一種碳酸酯類光敏試劑及其制備方法、5`-光敏保護核苷的制備方法
【專利摘要】本發(fā)明涉及一種碳酸酯類光敏試劑及其制備方法、5'?光敏保護核苷的制備方法。碳酸酯類光敏試劑,其結(jié)構(gòu)式為:其中X為-OX’、咪唑基、取代咪唑基;5'-光敏保護核苷的制備方法步驟包括將2’-脫氧核苷與2-鄰硝基苯-1-丙基碳酸酯類光敏試劑和三乙胺得5'-光敏保護核苷粗產(chǎn)物、粗產(chǎn)物提純得到5'-光敏保護核苷。本發(fā)明5'-光敏保護核苷制備方法選擇性平均提高了3.4倍,減化了提純過程,提高了產(chǎn)率,大大降低了生產(chǎn)成本,同時避免了使用劇毒的雙光氣。
【專利說明】
一種碳酸酯類光敏試劑及其制備方法、5光敏保護核苷的制 備方法
技術(shù)領(lǐng)域
[0001] 本發(fā)明屬于有機合成技術(shù)領(lǐng)域,具體涉及一種碳酸酯類光敏試劑及其制備方法、 5 光敏保護核苷的制備方法。
【背景技術(shù)】
[0002] 基因芯片技術(shù)是利用核酸分子雜交原理與微電子技術(shù)相結(jié)合而形成的一種高新 生物技術(shù)??蓮V泛應(yīng)用于疾病診斷、藥物篩選、生物科學(xué)研究,農(nóng)作物的優(yōu)選優(yōu)育、司法鑒 定、食品衛(wèi)生監(jiān)督、環(huán)境檢測等許多領(lǐng)域。由于原位光刻技術(shù)可制備高密度寡核苷酸基因芯 片,目前,以原位光刻技術(shù)為基礎(chǔ)的基因芯片被廣泛采用,5 光敏保護核苷及其衍生物5 ' -光敏亞磷酰胺單體是制備該類基因芯片的關(guān)鍵原料之一。但是,現(xiàn)有制備5'-光敏保護核苷 的方法(如下所示)中,
[0004]有二個共同的難題:(1)、在引入5'-光敏基團時,由于使用的是酰氯類光敏試劑, 反應(yīng)缺乏足夠的選擇性,特別是大規(guī)模反應(yīng),酰氯類光敏試劑的選擇反應(yīng)條件較難控制,在 生成5'_光敏保護核苷(5'-Photolabile dN)的同時,有相當(dāng)量的副產(chǎn)物3'-光敏保護核苷 (3'_Photolabile dN)和3',5'_雙光敏保護核苷(3',5'_diPhotolabile dN)生成,根據(jù)堿 基不同,生成的主產(chǎn)物5'-光敏保護核苷與副產(chǎn)物(3'_光敏保護核苷和3',5'_雙光敏保護 核苷等)的比例一般為5 :1 至2:1 (參考文獻:Sigrid Buhler,Irene Lago ja等,Helvetica Chimica Acta,2004,v87(3),620-659)。由于3'-光敏保護核苷與5'-光敏保護核苷分離性 質(zhì)很相近,使分離5'-光敏保護核苷與3'-光敏保護核苷相當(dāng)困難。即使分離,由于兩者易 相互交叉,導(dǎo)致5光敏保護核苷產(chǎn)物損失較大,產(chǎn)率偏低。因此,尋找對伯(1°)醇和仲(2°) 醇具有高度選擇性的試劑,提高反應(yīng)的選擇性非常重要(參考文獻:Abbas-Alli G. Shaikh, Chem Review ,1996, v96,951-976) ; (2)、在制備酰氯類光敏試劑時必須使用雙光氣 (diphosgene)(參考文獻:Woffgang Pfleiderer&Heiner Giegrich,1998,美國專利, US5763599),雙光氣毒性很大,操作起來很不方便,并且嚴重污染環(huán)境,在生產(chǎn)中應(yīng)盡可能 避免使用。
【發(fā)明內(nèi)容】
