本發(fā)明涉及生物醫(yī)藥,具體涉及一種環(huán)狀rna?circtcons及其應用。
背景技術:
1、乳腺癌發(fā)病率逐年上升,已成為女性惡性腫瘤中發(fā)病率及死亡率第一位的癌種,嚴重危害女性健康。三陰乳腺癌(triple?negative?breast?cancer,tnbc)是雌激素受體、孕激素受體、人表皮生長因子受體2表達均為陰性的一類乳腺癌,作為預后最差的亞型約占乳腺癌15%,其中約30%-40%患者在隨訪期內(nèi)出現(xiàn)轉移等惡性結果。由于三陰乳腺癌缺乏有效的治療靶點,治療手段有限,相比于其他類型的乳腺癌其預后最差。
2、tnbc被分為六種亞型,免疫調節(jié)型(im)、管腔雄激素受體型(lar)、基底樣1型(bl-1)、基底樣2型(bl-2)、間充質型(m)和間充質干細胞樣型(msl)。這些類型根據(jù)其基因表達組合進行分類。pam50基因固有亞型分析顯示,tnbc中1.6%為管腔a型,3.2%為管腔b型,9.1%為her2過表達,只有86.1%為blbc。越來越多的研究關注ihc替代因子,如ck5/6或ck17ck5/6或p-鈣黏著蛋白(鈣黏素)、ck5/6或ck14均提示基底樣分化,不同的因子具有不同程度的準確性。egfr和ckit同樣與blbc相關。另外一些標志物如p63、平滑肌肌動蛋白(sma)、陷窩蛋白和周期蛋白e也越來越多的被提出,盡管這些因子沒有被納入最新的美國臨床腫瘤學會(asco)指南,但它們對輔助分型、預后評估和治療都有重要作用。
3、基于血液樣本的液體活檢是一類無創(chuàng)診斷方法,通過在血液標本中分析循環(huán)腫瘤細胞(ctc)和循環(huán)腫瘤核酸(ctna)包括循環(huán)腫瘤dna(ctdna)和microrna(mirna)的存在。在癌癥患者血液中發(fā)現(xiàn)的ctdna通常來自原發(fā)腫瘤、ctc、以及腫瘤發(fā)生和進展過程中凋亡和壞死的細胞。血液中腫瘤ctdna的含量取決于原發(fā)灶或轉移灶的大小,因此ctdna的含量可以反應腫瘤負荷的大小。然而,ctc和ctdna半衰期較短,穩(wěn)定性較差,成熟穩(wěn)定表達時間較短,離體標本提取較為困難。且目前多項以ctdna作為診斷或者預后標記物的臨床研究未獲得陽性結果,其準確性及可靠性仍待商榷。
4、因此,迫切需要研發(fā)精確、高效、成本低廉且普適性高的三陰乳腺癌早期診斷、療效預測標記物,以用于臨床三陰乳腺癌早期診斷和預后風險評估。
技術實現(xiàn)思路
1、本發(fā)明的目的在于克服現(xiàn)有技術的不足之處而提供一種環(huán)狀rna?circtcons及其應用。
2、為實現(xiàn)上述目的,本發(fā)明采取的技術方案如下:
3、第一方面,本發(fā)明提供了一種用于評估三陰乳腺癌預后情況的環(huán)狀rna,所述rna為環(huán)狀rna?circtcons。
4、本發(fā)明的環(huán)狀rnacirctcons在不同基因亞型的三陰性乳腺癌中均高表達,circtcons直接干預細胞骨架蛋白的折疊影響三陰性乳腺癌轉移,可作為三陰性乳腺癌的診斷及預后標記物,彌補了ihc和基因檢測的不足,普適性好,可在所有的三陰乳腺癌患者中進行檢測;本發(fā)明的診斷及預后標記物circtcons成環(huán)性好,體內(nèi)及體外穩(wěn)定性好,無論在體內(nèi)還是體外組織中均可鑒定檢測。
5、作為本發(fā)明所述的用于評估三陰乳腺癌預后情況的環(huán)狀rna的優(yōu)選實施方式,所述環(huán)狀rna?circtcons的核苷酸序列如seq?id?no:1所示。
