本發(fā)明屬于雞遺傳育種和生物，特別涉及一種影響雞脛圍的snp遺傳標(biāo)記在雞遺傳育種中的應(yīng)用。

背景技術(shù)：

1、脛圍是蛋雞選育常用指標(biāo)，既可用來評價(jià)骨骼發(fā)育，也可用來衡量體尺均勻度。骨是蛋殼鈣的主要供應(yīng)源。據(jù)muir等統(tǒng)計(jì)，一只商品蛋雞一生沉積在蛋殼中的鈣約等于其體重。輕型蛋雞，包括來航雞和綠殼蛋雞，臨近產(chǎn)蛋末期往往面臨骨質(zhì)疏松的困擾，主要原因在于結(jié)構(gòu)骨與髓質(zhì)骨失去動(dòng)態(tài)平衡，導(dǎo)致結(jié)構(gòu)骨喪失完整性。骨質(zhì)疏松危害蛋雞生產(chǎn)主要體現(xiàn)在三個(gè)方面：一是引起蛋雞骨折、麻痹甚至死亡；二是產(chǎn)蛋性能下降；三是骨折及長期病痛導(dǎo)致的動(dòng)物福利問題。為了減少骨質(zhì)疏松對輕型高產(chǎn)蛋雞的危害，需要改善蛋雞骨骼質(zhì)量，其中包括對脛圍的選擇。脛圍性狀由微效多基因調(diào)控，常規(guī)選育方法難以遺傳上獲取有效進(jìn)展，唯有厘清脛圍遺傳結(jié)構(gòu)，通過基因組選擇提高其選育準(zhǔn)確性，達(dá)到遺傳上提升脛圍尺寸的目的。

技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路

1、為了滿足蛋雞行業(yè)對減輕骨質(zhì)疏松危害的需要，選育脛圍性狀，本發(fā)明提供了一種影響雞脛圍的snp遺傳標(biāo)記在雞遺傳育種中的應(yīng)用，所述影響雞脛圍的snp遺傳標(biāo)記包括sc_tag4，該snp遺傳標(biāo)記有助于從遺傳上提高脛圍，將其應(yīng)用于雞的遺傳育種，有利于改善蛋雞脛圍、減少骨質(zhì)疏松發(fā)病頻率，從而獲得高品質(zhì)蛋雞品種。

2、本發(fā)明通過以下技術(shù)方案實(shí)現(xiàn)：

3、本發(fā)明提供一種影響雞脛圍的snp遺傳標(biāo)記在雞遺傳育種中的應(yīng)用，所述影響雞脛圍的snp遺傳標(biāo)記包括sc_tag4，所述sc_tag4對應(yīng)于ncbi中公布的雞參考基因組bgalgal1.mat.broiler.grcg7b版本序列信息4號染色體物理位置第75909527位，屬于基因ldb2第8內(nèi)含子序列，此處堿基為t或c。

4、基于同一發(fā)明構(gòu)思，本發(fā)明提供一種雞脛圍性狀的早期選擇方法，所述早期選擇方法包括基于snp遺傳標(biāo)記sc_tag4的基因型對雞脛圍性狀進(jìn)行早期選擇；

5、所述sc_tag4對應(yīng)于ncbi中公布的雞參考基因組bgalgal1.mat.broiler.grcg7b版本序列信息4號染色體物理位置第75909527位，屬于基因ldb2第8內(nèi)含子序列，此處堿基為t或c。

6、進(jìn)一步的，所述早期選擇方法具體包括：

7、檢測待測雞基因組中sc_tag4遺傳標(biāo)記的基因型；

8、基于所述sc_tag4的基因型對待測雞脛圍性狀進(jìn)行早期選擇；

9、其中，所述sc_tag4的tt基因型個(gè)體的脛圍大于cc以及ct基因型個(gè)體的脛圍。

10、進(jìn)一步的，所述檢測待測雞基因組中sc_tag4遺傳標(biāo)記的基因型，具體包括：

11、以pr_sc4f和pr_sc4r為引物，對待測雞的基因組dna進(jìn)行pcr擴(kuò)增；

12、對pcr擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行測序，獲得待測雞4號染色體正義鏈第75909527位的基因型；

13、其中，所述pr_sc4f的核苷酸序列如seq?id?no.1所示，所述pr_sc4r的核苷酸序列如seq?id?no.2所示。

14、優(yōu)選的，所述待測雞的品種包括東鄉(xiāng)綠殼蛋雞和/或白來航雞。

15、基于同一發(fā)明構(gòu)思，本發(fā)明提供用于檢測snp遺傳標(biāo)記sc_tag4的引物，所述sc_tag4對應(yīng)于ncbi中公布的雞參考基因組bgalgal1.mat.broiler.grcg7b版本序列信息4號染色體物理位置第75909527位，屬于基因ldb2第8內(nèi)含子序列，此處堿基為t或c；

16、所述引物包括pr_sc4f和pr_sc4r，所述pr_sc4f的核苷酸序列如seq?id?no.1所示，所述pr_sc4r的核苷酸序列如seq?id?no.2所示。

17、基于同一發(fā)明構(gòu)思，本發(fā)明提供用于檢測snp遺傳標(biāo)記sc_tag4的引物在雞遺傳育種中的應(yīng)用。

18、基于同一發(fā)明構(gòu)思，本發(fā)明提供用于檢測snp遺傳標(biāo)記sc_tag4的試劑盒，所述試劑盒包含上述用于檢測snp遺傳標(biāo)記sc_tag4的引物。

