTGCATCGCGCTGATGCTGAAGCACCGTTCCGTCAGACGCTACACGGGGGAACCTCTCC
1750 1760 1770 1780 1790 1800CCCCAGGCACGCTGGAAATGCTGATGGCGGCGGGTCAGTCGGCTGCGACATCCTCCAACA1810 1820 1830 1840 1850 1860TGCAGACCGTGTCGGTCATCGCGGTGACGGACCCCGAGAAAAAGACCCGTCTCGCGAAGA1870 1880 1890 1900 1910 1920CATGCGCCGGGCAGGACTTCATCGCCAACGCTCCTGTGCTCCTGTGTTTCGTGACGGATC1930 1940 1950 1960 1970 1980TTGCGCGCCCCGCCAGGGTCGCCTCCACGATTGGCGCCGATCTTTTCGCGTTGCCGATGA1990 2000 2010 2020 2030 2040TCGACACCTTTCTGGCGTCCATCAGCGATTGTTCCATCTTCGCGCAAAACCTTGTTCTCG2050 2060 2070 2080 2090 2100CCGCGGAATCGCTCGGCATGGGCACCTGCTATGTCGGGAGCCTGCGCAACCGGCCTGATCCCGGG
序列2序列長度1569序列類型核酸序列102030405060TCGGAACCTGAAAACGAAATATCCCGCCGGACGGTGGGAAGGTGAAAGGAGGAGTCTCCAMet708090 100 110 120TGACAACAGTTATCAAGGGTGGAACGATCGTCGCCGCCGATCGCAGCTATGAAGCCGATAThrThrValIleLysGlyGlyThrIleValAlaAlaAspArgSerTyrGluAlaAspIle130 140 150 160 170 180TCCTGATCGAAGGCGAAAAGATCGCCCAGATCGGCAGGGATCTGCAGGGCGACAAGATTGLeuIleGluGlyGluLysIleAlaGlnIleGlyArgAspLeuGlnGlyAspLysIleVal190 200 210 220 230 240TAGACGCCGAGGGTGCCTATATCATTCCCGGCGGCATCGATCCTCACACGCATCTTGAAAAspAlaGluGlyAlaTyrIleIleProGlyGlyIleAspProHisThrHisLeuGluMet250 260 270 280 290 300
TGCCCTTTATGGGCACGACCACTGCCGAGACCTGGGAGTCCGGCACTTTCGCGGCTCTCTProPheMetGlyThrThrThrAlaGluThrTrpGluSerGlyThrPheAlaAlaLeuSer310 320 330 340 350 360CCGGCGGCACCACGATGGTTGTGGATTTCGTCATTCCCGGGCCGGCGGGAATGCTTGCCGGlyGlyThrThrMetValValAspPheValIleProGlyProAlaGlyMetLeuAlaAla370 380 390 400 410 420CCTTCGATCAATGGCAGGAGAGGGCAGCGCGCCAGGCTTCGTCCGACTACTCGCTGCATAPheAspGlnTrpGlnGluArgAlaAlaArgGlnAlaSerSerAspTyrSerLeuHisMet430 440 450 460 470 480TGTGCGTGACCGGCTGGTCAAAGCAGATCTTCGAGGACATGGCGAAGGTGGTCGAGCGCGCysValThrGlyTrpSerLysGlnIlePheGluAspMetAlaLysValValGluArgGly490 500 510 520 530 540GTGTCAACACCTTCAAGCATTTCATGGCCTATAAGGGCGCGCTGATGGTGAACGACGACGValAsnThrPheLysHisPheMetAlaTyrLysGlyAlaLeuMetValAsnAspAspGlu550 560 570 580 590 600AGATGTTCGCCTCCTTCCAGCGCTGCGCCGCCCTGGGCGCCCTCCCGCTCGTGCATGCGGMetPheAlaSerPheGlnArgCysAlaAlaLeuGlyAlaLeuProLeuValHisAlaGlu610 620 630 640 650 660
