本發(fā)明涉及微生物,更具體地說(shuō),它涉及一種高通量篩選噬菌體的方法及應(yīng)用。
背景技術(shù):
1、目前我國(guó)海水產(chǎn)品產(chǎn)量呈逐年增長(zhǎng)趨勢(shì),但是海水養(yǎng)殖動(dòng)物病害率升高,嚴(yán)重威脅全球海水養(yǎng)殖行業(yè)的發(fā)展。哈維氏弧菌(vibrio?harveyi)廣泛分布于海洋及河口,會(huì)引發(fā)石斑魚(yú)(epinephelus)、牙鲆(paralichthys?olivaceus)等多種海洋魚(yú)類(lèi)出血性敗血癥、腸炎和眼部病變等病害,是近年來(lái)海水養(yǎng)殖動(dòng)物病害事件中出現(xiàn)頻率最高的致病菌之一。
2、以往,使用抗生素是應(yīng)對(duì)哈維氏弧菌等致病菌的有效方式,但是如今致病菌產(chǎn)生了耐藥性,而新抗生素的研發(fā)已進(jìn)入瓶頸期。目前替代抗生素治療養(yǎng)殖動(dòng)物的方法還存在產(chǎn)生不良反應(yīng)、治療效果差、藥理不明等諸多缺陷。因此,找到安全、高效應(yīng)對(duì)海水養(yǎng)殖致病菌的新方法,對(duì)于海水養(yǎng)殖動(dòng)物應(yīng)對(duì)致病菌的感染、提高海洋經(jīng)濟(jì)具有重要的意義。
3、為了既能應(yīng)對(duì)當(dāng)前嚴(yán)重的細(xì)菌耐藥性問(wèn)題,又能推進(jìn)水產(chǎn)養(yǎng)殖按照“提質(zhì)增效、綠色發(fā)展”的要求發(fā)展。一種早于抗生素,在一百年前就被發(fā)現(xiàn)可以裂解細(xì)菌的噬菌體,又意外的被學(xué)者們重新重視起來(lái)。與抗生素相比,在海水養(yǎng)殖中使用噬菌體具有的優(yōu)勢(shì):1)具有專(zhuān)一性,不會(huì)影響環(huán)境中的其它微生物;2)易被生物降解,不易在環(huán)境中殘留使致病菌產(chǎn)生耐藥;3)噬菌體在水體環(huán)境中普遍存在。但是,特別針對(duì)于海洋弧菌有良好的噬菌體分離體系缺乏,使得噬菌體的分離過(guò)程繁雜,成本高,猶如大海撈針。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路
1、為了克服現(xiàn)有技術(shù)中所存在的上述缺陷,本發(fā)明提供了一種高通量篩選噬菌體的方法及應(yīng)用,可應(yīng)用此方法篩選到哈維氏弧菌的噬菌體,且能縮減將宿主菌與待篩選水體預(yù)孵育的步驟提高效率,并且減少成本,提高準(zhǔn)確性。
2、本發(fā)明的上述技術(shù)目的是通過(guò)以下技術(shù)方案得以實(shí)現(xiàn)的:一種高通量篩選噬菌體的方法及應(yīng)用,包括以下步驟:
3、s1、將所有待測(cè)水樣分裝到5ml離心管中離心,轉(zhuǎn)速為14000r/min;
4、s2、每個(gè)樣品取3ml上清液,每5個(gè)樣品混合,取3ml混合后的水樣與100μl待測(cè)宿主菌液和3ml雙倍液體培養(yǎng)基混合液于試管中,在適宜溫度下振蕩培養(yǎng);
5、s3、培養(yǎng)結(jié)束后離心過(guò)濾去除宿主菌,將噬菌體原液100ul與其對(duì)應(yīng)的菌液100ul混合,檢測(cè)上清液中是否有噬菌體,分離得到噬菌體;
6、s4、用雙層平板法制作培養(yǎng)基,在培養(yǎng)基上的每個(gè)噬菌體斑戳出多個(gè)小孔,加入至含有200ul?sm緩沖溶液的96孔板里,獲得噬菌體庫(kù);
7、s5、噬菌體庫(kù)每孔取5μl噬菌體液,點(diǎn)在一塊含有菌苔的方形培養(yǎng)皿上,觀察噬菌斑的情況;
8、s6、將透亮明顯的噬菌體斑進(jìn)行進(jìn)一步的純化。
9、進(jìn)一步的,步驟s3中所述的宿主菌為待篩選噬菌體裂解菌。
10、進(jìn)一步的,步驟s4中所述的培養(yǎng)基為含有35%nacl的lb培養(yǎng)基。
11、一種高通量篩選噬菌體的方法篩選出的噬菌體在分散劑、穩(wěn)定劑、填料或溶劑中的應(yīng)用。
12、綜上所述,本發(fā)明具有以下有益效果:
13、(1)本發(fā)明提供篩選噬菌體的方法,對(duì)雙層平板法和直接點(diǎn)滴法的改進(jìn),解決了傳統(tǒng)方法僅能對(duì)宿主菌篩選一種水樣的問(wèn)題;且相對(duì)于傳統(tǒng)方法耗時(shí)長(zhǎng)的問(wèn)題,該方法僅需要12~24h方可完成一次批量測(cè)試測(cè)定,縮短了噬菌體篩選的時(shí)間;
14、(2)實(shí)驗(yàn)結(jié)果用一個(gè)平板就可以進(jìn)行批量篩選,節(jié)約了噬菌體篩選的成本,而且容易觀察并記錄,僅需一張照片就可將實(shí)驗(yàn)結(jié)果清晰的記錄下來(lái),且可在方板上進(jìn)行編號(hào),方便確定不同噬菌體斑的來(lái)源。
1.一種高通量篩選噬菌體的方法,其特征在于,包括以下步驟:
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種高通量篩選噬菌體的方法,其特征在于,步驟s3中所述的宿主菌為待篩選噬菌體裂解菌。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種高通量篩選噬菌體的方法,其特征在于,步驟s4中所述的培養(yǎng)基為含有35%nacl的lb培養(yǎng)基。
4.基于權(quán)利要求1所述的一種高通量篩選噬菌體的方法篩選出的噬菌體在分散劑、穩(wěn)定劑、填料或溶劑中的應(yīng)用。