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      一種檢測(cè)布魯氏菌的lamp引物及包含該引物的試劑盒的制作方法

      文檔序號(hào):514340閱讀:261來(lái)源:國(guó)知局
      一種檢測(cè)布魯氏菌的lamp引物及包含該引物的試劑盒的制作方法
      【專利摘要】本發(fā)明涉及一種檢測(cè)布魯氏菌的LAMP引物及包含該引物的試劑盒。本發(fā)明所述的LAMP引物包括內(nèi)引物FIP和BIP,外引物F3和B3,以及2對(duì)環(huán)引物(LF1和LB1,或者LF2和LB2);所述試劑盒包括所述LAMP引物、Bst?DNA聚合酶、含dNTPs的反應(yīng)緩沖液等。本發(fā)明利用環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增反應(yīng)(LAMP),由Bst?ploymerase和所述LAMP引物對(duì)靶基因BCSP31進(jìn)行特異性擴(kuò)增,可以快速、準(zhǔn)確、方便地檢測(cè)出人血樣或者牛奶中的布魯氏菌。本發(fā)明所述的檢測(cè)方法靈敏度較高,檢測(cè)下限可達(dá)到35fg,反應(yīng)時(shí)間短,不需要昂貴的儀器來(lái)實(shí)現(xiàn),可操作性強(qiáng);并且產(chǎn)物檢測(cè)方便,通過(guò)肉眼觀察或染色法就能實(shí)現(xiàn),具有很高的實(shí)用價(jià)值。
      【專利說(shuō)明】—種檢測(cè)布魯氏菌的LAMP引物及包含該引物的試劑盒
      【技術(shù)領(lǐng)域】
      [0001]本發(fā)明涉及一種快速檢測(cè)布魯氏菌的方法以及LAMP引物及包含該引物的試劑盒,屬于微生物檢測(cè)【技術(shù)領(lǐng)域】。
      【背景技術(shù)】
      [0002]布魯氏菌(Brucella spp.)是一種革蘭氏陰性菌,無(wú)鞭毛,無(wú)芽孢,光滑有莢膜。常在細(xì)胞內(nèi)寄生。內(nèi)毒素是其重要的致病物質(zhì)。布魯氏菌可通過(guò)完整皮膚和粘膜進(jìn)入宿主,具有較強(qiáng)的侵襲力。根據(jù)表型,抗原性及宿主的不同,布魯氏菌被分為6各種,分別是Brucella abortus (牛種布魯氏菌),Brucella melitensis (羊種布魯氏菌),Brucellaovis (綿羊附睪種布魯氏菌),Brucella canis (犬種布魯氏菌),Brucella suis (豬種布魯氏菌)and Brucella neotomae (沙林鼠種布魯氏菌);感染人類的主要是牛種布魯氏菌,羊種布魯氏菌和豬種布魯氏菌。長(zhǎng)久以來(lái),布魯氏菌一直被列為潛在的生物武器。
      [0003]布魯氏菌病(Brucellosis)是由布魯氏菌引起的一種重要的人獸共患傳染病,在許多國(guó)家引起了嚴(yán)重的公共健康問(wèn)題和農(nóng)業(yè)經(jīng)濟(jì)問(wèn)題。該病可以導(dǎo)致許多家畜和野生動(dòng)物流產(chǎn)和不育;人類感染布魯氏菌的臨床癥狀表現(xiàn)為發(fā)熱(波浪熱)、寒戰(zhàn)、頭痛、全身疼痛、疲勞、腦神經(jīng)功能障礙癥狀、關(guān)節(jié)炎等非特異性癥狀。
      [0004]由于布魯氏菌病的臨床癥狀是非特異性的,并且變化無(wú)常,因此必須借助實(shí)驗(yàn)室診斷技術(shù)對(duì)布魯氏菌病進(jìn)行最后的確診。細(xì)菌學(xué)檢測(cè)是必要的,但是細(xì)菌在培養(yǎng)基中生長(zhǎng)較慢,并對(duì)實(shí)驗(yàn)室工作人員有危險(xiǎn);血清學(xué)診斷雖然比較簡(jiǎn)單,但是特異性比較低,因?yàn)椴剪斒暇闹嗵桥c其他病原菌的脂多糖(如小腸結(jié)腸炎耶氏菌)存在結(jié)構(gòu)相似性,因此容易產(chǎn)生交叉反應(yīng);基于DNA的PCR檢測(cè)方法敏感,準(zhǔn)確,快速,可以替代病原學(xué)檢測(cè),但由于需要昂貴的儀器設(shè)備、較高檢測(cè)`費(fèi)用及對(duì)檢測(cè)人員較高的技術(shù)要求而使其不適用于現(xiàn)場(chǎng)快速檢測(cè)及基層普及應(yīng)用。因此,迫切需要開發(fā)出一種可以快速、特異、簡(jiǎn)單、安全地檢測(cè)布魯氏菌病的方法。

