專利名稱：用于結(jié)直腸腺癌的診斷的基于蛋白質(zhì)的方法和組合物的制作方法
用于結(jié)直腸腺癌的診斷的基于蛋白質(zhì)的方法和組合物發(fā)明主題
本發(fā)明的涉及用于檢測(cè)結(jié)腸腺癌的造影劑、診斷標(biāo)記和方法。
背景技術(shù)：
大多數(shù)癌癥是上皮來(lái)源的并且通過(guò)從正常細(xì)胞經(jīng)發(fā)育異常逐步進(jìn)展至惡性細(xì)胞而產(chǎn)生，所述惡性細(xì)胞侵入外圍組織并且具有轉(zhuǎn)移潛能。結(jié)直腸癌(CRC ;也稱為結(jié)腸癌或大腸癌)是經(jīng)歷這樣的腫瘤進(jìn)展的一個(gè)突出類型的癌癥。CRC包括結(jié)腸、直腸和闌尾中的癌生長(zhǎng)。其為最重要的人癌癥之一，具有每年全世界約1，000，000例新病例的發(fā)病率。因此，CRC是第三大常見(jiàn)癌癥和世界上癌相關(guān)死亡的第四大原因(西方國(guó)家的第二大原因；綜述于例如Gryfe, R.等人(1997) Curr. Probl.Cancer 21, 233-300; Petersen, G. M.等人(1999) Cancer 86, 2540-2550 中。
如果在腫瘤發(fā)展的早期(即I期)被診斷，CRC是可治愈的。早期CRC的五年生存率超過(guò)90%。在該早期中，大多數(shù)患者不具有該疾病的表型癥狀。早期檢測(cè)可顯著增加長(zhǎng)期生存的機(jī)會(huì)，因?yàn)樘幱谀[瘤發(fā)展的晚期(即IV期)的CRC的五年生存率僅為低于5%。超過(guò)95% 的 CRC 病例表現(xiàn)為腺癌(Muto, T.等人(1975) Cancer 36，2251-2270; Fearon, E.R.等人(1990) Cell 61，759 767)。在過(guò)去，采取篩查來(lái)鑒定牽涉從低風(fēng)險(xiǎn)結(jié)直腸腺瘤至高風(fēng)險(xiǎn)腺癌的進(jìn)展的基因。為此，鑒定其表達(dá)在結(jié)直腸腺癌中相對(duì)于在腺瘤中被上調(diào)或下調(diào)的基因(參見(jiàn)例如Carvalho 等人(2009) Gut 58，79-89)。目前，結(jié)腸鏡檢查術(shù)是在目前應(yīng)用的技術(shù)當(dāng)中具有最高的檢測(cè)結(jié)直腸腫瘤的靈敏度和特異度的CRC的標(biāo)準(zhǔn)篩查方式。然而，利用結(jié)腸鏡檢查術(shù)的篩查可具有不利方面。此類不利方面是(i)當(dāng)為無(wú)癥狀個(gè)體提供CRC篩查時(shí)，結(jié)腸鏡檢查術(shù)是為限制因素的侵入性技術(shù)，(ii)作為結(jié)腸鏡檢查術(shù)的結(jié)果存在小的但嚴(yán)重的腸穿孔的風(fēng)險(xiǎn)以及(iii)結(jié)腸鏡檢查術(shù)不能區(qū)分非進(jìn)行性(低風(fēng)險(xiǎn))與進(jìn)行性(高風(fēng)險(xiǎn))結(jié)腸腫瘤損傷。因此，存在對(duì)允許CRC的診斷的試劑、組合物、標(biāo)記和方法的持續(xù)需要。本發(fā)明的目的和概述
本發(fā)明的一個(gè)目的是提供允許診斷CRC的方法。本發(fā)明的進(jìn)一步目的是提供可用于診斷CRC的標(biāo)記。本發(fā)明的另一個(gè)目的涉及可用于檢測(cè)CRC的造影劑的提供。這些和其他目的(如根據(jù)下文中接下來(lái)的描述它們將變得顯然)形成了獨(dú)立權(quán)利要求主題。本發(fā)明的某些優(yōu)選實(shí)施方案形成了從屬權(quán)利要求的主題。因此在一個(gè)實(shí)施方案中，本發(fā)明涉及診斷標(biāo)記，優(yōu)選用于CRC的診斷標(biāo)記，其包含由下列多肽組成的組的至少一種多肽
SEQ ID No. : I 的多肽；
SEQ ID No. : 2 的多肽；
SEQ ID No. : 3 的多肽； SEQ ID No. :4 的多肽；
SEQ ID No. :5 的多肽；
SEQ ID No. :6 的多肽；
SEQ ID No. :7 的多肽；
SEQ ID No. :8 的多肽；
SEQ ID No. :9 的多肽；
SEQ ID No. :10 的多肽；
SEQ ID No. :11 的多肽;
SEQ ID No. :12 的多肽;
SEQ ID No. :13 的多肽;
SEQ ID No. :14 的多肽;
SEQ ID No. :15 的多肽；
SEQ ID No. :16 的多肽；
SEQ ID No. :17 的多肽;
SEQ ID No. :18 的多肽；
SEQ ID No. :19 的多肽;
SEQ ID No. :20 的多肽;
SEQ ID No. :21 的多肽;
SEQ ID No. :22 的多肽;
SEQ ID No. :23 的多肽;
SEQ ID No. :24 的多肽;
SEQ ID No. :25 的多肽;
SEQ ID No. :26 的多肽;
SEQ ID No. :27 的多肽;
SEQ ID No. :28 的多肽;
SEQ ID No. :29 的多肽;
SEQ ID No. :30 的多肽;
SEQ ID No. :31的多肽，和/或;
SEQ ID No. :32 的多肽。本發(fā)明在其他實(shí)施方案中涉及選自由下列多肽組成的組的至少一種多肽作為診斷標(biāo)記，優(yōu)選用于檢測(cè)CRC的診斷標(biāo)記的用途
SEQID No. :I 的多肽；
SEQID No. :2 的多肽；
SEQID No. :3 的多肽；
SEQID No. :4 的多肽；
SEQID No. :5 的多肽；
SEQID No. :6 的多肽；
SEQID No. :7 的多肽；
SEQID No. :8 的多肽； SEQID No. :9 的多肽;
SEQID No. :10 的多肽；
SEQID No. :11 的多肽;
SEQID No. :12 的多肽;
SEQID No. :13 的多肽;
SEQID No. :14 的多肽;
SEQID No. :15 的多肽；
SEQID No. :16 的多肽；
SEQID No. :17 的多肽;
SEQID No. :18 的多肽；
SEQID No. :19 的多肽;
SEQID No. :20 的多肽;
SEQID No. :21 的多肽;
SEQID No. :22 的多肽;
SEQID No. :23 的多肽;
SEQID No. :24 的多肽;
SEQID No. :25 的多肽;
SEQID No. :26 的多肽;
SEQID No. :27 的多肽;
SEQID No. :28 的多肽;
SEQID No. :29 的多肽;
SEQID No. :30 的多肽;
SEQID No. :31的多肽，和/或
