專利名稱：人睪丸發(fā)育特異性蛋白－24基因編碼蛋白的制作方法
技術(shù)領(lǐng)域：
本發(fā)明屬于人類基因組技術(shù)領(lǐng)域。
二
發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明所述人睪丸發(fā)育特異性蛋白-24基因(testis developmentspecific protein gene 24，NYD-SP24)是發(fā)明人在南京醫(yī)科大學(xué)生殖醫(yī)學(xué)江蘇省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室用基因芯片方法篩選獲得，首先制備人睪丸功能基因表達(dá)芯片，通過(guò)比較胚胎和成年人睪丸功能基因的表達(dá)，獲得差異表達(dá)克隆，經(jīng)序列測(cè)定證明為全長(zhǎng)cDNA，為2823bp；其開(kāi)放閱讀框架為2178bp，其編碼725個(gè)氨基酸。查閱基因庫(kù)，該基因?yàn)樾禄?。由于該基因是成人睪丸高表達(dá)，胚胎睪丸低表達(dá)，因此發(fā)現(xiàn)的人睪丸發(fā)育特異性蛋白-24基因可能與睪丸發(fā)育，特別是精子發(fā)生有關(guān)，用該基因克隆可制備成融合蛋白，用該蛋白免疫家兔，可獲得單克隆和多克隆抗體，該基因也可用于制備睪丸功能基因表達(dá)芯片。
由于人睪丸發(fā)育特異性蛋白-24基因在Genbank數(shù)據(jù)庫(kù)中尚無(wú)人的同源基因，本發(fā)明人對(duì)于該基因的結(jié)構(gòu)和功能研究成果全都是開(kāi)創(chuàng)性的。美國(guó)國(guó)家生物技術(shù)情報(bào)中心(National Center for BiotechnologyInformation，NCBI)已正式接受該基因?yàn)镚enbank的新成員，接受號(hào)為AY032876。
1 ggggggggcg cgcctgcgca ttatgctggt ctccatggcg gggctcggag caagacgaga61 gaaaatgctg ctgtgaagac ccaattaaag ctttcacata aatgaagcta cagctatcat121 gatttagtgc ccccaaaagg aagaacttca gtggacaaga aaggacattt ctgggggtag181 tagaatgctt gaggcctgga atttaaacct gagccactat ctgaagctat taaataatag241 aagaaaatgg aattgaatat gatgtcagca tggaacaatc taatgattca ttaagagtca301 accataatga cggtgaagag tcaaaaacca gtgctcaagt atttgagcat ctaatctgta361 tggactccag ggattcttcc tttggacaaa atgattctcc tacagttttg cccatcacta421 ctcgtgaagc aaataattca ctcatatcac agaatatacc agggcccctg actcagacac481 agactctttc tgcagagcaa ttccatctag tggaccaaaa tgggcaggct attcaatatg541 aacttcagtc attgggggaa tccaatgcac aaatgatgat cgttgccagc ccaacagaaa601 atggacaggt acttcgtgta attccaccta cccagacagg aatggcacaa gtgattatac661 ctcaggggca acttgtggat gtgaatagtc ctcgggatgt ccctgaagag aaacccagta721 acagaaactt accaactgta agagtggata ctctagcaga caataccagc aattacattc781 ttcatcctca aacatccttc ccattgccca aaaagtcagt gaccggaatg ctggaagaac841 cccttctggg gcctcttcag ccactttctt ctaatacacc tatatgggcc tgccgtctta901 ggagctgtga gaaaattgga gattcatacc gtggctactg tgtaagtgag actgaattag961 aaagtgtcct aacatttcac gagcagcaaa cacagagtgt ttgggggacc cgtcagtctc1021 caagcccagc caagcctgct acacgcttga tgtggaaatc ccagtatgtt ccatatgatg1081 gaatcccatt tgttaatgca gggagtagag ctgtggtaat ggagtgtcag tatgggccaa1141 gaagaaaagg tttccagtta aaaaaagtca gtgagcagga aagcaggtct tgtcagctct
