與自殺風(fēng)險關(guān)聯(lián)的遺傳標(biāo)志物及其使用方法
【專利摘要】本文提供SEQ ID No:1?5定義的多態(tài)性標(biāo)志物，其與自殺風(fēng)險相關(guān)聯(lián)。還提供使用該標(biāo)志物的方法以及鑒定是否存在標(biāo)志物的試劑盒。
【專利說明】與自殺風(fēng)險關(guān)聯(lián)的遺傳標(biāo)志物及其使用方法 發(fā)明領(lǐng)域
[0001] 本文設(shè)及自殺的風(fēng)險標(biāo)志物。更具體的，本發(fā)明設(shè)及與自殺風(fēng)險關(guān)聯(lián)的遺傳標(biāo)志 物。
[0002] 發(fā)明背景
[0003] 每年自殺奪取100萬人的性命，每個成功的自殺中都有20次自殺企圖，使其變成重 要的公眾健康問題。超過90%的自殺受害者具有至少一次精神診斷，包括雙相性障礙 (Mann，2002)，其中多至8 %的雙相性患者(跟蹤多至40年)死于自殺（1，2)。
[0004] 自殺具有顯性遺傳組分(3中綜述）。家族中的自殺企圖發(fā)生更加頻繁(Johnson等， 1998;Brent等，2002)。在同卵雙胞胎中觀察到比異卵雙胞胎更高的一致性(4,5)。一致的表 型包括成功和企圖自殺(4)。雙胞胎研究的綜述估計自殺行為的遺傳性高至55% (6)。
[0005] 許多關(guān)聯(lián)研究已針對自殺進(jìn)行(7,8)。它們在染色體2的短臂上的發(fā)現(xiàn)隨后在162 個雙相性癥狀家族中得到再現(xiàn)(9)。近期技術(shù)的發(fā)展使得可W對基因組上成百上千的單核 巧酸多態(tài)性進(jìn)行高通量基因分型。出現(xiàn)許多啟發(fā)性發(fā)現(xiàn)（10,11)。近期，報道了2689個雙相 素亂患者的樣品的基因組水平相關(guān)性研究(GWAS)，其中1201個人之前具有自殺企圖。從其 發(fā)現(xiàn)的樣品（GAIN，TGEN，德國）與其重復(fù)雙相性素亂樣品（STEP-BD，WTCCC，UCL)中用p< lxl(T3對標(biāo)志物進(jìn)行元分析后，最顯著相關(guān)的標(biāo)志物是染色體區(qū)域化25處的基因間區(qū)段中 的rs300774,其含甜3YL1，ACP1和FAM150B基因。死后前額皮質(zhì)基因表達(dá)分析支持了該關(guān)聯(lián) 性發(fā)現(xiàn)，其中發(fā)現(xiàn)自殺成功者比非自殺受害者具有顯著更高的ACPI表達(dá)（12)。從雙相性素 亂的自殺企圖的其他GWAS (STEP-BD，WTCCC，U化）中得到的最強(qiáng)關(guān)聯(lián)信號來自基因間區(qū)染色 體10標(biāo)志物rsl466846;該發(fā)現(xiàn)并未在重復(fù)樣品中再現(xiàn)(GAINJGEN，德國）（10)。用RADIANT 研究的大部分抑郁樣品進(jìn)行基于自殺行為評分的GWAS(源自SCAN面談）（11)。自殺行為評分 獲取自殺想法到企圖的自殺嚴(yán)重度。RADIANT樣品中最顯著的發(fā)現(xiàn)未能在德國重復(fù)樣品中 再現(xiàn)。
[0006] 當(dāng)前，缺少自殺行為的有意義的遺傳預(yù)測物。因此，本領(lǐng)域需要診斷方法和測試W 鑒定對象的自殺風(fēng)險。此外，本領(lǐng)域需要可用于鑒定對象自殺風(fēng)險的遺傳標(biāo)記物和試劑盒。

【發(fā)明內(nèi)容】

[0007] 本文設(shè)及自殺的風(fēng)險標(biāo)志物。更具體的，本發(fā)明設(shè)及自殺的遺傳風(fēng)險標(biāo)記物及其 應(yīng)用。
[000引根據(jù)本發(fā)明，提供鑒定自殺風(fēng)險對象的方法，包括鑒定對象的生物樣品中與自殺 關(guān)聯(lián)的一種或多種遺傳標(biāo)志物，其中至少一種標(biāo)志物由rs2491144(SEQ ID NO: 1)限定，其 中標(biāo)志物rs2491144上存在G等位基因則鑒定所述對象自殺風(fēng)險增加。