SEQID No. :32 的多肽。在一個(gè)實(shí)施方案中，在人或動(dòng)物體外進(jìn)行這樣的用途。本發(fā)明的另一個(gè)方面涉及任選地用于磁共振成像(MRI)和/或磁光子成像(magneticphotonimaging) (MPI)的造影劑,其包含至少一種能夠與選自由下列多肽組成的組的多肽相互作用的化合物
SEQID No. :I 的多肽；
SEQID No. :2 的多肽；
SEQID No. :3 的多肽；
SEQID No. :4 的多肽；
SEQID No. :5 的多肽；
SEQID No. :6 的多肽；
SEQID No. :7 的多肽；
SEQID No. :8 的多肽；
SEQID No. :9 的多肽；
SEQID No. :10 的多肽；
SEQID No. :11 的多肽; SEQ ID No. :12 的多肽;
SEQ ID No. :13 的多肽;
SEQ ID No. :14 的多肽;
SEQ ID No. :15 的多肽；
SEQ ID No. :16 的多肽；
SEQ ID No. :17 的多肽;
SEQ ID No. :18 的多肽；
SEQ ID No. :19 的多肽;
SEQ ID No. :20 的多肽;
SEQ ID No. :21 的多肽;
SEQ ID No. :22 的多肽;
SEQ ID No. :23 的多肽;
SEQ ID No. :24 的多肽;
SEQ ID No. :25 的多肽;
SEQ ID No. :26 的多肽;
SEQ ID No. :27 的多肽;
SEQ ID No. :28 的多肽;
SEQ ID No. :29 的多肽;
SEQ ID No. :30 的多肽;
SEQ ID No. :31 的多肽；和 / 或 SEQ ID No. : 32 的多肽。在優(yōu)選實(shí)施方案中，將此類化合物偶聯(lián)至優(yōu)選可被MRI或MPI檢測(cè)的標(biāo)記分子?；衔飪?yōu)選地可以是抗體。此類造影劑優(yōu)選地可用于檢測(cè)CRC。在其他實(shí)施方案中，本發(fā)明涉及至少一種能夠與選自由下列多肽組成的組的多肽相互作用的抗體作為造影劑(任選地適用于MRI和/或MPI)的用途
SEQ ID No. :I 的多肽；
SEQ ID No. :2 的多肽;
SEQ ID No. :3 的多肽；
SEQ ID No. :4 的多肽；
SEQ ID No. :5 的多肽；
SEQ ID No. :6 的多肽；
SEQ ID No. :7 的多肽；
SEQ ID No. :8 的多肽；
SEQ ID No. :9 的多肽；
SEQ ID No. :10 的多肽；
SEQ ID No. :11 的多肽;
SEQ ID No. :12 的多肽;
SEQ ID No. :13 的多肽;
SEQ ID No. :14 的多肽; SEQIDNo. :15 的多肽；
SEQIDNo. :16 的多肽；
SEQIDNo. :17 的多肽;
SEQIDNo. :18 的多肽；
SEQIDNo. :19 的多肽;
SEQIDNo. :20 的多肽;
SEQIDNo. :21 的多肽; SEQIDNo. :22 的多肽;
SEQIDNo. :23 的多肽;
SEQIDNo. :24 的多肽;
SEQIDNo. :25 的多肽;
SEQIDNo. :26 的多肽;
SEQIDNo. :27 的多肽;
SEQIDNo. :28 的多肽;
SEQIDNo. :29 的多肽;
SEQIDNo. :30 的多肽;
SEQIDNo. :31的多肽；和/或
SEQIDNo. :32 的多肽，
此類造影劑優(yōu)選可用于檢測(cè)CRC。
本發(fā)明的另一個(gè)實(shí)施方案涉及診斷CRC的方法，其包括至少下列步驟
a)從至少一個(gè)懷疑遭受正在進(jìn)行或迫近的CRC發(fā)展的人或動(dòng)物個(gè)體獲得至少一個(gè)樣
口 ■
m ,
b)測(cè)試所述至少一個(gè)樣品中至少一種選自由下列多肽組成的組的多肽的表達(dá)
SEQIDNo. :I 的多肽；
SEQIDNo. :2 的多肽；
SEQIDNo. :3 的多肽；
SEQIDNo. :4 的多肽；
SEQIDNo. :5 的多肽；
SEQIDNo. :6 的多肽；
SEQIDNo. :7 的多肽；
SEQIDNo. :8 的多肽；
SEQIDNo. :9 的多肽；
SEQIDNo. :10 的多肽；
SEQIDNo. :11 的多肽;
SEQIDNo. :12 的多肽;
SEQIDNo. :13 的多肽;
SEQIDNo. :14 的多肽;
SEQIDNo. :15 的多肽；
SEQIDNo. :16 的多肽； SEQ ID No. :17 的多肽;
SEQ ID No. :18 的多肽；
SEQ ID No. :19 的多肽；
SEQ ID No. :20 的多肽;
SEQ ID No. :21 的多肽;
SEQ ID No. :22 的多肽;
SEQ ID No. :23 的多肽;
SEQ ID No. :24 的多肽;
SEQ ID No. :25 的多肽;
SEQ ID No. :26 的多肽;
SEQ ID No. :27 的多肽;
SEQ ID No. :28 的多肽;
SEQ ID No. :29 的多肽;
SEQ ID No. :30 的多肽;
SEQ ID No. :31的多肽；和/或
SEQ ID No. :32 的多肽;
c)測(cè)試獲自至少一個(gè)未遭受正在進(jìn)行或迫近的CRC發(fā)展的人或動(dòng)物個(gè)體的至少一個(gè)對(duì)照樣品中至少一種選自由下列多肽組成的組的多肽的表達(dá)
SEQ ID No. :I 的多肽；
SEQ ID No. :2 的多肽；
SEQ ID No. :3 的多肽；
SEQ ID No. :4 的多肽；
SEQ ID No. :5 的多肽；
SEQ ID No. :6 的多肽；
SEQ ID No. :7 的多肽；
SEQ ID No. :8 的多肽；
SEQ ID No. :9 的多肽；
SEQ ID No. :10 的多肽；
SEQ ID No. :11 的多肽;
SEQ ID No. :12 的多肽;
SEQ ID No. :13 的多肽；
SEQ ID No. :14 的多肽;
SEQ ID No. :15 的多肽；
SEQ ID No. :16 的多肽；
SEQ ID No. :17 的多肽;
SEQ ID No. :18 的多肽；
SEQ ID No. :19 的多肽;
SEQ ID No. :20 的多肽;
SEQ ID No. :21 的多肽; SEQID No. :22 的多肽;
SEQID No. :23 的多肽;
SEQID No. :24 的多肽;
SEQID No. :25 的多肽;
SEQID No. :26 的多肽;
SEQID No. :27 的多肽;
SEQID No. :28 的多肽;
SEQID No. :29 的多肽;
SEQID No. :30 的多肽;
SEQID No. :31的多肽；和/或
SEQID No. :32 的多肽;
d)測(cè)定步驟b)和d)的表達(dá)的差異；
e)基于步驟d)中獲得的結(jié)果確定結(jié)直腸癌發(fā)展的存在或迫近.
