本發(fā)明屬于植物育種,具體涉及一種大豆葉片蔗糖含量相關(guān)的分子標(biāo)記及其應(yīng)用。
背景技術(shù):
1、大豆(glycine?max[l]merr.)起源于中國(guó),已有五千多年的栽培歷史,是豆科大豆屬的一年生草本植物。它也是世界上最早栽培的經(jīng)濟(jì)作物之一,含有豐富的植物蛋白和油脂,是重要的油料和飼料作物,具有良好的發(fā)展前景。隨著人們生活水平的提高,對(duì)大豆的需求量也越來越大,但是目前我國(guó)大豆的產(chǎn)量有限,無法滿足國(guó)內(nèi)的需求,其對(duì)外依存度正逐年上升。這主要是由于在當(dāng)前階段,大豆的單產(chǎn)水平較低,提高單位面積產(chǎn)量是目前育種工作的重點(diǎn),所以為適應(yīng)我國(guó)大豆產(chǎn)業(yè)發(fā)展的需要,急需選育高產(chǎn)品種。生物產(chǎn)量是經(jīng)濟(jì)產(chǎn)量的基礎(chǔ),苗期形成較大生物產(chǎn)量,為大豆最終生物產(chǎn)量的形成奠定了良好的基礎(chǔ)。大豆苗期主要是進(jìn)行營(yíng)養(yǎng)生長(zhǎng),隨著營(yíng)養(yǎng)體增大,更多的光能向化學(xué)能進(jìn)行轉(zhuǎn)換,促進(jìn)干物質(zhì)的積累,為生殖生長(zhǎng)的發(fā)育奠定了堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)。
2、蔗糖是光能向化學(xué)能轉(zhuǎn)換的重要中間產(chǎn)物,植物生長(zhǎng)發(fā)育所需要的光合產(chǎn)物大部分以蔗糖的形式供應(yīng)和運(yùn)輸。研究大豆苗期葉片蔗糖含量的變化特征,對(duì)大豆良種的選育具有重要的參考價(jià)值,傳統(tǒng)的檢測(cè)方法過于緩慢,亟需一種快速準(zhǔn)確便捷的方法。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路
1、本發(fā)明的目的是為了快速、準(zhǔn)確的篩選出葉片蔗糖含量高的大豆品種。
2、本發(fā)明提供一種大豆葉片蔗糖含量相關(guān)的分子標(biāo)記,所述分子標(biāo)記的基因?yàn)間lyma.14g029100,且在2131531位上的核苷酸位點(diǎn)為t或c。
3、本發(fā)明提供一種擴(kuò)增上述的分子標(biāo)記的引物序列,正向引物序列為seq?id?no.4或seq?id?no.5所示;反向引物序列如seq?id?no.6所示。
4、本發(fā)明提供一種大豆葉片蔗糖含量相關(guān)的snp位點(diǎn),所述snp位點(diǎn)位于14號(hào)染色體上的2131531位,所述位點(diǎn)的堿基為t或c。
5、本發(fā)明提供一種擴(kuò)增上述的snp位點(diǎn)的引物序列,正向引物序列為seq?id?no.4或seq?id?no.5所示;反向引物序列如seq?id?no.6所示。
6、本發(fā)明提供一種上述的分子標(biāo)記、上述的引物序列、上述的snp位點(diǎn)或上述的引物序列在制備鑒定高蔗糖含量的大豆葉片或低蔗糖含量的大豆葉片的試劑盒中的應(yīng)用。
7、本發(fā)明提供一種鑒定高蔗糖含量的大豆葉片的試劑盒,所述試劑盒包括上述的引物序列;檢測(cè)待檢測(cè)品種的大豆為tc基因型則待檢測(cè)品種為高蔗糖含量的大豆葉片。
8、本發(fā)明提供一種鑒定苗期生物產(chǎn)量高的大豆的試劑盒,所述試劑盒包括上述的引物序列;檢測(cè)待檢測(cè)品種的大豆為tc基因型則待檢測(cè)品種為苗期生物產(chǎn)量高的大豆。
9、本發(fā)明提供一種鑒定高蔗糖含量的大豆葉片的方法,所述方法的具體步驟如下:
10、步驟1:提取待檢測(cè)大豆的dna;
