專利名稱：化合物、組合物和其制備方法
化合物、組合物和其制備方法相關(guān)申請(qǐng)案本申請(qǐng)案主張2008年4月21日申請(qǐng)的美國(guó)臨時(shí)專利申請(qǐng)案第61/124,949號(hào)、 2008年4月23日申請(qǐng)的美國(guó)臨時(shí)專利申請(qǐng)案第61/125,205號(hào)、和2008年5月16日申請(qǐng) 的美國(guó)臨時(shí)專利申請(qǐng)案第61/127,900號(hào)的優(yōu)先權(quán)，每一案件的全部揭示內(nèi)容皆以引用的 方式并入本文中。
背景技術(shù)：
蛋白磷酸酶2A( “PP2A”)是一種具有寬底物特異性和不同細(xì)胞功能的普 遍存在且保守的絲氨酸/蘇氨酸磷酸酶。PP2A通常以包含催化性C-、結(jié)構(gòu)或支架 A-和調(diào)控性B-型亞單位(屬于B、B'、B〃和B' 〃家族)的異源三聚體形式存 在。在活體內(nèi)，大部分A-和C-亞單位形成穩(wěn)定的異源二聚體，其也稱作核心酶(參 見普萊斯 N.E.(Price，N.E.)和姆貝 M.C. (Mumby，M.C.)生物化學(xué)(Biochemistry) 39， 11312-11318(2000))。B型亞單位指示底物特異性和亞細(xì)胞定位。具有特異性B型亞單 位的異源三聚體全酶組裝產(chǎn)生PP2A特異性、可調(diào)節(jié)PP2A對(duì)不同底物的動(dòng)力學(xué)性質(zhì)(參 見普萊斯N.E.和姆貝M.C.，生物化學(xué)39，11312-11318(2000))且因此可能影響對(duì)所述底 物的PP2A酶活性。PP2A的催化性亞單位的C端亮氨酸殘基的α-羧基經(jīng)受可逆甲基酯化 和甲基-酯水解，并且ΡΡ2Α的甲基化狀態(tài)調(diào)控異源三聚體組裝[參見托爾斯特赫 Τ. (Tokstykh, Τ.)等人，EMBO J.19(21) 5682-91(2000)；吳 J. (Wu，J.)等人， EMBO J.19 (21) 5672-81 (2000)；魏 H.(Wei，H.)等人，J.Biol.Chem.276 (2) 1570-77(2001)；和于 X.X.(Yu，X.X.)等人，Mol.Biol.Cell 12(1) 185-99(2001)]。羧基 甲基化需要S-腺苷-甲硫氨酸(SAM)依賴性甲基轉(zhuǎn)移酶(MT、Mt酶、LCMT或PPMT) (參見李 J.CLee，J.)和斯托克 J. (Stock，J.)，J.Biol.Chem.268，19192-19195(1993))，其 識(shí)別SAM和AC異源二聚體或異源三聚體全酶(但并非單獨(dú)C亞單位)作為底物。甲基 化PP2A是通過(guò)特異性甲酯酶(ME、ME酶、PMEl或PPME)脫甲基化(參見李J.，陳 Y. (Chen, Y.)、托爾斯特赫 Τ.和斯托克 J.，P.N.A.S.U.S.A.93，6043-6047.(1996))。作為細(xì)胞功能的通用調(diào)節(jié)劑，PP2A對(duì)正常生物活動(dòng)十分重要。PP2A的功能失 常與多種疾病病況相關(guān)。PP2A甲基化和/或活性改變與尤其包括神經(jīng)病癥、神經(jīng)變性疾 病、糖尿病、胰島素抗性和代謝性綜合癥的各種病癥、疾病和病況相關(guān)。
經(jīng)分離且經(jīng)純化的睡茄酰胺和睡茄內(nèi)酯闡述于美國(guó)專利第7,282,593中。美國(guó)專 利公開案第2007/0197629號(hào)闡述褪黑素類似物，其對(duì)成骨細(xì)胞和破骨細(xì)胞二者起抑制性 作用。美國(guó)專利第5,714,094號(hào)闡述抗氧化劑組合物和從研磨咖啡殘?jiān)挠偷哪z狀滲余 物回收抗氧化劑組合物的方法。美國(guó)專利第4,939,174號(hào)闡述自脂肪酸載劑和神經(jīng)活性藥 物的前藥形成。