[0005] 針對現(xiàn)有技術(shù)的不足,本發(fā)明提供一種碳酸酯類光敏試劑及其制備方法、5'-光敏 保護核苷的制備方法,本發(fā)明合成一種新的碳酸酯類光敏試劑,其與對伯(1°)醇和仲(2°) 醇具有高度反應(yīng)選擇性,將光敏基團選擇性引入核苷的5'-位,使得5'-光敏保護核苷的產(chǎn) 率大幅提尚。
[0006] 本發(fā)明采用的技術(shù)方案是:
[0007] 一種碳酸酯類光敏試劑,其結(jié)構(gòu)式為:
[0009] 其中X為-0X'、咪唑基、取代咪唑基,所述取代咪唑基為2-甲基咪唑基、1,2,4_三氮 P坐基;-0X'中X'為對硝基苯基(4-nitrophenyl),五氟苯基(pentafluorophenyl) ,2-吡啶基 (2-pyridyl),和琥泊酰亞胺基(succinimidyl)。
[0010] -種碳酸酯類光敏試劑的制備方法,步驟包括:
[0011] A、將2-鄰硝基苯-1-丙醇溶于有機溶劑中,加入碳酸二酯類試劑或羰基二唑類試 劑,再加入三乙胺,室溫下攪拌反應(yīng)6-10h;
[0012] B、將反應(yīng)后的溶液先后用水和飽和氯化鈉水溶液萃取,保留有機溶液層,有機溶 液用無水硫酸鈉干燥后,過濾,濾液蒸干,真空干燥,得2-鄰硝基苯-1-丙基碳酸酯類光敏試 劑。
[0013] 所述步驟A中有機溶劑選自二氯甲烷,三氯甲烷,乙酸乙酯、甲苯中的一種;
[0014] 所述步驟A中2-鄰硝基苯-1-丙醇、碳酸二酯類試劑或羰基二唑類試劑、三乙胺在 有機溶劑中的濃度分別為 〇 ? 40-0 ? 65mol/L、0 ? 50-0 ? 75mol/L、0 ? 40-0 ? 65mol/L。
[0015] 所述步驟A碳酸二酯類試劑選自雙(對硝基苯)碳酸酯、雙(五氟苯)碳酸酯、碳酸 二-2-吡啶酯、N,N' -琥珀酰亞胺基碳酸酯中的一種;羰基二唑類試劑選自N ' N-羰基二咪唑、 N'N-羰基二(2-甲基咪唑),N'N-羰基二(1,2,4-三氮唑)中的一種;
[0016] 所述步驟A室溫溫度為10-3(TC。
[0017] -種5 光敏保護核苷的制備方法,步驟包括:
[0018] a、將干燥的2 脫氧核苷溶于無水吡啶和二氯甲烷的混合溶劑中,冷卻至-3°C-3 °C,依次加入2-鄰硝基苯-1-丙基碳酸酯類光敏試劑和三乙胺,在室溫下攪拌反應(yīng)14_22h, 減壓蒸去反應(yīng)溶劑,得5'-(2_鄰硝基苯-1-丙基碳酸酯)-2'_脫氧核苷粗產(chǎn)物,即5'-光敏保 護核苷粗產(chǎn)物;
[0019] b、將5'-光敏保護核苷粗產(chǎn)物用乙酸乙酯和碳酸氫鈉水溶液的混合液萃取,保留 乙酸乙酯層,乙酸乙酯層先后用水和飽和氯化鈉水溶液洗滌,然后乙酸乙酯層用無水硫酸 鈉干燥,過濾,濾液蒸干,將蒸干后的產(chǎn)物用硅膠柱層析提純,以二氯甲烷/甲醇為洗脫溶 劑,收集產(chǎn)物組分,濃縮得5'_(2_鄰硝基苯-1-丙基碳酸酯)-2'_脫氧核苷即5'-光敏保護核 苷。
[0020]所述步驟a中2 脫氧核苷選自2 脫氧胸苷、2 脫氧尿苷,N-乙酰基-2 脫氧胞 苷、N-苯甲酰基-2'-脫氧腺苷、N-異丁?;?2'-脫氧鳥苷中的一種;
[0021]所述步驟a中2'-脫氧核苷、2-鄰硝基苯-1-丙基碳酸酯類光敏試劑和三乙胺在無 水吡啶和二氯甲烷的混合溶劑中的濃度分別為0.25-0.35mol/L、0.29-0.39mol/L、0.26-0?36mol/L。
[0022] 所述步驟a中無水吡啶與二氯甲烷的體積比為4-6:1;
[0023] 所述步驟a中室溫溫度為10_30°C;
[0024]所述步驟b中乙酸乙酯和碳酸氫鈉水溶液體積比為1-2:1;碳酸氫鈉水溶液質(zhì)量百 分濃度為3-5 %;
[0025] 所述步驟b中洗脫溶劑中二氯甲烷與甲醇體積比為20-50:1。
[0026] 5'-光敏保護核苷的制備方法的反應(yīng)原理如下:
[0028] 在式中,BR為胸腺嘧啶(Thymine,簡稱T)、N4_乙酰胞嘧啶(N 4_Acetyl Cytosine,簡 稱Ac-C),N6-苯甲?;汆堰?N6-Benzoyl-Adenine,簡稱Bz-A),和N2-異丁?;B嘌呤(N 2-ibu-Guanine,簡稱ibu-G)等。由于5'-(2-鄰硝基苯-1-丙基碳酸酯)中與鄰硝基苯相連的碳 原子具有手性,所得5'-光敏保護核苷產(chǎn)物應(yīng)為比例約為1:1的二個非對映異構(gòu)體的混合 物,在對產(chǎn)物1H HMR和HPLC分析中,可清晰地觀察到二個非對映異構(gòu)體的存在。
[0029]本發(fā)明使用對伯(1°)醇和仲(2°)醇具有高度反應(yīng)選擇性的碳酸酯類光敏試劑,選 擇性地與脫氧核苷或堿基保護的脫氧核苷中的伯(1°)醇5'-OH反應(yīng),選擇性生成5'-光敏 保護核苷,將生成所需產(chǎn)物(5'_光敏保護核苷)與副產(chǎn)物(3'_光敏保護核苷和3',5'_雙光 敏保護核苷)的比例從5:1至2:1(平均為3.5:1)提高到14:1至10:1(平均為12:1),選擇性平 均提高了3.4倍,減化了提純過程,提高了產(chǎn)率,大大降低了生產(chǎn)成本,同時避免了使用劇毒 的雙光氣,為制備廣泛用于基因芯片技術(shù)的5'-光敏保護核苷及其衍生物提供了一種高效 實用的新工藝方法,具有很高的應(yīng)用價值。
【具體實施方式】
[0030] 實施例1:
[0031] 5'-NPP0C_dT(互)的制備
[0032] la.光敏試劑的制備反應(yīng)步驟:
[0034]室溫25°C,在反應(yīng)容器中,將2-鄰硝基苯-1-丙醇丄[2-(2-11;[1:1'(^1161171)口1'(^311-1-01,54.4g,0.30mol ]溶于二氯甲燒(544ml)中,加入雙(對硝基苯)碳酸酯蘭[1318(4-nitrophenyl) carbonate,0 ? 33mol ],再加入三乙胺(0 ? 303mol);室溫攪拌反應(yīng)體系,6小時 后,HPLC表明反應(yīng)完全,停止反應(yīng),反應(yīng)溶液先后用水(2x 300ml,表示用300ml水萃取后,再 用300ml水萃取一次,共萃取2次)和飽和氯化鈉水溶液(300ml)萃取,保留有機(二氯甲燒) 層,二氯甲烷層用無水硫酸鈉干燥后,過濾,濾液蒸干,真空干燥,得對硝基苯碳酸(2-鄰硝 基苯)_1_丙酯g,87.3g,HPLC純度為96%,產(chǎn)率為84%。
[0035] lb.選擇偶聯(lián)反應(yīng)步驟:
[0037] 將干燥的2'-脫氧胸苷!(Thymidine,0? 20mol)溶于無水吡啶(485ml)和二氯甲燒 (97ml)中,冷卻,在0°C先后依次加入硝基苯碳酸(2-鄰硝基苯)-1_丙酯}(0.224m〇l)和三 乙胺(0.204mol),加畢,在室溫25°C攪拌反應(yīng)體系,14小時后,HPLC表明反應(yīng)完全,停止反 應(yīng),減壓蒸去反應(yīng)溶劑,得5'-[對硝基苯碳酸(2-鄰硝基苯)-1_丙基碳酸酯]-2'-脫氧胸苷互 (5 ' -NPPOC-dT)反應(yīng)粗產(chǎn)物。此時,HPLC表明產(chǎn)物(5 ' -光敏保護核苷)與副產(chǎn)物(3 ' -光敏保 護核苷和3 ',5 雙光敏保護核苷)的比例為14:1。
[0038] lc、提純步驟:
[0039] 將上述5 ' -NPPOC-dT反應(yīng)粗產(chǎn)物用乙酸乙酯(500ml)和3 %碳酸氫鈉水溶液 (300ml)萃取,保留乙酸乙酯層,乙酸乙酯層先后用水(300ml)和飽和氯化鈉水溶液(300ml) 洗滌,然后乙酸乙酯層用無水硫酸鈉干燥,過濾,濾液蒸干,得5 ' -NPPOC-dT粗產(chǎn)物。5 ' -NPP0C-dT粗產(chǎn)物用硅膠柱層析提純,以二氯甲烷/甲醇為洗脫溶劑,收集產(chǎn)物組分,濃縮得 5'-(2-鄰硝基苯-1-丙基碳酸酯)-2'_脫氧胸苷5'-NPPOC-dT),73.7g,HPLC純度為 98.3%,產(chǎn)率為82%。5 ' -(2-鄰硝基苯-1-丙基碳酸酯)-2 ' -脫氧胸苷g5 ' -NPPOC-dT)的化 學(xué)結(jié)構(gòu)通過1H NMR和LC-MS(M+)證實。
[0040] 5 ' -(2-鄰硝基苯-1-丙基碳酸酯)-2 ' -脫氧胸苷g(5 ' -NPPOC-dT): 4 NMR(CDC13, 4001抱)5化口111)8.65(8,順,非對映異構(gòu)體),8.63(8,順,非對映異構(gòu)體),7.76(111,1-厶廣11,11-NPP0C),7 ? 57(t,1-Ar-H,H-NPP0C),7 ? 40(m,2Ar-H,H-NPP0C),7 ? 31 (s,H-6,非對映異構(gòu)體), 7.28(8,11-6,非對映異構(gòu)體),6.33(^-1',非對映異構(gòu)體),6.29(^-1',非對映異構(gòu)體), 4.31-3.87(m,6H,H-3',H-4',2H-5',NPP0C的-CH2),3.76(m,lH,NPP0(^9-CH),2.61-2.58 (dd,lH,3'-OH),2.39-2.18(m,2H,H-2'),1.85,1.74(2s,3H,5-CH3),l.38,1.35(2d,3H, NPP0C的-CH3); LC-MS: m/z f or (M+H) +,計算值C2QH24N3O9,450 ? 41 ?;實測值450 ? 4。
[0041 ] 實施例2:
[0042] 5'-NPP0C-N-Ac-dC(竺)的制備 [0043] 2a.光敏試劑的制備反應(yīng)步驟:
[0045]室溫20<€下,在反應(yīng)容器中,將2-鄰硝基苯-1-丙醇1[2-(2-11;[1:1'(^116117141'(^&11-1-01,0.30mol]溶于三氯甲燒(544ml)中,加入雙(五氟苯)碳酸酯蘭[Bis (pentaf luorophenyl )carbonateO ? 33mol ],再加入三乙胺(0 ? 303mol)。室溫攪拌反應(yīng)體系, 9小時后,HPLC表明反應(yīng)完全,停止反應(yīng),反應(yīng)溶液先后用水(2x 300ml)和飽和氯化鈉水溶 液(300ml)萃取,保留有機(三氯甲烷)層;三氯甲烷層用無水硫酸鈉干燥后,過濾,蒸干,真 空干燥,得五氟苯碳酸(2-鄰硝基苯)-1_丙酯^,95.1 8,即^:純度為97%,產(chǎn)率為81%。
[0046] 2b ?選擇偶聯(lián)反應(yīng)步驟:
[0048] 將干燥的N-乙酰基-2'-脫氧胞苷g(N-Ac-dC,0.20mol)溶于無水吡啶(540ml)和二 氯甲烷(108ml)中,冷卻,在0°C先后依次加入五氟苯碳酸(2-鄰硝基苯)-1_丙酯Z (0.224mol)和三乙胺(0.204mol),加畢,在室溫20°C攪拌反應(yīng)體系,18小時后,HPLC表明反 應(yīng)完全,停止反應(yīng),減壓蒸去反應(yīng)溶劑,得5 ' - (2-鄰硝基苯-1-丙基碳酸酯)-N-乙?;?2 ' -脫氧胞苷&(5 ' -NPPOC-N-Ac-dC)反應(yīng)粗產(chǎn)物。此時,HPLC表明產(chǎn)物(5 ' -光敏保護核苷)與副 產(chǎn)物(3 光敏保護核苷和3 ',5 雙光敏保護核苷)的比例為12:1。
