本發(fā)明涉及生物診斷,具體涉及一種凍干型黃顙魚杯狀病毒的熒光定量pcr技術(shù)檢測試劑盒。
背景技術(shù):
1、黃顙魚杯狀病毒(yellow?catfish?calicivirus,?yccv)全基因組長為7432bp,分類于小rna病毒目中的杯狀病毒科caliciviridae,是一種近年來新發(fā)現(xiàn)的黃顙魚病毒性疾病,病原為杯狀病毒,主要發(fā)生于春后。感染該病毒的黃顙魚會出現(xiàn)聚堆、趴邊、游水、頭朝上尾朝下、螺旋狀狂游等異常行為,以及下頜、鰓蓋和口腔基部出血,肝臟色淺,脾臟充血,腎臟腫大、壞死等病理變化,限制了魚類養(yǎng)殖業(yè)的發(fā)展,因此,黃顙魚杯狀病毒的檢測和鑒定對于疾病的預(yù)防和控制至關(guān)重要。
2、現(xiàn)有的黃顙魚杯狀病毒檢測方法主要包括傳統(tǒng)的病毒分離、血清學(xué)檢測和分子生物學(xué)檢測等。比如在中國專利cn202110574113.2中公開了以調(diào)控病毒復(fù)制的關(guān)鍵基因即病毒的非結(jié)構(gòu)蛋白(nonstructural?protein,ns),設(shè)計兩條引物對該病毒進行檢測,該專利利用的方法為常規(guī)pcr方法檢測,存在操作繁瑣、檢測限高且pcr后需要開蓋進行凝膠電泳進一步確定診斷結(jié)果,容易造成交叉污染?,F(xiàn)有的檢測方法存在操作復(fù)雜、檢測周期長、靈敏度和特異性不足等問題,難以滿足養(yǎng)殖業(yè)對快速、準(zhǔn)確檢測的需求,而且都是液態(tài)試劑,保存穩(wěn)定性差,應(yīng)用范圍有限。
3、基于此,亟需開發(fā)一種快速、靈敏、特異的黃顙魚杯狀病毒檢測試劑盒。
技術(shù)實現(xiàn)思路
1、針對現(xiàn)有技術(shù)的缺陷,本發(fā)明設(shè)計了一種凍干型黃顙魚杯狀病毒的熒光定量pcr技術(shù)檢測試劑盒,具有高靈敏度、高特異性、常溫穩(wěn)定、擺脫冷鏈、即時活化、不相容試劑共存、無交叉污染等優(yōu)點。
2、為了實現(xiàn)上述目的,本發(fā)明解決技術(shù)問題采用如下技術(shù)方案:
3、一方面,本發(fā)明提供了一種凍干型黃顙魚杯狀病毒的熒光定量pcr技術(shù)檢測試劑盒,所述試劑盒包括pcr?mix,陽性對照、陰性對照、復(fù)溶劑;
4、其中,所述pcr?mix為凍干試劑,包括50~500mm核苷酸序列如seq?id?no.1所示的上游引物、50~500nm核苷酸序列如seq?id?no.2所示的下游引物、25~250nm?核苷酸序列如seq?id?no.3所示的taqman熒光探針。
5、本發(fā)明制備的凍干劑型的pcr?mix在儲存運輸過程不需要進行冷鏈運輸,大大降低了試劑運輸?shù)某杀?,在運輸過程中不會出現(xiàn)試劑失效的風(fēng)險,且該凍干劑型的pcr試劑中含有尿嘧啶-dna糖基化酶防污染體系,并以dutp替代dttp作為pcr原料,在進行pcr擴增時,尿嘧啶-dna糖基化酶能消化pcr產(chǎn)物中含u的pcr產(chǎn)物,進而防止pcr產(chǎn)物氣溶膠污染,保證凍干劑型的pcr試劑檢測效果。
6、優(yōu)選地,所述pcr?mix還包括1u~10u?rnase抑制劑、體積比為1%~50%的甘油、10mm~200mm鉀離子、0.01~1mm?edta、20mm~80m且ph為7.5~8.9的tris-hcl、10mm~50mm含u的dntp、100mm~4m?kcl、1mm~50mm?mgcl2、體積比為0.01~0.3%的tween-20、體積比為0.01~0.1%的四氫噻吩1-氧化物、10mm~5m四甲基氯化銨、10mm~100mm甜菜堿、體積比為0.01~0.1%的dmso、體積比為0.01~0.3%的triton?x-100。
7、優(yōu)選地,所述pcr?mix還包括0.5~2u熱啟動taq酶、0.5~5u反轉(zhuǎn)錄酶、0.1u~10u?udg酶。
8、優(yōu)選地,所述pcr?mix還包括體積比為30.3%的凍干保護劑。
9、優(yōu)選地,所述凍干保護劑包括海藻糖1~15%、蔗糖1~15%、甘露醇1~15%、聚乙二醇0.01~0.5%、2%~10%卵磷脂和2%~10%環(huán)糊精。
10、優(yōu)選地,所述復(fù)溶劑為nuclease-free?water。
11、另一方面,本發(fā)明還提供了一種非診斷目的檢測黃顙魚杯狀病毒的方法,其特征在于,采用所述的凍干型黃顙魚杯狀病毒的熒光定量pcr技術(shù)檢測試劑盒。
12、優(yōu)選地,所述方法包括以下步驟:
13、s1:提取樣本核酸;
14、s2:將20μl復(fù)溶劑加入pcr?mix中,再加入5μl步驟s1提取的核酸溶液,進行pcr擴增反應(yīng),反應(yīng)結(jié)束后對檢測結(jié)果進行判定。