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②制備特異性抗體基因編碼蛋白的特異性抗體是研究基因結(jié)構(gòu)和功能的不可缺少的重要工具，人睪丸發(fā)育特異性蛋白-24基因編碼蛋白的多克隆和單克隆抗體，可用作免疫組織化學(xué)染色、ELISA、免疫電鏡、免疫共沉淀等多種根據(jù)免疫學(xué)原理設(shè)計(jì)的檢測(cè)方法，可用于該基因編碼蛋白在組織細(xì)胞中的定位和定量研究，也可用于各種生物樣本(如血液、精液、尿液等)中的含量變化研究以及蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用研究等。因此，該抗體有可能用于制備與人睪丸發(fā)育特異性蛋白-24基因表達(dá)異常相關(guān)疾病的診斷試劑盒，并有可能用于制備抗生育藥物。
③制備基因診斷芯片將功能基因用于制備基因診斷芯片是基因開(kāi)發(fā)研究的一個(gè)重要方面，在疾病診斷(如男性不育、性功能低下)和藥物篩選等方面均具有重要意義。本發(fā)明技術(shù)方案1.人睪丸發(fā)育特異性蛋白-24基因融合蛋白的制備以人睪丸發(fā)育特異性蛋白-24基因開(kāi)放閱讀框的核苷酸序列與質(zhì)粒pDESTTM15制備成GST-SP2-pDEST15表達(dá)質(zhì)粒，在無(wú)NaCl的LB中30℃培養(yǎng)到0.5OD600，經(jīng)0.3M NaCl誘導(dǎo)，超聲粉碎后經(jīng)GST親和層析柱純化，得到純化的融合蛋白。2.人睪丸發(fā)育特異性蛋白-24基因編碼蛋白特異性多克隆抗體取融合蛋白與載體蛋白KLH(Keyhole Limpet Hymocyanin)結(jié)合，經(jīng)透析后再與完全/不完全佐劑(Complete/Incomplete Freund’sAdjuvant)等量混合，免疫新西蘭兔(背部皮下注射)，每隔3～4周激發(fā)注射一次，共三次，于三個(gè)月后取血分離血清。以免疫前動(dòng)物血清作為對(duì)照做ELISA，測(cè)定各免疫兔血清中抗體滴度。篩選高滴度血清，進(jìn)一步用抗原作競(jìng)爭(zhēng)抑制免疫試驗(yàn)確定抗體的特異性。根據(jù)ELISA結(jié)果確定其用于免疫組織化學(xué)染色的稀釋倍數(shù)為1∶200～500。3.人睪丸發(fā)育特異性蛋白-24基因編碼蛋白特異性單克隆抗體取融合蛋白與載體蛋白KLH(Keyhole Limpet Hymocyanin)結(jié)合，經(jīng)透析后再與完全/不完全佐劑(Complete/Incomplete Freund’sAdjuvant)混合，免疫Balb/C小鼠(腹腔內(nèi)注射)，隔周一次，連續(xù)2-3次，融合前靜脈加強(qiáng)一次，用ELISA方法證實(shí)抗體的產(chǎn)生后，取脾臟分離脾細(xì)胞，然后與骨髓瘤細(xì)胞融合產(chǎn)生雜交瘤細(xì)胞。陽(yáng)性克隆經(jīng)多次亞克隆，直至獲得分泌抗人睪丸發(fā)育特異性蛋白-24的單克隆雜交瘤細(xì)胞株。4.人睪丸發(fā)育特異性蛋白-24基因用于制備睪丸功能基因表達(dá)芯片(1)以獲取的人睪丸發(fā)育特異性蛋白-24基因的核苷酸序列設(shè)計(jì)引物，擴(kuò)增全長(zhǎng)的人睪丸發(fā)育特異性蛋白-24基因序列，用作點(diǎn)膜的樣品。
(2)用英國(guó)BioRobotics自動(dòng)點(diǎn)膜儀將標(biāo)本點(diǎn)在8×12cm尼龍膜上，每一標(biāo)本點(diǎn)2個(gè)點(diǎn)，每點(diǎn)的DNA量約幾ng。；陽(yáng)性對(duì)照8個(gè)housekeeping genes(a.ribosomal protein S9；b.Actin gamma；c.glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase；d.hypoxanthinephosphoribosyltransferase 1；e.H.sapiens mRNA for 23KD highly basicprotein；f.ubiqnitin C；g.Phospholipase A2；h.ubiquitin carboxy I-ferminal esterase L I)。陰性對(duì)照加λ噬菌體DNA和P-blue質(zhì)粒。(3)將含有該基因的芯片用于人睪丸發(fā)育特異性蛋白-24基因缺失的診斷和藥物篩選33P標(biāo)記抽提待檢標(biāo)本mRNA或DNA，用Random Primer標(biāo)記法標(biāo)記待檢標(biāo)本mRNA或DNA，作為雜交的探針。雜交將點(diǎn)制好的尼龍膜標(biāo)記探針雜交后，雜交爐(68℃)內(nèi)烘干，用磷屏壓片。信號(hào)掃描和分析用記錄儀分析雜交信號(hào)。根據(jù)雜交信號(hào)的強(qiáng)弱分析人睪丸發(fā)育特異性蛋白-24基因蛋白表達(dá)水平或人睪丸發(fā)育特異性蛋白-24基因的缺失。