在一個(gè)實(shí)施方案中，在人或動(dòng)物體外進(jìn)行該診斷方法的步驟b)、C)、d)和/或e)。本發(fā)明的另一個(gè)方面涉及診斷結(jié)直腸癌的方法，其包括至少下列步驟
a)測(cè)試懷疑遭受正在進(jìn)行或迫近的CRC發(fā)展的至少一個(gè)人或動(dòng)物個(gè)體中選自由下列多肽組成的組的至少一種多肽的表達(dá)
SEQID No. :I 的多肽；
SEQID No. :2 的多肽；
SEQID No. :3 的多肽；
SEQID No. :4 的多肽；
SEQID No. :5 的多肽；
SEQID No. :6 的多肽；
SEQID No. :7 的多肽；
SEQID No. :8 的多肽；
SEQID No. :9 的多肽；
SEQID No. :10 的多肽；
SEQID No. :11 的多肽;
SEQID No. :12 的多肽;
SEQID No. :13 的多肽;
SEQID No. :14 的多肽;
SEQID No. :15 的多肽；
SEQID No. :16 的多肽；
SEQID No. :17 的多肽;
SEQID No. :18 的多肽；
SEQID No. :19 的多肽;
SEQID No. :20 的多肽;
SEQID No. :21 的多肽;
SEQID No. :22 的多肽; SEQ ID No. :23 的多肽;
SEQ ID No. :24 的多肽；
SEQ ID No. :25 的多肽;
SEQ ID No. :26 的多肽;
SEQ ID No. :27 的多肽;
SEQ ID No. :28 的多肽;
SEQ ID No. :29 的多肽;
SEQ ID No. :30 的多肽;
SEQ ID No. :31的多肽；和/或
SEQ ID No. :32 的多肽;
b)將如步驟a)中測(cè)定的表達(dá)與如對(duì)于未遭受正在進(jìn)行或迫近的CRC發(fā)展的人或動(dòng)物個(gè)體所測(cè)定的選自由下列多肽組成的組的至少一種多肽的表達(dá)相比較
SEQ ID No. :I 的多肽；
SEQ ID No. :2 的多肽；
SEQ ID No. :3 的多肽；
SEQ ID No. :4 的多肽；
SEQ ID No. :5 的多肽；
SEQ ID No. :6 的多肽；
SEQ ID No. :7 的多肽；
SEQ ID No. :8 的多肽；
SEQ ID No. :9 的多肽；
SEQ ID No. :10 的多肽；
SEQ ID No. :11 的多肽;
SEQ ID No. :12 的多肽;
SEQ ID No. :13 的多肽;
SEQ ID No. :14 的多肽;
SEQ ID No. :15 的多肽；
SEQ ID No. :16 的多肽；
SEQ ID No. :17 的多肽;
SEQ ID No. :18 的多肽；
SEQ ID No. :19 的多肽;
SEQ ID No. :20 的多肽;
SEQ ID No. :21 的多肽;
SEQ ID No. :22 的多肽;
SEQ ID No. :23 的多肽;
SEQ ID No. :24 的多肽;
SEQ ID No. :25 的多肽;
SEQ ID No. :26 的多肽;
SEQ ID No. :27 的多肽; SEQ ID No. :28 的多肽;
SEQ ID No. :29 的多肽;
SEQ ID No. :30 的多肽;
SEQ ID No. :31的多肽；和/或
SEQ ID No. :32 的多肽;
c)基于步驟b)中獲得的結(jié)果確定CRC發(fā)展的存在或迫近。
本發(fā)明的另一個(gè)方面涉及數(shù)據(jù)獲取的方法，其包括至少下列步驟a)測(cè)試至少一個(gè)懷疑遭受正進(jìn)行或迫近的CRC發(fā)展的人或動(dòng)物個(gè)體中選自由下列多肽組成的組的至少一種多肽的表達(dá)
SEQ ID No. :I 的多肽；
SEQ ID No. :2 的多肽；
SEQ ID No. :3 的多肽；
SEQ ID No. :4 的多肽；
SEQ ID No. :5 的多肽；
SEQ ID No. :6 的多肽；
SEQ ID No. :7 的多肽；
SEQ ID No. :8 的多肽;
SEQ ID No. :9 的多肽;
SEQ ID No. :10 的多肽；
SEQ ID No. :11 的多肽;
SEQ ID No. :12 的多肽;
SEQ ID No. :13 的多肽;
SEQ ID No. :14 的多肽;
SEQ ID No. :15 的多肽；
SEQ ID No. :16 的多肽；
SEQ ID No. :17 的多肽;
SEQ ID No. :18 的多肽；
SEQ ID No. :19 的多肽;
SEQ ID No. :20 的多肽;
SEQ ID No. :21 的多肽;
SEQ ID No. :22 的多肽;
SEQ ID No. :23 的多肽;
SEQ ID No. :24 的多肽;
SEQ ID No. :25 的多肽;
SEQ ID No. :26 的多肽;
SEQ ID No. :27 的多肽;
SEQ ID No. :28 的多肽;
SEQ ID No. :29 的多肽;
SEQ ID No. :30 的多肽; SEQID No. :31的多肽；和/或
SEQID No. :32 的多肽;
b)將步驟a)中測(cè)定的表達(dá)與如對(duì)于未遭受正在進(jìn)行或迫近的CRC發(fā)展的人或動(dòng)物個(gè)體測(cè)定的選自由下列多肽組成的組的至少一種多肽的表達(dá)相比較
SEQID No. :I 的多肽；
SEQID No. :2 的多肽；
SEQID No. :3 的多肽；
SEQID No. :4 的多肽；
SEQID No. :5 的多肽； SEQID No. :6 的多肽；
SEQID No. :7 的多肽；
SEQID No. :8 的多肽；
SEQID No. :9 的多肽；
SEQID No. :10 的多肽；
SEQID No. :11 的多肽;
SEQID No. :12 的多肽;
SEQID No. :13 的多肽;
SEQID No. :14 的多肽;
SEQID No. :15 的多肽；
SEQID No. :16 的多肽；
SEQID No. :17 的多肽;
SEQID No. :18 的多肽；
SEQID No. :19 的多肽;
SEQID No. :20 的多肽;
SEQID No. :21 的多肽;
SEQID No. :22 的多肽;
SEQID No. :23 的多肽;
SEQID No. :24 的多肽;
SEQID No. :25 的多肽;
SEQID No. :26 的多肽;
SEQID No. :27 的多肽;
SEQID No. :28 的多肽;
SEQID No. :29 的多肽；
SEQID No. :30 的多肽;
SEQID No. :31的多肽；和/或
SEQID No. :32 的多肽;