發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明提供調(diào)節(jié)PP2A活性的化合物和/或組合物。所關(guān)注的某些化合物可分 離自天然來(lái)源(參見，例如，美國(guó)臨時(shí)專利申請(qǐng)案第61/124,949號(hào)、第61/125,205號(hào)和 第61/125,169、美國(guó)專利公開案第2006/0171938號(hào)、和美國(guó)專利公開案第2008/0213406 號(hào)、和申請(qǐng)案第PCT/US06/003686號(hào))；和/或某些化合物可經(jīng)合成(參見，例如，美 國(guó)臨時(shí)專利申請(qǐng)案第61/127,900)，每一案件皆以引用的方式并入本文中。已發(fā)現(xiàn)如本文所述，本文所述式(例如，式I、la、lb、Ic、Id、Ie、If、Ig和 /或Ih)的某些化合物和其類和亞類調(diào)節(jié)PP2A的活性。調(diào)節(jié)PP2A的活性的化合物可用 于治療各種疾病和/或病癥，例如，神經(jīng)變性病癥、糖尿病和代謝性病癥。在一些實(shí)施 例中，所述化合物直接調(diào)節(jié)PP2A活性；在一些實(shí)施例中，所述化合物間接調(diào)節(jié)PP2A活 性。在一些實(shí)施例中，所述化合物調(diào)節(jié)PP2A甲基化狀態(tài)。在一些實(shí)施例中，所述化合物 調(diào)節(jié)PP2A甲基轉(zhuǎn)移酶的活性；在一些實(shí)施例中，所述化合物調(diào)節(jié)PP2A甲酯酶的活性。本發(fā)明另外提供可制備所關(guān)注化合物的合成技術(shù)。合成技術(shù)可用于制備在自然 界也存在的化合物，但重要的是還可獲得有關(guān)化學(xué)結(jié)構(gòu)的其它化合物(參見，例如，美 國(guó)臨時(shí)專利申請(qǐng)案第61/127,900號(hào))，其以引用的方式并入本文中。因此，本發(fā)明提供化合物、組合物、和/或其制備方法或在治療多種病癥、疾 病或病況中的任一者中的用途。在一些實(shí)施例中，本發(fā)明提供化合物、組合物、和/或 其制備方法或在治療一種或多種與異常PP2A甲基化水平和/或異常PP2A磷酸酶活性相 關(guān)的疾病、病癥或病況中的用途。在一些實(shí)施例中，本發(fā)明提供化合物、組合物、和/或其制備方法或在治療(例 如)某些神經(jīng)病癥、神經(jīng)變性疾病、糖尿病、胰島素抗性和/或代謝性綜合癥中的用途。還涵蓋可調(diào)節(jié)PP2A活性的不管是合成的還是天然的所提供化合物和組合物(例 如，調(diào)節(jié)PP2A的甲基化的化合物、調(diào)節(jié)PP2A的脫甲基化的化合物、調(diào)節(jié)PP2A底物 與PP2A的相互作用的化合物、調(diào)節(jié)輔助蛋白與PP2A的相互作用的化合物和/或直接與 PP2A相互作用的化合物等)。在某些實(shí)施例中，所述化合物和組合物在最小化甲基轉(zhuǎn)移 酶的抑制的同時(shí)最大化甲酯酶的抑制和/或阻礙甲基轉(zhuǎn)移酶和/或PP2A?？捎糜诒景l(fā)明的化合物包括所繪示的式I的所述者和其各種類別和亞類
權(quán)利要求
1. 一種式I化合物
2.如權(quán)利要求IA所述的化合物，所述化合物不是選自由以下組成的群組的化合物N-(l，4-二甲基戊基)-5，6-二甲基-3-苯并呋喃乙酰胺；Ν-[2-(6-甲氧基-IH-吲哚-3-基)乙基]-十二酰胺；N-(l，4-二甲基戊基)-IH-吲哚-3-丙酰胺；N-(l，1-二乙基-2-丙炔-1-基)-IH-吲哚-3-丙酰胺；N-(l-甲基己基)-IH-吲哚-3-丙酰胺；N-(l，1-二乙基-2-丙炔-1-基)-IH-吲哚-3-乙酰胺；N-(2-乙基己基)-IH-吲哚-3-甲酰胺；N-(l，1-二乙基-2-丙炔-1-基)-6_乙基-3-苯并呋喃乙酰胺； Ν-[2- (5-氯-IH-吲哚-3-基)乙基|-2-乙基-己酰胺； Ν-[2-(5-羥基-IH-叼丨哚-3-基)乙基]-5，8，11，14-二十碳四烯酰胺； 