本發(fā)明涉及豬育種改良，尤其涉及一種基于abhd4基因的評估大白豬背膘及眼肌面積的方法。

背景技術(shù)：

1、繁殖性狀、肉質(zhì)性狀、胴體性狀以及生長性狀是豬的主要經(jīng)濟性狀，這些主要經(jīng)濟性狀的遺傳改良直接關(guān)系生豬的養(yǎng)殖成本及養(yǎng)殖效率。生長性狀及酮體性狀一直是遺傳改良的重點，豬生長的性狀通常用生長速度、飼料轉(zhuǎn)化率、日采食量、100kg背膘厚度等來表示，這些性狀的遺傳系數(shù)中等，是可以通過遺傳選擇來改善的。胴體性狀以胴體重、屠宰率、胴體長度、胴體瘦肉率、脂肪率等表示，這些性狀大多是高度遺傳性狀。在漫長的育種改良過程中，傳統(tǒng)的育種方式弊端逐漸顯現(xiàn)，例如一些遺傳力較低的性狀，依據(jù)傳統(tǒng)的育種方式進行改良的收效甚微。隨著現(xiàn)代生物技術(shù)的發(fā)展，新的遺傳育種改良方式開始出現(xiàn)。

2、利用現(xiàn)代生物技術(shù)進行分子輔助標(biāo)記選擇是目前常用的育種方法，而有效的分子標(biāo)記是分子育種的前提和保障。對目的性狀功能基因snp分子遺傳標(biāo)記的檢測，能提高育種過程中基因組選擇的準(zhǔn)確性。因此，通過鑒定豬重要經(jīng)濟性狀功能基因可為后續(xù)豬育種實際工作提供更多理論依據(jù)。

3、現(xiàn)階段，豬的全基因組關(guān)聯(lián)分析(gwas)、高通量測序等實施以來，檢測到的候選基因和功能位點很多，但是可以應(yīng)用的、真正有效應(yīng)的主效基因和關(guān)鍵致因突變并不多。

技術(shù)實現(xiàn)思路

1、為解決背景技術(shù)中所提出的技術(shù)問題，本發(fā)明提供一種評估大白豬背膘及眼肌面積的方法。

2、本發(fā)明采用以下技術(shù)方案實現(xiàn)：一種基于abhd4基因的評估大白豬背膘及眼肌面積的方法，確定所述大白豬的snp分子標(biāo)記，判讀所述snp分子標(biāo)記是否為如下snp分子標(biāo)記中的一種，具體為：

3、位于abhd4基因第9外顯子區(qū)的g.76405883a>g位點；

4、位于abhd4基因第9外顯子區(qū)的g.76405942t>c位點；

5、位于abhd4基因第9外顯子區(qū)的g.76405956g>a位點；

6、位于abhd4基因第9外顯子區(qū)的g.76406109a>g位點；

7、位于abhd4基因下游調(diào)控區(qū)的g.76432041c>t位點；

8、具體地，位于abhd4基因第9外顯子區(qū)的g.76405942t>c位點，所述大白豬的背膘從大到小，對應(yīng)的基因型排序依次為：tt基因型、cc基因型、tc基因型；所述大白豬的眼肌面積從大到小，對應(yīng)的基因型排序依次為：tt基因型、tc基因型、cc基因型。

9、具體地，所述位于abhd4基因第9外顯子區(qū)的g.76405956g>a位點，所述大白豬的背膘從大到小，對應(yīng)的基因型排序依次為：gg基因型、ag基因型、aa基因型；所述大白豬的眼肌面積從大到小，對應(yīng)的基因型排序依次為：gg基因型、ag基因型、aa基因型。

10、具體地，位于abhd4基因第9外顯子區(qū)的g.76406109a>g位點，所述大白豬的背膘從大到小，對應(yīng)的基因型排序依次為：aa基因型、ga基因型、gg基因型；所述大白豬的眼肌面積從大到小，對應(yīng)的基因型排序依次為：aa基因型、ga基因型、gg基因型

11、具體地，位于abhd4基因下游調(diào)控區(qū)的g.76432041c>t位點，所述大白豬的背膘從大到小，對應(yīng)的基因型排序依次為：cc基因型、ct基因型、tt基因型；所述大白豬的眼肌面積從大到小，對應(yīng)的基因型排序依次為：cc基因型、ct基因型、tt基因型。

12、一種引物對組合，用于檢測大白豬的snp分子標(biāo)記，其中:

13、檢測位于abhd4基因第9外顯子區(qū)的g.76405883a>g位點，其正向引物的核苷酸序列為序列表seq?id?no.1所示，其反向引物的核苷酸序列為序列表seq?id?no.2所示；

14、檢測位于abhd4基因第9外顯子區(qū)的g.76405942t>c位點，其正向引物的核苷酸序列為序列表seq?id?no.3所示，其反向引物的核苷酸序列為序列表seq?id?no.4所示；

15、檢測位于abhd4基因第9外顯子區(qū)的g.76405956g>a位點，其正向引物的核苷酸序列為序列表seq?id?no.5所示，其反向引物的核苷酸序列為序列表seq?id?no.6所示；