15、優(yōu)選地,所述pcr擴增反應(yīng)條件為:50℃?1min;95℃?2min;95℃?10s,59℃?30s,40個循環(huán)。
16、優(yōu)選地,所述結(jié)果判定為:當(dāng)ct值<35,則結(jié)果為陽性;當(dāng)35≤ct<37擴增曲線呈s型,可疑樣本需復(fù)檢;復(fù)檢結(jié)果一致則判斷為陽性,否則為陰性;當(dāng)ct值≥37或無擴增曲線,結(jié)果為陰性。
17、與現(xiàn)有技術(shù)相比,本發(fā)明具有如下的有益效果:
18、本發(fā)明提供了一種凍干型黃顙魚杯狀病毒的熒光定量pcr技術(shù)檢測試劑盒,所述試劑盒中的pcr?mix為可凍干試劑,各組分與凍干保護劑相互配合,在具有高靈敏度、高特異性的同時,還能保證常溫下的穩(wěn)定,無需復(fù)雜的冷鏈物流,降低了運輸和儲存的成本與復(fù)雜性。其次,使用時只需加入適當(dāng)?shù)娜軇┘纯裳杆倩謴?fù)活性,簡化了實驗步驟。此外,凍干技術(shù)允許將多種不相容的試劑共同凍干,減少了交叉污染的風(fēng)險,解決了現(xiàn)有黃顙魚杯狀病毒檢測試劑保存穩(wěn)定差、對溫度敏感、實驗操作復(fù)雜,從而檢測結(jié)果不穩(wěn)定的問題。
19、本發(fā)明還提供了使用該試劑盒檢測黃顙魚杯狀病毒的方法,并優(yōu)化了pcr擴增條件,可以快速準(zhǔn)確檢測黃顙魚杯狀病毒,操作簡單,易于在偏遠地區(qū)等資源有限的環(huán)境中使用,而且減少了操作過程中可能出現(xiàn)的人為錯誤,提高了檢測結(jié)果的準(zhǔn)確性和可靠性。同時在緊急情況下,也有利于快速開展大規(guī)模的病毒篩查以及實現(xiàn)對黃顙魚杯狀病毒實時監(jiān)測,有利于魚類養(yǎng)殖業(yè)的健康發(fā)展,也為黃顙魚杯狀病毒檢測技術(shù)提供了新思路。
1.一種凍干型黃顙魚杯狀病毒的熒光定量pcr技術(shù)檢測試劑盒,其特征在于,所述試劑盒包括pcr?mix,陽性對照、陰性對照、復(fù)溶劑;
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的凍干型黃顙魚杯狀病毒的熒光定量pcr技術(shù)檢測試劑盒,其特征在于,所述pcr?mix還包括1u~10u?rnase抑制劑、體積比為1%~50%的甘油、10mm~200mm鉀離子、0.01~1mm?edta、20mm~80m且ph為7.5~8.9的tris-hcl、10mm~50mm含u的dntp、100mm~4m?kcl、1mm~50mm?mgcl2、體積比為0.01~0.3%的tween-20、體積比為0.01~0.1%的四氫噻吩1-氧化物、10mm~5m四甲基氯化銨、10mm~100mm甜菜堿、體積比為0.01~0.1%的dmso、體積比為0.01~0.3%的triton?x-100。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的凍干型黃顙魚杯狀病毒的熒光定量pcr技術(shù)檢測試劑盒,其特征在于,所述pcr?mix還包括0.5~2u熱啟動taq酶、0.5~5u反轉(zhuǎn)錄酶、0.1u~10u?udg酶。
4.根據(jù)權(quán)利要求1所述的凍干型黃顙魚杯狀病毒的熒光定量pcr技術(shù)檢測試劑盒,其特征在于,所述pcr?mix還包括體積比為30.3%的凍干保護劑。
5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的凍干型黃顙魚杯狀病毒的熒光定量pcr技術(shù)檢測試劑盒,其特征在于,所述凍干保護劑包括海藻糖1~15%、蔗糖1~15%、甘露醇1~15%、聚乙二醇0.01~0.5%、2%~10%卵磷脂和2%~10%環(huán)糊精。
6.根據(jù)權(quán)利要求1所述的凍干型黃顙魚杯狀病毒的熒光定量pcr技術(shù)檢測試劑盒,其特征在于,所述復(fù)溶劑為nuclease-free?water。
7.一種非診斷目的檢測黃顙魚杯狀病毒的方法,其特征在于,采用權(quán)利要求1~6任一項所述的凍干型黃顙魚杯狀病毒的熒光定量pcr技術(shù)檢測試劑盒。
8.根據(jù)權(quán)利要求7所述的方法,其特征在于,所述方法包括以下步驟:
9.根據(jù)權(quán)利要求8所述的方法,其特征在于,所述pcr擴增反應(yīng)條件為:50℃?1min;95℃2min;95℃?10s,59℃?30s,40個循環(huán)。
10.根據(jù)權(quán)利要求8所述的方法,其特征在于,所述結(jié)果判定為:當(dāng)ct值<35,則結(jié)果為陽性;當(dāng)35≤ct<37擴增曲線呈s型,可疑樣本需復(fù)檢;復(fù)檢結(jié)果一致則判斷為陽性,否則為陰性;當(dāng)ct值≥37或無擴增曲線,結(jié)果為陰性。