本發(fā)明涉及生物化學(xué),尤其是涉及一種rna解旋酶抑制劑的篩選方法。
背景技術(shù):
1、rna解旋酶5是細(xì)胞核和細(xì)胞質(zhì)中的穿梭蛋白,屬于dead-box?rna解旋酶家族,具有atp依賴性的rna解旋活性。該蛋白在大多數(shù)組織和細(xì)胞中都有表達(dá),在調(diào)控正常生理功能方面發(fā)揮作用。rna解旋酶5參與了幾乎所有的rna代謝過程,包括mrna的選擇性剪接、micro?rnas和核糖體的生物發(fā)生、mrna的降解、與長鏈非編碼rna的相互作用以及轉(zhuǎn)錄活性的協(xié)同調(diào)節(jié)等。此外,rna解旋酶5的不同翻譯后修飾,如磷酸化、乙酰化、泛素化和sumo化,使其在腫瘤的發(fā)生和進(jìn)展中具有重要的調(diào)節(jié)功能。當(dāng)rna解旋酶5的表達(dá)或其翻譯后修飾失調(diào)時,正常的細(xì)胞信號網(wǎng)絡(luò)就會崩塌,導(dǎo)致多種病理狀態(tài)的發(fā)生,包括腫瘤的發(fā)生和發(fā)展。研究表明,rna解旋酶5在大部分腫瘤中具有高表達(dá),且其異常表達(dá)與腫瘤的發(fā)生發(fā)展、及患者預(yù)后不良密切相關(guān)。抑制rna解旋酶5的活性,能有效抑制腫瘤的生長。
2、rna解旋酶17屬于dead-box?rna解旋酶家族,具有atp依賴性的rna解旋活性,參與rna的加工和修飾,影響mrna的剪接和穩(wěn)定性,進(jìn)而調(diào)控基因表達(dá)。rna解旋酶17能夠調(diào)節(jié)原癌基因和抑癌基因的表達(dá),因此與細(xì)胞周期、凋亡和細(xì)胞增殖等過程密切相關(guān)。rna解旋酶17在多種癌癥中表達(dá)上調(diào),如乳腺癌、非小細(xì)胞肺癌、結(jié)直腸癌、肝細(xì)胞癌和前列腺癌等,其表達(dá)水平的增加可能促進(jìn)腫瘤的生長、遷移和侵襲。在腫瘤的發(fā)生和發(fā)展進(jìn)程中,rna解旋酶17能調(diào)控腫瘤相關(guān)基因的表達(dá),影響細(xì)胞周期控制、凋亡和dna損傷修復(fù)等。研究發(fā)現(xiàn),rna解旋酶17的高表達(dá)與腫瘤的不良預(yù)后相關(guān),因此,rna解旋酶17被認(rèn)為是癌癥治療的一個潛在靶點。
3、開發(fā)靶向rna解旋酶5或者rna解旋酶17活性的小分子抑制劑,有望成為一類新型的腫瘤靶向藥物。因此,開發(fā)一種易于實施的高通量篩選rna解旋酶抑制劑的檢測方法具有重要的臨床及市場價值。
4、有鑒于此,特提出本發(fā)明。
技術(shù)實現(xiàn)思路
1、本發(fā)明的目的在于提供一種rna解旋酶抑制劑的篩選方法,以解決上述技術(shù)問題。
2、為了實現(xiàn)以上目的,特采用以下技術(shù)方案:
3、第一方面,本發(fā)明提供了一種rna解旋酶抑制劑的篩選方法,采用adp-glotm激酶檢測試劑盒進(jìn)行檢測,包括以下步驟:
4、a.將rna解旋酶溶液和待測樣品溶液混合,進(jìn)行孵育;
5、b.a步驟孵育結(jié)束后添加含有dsrna和三磷酸腺苷的底物溶液進(jìn)行反應(yīng);
6、c.b步驟反應(yīng)結(jié)束后添加adp?glo試劑終止反應(yīng),并消耗掉多余的atp;
7、d.c步驟結(jié)束后添加激酶檢測試劑,將adp轉(zhuǎn)化成atp,根據(jù)熒光強(qiáng)度判斷待測樣品對rna解旋酶的抑制活性。
8、作為進(jìn)一步技術(shù)方案,所述rna解旋酶包括rna解旋酶5或rna解旋酶17。
9、作為進(jìn)一步技術(shù)方案,所述rna解旋酶溶液中rna解旋酶的濃度為18-22nm;