2-乙基-Ν_[2-(5-甲基-IH-吲哚-3-基)乙基]-己酰胺；1-甲基-N-(5-甲基己-2-基)-IH-吲哚-2-甲酰胺； N-(l，5-二甲基己基)-6-甲氧基-3-苯并呋喃乙酰胺； N-(l，5-二甲基己基)-IH-吲哚-3-丙酰胺;2-乙基-Ν_[2-(5-甲氧基-IH-吲哚-3-基)乙基]-己酰胺； N-(l，4-二甲基戊基)-IH-吲哚-3-乙酰胺;Ν-[2- (6-甲氧基-IH-吲哚-3-基)乙基|-2-丙基-戊酰胺；N-(l，5-二甲基己基)-IH-吲哚-3-乙酰胺;Ν-[2- (5-氯-IH-吲哚-3-基)乙基]-2_丙基-戊酰胺；6-甲氧基-N-[(1S)_1-甲基己基]-3_苯并呋喃乙酰胺；N-[2- (5-甲基-IH-吲哚-3-基)乙基|-2-丙基-戊酰胺；Ν-(1，ι-二乙基-2-丙炔-ι-基)-6-甲氧基-3-苯并呋喃乙酰胺；N-十二烷基_ α -氧代-IH-吲哚-3-乙酰胺；N-(l，4- 二甲基戊基)-6-甲氧基-3-苯并呋喃乙酰胺；5-溴-N-十八烷基_ α _氧代-IH-吲哚-3-乙酰胺；N-[3-乙基-2-(4-嗎啉基)戊基]-Ν' -[2-(1Η-吲哚_3_基)乙基]-脲； N-4-羥基-Nl_[2- (1H-吲哚-3-基)乙基]-2_ (2-甲基丙基)-丁二酰胺； 4-己烯酸3-[2-[[2-(1Η-吲哚-3-基乙基]氨基]-2_氧代乙基]-甲基-酯； 庚酸7-[[[6-(氨基亞氨基甲基)-1Η-吲哚-3-基]羰基]氨基hl，1- 二甲基乙酯； 庚酸7-[[[6_ (氨基硫代甲基)-IH-吲哚-3-基]羰基]氨基]_1，1- 二甲基乙酯； 2-[[2-(1Η-吲哚-3-基)乙?；鵠氨基]-(2S)-庚酸； N-[3-乙基-2-(4-嗎啉基)戊基]-1Η-吲哚-3-丙酰胺；N4-羥基-Nl_[2- (1H-吲哚-3-基)乙基]-Ν1_甲基_2_ (2~甲基丙基)-(2R) - 丁二 酰胺；庚酸7-[[[5-(氨基亞氨基甲基)-1Η-吲哚-3-基]羰基]氨基hl，1- 二甲基乙酯；和
3.如權(quán)利要求1所述的化合物，其中所述化合物具有式II
4.如權(quán)利要求1所述的化合物，其中所述化合物具有式III
5.如權(quán)利要求1所述的化合物，其中所述化合物具有式VI
6.如權(quán)利要求1所述的化合物，其中所述化合物具有式VII
7.如權(quán)利要求1所述的化合物，其中所述化合物具有式VIII
8.如權(quán)利要求1所述的化合物，其中所述化合物具有式IX
9.如權(quán)利要求1所述的化合物，其中所述化合物具有式Ia
10.如權(quán)利要求1所述的化合物，其中所述化合物具有式Ib
11.如權(quán)利要求1所述的化合物，其中所述化合物具有式Ic
12.如權(quán)利要求1所述的化合物，其中所述化合物具有式Id
13.如權(quán)利要求1所述的化合物，其中所述化合物具有式Ie
14. 一種式I化合物
15.如權(quán)利要求14所述的化合物，其中所述化合物具有式II
16.如權(quán)利要求14所述的化合物，其中所述化合物具有式III
17.如權(quán)利要求14所述的化合物，其中所述化合物具有式VI
18.如權(quán)利要求14所述的化合物，其中所述化合物具有式VII
19.如權(quán)利要求14所述的化合物，其中所述化合物具有式VIII
20.如權(quán)利要求14所述的化合物，其中所述化合物具有式IX
21.如權(quán)利要求14所述的化合物，其中所述化合物具有式Ia
22.如權(quán)利要求14所述的化合物，其中所述化合物具有式Ib
23.如權(quán)利要求14所述的化合物，其中所述化合物具有式Ic
24.如權(quán)利要求14所述的化合物，其中所述化合物具有式Id
25.如權(quán)利要求14所述的化合物，其中所述化合物具有式Ie
26.—種式I分離化合物
27.如權(quán)利要求26所述的化合物，其中所述化合物具有式II
28.如權(quán)利要求26所述的化合物，其中所述化合物具有式III
29.如權(quán)利要求26所述的化合物，其中所述化合物具有式VI
30.如權(quán)利要求26所述的化合物，其中所述化合物具有式VII
31.如權(quán)利要求26所述的化合物，其中所述化合物具有式VIII