此外，本發(fā)明的實(shí)施方案涉及鑒定至少一個(gè)適合作為結(jié)直腸癌的診斷標(biāo)記的靶分子的方法，其中所述方法包括至少下列步驟a)從全都患有結(jié)直腸癌的不同人個(gè)體獲得細(xì)胞和/或獲得結(jié)直腸癌細(xì)胞系；b)標(biāo)記所述細(xì)胞表面上的多肽；
c)將標(biāo)記的多肽與非標(biāo)記的多肽分尚；
d)鑒定步驟C)的來(lái)自細(xì)胞表面多肽-級(jí)分的分離的標(biāo)記的多肽，
e)在步驟d)的多肽中，選擇對(duì)于其基因組表達(dá)數(shù)據(jù)顯示與從健康個(gè)體獲得的細(xì)胞相比較增加的表達(dá)的那些分離的標(biāo)記的多肽；
f)在于步驟e)中選擇的多肽中，進(jìn)一步選擇包含至少一個(gè)跨膜結(jié)構(gòu)域和/或至少一個(gè)信號(hào)肽的那些分離的標(biāo)記的多肽；
g)在于步驟f)中選擇的多肽中，進(jìn)一步選擇具有陽(yáng)性RSC的那些多肽；
h)在于步驟g)中選擇的多肽中，進(jìn)一步選擇在至少70%的來(lái)自不同人個(gè)體的測(cè)試細(xì) 胞內(nèi)發(fā)現(xiàn)的那些多肽；
i)在于步驟h)中選擇的多肽中，進(jìn)一步選擇組織學(xué)分析確認(rèn)其至質(zhì)膜的定位的那些多肽。上述診斷標(biāo)記、造影劑、用途和方法適合用于區(qū)分進(jìn)行性(高風(fēng)險(xiǎn))CRC(腺癌)與非進(jìn)行性(低風(fēng)險(xiǎn))結(jié)直腸腺瘤。此外，本發(fā)明的診斷標(biāo)記、造影劑、用途和方法可以特別適合用于非侵入性分子成像,例如利用MRI的成像，用于CRC的診斷。根據(jù)下文中的詳細(xì)描述，本發(fā)明的其他實(shí)施方案將變得顯而易見(jiàn)。附例
圖I 描述了結(jié)直腸癌細(xì)胞系Colo 205、HT-29、Caco2、RKO和HCT116的Neuravidine-純化的生物素-標(biāo)記的細(xì)胞表面或細(xì)胞內(nèi)級(jí)分的SDS-PAGE分析。細(xì)胞內(nèi)級(jí)分的兩個(gè)泳道對(duì)應(yīng)于獲自CRC細(xì)胞系Colo 205、HT29和Caco2(左泳道)以及RKO和HCTl 16 (右泳道)的級(jí)分。圖2描述了 PRNP (SEQ ID NO: 6)的組織學(xué)分析。圖3描述了獲自結(jié)直腸癌患者的組織培養(yǎng)物中的BCAM (SEQ ID NO: 5)的組織學(xué)檢測(cè)。發(fā)明詳述
在根據(jù)其優(yōu)選實(shí)施方案中的一些詳細(xì)描述本發(fā)明之前，提供了下列一般定義?？蛇m當(dāng)?shù)卦谖丛诒疚闹忻鞔_地公開(kāi)的任何要素、限制不存在的情況下實(shí)施如在下文中舉例說(shuō)明性描述的本發(fā)明。通過(guò)具體的實(shí)施方案和參考某些圖描述本發(fā)明，但本發(fā)明不限定于其但只受權(quán)利要求要求的限制。在術(shù)語(yǔ)“包含”用于本說(shuō)明書(shū)和權(quán)利要求中的情況下，其不排除其他要素。為了本發(fā)明的目的，術(shù)語(yǔ)“由……組成”被認(rèn)為是術(shù)語(yǔ)“包括(comprising of)”的優(yōu)選實(shí)施方案。如果在下文中，組被定義為包括至少一定數(shù)目的實(shí)施方案，那么這也可被理解為公開(kāi)優(yōu)選只由這些實(shí)施方案組成的組。在使用不定冠詞或定冠詞(當(dāng)指單數(shù)名詞時(shí))例如“一”或“該”的情況下，除非明確地作出其他聲明，否則這包括該名詞的復(fù)數(shù)。在本發(fā)明的情境中，術(shù)語(yǔ)“約”或“大致”表示本領(lǐng)域技術(shù)人員將理解仍然確保所述特征的技術(shù)效果的精確性的區(qū)間。該術(shù)語(yǔ)通常表示為±10%的，優(yōu)選為±5%的與指示的數(shù)值的偏差。
在下文中在術(shù)語(yǔ)所使用的情境中提供了所述術(shù)語(yǔ)的進(jìn)一步定義。如背景部分中提及的，用于診斷CRC的分子標(biāo)記(模式)的鑒定已集中在其表達(dá)在CRC發(fā)展過(guò)程被上調(diào)或下調(diào)的基因的鑒定。雖然該數(shù)據(jù)提供了有價(jià)值的信息，但診斷標(biāo)記即基因和它們的產(chǎn)物(例如多肽)可能不全都適合于非侵入性分子成像診斷法。本發(fā)明的發(fā)明者已成功地鑒定了一組多肽，所述多肽可能相對(duì)于健康個(gè)體在大部分遭受結(jié)直腸癌發(fā)展的患者中過(guò)表達(dá)并且對(duì)于非侵入性分子成像診斷方法是可使用的。為此，本發(fā)明者已設(shè)計(jì)了篩查策略，其包括至少下列步驟
a)從全都患有結(jié)直腸癌的不同人個(gè)體獲得細(xì)胞和/或獲得結(jié)直腸癌細(xì)胞系；
b)標(biāo)記所述細(xì)胞的表面上的多肽；
c)將標(biāo)記的多肽與非標(biāo)記的多肽分尚；
d)鑒定步驟C)的來(lái)自細(xì)胞表面多肽-級(jí)分的分離的標(biāo)記的多肽，
e)在步驟d)的多肽中，選擇基因組表達(dá)數(shù)據(jù)對(duì)于其顯示與從健康個(gè)體獲得的細(xì)胞相比較增加的表達(dá)的那些分離的標(biāo)記的多肽；
f)在于步驟e)中選擇的多肽中，進(jìn)一步選擇包含至少一個(gè)跨膜結(jié)構(gòu)域和/或至少一個(gè)信號(hào)肽的那些分離的標(biāo)記的多肽；
g)在于步驟f)中選擇的多肽中，進(jìn)一步選擇具有陽(yáng)性RSC的那些多肽；
h)在于步驟g)中選擇的多肽中，進(jìn)一步選擇在至少70%的來(lái)自不同人個(gè)體的測(cè)試細(xì)胞內(nèi)發(fā)現(xiàn)的那些多肽；
i)在于步驟h)中選擇的多肽中，進(jìn)一步選擇組織學(xué)分析確認(rèn)其至質(zhì)膜的定位的那些多肽。從患CRC的人個(gè)體獲得的步驟a)的細(xì)胞通常是已知參與CRC的發(fā)展的細(xì)胞類型。通常，所述細(xì)胞包括胚胎干細(xì)胞、胎兒干細(xì)胞或成人干細(xì)胞；祖細(xì)胞；血細(xì)胞例如B和T-淋巴細(xì)胞、單核細(xì)胞和巨噬細(xì)胞；上皮細(xì)胞；成纖維細(xì)胞；和神經(jīng)元細(xì)胞。上皮細(xì)胞可以是優(yōu)選的。步驟a)中使用的細(xì)胞還可以是已建立的CRC細(xì)胞系。此類細(xì)胞系可商購(gòu)獲得并且包括特別是 Colo205、HT-29、Caco-2、RKO, HCTl 16、SW1398、LS513、SW480、SW620 和 COLO320。進(jìn)行標(biāo)記步驟b)以允許定位至細(xì)胞的表面的優(yōu)先多肽的有效純化、富集和分離。因此，將使用允許例如利用親和層析進(jìn)行有效純化的標(biāo)記。此類標(biāo)記可包括例如生物素、麥芽糖結(jié)合蛋白(MBP)、谷胱苷肽S-轉(zhuǎn)移酶(GST)、組氨酸-標(biāo)簽、Flag-標(biāo)簽、抗體等?？蓪?biāo)記共價(jià)或非共價(jià)地連接至優(yōu)先定位在細(xì)胞表面上的蛋白質(zhì)。I.為了進(jìn)行共價(jià)鍵改性(covalent modification),可使用通常用于此類目的的偶聯(lián)化學(xué)。因此，可使用同和/或異-雙和/或多功能交聯(lián)劑。典型的交聯(lián)劑包括但不限于雙(硫代琥拍酰亞胺)雙(重氮基-聯(lián)苯胺)、己二酰亞胺二甲酯、Dimethyl Pimelimidate,辛二酸亞胺二甲酯、Disuccininnclyl Suberate、戍二醒、in-MaleimidobenzoyI-N-Hydroxysuccinimide、4-(N-馬來(lái)酰亞胺基甲基)環(huán)己燒_1_羧酸硫代琥拍酰亞胺酯等。優(yōu)選標(biāo)記可以是硫代-NHS-SS-生物素.