      【發(fā)明內(nèi)容】

      [0005]本發(fā)明的目的是針對(duì)現(xiàn)有技術(shù)中無(wú)法快速、準(zhǔn)確的檢測(cè)布魯氏菌的不足,提供一種可以快速、特異、簡(jiǎn)單、安全地檢測(cè)布魯氏菌的方法;
      [0006]進(jìn)一步的,本發(fā)明提供了一種能夠快速檢測(cè)布魯氏菌的LAMP引物以及包含該引物的試劑盒。
      [0007]為解決上述技術(shù)問(wèn)題,本發(fā)明是通過(guò)以下技術(shù)方案實(shí)現(xiàn)的:
      [0008]一種用于檢測(cè)布魯氏菌的LAMP引物,其特征在于,所述LAMP引物包括核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示的正向內(nèi)引物FIP、核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示的反向內(nèi)引物BIP、核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示的正向外引物F3以及核苷酸序列如SEQ ID NO:4所示的反向外引物B3。
      [0009]所述LAMP引物還包括核苷酸序列分別如SEQ ID NO:5和SEQ IDNO:6所示的環(huán)引物L(fēng)Fl和LB1,或者核苷酸序列分別如SEQ ID NO:7和SEQ ID NO:8所示的環(huán)引物L(fēng)F2和LB2。
      [0010]一種用于檢測(cè)布魯氏菌的試劑盒,包括:權(quán)利要求1或2所述的LAMP引物、BstDNA聚合酶、含dNTPs的反應(yīng)緩沖液和去離子水;
      [0011]其中,所述含dNTPs的反應(yīng)緩沖液包含40mM pH8.8的Tris-HCl、20mM KCl、20mM(NH4)2S04U6mM MgS04、0.2% 吐溫 20,1.6M 甜菜堿以及 2.8mM dNTPs
      [0012]所述試劑盒包括40?]\1/^1^引物卩1?10(^1^,40?]\1/^1^引物81?10(^1^,5?]\1/^1^弓丨物 F3100y L,5pM/y L 引物 B3100 μ L,20ρΜ/μ L 引物 LFl 或 LF2100 μ L,20pM/μ L 引物 LBl或LB2100 μ L,8U/ μ L的Bst DNA聚合酶100 μ L,含dNTPs的反應(yīng)緩沖液1.5mL,去離子水ImL0
      [0013]一種利用權(quán)利要求3所述的試劑盒檢測(cè)布魯氏菌的方法,包括如下步驟:
      [0014]S01:制備模板 DNA;
      [0015]S02:以SOl中所得的DNA作為模板,采用權(quán)利要求1或2所述的LAMP引物,于60°C~65°C進(jìn)行LAMP擴(kuò)增反應(yīng),反應(yīng)時(shí)間為55min~90min ;所述LAMP擴(kuò)增反應(yīng)的體系為25 μ L,各組分的含量如下:
      [0016]
      模板 DNA2μΙ_
      40ρΜ/μΙ_ 引物 FIPΙμΙ
      40ρΜ/μ!_ 引物 BIP1μ!_
      5ρΜ/μ1_#_Ρ31μ!_
      5ρΜ/μΙ_ 引物 Β3ΙμΙ
      含dNTPs的反應(yīng)緩沖液12 5μ?
      Bst DNA 聚合酶1μ!_
      去離子水5.5μΙ_ [0017]或者
      [0018]模板DNA2μΙ
      40ρΜ/μ!_ 引物 FIP1μ1_
      40ρΜ/μ? 引物 BIP1μ1_
      5ρΜ/μΙ_ 引物I F31μ1_
      5ρΜ/μ1_ 引物 Β31μ!_
      5ρΜ/μΙ_ 引物 LFl 或 LF2Ιμ?
