本發(fā)明屬于動物分子育種，涉及與湖羊產羔數(shù)性狀相關的snp標記在湖羊育種中的應用。

背景技術：

1、產羔數(shù)是衡量綿羊繁殖能力的關鍵指標，對綿羊養(yǎng)殖的經濟效益有直接的影響。湖羊是中國地方優(yōu)良綿羊品種，以其高繁殖率和強適應性而聞名。在高原環(huán)境下，低氧環(huán)境影響母羊的生理狀態(tài)，特別是在妊娠期，母羊需要更高的氧氣供應來維持自身及多個胎兒的正常發(fā)育。因此在高原環(huán)境下的氧氣供應不足可能降低湖羊的產羔數(shù)，這對維持和提升湖羊的繁殖性能提出了新的挑戰(zhàn)和需求。

2、epas1，也稱為低氧誘導因子2α(hif-2α)，是低氧誘導因子家族中的重要成員，該蛋白是一種氧依賴性轉錄因子，能夠感知并響應細胞內氧氣濃度的變化。在正常氧氣水平下，hif-2α蛋白通過脯氨酸羥化酶(phds)調控，被泛素化降解；而在低氧條件下，hif-2α則處于穩(wěn)定狀態(tài)，進入細胞核，與hif-1β結合，激活多個低氧應答相關基因的表達。epas1在紅細胞生成、鐵代謝和血管生成等生理過程中起著關鍵作用，在高海拔環(huán)境下，空氣中氧氣水平降低，該蛋白可增強血氧水平并改善氧氣輸送效率，幫助機體適應低氧環(huán)境。

3、在綿羊生產中，第一胎的產羔數(shù)，直接影響?zhàn)B殖者的早期收益。本發(fā)明發(fā)現(xiàn)epas1基因中與湖羊第一胎產羔數(shù)相關的snp標記，說明epas1基因參與湖羊在低氧環(huán)境條件下繁殖，也為湖羊產羔數(shù)的標記輔助選擇提供遺傳標記資源。

技術實現(xiàn)思路

1、本發(fā)明為解決現(xiàn)有選育綿羊產羔數(shù)所存在的技術問題提供一種方法。

2、根據本發(fā)明的實施例，所述snp標記位于seq?id?no：1所示核苷酸序列的第320位堿基處，該snp標記位點的tc和cc基因型湖羊個體的第一胎產羔數(shù)均顯著高于tt基因型個體。通過檢測湖羊的上述snp標記，能夠有效地預測其第一胎產羔數(shù)，從而能夠根據該snp標記位點的基因型評估湖羊個體第一胎的產羔性能。因此，本發(fā)明的snp標記與湖羊的第一胎產羔數(shù)量性狀有密切關聯(lián)，能夠有效應用于湖羊的分子標記輔助育種，進而根據實際育種需求對綿羊育種素材進行選擇，從而準確、高效地篩選出多羔優(yōu)良個體，提高育種選擇的效率和準確性。

3、本發(fā)明提供一種用于檢測權利要求1所述snp標記的引物對。根據本發(fā)明的實施例，所述引物對為具有序列表中seq?id?no：2和seq?id?no：3所示的核苷酸序列，用于檢測所述snp標記。

4、根據本發(fā)明的實施例，本發(fā)明提供了一種預測綿羊第一胎高產羔數(shù)的方法，利用本發(fā)明的引物對、擴增程序和擴增體系能夠有效地擴增待測湖羊的上述與第一胎產羔數(shù)性狀相關的snp標記所在片段，通過測序能夠有效實現(xiàn)對這種snp標記的檢測，確定待測湖羊該snp標記位點的基因型，進而能夠有效預測待測湖羊第一胎產羔數(shù)。具體地，該snp標記位點的tc和cc基因型可以作為判斷湖綿羊第一胎產羔數(shù)多少的重要標準。在湖羊選育工作中可以通過保留該snp標記位點基因型cc基因型的綿羊用于繁育，也可用tc基因型個體與cc基因型個體配種以取得更多的cc型后代個體，淘汰該snp標記位點基因型為tt的綿羊。由此，本發(fā)明能夠有效應用于湖羊的分子標記輔助選擇育種，從而以低成本和高準確性篩選出第一胎產羔數(shù)多的湖羊個體。

5、本發(fā)明具有以下有益效果：(1)本發(fā)明提供的snp標記與湖羊的第一胎產羔數(shù)顯著相關，tc和cc基因型綿羊的第一胎產羔數(shù)均顯著高于tt基因型。(2)通過識別上述特定snp標記，可以在早期階段篩選出高產潛力的個體，能夠顯著縮短育種周期，加快綿羊第一胎產羔數(shù)的選育進程，提高選種的精準度和效率。(3)本發(fā)明提供的檢測方法操作簡便，利用pcr擴增和常規(guī)測序技術即可準確檢測目標snp位點的基因型。此方法不僅成本低廉，而且適用于大規(guī)模篩選和應用，具有良好的推廣應用前景。

技術特征：

1.一種根據與綿羊產羔數(shù)性狀相關分子標記選擇綿羊的方法，所述分子標記位于核苷酸序列seq?id?no：1，其中該序列第320bp位點的tc和cc基因型綿羊個體的第一胎產羔數(shù)顯著高于tt基因型個體；其方法包括以下步驟：

2.權利要求1所述snp標記在篩選具有第一胎高產羔數(shù)湖羊中的應用，選擇所述分子標記的cc基因型綿羊個體留種。

技術總結
本發(fā)明公開EPAS1基因中一個影響綿羊產羔數(shù)SNP標記的應用。該標記位于綿羊3號染色體的EPAS1基因，具體的SNP標記位點為序列表中SEQ?ID?NO：1的第320bp處的C/T堿基突變，該位點TC和CC基因型綿羊第一胎產羔數(shù)顯著高于TT基因型個體，CC為湖羊的優(yōu)勢基因型。本發(fā)明以湖羊為研究對象，利用PCR擴增綿羊EPAS1基因第13內含子的SNP變異，分析該變異位點特定基因型對湖羊產羔數(shù)的影響，并據此進行湖羊個體的留種，可用于提高湖羊第一胎產羔數(shù)，為綿羊產羔數(shù)性狀的標記輔助選擇育種提供標記資源。

技術研發(fā)人員：姜勛平,劉桂瓊,廖晨昱,唐粒菁
受保護的技術使用者：華中農業(yè)大學
技術研發(fā)日：
技術公布日：2024/12/17