本發(fā)明涉及水稻基因工程,具體涉及一種與水稻穗型和籽粒大小相關(guān)的蛋白、基因及應(yīng)用。
背景技術(shù):
1、水稻(oryza?sativa)是最重要的糧食作物,世界上三分之一以上的人口以水稻為主食。由于水稻具有基因組小、遺傳和物理圖譜精細(xì)、轉(zhuǎn)基因技術(shù)相對(duì)容易及與其它禾本科作物的共線性的優(yōu)點(diǎn),水稻也一直作為優(yōu)良的模式植物。隨著水稻基因組測(cè)序的完成,人類開(kāi)始進(jìn)入后基因組時(shí)代,全面開(kāi)展水稻功能基因組研究和基因注釋己成為生命科學(xué)的前沿領(lǐng)域。因此水稻功能基因的研究對(duì)社會(huì)經(jīng)濟(jì)發(fā)展和生物學(xué)研究具有重大意義。
2、為解決人口增長(zhǎng)與耕地面積減少的矛盾,提高水稻品質(zhì)(如提高水稻單位面積產(chǎn)量)是人們面臨的重大挑戰(zhàn)。雖然20世紀(jì)50、60年代的矮化育種和70年代的雜交水稻培育是水稻科學(xué)的兩次革命,但近幾年來(lái)水稻的品質(zhì)提高開(kāi)始徘徊。
3、水稻粒型是重要的產(chǎn)量性狀,水稻的產(chǎn)量由有效穗數(shù)、每穗粒數(shù)、千粒重三要素決定,其中千粒重所影響的產(chǎn)量與粒型密切相關(guān)。隨著分子生物學(xué)技術(shù)發(fā)展,目前雖有許多調(diào)控粒型相關(guān)基因被克隆和定位,但其調(diào)控網(wǎng)絡(luò)復(fù)雜多樣,且大多具有負(fù)效應(yīng),很難真正應(yīng)用于育種實(shí)踐之中。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路
1、本發(fā)明針對(duì)現(xiàn)有技術(shù)存在的問(wèn)題提供一種與水稻穗型和籽粒大小相關(guān)的蛋白、基因及應(yīng)用。
2、本發(fā)明采用的技術(shù)方案是:
3、一種與水稻穗型和籽粒大小相關(guān)的蛋白,所述蛋白的氨基酸序列為seq?id?no.1或seq?id?no.2。
4、一種與水稻穗型和籽粒大小相關(guān)的基因,所述基因用于編碼如權(quán)利要求1所述蛋白。
5、進(jìn)一步的,所述基因的核苷酸序列如seq?id?no.3或seq?id?no.4。
6、進(jìn)一步的,所述基因?yàn)樯鲜鱿薅ǖ暮塑账嵝蛄薪?jīng)取代、缺失或添加一個(gè)或幾個(gè)堿基序列得到。
7、進(jìn)一步的,所述基因的核苷酸序列如seq?id?no.5、seq?id?no.6或seq?id?no.7。
8、進(jìn)一步的,所述取代、缺失或添加一個(gè)或幾個(gè)堿基序列采用基因編輯方法進(jìn)行。
9、進(jìn)一步的,所述基因編輯采用crispr/cas9進(jìn)行。
10、進(jìn)一步的,所述取代、缺失或添加一個(gè)或幾個(gè)堿基序列中敲除基因的靶標(biāo)序列的核苷酸如seq?id?no.8或seq?id?no.9。
11、基因的應(yīng)用,所述基因在水稻育種中的用途。
12、進(jìn)一步的,所述水稻育種為雜交選育穗型和粒型品種水稻。
13、本發(fā)明的有益效果是:
14、(1)本發(fā)明通過(guò)ems誘變,分離篩選得到粒長(zhǎng)變短,穗粒數(shù)減少的突變體基因spsc11,通過(guò)基因編輯技術(shù)對(duì)spsc11進(jìn)行基因編輯,其功能失活表型與突變體一致,均表現(xiàn)為粒長(zhǎng)變短,穗粒數(shù)減少;
15、(2)本發(fā)明得到的spsc11可正向調(diào)控水稻粒型及穗粒數(shù),可通過(guò)過(guò)表達(dá)spsc11提高粒長(zhǎng)、增加穗粒數(shù),進(jìn)而提高水稻產(chǎn)量;
16、(3)本發(fā)明得到的spsc11基因通過(guò)調(diào)控udp葡萄糖基轉(zhuǎn)移酶活性,調(diào)控水稻籽粒大小及穗粒數(shù),豐富了水稻粒型調(diào)控網(wǎng)絡(luò),為水稻高產(chǎn)育種提供優(yōu)異資源。
1.一種與水稻穗型和籽粒大小相關(guān)的蛋白,其特征在于,所述蛋白的氨基酸序列為seqid?no.1或seq?id?no.2。
2.一種與水稻穗型和籽粒大小相關(guān)的基因,其特征在于,所述基因用于編碼如權(quán)利要求1所述蛋白。
3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的一種與水稻穗型和籽粒大小相關(guān)的基因,其特征在于,所述基因的核苷酸序列如seq?id?no.3或seq?id?no.4。
4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的一種與水稻穗型和籽粒大小相關(guān)的基因,其特征在于,所述基因?yàn)槿鐧?quán)利要求3限定的核苷酸序列經(jīng)取代、缺失或添加一個(gè)或幾個(gè)堿基序列得到。
5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的一種與水稻穗型和籽粒大小相關(guān)的基因,其特征在于,所述基因的核苷酸序列如seq?id?no.5、seq?id?no.6或seq?id?no.7。
6.根據(jù)權(quán)利要求3所述的一種與水稻穗型和籽粒大小相關(guān)的基因,其特征在于,所述取代、缺失或添加一個(gè)或幾個(gè)堿基序列采用基因編輯方法進(jìn)行。
7.根據(jù)權(quán)利要求6所述的一種與水稻穗型和籽粒大小相關(guān)的基因,其特征在于,所述基因編輯采用crispr/cas9進(jìn)行。
8.根據(jù)權(quán)利要求6所述的一種與水稻穗型和籽粒大小相關(guān)的基因,其特征在于,所述取代、缺失或添加一個(gè)或幾個(gè)堿基序列中敲除基因的靶標(biāo)序列的核苷酸如seq?id?no.8或seqid?no.9。
9.如權(quán)利要求2~8任一所述基因的應(yīng)用,其特征在于,所述基因在水稻育種中的用途。
10.根據(jù)權(quán)利要求9所述的應(yīng)用,其特征在于,所述水稻育種為雜交選育穗型和粒型品種水稻。