本發(fā)明涉及生物,具體是涉及誘導(dǎo)痰單細(xì)胞懸液及其制備方法和應(yīng)用。
背景技術(shù):
1、誘導(dǎo)痰細(xì)胞學(xué)可以用于反映氣道炎癥類型,痰的檢查對支氣管哮喘、肺結(jié)核、支氣管炎、肺吸蟲病、肺部腫瘤等肺部疾病的診斷很有價值,對于指導(dǎo)氣道慢性炎癥疾病的臨床治療有較大價值。利用誘導(dǎo)痰細(xì)胞學(xué)分類,還可以判斷在臨床工作中藥物的療效。然而目前臨床誘導(dǎo)痰細(xì)胞學(xué)檢測以誘導(dǎo)痰細(xì)胞形態(tài)學(xué)為主,限制了對氣道炎癥細(xì)胞的進(jìn)步認(rèn)識,特別是炎癥細(xì)胞內(nèi)反應(yīng)機(jī)制的進(jìn)一步研究。
2、目前,誘導(dǎo)痰細(xì)胞基因表達(dá)的檢測尚未有相關(guān)技術(shù)開發(fā)。
3、本發(fā)明通過開發(fā)誘導(dǎo)痰細(xì)胞的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組方法學(xué),有助于揭開誘導(dǎo)痰細(xì)胞基因表達(dá),有助探究氣道炎癥發(fā)病機(jī)制及指導(dǎo)臨床治療。
技術(shù)實現(xiàn)思路
1、基于此,本發(fā)明的目的是提供一種誘導(dǎo)痰單細(xì)胞懸液及其制備方法和應(yīng)用,本發(fā)明所制備得到的誘導(dǎo)痰單細(xì)胞懸液能夠適用于單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組方法學(xué)檢測。
2、實現(xiàn)上述目的的技術(shù)方案,包括如下。
3、本發(fā)明的第一目的,是提供一種誘導(dǎo)痰單細(xì)胞懸液制備方法,包括如下步驟:
4、1)獲得待檢測濾痰混懸液;
5、2)低溫離心;
6、3)樣本離心后去除上清液而不破壞細(xì)胞沉淀;
7、5)往細(xì)胞沉淀,加不含鈣、鎂離子的dpbs,輕輕地用移液管混合,反復(fù)倒置管使細(xì)胞球團(tuán)重新懸??;
8、6)過濾,用新的離心管收集濾過液;
9、7)對上步驟的收集的濾過液進(jìn)行低溫離心,去除上清液而不破壞細(xì)胞沉淀;
10、8)往上步驟細(xì)胞沉淀加適量不含鈣、鎂離子的dpbs(杜氏磷酸鹽緩沖鹽溶液),輕輕地用移液管混合,輕輕吹吸10-15次或直到細(xì)胞完全懸??;
11、9)調(diào)整懸液體積以獲得目標(biāo)細(xì)胞濃度,即得單細(xì)胞懸液。
12、在其中一些實施例中,所述低溫離心的參數(shù)是:1200±10rpm,4℃,離心4-6min。
13、在其中一些實施例中,目標(biāo)細(xì)胞濃度為700~1200cells/ul。
14、在其中一些實施例中,步驟6)中,過濾所用的過濾網(wǎng)的孔徑為30±5um。
15、在其中一些實施例中,步驟6)中,使用過濾網(wǎng)時,應(yīng)先用1ml不含鈣、鎂離子的dpbs先潤濕過濾網(wǎng),細(xì)胞懸液過濾完后,再往過濾網(wǎng)中加入500-1000ul的不含鈣、鎂離子的dpbs以盡量收集更多的濾過細(xì)胞。
16、本發(fā)明的第二目的,是提供通過任一上述方法制備得到的誘導(dǎo)痰單細(xì)胞懸液。
17、本發(fā)明的第三目的,是提供任一上述誘導(dǎo)痰單細(xì)胞懸液制備方法在誘導(dǎo)痰單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序方法中的應(yīng)用。
18、本發(fā)明的第四目的,是提供一種誘導(dǎo)痰單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序方法。
19、一種誘導(dǎo)痰單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序方法,包括以下步驟:
20、按照上述任一上述方法制備得到的誘導(dǎo)痰單細(xì)胞懸液,
21、進(jìn)行scrna-seq建庫和測序。
22、在其中一些實施例中,所述scrna-seq建庫和測序包括以下步驟:
23、a)gem生成和標(biāo)簽化;
24、對誘導(dǎo)痰單細(xì)胞懸液進(jìn)行單細(xì)胞分離,并進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄實現(xiàn)標(biāo)簽化;
25、b)post?gem-rt純化和cdna擴(kuò)增;
26、c)文庫構(gòu)建和定量;
27、d)對構(gòu)建完成的文庫測序。
28、與現(xiàn)有技術(shù)相比,本發(fā)明具有以下有益效果:本發(fā)明通過對誘導(dǎo)痰單細(xì)胞懸液進(jìn)行制備,能夠富集到大量的痰單細(xì)胞,使獲得的誘導(dǎo)痰單細(xì)胞懸液可用于單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序,從而可以很好地檢測痰細(xì)胞的基因表達(dá)情況,有助探究氣道炎癥發(fā)病機(jī)制及指導(dǎo)臨床治療,還可以用于支氣管哮喘、肺結(jié)核、支氣管炎、肺吸蟲病、肺部腫瘤等肺部疾病的診斷,具有巨大的臨床應(yīng)用價值。
1.一種誘導(dǎo)痰單細(xì)胞懸液的制備方法,其特征在于,包括如下步驟:
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的制備方法,其特征在于,所述低溫離心的參數(shù)是:1200±10rpm,4℃,離心4-6min。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的制備方法,其特征在于,目標(biāo)細(xì)胞濃度為700~1200cells/ul。
4.根據(jù)權(quán)利要求1所述的制備方法,其特征在于,步驟6)中,過濾所用的過濾網(wǎng)的孔徑為30±5um。
5.根據(jù)權(quán)利要求1-4任一項所述的制備方法,其特征在于,步驟6)中,使用過濾網(wǎng)時,應(yīng)先用不含鈣、鎂離子的dpbs先潤濕過濾網(wǎng),細(xì)胞懸液過濾完后,再往過濾網(wǎng)中加入500-1000ul的不含鈣、鎂離子的dpbs以盡量收集更多的濾過細(xì)胞。
6.根據(jù)權(quán)利要求1-5任一項所述方法制備得到的誘導(dǎo)痰單細(xì)胞懸液。
7.根據(jù)權(quán)利要求1-5任一項所述誘導(dǎo)痰單細(xì)胞懸液的制備方法在誘導(dǎo)痰單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序方法中的應(yīng)用。
8.一種誘導(dǎo)痰單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序方法,其特征在于,包括以下步驟:
9.根據(jù)權(quán)利要求8所述的誘導(dǎo)痰單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序方法,其特征在于,所述scrna-seq建庫和測序包括以下步驟: