本發(fā)明涉及分子標(biāo)記領(lǐng)域,特別涉及影響豬中c14:0含量或c18:1n9含量的豬12號染色體上的snp標(biāo)記。
背景技術(shù):
1、豬是六畜之首,是中國人最重要的肉食來源,我國每年生產(chǎn)消費5億頭豬,占全球總耗費量的一半,每個中國人平均一年要消費掉近40公斤的豬肉,遠遠高于其他肉類的總和。而豬肉中富含大量的營養(yǎng)物質(zhì),為人體提供包括:蛋白質(zhì)、多種必需氨基酸、脂肪酸、豐富的微量元素等營養(yǎng)物質(zhì)。其中脂肪酸作為一類營養(yǎng)物質(zhì),與人類日常生活以及身體健康息息相關(guān)。大多數(shù)不飽和脂肪酸(如油酸、亞油酸、亞麻酸等必需脂肪酸)人類自身不能合成,需要靠外界攝入。
2、c14:0,也被稱為肉豆蔻酸,是一種飽和脂肪酸。研究表明,c14:0不僅會升高低密度脂蛋白、膽固醇和中性脂肪的含量,而且c14:0攝入量過高還會導(dǎo)致血膽固醇、三酰甘油、ldl-c升高,繼而引發(fā)動脈管腔狹窄,形成動脈粥樣硬化,增加患冠心病的風(fēng)險。c18:1n9,可用于預(yù)防心臟病和降低膽固醇,以及預(yù)防癌癥和其他疾病。另外,c18:1n9在豬肉中的含量與豬肉的風(fēng)味呈正相關(guān),對豬的肉質(zhì)有正面的影響。因此,適當(dāng)提高豬肉脂肪酸中c18:1n9的含量,可以提供豬肉的風(fēng)味,且對人類健康有益;降低脂肪酸c14:0的含量,可以有效地緩解各種誘發(fā)人類疾病的風(fēng)險。
3、由于脂肪酸性狀的測定成本高,費時費力,且需要屠宰后取樣測定,利用傳統(tǒng)基于家系信息的遺傳育種技術(shù)來改良脂肪酸效率不高。豬肉作為一種富含飽和脂肪酸與不飽和脂肪酸的肉類食品,挖掘出影響脂肪酸性狀的分子標(biāo)記,對于肉質(zhì)改良、育種群體改良、生豬養(yǎng)殖的經(jīng)濟效應(yīng)、以及人類健康都有重大的意義。
技術(shù)實現(xiàn)思路
1、本發(fā)明之一提供了一種豬的snp標(biāo)記,所述snp標(biāo)記的核酸的序列如seq?id?no.1所示,所述snp標(biāo)記的位點位于如seq?id?no.1所示的核酸上的從5’端起的第301位,對應(yīng)于11.1版本國際豬基因組的12號染色體上的從5’端起的第516894位,為g或a。
2、本發(fā)明之二提供了本發(fā)明之一中所述的snp標(biāo)記在輔助鑒定豬脂肪酸含量中的應(yīng)用。即可以先通過snp標(biāo)記高通量篩選出c14:0的含量較低和/或c18:1n9的含量較高的g/g基因型和/或g/a基因型,再根據(jù)需要基于常規(guī)方法(例如《食品安全國家標(biāo)準食品中脂肪酸的測定gb5009.168—2016》中所述及到的方法)對g/g基因型和/或g/a基因型進行定量測定,或省略定量測定步驟,僅基于snp標(biāo)記的基因型作出選擇。
3、在一個具體實施方式中,所述脂肪酸含量包括c14:0的含量和/或c18:1n9的含量。
4、在一個具體實施方式中,基于所述豬脂肪酸含量,所述seq?id?no.1上的從5’端起的第301位點基因型的優(yōu)選順序依次為:g/g基因型、g/a基因型和a/a基因型。
5、在一個具體實施方式中,基于所述c14:0的含量,所述seq?id?no.1上的從5’端起的第301位點基因型的優(yōu)選順序依次為:g/g基因型、g/a基因型和a/a基因型。
6、在一個具體實施方式中,基于所述c18:1n9的含量,所述seq?id?no.1上的從5’端起的第301位點基因型的優(yōu)選順序依次為:g/g基因型、g/a基因型和a/a基因型。
7、在一個具體實施方式中,所述豬為杜洛克、大白、長白、皮特蘭、二花臉、萊蕪、巴馬香和藏豬的雜交嵌合豬。
8、在一個具體實施方式中,所述豬為杜洛克、大白、長白、皮特蘭、二花臉、萊蕪、巴馬香和藏豬的雜交嵌合豬的f6代、f7代或f7代的后代。
9、本發(fā)明之三提供了一種輔助豬遺傳改良的方法,所述方法包括:確定種豬核心群中的種豬的如本發(fā)明之一所述的snp標(biāo)記,并根據(jù)所述snp標(biāo)記做出相應(yīng)的選擇:在所述種豬核心群中選擇在所述seq?id?no.1上的從5’端起的第301位點為g/a或g/g基因型的種豬個體,淘汰在該位點為a/a基因型的種豬個體,以逐代提高該位點的等位基因g的頻率。
10、在一個具體實施方式中,在所述種豬核心群中選擇在所述seq?id?no.1上的從5’端起的第301位點為g/g基因型的種豬個體,淘汰在該位點為g/a和a/a基因型的種豬個體,以逐代提高該位點的等位基因g的頻率。
11、在一個具體實施方式中,利用分析所述種豬的核酸的序列來確定所述種豬的如本發(fā)明之一所述的snp標(biāo)記,其中所述核酸的序列如seq?id?no.1所示。
12、在一個具體實施方式中,所述豬的來源為杜洛克、大白、長白、皮特蘭、二花臉、萊蕪、巴馬香和藏豬的雜交嵌合豬。
13、在一個具體實施方式中,所述豬的來源為杜洛克、大白、長白、皮特蘭、二花臉、萊蕪、巴馬香和藏豬的雜交嵌合豬的f6代、f7代或f7代的后代。
14、本發(fā)明的有益效果:
15、本發(fā)明的snp標(biāo)記12_516894與豬脂肪酸含量顯著相關(guān),特別是與c14:0的含量和c18:1n9的含量顯著相關(guān),因此可以通過本發(fā)明的snp標(biāo)記對豬群該位點進行判型,并通過該snp標(biāo)記可以對豬中的脂肪酸含量進行輔助鑒定或?qū)ωi群進行與脂肪酸含量相關(guān)的遺傳改良。
16、通過改良12_516894snp位點,提高該位點等位基因g的頻率,降低等位基因a的頻率,可以降低c14:0的含量,提高c18:1n9的含量。其中,降低c14:0的含量有利于降低人患2型糖尿病,心腦管等疾病的風(fēng)險;而提高c18:1n9的含量有利于提高肉質(zhì)的風(fēng)味,可預(yù)防心臟病和降低膽固醇,以及預(yù)防癌癥和其他疾病,為人類健康帶來益處。
1.一種豬的snp標(biāo)記,所述snp標(biāo)記的核酸的序列如seq?id?no.1所示,所述snp標(biāo)記的位點位于如seq?id?no.1所示的核酸上的從5’端起的第301位,對應(yīng)于11.1版本國際豬基因組的12號染色體上的從5’端起的第516894位,為g或a。
2.如權(quán)利要求1所述的snp標(biāo)記在輔助鑒定豬脂肪酸含量中的應(yīng)用。
3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的應(yīng)用,其特征在于,所述脂肪酸含量包括c14:0的含量和/或c18:1n9的含量。
4.根據(jù)權(quán)利要求2或3所述的應(yīng)用,其特征在于,基于所述豬脂肪酸含量,所述seq?idno.1上的從5’端起的第301位點基因型的優(yōu)選順序依次為:g/g基因型、g/a基因型和a/a基因型。
5.根據(jù)權(quán)利要求3所述的應(yīng)用,其特征在于,基于所述c14:0的含量,所述seq?idno.1上的從5’端起的第301位點基因型的優(yōu)選順序依次為:g/g基因型、g/a基因型和a/a基因型;和/或
6.根據(jù)權(quán)利要求2至5中任意一項所述的應(yīng)用,其特征在于,所述豬為杜洛克、大白、長白、皮特蘭、二花臉、萊蕪、巴馬香和藏豬的雜交嵌合豬。
7.一種輔助豬遺傳改良的方法,所述方法包括:確定種豬核心群中的種豬的如權(quán)利要求1所述的snp標(biāo)記,并根據(jù)所述snp標(biāo)記做出相應(yīng)的選擇:
8.根據(jù)權(quán)利要求7所述的方法,其特征在于,在所述種豬核心群中選擇在所述seq?idno.1上的從5’端起的第301位點為g/g基因型的種豬個體,淘汰在該位點為g/a和a/a基因型的種豬個體,以逐代提高該位點的等位基因g的頻率。
9.根據(jù)權(quán)利要求7或8所述的方法,其特征在于,利用分析所述種豬的核酸的序列來確定所述種豬的如權(quán)利要求1所述的snp標(biāo)記,其中所述核酸的序列如seq?id?no.1所示。
10.根據(jù)權(quán)利要求7或8所述的方法,其特征在于,所述豬的來源為杜洛克、大白、長白、皮特蘭、二花臉、萊蕪、巴馬香和藏豬的雜交嵌合豬。