[0009]根據(jù)本發(fā)明，提供上述方法，并且還包含鑒定對象的生物樣品中與自殺關(guān)聯(lián)的一 種或多種其他遺傳標(biāo)志，所述一種或多種其他遺傳標(biāo)志通過由rs9315639(SEQ ID N0:2)、 rsll082138(沈Q ID N0:3)、rsll697517(SEQ ID N0:4)、和rs2186437(SEQ ID N0:5)組成 的組限定，其中標(biāo)志物rs9315639上存在C等位基因、標(biāo)志物rsll082138上存在C等位基因、 標(biāo)志物rsll697517上存在T等位基因和標(biāo)志物rs2186437上存在C等位基因中任一則鑒定所 述對象自殺風(fēng)險增加。
[0010] 根據(jù)本發(fā)明，還提供上述方法并且其還包括從對象獲取生物樣品的步驟。
[0011] 根據(jù)本發(fā)明，還提供上述方法并且其中所述生物樣品是來自血液、唾液、脊髓液、 腦活檢物的樣品、獲自對象的培養(yǎng)細(xì)胞、糞便、尿液、尸檢樣品，或獲取用于組織學(xué)目的的冷 凍切片。
[0012] 根據(jù)本發(fā)明，還提供上述方法并且其中從所述對象的生物樣品鑒定與自殺有關(guān)的 一種或多種遺傳標(biāo)志物的步驟包括PCR分析、測序、5'外切核酸酶巧光分析、探針雜交或其 組合。
[0013] 根據(jù)本發(fā)明，還提供上述方法并且其中所述對象是診斷為患有精神疾病的對象。
[0014] 根據(jù)本發(fā)明，還提供上述方法并且其中所述精神疾病選自抑郁、精神分裂癥、情感 分裂病癥、雙相型障礙、人格障礙、季節(jié)性情感障礙、焦慮性障礙和創(chuàng)傷后應(yīng)激障礙。
[0015] 根據(jù)本發(fā)明，還提供上述方法并且其中所述對象表現(xiàn)出精神疾病的一種或多種臨 床癥狀。
[0016] 根據(jù)本發(fā)明，還提供上述方法并且其中所述對象表現(xiàn)出選自抑郁、精神分裂癥、情 感分裂病癥、雙相型障礙、人格障礙、季節(jié)性情感障礙、焦慮性障礙和創(chuàng)傷后應(yīng)激障礙的精 神疾病的一種或多種癥狀。
[0017] 根據(jù)本發(fā)明，還提供上述方法并且其還包含在電腦系統(tǒng)中接收對象的與自殺關(guān)聯(lián) 的一種或多種遺傳標(biāo)志物的基因型，并且鑒定步驟通過所述電腦系統(tǒng)進(jìn)行。
[0018] 根據(jù)本發(fā)明，還提供上述方法并且其中所述對象的基因型直接接收自用于測定患 者基因型的設(shè)備。
[0019] 根據(jù)本發(fā)明，還提供上述方法并且其還包括在計算機(jī)系統(tǒng)中接收患者診斷。
[0020] 根據(jù)本發(fā)明，還提供上述方法并且其還包括輸出對象是否具有增加的自殺風(fēng)險的 指示的步驟。
[0021] 根據(jù)本發(fā)明，還提供上述方法并且其中對象是否具有增加的自殺風(fēng)險的指示體現(xiàn) 在患者具體報告中。
[0022] 根據(jù)本發(fā)明，還提供含可執(zhí)行指令的計算機(jī)可讀介質(zhì)，執(zhí)行所述指令引起一個或 多個處理器進(jìn)行如下操作：
[0023] 接受對象的與自殺關(guān)聯(lián)的一種或多種遺傳標(biāo)志物的基因型，所述遺傳標(biāo)志物選自 rs2491144(SEQ ID NO:1)^rs9315639(SEQ ID NO:2)^rsl1082138(SEQ ID N0:3)^ rsll697517(沈Q ID N0:4)和rs2186437(沈Q ID N0:5);
[0024] 鑒定是否存在下述中的任一:標(biāo)志物rs2491144(SEQ ID N0:1)中的G等位基因、標(biāo) 志物 rs9315639(SEQ ID N0:2)中的 C 等位基因、標(biāo)志物 rsll082138(SEQ ID N0:3)中的 C 等 位基因、標(biāo)志物rsll697517(SEQ ID N0:4)中的T等位基因、和標(biāo)志物rs2186437(SEQ ID NO:5)中的C等位基因，和
