一種慢性阻塞性肺病急性加重基因表達診斷芯片的制作方法
【專利摘要】本發(fā)明提供了一種慢性阻塞性肺病急性加重基因表達診斷芯片,其特征在于,包括載體,所述載體上設有FOS基因探針、IFI27基因探針、CYR61基因探針、CTGF基因探針、GPRC5A基因探針、FOSB基因探針、DCN基因探針、C11orf96基因探針、KIR2DS2基因探針、SH2D1B基因探針、CD8B基因探針、OR2W5基因探針、FGFBP2基因探針和TCF7基因探針。與現(xiàn)有技術相比,本發(fā)明為診斷慢性阻塞性肺病急性加重提供了生物學依據,能快速、準確地檢測出慢性阻塞性肺病急性加重,對于慢性阻塞性肺病急性加重的診斷和治療具有重要的意義。
【專利說明】一種慢性阻塞性肺病急性加重基因表達診斷芯片
【技術領域】
[0001]本發(fā)明屬于生物醫(yī)學檢測領域,涉及一種診斷芯片,特別涉及一種慢性阻塞性肺病急性加重基因表達診斷芯片。
【背景技術】
[0002]慢性阻塞性肺病(COPD)是一種以不完全可逆且持續(xù)進展的氣流受限和慢性氣道炎癥為特征的肺部疾病(綜述參見Fabbri等,2006, Am.J.Respir.Crit.CareMed.173:1056-1065)。其主要的臨床表現(xiàn)為咳嗽,咳痰以及呼吸困難。隨著病程的進展,可發(fā)展到呼吸衰竭,嚴重影響生活質量。由于COPD患病人數(shù)多,死亡率高,社會經濟負擔重,已成為一個重要的公共衛(wèi)生問題。COPD目前居全球死亡原因的第4位,據世界衛(wèi)生組織估計,至2020年將位居世界疾病經濟負擔第5位。在我國,慢性阻塞性肺病同樣是嚴重危害人民身體健康的重要慢性呼吸系統(tǒng)疾病,居城市死因第4位和農村死因第3位。
[0003]慢性阻塞性肺病急性加重(AECOPD),定義為咳嗽、咳痰或氣促加重,需要及時關注,改變平時的治療方案。CCffD患者通常診斷于疾病的嚴重階段,即患者發(fā)生明顯的肺功能損害時。隨著COPD病情進展,AECOPD的發(fā)生會越來越頻繁且越來越重。AECOPD不僅癥狀加重,而且容易出現(xiàn)呼吸衰竭、肺性腦病、心律失常和心力衰竭等各器官并發(fā)癥,使再次急性發(fā)作的風險升高,肺功能進一步惡化,死亡率升高。
[0004]COPD的診斷除了依據危險因素和癥狀體征外,金標準診斷參數(shù)是FEV1/FVC(1秒鐘用力呼氣容積/用力肺活量)< 70%,該參數(shù)通過肺功能檢查來測量(Rennard,1998,Chest 113:235S-241S)。而目前診斷AECOPD主要是依據癥狀和治療的改變,具有很大的主觀性,且難以與其它臨床情況如肺部感染和心功能不全等鑒別。因此,如何更加準確地診斷慢性阻塞性肺病以及急性加重期,以及如何優(yōu)化現(xiàn)有預測指標指導該疾病的治療等問題顯得尤為緊迫。
[0005]基因芯片技術以高通量平行篩選疾病相關基因的技術優(yōu)勢,為研究CCffD發(fā)生發(fā)展中多基因改變的分子機制提供了有力的工具,特別在CCffD加重相關基因群的篩選中具有特殊優(yōu)勢。
【發(fā)明內容】
[0006]本發(fā)明的目的在于提供一種慢性阻塞性肺病急性加重基因表達診斷芯片。
[0007]為了達到上述目的,本發(fā)明提供了一種慢性阻塞性肺病急性加重基因表達診斷芯片,其特征在于,包括載體,所述載體上設有FOS基因探針、IFI27基因探針、CYR61基因探針、CTGF基因探針、GPRC5A基因探針、FOSB基因探針、DCN基因探針、Cllorf96基因探針、KIR2DS2基因探針、SH2D1B基因探針、CD8B基因探針、0R2W5基因探針、FGFBP2基因探針和TCF7基因探針。
[0008]優(yōu)選地,所述的載體上還設有ACTB基因探針作為陽性內參。
[0009]優(yōu)選地,所述的載體上還設有空白對照探針。
[0010]本發(fā)明通過收集10例慢性阻塞性肺病急性加重患者(AECOPD)外周血、10例慢性阻塞性肺病穩(wěn)定患者(StCOPD)外周血,以及10例健康人(Control)外周血。應用基因表達譜芯片技術檢測外周血單個核細胞(PBMC)超過45000個基因的表達,分別篩選急性加重不同時期(發(fā)病第Id、第3d和第1d)較穩(wěn)定期和正常對照共同上調或下調的基因,隨后再次篩選急性加重不同時期共同差異的基因,同時與臨床嚴重度評分(DESS)進行匹配,最終篩選出有臨床意義的差異表達基因。最終確定慢性阻塞性肺病急性加重期患者PBMC基因表達譜中有8個上調基因;另有6個下調基因。
[0011]本發(fā)明以獲得的14個基因加上一個內參基因作為分類器(參見表1),設計針對這些基因的探針,最后確定用于設計診斷芯片的15個基因探針。
[0012]表1
[0013]
【權利要求】
1.一種慢性阻塞性肺病急性加重基因表達診斷芯片,其特征在于,包括載體,所述載體上設有FOS基因探針、IFI27基因探針、CYR61基因探針、CTGF基因探針、GPRC5A基因探針、FOSB基因探針、DCN基因探針、Cllorf96基因探針、KIR2DS2基因探針、SH2D1B基因探針、⑶8B基因探針、0R2W5基因探針、FGFBP2基因探針和TCF7基因探針。
2.如權利要求1所述的慢性阻塞性肺病急性加重基因表達診斷芯片,其特征在于,所述的載體上還設有ACTB基因探針作為陽性內參。
3.如權利要 求1所述的慢性阻塞性肺病急性加重基因表達診斷芯片,其特征在于,所述的載體上還設有空白對照探針。
【文檔編號】C12Q1/68GK104131073SQ201410269884
【公開日】2014年11月5日 申請日期:2014年6月17日 優(yōu)先權日:2014年6月17日
【發(fā)明者】王向東, 吳曉丹, 眭飛 申請人:復旦大學附屬中山醫(yī)院