隨后，通常裂解細(xì)胞。這可通過(guò)低滲、酶促、超聲或機(jī)械細(xì)胞破碎來(lái)實(shí)現(xiàn)。隨后，可利用標(biāo)記分離標(biāo)記的多肽。本領(lǐng)域技術(shù)人員了解如何選擇適當(dāng)?shù)姆蛛x方法。如果例如使用生物-標(biāo)記標(biāo)記多肽，那么可使用如它們可商購(gòu)獲得的基于鏈霉抗生物素蛋白的層析系統(tǒng)例如鏈霉抗生物素蛋白標(biāo)記的或neuravidine-標(biāo)記的珠粒。對(duì)His-標(biāo)簽，可使用可從Qiagen獲得的Ni-NTA瓊脂糖。對(duì)于谷胱苷肽-S-轉(zhuǎn)移酶標(biāo)記，可使用 GST-sepharose 等。通過(guò)將來(lái)自例如裂解的細(xì)胞的標(biāo)記的多肽經(jīng)歷這樣的層析介質(zhì)，可實(shí)現(xiàn)標(biāo)記的多肽的純化。由于標(biāo)記方法通常優(yōu)先標(biāo)記細(xì)胞表面多肽，因此保留在層析介質(zhì)上并且從層析介質(zhì)洗脫的級(jí)分可被稱為標(biāo)記的細(xì)胞表面多肽級(jí)分。在穿流液中發(fā)現(xiàn)的多肽可被稱為細(xì)胞內(nèi)多肽級(jí)分。此外，可使用如它們是公知的特定制備方案來(lái)從裂解的細(xì)胞獲得主要包含細(xì)胞表面結(jié)合多肽和細(xì)胞內(nèi)多肽的級(jí)分。將此類級(jí)分經(jīng)歷如上所述的層析介質(zhì)可改善標(biāo)記的細(xì)胞表面多肽至層析介質(zhì)的附著。如果例如已用生物素標(biāo)記細(xì)胞，那么細(xì)胞的多肽可優(yōu)先于細(xì)胞質(zhì)多肽被標(biāo)記，以 便標(biāo)記的細(xì)胞表面多肽將被優(yōu)先保留在例如鏈霉抗生物素-珠粒上而細(xì)胞質(zhì)多肽將主要發(fā)現(xiàn)于穿流液或洗滌級(jí)分中。本領(lǐng)域技術(shù)人員了解如何正確地進(jìn)行此類分離/純化方法,例如如何選擇適當(dāng)?shù)南礈炀彌_液、洗脫緩沖液、PH值等。從而通過(guò)將標(biāo)記的多肽從各自層析介質(zhì)洗脫來(lái)將它們與細(xì)胞表面多肽-級(jí)分分離。隨后，鑒定此類分離的標(biāo)記的多肽。為此，可使用例如質(zhì)譜(MS)分析。隨后使利用該方法獲得的數(shù)據(jù)與關(guān)于基因的基因組表達(dá)數(shù)據(jù)關(guān)聯(lián)，所述基因的表達(dá)在CRC中被上調(diào)或下調(diào)。基因組表達(dá)數(shù)據(jù)可從例如Carvalho等人(2009) Gut 58 (I),79-89 (就其提供其表達(dá)在CRC中被上調(diào)的基因的信息將其通過(guò)引用合并入本文)獲得。本發(fā)明的情境中的關(guān)聯(lián)意指只選擇已鑒定的標(biāo)記的多肽，對(duì)于所述多肽，基因組表達(dá)數(shù)據(jù)顯示與獲自健康個(gè)體的細(xì)胞相比較增加的表達(dá)。為了增加標(biāo)記的、分離的和已鑒定的多肽確實(shí)定位至細(xì)胞的質(zhì)膜的可能性，應(yīng)用進(jìn)一步的選擇標(biāo)準(zhǔn)，所述選擇標(biāo)準(zhǔn)只選擇對(duì)于其基于算法的分析顯示跨膜(TM)結(jié)構(gòu)域和/或至少一個(gè)信號(hào)肽的存在的多肽。術(shù)語(yǔ)“信號(hào)肽”是指指導(dǎo)蛋白質(zhì)至細(xì)胞的質(zhì)膜的定位的序列特征。此類信號(hào)肽序列在本領(lǐng)域內(nèi)是已知的?？墒褂猛ǔＳ糜诖祟惙椒ǖ某绦蚝退惴ɡ缬蒘tockholm BioinformaticsCenter (Kjill 等人(2004) Journal of Molecular Biology, 338 (5) : 1027-1036)開(kāi)發(fā)的Phobias進(jìn)行該分析。在選擇具有至少一個(gè)跨膜結(jié)構(gòu)域或至少一個(gè)信號(hào)肽的多肽后，應(yīng)用進(jìn)一步選擇來(lái)減少假陽(yáng)性的數(shù)目。為此，只選擇具有陽(yáng)性相對(duì)計(jì)數(shù)(RSC)值的這類蛋白質(zhì)。在這樣的分析中，確定當(dāng)與細(xì)胞內(nèi)多肽級(jí)分相比較時(shí)哪種標(biāo)記的多肽富集在細(xì)胞表面多肽級(jí)分中(即優(yōu)先保留在層析介質(zhì)上)。隨后進(jìn)行從譜圖計(jì)數(shù)(RSC)分析測(cè)量的log2比率。原則上，該分析依賴于基于圖譜計(jì)數(shù)的非標(biāo)記定量法并且適合于計(jì)算樣品之間的相對(duì)蛋白質(zhì)豐度。詳細(xì)描述可見(jiàn)于Old等人(2005) Molecular & Cellular Proteomics4(10) : 1487-1502，就關(guān)于RSC值的測(cè)定而言將其通過(guò)引用并入本文。通過(guò)使用該分析，隨后只選擇具有陽(yáng)性RSC值的蛋白質(zhì)。隨后通過(guò)鑒定在至少70%的步驟a)中測(cè)試的細(xì)胞內(nèi)發(fā)現(xiàn)的那些多肽來(lái)進(jìn)一步分析通過(guò)該系列不同步驟鑒定的多肽。如上文中所指出的，細(xì)胞可獲自不同的人個(gè)體或可以是已建立的CRC細(xì)胞系。通常，將分析至少5種不同的細(xì)胞，這意味著分析例如至少來(lái)自全都患有CRC的5個(gè)不同人個(gè)體的細(xì)胞或至少5種不同CRC細(xì)胞系。在最后的選擇步驟中，選擇組織學(xué)分析確認(rèn)其至少定位至質(zhì)膜的多肽。這樣的組織學(xué)分析可利用例如特異于所選擇的多肽的抗體來(lái)進(jìn)行。.