10、所述rna解旋酶溶液為含有rna解旋酶的緩沖液;
11、所述緩沖液為含有4-6mm的三羥甲基氨基甲烷、1.8-2.2mm的二硫蘇糖醇和9-11mm的mgcl2的水溶液;
12、所述rna解旋酶溶液和待測樣品溶液等體積混合。
13、作為進(jìn)一步技術(shù)方案,所述待測樣品溶液的數(shù)量至少為1個,當(dāng)待測樣品溶液的數(shù)量大于1個時,各個待測樣品溶液的濃度不同。
14、作為進(jìn)一步技術(shù)方案,a步驟中,所述孵育的溫度為24-28℃,時間為18-22min。
15、作為進(jìn)一步技術(shù)方案,所述底物溶液中,dsrna的濃度為250-350nm,三磷酸腺苷的濃度為250-350μm;
16、所述底物溶液為水相溶液,還包括4-6mm的三羥甲基氨基甲烷、1.8-2.2mm的二硫蘇糖醇和9-11mm的mgcl2;
17、a步驟孵育后的溶液與底物溶液等體積混合。
18、作為進(jìn)一步技術(shù)方案,b步驟中,所述反應(yīng)的ph為7-8,溫度為24-28℃,時間為110-130min。
19、作為進(jìn)一步技術(shù)方案,所述rna解旋酶溶液與adpglo試劑的體積比為1:2;
20、添加adp?glo試劑50-70min后再進(jìn)行d步驟。
21、作為進(jìn)一步技術(shù)方案,所述rna解旋酶溶液與激酶檢測試劑的體積比為1:4;
22、添加激酶檢測試劑50-70min后,檢測熒光強(qiáng)度。
23、作為進(jìn)一步技術(shù)方案,d步驟中,根據(jù)不同濃度待測樣品的熒光強(qiáng)度獲得待測樣本的半抑制濃度,然后判斷待測樣品對rna解旋酶的抑制活性。
24、與現(xiàn)有技術(shù)相比,本發(fā)明具有以下有益效果:
25、本發(fā)明提供的rna解旋酶抑制劑的篩選方法,穩(wěn)定可靠,靈敏度高,兼具高通量和普適性,能夠用于包括rna解旋酶5抑制劑和rna解旋酶17抑制劑的篩選相關(guān)酶促動力學(xué)的研究。
1.一種rna解旋酶抑制劑的篩選方法,其特征在于,采用adp-glotm激酶檢測試劑盒進(jìn)行檢測,包括以下步驟:
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的篩選方法,其特征在于,所述rna解旋酶包括rna解旋酶5或rna解旋酶17。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的篩選方法,其特征在于,所述rna解旋酶溶液中rna解旋酶的濃度為18-22nm;
4.根據(jù)權(quán)利要求1所述的篩選方法,其特征在于,所述待測樣品溶液的數(shù)量至少為1個,當(dāng)待測樣品溶液的數(shù)量大于1個時,各個待測樣品溶液的濃度不同。
5.根據(jù)權(quán)利要求1所述的篩選方法,其特征在于,a步驟中,所述孵育的溫度為24-28℃,時間為18-22min。
6.根據(jù)權(quán)利要求1所述的篩選方法,其特征在于,所述底物溶液中,dsrna的濃度為250-350nm,三磷酸腺苷的濃度為250-350μm;
7.根據(jù)權(quán)利要求1所述的篩選方法,其特征在于,b步驟中,所述反應(yīng)的ph為7-8,溫度為24-28℃,時間為110-130min。
8.根據(jù)權(quán)利要求1所述的篩選方法,其特征在于,所述rna解旋酶溶液與adpglo試劑的體積比為1:2;
9.根據(jù)權(quán)利要求1所述的篩選方法,其特征在于,所述rna解旋酶溶液與激酶檢測試劑的體積比為1:4;
10.根據(jù)權(quán)利要求1所述的篩選方法,其特征在于,d步驟中,根據(jù)不同濃度待測樣品的熒光強(qiáng)度獲得待測樣本的半抑制濃度,然后判斷待測樣品對rna解旋酶的抑制活性。