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      Dna序列在乳品業(yè)領(lǐng)域中的應(yīng)用的制作方法

      文檔序號:576056閱讀:241來源:國知局
      專利名稱:Dna序列在乳品業(yè)領(lǐng)域中的應(yīng)用的制作方法
      技術(shù)領(lǐng)域
      本發(fā)明涉及生物技術(shù)領(lǐng)域,具體涉及一條DNA序列在乳品業(yè)領(lǐng)域中的應(yīng)用。
      背景技術(shù)
      乳品行業(yè)中需要用到乳糖酶(又稱β _半乳糖苷酶)來將乳糖水解為易吸收和甜味品質(zhì)好的半乳糖和葡萄糖,并且在水解糖過程中還可以發(fā)生轉(zhuǎn)糖苷反應(yīng),生成具有多種 生理功能的低聚半乳糖?,F(xiàn)在用于乳品行業(yè)的乳糖酶雖然有多種,但是這些酶均為中溫或高溫β -半乳糖 苷酶,反應(yīng)溫度高,低溫下酶活低,不利于保留牛奶中的營養(yǎng)物質(zhì)和風(fēng)味物質(zhì),難以滿足生 產(chǎn)綠色有機(jī)乳制品的要求,因此尋找在低溫下還能保持較高乳糖水解酶活性的新酶是當(dāng)今 乳品業(yè)發(fā)展的迫切需要。尋找在低溫下還能保持較高乳糖水解酶活性的新酶,具有如下優(yōu)點低溫下進(jìn)行 反應(yīng),可節(jié)省大量能源,最大限度地保留乳品中的營養(yǎng)和風(fēng)味物質(zhì),而且也減少了染菌的可 能,此外,低溫下能夠保持較高乳糖分解酶活性的酶很容易通過加熱失活,有助于乳品的某 些后處理工序。一種適于食品工業(yè)乳品處理的理想的低溫乳糖分解酶應(yīng)具有以下優(yōu)點在低溫情 況下酶活高,最適PH接近天然牛奶的ρΗ值(ρΗ 6. 7 6. 8),酶活不被牛奶中的鈉離子、鈣 離子等抑制,以乳糖為底物時的酶活高。目前雖然已有許多不同來源的低溫半乳糖苷 酶基因被克隆,但這些低溫β “半乳糖苷酶大多數(shù)僅在25 50°C、堿性條件下表現(xiàn)出最大 酶活,而在低溫和中性PH條件下酶活很低。目前市面上應(yīng)用最廣的商品化的半乳糖苷酶(來自克魯維乳酸酵母),其最適 溫度為50°C,在20°C時的酶活非常低,酶學(xué)特性也不理想。僅有幾種β-半乳糖苷酶在低 溫和中性條件下酶活較好,然而這些酶卻由于表達(dá)量不佳或重組酶蛋白的可溶性不好等原 因,也難以規(guī)?;a(chǎn)。因此迄今國內(nèi)外尚未有很理想的在低溫下可保持較高乳糖分解酶 活性的低溫半乳糖苷酶進(jìn)入規(guī)?;a(chǎn)。宏基因組學(xué)是指直接提取環(huán)境中所有微生物的基因組DNA,克隆到合適的載體,構(gòu) 建宏基因組文庫,將環(huán)境中全部微生物的核酸信息收集在一起,并運(yùn)用序列篩選或功能篩 選方式從文庫中獲得有用的酶、抗生素、活性物質(zhì)等。宏基因組學(xué)完全不依賴于環(huán)境中微生 物的分離和培養(yǎng),為從不同自然生境中的未培養(yǎng)微生物中尋找新的基因資源和活性物質(zhì)提 供了有力的技術(shù)手段。

      發(fā)明內(nèi)容
      本發(fā)明的目的在于針對現(xiàn)有技術(shù)的不足,提供一條DNA序列在乳品業(yè)領(lǐng)域中的應(yīng) 用,該DNA序列表達(dá)的重組蛋白能在30°C以下保持較高的、穩(wěn)定的乳糖分解活性,且該蛋白 具有高可溶性特性表達(dá)。本發(fā)明的上述目的是通過如下方案予以實現(xiàn)的
