本發(fā)明涉及棉花分子育種，更具體的說(shuō)是涉及一種與陸地棉纖維長(zhǎng)度主效qtl緊密連鎖的indel分子標(biāo)記及其應(yīng)用。

背景技術(shù)：

1、棉花是一種重要的經(jīng)濟(jì)作物，約占世界纖維年需求量的35％，為紡織、造紙、醫(yī)藥等50多個(gè)行業(yè)提供原材料，在全球市場(chǎng)上具有較高的經(jīng)濟(jì)地位。目前，棉花畝產(chǎn)量有了顯著增長(zhǎng)，優(yōu)質(zhì)棉產(chǎn)量仍有較大缺口，不能滿足紡織工業(yè)對(duì)原棉“質(zhì)”的需求。因此，改良棉花纖維品質(zhì)仍然是棉花育種的重要目標(biāo)。棉花纖維品質(zhì)性狀主要包括纖維長(zhǎng)度、纖維強(qiáng)度、馬克隆值、整齊度指數(shù)和伸長(zhǎng)率，纖維品質(zhì)主要性狀間存在顯著相關(guān)性，因此，挖掘與棉花纖維長(zhǎng)度主效qtl緊密連鎖的分子標(biāo)記，是本領(lǐng)域技術(shù)人員亟需解決的問(wèn)題，將為分子標(biāo)記輔助選擇優(yōu)質(zhì)棉品種提供基礎(chǔ)和依據(jù)，大大加快分子育種的進(jìn)程。

技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路

1、有鑒于此，本發(fā)明提供了一種與陸地棉纖維長(zhǎng)度主效qtl緊密連鎖的indel分子標(biāo)記及其應(yīng)用。

2、為了實(shí)現(xiàn)上述目的，本發(fā)明采用如下技術(shù)方案：

3、一種與陸地棉纖維長(zhǎng)度主效qtl緊密連鎖的indel分子標(biāo)記，所述indel分子標(biāo)記的核苷酸序列如seq?id?no.3所示。

4、作為優(yōu)選的方案，所述indel分子標(biāo)記位于棉花a9染色體，a09:6297275-a09:6297276之間，為40bp的插入/缺失。

5、本發(fā)明的另一目的是，提供一種檢測(cè)上述indel分子標(biāo)記的引物對(duì)，所述引物對(duì)包括核苷酸序列如seq?id?no.1所述的正向引物和核苷酸序列如seq?id?no.2所示的反向引物。

6、本發(fā)明的另一目的是，提供一種檢測(cè)上述indel分子標(biāo)記的產(chǎn)品，所述產(chǎn)品包括上述的引物對(duì)。

7、作為優(yōu)選的方案，所述產(chǎn)品為試劑盒。

8、本發(fā)明的另一目的是，提供上述indel分子標(biāo)記、或者上述引物對(duì)、或者上述的產(chǎn)品在棉花育種中的應(yīng)用，所述應(yīng)用為以下任意一種：

9、a：提高棉花纖維長(zhǎng)度；

10、b：鑒定優(yōu)質(zhì)棉花資源；

11、c：棉花品種改良。

12、本發(fā)明的另一目的是，提供一種檢測(cè)棉花纖維長(zhǎng)度的方法，利用上述引物對(duì)或者上述產(chǎn)品檢測(cè)棉花樣品，當(dāng)擴(kuò)增產(chǎn)物只有277bp條帶時(shí)，棉纖維長(zhǎng)度較短；當(dāng)擴(kuò)增產(chǎn)物只有237bp條帶時(shí)，棉纖維長(zhǎng)度較長(zhǎng)；當(dāng)擴(kuò)增產(chǎn)物包含277bp和237bp兩條時(shí)，棉纖維長(zhǎng)度居中。

13、有益效果：本發(fā)明提供的indel分子標(biāo)記a9-35，能夠與陸地棉a9染色體纖維長(zhǎng)度主效qtl緊密連鎖，為棉花纖維長(zhǎng)度基因的圖位克隆奠定基礎(chǔ)，能夠應(yīng)用于棉花纖維品質(zhì)分子標(biāo)記輔助選擇育種和分子聚合育種，提高選擇和聚合效率。

技術(shù)特征：

1.一種與陸地棉纖維長(zhǎng)度主效qtl緊密連鎖的indel分子標(biāo)記，其特征在于，所述indel分子標(biāo)記的核苷酸序列如seq?id?no.3所示。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的indel分子標(biāo)記，其特征在于，所述indel分子標(biāo)記位于棉花a9染色體，a09:6297275-a09:6297276之間，為40bp的插入/缺失。

3.一種檢測(cè)權(quán)利要求1或2所述indel分子標(biāo)記的引物對(duì)，其特征在于，所述引物對(duì)包括核苷酸序列如seq?id?no.1所述的正向引物和核苷酸序列如seq?id?no.2所示的反向引物。

4.一種檢測(cè)權(quán)利要求1或2所述indel分子標(biāo)記的產(chǎn)品，其特征在于，所述產(chǎn)品包括權(quán)利要求3所述的引物對(duì)。

5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的檢測(cè)所述indel分子標(biāo)記的產(chǎn)品，其特征在于，所述產(chǎn)品為試劑盒。

6.權(quán)利要求1或2所述indel分子標(biāo)記、或者權(quán)利要求3所述引物對(duì)、或者權(quán)利要求4或5所述的產(chǎn)品在棉花育種中的應(yīng)用，其特征在于，所述應(yīng)用為以下任意一種：

7.一種檢測(cè)棉花纖維長(zhǎng)度的方法，其特征在于，利用權(quán)利要求3所述引物對(duì)或者權(quán)利要求4或5所述產(chǎn)品檢測(cè)棉花樣品，當(dāng)擴(kuò)增產(chǎn)物只有277bp條帶時(shí)，棉纖維長(zhǎng)度較短；當(dāng)擴(kuò)增產(chǎn)物只有237bp條帶時(shí)，棉纖維長(zhǎng)度較長(zhǎng)；當(dāng)擴(kuò)增產(chǎn)物包含277bp和237bp兩條時(shí)，棉纖維長(zhǎng)度居中。

技術(shù)總結(jié)
本發(fā)明公開(kāi)了一種與陸地棉纖維長(zhǎng)度主效QTL緊密連鎖的InDel分子標(biāo)記及其應(yīng)用，涉及棉花分子育種技術(shù)領(lǐng)域，所述InDel分子標(biāo)記核苷酸序列如SEQ?ID?NO.4所示，可由核苷酸序列如SEQ?ID?NO.1所述的正向引物和核苷酸序列如SEQ?ID?NO.2所示的反向引物擴(kuò)增鑒別。本發(fā)明提供的InDel分子標(biāo)記A9?35，能夠與陸地棉A9染色體纖維長(zhǎng)度主效QTL緊密連鎖，為棉花纖維長(zhǎng)度基因的圖位克隆奠定基礎(chǔ)，能夠應(yīng)用于棉花纖維品質(zhì)分子標(biāo)記輔助選擇育種和分子聚合育種，提高選擇和聚合效率。

技術(shù)研發(fā)人員：李興河,張建宏,唐麗媛,王海濤,張素君,蔡肖
受保護(hù)的技術(shù)使用者：河北省農(nóng)林科學(xué)院棉花研究所（河北省農(nóng)林科學(xué)院特種經(jīng)濟(jì)作物研究所）
技術(shù)研發(fā)日：
技術(shù)公布日：2024/9/17