16、檢測位于abhd4基因第9外顯子區(qū)的g.76406109a>g位點，其正向引物的核苷酸序列為序列表seq?id?no.7所示，其反向引物的核苷酸序列為序列表seq?id?no.8所示；

17、檢測位于abhd4基因下游調(diào)控區(qū)的g.76432041c>t位點，其正向引物的核苷酸序列為序列表seq?id?no.9所示，其反向引物的核苷酸序列為序列表seq?id?no.10所示。

18、一種試劑盒，其包含上述的引物對組合。

19、相比現(xiàn)有技術(shù)，本發(fā)明的有益效果在于：

20、本方案以大白豬以及長白豬為試驗群體，測定100kg體重日齡、100kg背膘厚、100kg眼肌面積三個性狀的表型，采集耳組織并提取基因組dna，針對abhd4基因全覆蓋外顯子區(qū)、基因上游及下游調(diào)控區(qū)2000-3000bp設(shè)計引物，通過混池測序，共檢測abhd4基因的5個snp位點。利用飛行時間質(zhì)譜方法對篩選出的5個snp位點進行基因分型，并對snp位點與三個性狀進行關(guān)聯(lián)分析以及基因型之間的兩兩比較。

21、本方案提出的評估方法以及用到的snp分子標(biāo)記為豬的生長性狀的育種、改良提供了良好的理論支撐和有效的指導(dǎo)意見。

技術(shù)特征：

1.一種基于abhd4基因的評估大白豬背膘及眼肌面積的方法，其特征在于，確定所述大白豬的snp分子標(biāo)記，判讀所述snp分子標(biāo)記是否為如下snp分子標(biāo)記中的一種，具體為：

2.如權(quán)利要求1所述的一種基于abhd4基因的評估大白豬背膘及眼肌面積的方法，其特征在于，位于abhd4基因第9外顯子區(qū)的g.76405942t>c位點，所述大白豬的背膘厚度從大到小，對應(yīng)的基因型排序依次為：tt基因型、cc基因型、tc基因型；所述大白豬的眼肌面積從大到小，對應(yīng)的基因型排序依次為：tt基因型、tc基因型、cc基因型。

3.如權(quán)利要求1所述的一種基于abhd4基因的評估大白豬背膘及眼肌面積的方法，其特征在于，所述位于abhd4基因第9外顯子區(qū)的g.76405956g>a位點，所述大白豬的背膘厚度從大到小，對應(yīng)的基因型排序依次為：gg基因型、ag基因型、aa基因型；所述大白豬的眼肌面積從大到小，對應(yīng)的基因型排序依次為：gg基因型、ag基因型、aa基因型。

4.如權(quán)利要求1所述的一種基于abhd4基因的評估大白豬背膘及眼肌面積的方法，其特征在于，位于abhd4基因第9外顯子區(qū)的g.76406109a>g位點，所述大白豬的背膘厚度從大到小，對應(yīng)的基因型排序依次為：aa基因型、ga基因型、gg基因型；所述大白豬的眼肌面積從大到小，對應(yīng)的基因型排序依次為：aa基因型、ga基因型、gg基因型。

5.如權(quán)利要求1所述的一種基于abhd4基因的評估大白豬背膘及眼肌面積的方法，其特征在于，位于abhd4基因下游調(diào)控區(qū)的g.76432041c>t位點，所述大白豬的背膘厚度從大到小，對應(yīng)的基因型排序依次為：cc基因型、ct基因型、tt基因型；所述大白豬的眼肌面積從大到小，對應(yīng)的基因型排序依次為：cc基因型、ct基因型、tt基因型。

6.一種引物對組合，其特征在于，用于檢測大白豬的snp分子標(biāo)記，其中:

7.一種試劑盒，其特征在于，其包含如權(quán)利要求6所述的引物對組合。

8.如權(quán)利要求6所述的引物對組合在如下任一項中的應(yīng)用：鑒定大白豬眼肌面積性狀、提高大白豬眼肌面積、鑒定大白豬背膘厚度性狀、提高大白豬背膘厚度性狀、大白豬遺傳育種。

技術(shù)總結(jié)
本發(fā)明涉及豬育種改良技術(shù)領(lǐng)域，尤其涉及一種基于ABHD4基因的評估大白豬背膘及眼肌面積的方法，確定所述大白豬的SNP分子標(biāo)記，判讀所述SNP分子標(biāo)記是否為如下SNP分子標(biāo)記中的一種，具體為：位于ABHD4基因第9外顯子區(qū)的g.76405883A>G位點；位于ABHD4基因第9外顯子區(qū)的g.76405942T>C位點；位于ABHD4基因第9外顯子區(qū)的g.76405956G>A位點；位于ABHD4基因第9外顯子區(qū)的g.76406109A>G位點；位于ABHD4基因下游調(diào)控區(qū)的g.76432041C>T位點。本方案提出的評估方法以及用到的SNP分子標(biāo)記為豬的生長性狀的育種、改良提供了良好的理論支撐和有效的指導(dǎo)意義。

技術(shù)研發(fā)人員：史麗莎,鄭先瑞,殷宗俊,張曉東,丁月云,馬淑雅,李文璽
受保護的技術(shù)使用者：安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)
技術(shù)研發(fā)日：
技術(shù)公布日：2024/12/10