      本發(fā)明人采用宏基因組技術(shù),從土壤宏基因組文庫中分離得到多條新的DNA序列,通過對這些序列進(jìn)行結(jié)構(gòu)和功能性質(zhì)的研究,發(fā)現(xiàn)其中一條DNA序列表達(dá)的重組蛋白 具有低溫下依然保持較高乳糖分解活性以及高可溶性表達(dá)等特點,可用于乳品業(yè)中,滿足 低溫下進(jìn)行乳糖分解作用的需求。上述DNA序列已經(jīng)登錄于GenBank,其GenBank登錄號為GQ274002,其核苷酸序列 如SEQ ID NO :1所示,該核苷酸序列編碼的多肽,其氨基酸序列如SEQ ID NO :3所示,本發(fā) 明人將SEQ ID NO :1所示DNA序列克隆到原核表達(dá)載體上,轉(zhuǎn)化大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞,通過 誘導(dǎo)表達(dá)得到重組蛋白,然后對該重組蛋白進(jìn)行特性研究,研究結(jié)果如下所示該重組蛋白高度可溶,無包涵體形成。該重組蛋白的分子量為76kD,等電點為3. 9。該重組蛋白通過酶活試驗,發(fā)現(xiàn)具有乳糖分解的作用,且乳糖分解時的最適反應(yīng) PH為7. 0,在pH 6. 0 8. 0的范圍內(nèi)能保持穩(wěn)定的乳糖分解活性,且該區(qū)域的乳糖分解活 性為最大活性的80%以上。該重組蛋白不但能夠分解乳糖,而且可以在較低的溫度下實現(xiàn)乳糖分解,其最 適溫度為42°C,35°C時可達(dá)最大乳糖分解活性的90%,20°C時可達(dá)最大乳糖分解活性的 54%,甚至在0°C時仍可達(dá)到最大乳糖分解活性最大酶活的11%,由此可以看出該重組蛋 白在30°C以下仍能保持穩(wěn)定的乳糖分解活性。該重組蛋白對乳糖和鄰硝基-β -D-半乳糖苷(ONPG)的最大酶活分別高達(dá)25. 4U/ mg 禾口 243U/mg。當(dāng)體系中存在低濃度(1 IOmM)的Mg2+、Zn2+、Mn2+和Fe2+時,這些低濃度的金屬 離子并不會對該重組蛋白的乳糖分解活性有明顯影響;ImMCu2+對該重組蛋白的乳糖分解 活性有強(qiáng)烈的抑制作用;而IOmM的Na+、K+或Ca2+可導(dǎo)致該重組蛋白的乳糖分解活性有輕 微增加。通過上述重組蛋白的特性研究結(jié)果可以看出,SEQ ID NO 1所示DNA序列所編碼 的多肽在低溫情況下可以保持較高的穩(wěn)定的乳糖分解活性,而且其最適合PH接近天然牛 奶的PH值(pH 6. 7 6. 8),其乳糖分解活性也不被牛奶中的鈉離子、鈣離子等抑制,以乳糖 為底物時酶活高,因此非常適用于食品工業(yè)中對乳品的處理,尤其可滿足乳品業(yè)對低溫乳 糖分解酶的需求。與現(xiàn)有技術(shù)相比,本發(fā)明具有如下有益效果本發(fā)明人首先通過宏基因組學(xué)技術(shù)得到新的尚未有功能研究的DNA序列,然后通 過基因克隆技術(shù),對這些DNA序列分別進(jìn)行結(jié)構(gòu)和功能的分析研究,最終獲得一條DNA序 列,該DNA序列在原核表達(dá)系統(tǒng)中表達(dá)的重組蛋白可在低溫情況下保持較高的、穩(wěn)定的乳 糖分解活性,而且該蛋白還具有高可溶性表達(dá)的特性,可應(yīng)用于乳品業(yè)中,有效解決乳品業(yè) 當(dāng)前存在的低溫乳糖分解酶匱乏的問題。


      圖1為實施例3中的SDS-PAGE電泳圖;其中,M為標(biāo)準(zhǔn)蛋白分子量標(biāo)記,1為粗的重組蛋白,2為純化后的重組蛋白。