6、第二方面,本發(fā)明將識別所述的環(huán)狀rna的標記物在制備診斷治療三陰乳腺癌的試劑中應用,所述的標記物包括但不限于:
7、(1)結合所述環(huán)狀rna的引物/引物組或熒光標記的結合所述環(huán)狀rna的引物/引物組;
8、(2)結合所述環(huán)狀rna的小分子化合物;
9、(3)結合所述環(huán)狀rna的生物大分子,所述的生物大分子包括但不限于:抗體或抗體功能片段、熒光標記的抗體或抗體功能片段、rna結合蛋白或其功能片段、熒光標記的rna結合蛋白或其功能片段。
10、第三方面,本發(fā)明將識別所述的環(huán)狀rna的標記物在制備評估三陰乳腺癌預后情況的產(chǎn)品中應用,所述的標記物包括但不限于:
11、(1)結合所述環(huán)狀rna的引物/引物組或熒光標記的結合所述環(huán)狀rna的引物/引物組;
12、(2)結合所述環(huán)狀rna的小分子化合物;
13、(3)結合所述環(huán)狀rna的生物大分子,所述的生物大分子包括但不限于:抗體或抗體功能片段、熒光標記的抗體或抗體功能片段、rna結合蛋白或其功能片段、熒光標記的rna結合蛋白或其功能片段。
14、第四方面,本發(fā)明提供一種用于評估三陰乳腺癌預后情況的試劑或試劑盒,其特征在于,包含所述的標記物。
15、第五方面,本發(fā)明將所述的環(huán)狀rna在制備診斷三陰乳腺癌的試劑中應用,所述試劑用于識別所述環(huán)狀rna。
16、第六方面,本發(fā)明將所述的環(huán)狀rna在制備治療三陰乳腺癌的藥物中應用,所述藥物用于沉默或敲除所述環(huán)狀rna。
17、第七方面,本發(fā)明將所述的環(huán)狀rna在制備篩選判斷三陰乳腺癌預后情況的評估試劑中應用。
18、與現(xiàn)有技術相比,本發(fā)明的有益效果為:
19、本發(fā)明的環(huán)狀rnacirctcons在不同基因亞型的三陰性乳腺癌中均高表達,circtcons直接干預細胞骨架蛋白的折疊影響三陰性乳腺癌轉移,可作為三陰性乳腺癌的診斷及預后標記物,彌補了ihc和基因檢測的不足,普適性好,可在所有的三陰乳腺癌患者中進行檢測;本發(fā)明的診斷及預后標記物circtcons成環(huán)性好,體內(nèi)及體外穩(wěn)定性好,無論在體內(nèi)還是體外組織中均可鑒定檢測。本發(fā)明解決了三陰乳腺癌缺乏精確、高效、成本低廉且普適性高的早期診斷、療效預測標記物的難題。
1.一種用于評估三陰乳腺癌預后情況的環(huán)狀rna,其特征在于,所述rna為環(huán)狀rnacirctcons。
2.根據(jù)權利要求1所述的用于評估三陰乳腺癌預后情況的環(huán)狀rna,其特征在于,所述環(huán)狀rna?circtcons的核苷酸序列如seq?id?no:1所示。
3.識別權利要求1所述的環(huán)狀rna的標記物在制備診斷治療三陰乳腺癌的試劑中的應用,其特征在于,所述的標記物包括但不限于:
4.識別權利要求1所述的環(huán)狀rna的標記物在制備評估三陰乳腺癌預后情況的產(chǎn)品中的應用,其特征在于,所述的標記物包括但不限于:
5.一種用于評估三陰乳腺癌預后情況的試劑或試劑盒,其特征在于,包含權利要求4所述的標記物。
6.權利要求1或2所述的環(huán)狀rna在制備診斷三陰乳腺癌的試劑中的應用,其特征在于,所述試劑用于識別所述環(huán)狀rna。
7.權利要求1或2所述的環(huán)狀rna在制備治療三陰乳腺癌的藥物中的應用,其特征在于,所述藥物用于沉默或敲除所述環(huán)狀rna。
8.權利要求1或2所述的環(huán)狀rna在制備篩選判斷三陰乳腺癌預后情況的評估試劑中的應用。