32.如權(quán)利要求26所述的化合物，其中所述化合物具有式IX
33.如權(quán)利要求26所述的化合物，其中所述化合物具有式Ia
34.如權(quán)利要求26所述的化合物，其中所述化合物具有式Ib
35.如權(quán)利要求26所述的化合物，其中所述化合物具有式Ic
36.如權(quán)利要求26所述的化合物，其中所述化合物具有式Id
37.如權(quán)利要求26所述的化合物，其中所述化合物具有式Ie
38.一種式I化合物其中Z選自由以下組成的群組
39. 一種組合物，其包含式I化合物
40.如權(quán)利要求1、14、26和38中任一權(quán)利要求所述的化合物，其選自由以下組成的群組
41.如權(quán)利要求1、14、26和38中任一權(quán)利要求所述的化合物，其選自由以下組成的群組
42.—種組合物，其包含式I化合物 其中Z選自由以下組成的群組
43.如權(quán)利要求42所述的組合物，所述組合物另外包含至少一種來(lái)自產(chǎn)生所述化 合物的植物來(lái)源的組份，所述植物來(lái)源選自由以下組成的群組綠咖啡豆、烘焙咖 啡豆、研磨咖啡豆殘?jiān)?spent ground coffee bean)、咖啡蠟(統(tǒng)稱為“咖啡”)、櫻桃咖啡(coffee cherry)(漿果)、巧克力、睡茄(withania somnifera)(果實(shí))、金雀花 (Butcher‘ sbroom)(根)、椰子、銀杏(ginkgo biloba)、假馬齒覽(bacopa monniera)、黑 種草(nigellasativa)、圣約翰草(St.John' s wort)、鳳梨釋迦(annona atemoya)(種子)、 禾口蒜果木(scorodocarpus borneensis)(果實(shí))。
44.如權(quán)利要求42或43所述的組合物，所述組合物實(shí)質(zhì)上不含咖啡因、咖啡酸或綠原酸。
45.一種治療有需要的患者的與異常PP2A甲基化和/或活性有關(guān)的疾病或病癥或減 輕其嚴(yán)重程度的方法，所述方法包含向所述患者投與如權(quán)利要求1、14、26和38中任一 權(quán)利要求所述的化合物或如權(quán)利要求42所述的組合物的步驟。
46.如權(quán)利要求45所述的方法，其中所述疾病或病癥選自神經(jīng)病癥、神經(jīng)變性疾病、 糖尿病和/或代謝綜合癥。
47.如權(quán)利要求46所述的方法，其中所述代謝綜合癥選自高血糖癥、胰島素生成減 少、胰島素分泌減少和胰島素抵抗。
48.如權(quán)利要求46所述的方法，其中所述神經(jīng)變性疾病是帕金森氏病 (Parkinson‘ sdisease)或阿茲海默氏病(Alzheimer' s disease)。
49.一種治療糖尿病的方法，其包含向有需要的患者投與治療有效量的如權(quán)利要求38 所述的化合物、或如權(quán)利要求39所述的醫(yī)藥組合物。
50.—種提取物，其包含至少一種具有式⑴的脂肪酸化合物和/或提取物，所述化 合物和/或提取物具有低于約50 μ M的甲酯酶抑制活性(IC5tl)，其特征在于游離脂肪酸含 量低于約20%。
51.如權(quán)利要求1、14、26和38中任一權(quán)利要求所述的化合物，其具有以下結(jié)構(gòu)
52.一種制備提取物的方法，所述方法包含使包含咖啡蠟的組合物與溶劑接觸；將所述組合物加熱至與所述溶劑的沸點(diǎn)相差約20°C以內(nèi)的溫度來(lái)產(chǎn)生提取物；冷卻所述提取物；和收集所述提取物中包含如權(quán)利要求1、14、26和38中任一權(quán)利要求所述的化合物的 部分。
53.如權(quán)利要求52所述的方法，其中所述溶劑是選自乙腈和乙酸乙酯的溶劑。
54.如權(quán)利要求52所述的方法，其中所述方法另外包含使所述提取物的所述部分與溶劑接觸；將所述提取物的所述部分加熱至與所述溶劑的沸點(diǎn)相差約20°C以內(nèi)的溫度；冷卻所述提取物的所述部分；和收集所述提取部分中包含如權(quán)利要求1、14、26和38中任一權(quán)利要求所述的化合物 的部分。