      具體實施例方式下面結(jié)合具體實施例對本發(fā)明做進(jìn)一步地描述,但具體實施例并不對本發(fā)明做任 何限定。實施例1 土壤樣品中宏基因組DNA的提取土壤樣品采集自廣東省肇慶鼎湖山(23° 10' N,112° 31' E)。土壤樣品中宏基因組DNA的提取稱取5g土壤樣品,加入離心管中,與13. 5mL DNA 提取液(lOOmM Tris-HClUOOmM EDTA、lOOmM 磷酸鈉、1. 5M NaCl,l% CTAB, pH 8.0)混合 后,再加入100 u L蛋白酶K(10mg/mL),于37°C、225rpm的搖床上搖動溫育30min,接著加 入1. 5mL 20% SDS,65°C水浴2h,每隔15 20min輕輕顛倒離心管幾下,室溫6000g離心 lOmin,收集上清,轉(zhuǎn)移到一新的離心管中,然后土壤沉淀中再加入4. 5mL DNA提取液(配方 同前述)和0. 5mL 20%的SDS,渦旋10s,65°C水浴lOmin,室溫6000g離心lOmin,收集上 清,并與上次上清合并。重復(fù)上述操作,收集上清與前兩次上清合并。上清與等體積的氯 仿-異戊醇(24 1體積比)混合,離心,吸取水相轉(zhuǎn)移至另一離心管中,以0.6倍體積的 異丙醇室溫沉淀lh,室溫16000g離心20min,收集核酸沉淀,用冷的70%乙醇洗滌沉淀,重 懸于滅菌的去離子水中,最終體積為500 yL。實施例2 土壤宏基因組文庫的構(gòu)建和DNA序列的獲得用Sau3AI部分酶切實施例1所提取的土壤宏基因組DNA,并電泳回收2 8kb的 酶切片段?;厥盏降腄NA片段與經(jīng)BamHI酶切和CIAP酶去磷酸化處理的pZEr0_2載體 (Invitrogen)連接,電擊轉(zhuǎn)化E. coli ToplO感受態(tài)細(xì)胞,并涂布含有50 u g/mL卡那霉素、 0. 01% X-Gal和0. 75mM IPTG的LB固體平板,由此構(gòu)建了一個庫容量達(dá)12000個轉(zhuǎn)化子、 多樣性好的宏基因組文庫。通過篩庫獲得了三個具有藍(lán)色的克隆,其中藍(lán)色最深的一個克隆被選出進(jìn)行測序 和進(jìn)一步的研究。測序結(jié)果顯示該DNA序列由2019個堿基組成,其核苷酸序列如SEQ ID NO :1所示,該DNA序列編碼的多肽,含有672個氨基酸,其氨基酸序列如SEQ ID NO :3所示, 預(yù)測的分子量為75. 95kDa,該DNA序列已提交GenBank數(shù)據(jù)庫,其登錄號為GQ274002。實施例3 DNA序列編碼多肽在大腸桿菌中的表達(dá)和純化將實施例2篩選到的含有SEQ ID NO :1所述核苷酸序列的重組菌接種于50mL LB 培養(yǎng)基(含有氨芐青霉素100ii g/ml),37°C,250rpm搖床培養(yǎng)12 16小時,提取重組質(zhì)粒。設(shè)計引物F1和F2,引物兩端引入能插入pET32a(+)質(zhì)粒的BamHI和Hindlll酶切 位點。兩條引物的序列如下上游引物F1,其核苷酸序列如SEQ ID NO 4所示;下游引物F2,其核苷酸序列如SEQ ID N0 5所示。以重組質(zhì)粒為模板,采用上述引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增。PCR擴(kuò)增體系總體積為50 ill,含滅菌蒸餾水32 ill,5 X PCR Buffer (Mg2+已加)10 ii 1,dNTP Mixture 4 u 1(每種堿基各 2. 5mM),兩種引物各 lu l(10uM),模板 DNA 1u 1(lng),TaKaRa PrimeSTAR HS DNA Polymerase 1u 1(2. 5U)。PCR擴(kuò)增條件98°C 10秒鐘,68°C 2分鐘,反應(yīng)30個循環(huán)。