      5ρΜ/μΙ_ 引物 LBl 成 LB21μ1_
      含dNTPs的反應(yīng)緩沖液12.5μ!_
      Bst DNA 聚合酶1μΙ_
      去離子水3.5μ?
      [0019]S03:擴(kuò)增結(jié)果判定。
      [0020]所述步驟S02中,利用Real-time turbidimeter池度儀進(jìn)行LAMP擴(kuò)增反應(yīng);通過(guò)濁度儀連接的LA-320程序顯示的濁度上升時(shí)間鑒定所述步驟S02中特異性擴(kuò)增產(chǎn)物的存 在。
      [0021 ] 本領(lǐng)域技術(shù)人員也可以根據(jù)實(shí)際需要按比例調(diào)節(jié)所述步驟S02中的反應(yīng)體系,亦可以實(shí)現(xiàn)本發(fā)明。
      [0022]所述步驟S02中,所述LAMP擴(kuò)增反應(yīng)的溫度為63°C,時(shí)間為90min。
      [0023]在所述步驟S02結(jié)束后,可以將反應(yīng)產(chǎn)物于80°C恒溫滅活5min或95°C恒溫滅活5min。
      [0024]所述布魯氏菌為人體血液或者牛奶中的布魯氏菌。
      [0025]一種利用所述的試劑盒進(jìn)行檢測(cè)布魯氏菌的應(yīng)用。
      [0026]BCSP31基因在所有布魯氏菌種和生物型中是保守的,它編碼了大小為31 ku具有免疫原性的可溶性細(xì)胞表面蛋白質(zhì)。該基因于1988年被克隆測(cè)序和體外表達(dá);1992年Baily等擴(kuò)增BCSP31基因的一段大小為223bp的片段,結(jié)果表明該序列在牛種布魯氏菌和羊種布魯氏菌中是保守的;1996年Da Costa等證實(shí)BCSP31基因能鑒別所有的布魯氏菌種和生物型,他們還檢測(cè)了其他98種對(duì)照細(xì)菌,結(jié)果均為陰性;王勝昌等(2003)以BCSP31為靶基因建立套式PCR反應(yīng),不同型的布魯氏菌都能出現(xiàn)預(yù)期的擴(kuò)增帶;結(jié)果表明BCSP31序列具有高度的布魯氏菌特異性,可用于鑒別布魯氏菌。
      [0027]環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)(LAMP,loop-mediated isotherma lamplification)是一種全新的核酸擴(kuò)增方法。該法在等溫條件下(60~65°C )就能完成擴(kuò)增反應(yīng),它可以在Ih以內(nèi)在恒溫條件下特異地?cái)U(kuò)增DNA到109個(gè)拷貝,在保持PCR技術(shù)優(yōu)點(diǎn)的基礎(chǔ)上,進(jìn)一步增強(qiáng)了反應(yīng)的特異性和縮短了檢測(cè)時(shí)間。LAMP技術(shù)利用Bst DNA聚合酶和根據(jù)靶基因序列設(shè)計(jì)的兩對(duì)特殊的內(nèi)、外引物(即內(nèi)引物FIP/BIP和外引物F3/B3),特異性識(shí)別靶序列上的六個(gè)獨(dú)立區(qū)域,啟動(dòng)循環(huán)鏈置換反應(yīng),在靶標(biāo)DNA區(qū)啟動(dòng)互補(bǔ)鏈合成,結(jié)果在同一鏈上互補(bǔ)序列周而復(fù)始形成有很多環(huán)的花椰菜結(jié)構(gòu)的莖-環(huán)DNA混合物。由于它針對(duì)靶基因的6個(gè)區(qū)域設(shè)計(jì)4種特意的引物,因而對(duì)靶基因序列有高度的特異性;如果再增加一對(duì)環(huán)引物,則可以使反應(yīng)加速,提高擴(kuò)增效率。LAMP擴(kuò)增結(jié)果判定的方法包括:(I)熒光染色法:向LAMP反應(yīng)產(chǎn)物中加入SYBR Green I等燃料,進(jìn)行呈色反應(yīng),通過(guò)觀察LAMP反應(yīng)體系的顏色變化來(lái)判定擴(kuò)增結(jié)果。