本發(fā)明涉及生物，特別是涉及一種鑒別高棉籽油含量陸地棉品種的生物標(biāo)志物及其應(yīng)用。

背景技術(shù)：

1、棉花作為最重要的油料作物之一，其包含的棉籽油占整個種子重量的約20％，是棉花中僅次于纖維的第二大有價值的組分，表明棉籽油是一種具有發(fā)展?jié)摿Φ闹匾r(nóng)產(chǎn)品。

2、棉花在我國廣泛種植，棉籽油作為棉花的副產(chǎn)品，相比于其他油料作物，棉籽油富含豐富的亞油酸，對于治療心血管疾病具有重要的作用；此外棉籽油也是一種優(yōu)秀的煎炸食品用油和生物柴油的原材料。

3、目前棉花研究以纖維品質(zhì)和產(chǎn)量為主，對棉籽油的重視程度不足，這可能是導(dǎo)致棉籽油產(chǎn)量呈現(xiàn)波動趨勢的主要原因。因此加速高油棉花品種的選育，有利于提高我國油料自給率，保障我國油料安全，突破種業(yè)“卡脖子”難題。

技術(shù)實現(xiàn)思路

1、本發(fā)明的目的是提供一種鑒別高棉籽油含量陸地棉品種的生物標(biāo)志物及其應(yīng)用，以解決上述現(xiàn)有技術(shù)存在的問題。采用本發(fā)明提供的生物標(biāo)志物可以有效鑒別高棉籽油含量陸地棉品種，本發(fā)明為推動棉籽油的遺傳育種，加快培育棉花高油品種提供了遺傳機制基礎(chǔ)，對進一步提高棉籽利用價值具有深遠的意義。

2、為實現(xiàn)上述目的，本發(fā)明提供了如下方案：

3、本發(fā)明提供一種鑒別高棉籽油含量陸地棉品種的生物標(biāo)志物，所述生物標(biāo)志物為ghir_d03g013530基因、ghir_d03g013680基因和ghir_d12g004870基因；

4、所述ghir_d03g013530基因的cds序列如seq?id?no.1所示；

5、所述ghir_d03g013680基因的cds序列如seq?id?no.2所示；

6、所述ghir_d12g004870基因的cds序列如seq?id?no.3所示。

7、本發(fā)明還提供一種檢測上述的生物標(biāo)志物的引物對，當(dāng)所述生物標(biāo)志物為所述ghir_d03g013530基因時，所述引物對包括核苷酸序列如seq?id?no.4所示的上游引物和核苷酸序列如seq?id?no.5所示的下游引物；

8、當(dāng)所述生物標(biāo)志物為所述ghir_d03g013680基因時，所述引物對包括核苷酸序列如seq?id?no.6所示的上游引物和核苷酸序列如seq?id?no.7所示的下游引物；

9、當(dāng)所述生物標(biāo)志物為所述ghir_d12g004870基因時，所述引物對包括核苷酸序列如seq?id?no.8所示的上游引物和核苷酸序列如seq?id?no.9所示的下游引物。

10、本發(fā)明還提供檢測上述的生物標(biāo)志物表達量的試劑在制備鑒別高棉籽油含量陸地棉品種的檢測產(chǎn)品中的應(yīng)用。

11、進一步地，所述檢測產(chǎn)品為試劑盒。

12、進一步地，所述試劑為上述的引物對。

13、本發(fā)明還提供一種鑒別高棉籽油含量陸地棉品種的檢測產(chǎn)品，包括檢測上述的生物標(biāo)志物表達量的試劑。

14、進一步地，所述檢測產(chǎn)品為試劑盒。

15、進一步地，所述試劑為上述的引物對。

16、本發(fā)明還提供上述的生物標(biāo)志物、引物對或檢測產(chǎn)品在鑒別高棉籽油含量陸地棉品種中的應(yīng)用。

17、本發(fā)明還提供一種鑒別高棉籽油含量陸地棉品種的方法，包括對上述的生物標(biāo)志物在待檢陸地棉樣品中的表達量進行檢測，根據(jù)表達量檢測結(jié)果鑒別高棉籽油含量陸地棉品種的步驟；

18、當(dāng)所述生物標(biāo)志物為所述ghir_d03g013530基因時，所述ghir_d03g013530基因的表達量越低，提示所述待檢陸地棉樣品的棉籽油含量越高；

19、當(dāng)所述生物標(biāo)志物為所述ghir_d03g013680基因時，所述ghir_d03g013680基因的表達量越低，提示所述待檢陸地棉樣品的棉籽油含量越高；