人睪丸發(fā)育特異性蛋白-24基因編碼蛋白人睪丸發(fā)育特異性蛋白-24基因cDNA序列1 ggggggggcg cgcctgcgca ttatgctggt ctccatggcg gggctcggag caagacgaga61 gaaaatgctg ctgtgaagac ccaattaaag ctttcacata aatgaagcta cagctatcat121 gatttagtgc ccccaaaagg aagaacttca gtggacaaga aaggacattt ctgggggtag181 tagaatgctt gaggcctgga atttaaacct gagccactat ctgaagctat taaataatag241 aagaaaatgg aattgaatat gatgtcagca tggaacaatc taatgattca ttaagagtca301 accataatga cggtgaagag tcaaaaacca gtgctcaagt atttgagcat ctaatctgta361 tggactccag ggattcttcc tttggacaaa atgattctcc tacagttttg cccatcacta421 ctcgtgaagc aaataattca ctcatatcac agaatatacc agggcccctg actcagacac481 agactctttc tgcagagcaa ttccatctag tggaccaaaa tgggcaggct attcaatatg541 aacttcagtc attgggggaa tccaatgcac aaatgatgat cgttgccagc ccaacagaaa601 atggacaggt acttcgtgta attccaccta cccagacagg aatggcacaa gtgattatac661 ctcaggggca acttgtggat gtgaatagtc ctcgggatgt ccctgaagag aaacccagta721 acagaaactt accaactgta agagtggata ctctagcaga caataccagc aattacattc781 ttcatcctca aacatccttc ccattgccca aaaagtcagt gaccggaatg ctggaagaac841 cccttctggg gcctcttcag ccactttctt ctaatacacc tatatgggcc tgccgtctta901 ggagctgtga gaaaattgga gattcatacc gtggctactg tgtaagtgag actgaattag961 aaagtgtcct aacatttcac gagcagcaaa cacagagtgt ttgggggacc cgtcagtctc1021 caagcccagc caagcctgct acacgcttga tgtggaaatc ccagtatgtt ccatatgatg1081 gaatcccatt tgttaatgca gggagtagag ctgtggtaat ggagtgtcag tatgggccaa1141 gaagaaaagg tttccagtta aaaaaagtca gtgagcagga aagcaggtct tgtcagctct1201 acaaagccac ttgtccagct cggatttaca ttaaaaaggt acagaagttt cctgaatata1261 gagttcctac agaccccaaa attgacaaga aaattatcag aatggagcag gagaaagctt1321 ttaacatgct aaagaagaac ttggtagatg ctggtggtgt tcttaggtgg tatgtacagt1381 tacctacaca gcaagctcat cagtatcatg aattagagac tccctgcctc actttgtcac1441 cttctccttt tcctgtgtct tctcttgaag aagaggaaac tgcagttaga gatgagaatt1501 gtgcattacc ctcacgttta catcctcaag tagcacataa gattcaagaa ttagtatcac1561 agggaataga acaagtgtat gcagtaagga aacagctaag aaaatttgtg gaaagggaac1621 tgttcaaacc cgatgaggta cctgaaagac ataatttatc tttttttcca actgtaaatg1681 atataaaaaa tcacatccat gaggtacaga aatccttgag aaatggagat acggtatata1741 actcagagat tattccagca acgcttcaat ggactacaga cagtgggaat attctcaaag1801 agaccatgac agttacattt gcagaaggaa attcaccagg agaatcaatt accaccaaag1861 tggaaacaaa tcagaccagg ggttctttgt ctcctgagcc aacccacttg ctctcctcac1921 tctcctcatt tcagcccaaa atatttacac aactacaggg tttgcagtta caaccaaggt1981 acacctctcc tgatgaatca ccagctgtgg tatcagtaaa taaccagccg tcctctagtc2041 cttcaggact tctggataca ataggaagtg ctgtaatgaa taataattct ctactgcttg2101 gtcaaagtca tagccttcaa agagatacat gcttaaccca aaacaatagt actgcctcca2161 