[0049] 2c.提純步驟:
[0050] 將上述5'-即?0(:-^4(3-(1(:反應(yīng)粗產(chǎn)物用乙酸乙酯(50〇1111)和和3%碳酸氫鈉水溶 液(300ml)萃取,保留乙酸乙酯層,乙酸乙酯層先后用水(300ml)和飽和氯化鈉水溶液 (300ml)洗滌,然后乙酸乙酯層用無水硫酸鈉干燥,過濾,濾液蒸干,得5 ' -NPPOC-N-Ac-dC粗 產(chǎn)物。5 ' -NPPOC-N-Ac-dC粗產(chǎn)物用硅膠柱層析提純,以二氯甲烷/甲醇為洗脫溶液,收集產(chǎn) 物組分,濃縮得5 ' -(2-鄰硝基苯-1-丙基碳酸酯)-N-乙?;?2 ' -脫氧胞苷^(5'-即?0(:,-Ac-dC),75.3g,HPLC純度為98.1 %,產(chǎn)率為79 %。5 ' -(2-鄰硝基苯-1-丙基碳酸酯)-N-乙酰 基-2' _脫氧胞苷&(5' -NPPOC-N-Ac-dC)的化學(xué)結(jié)構(gòu)通過1H NMR和LC-MS(M+)證實。
[0051 ] 5 ' - (2-鄰硝基苯-1-丙基碳酸酯)-N-乙?;?2 脫氧胞苷&(5 ' -NPPOC-N-Ac-dC) :咕 NMR(CDCl3,400MHz)S(ppm)8.92(br,乙?;?NH,非對映異構(gòu)體),8.89(br,乙?;?NH, 非對映異構(gòu)體),7.92((1,11-6,非對映異構(gòu)體),7.89((1,11-6,非對映異構(gòu)體),7.74(111,1-八廣 H,H-NPPOC),7 ? 55(t,1 -Ar-H,H-NPPOC),7 ? 38(m,2Ar-H,H-NPPOC),7 ? 29(d,H-5,非對映異構(gòu) 體),7.26((1,11-5非對映異構(gòu)體),6.24(^-1',非對映異構(gòu)體),6.19(^-1',非對映異構(gòu) 體),4.32-3.89(m,6H,H-3',H-4',2H-5',NPP0C的-CH2),3.75(m,lH,NPP0(^9-CH),2.62-2.59(dd,lH,3,-OH),2.38-2.17(m,2H,H-2,),2.14,2.11(2s,3H,CH3C = 0),l .40,1.37(2(1, 3H,NPPOC的-CH3); LC-MS:m/z for(M+H) +,計算值C21H25N4O9,477 ? 44 ?;實測值477 ? 5。
[0052] 實施例3:
[0053] 5'-NPP0C-N-Bz-dA(p)的制備 [0054] 3a.光敏試劑的制備反應(yīng)步驟:
[0056] 室溫25°C下,在反應(yīng)容器中,將2-鄰硝基苯-1-丙醇1[2-(2-11;[1:1'(^116117141'(^已11- 1-01,0 ? 30mol ]溶于乙酸乙酯( 540ml )中,加入N 'N-羰基二咪唑1_^(1,1/-Carbonyldiimidazole,0 ? 33mol),再加入三乙胺(0 ? 303mol)。室溫攪拌反應(yīng)體系,7小時后, HPLC表明反應(yīng)完全,停止反應(yīng),反應(yīng)溶液先后用水(2x 300ml)和飽和氯化鈉水溶液(300ml) 萃取,保留有機(乙酸乙酯)層;乙酸乙酯層用無水硫酸鈉干燥后,過濾,蒸干,真空干燥,得 N-咪唑碳酸(2-鄰硝基苯)-1 -丙酯U,69.4g,HPLC純度為96 %,產(chǎn)率為84 %。
[0057] 3b.選擇偶聯(lián)反應(yīng)步驟:
[0059] 將干燥的N-苯甲?;?2 ' -脫氧腺苷B(N-BZ-dA,71. lg,0.20mol)溶于無水吡啶 (710ml)和二氯甲烷(142ml)中,冷卻,在0°C先后依次加入N-咪唑碳酸(2-鄰硝基苯)-1_丙 酯U (0.224mol)和三乙胺(0.204mol),加畢,在室溫25°C攪拌反應(yīng)體系,16小時后,HPLC表 明反應(yīng)完全,停止反應(yīng),減壓蒸去反應(yīng)溶劑,得5 '-(2-鄰硝基苯-1-丙基碳酸酯)-N-苯甲酰 基-2 ' -脫氧腺苷5 ' -NPPOC-N-Bz-dA)反應(yīng)粗產(chǎn)物。此時,HPLC表明產(chǎn)物(5 ' -光敏保護核 苷)與副產(chǎn)物(3 光敏保護核苷和3 ',5 雙光敏保護核苷)的比例為11:1。
[0060] 3c ?提純步驟:
[0061 ] 將上述5'-即?0(:-182-(^反應(yīng)粗產(chǎn)物用乙酸乙酯(60〇1111)和和3%碳酸氫鈉水溶 液(400ml)萃取,保留乙酸乙酯層,乙酸乙酯層先后用水(400ml)和飽和氯化鈉水溶液 (400ml)洗滌,然后乙酸乙酯層用無水硫酸鈉干燥,過濾,濾液蒸干,得5 ' -NPPOC-N-Bz-dA粗 產(chǎn)物。5 ' -NPPOC-N-Bz-dA粗產(chǎn)物用硅膠柱層析提純,以二氯甲烷/甲醇為洗脫溶劑,收集產(chǎn) 物組分,濃縮得5 ' -(2-鄰硝基苯-1-丙基碳酸酯)-N-苯甲酰基-2 ' -脫氧腺苷以(5'-即?0(:-N-Bz-dA),90. lg,HPLC純度為98.2%,產(chǎn)率為80%。5 ' -(2-鄰硝基苯-1-丙基碳酸酯)-N-苯 甲酰基-2' -脫氧腺苷巧(5' -NPPOC-N-Bz-dA)的化學(xué)結(jié)構(gòu)通過1H NMR和LC-MS(M+)證實。 [0062] 5 ' -(2-鄰硝基苯-1-丙基碳酸酯)-N-苯甲酰基-2 ' -脫氧腺苷以(5'-陬?0(:,-82- dA):咕 NMR(CDCl3,400MHz)S(ppm)9.29(br,苯甲?;?NH,非對映異構(gòu)體),9.25(br,苯甲 ?;?NH,非對映異構(gòu)體),8.61 (s,H-2,非對映異構(gòu)體),8.58(s,H-2,非對映異構(gòu)體),8.19 (s,H-8,非對映異構(gòu)體),8.16(s,H-8,非對映異構(gòu)體),7.86(m,2H,苯甲?;腁r-H),7.75 (m,1-Ar-H,H-NPP0C),7 ? 56(t,1-Ar-H,H-NPP0C),7 ? 45-7 ? 44(m,3H,苯甲?;腁r-H),7 ? 37 (m,2Ar-H,H-NPP0C),6.35(t,H-r,非對映異構(gòu)體),6.31 (t,H-r,非對映異構(gòu)體),4.31_ 3?88(m,6H,H-3 ',H-4 ',2H-5 ',NPPOC的-CH2),3?74(m,1H,NPPOC的-CH),2?83-2?80(dd,1H, 3'-OH),2.39-2.17(m,2H,H-2'),1.41,1.38(2d,3H,NPP0C的-CH3);LC-MS:m/z for(M+H)+, 計算值 C27H27N6〇8,563 ? 53 ?;實測值563 ? 5。
[0063] 實施例4:
[0064] 5'-NPP0C_dT(互)的制備 [0065] 4a.光敏試劑的制備反應(yīng)步驟:
[0067] 室溫26°C下,在反應(yīng)容器中,將2-鄰硝基苯-1-丙醇丄[2-(2-11;[1:1'(^1161171)口1'(^已11-1-01,54 ? 4g,0 ? 30mol ]溶于二氯甲燒(540ml)中,加入碳酸二_2_吡啶酯 14(Di_2-pyridyl carbonate,0.33mol ),再加入三乙胺(0.303mol)。室溫攪拌反應(yīng)體系,10小時后,HPLC表明 反應(yīng)完全,停止反應(yīng),反應(yīng)溶液先后用水(2x 300ml)和飽和氯化鈉水溶液(300ml)萃取,保 留有機(二氯甲烷)層;二氯甲烷層用無水硫酸鈉干燥后,過濾,蒸干,真空干燥,得(2-吡啶) 碳酸-2-鄰硝基苯-1-丙酯叢,74 ? 4g,HPLC純度為97 %,產(chǎn)率為82 %。