[00巧]若至少存在標(biāo)志物rs2491144(SEQ ID N0:1)中的G等位基因則輸出對象的自殺風(fēng) 險增加的指示，若標(biāo)志物rs2491144(SEQ ID N0:1)中沒有G等位基因則輸出零結(jié)果。
[0026]根據(jù)本發(fā)明，還提供一種降低對象自殺風(fēng)險的方法，所述方法包括下述一個或多 個步驟，所述對象通過上述和此處所述方法被鑒定為自殺風(fēng)險增加：
[0027] a)通過藥物、非醫(yī)藥治療或其組合治療所述患者；
[002引 b)監(jiān)控所述患者；
[0029] C)勸導(dǎo)所述患者；
[0030] d)就精神疾病或與精神疾病或自殺關(guān)聯(lián)的一種或多種癥狀對所述對象進(jìn)行測試 或篩選；
[0031] e)就一種或多種其他遺傳標(biāo)志物、核巧酸序列、蛋白質(zhì)、代謝物或其任何組合測試 獲自所述對象的含有基因組DNA的生物樣品或第二生物樣品；
[0032] f)移除或減少與增加自殺風(fēng)險的化合物、組合物、制品或提示的接觸，或
[0033] 它們的任意組合。
[0034] 根據(jù)本發(fā)明，還提供上述方法并且其中用藥物治療所述患者包括給予一種或多種 抗精神病藥、情緒穩(wěn)定劑、抗抑郁藥、抗驚厥藥、抗焦慮藥或其任意組合。
[0035] 根據(jù)本發(fā)明，還提供上述方法并且其中所述藥物包括氯氮平、裡或氯胺酬。
[0036] 根據(jù)本發(fā)明，還提供上述方法并且其中所述非醫(yī)藥治療包括電驚厥、或電休克治 療、磁癒痛治療、經(jīng)煩磁刺激、認(rèn)知行為治療、辯證行為治療、風(fēng)險消散組治療、深度腦刺激、 或其組合。
[0037] 根據(jù)本發(fā)明，還提供上述方法并且其中就精神疾病或與精神疾病或自殺關(guān)聯(lián)的一 種或多種癥狀對所述對象進(jìn)行測試或篩選包括就抑郁、精神分裂癥、情感分裂病癥、雙相型 障礙、強(qiáng)迫癥、人格障礙、季節(jié)性情感障礙、成癒、濫用藥物、酒精中毒、賭博成癒、焦慮增加、 焦慮性障礙、感覺無用、精神癥狀、妄想、幻覺、憂慮、不安、易怒、侵略性或憤怒對所述對象 進(jìn)行測試或篩選。
[0038] 根據(jù)本發(fā)明，還提供包含下述的試劑盒，
[0039] a) -種或多種引物，用W擴(kuò)增含下述定義的多態(tài)性的核巧酸序列：
[0040] 含所述多態(tài)性位置的rs2491144(SEQ ID N0:1)或其片段，或含所述多態(tài)性位置的 SEQ ID NO: 1的互補(bǔ)物或其片段；
[0041 ] 含所述多態(tài)性位置的'39315639(569 10^:2)或其片段，或含所述多態(tài)性位置的 SEQ ID NO:2的互補(bǔ)物或其片段；
[0042] 含所述多態(tài)性位置的rsll082138(SEQ ID N0:3)或其片段，或含所述多態(tài)性位置 的SEQ ID NO:3的互補(bǔ)物或其片段；
[0043] 含所述多態(tài)性位置的rsll697517(SEQ ID N0:4)或其片段，或含所述多態(tài)性位置 的SEQ ID NO:4的互補(bǔ)物或其片段；
[0044] 含所述多態(tài)性位置的'32186437(569 10^:5)或其片段，或含所述多態(tài)性位置的 SEQ ID NO:5的互補(bǔ)物或其片段；
[0045] 或它們的任意組合；
[0046] b)在含所述多態(tài)性位置的核巧酸區(qū)域上與SEQ ID N0:l、2、3、4或5或其互補(bǔ)物雜 交的一種或多種探針，其中所述探針在所述多態(tài)性位置與多態(tài)性的特定變體雜交；
[0047] C)含緩沖液、核巧酸、DNA擴(kuò)增酶或其任意組合的一種或多種試劑和/或產(chǎn)品；
[004引 d)對SEQ ID N0:l、2、3、4、5、其互補(bǔ)物、或它們的任何組合的多態(tài)性進(jìn)行基因分型 的一種或多種試劑、組分和/或產(chǎn)品，
[0049] e)進(jìn)行用于確定SEQ ID N0:l、2、3、4、5、其互補(bǔ)物、或它們的任何組合的序列的 DM測序反應(yīng)的一種或多種試劑、組分和/或產(chǎn)品，