PCR產(chǎn)物約為2kb左右, 經(jīng)BamHI/Hindlll于37°C酶切6小時,進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳,然后回收目的片段,酶切后連 接入pET32a(+) (Invitrogen)質(zhì)粒中,然后將重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化宿主菌E. coli BL21(DE3),轉(zhuǎn)化液涂布含lOOy g/mL氨芐青霉素的LB平板,37°C過夜培養(yǎng)。提取陽性菌落質(zhì)粒,雙酶切 驗證后,送交測序。對測序正確的重組菌進(jìn)行乳糖酶的誘導(dǎo)表達(dá)研究,其步驟如下將重組菌種接種 到一個250ml的三角瓶中,瓶中含有50mL LB液體培養(yǎng)基(含50 y g/mL氨芐青霉素), 37 °C培養(yǎng)直至0D6(1(1達(dá)到0. 6,然后加入IPTG至終濃度為0. 75mM, 37 °C, 225rpm繼續(xù)培養(yǎng) 5小時(0D6C1C1= 1.83)以誘導(dǎo)靶蛋白表達(dá)。4°C下6000g離心20min收獲細(xì)胞。將細(xì)胞沉 淀用lOOmM Tris-HCl緩沖液(pH 6.8)洗兩次,然后細(xì)胞被懸浮于10ml 1 XHis-binding buffer (500mMNaCl,20mM Tris-HCl,5mM咪唑,pH 7. 0),在冰水浴中進(jìn)行超聲波破碎。將細(xì) 胞破碎液于15000g離心20min以除去細(xì)胞碎片,所得上清即為粗重組蛋白,將該粗重組蛋 白用Ni-NTA Agarose (QIAGEN)親合柱層析除去不帶6個His標(biāo)記的雜蛋白,從而得到純化 后的重組蛋白,親合柱層析的具體操作步驟按QIAGEN公司產(chǎn)品的說明書進(jìn)行即可。對獲得的粗的重組蛋白和純化后的重組蛋白進(jìn)行SDS-PAGE電泳(如圖1所 示)。SDS-PAGE電泳結(jié)果表明,SEQ ID NO :1所述核苷酸序列所編碼的多肽在大腸桿菌 BL2KDE3)中的表達(dá)量非常高,每升培養(yǎng)液可獲得279mg純的蛋白,而且所有重組蛋白都是 可溶的,無包涵體形成,這種高可溶性表達(dá)特性有利于將本發(fā)明的多肽應(yīng)用于原核系統(tǒng)中 的工業(yè)化生產(chǎn)。利用 Quantity One software (BioRad Laboratories Inc. , Hercules, CA)軟件分 析蛋白表達(dá)量,結(jié)果顯示本發(fā)明的多肽在大腸桿菌BL21(DE3)的總可溶性蛋白中的含量高 達(dá) 47. 5%0 實施例4 DNA序列在原核表達(dá)系統(tǒng)中表達(dá)的重組蛋白的特性研究本實施例對實施例2所得DNA序列(其核苷酸序列如SEQ ID N0 1所述)在原核 表達(dá)系統(tǒng)中表達(dá)的重組蛋白進(jìn)行了各種特性的研究。1、分子量采用常規(guī)的SDS-PAGE電泳和Native gradient PAGE (非解離梯度聚丙烯酰胺凝 膠電泳)對蛋白進(jìn)行分子量研究。Native gradient PAGE結(jié)果顯示該蛋白的分子量約為76KDa(與實施例2中預(yù)測 的分子量75. 95kDa相符),SDA-PAGE電泳結(jié)果顯示該蛋白的單亞基分子量也約為76KDa, 表明實施例2制備所得DNA序列的重組蛋白為一個單亞基蛋白。2、pH值和溫度對蛋白分解乳糖活性的影響以0NPG為底物,分別測定pH值和溫度對蛋白活性的影響。最適pH研究用不同pH(pH 5. 0 10. 0)的緩沖液配制蛋白分解乳糖的反應(yīng)體 系,結(jié)果表明,實施例2所得DNA序列在原核表達(dá)系統(tǒng)中的重組蛋白,其最適pH為7. 0,接近 天然牛奶的pH值(6. 7 6. 8)。因此該蛋白適于降解牛奶中的乳糖。