若發(fā)生了擴(kuò)增反應(yīng),SYBR Green I會(huì)摻入雙鏈DNA中,反應(yīng)體系的顏色會(huì)從橙色變?yōu)榫G色;若反應(yīng)體系的顏色保持不變,則沒(méi)有發(fā)生擴(kuò)增反應(yīng)。(2)瓊脂糖凝膠電泳法:根據(jù)LAMP的擴(kuò)增原理,LAMP反應(yīng)的最終產(chǎn)物含有不同長(zhǎng)度(目的片段長(zhǎng)度的自然數(shù)倍)的花椰菜狀的反向重復(fù)序列,所以其產(chǎn)物在瓊脂糖凝膠上呈現(xiàn)特征性梯狀條帶,而非單一條帶。(3)焦磷酸鎂濁度檢測(cè):DNA大量合成時(shí),從dNTPs析出的焦磷酸根離子與溶液中的鎂離子結(jié)合產(chǎn)生焦磷酸鎂白色沉淀,出現(xiàn)肉眼可見的渾濁,濁度大小與DNA的含量成正t匕,可以通過(guò)肉眼觀察反應(yīng)前后的渾濁情況來(lái)判斷是否發(fā)生了 LAMP反應(yīng),也可以用分光光度計(jì)檢測(cè)其在400nm處的吸光度,實(shí)現(xiàn)實(shí)時(shí)定量檢測(cè)。
      [0028]如果LAMP反應(yīng)的靶序列在除引物區(qū)外帶有限制性酶切位點(diǎn),則可以利用該酶切位點(diǎn)進(jìn)行LAMP反應(yīng)特異性擴(kuò)增產(chǎn)物的鑒定。本發(fā)明所述的靶序列在除引物區(qū)外帶有限制性酶切位點(diǎn)BstH2 I,用該酶對(duì)所述LAMP擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行酶切,所得到的酶切片段的大小的計(jì)算如下所示:
      [0029]所述LAMP反應(yīng)的機(jī)理如附圖11所示。
      [0030]LAMP擴(kuò)增產(chǎn)物的線性示意圖如附圖12所示。
      [0031 ] 本發(fā)明所述的LAMP反應(yīng)的目的基因如圖13所示。
      [0032]
      [0033]由以上各圖可推知:
      [0034]B+的長(zhǎng)度=Blc的長(zhǎng)度+B2的長(zhǎng)度+B2和BI之間的長(zhǎng)度+BI的長(zhǎng)度=22+18+35+22=97bp
      [0035]B-的長(zhǎng)度=22+l8+35+22=97bp
      [0036]F+的長(zhǎng)度=Flc的長(zhǎng)度+Flc和F2c之間的長(zhǎng)度+F2c的長(zhǎng)度+Fl的長(zhǎng)度=22+22+19+22=85bp
      [0037]F-的長(zhǎng)度=22+22+l9+22=85bp
      [0038]+的長(zhǎng)度=_的長(zhǎng)度=Bl和Flc之間的距離=2bp
      [0039]BstH2 I的酶切位點(diǎn)位于Flc和BI之間,酶切產(chǎn)物預(yù)期片段的大小推導(dǎo)結(jié)果如圖14所示。
      [0040]
      [0041]酶切后的片段大小為:
      [0042]97+2+22+20+16=141bp
      [0043]2+I9+22+2+97+2+22+I9+2=I87bp
      [0044]20+22+2+97+2+22+20=I85bp
      [0045]本發(fā)明的上述技術(shù)方案相比現(xiàn)有技術(shù)具有以下優(yōu)點(diǎn):
      [0046](1)本發(fā)明所述的一種檢測(cè)布魯氏菌的LAMP引物及包含該引物的試劑盒,所述LAMP引物以BCSP31基因?yàn)榘谢蜻M(jìn)行擴(kuò)增;該基因序列具有高度的布魯氏菌特異性,因而可以實(shí)現(xiàn)布魯氏菌的特異性檢測(cè)。