[0068] 4b.選擇偶聯(lián)反應(yīng)步驟:
[0070] 將干燥的N-異丁?;?2 ' -脫氧鳥苷遲(N-ibu-dG,0.20mol)溶于無水吡啶(670ml) 和二氯甲烷(134ml)中,冷卻,在0°C先后依次加入(2-吡啶)碳酸-2-鄰硝基苯-1-丙酯也 (0.224mol)和三乙胺(0.204mol),加畢,在室溫26°C攪拌反應(yīng)體系,22小時后,HPLC表明反 應(yīng)完全,停止反應(yīng),減壓蒸去反應(yīng)溶劑,得5'-(2_鄰硝基苯-1-丙基碳酸酯)-N-異丁?;? 2 ' -脫氧鳥苷5 ' -NPPOC-N-ibu-dG)反應(yīng)粗產(chǎn)物。此時,HPLC表明產(chǎn)物(5 ' -光敏保護核苷) 與副產(chǎn)物(3 光敏保護核苷和3 ',5 雙光敏保護核苷)的比例為10:1。
[0071] 4c ?提純步驟:
[0072] 將上述5 ' -NPPOC-N-ibu-dG反應(yīng)粗產(chǎn)物用乙酸乙酯(600ml)和和3 %碳酸氫鈉水溶 液(400ml)萃取,保留乙酸乙酯層,乙酸乙酯層先后用水(400ml)和飽和氯化鈉水溶液 (400ml)洗滌,然后乙酸乙酯層用無水硫酸鈉干燥,過濾,濾液蒸干,得5 ' -NPPOC-N-ibu-dG 粗產(chǎn)物。5 ' -NPPOC-N-ibu-dG粗產(chǎn)物用硅膠柱層析提純,以二氯甲烷/甲醇為洗脫溶劑,收集 產(chǎn)物組分,濃縮得5'-(2-鄰硝基苯-1-丙基碳酸酯)-.異丁?;?2'-脫氧鳥苷1^(5'_ NPPOC-N-ibu-dG),82.8g,HPLC純度為98.0%,產(chǎn)率為76%。5 ' -(2-鄰硝基苯-1-丙基碳酸 酯)4-異丁?;?2'-脫氧鳥苷立(5'-即?0(:4-讓11-(16)的化學(xué)結(jié)構(gòu)通過 111匪1?和^:-]^(]\〇 證實。
[0073] 5 ' -(2-鄰硝基苯-1-丙基碳酸酯)-N-異丁?;?2 ' -脫氧鳥苷立(5 ' -NPP0C-N-ibu- dG): NMR(CDCl3,400MHz)S(ppm)10.25(s,鳥嘌呤-NH,非對映異構(gòu)體),10.21(s,鳥嘌呤- NH,非對映異構(gòu)體),9.28(br,異丁酰基-NH,非對映異構(gòu)體),9.24(br,異丁酰基-NH,非對 映異構(gòu)體),7.97(8,11-8,非對映異構(gòu)體),7.94(8,11-8,非對映異構(gòu)體),7.74(111,14^11-NPP0C),7.57(t,l-Ar-H,H-NPP0C),7.38(m,2Ar-H,H-NPP0C),6.19(t,H-l',非對映異構(gòu) 體),6.16(t,H-l',非對映異構(gòu)體),4.33-3.90(m,6H,H-3',H-4',2H-5',NPP0C的-CH2), 3.73(111,111,陬?0(:的-〇1),2.77-2.74(111,111,異丁酰基的-〇〇,2.61-2.58((1(1,111,3'-〇1〇, 2.39-2.17(m,2H,H-2'),1.42,1.39(2d,3H,NPP0C的-CH3),1.21,1.18(dd,6H,異丁?;?CH3); LC-MS :m/z for(M+H) +,計算值C24H29N6O9,545 ? 51,實測值545 ? 5。