55.如權(quán)利要求54所述的方法，其中所述溶劑是選自乙腈、己烷、和石油醚的溶劑。
56.如權(quán)利要求52所述的方法，其中所述方法另外包含分離所述提取物的所述部分中富集如權(quán)利要求1、14、26和38中任一權(quán)利要求所述 的化合物的流份。
57.如權(quán)利要求56所述的方法，其中分離富集化合物1-63的流份。
58.如權(quán)利要求56所述的方法，其中分離富集1-62的流份。
59.如權(quán)利要求56所述的方法，其中分離富集1-62和1-63的流份。
60.一種制備式I化合物或其醫(yī)藥上可接受的鹽的方法
61.如權(quán)利要求60所述的方法，其中Y是-OH并且X是NH。
62.如權(quán)利要求60所述的方法，其中所述步驟另外包含添加偶合劑。
63.如權(quán)利要求62所述的方法，其中所述偶合劑選自HATU、PyBop和DCC。
64.如權(quán)利要求60所述的方法，其另外包含使所述式B的酸
65.如權(quán)利要求64所述的方法，其中所述適宜試劑是亞硫酰氯、亞硫酰碘或草酰氯。
66.如權(quán)利要求64所述的方法，其中W是
67.如權(quán)利要求66所述的方法，其中ρ為17。
68.如權(quán)利要求60所述的方法，其中所述偶合步驟是在適宜堿存在下進(jìn)行的。
69.如權(quán)利要求60所述的方法，其中所述式I化合物是1-63、或其醫(yī)藥上可接受的鹽 或前藥。
70.如權(quán)利要求60所述的方法，其中所述步驟是在介于_12°C至約90°C范圍內(nèi)的溫度 下進(jìn)行的。
71.如權(quán)利要求70所述的方法，其中所述步驟是在介于約0°C至約60°C范圍內(nèi)的溫度 下進(jìn)行的。
72.如權(quán)利要求71所述的方法，其中所述步驟是在約16°C至約28°C下進(jìn)行的。
73.如權(quán)利要求60所述的方法，其中pH值在約7.5至約10范圍內(nèi)。
74.如權(quán)利要求73所述的方法，其中所述pH值在約8.5至約9.5范圍內(nèi)。
75.如權(quán)利要求74所述的方法，其中所述pH值為約9。
76.—種組合物，其包含如權(quán)利要求1所述的化合物，其量為約0.5%至約3.0% (wt% )； 吐溫(Tween)8O,其量為約20%至約30% (wt% )； PEG-400,其量為約 20% 至約 30% (wt% )； PBS,其量為約40%至約43% (wt% )；并且 pH值為約4,0至約9.0。
77.—種組合物，其包含如權(quán)利要求1所述的化合物，其量為約0.5%至約3.0% (wt% )；油酸乙酯，其量為約0.01%至約(wt% )；色魯托(solutol)-HS 15，其量為約 0.01%至約 7% (wt% )；SDA-3A醇，其量為約0.01%至約5% (wt% )；異丙醇，其量為約0.01%至約7% (wt% )；吐溫80，其量為約20%至約30% (wt% )；PEG-400,其量為約 20% 至約 30% (wt% )；PBS,其量為約40%至約43% (wt% )；并且pH值為約4,0至約9.0。
78.—種方法，其包括以下步驟 (a)提供多種式I化合物；(b)評(píng)價(jià)所述多種化合物中的至少一者對(duì)PP2A活性的影響；和/或 (C)確定至少一種化合物調(diào)節(jié)PP2A活性。
全文摘要
本發(fā)明提供調(diào)節(jié)PP2A甲基化和/或活性的化合物和/或組合物和其制備方法，其可用于調(diào)節(jié)PP2A的脫甲基化、調(diào)節(jié)PP2A的甲基化和/或調(diào)節(jié)PP2A的活性。
文檔編號(hào)A61K31/405GK102014897SQ200980114132
公開日2011年4月13日 申請(qǐng)日期2009年4月21日 優(yōu)先權(quán)日2008年4月21日
發(fā)明者戈帕爾·薩爾加達(dá)蘭, 斯科特·瓦法伊, 李圣燁, 李珠, 杰弗里·B·斯托克, 邁克爾·沃龍科夫, 顧浩明, 馬克斯韋爾·斯托克 申請(qǐng)人:西格納姆生物科學(xué)公司