本發(fā)明非天然氨基酸插入,具體涉及一種在細(xì)胞中生物合成和定點(diǎn)插入乙?;嚢彼岬南到y(tǒng)和應(yīng)用。
背景技術(shù):
1、蛋白質(zhì)乙?;?,作為翻譯后修飾的重要一環(huán),由組蛋白乙?;D(zhuǎn)移酶(hats)和賴氨酸乙?;D(zhuǎn)移酶(kats)催化,將乙酰輔酶a(accoa)的乙?;珳?zhǔn)轉(zhuǎn)移至賴氨酸上,其過程受accoa濃度調(diào)控。最初,組蛋白的乙?;粡V泛揭示,迅速引起轉(zhuǎn)錄調(diào)控領(lǐng)域的關(guān)注。乙酰化不僅限于組蛋白,還廣泛影響非組蛋白。例如,在p53的關(guān)鍵位點(diǎn),乙?;⒄{(diào)其穩(wěn)定性和功能,深刻影響細(xì)胞命運(yùn)。這凸顯了賴氨酸乙?;谏^程中的關(guān)鍵作用,激發(fā)了科學(xué)家對(duì)乙?;瘷C(jī)制及其效應(yīng)的深入探索。
2、科學(xué)家們好奇:乙?;芊褡鳛榫_調(diào)控蛋白功能的“開關(guān)”?它如何在細(xì)胞內(nèi)引發(fā)包括活性、穩(wěn)定性、相互作用及定位在內(nèi)的多種變化?不同賴氨酸位點(diǎn)的乙酰化是否賦予蛋白更多樣的調(diào)控能力?然而,探究這些問題面臨著巨大的挑戰(zhàn)。生理?xiàng)l件下,乙?;{(diào)控網(wǎng)絡(luò)復(fù)雜,難以精準(zhǔn)控制。傳統(tǒng)方法也難以全面模擬乙?;恼鎸?shí)狀態(tài)。因此,乙?;亟M蛋白的表達(dá)技術(shù)創(chuàng)新成為關(guān)鍵。我們需要更精準(zhǔn)、高效的工具來修飾乙?;鞍?,揭示其調(diào)控機(jī)制,為疾病治療和藥物研發(fā)提供支持。
3、基因密碼子擴(kuò)展技術(shù)(gce)通過將非天然氨基酸(ncaas)引入蛋白質(zhì),極大地?cái)U(kuò)展了蛋白質(zhì)研究的可能性。gce的核心在于開發(fā)了與細(xì)胞自然翻譯機(jī)制不同的aars/trna對(duì),這些酶能精確識(shí)別并結(jié)合ncaas。在前期研究中,科學(xué)家們通過使用基于巴氏甲烷八疊球菌(methanosarcinamazei)來源的乙酰化賴氨酰trna合成酶kacrs/trna對(duì),將化學(xué)合成的kac定點(diǎn)插入至目標(biāo)蛋白,獲得乙?;揎椫亟M蛋白。盡管以上方法從外源添加了高達(dá)5-20mm的kac,但是乙?;亟M蛋白產(chǎn)量通常較低,且技術(shù)過程相對(duì)復(fù)雜、表達(dá)成本高昂。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路
1、發(fā)明目的:針對(duì)現(xiàn)有乙?;爰夹g(shù)存在的效率問題和成本問題,本發(fā)明提供了一種在細(xì)胞中生物合成和定點(diǎn)插入乙?;嚢彼岬南到y(tǒng)和應(yīng)用,利用該系統(tǒng)可以實(shí)現(xiàn)“一鍋法”蛋白質(zhì)定點(diǎn)乙?;揎棽呗裕撓到y(tǒng)能夠在大腸桿菌或者哺乳動(dòng)物細(xì)胞中實(shí)現(xiàn)乙?;嚢彼?kac)的生物合成和定點(diǎn)插入,并提供了該的系統(tǒng)的具體應(yīng)用方法。
2、技術(shù)方案:為達(dá)到上述目的,本發(fā)明采取以下技術(shù)方案:
3、第一方面,本發(fā)明提供了一種在細(xì)胞中生物合成和定點(diǎn)插入乙?;嚢彼岬南到y(tǒng),所述系統(tǒng)包括一種編碼乙?;嚢滨?trna合成酶的基因,以及編碼氨基酸序列如seqid?no:1-10任意一種所示乙?;嚢彼岷铣擅傅幕颉?/p>
4、作為具體實(shí)施方案,所述細(xì)為原核細(xì)胞或哺乳動(dòng)物細(xì)胞;優(yōu)選的,所述細(xì)胞為大腸桿菌細(xì)胞或人體細(xì)胞。