19、基于同一發(fā)明構(gòu)思，本發(fā)明提供用于檢測snp遺傳標(biāo)記sc_tag4的試劑盒在雞遺傳育種中的應(yīng)用。

20、基于同一發(fā)明構(gòu)思，本發(fā)明還提供snp遺傳標(biāo)記sc_tag4在預(yù)測雞40周齡脛圍中的應(yīng)用，所述sc_tag4對應(yīng)于ncbi中公布的雞參考基因組bgalgal1.mat.broiler.grcg7b版本序列信息4號染色體物理位置第75909527位，屬于基因ldb2第8內(nèi)含子序列，此處堿基為t或c。

21、本發(fā)明實(shí)施例中的一個(gè)或多個(gè)技術(shù)方案，至少具有如下技術(shù)效果或優(yōu)點(diǎn)：

22、本發(fā)明一種影響雞脛圍的snp遺傳標(biāo)記在雞遺傳育種中的應(yīng)用，所述影響雞脛圍的snp遺傳標(biāo)記包括sc_tag4，sc_tag4的有益基因型(tt)個(gè)體的脛圍更高，將其應(yīng)用于雞的遺傳育種，有助于從遺傳上提高蛋雞40周齡脛圍，進(jìn)而獲得腿部更強(qiáng)壯、體尺均勻度更好的蛋雞，有利于減少骨質(zhì)疏松發(fā)病頻率，從而獲得高品質(zhì)蛋雞品種。

技術(shù)特征：

1.一種影響雞脛圍的snp遺傳標(biāo)記在雞遺傳育種中的應(yīng)用，其特征在于，所述影響雞脛圍的snp遺傳標(biāo)記包括sc_tag4，所述sc_tag4對應(yīng)于ncbi中公布的雞參考基因組bgalgal1.mat.broiler.grcg7b版本序列信息4號染色體物理位置第75909527位，屬于基因ldb2第8內(nèi)含子序列，此處堿基為t或c。

2.一種雞脛圍性狀的早期選擇方法，其特征在于，所述早期選擇方法包括基于snp遺傳標(biāo)記sc_tag4的基因型對雞脛圍性狀進(jìn)行早期選擇；

3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的一種雞脛圍性狀的早期選擇方法，其特征在于，所述早期選擇方法具體包括：

4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的一種雞脛圍性狀的早期選擇方法，其特征在于，所述檢測待測雞基因組中sc_tag4遺傳標(biāo)記的基因型，具體包括：

5.根據(jù)權(quán)利要求3或4所述的一種雞脛圍性狀的早期選擇方法，其特征在于，所述待測雞的品種包括東鄉(xiāng)綠殼蛋雞和/或白來航雞。

6.用于檢測snp遺傳標(biāo)記sc_tag4的引物，其特征在于，所述sc_tag4對應(yīng)于ncbi中公布的雞參考基因組bgalgal?1.mat.broiler.grcg7b版本序列信息4號染色體物理位置第75909527位，屬于基因ldb2第8內(nèi)含子序列，此處堿基為t或c；

7.如權(quán)利要求6所述的用于檢測snp遺傳標(biāo)記sc_tag4的引物在雞遺傳育種中的應(yīng)用。

8.用于檢測snp遺傳標(biāo)記sc_tag4的試劑盒，其特征在于，所述試劑盒包含權(quán)利要求6所述的用于檢測snp遺傳標(biāo)記sc_tag4的引物。

9.如權(quán)利要求8所述的用于檢測snp遺傳標(biāo)記sc_tag4的試劑盒在雞遺傳育種中的應(yīng)用。

10.snp遺傳標(biāo)記sc_tag4在預(yù)測雞40周齡脛圍中的應(yīng)用，其特征在于，所述sc_tag4對應(yīng)于ncbi中公布的雞參考基因組bgalgal?1.mat.broiler.grcg7b版本序列信息4號染色體物理位置第75909527位，屬于基因ldb2第8內(nèi)含子序列，此處堿基為t或c。

技術(shù)總結(jié)
本發(fā)明提供一種影響雞脛圍的SNP遺傳標(biāo)記在雞遺傳育種中的應(yīng)用，屬于雞遺傳育種和生物技術(shù)領(lǐng)域，所述影響雞脛圍的SNP遺傳標(biāo)記包括SC_tag4，所述SC_tag4對應(yīng)于NCBI中公布的雞參考基因組bGa?lGa?l?1.mat.broi?ler.GRCg7b版本序列信息4號染色體物理位置第75909527位，屬于基因LDB2第8內(nèi)含子序列，此處堿基為T或C。該SNP遺傳標(biāo)記有助于從遺傳上提高脛圍，將其應(yīng)用于雞的遺傳育種，有利于改善蛋雞脛圍、減少骨質(zhì)疏松發(fā)病頻率，從而獲得高品質(zhì)蛋雞品種。

技術(shù)研發(fā)人員：曲亮,郭軍,竇套存,王星果,李永峰,胡玉萍,邵丹,郭偉,盧建,馬猛,王強(qiáng),童海兵
受保護(hù)的技術(shù)使用者：江蘇省家禽科學(xué)研究所
技術(shù)研發(fā)日：
技術(shù)公布日：2024/12/10