本發(fā)明涉及遺傳育種,更具體的涉及一種影響絨山羊早期生長性狀的snp標(biāo)記及應(yīng)用。
背景技術(shù):
1、內(nèi)蒙古絨山羊是經(jīng)過長期的自然選擇和人工系統(tǒng)選育而成的優(yōu)良地方畜種,具有重要的經(jīng)濟(jì)價(jià)值。羔羊出生后的生長發(fā)育對(duì)繁殖和生產(chǎn)性能都有很大影響,隨著飼喂方式以及環(huán)境的變化,如何提高絨山羊的生長速度已經(jīng)成為亟待解決的問題之一。初生重和斷乳重是衡量絨山羊生長速度的兩個(gè)重要指標(biāo)。初生重是指絨山羊在出生時(shí)的體重,而斷乳重是指絨山羊在斷奶時(shí)的體重。這兩個(gè)指標(biāo)對(duì)絨山羊的生長速度都有顯著影響。而現(xiàn)有技術(shù)并未同時(shí)考慮絨山羊的初生重大和斷乳重大,因此在基因組層面挖掘影響內(nèi)蒙古絨山羊初生重和斷乳重的分子標(biāo)記是非常有必要的。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路
1、為解決以上問題,本發(fā)明提供了一種影響絨山羊早期生長性狀的snp標(biāo)記及應(yīng)用,以提高絨山羊的生長速度。
2、本發(fā)明是通過如下技術(shù)方案實(shí)現(xiàn)的:
3、一種影響絨山羊早期生長性狀的snp標(biāo)記,所述snp標(biāo)記包括標(biāo)記一和/或標(biāo)記二;
4、所述標(biāo)記一的核苷酸序列如seq?id?no.1所示,第101bp處位點(diǎn),發(fā)生了a至g的突變;
5、所述標(biāo)記二的核苷酸序列如seq?id?no.2所示,第101bp處位點(diǎn),發(fā)生了t至g的突變;
6、所述標(biāo)記二的所述分子標(biāo)記的核苷酸序列如seq?id?no.1所示,具體為:aacgtcatgaacactgcgacagagggaaggaactccaagccagggagaacagtgagccctgggtgctgccccctgagtaaggcaggcaggcaggggcaccagctctccttggggaccacacagaggggctgagtactttactatttagcgctctggaggcttgaggccaccctggagggttaatgtgtacaaagagctgcc,展示了突變位點(diǎn)上下游各100bp的序列,第101處位點(diǎn)發(fā)生了a至g的突變。
7、所述標(biāo)記二的所述分子標(biāo)記的核苷酸序列如seq?id?no.2所示,具體為:ttagtcttaattaagtatcttaatcttcccaggttaagggcagaaaagtaagagaaagcaggcagccacgggtggacccttcgtaagagtgtgtcctggatgccctggagccctgcatcgcggctgacccgggtgtgtacatccggggtttgatatagaaggaagatgaacgtggagaagaaacacgtctgacacctctttc,展示了突變位點(diǎn)上下游各100bp的序列,第101處位點(diǎn)發(fā)生了t至g的突變。
8、所述snp標(biāo)記在鑒定絨山羊初生重和斷乳重中的應(yīng)用,所述snp標(biāo)記包括所述標(biāo)記一和/或所述標(biāo)記二。
9、所述標(biāo)記一的堿基是a時(shí)為初生重大的絨山羊;所述標(biāo)記二的堿基是t時(shí)為斷乳重大的絨山羊。
10、優(yōu)選的,鑒定絨山羊初生重和斷乳重包括以下步驟:
11、提取絨山羊的耳組織基因組dna;
12、將基因組dna破碎獲得dna片段,然后利用dna片段構(gòu)建文庫,對(duì)文庫進(jìn)行測(cè)序,獲得測(cè)序數(shù)據(jù);
13、將測(cè)序數(shù)據(jù)經(jīng)變異位點(diǎn)的識(shí)別、篩選,使用全基因組關(guān)聯(lián)分析檢測(cè)絨山羊14號(hào)染色體上的所述標(biāo)記一,所述標(biāo)記一的堿基是a時(shí)為初生重大的絨山羊;
14、檢測(cè)絨山羊23號(hào)染色體上的所述標(biāo)記二,所述標(biāo)記二的堿基是t時(shí)為斷乳重大的絨山羊。
15、一種早期生長性狀表型值大的絨山羊的遺傳方法,通過選擇aa與tt基因型個(gè)體并作為親本,來提高后代出生體重。
16、優(yōu)選的,所述絨山羊?yàn)閮?nèi)蒙古絨山羊。
17、與現(xiàn)有技術(shù)相比較,本發(fā)明具有如下有益效果:
18、本發(fā)明提供了一種影響絨山羊早期生長性狀的snp標(biāo)記及應(yīng)用,通過基因組測(cè)序、變異位點(diǎn)的識(shí)別、全基因組關(guān)聯(lián)分析等方法,篩選出了影響絨山羊早期生長性狀的兩種snp標(biāo)記,標(biāo)記一和標(biāo)記二。用于鑒定絨山羊早期生長性狀初生重和斷乳重,通過選擇aa和tt基因型個(gè)體作為父本或者母本,來提高后代出生體重。
1.一種影響絨山羊早期生長性狀的snp標(biāo)記,其特征在于,所述snp標(biāo)記包括標(biāo)記一和/或標(biāo)記二;
2.如權(quán)利要求1所述snp標(biāo)記在鑒定絨山羊初生重和斷乳重中的應(yīng)用。
3.如權(quán)利要求2所述snp標(biāo)記在鑒定絨山羊初生重和斷乳重中的應(yīng)用,其特征在于,所述標(biāo)記一第101bp處位點(diǎn)的堿基是a時(shí)為初生重大的絨山羊;所述標(biāo)記二第101bp處位點(diǎn)的堿基是t時(shí)為斷乳重大的絨山羊。
4.如權(quán)利要求2所述snp標(biāo)記在鑒定絨山羊初生重和斷乳重中的應(yīng)用,其特征在于,鑒定絨山羊初生重和斷乳重包括以下步驟:
5.如權(quán)利要求1所述snp標(biāo)記在絨山羊遺傳育種中的應(yīng)用。
6.如權(quán)利要求5所述snp標(biāo)記在絨山羊遺傳育種中的應(yīng)用,其特征在于,通過選擇基因型為aa與tt的個(gè)體并作為親本,來提高后代出生體重。
7.如權(quán)利要求5所述snp標(biāo)記在絨山羊遺傳育種中的應(yīng)用,其特征在于,所述絨山羊?yàn)閮?nèi)蒙古絨山羊。