AAAACGGCGACATCGTCGCCTCGCTGCAGCAGAAATATATGCAGGAAGGCCTCACGGGTCAsnGlyAspIleValAlaSerLeuGlnGlnLysTyrMetGlnGluGlyLeuThrGlyPro670 680 690 700 710 720CGGAGGCTCATGCCTATTCCCGCCCGCCGGAGGTCGAGGGCGAGGCCACCAACCGCGCCAGluAlaHisAlaTyrSerArgProProGluValGluGlyGluAlaThrAsnArgAlaIle730 740 750 760 770 780TCATGATCGCCGATGCCGCAGGCGTGCCGGTCTATATCGTGCATGTCTCCTGTGAACAGGMetIleAlaAspAlaAlaGlyValProValTyrIleValHisValSerCysGluGlnAla790 800 810 820 830 840CGCACGAAGCGATCCGCCGCGCACGCCAGAAGGGAATGCGCGTCTATGGCGAGCCGCTCAHisGluAlaIleArgArgAlaArgGlnLysGlyMetArgValTyrGlyGluProLeuIle850 860 870 880 890 900TCCAGCACCTGCTGCTTGACGAGTCCGAGTACAAGAGAGCCGACTGGGACGAGGCGGCTCGlnHisLeuLeuLeuAspGluSerGluTyrLysArgAlaAspTrpAspGluAlaAlaArg
910 920 930 940 950 960GGCGGGTGATGTCCGCGCCATTCCGCGATAAAAGCCATCAGGACAGCCTCTGGGCTGGGCArgValMerSerAlaProPheArgAspLysSerHisGlnAspSerLeuTrpAlaGlyLeu970 980 990 1000 1010 1020TCGCAGCGGGCTCGCTGCAGGTCGTGGCAACGGACCACTGCGCCTTTACCACTGAACAGAAlaAlaGlySerLeuGlnValValAlaThrAspHisCysAlaPheThrThrGluGlnLys1030 1040 1050 1060 1070 1080AGCGGCTGGGACTCAACGACTTCACGAAAATCCCGAACGGCACCGGGGGGTTAGAGGACCArgLeuGlyLeuAsnAspPheThrLysIleProAsnGlyThrGlyGlyLeuGluAspArg1090 1100 1110 1120 1130 1140GGTTGTCGCTGCTCTGGACCTATGGCGTGAAGACGGGGCGGCTCACGCCTAACGAATTCGLeuSerLeuLeuTrpThrTyrGlyValLysThrGlyArgLeuThrProAsnGluPheVal1150 1160 1170 1180 1190 1200TCGCCGTCACCTCCACCAATATCGCACAAATCCTGAACATCTATCCGCAAAAGGGCGCAA
AlaValThrSerThrAsnIleAlaGlnIleLeuAsnIleTyrProGlnLysGlyAlaIle1210 1220 1230 1240 1250 1260TCCTGCCTGGGTCCGATGCCGACCTCGTCGTCTGGGATCCAGCCAAATCGAAGAAGATCALeuProGlySerAspAlaAspLeuValValTrpAspProAlaLysSerLysLysIleThr1270 1280 1290 1300 1310 1320CTGCTTCCGCTCAGAAATCCATCATCGACTACAATATCTTCGAGGGCTACGAGGTGACCGAlaSerAlaGlnLysSerIleIleAspTyrAsnIlePheGluGlyTyrGluValThrGly1330 1340 1350 1360 1370 1380GCATGCCGCGATACACGCTCTCACGCGGCGAGGTCGTATGGGGCGAGGAAGGCAGCAACGMetProArgTyrThrLeuSerArgGlyGluValValTrpGlyGluGluGlySerAsnGlu1390 1400 1410 1420 1430 1440AACCGCGGCCCGGTCGCGGTAGGTTCGTCGAGCGCCGGCCCTTTGCCGCCGTCAGCCGTGProArgProGlyArgGlyArgPheValGluArgArgProPheAlaAlaValSerArgAla1450 1460 1470 1480 1490 1500