      [0047](2)本發(fā)明所述的一種檢測(cè)布魯氏菌的LAMP引物及包含該引物的試劑盒,在檢測(cè)布魯氏菌時(shí)更加快速和高效,因?yàn)長(zhǎng)AMP擴(kuò)增反應(yīng)不需要對(duì)模板DNA進(jìn)行熱變性,避免了溫度循環(huán)造成的時(shí)間損失,核酸擴(kuò)增在Ih內(nèi)即可完成;添加環(huán)引物后20-30min內(nèi)就可以檢測(cè)到擴(kuò)增產(chǎn)物,Ih內(nèi)可擴(kuò)增出109個(gè)靶序列拷貝,且產(chǎn)物可以達(dá)到0.5mg/mL。
      [0048](3)本發(fā)明所述的LAMP法檢測(cè)布魯氏菌,針對(duì)靶序列的6個(gè)區(qū)域設(shè)計(jì)了 4種特異性引物,6個(gè)區(qū)域中任何一處與引物不匹配均不能進(jìn)行核酸擴(kuò)增,因而具有高特異性;同時(shí)LAMP擴(kuò)增法具有高靈敏度,所需模板拷貝量少,靈敏度較較高,檢測(cè)下限約為35fg。
      [0049](4)本發(fā)明所述的LAMP反應(yīng)可操作性強(qiáng),只需要一個(gè)簡(jiǎn)單的恒溫器即可完成此操作;并且產(chǎn)物檢測(cè)方便,通過(guò)肉眼觀察或染色法就能實(shí)現(xiàn)。
      【專利附圖】

      【附圖說(shuō)明】
      [0050]為了使本發(fā)明的內(nèi)容更容易被清楚的理解,下面結(jié)合附圖,對(duì)本發(fā)明作進(jìn)一步詳細(xì)的說(shuō)明,其中,
      [0051]圖1是本發(fā)明所述實(shí)施例4中實(shí)驗(yàn)例(I)不加環(huán)引物的LAMP反應(yīng)開始時(shí)間(min),均在45min之后開始反應(yīng);
      [0052]圖2是本發(fā)明所述實(shí)施例2中LAMP反應(yīng)特異性分析的實(shí)時(shí)濁度法反應(yīng)結(jié)果,橫坐標(biāo)代表反應(yīng)時(shí)間(min),縱坐標(biāo)代表濁度;CHl-8分別對(duì)應(yīng):大腸桿菌、金黃色葡萄球菌、沙門氏菌、蘇云金芽孢桿菌、乳酸乳球菌、嗜熱鏈球菌、酵母菌、黃曲霉;
      [0053]圖3是本發(fā)明所述實(shí)施例2中實(shí)時(shí)濁度法反應(yīng)結(jié)果,橫坐標(biāo)代表樣品編號(hào),縱坐標(biāo)代表濁度;1_8分別對(duì)應(yīng):大腸桿菌、金黃色葡萄球菌、沙門氏菌、蘇云金芽孢桿菌、乳酸乳球菌、嗜熱鏈球菌、酵母菌、黃曲霉;
      [0054]圖4是本發(fā)明所述實(shí)施例3中向LAMP擴(kuò)增產(chǎn)物肉眼觀察結(jié)果,編號(hào)1_8對(duì)應(yīng)的稀釋梯度分別為 3.5ng/ μ L,350pg/ μ L,35pg/ μ L,3.5pg/μ L、350fg/μ L、35fg/μ L、3.5fg/μ L 和 350ag/ μ L ;
      [0055]圖5是本發(fā)明所述實(shí)施例4中實(shí)驗(yàn)例(2)、(3)和(4)加入環(huán)引物的LAMP實(shí)時(shí)濁度法反應(yīng)結(jié)果,橫坐標(biāo)代表反應(yīng)時(shí)間(min),縱坐標(biāo)代表濁度;CH1為標(biāo)準(zhǔn)布魯氏菌株對(duì)照DNA、CH5為實(shí)驗(yàn)例(2)的擴(kuò)增結(jié)果、CH6為實(shí)驗(yàn)例(3)的擴(kuò)增結(jié)果、CH7為實(shí)驗(yàn)例(4)的擴(kuò)增結(jié)果、CH8為陰性對(duì)照(水);所述反應(yīng)均在45min之前開始反應(yīng);
      [0056]圖6是本發(fā)明所述實(shí)施例4中實(shí)驗(yàn)例(2)、(3)和(4)的實(shí)時(shí)濁度法反應(yīng)結(jié)果,橫坐標(biāo)代表樣品編號(hào),縱坐標(biāo)代表池度;1為標(biāo)準(zhǔn)布魯氏菌株對(duì)照DNA、5為實(shí)驗(yàn)例(2)的擴(kuò)增結(jié)果、6為實(shí)驗(yàn)例(3)的擴(kuò)增結(jié)果、7為為實(shí)驗(yàn)例(4)的擴(kuò)增結(jié)果、8為陰性對(duì)照(水);