5、作為具體實(shí)施方案,所述乙?;嚢滨?trna合成酶的氨基酸序列如seq?id?no:11所示。所述乙?;嚢滨?trna合成酶是基于巴氏甲烷八疊球菌(methanosarcinamazei)來源的乙酰化賴氨酰trna合成酶kacrs。
6、作為具體實(shí)施方案,所述系統(tǒng)還包括與所述編碼乙酰化賴氨酰-trna合成酶的基因配對(duì)的trna,其核苷酸序列如seq?id?no:12所示。
7、第二方面,本發(fā)明提供了所述的系統(tǒng)在細(xì)胞中生物合成和定點(diǎn)插入乙酰化賴氨酸的應(yīng)用。
8、作為具體實(shí)施方案,所述細(xì)胞為原核細(xì)胞或哺乳動(dòng)物細(xì)胞;優(yōu)選的,所述細(xì)胞為大腸桿菌細(xì)胞或人體細(xì)胞;更優(yōu)選的,所述細(xì)胞為大腸桿菌bl21(de3)或者bl21-ai,或者為人胚腎細(xì)胞hek293t。
9、作為具體實(shí)施方案,所述應(yīng)用包括:將包含編碼乙酰化賴氨酰-trna合成酶基因的重組質(zhì)粒和包含乙酰化賴氨酸合成酶基因的重組質(zhì)粒與目標(biāo)蛋白質(zhì)粒共轉(zhuǎn)化或轉(zhuǎn)染至細(xì)胞中進(jìn)行培養(yǎng),或者將包含編碼乙酰化賴氨酰-trna合成酶基因和乙?;嚢彼岷铣擅富虻闹亟M質(zhì)粒與目標(biāo)蛋白質(zhì)粒共轉(zhuǎn)化或轉(zhuǎn)染至細(xì)胞中進(jìn)行培養(yǎng),得到含乙?;嚢彼岬哪繕?biāo)蛋白;優(yōu)選的,所述目標(biāo)蛋白為sfgfp。
10、第三方面,本發(fā)明提供了一種在細(xì)胞中生物合成和定點(diǎn)插入乙?;嚢彼岬姆椒?,所述方法包括將包含編碼乙?;嚢滨?trna合成酶基因的重組質(zhì)粒和包含編碼氨基酸序列如seq?id?no:1-10任意一種所示乙酰化賴氨酸合成酶基因的重組質(zhì)粒與目標(biāo)蛋白質(zhì)粒共轉(zhuǎn)化或轉(zhuǎn)染至細(xì)胞中進(jìn)行培養(yǎng),或者將包含編碼乙酰化賴氨酰-trna合成酶基因和編碼氨基酸序列如seq?id?no:1-10任意一種所示乙?;嚢彼岷铣擅富虻闹亟M質(zhì)粒與目標(biāo)蛋白質(zhì)粒共轉(zhuǎn)化或轉(zhuǎn)染至細(xì)胞中進(jìn)行培養(yǎng),得到含乙酰化賴氨酸的目標(biāo)蛋白。
11、第四方面,本發(fā)明提供了一種乙?;嚢彼岷铣擅?,所述乙酰化賴氨酸合成酶的氨基酸序列如seq?id?no:1-10任意一種所示。
12、第五方面,本發(fā)明提供了上述乙?;嚢彼岷铣擅傅幕?。
13、第六方面,本發(fā)明提供了所述的乙酰化賴氨酸合成酶,所述的基因在細(xì)胞中生物合成和定點(diǎn)插入乙酰化賴氨酸的應(yīng)用。
14、與現(xiàn)有技術(shù)中需要外源添加kac相比,利用本發(fā)明提供的系統(tǒng),則省去了這一步驟,并顯著提高了乙酰化重組蛋白產(chǎn)量。以nmgnat為例,在相同的培養(yǎng)條件和時(shí)間下,通過nmgnat生物合成kac和定點(diǎn)插入sfgfp時(shí),sfgfp149kac的蛋白產(chǎn)量高達(dá)2.58mg/l,接近野生型sfgfp蛋白的產(chǎn)量3.45mg/l;而外源性添加5mm?kac,sfgfp149kac的蛋白產(chǎn)量?jī)H為0.564mg/l,遠(yuǎn)低于生物合成組。因此,本發(fā)明不僅豐富了乙?;嚢彼岷铣擅傅姆N類,還創(chuàng)新性地提出了一種無需外源添加kac、直接在大腸桿菌和哺乳動(dòng)物細(xì)胞中高效合成并定點(diǎn)插入kac的系統(tǒng)和方法,具有重要的科研價(jià)值和應(yīng)用前景。