20、當(dāng)所述生物標(biāo)志物為所述ghir_d12g004870基因時，所述ghir_d12g004870基因的表達量越高，提示所述待檢陸地棉樣品的棉籽油含量越高。

21、本發(fā)明公開了以下技術(shù)效果：

22、本發(fā)明根據(jù)全基因組關(guān)聯(lián)分析、單倍型分析、表型變異分析、轉(zhuǎn)錄組表達水平分析和基因注釋。共鑒定到三個參與油脂代謝的候選基因，分別是ghir_d03g013530(ghhad)、ghir_d03g013680(ghtpi)和ghir_d12g004870(ghran1)，并通過qrt-pcr分析對基因功能進行了初步驗證。結(jié)果發(fā)現(xiàn)，ghir_d03g013530可能通過抑制aba響應(yīng)和水解pa降低棉籽含油量，ghir_d03g013680可能通過催化dhap和gap之間相互轉(zhuǎn)化，減少g-3-p的底物，來限制tag組裝。qrt-pcr分析表明上述兩個基因均在低油品種中表達水平更高，與本發(fā)明分析結(jié)果一致。ghir_d12g004870可能通過激活乙烯應(yīng)答，抑制aapt的表達，增加pc向dag轉(zhuǎn)化，qrt-pcr分析表明該基因在高油品種中表達水平更高，說明該基因的表達可以促進棉籽油的合成。

23、本發(fā)明為推動棉籽油的遺傳育種，加快培育棉花高油品種提供了遺傳機制基礎(chǔ)，對進一步提高棉籽利用價值具有深遠的意義。

技術(shù)特征：

1.一種鑒別高棉籽油含量陸地棉品種的生物標(biāo)志物，其特征在于，所述生物標(biāo)志物為ghir_d03g013530基因、ghir_d03g013680基因和ghir_d12g004870基因；

2.一種檢測權(quán)利要求1所述的生物標(biāo)志物的引物對，其特征在于，當(dāng)所述生物標(biāo)志物為所述ghir_d03g013530基因時，所述引物對包括核苷酸序列如seq?id?no.4所示的上游引物和核苷酸序列如seq?id?no.5所示的下游引物；

3.檢測權(quán)利要求1所述的生物標(biāo)志物表達量的試劑在制備鑒別高棉籽油含量陸地棉品種的檢測產(chǎn)品中的應(yīng)用。

4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的應(yīng)用，其特征在于，所述檢測產(chǎn)品為試劑盒。

5.根據(jù)權(quán)利要求3所述的應(yīng)用，其特征在于，所述試劑為權(quán)利要求2所述的引物對。

6.一種鑒別高棉籽油含量陸地棉品種的檢測產(chǎn)品，其特征在于，包括檢測權(quán)利要求1所述的生物標(biāo)志物表達量的試劑。

7.根據(jù)權(quán)利要求6所述的檢測產(chǎn)品，其特征在于，所述檢測產(chǎn)品為試劑盒。

8.根據(jù)權(quán)利要求6所述的檢測產(chǎn)品，其特征在于，所述試劑為權(quán)利要求2所述的引物對。

9.一種如權(quán)利要求1所述的生物標(biāo)志物、權(quán)利要求2所述的引物對或權(quán)利要求6-8任一項所述的檢測產(chǎn)品在鑒別高棉籽油含量陸地棉品種中的應(yīng)用。

10.一種鑒別高棉籽油含量陸地棉品種的方法，其特征在于，包括對權(quán)利要求1所述的生物標(biāo)志物在待檢陸地棉樣品中的表達量進行檢測，根據(jù)表達量檢測結(jié)果鑒別高棉籽油含量陸地棉品種的步驟；

技術(shù)總結(jié)
本發(fā)明公開了一種鑒別高棉籽油含量陸地棉品種的生物標(biāo)志物及其應(yīng)用，涉及生物技術(shù)領(lǐng)域。該生物標(biāo)志物為Ghir_D03G013530基因、Ghir_D03G013680基因和Ghir_D12G004870基因；該Ghir_D03G013530基因、Ghir_D03G013680基因和Ghir_D12G004870基因的CDS序列分別如SEQ?ID?NO.1?3所示。采用本發(fā)明提供的生物標(biāo)志物可以有效鑒別高棉籽油含量陸地棉品種，本發(fā)明為推動棉籽油的遺傳育種，加快培育棉花高油品種提供了遺傳機制基礎(chǔ)，對進一步提高棉籽利用價值具有深遠的意義。

技術(shù)研發(fā)人員：李黎貝,馮震,段佳豪,周志斌,喻樹迅
受保護的技術(shù)使用者：浙江農(nóng)林大學(xué)
技術(shù)研發(fā)日：
技術(shù)公布日：2024/12/19