      [0057]圖7是本發(fā)明所述實(shí)施例4中實(shí)驗(yàn)例(5)的LAMP實(shí)時(shí)濁度法反應(yīng)結(jié)果,橫坐標(biāo)代表反應(yīng)時(shí)間(min),縱坐標(biāo)代表濁度;CH1和CH2為陰性對(duì)照,CH3為標(biāo)準(zhǔn)布魯氏菌株對(duì)照DNA, CH7為本實(shí)驗(yàn)例的擴(kuò)增結(jié)果;
      [0058]圖8是本發(fā)明所述實(shí)施例4中實(shí)驗(yàn)例(5)的實(shí)時(shí)濁度法反應(yīng)結(jié)果,橫坐標(biāo)代表樣品編號(hào),縱坐標(biāo)代表濁度;1和2為陰性對(duì)照(水和大腸桿菌)、3為標(biāo)準(zhǔn)布魯氏菌株對(duì)照DNA、7為實(shí)驗(yàn)例(5)的擴(kuò)增結(jié)果;[0059]圖9本發(fā)明所述實(shí)施例4實(shí)驗(yàn)例(I)擴(kuò)增產(chǎn)物的1%瓊脂糖凝膠電泳圖,所用Marker為lOO-llOObp,泳道I為實(shí)驗(yàn)例(I)的擴(kuò)增產(chǎn)物;
      [0060]圖10本發(fā)明所述實(shí)施例4實(shí)驗(yàn)例(I)擴(kuò)增產(chǎn)物酶切后所得酶切產(chǎn)物的2%瓊脂糖凝膠電泳圖,所用Marker為100_600bp,泳道I為實(shí)驗(yàn)例(I)擴(kuò)增產(chǎn)物的酶切產(chǎn)物;
      [0061 ] 圖11所述LAMP反應(yīng)的機(jī)理圖;
      [0062]附圖12所述LAMP擴(kuò)增產(chǎn)物的線性示意圖;
      圖13為所述的LAMP反應(yīng)的目的基因;
      圖14為所述的LAMP反應(yīng)酶切產(chǎn)物預(yù)期片段的大小推導(dǎo)結(jié)果。
      【具體實(shí)施方式】
      [0063]實(shí)施例1用于檢測(cè)布魯氏菌的LAMP引物的設(shè)計(jì)與合成
      [0064]選擇羊種布魯氏菌BCSP31基因作為目的基因,通過(guò)在線工具h(yuǎn)ttp://primerexplorer.jp/e/,使用Primer Explorer V4設(shè)計(jì)、篩選并合成一套參數(shù)符合LAMP引物設(shè)計(jì)要求的引物。所述引物包括2條外引物(F3、B3),2條內(nèi)引物(FIP、BIP)和2對(duì)環(huán)引物(LF1、LBl和LF2、LB2),由生工生物工程(上海)股份有限公司合成。各引物的序列見表I:
      [0065]表1:檢測(cè)布魯氏菌的LAMP弓丨物
      [0066]
      【權(quán)利要求】
      1.一種用于檢測(cè)布魯氏菌的LAMP引物,其特征在于,所述LAMP引物包括核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示的正向內(nèi)引物FIP、核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示的反向內(nèi)引物BIP、核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示的正向外引物F3以及核苷酸序列如SEQ ID NO:4所示的反向外引物B3。
      2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的用于檢測(cè)布魯氏菌的LAMP引物,其特征在于,所述LAMP引物還包括核苷酸序列分別如SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:6所示的環(huán)引物L(fēng)Fl和LB1,或者核苷酸序列分別如SEQ ID NO:7和SEQ ID NO:8所示的環(huán)引物L(fēng)F2和LB2。