通常，組織學(xué)分析包括獲自患CRC的個(gè)體或已建立的CRC細(xì)胞系的細(xì)胞的免疫熒光分析。用于這樣的組織學(xué)分析的具體方案通常視分析的具體多肽而定。然而，本領(lǐng)域技術(shù)人員能夠依靠通?？色@得的知識(shí)進(jìn)行例如多肽的免疫熒光檢測(cè)和定位。基本上，此類方法將包括細(xì)胞在固體載體例如透明顯微蓋玻片上的固定。隨后，在用例如抗體標(biāo)記之前裂解和固定細(xì)胞。此類方法尤其是描述于Carvalho等人(2009) Gut 58 (I), 79-89中。
本發(fā)明的發(fā)明者依靠于步驟a)至步驟h)已成功地鑒定了一組32種蛋白質(zhì)，所述蛋白質(zhì)滿足上述標(biāo)準(zhǔn)。此外，PRNP (SEQ ID NO: 6)和BCAM (SEQ ID NO: 5)的組織學(xué)分析確認(rèn)這兩種蛋白質(zhì)確實(shí)至少定位至質(zhì)膜(分別地，參見(jiàn)圖2和圖3)。這32種蛋白質(zhì)的性質(zhì)的概述可獲自表I。
權(quán)利要求
1.包含由下列多肽組成的組的至少一種多肽的診斷標(biāo)記 SEQIDNo.:I 的多肽； SEQIDNo.:2 的多肽； SEQIDNo.:3 的多肽； SEQIDNo.:4 的多肽； SEQIDNo.:5 的多肽； SEQIDNo.:6 的多肽； SEQIDNo.:7 的多肽； SEQIDNo.:8 的多肽； SEQIDNo.:9 的多肽； SEQIDNo.:10 的多肽； SEQIDNo.:11 的多肽; SEQIDNo.:12 的多肽; SEQIDNo.:13 的多肽； SEQIDNo.:14 的多肽; SEQIDNo.:15 的多肽； SEQIDNo.:16 的多肽； SEQIDNo.:17 的多肽; SEQIDNo.:18 的多肽； SEQIDNo.:19 的多肽; SEQIDNo.:20 的多肽; SEQIDNo.:21 的多肽; SEQIDNo.:22 的多肽; SEQIDNo.:23 的多肽; SEQIDNo.:24 的多肽; SEQIDNo.:25 的多肽； SEQIDNo.:26 的多肽; SEQIDNo.:27 的多肽; SEQIDNo.:28 的多肽; SEQIDNo.:29 的多肽; SEQIDNo.:30 的多肽; SEQIDNo.:31的多肽；和/或 SEQIDNo.:32 的多肽。
2.權(quán)利要求I的診斷標(biāo)記，其包含至少下列多肽 SEQIDNo.:I 的多肽； SEQIDNo.:2的多肽；和/或 SEQIDNo.:3 的多肽。
3.選自由下列多肽組成的組的至少一種多肽作為診斷標(biāo)記的用途 SEQIDNo.:I 的多肽； SEQIDNo. :2 的多肽；SEQIDNo. :3 的多肽；SEQIDNo. :4 的多肽；SEQIDNo. :5 的多肽；SEQIDNo. :6 的多肽；SEQIDNo. :7 的多肽；SEQIDNo. :8 的多肽；SEQIDNo. :9 的多肽； SEQIDNo. :10 的多肽；SEQIDNo. :11 的多肽;SEQIDNo. :12 的多肽;SEQIDNo. :13 的多肽;SEQIDNo. :14 的多肽;SEQIDNo. :15 的多肽； SEQIDNo. :16 的多肽；SEQIDNo. :17 的多肽;SEQIDNo. :18 的多肽；SEQIDNo. :19 的多肽;SEQIDNo. :20 的多肽;SEQIDNo. :21 的多肽;SEQIDNo. :22 的多肽;SEQIDNo. :23 的多肽;SEQIDNo. :24 的多肽;SEQIDNo. :25 的多肽;SEQIDNo. :26 的多肽;SEQIDNo. :27 的多肽;SEQIDNo. :28 的多肽;SEQIDNo. :29 的多肽;SEQIDNo. :30 的多肽;SEQIDNo. :31的多肽；和/或SEQIDNo. :32 的多肽。
4.權(quán)利要求3的用途，其中使用至少下列多肽SEQIDNo. :I 的多肽；SEQIDNo. :2的多肽；和SEQIDNo. :3 的多肽。
5.任選地用于MRI和/或MPI的造影劑，其包括至少一種能夠與選自由下列多肽組成的組的多肽相互作用的化合物SEQIDNo. :I 的多肽；SEQIDNo. :2 的多肽； SEQID No. :3 的多肽；SEQID No. :4 的多肽；SEQID No. :5 的多肽；SEQID No. :6 的多肽；SEQID No. :7 的多肽；SEQID No. :8 的多肽；SEQID No. :9 的多肽； SEQID No. :10 的多肽； SEQID No. :11 的多肽;SEQID No. :12 的多肽;SEQID No. :13 的多肽;SEQID No. :14 的多肽;SEQID No. :15 的多肽；SEQID No. :16 的多肽；SEQID No. :17 的多肽;SEQID No. :18 的多肽；SEQID No. :19 的多肽;SEQID No. :20 的多肽;SEQID No. :21 的多肽;SEQID No. :22 的多肽;SEQID No. :23 的多肽;SEQID No. :24 的多肽;SEQID No. :25 的多肽;SEQID No. :26 的多肽;SEQID No. :27 的多肽;SEQID No. :28 的多肽;SEQID No. :29 的多肽;SEQID No. :30 的多肽;SEQID No. :31的多肽；和/或 SEQID No. :32 的多肽。
6.權(quán)利要求5的造影劑，其中所述造影劑包含至少與下列多肽相互作用的單種或復(fù)數(shù)種化合物SEQID No. :I 的多肽；SEQID No. :2的多肽；和 SEQID No. :3 的多肽。
7.權(quán)利要求5或6的造影劑，其中所述化合物選自與SEQID No. I至32的至少一種多肽特異性相互作用的抗體。
8.權(quán)利要求5至7的任一項(xiàng)的造影劑，其中所述化合物被偶聯(lián)至可檢測(cè)的標(biāo)記分子。