ccatgggtaa ccttccagaa ccagatcaaa atctagttgc aatggacgag ctggtagaag2221 ttggagatgt tgaggataca gggaatctgg aaggaactgt tcatcggatt ctgttgggag2281 atgtgcagac tattccaata cagattatag acaaccactc agctcttatt gaagaaaatc2341 cagaaagtac catttctgtg agccaagtta aacaagaacc caaagaacca gcattgtcta2401 tggaagcaaa aaaaactgtg gactataaga aattatctgc tacataaatt attgaagctt2461 ttcagaattt acaactctgg tgacttctga tgtcttagaa aggaaggtga atatagtcaa2521 agcgtggcat tgagataatt ggactgaaga ccagtttgat gagaagcttt tatttaaaac2581 tgatatattt gttgccagtt ccatattttt accttcctta agagatgttt tactcttctt
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權(quán)利要求
1.一種睪丸功能特異基因(NYD-SP24)克隆制備的融合蛋白，其特征是NYD-SP24基因全部開(kāi)放閱讀框氨基酸，序列為QNIPGPLTQTQTLSAEQFHLVDQNGQAIQYELQSLGESNAQMMIVASPTENGQVLRVIPPTQTGMAQVIIPQGQLVDVNSPRDVPEEKPSNRNLPTVRVDTLADNTSNYILHPQTSFPLPKKSVTGMLEEPLLGPLQPLSSNTPIWACRLRSCEKIGDSYRGYCVSETELESVLTFHEQQTQSVWGTRQSPSPAKPATRLMWKSQYVPYDGIPFVNAGSRAVVMECQYGPRRKGFQLKKVSEQESRSCQLYKATCPARIYIKKVQKFPEYRVPTDPKIDKKIIRMEQEKAFNMLKKNLVDAGGVLRWYVQLPTQQAHQYHELETPCLTLSPSPFPVSSLEEEETAVRDENCALPSRLHPQVAHKIQELVSQGIEQVYAVRKQLRKFVERELFKPDEVPERHNLSFFPTVNDIKNHIHEVQKSLRNGDTVYNSEIIPATLQWTTDSGNILKETMTVTFAEGNSPGESITTKVETNQTRGSLSPEPTHLLSSLSSFQPKIFTQLQGLQLQPRYTSPDESPAVVSVNNQPSSSPSGLLDTIGSAVMNNNSLLLGQSHSLQRDTCLTQNNSTASTMGNLPEPDQNLVAMDELVEVGDVEDTGNLEGTVHRILLGDVQTIPIQIIDNHSALIEENPESTISVSQVKQEPKEPALSMEAKKTVDYKKLSAT
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述針對(duì)NYD-SP24基因開(kāi)放閱讀框氨基酸序列制備的多克隆抗體，其特征是融合蛋白與完全和不完全佐劑混合后，免疫新西蘭兔制備多克隆抗體。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述針對(duì)NYD-SP24基因開(kāi)放讀框氨基酸序列制備的單克隆抗體，其特征是融合蛋白與完全和不完全佐劑混合，免疫Balb/C小鼠，分離脾臟B淋巴細(xì)胞并和骨髓瘤細(xì)胞融合產(chǎn)生雜交瘤細(xì)胞，進(jìn)一步用亞克隆方法、ELISA和抗體分型方法篩選分泌IgG抗體的單克隆，制備單克隆抗體。
4.根據(jù)權(quán)利要求1所述針對(duì)將NYD-SP24基因開(kāi)放讀框氨基酸序列用于制備睪丸功能基因表達(dá)芯片，其特征是PCR擴(kuò)增NYD-SP24基因cDNA，點(diǎn)于芯片用于芯片制備。
5.根據(jù)權(quán)利要求1所述，針對(duì)NYD-SP24基因開(kāi)放讀框氨基酸序列用于制備融合蛋白，其特征是融合蛋白可作為制備治療相關(guān)疾病的藥物。
全文摘要
本發(fā)明屬于人類基因組技術(shù)領(lǐng)域,所述的人睪丸發(fā)育特異性蛋白－24基因(testis development specific protein gene 24,NYD－SP24)基因全長(zhǎng)cDNA序列為2823bp,其開(kāi)放閱讀框序列為2178bp,其編碼725個(gè)氨基酸,該基因在基因庫(kù)(Genbank)中的編號(hào)為AY032876。本發(fā)明利用NYD－SP24基因克隆制備融合蛋白,并用該蛋白免疫動(dòng)物制備單克隆和多克隆抗體,同時(shí)將基因克隆用于睪丸特異功能基因表達(dá)芯片的制備。
文檔編號(hào)A61P15/08GK1344742SQ0112720
公開(kāi)日2002年4月17日 申請(qǐng)日期2001年9月13日 優(yōu)先權(quán)日2001年9月13日
發(fā)明者沙家豪, 周作民, 李建民 申請(qǐng)人:南京醫(yī)科大學(xué)