15、有益效果:與傳統(tǒng)的乙?;揎椫亟M蛋白表達(dá)技術(shù)相比,本發(fā)明顯著改進(jìn)了方法,不再需要將化學(xué)合成的kac外源性添加到培養(yǎng)基中。相反,本發(fā)明利用前述10種乙?;嚢彼岷铣擅负鸵阴;嚢滨rna合成酶kacrs/trna對(duì),通過創(chuàng)新的“一鍋法”,直接在活細(xì)胞中將生物合成的kac位點(diǎn)特異性地?fù)饺肽繕?biāo)蛋白質(zhì)中。這種方法不僅省去了kac的化學(xué)合成和提純步驟,還極大地提升了重組蛋白乙?;揎椀男屎吞禺愋?。在大腸桿菌和哺乳動(dòng)物細(xì)胞系統(tǒng)的應(yīng)用中,nmgnat均展現(xiàn)出最高的kac生物合成效率,凸顯了其在蛋白質(zhì)乙酰化研究領(lǐng)域的潛在應(yīng)用價(jià)值。
1.一種在細(xì)胞中生物合成和定點(diǎn)插入乙?;嚢彼岬南到y(tǒng),其特征在于,所述系統(tǒng)包括一種編碼乙?;嚢滨?trna合成酶的基因,以及編碼氨基酸序列如seq?id?no:1-10任意一種所示乙?;嚢彼岷铣擅傅幕?。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的在細(xì)胞中生物合成和定點(diǎn)插入乙酰化賴氨酸的系統(tǒng),其特征在于,所述細(xì)為原核細(xì)胞或哺乳動(dòng)物細(xì)胞;優(yōu)選的,所述細(xì)胞為大腸桿菌細(xì)胞或人體細(xì)胞。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的在細(xì)胞中生物合成和定點(diǎn)插入乙酰化賴氨酸的系統(tǒng),其特征在于,所述乙?;嚢滨?trna合成酶的氨基酸序列如seq?id?no:11所示;所述系統(tǒng)還包括與所述編碼乙酰化賴氨酰-trna合成酶的基因配對(duì)的trna,其核苷酸序列如seq?id?no:12所示。
4.權(quán)利要求1-3任一項(xiàng)所述的系統(tǒng)在細(xì)胞中生物合成和定點(diǎn)插入乙?;嚢彼岬膽?yīng)用。
5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的應(yīng)用,其特征在于,所述細(xì)胞為原核細(xì)胞或哺乳動(dòng)物細(xì)胞;優(yōu)選的,所述細(xì)胞為大腸桿菌細(xì)胞或人體細(xì)胞;更優(yōu)選的,所述細(xì)胞為大腸桿菌bl21(de3)或者bl21-ai,或者為人胚腎細(xì)胞hek293t。
6.根據(jù)權(quán)利要求4所述的應(yīng)用,其特征在于,所述應(yīng)用包括:將包含編碼乙?;嚢滨?trna合成酶基因的重組質(zhì)粒和包含乙?;嚢彼岷铣擅富虻闹亟M質(zhì)粒與目標(biāo)蛋白質(zhì)粒共轉(zhuǎn)化或轉(zhuǎn)染至細(xì)胞中進(jìn)行培養(yǎng),或者將包含編碼乙?;嚢滨?trna合成酶基因和乙酰化賴氨酸合成酶基因的重組質(zhì)粒與目標(biāo)蛋白質(zhì)粒共轉(zhuǎn)化或轉(zhuǎn)染至細(xì)胞中進(jìn)行培養(yǎng),得到含乙?;嚢彼岬哪繕?biāo)蛋白;優(yōu)選的,所述目標(biāo)蛋白為sfgfp。
7.一種在細(xì)胞中生物合成和定點(diǎn)插入乙?;嚢彼岬姆椒ǎ涮卣髟谟?,所述方法包括將包含編碼乙?;嚢滨?trna合成酶基因的重組質(zhì)粒和包含編碼氨基酸序列如seq?idno:1-10任意一種所示乙?;嚢彼岷铣擅富虻闹亟M質(zhì)粒與目標(biāo)蛋白質(zhì)粒共轉(zhuǎn)化或轉(zhuǎn)染至細(xì)胞中進(jìn)行培養(yǎng),或者將包含編碼乙?;嚢滨?trna合成酶基因和編碼氨基酸序列如seq?id?no:1-10任意一種所示乙?;嚢彼岷铣擅富虻闹亟M質(zhì)粒與目標(biāo)蛋白質(zhì)粒共轉(zhuǎn)化或轉(zhuǎn)染至細(xì)胞中進(jìn)行培養(yǎng),得到含乙酰化賴氨酸的目標(biāo)蛋白。
8.一種乙?;嚢彼岷铣擅?,其特征在于,所述乙?;嚢彼岷铣擅傅陌被嵝蛄腥鐂eq?id?no:1-10任意一種所示。
9.編碼權(quán)利要求8所述乙?;嚢彼岷铣擅傅幕?。
10.權(quán)利要求8所述的乙酰化賴氨酸合成酶,權(quán)利要求9所述的基因在細(xì)胞中生物合成和定點(diǎn)插入乙?;嚢彼岬膽?yīng)用。