【主權(quán)項】
1. 一種5 光敏保護核巧的制備方法,步驟包括: a、 將干燥的2'-脫氧核巧溶于無水化晚和二氯甲燒的混合溶劑中,冷卻至-3°C-3°C,依 次加入2-鄰硝基苯-1-丙基碳酸醋類光敏試劑和Ξ乙胺,在室溫下攬拌反應(yīng)14-2化,減壓蒸 去反應(yīng)溶劑,得5 '-(2-鄰硝基苯-1-丙基碳酸醋)-2 ' -脫氧核巧粗產(chǎn)物,即5 ' -光敏保護核巧 粗產(chǎn)物; b、 將5'-光敏保護核巧粗產(chǎn)物用乙酸乙醋和碳酸氨鋼水溶液萃取,保留乙酸乙醋層,乙 酸乙醋層先后用水和飽和氯化鋼水溶液洗涂,然后乙酸乙醋層用無水硫酸鋼干燥,過濾,濾 液蒸干,將蒸干后的產(chǎn)物用硅膠柱層析提純,W二氯甲燒/甲醇為洗脫溶劑,收集產(chǎn)物組分, 濃縮得5 ' -(2-鄰硝基苯-1 -丙基碳酸醋)-2 ' -脫氧核巧即5 ' -光敏保護核巧。2. 如權(quán)利要求1所述的制備方法,其特征在于:所述步驟a中2'-脫氧核巧選自2'-脫氧 胸巧、2'-脫氧尿巧,N-乙酷基-2'-脫氧胞巧、N-苯甲酯基-2'-脫氧腺巧、N-異下酷基-2'-脫 氧鳥巧中的一種。3. 如權(quán)利要求1所述的制備方法,其特征在于:所述步驟a中2'-脫氧核巧、2-鄰硝基苯- 1-丙基碳酸醋類光敏試劑和Ξ乙胺在無水化晚和二氯甲燒的混合溶劑中的濃度分別為 0.25-0.35mol/L、0.29-0.39mol/L、0.26-0.36mol/L。4. 如權(quán)利要求1所述的制備方法,其特征在于:所述步驟a中無水化晚與二氯甲燒的體 積比為4-6:1。5. 如權(quán)利要求1所述的制備方法,其特征在于:所述步驟b中乙酸乙醋和碳酸氨鋼水溶 液體積比為1-2:1;碳酸氨鋼水溶液質(zhì)量百分濃度為3-5%;洗脫溶劑中二氯甲燒與甲醇體 積比為20-50:1。6. 如權(quán)利要求1所述的制備方法,其特征在于:所述2-鄰硝基苯-1-丙基碳酸醋類光敏 試劑的結(jié)構(gòu)式為:其中X為-OX'、咪挫基、取代咪挫基;-OX'中X'為對硝基苯基、五氣苯基、2-化晚基、和班 巧酷亞胺基。7. 如權(quán)利要求6所述的制備方法,其特征在于: 所述2-鄰硝基苯-1-丙基碳酸醋類光敏試劑的制備步驟包括: A、 將2-鄰硝基苯-1-丙醇溶于有機溶劑中,加入碳酸二醋類試劑或幾基二挫類試劑,再 加入Ξ乙胺,室溫下攬拌反應(yīng)6-lOh; B、 將反應(yīng)后的溶液先后用水和飽和氯化鋼水溶液萃取,保留有機溶液層,有機溶液用 無水硫酸鋼干燥后,過濾,濾液蒸干,真空干燥,得2-鄰硝基苯-1-丙基碳酸醋類光敏試劑。8. 如權(quán)利要求7所述的制備方法,其特征在于:所述步驟A中有機溶劑選自二氯甲燒,Ξ 氯甲燒,乙酸乙醋或甲苯中的一種。9. 如權(quán)利要求7所述的制備方法,其特征在于:所述步驟A中2-鄰硝基苯-1-丙醇、碳酸 二醋類試劑或幾基二挫類試劑、Ξ乙胺在有機溶劑中的濃度分別為0.40-0.65111〇1/1、0.50- 0.75mol/L、0.4〇-〇.65mol/L。10.如權(quán)利要求7所述的制備方法,其特征在于:所述步驟A碳酸二醋類試劑選自雙(對 硝基苯)碳酸醋、雙(五氣苯)碳酸醋、碳酸二-2-化晚醋、N,N'-班巧酷亞胺基碳酸醋中的一 種;幾基二挫類試劑選自N'N-幾基二咪挫、N' N-幾基二(2-甲基咪挫),N' N-幾基二(1,2,4- Ξ氮挫)中的一種。
【文檔編號】C07C205/43GK105968016SQ201610325613
【公開日】2016年9月28日
【申請日】2015年2月12日
【發(fā)明人】石平, 林金來
【申請人】石平, 林金來