9.至少一種能夠與選自由下列多肽組成的組的多肽相互作用的抗體作為任選用于MRI和/或MPI的造影劑的用途 SEQ ID No. : I 的多肽； SEQ ID No. : 2 的多肽; SEQ ID No. : 3 的多肽； SEQ ID No. : 4 的多肽； SEQ ID No. : 5 的多肽； SEQ ID No. : 6 的多肽； SEQ ID No. : 7 的多肽； SEQ ID No. : 8 的多肽； SEQ ID No. : 9 的多肽； SEQ ID No. : 10 的多肽； SEQ ID No. : 11 的多肽; SEQ ID No. : 12 的多肽; SEQ ID No. : 13 的多肽; SEQ ID No. : 14 的多肽; SEQ ID No. : 15 的多肽； SEQ ID No. : 16 的多肽； SEQ ID No. : 17 的多肽; SEQ ID No. : 18 的多肽； SEQ ID No. : 19 的多肽; SEQ ID No. : 20 的多肽; SEQ ID No. : 21 的多肽; SEQ ID No. : 22 的多肽； SEQ ID No. : 23 的多肽; SEQ ID No. : 24 的多肽; SEQ ID No. : 25 的多肽; SEQ ID No. : 26 的多肽; SEQ ID No. : 27 的多肽; SEQ ID No. : 28 的多肽； SEQ ID No. : 29 的多肽； SEQ ID No. : 30 的多肽;SEQ ID No. : 31的多肽；和/或 SEQ ID No. : 32 的多肽。
10.權(quán)利要求9的用途，其中所述抗體選自與所述多肽相互作用的商購(gòu)可得的抗體。
11.權(quán)利要求9或10的用途，其中所述抗體被偶聯(lián)至可檢測(cè)的標(biāo)記分子。
12.診斷結(jié)直腸癌(CRC)的方法，其包括至少下列步驟 a)從懷疑遭受正在進(jìn)行或迫近的CRC發(fā)展的至少一個(gè)人或動(dòng)物個(gè)體獲得至少一個(gè)樣品。
b)測(cè)試所述至少一個(gè)樣品中選自由下列多肽組成的組的至少一種多肽的表達(dá) SEQ ID No. :I 的多肽；SEQ ID No. :2 的多肽；SEQ ID No. :3 的多肽；SEQ ID No. :4 的多肽；SEQ ID No. :5 的多肽；SEQ ID No. :6 的多肽；SEQ ID No. :7 的多肽；SEQ ID No. :8 的多肽；SEQ ID No. :9 的多肽；SEQ ID No. :10 的多肽；SEQ ID No. :11 的多肽;SEQ ID No. :12 的多肽;SEQ ID No. :13 的多肽;SEQ ID No. :14 的多肽;SEQ ID No. :15 的多肽；SEQ ID No. :16 的多肽；SEQ ID No. :17 的多肽;SEQ ID No. :18 的多肽；SEQ ID No. :19 的多肽;SEQ ID No. :20 的多肽;SEQ ID No. :21 的多肽;SEQ ID No. :22 的多肽;SEQ ID No. :23 的多肽;SEQ ID No. :24 的多肽;SEQ ID No. :25 的多肽； SEQ ID No. :26 的多肽;SEQ ID No. :27 的多肽;SEQ ID No. :28 的多肽;SEQ ID No. :29 的多肽;SEQ ID No. :30 的多肽;SEQ ID No. :31的多肽；和/或SEQ ID No. :32 的多肽; c)測(cè)試獲自未遭受正在進(jìn)行或迫近的CRC發(fā)展的至少一個(gè)人或動(dòng)物個(gè)體的至少一個(gè)對(duì)照樣品中選自由下列多肽組成的組的至少一種多肽的表達(dá)SEQ ID No. :I 的多肽；SEQ ID No. :2 的多肽；SEQ ID No. :3 的多肽；SEQ ID No. :4 的多肽；SEQ ID No. :5 的多肽； SEQ ID No. :6 的多肽；SEQ ID No. :7 的多肽；SEQ ID No. :8 的多肽；SEQ ID No. :9 的多肽；SEQ ID No. :10 的多肽；SEQ ID No. :11 的多肽;SEQ ID No. :12 的多肽;SEQ ID No. :13 的多肽; SEQ ID No. :14 的多肽;SEQ ID No. :15 的多肽；SEQ ID No. :16 的多肽；SEQ ID No. :17 的多肽;SEQ ID No. :18 的多肽；SEQ ID No. :19 的多肽;SEQ ID No. :20 的多肽;SEQ ID No. :21 的多肽;SEQ ID No. :22 的多肽;SEQ ID No. :23 的多肽;SEQ ID No. :24 的多肽;SEQ ID No. :25 的多肽;SEQ ID No. :26 的多肽;SEQ ID No. :27 的多肽;SEQ ID No. :28 的多肽;SEQ ID No. :29 的多肽;SEQ ID No. :30 的多肽;SEQ ID No. :31的多肽；和/或SEQ ID No. :32 的多肽; d)測(cè)定步驟b)和d)的表達(dá)的差異； e)基于步驟d)中獲得的結(jié)果確定CRC發(fā)展的存在或迫近。
13.診斷CRC的方法，其包括至少下列步驟 a)測(cè)試懷疑遭受正在進(jìn)行或迫近的CRC發(fā)展的至少一個(gè)人或動(dòng)物個(gè)體中選自由下列多肽組成的組的至少一種多肽的表達(dá)SEQ ID No. :I 的多肽；SEQ ID No. :2 的多肽；SEQ ID No. :3 的多肽；SEQ ID No. :4 的多肽；SEQ ID No. :5 的多肽；SEQ ID No. :6 的多肽；SEQ ID No. :7 的多肽； SEQ ID No.:8 的多肽；SEQ ID No.:9 的多肽；SEQ ID No.:10 的多肽；SEQ ID No.:11 的多肽;SEQ ID No.:12 的多肽;SEQ ID No.:13 的多肽; SEQ ID No.:14 的多肽;SEQ ID No.:15 的多肽；SEQ ID No.:16 的多肽；SEQ ID No.:17 的多肽;SEQ ID No.:18 的多肽；SEQ ID No.:19 的多肽;SEQ ID No.:20 的多肽;SEQ ID No.:21 的多肽;SEQ ID No.:22 的多肽;SEQ ID No.:23 的多肽;SEQ ID No.:24 的多肽;SEQ ID No.:25 的多肽;SEQ ID No.:26 的多肽;SEQ ID No.:27 的多肽;SEQ ID No.:28 的多肽;SEQ ID No.:29 的多肽;SEQ ID No.:30 的多肽;SEQ ID No.:31的多肽；和/或SEQ ID No.:32 的多肽; b)將步驟a)中測(cè)定的表達(dá)與如對(duì)于未遭受正在進(jìn)行或迫近的結(jié)直腸癌發(fā)展的人或動(dòng)物個(gè)體測(cè)定的選自由下列多肽組成的組的至少一種多肽的表達(dá)相比較SEQ ID No.:I 的多肽；SEQ ID No.:2 的多肽；SEQ ID No.:3 的多肽；SEQ ID No.:4 的多肽；SEQ ID No.:5 的多肽；SEQ ID No.:6 的多肽；SEQ ID No.:7 的多肽；SEQ ID No.:8 的多肽；SEQ ID No.:9 的多肽；SEQ ID No.:10 的多肽;SEQ ID No.:11 的多肽;SEQ ID No.:12 的多肽; SEQID No. :13 的多肽;SEQID No. :14 的多肽;SEQID No. :15 的多肽；SEQID No. :16 的多肽；SEQID No. :17 的多肽;SEQID No. :18 的多肽；SEQID No. :19 的多肽;SEQID No. :20 的多肽; SEQID No. :21 的多肽;SEQID No. :22 的多肽;SEQID No. :23 的多肽;SEQID No. :24 的多肽;SEQID No. :25 的多肽;SEQID No. :26 的多肽;SEQID No. :27 的多肽; SEQID No. :28 的多肽；SEQID No. :29 的多肽;SEQID No. :30 的多肽;SEQID No. :31的多肽；和/或SEQID No. :32 的多肽; c)基于步驟b)中獲得的結(jié)果確定CRC發(fā)展的存在或迫近。
14.數(shù)據(jù)獲取的方法，其包括至少下列步驟 a)測(cè)試懷疑遭受正在進(jìn)行或迫近的CRC發(fā)展的至少一個(gè)人或動(dòng)物個(gè)體中選自由下列多肽組成的組的至少一種多肽的表達(dá)SEQID No. :I 的多肽；SEQID No. :2 的多肽;SEQID No. :3 的多肽；SEQID No. :4 的多肽；SEQID No. :5 的多肽；SEQID No. :6 的多肽；SEQID No. :7 的多肽；SEQID No. :8 的多肽；SEQID No. :9 的多肽；SEQID No. :10 的多肽；SEQID No. :11 的多肽;SEQID No. :12 的多肽;SEQID No. :13 的多肽;SEQID No. :14 的多肽;SEQID No. :15 的多肽； SEQ ID No. :16 的多肽；SEQ ID No. :17 的多肽;SEQ ID No. :18 的多肽；SEQ ID No. :19 的多肽；SEQ ID No. :20 的多肽;SEQ ID No. :21 的多肽;SEQ ID No. :22 的多肽;SEQ ID No. :23 的多肽; SEQ ID No. :24 的多肽；SEQ ID No. :25 的多肽;SEQ ID No. :26 的多肽;SEQ ID No. :27 的多肽;SEQ ID No. :28 的多肽;SEQ ID No. :29 的多肽;SEQ ID No. :30 的多肽;SEQ ID No. :31的多肽；和/或SEQ ID No. :32 的多肽; b)將步驟a)中測(cè)定的表達(dá)與如對(duì)于未遭受正在進(jìn)行或迫近的CRC發(fā)展的人或動(dòng)物個(gè)體所測(cè)定的選自由下列多肽組成的組的至少一種多肽的表達(dá)相比較SEQ ID No. :I 的多肽；SEQ ID No. :2 的多肽；SEQ ID No. :3 的多肽；SEQ ID No. :4 的多肽；SEQ ID No. :5 的多肽；SEQ ID No. :6 的多肽；SEQ ID No. :7 的多肽；SEQ ID No. :8 的多肽；SEQ ID No. :9 的多肽；SEQ ID No. :10 的多肽；SEQ ID No. :11 的多肽;SEQ ID No. :12 的多肽;SEQ ID No. :13 的多肽;SEQ ID No. :14 的多肽;SEQ ID No. :15 的多肽；SEQ ID No. :16 的多肽；SEQ ID No. :17 的多肽;SEQ ID No. :18 的多肽；SEQ ID No. :19 的多肽;SEQ ID No. :20 的多肽; SEQIDNo. :21 的多肽;SEQIDNo. :22 的多肽;SEQIDNo. :23 的多肽;SEQIDNo. :24 的多肽;SEQIDNo. :25 的多肽;SEQIDNo. :26 的多肽;SEQIDNo. :27 的多肽；SEQIDNo. :28 的多肽;SEQIDNo. :29 的多肽;SEQIDNo. :30 的多肽;SEQIDNo. :31的多肽；和/或SEQIDNo. :32 的多肽。
15.權(quán)利要求I或2的任一項(xiàng)的診斷標(biāo)記和/或權(quán)利要求5至8的任一項(xiàng)的造影劑用于區(qū)分進(jìn)行性(高風(fēng)險(xiǎn))CRC(腺癌)與非進(jìn)行性(低風(fēng)險(xiǎn))結(jié)直腸腺瘤的用途。
全文摘要
本發(fā)明公開(kāi)了用于結(jié)直腸腺癌的診斷的基于蛋白質(zhì)的方法和組合物。公開(kāi)了用于鑒定細(xì)胞表面蛋白的方法，所述細(xì)胞表面蛋白是跨膜蛋白或具有信號(hào)肽的蛋白并且在結(jié)直腸癌(CRC)中過(guò)表達(dá)。公開(kāi)了用這種方法發(fā)現(xiàn)的生物標(biāo)記，使用它們和用于磁共振成像(MRI)和/或磁光子成像(MPI)的針對(duì)它們的造影劑的診斷方法。本方法和生物標(biāo)記允許將進(jìn)行性(高風(fēng)險(xiǎn))CRC(腺癌)與非進(jìn)行性(低風(fēng)險(xiǎn))結(jié)直腸腺瘤區(qū)分開(kāi)。
文檔編號(hào)C07K14/00GK102803967SQ201080025187
公開(kāi)日2012年11月28日 申請(qǐng)日期2010年3月31日 優(yōu)先權(quán)日2009年4月7日
發(fā)明者M.德維特, R.J.A.菲尼曼, C.R.吉梅尼茨, G.A.梅杰 申請(qǐng)人:基督教高等教育科學(xué)研究及病人護(hù)理協(xié)會(huì)