      3.一種用于檢測(cè)布魯氏菌的試劑盒,其特征在于,包括:權(quán)利要求1或2所述的LAMP引物、Bst DNA聚合酶、含dNTPs的反應(yīng)緩沖液和去離子水; 其中,所述含dNTPs的反應(yīng)緩沖液包含40mM pH8.8的Tris_HCl、20mM KCl、20mM(NH4)2S04U6mM MgS04、0.2% 吐溫 20,1.6M 甜菜堿以及 2.8mM dNTPs。
      4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的用于檢測(cè)布魯氏菌的試劑盒,其特征在于,所述試劑盒包括40ρΜ/μ L 弓丨物 FIPlOOy L,40pM/y L 弓丨物 BIP100 μ L, 5ρΜ/μ L 弓丨物 F3100 μ L, 5ρΜ/μ L 引物 Β3100 μ L, 20ρΜ/ μ L 引物 LFl 或 LF2100 μ L, 20ρΜ/ μ L 引物 LBl 或 LB2100 μ L, 8U/ μ L 的Bst DNA聚合酶100 μ L,含dNTPs的反應(yīng)緩沖液1.5mL,去離子水lmL。
      5.一種檢測(cè)布魯氏菌的方法,其特征在于,包括如下步驟: 501:制備模板DNA ; 502:以SOl中所得的D NA作為模板,采用權(quán)利要求1或2所述的LAMP引物,于60V~65°C進(jìn)行LAMP擴(kuò)增反應(yīng),反應(yīng)時(shí)間為55min~90min ;所述LAMP擴(kuò)增反應(yīng)的體系為25 μ L,各組分的含量如下:模板DNA2μ?40ρΜ/μ1_ 引物 F!PΙμΙ40ρΜ/μΙ_ 引物 BIP1μ!_5pMyVL'ji*F31μ!_5ρΜ/μ1_ 引物 Β31μ1_含dNTPs的反應(yīng)緩沖液12.5μ!_Bst DNA 聚合酶1μΙ_去離子水5.5μ? 或者模板DNA2μ?40ρΜ/μ?:’j丨構(gòu) FIPΙμ?40ρΜ/μ?_ 1J丨物 BIPΙμ?5ρ!/1/μ!_ 引物 F31μ!_5ρΜ/μ?_ 引物 Β31μ1_5ρΜ/μ?丨物 LFl 或 LF2ΙμΙSpM/μΙ 引物 LBl 或 LB21μ!_含dNTPs的反應(yīng)緩沖液12.5μ?Bst DNA聚合酶Ιμ?去離子水3.5μΙ_ S03:擴(kuò)增結(jié)果判定。
      6.根據(jù)權(quán)利要求5所述的檢測(cè)布魯氏菌的方法,其特征在于,所述步驟S02中,利用Real-time turbidimeter池度儀進(jìn)行LAMP擴(kuò)增反應(yīng);通過(guò)池度儀連接的LA-320程序顯示的濁度上升時(shí)間鑒定所述步驟S02中特異性擴(kuò)增產(chǎn)物的存在。
      7.根據(jù)權(quán)利要求5或6 所述的檢測(cè)布魯氏菌的方法,其特征在于,所述步驟S02中,所述LAMP擴(kuò)增反應(yīng)的溫度為63°C,時(shí)間為90min。
      8.根據(jù)權(quán)利要求5-7任一所述的檢測(cè)布魯氏菌的方法,其特征在于,所述布魯氏菌為人體血液或者牛奶中的布魯氏菌。
      9.一種利用權(quán)利要求3或4所述的試劑盒在檢測(cè)布魯氏菌中的應(yīng)用。
      10.一種利用權(quán)利要求1或2所述的LAMP引物在檢測(cè)布魯氏菌中的應(yīng)用。
      【文檔編號(hào)】C12Q1/04GK103602721SQ201310298369
      【公開日】2014年2月26日 申請(qǐng)日期:2013年7月16日 優(yōu)先權(quán)日:2013年7月16日
      【發(fā)明者】黃耀江, 蔣丹, 楊志達(dá), 靳衛(wèi)林, 閆強(qiáng) 申請(qǐng)人:黃耀江
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