CCCTTTCAACCTGGAAGGAGATCGTCGCTCCGCGTGCGGTGGAGCGCTCGGCAAAGCATALeuSerThrTrpLysGluIleValAlaProArgAlaValGluArgSerAlaLysHisMet1510 1520 1530 1540 1550 1560TGCCGATCGGCGTTTGAATTTTGGGAGGCAGGCTCGAACTACGGTTTGGCCTGTCTCAGGProIleGlyVal***ACAATCCAT
權(quán)利要求
1.一種轉(zhuǎn)化型微生物,它是用含有編碼一種乙內(nèi)酰脲酶的基因的DNA片段和一種載體DNA的重組DNA轉(zhuǎn)化一種宿主微生物所獲得的,其中所述乙內(nèi)酰脲酶能通過不對稱裂解水解作用將5-取代乙內(nèi)酰脲轉(zhuǎn)化成相應(yīng)的D-N-氨基甲?;?α-氨基酸,其中所述DNA片段源于保藏編號為FERM BP-3181的假單胞菌KNK003A。
2.如權(quán)利要求1的轉(zhuǎn)化型微生物,其中所述宿主微生物選自屬于埃希氏菌屬(Escherichia)、假單胞菌屬(Pseudomonas)、黃桿菌屬(Flavobacterium)、芽胞桿菌屬(Bacillus)、沙雷菌屬(Serratia)、農(nóng)桿菌屬(Agrobacterium)、棒狀桿菌屬(Corynebacterium)或短桿菌屬(Brevibacterium)的微生物。
3.如權(quán)利要求2的轉(zhuǎn)化型微生物,其中所述轉(zhuǎn)化型微生物是保藏編號為FERM BP-4866的大腸桿菌HB101 pPHD301。
4.一種生產(chǎn)一種能通過不對稱裂解水解作用將5-取代乙內(nèi)酰脲轉(zhuǎn)化成相應(yīng)的D-N-氨基甲?;?α-氨基酸的酶的方法,包括使用權(quán)利要求1-3中任一項(xiàng)的轉(zhuǎn)化型微生物。
5.一種用于生產(chǎn)D-N-氨基甲酰基-α-氨基酸的方法,包括使用按權(quán)利要求4的方法所獲得的酶。
6.如權(quán)利要求5的方法,其中所述5-取代乙內(nèi)酰脲是一種由下面的通式(1)所代表的化合物 其中,R是苯基,由羥基取代的苯基,烷基,取代烷基,芳烷基或噻吩基。
7.一種通過重組源于保藏編號為FERM BP-3181的假單胞菌KNK003A的編碼乙內(nèi)酰脲酶的DNA片段和質(zhì)粒pUC18所獲得的重組質(zhì)粒,它具有圖5所示的限制酶圖。
8.一個編碼一種具有通過不對稱裂解水解作用將5-取代乙內(nèi)酰脲轉(zhuǎn)化成相應(yīng)的D-N-氨基甲?;?α-氨基酸的酶促活性的蛋白的基因,其中所述基因編碼序列2中所示氨基酸序列。
9.一種DNA片段,它含有編碼一種具有通過不對稱裂解水解作用將5-取代乙內(nèi)酰脲轉(zhuǎn)化成相應(yīng)的D-N-氨基甲?;?α-氨基酸的酶促活性的蛋白的基因,所述基因具有序列2中所示60位-1517位核甘酸的核甘酸序列或者含有編碼一種相應(yīng)于序列2中所示60位-1517位核甘酸的核甘酸序列的氨基酸序列的另一種核甘酸序列。
10.一種酶蛋白,它含有序列2中所示氨基酸序列并且具有通過不對稱裂解水解作用將5-取代乙內(nèi)酰脲轉(zhuǎn)化成相應(yīng)的D-N-氨基甲?;?α-氨基酸的酶促活性。
全文摘要
披露了用一種乙內(nèi)酰脲酶由5-取代的乙內(nèi)酰脲生產(chǎn)D-N-氨基甲?;粒被岬姆椒?,所述乙內(nèi)酰脲酶由一種用含有編碼乙內(nèi)酰脲酶的基因的DNA片段和一種載體DNA的重組DNA轉(zhuǎn)化的轉(zhuǎn)化型微生物生產(chǎn),所述乙內(nèi)酰脲酶源自芽胞桿菌屬(Bacillus)、農(nóng)桿菌屬(Agrobacterium)或假單胞菌屬的一種具體微生物。
文檔編號C12N15/55GK1916164SQ200610100709
公開日2007年2月21日 申請日期1995年12月26日 優(yōu)先權(quán)日1994年12月28日
發(fā)明者難波弘憲, 矢島麗嘉, 高野昌行, 山田勇喜雄, 池中康裕, 高橋里美 申請人:鐘淵化學(xué)工業(yè)株式會社