另外pH穩(wěn)定性的研 究結(jié)果表明,該蛋白在pH 6. 0 8. 0范圍內(nèi)比較穩(wěn)定,其活性為最大分解乳糖活性的80% 以上。最適溫度研究蛋白分解乳糖的反應(yīng)體系采用一系列的溫度條件,0 50°C,結(jié) 果表明,實施例2所得DNA序列在原核表達(dá)系統(tǒng)中的重組蛋白的最適反應(yīng)溫度為42°C,在 35°C和20°C分別展現(xiàn)了 90%、54%的最大分解乳糖活性,即使溫度降到0°C,仍有11%的最 大分解乳糖活性,這表明該蛋白可在低溫下分解乳糖。溫度穩(wěn)定性研究的結(jié)果表明上述蛋
      6白在30°C以下很穩(wěn)定,分解乳糖活性高達(dá)最大活性的90%以上。但是35°C以上活性降低較 快,溫度達(dá)到50°C時,活性幾乎完全失去。通過上述溫度試驗可以看出,實施例2所得DNA序列在原核表達(dá)系統(tǒng)中的重組蛋 白可以在低溫下保持很好的乳糖分解活性,而且該蛋白在溫度升高的時候就會失去活性, 很容易通過加熱失活,有助于乳品的某些后處理工序。本實施例的酶活測定方法為在酶對鄰硝基-D-半乳糖苷(0NPG)活性的測定 中,10iiL 純酶溶液(0. 13iig)與 990iiL 的 lOOmM Tris-HCl 緩沖液溶液(pH 7. 0,含有 22mM 0NPG)混合,于42V反應(yīng)10分鐘,加lml 1M Na2C03終止反應(yīng),測定OD420值。一個酶活單位 定義為每分鐘釋放1 P mol的o-硝基苯所需酶量。3、部分金屬離子和化合物對蛋白分解乳糖活性的影響。以0NPG為底物,在蛋白分解乳糖活性的測定反應(yīng)體系中分別加入終濃度為10mM 的 MgCl2、MnCl2、KC1、NaCl 和 CaCl2,終濃度為 ImM 的 FeCl2、CuS04 和 ZnS04 以及終濃度 為lOOmM EDTA,測定相對活性。結(jié)果顯示,加入lOOmM EDTA對蛋白活性沒有影響,而加入 MgCl2、ZnS04、MnCl2和FeCl2對蛋白活性也沒有明顯的影響??墒牵尤隝mM CuS04對蛋白 活性產(chǎn)生強(qiáng)烈的抑制作用。另外,加入低濃度的Na+、K+或Ca2+對蛋白活性有輕微的提高作 用。4、蛋白的底物專一性研究。將實施例2所得DNA序列在原核表達(dá)系統(tǒng)中的重組蛋白加入100mMTriS-HCl緩沖 液(pH 7. 0)中,緩沖液中分別含有終濃度為5mM的12種不同底物,在42°C溫育5分鐘,測 定活性。結(jié)果表明,該蛋白能水解所有的12種底物,對0NPG的活性最高(100% ), 對 P -nitrophenyl-3 -D-glactopyranoside^ p -nitrophenyl-3 _D_arabinosi_de、 P -nitrophenyl-^ -D-glucuronide、 p -nitrophenyl-^ -D-mannoside 的活性分別為 44. 8%.52. 8%.49. 5%.61. 3%。而對其余的七種底物的活性較低,活性不到對0NPG活性 的1%。另外,該蛋白對天然底物乳糖的活性為25. 4U/mg,低于它對合成底物0NPG的活性 (243U/mg)。上述 12 禾中不同的底物分另lj 為0NPG, P -nitrophenyl-^ -D-galactopyran oside, p -nitrophenyl-3 -D—fucopyra—noside, p -nitrophenyl-3 -D-mannoside, o-nitrophenyl-旦 _D_glucoside, p -nitrophenyl-旦 _D_xyloside, P -nitrophenyl-^-D~ce11obioside, p -nitrophenyl-^-D-arabinoside, P-nitrophenyl-^—D—lactoside, p-nitrophenyl-^—D—galacturonide, P -nitrophenyl-^ -D-glucuronide, p -nitrophenyl-a -D—galactoside。上述酶活的測定方法如下所述酶對鄰硝基-D-半乳糖苷(0NPG)及其它底物活性的測定如上面實施例5(2) 中所述。在酶對乳糖活性的測定中使用同樣的緩沖液,但反應(yīng)的終止采用煮沸10分鐘的方 法。反應(yīng)液中葡萄糖的濃度采用葡萄糖氧化酶-過氧化物酶分析試劑盒(Sigma-Aldrich Corp. ,St. Louis,M0, USA)來分析。一個酶活單位定義為每分鐘釋放1 P mol的葡萄糖所需酶量。本實施例中的各項性能指標(biāo)結(jié)果說明,實施例2所得DNA序列在原核表達(dá)系統(tǒng)中
      7的重組蛋白具有高可溶性表達(dá)和冷適應(yīng)的特性,低溫下降解乳糖的效果好,可用于高效、廉 價、大規(guī)模的生產(chǎn)低溫乳糖酶,在食品工業(yè)上具有重要的應(yīng)用潛力。 DNA序列在乳品業(yè)領(lǐng)域中的應(yīng)用序列表.txt SEQUENCE LISTING <110>中山大學(xué)
      <120>DNA序列在乳品業(yè)領(lǐng)域中的應(yīng)用 <130> <160>5
      <170>PatentIn version 3. 5 <210>1 <211>2019 <212>DNA <213> 土壤(soil) <100>1atgatcaacgaagacctccccgatatttggta cggtggcgattataatccggagcaatgg60
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      一條DNA序列在乳品業(yè)領(lǐng)域中的應(yīng)用,其特征在于所述DNA序列的核苷酸序列如SEQ ID NO1所示。
      2.根據(jù)權(quán)利要求1所述應(yīng)用,其特征在于該應(yīng)用是將所述DNA序列通過克隆技術(shù)轉(zhuǎn)化 入原核表達(dá)載體中,所得重組蛋白用于乳品業(yè)中乳糖分解。
      3.根據(jù)權(quán)利要求2所述應(yīng)用,其特征在于所述重組蛋白進(jìn)行乳糖分解時的反應(yīng)pH為 6. 0 8. O0
      4.根據(jù)權(quán)利要求2所述應(yīng)用,其特征在于所述重組蛋白進(jìn)行乳糖分解時的反應(yīng)溫度為 0°C 30°C。
      全文摘要
      本發(fā)明公開一條DNA序列在乳品業(yè)領(lǐng)域中的應(yīng)用,該DNA序列的核苷酸序列如SEQ ID NO1所示。本發(fā)明人通過宏基因組學(xué)技術(shù)得到新的尚未有功能研究的DNA序列,然后通過基因克隆技術(shù),對該DNA序列進(jìn)行結(jié)構(gòu)和功能的分析研究,發(fā)現(xiàn)該DNA序列在原核表達(dá)系統(tǒng)中表達(dá)的重組蛋白可在低溫情況下保持較高的、穩(wěn)定的乳糖分解活性,而且該蛋白還具有高可溶性表達(dá)的特性,可應(yīng)用于乳品業(yè)中,滿足乳品業(yè)對低溫乳糖分解酶的需求。
      文檔編號C12N9/38GK101812471SQ200910214209
      公開日2010年8月25日 申請日期2009年12月28日 優(yōu)先權(quán)日2009年12月28日
      發(fā)明者劉玉煥, 李剛 申請人:中山大學(xué)
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