11、步驟2:利用上述的分子標(biāo)記的引物序列或上述的snp位點(diǎn)的引物序列進(jìn)行pcr反應(yīng),檢測(cè)待檢測(cè)品種的大豆為tc基因型則待檢測(cè)品種為高蔗糖含量的大豆葉片,若為cc基因型則待檢測(cè)品種為低蔗糖含量的大豆葉片。
12、進(jìn)一步地限定,步驟2中pcr反應(yīng)為95℃,10min;95℃,20sec,61℃,45sec,每個(gè)循環(huán)-0.6℃10個(gè)循環(huán);95℃,20sec,30個(gè)循環(huán);55℃,45sec;37℃,1min,1個(gè)循環(huán)。
13、進(jìn)一步地限定,步驟2中的tc基因型為snp位點(diǎn)的堿基為t;cc基因型為snp位點(diǎn)的堿基為c。
14、有益效果:大豆kasp標(biāo)記開發(fā)群體中不同品種的生物產(chǎn)量和葉片蔗糖含量均有顯著差異且差異幅度較大。大豆苗期生物產(chǎn)量和葉片蔗糖含量顯著正相關(guān)。開發(fā)了1個(gè)判斷大豆苗期葉片蔗糖含量的kasp標(biāo)記為chr14_2131531,利用kasp標(biāo)記驗(yàn)證群體確認(rèn)了chr14_2131531具有很好的分型效果,將337份種質(zhì)資源分為攜帶基因型tc的品種和攜帶基因型cc的品種兩類,并發(fā)現(xiàn)利用chr14_2131531標(biāo)記可以對(duì)葉片蔗糖含量高的品種有70.14%的選擇效果。
1.一種大豆葉片蔗糖含量相關(guān)的分子標(biāo)記,其特征在于,所述分子標(biāo)記的基因?yàn)間lyma.14g029100,且在2131531位上的核苷酸位點(diǎn)為t或c。
2.擴(kuò)增權(quán)利要求1所述的分子標(biāo)記的引物序列,其特征在于,正向引物序列為seq?idno.4或seq?id?no.5所示;反向引物序列如seq?id?no.6所示。
3.一種大豆葉片蔗糖含量相關(guān)的snp位點(diǎn),其特征在于,所述snp位點(diǎn)位于14號(hào)染色體上的2131531位,所述位點(diǎn)的堿基為t或c。
4.擴(kuò)增權(quán)利要求3所述的snp位點(diǎn)的引物序列,其特征在于,正向引物序列為seq?idno.4或seq?id?no.5所示;反向引物序列如seq?id?no.6所示。
5.權(quán)利要求1所述的分子標(biāo)記、權(quán)利要求2所述的引物序列、權(quán)利要求3所述的snp位點(diǎn)或權(quán)利要求4所述的引物序列在制備鑒定高蔗糖含量的大豆葉片或低蔗糖含量的大豆葉片的試劑盒中的應(yīng)用。
6.一種鑒定高蔗糖含量的大豆葉片的試劑盒,其特征在于,所述試劑盒包括權(quán)利要求2或權(quán)利要求4所述的引物序列;檢測(cè)待檢測(cè)品種的大豆為tc基因型則待檢測(cè)品種為高蔗糖含量的大豆葉片。
7.一種鑒定苗期生物產(chǎn)量高的大豆的試劑盒,其特征在于,所述試劑盒包括權(quán)利要求2或權(quán)利要求4所述的引物序列;檢測(cè)待檢測(cè)品種的大豆為tc基因型則待檢測(cè)品種為苗期生物產(chǎn)量高的大豆。
8.一種鑒定高蔗糖含量的大豆葉片的方法,其特征在于,所述方法的具體步驟如下:
9.根據(jù)權(quán)利要求8所述的方法,其特征在于,步驟2中pcr反應(yīng)為95℃,10min;95℃,20sec,61℃,45sec,每個(gè)循環(huán)-0.6℃10個(gè)循環(huán);95℃,20sec,30個(gè)循環(huán);55℃,45sec;37℃,1min,1個(gè)循環(huán)。
10.根據(jù)權(quán)利要求8所述的方法,其特征在于,步驟2中的tc基因型為snp位點(diǎn)的堿基為t;cc基因型為snp位點(diǎn)的堿基為c。