[0050] f)含多種核巧酸序列的基因忍片或核巧酸序列陣列，所述核巧酸序列包含SEQ ID NO: 1-5、其含所述多態(tài)性位置的片段、或它們的互補(bǔ)物中的任一或組合，或由運(yùn)些物質(zhì)組 成；
[0051] g)使用本文所述組分、實踐本文所述方法、解釋獲自實踐所述方法的數(shù)據(jù)、或它們 的任意組合的一個或多個說明書；
[0052] h)可用于測試、診斷、監(jiān)控或確定對象癥狀的標(biāo)尺、參照等；
[0化3] 或a)-h)的任何組合或亞組合。
[0054]根據(jù)本發(fā)明，還提供上述試劑盒并且其包含，
[0化5] a) - 種或多種引物，用W擴(kuò)增含rs2491144(SEQ ID N0:l)、rs9315639(SEQ ID N0:2)、rsll082138(SEQ ID N0:3)、rsll697517(SEQ ID N0:4)、rs2186437(SEQ ID N0:5) 或其任意組合所定義的多態(tài)性的核巧酸序列；
[0056] b)在含所述多態(tài)性位置的核巧酸區(qū)域上與SEQ ID N0:l、2、3、4或5雜交的一種或 多種探針，其中所述探針在所述多態(tài)性位置與多態(tài)性的特定變體雜交；
[0057] C)含緩沖液、核巧酸、DNA擴(kuò)增酶或其任意組合的一種或多種試劑和/或產(chǎn)品；
[0化引 d)對SEQ ID ^:1、2、3、4、5、或它們的組合的多態(tài)性進(jìn)行基因分型的一種或多種 試劑、組分和/或產(chǎn)品，
[0化9] e)進(jìn)行用于確定SEQ ID N0:l、2、3、4、5、或它們的組合的序列的DNA測序反應(yīng)的一 種或多種試劑、組分和/或產(chǎn)品，
[0060] f)含多種核巧酸序列的基因忍片或核巧酸序列陣列，所述核巧酸序列包含SEQ ID NO :1-5或由其組成;和
[0061] g)使用本文所述組分、實踐本文所述方法、解釋獲自實踐所述方法的數(shù)據(jù)、或它們 的任意組合的一個或多個說明書；
[0062] h)可用于測試、診斷、監(jiān)控或確定對象癥狀的標(biāo)尺、參照等；
[0063] 或a)-h)的任何組合或亞組合。
[0064] 本發(fā)明的該匯總性說明不必描述本發(fā)明的全部特征。
[0065] 附圖的簡要說明
[0066] 參照附圖，在詳述中對本發(fā)明的運(yùn)些特征和其它特征進(jìn)行更明顯的描述，在附圖 中：
[0067] 圖 1 顯示rs2491144(SEQ ID N0:l)、rs9315639(SEQ ID N0:2)、rsll082138(SEQ ID N0:3)、rsll697517(SEQ ID N0:4)和rs2186437(沈Q ID N0:5)的核巧酸序列。多態(tài)性位 置在方括號中用下劃線顯示。
[006引發(fā)明詳述
[0069] 下述描述為優(yōu)選實施方式。
[0070] 本發(fā)明提供鑒定具有自殺風(fēng)險的對象的方法，包括，
[0071] 測試含對象的基因組DNA的生物樣品W確定基因組DNA是否包含關(guān)聯(lián)自殺的一種 或多種多態(tài)性標(biāo)志物，所述多態(tài)性標(biāo)志物如下定義：1)含所述多態(tài)性位置的rs2491144(SEQ ID NO: 1)或其片段，或含所述多態(tài)性位置的SEQ ID NO: 1的互補(bǔ)物或其片段的核巧酸序列； 2)含所述多態(tài)性位置的rs9315639(SEQIDN0:2)或其片段，或含所述多態(tài)性位置的 rs9315639(SEQ ID N0:2)的互補(bǔ)物或其片段的核巧酸序列；3)含所述多態(tài)性位置的 rsll082138(沈Q ID N0:3)或其片段，或含所述多態(tài)性位置的rsll082138(SEQ ID N0:3)的 互補(bǔ)物或其片段的核巧酸序列;含所述多態(tài)性位置的rsll697517(SEQ ID N0:4)或其片段， 或含所述多態(tài)性位置的rsll697517(SEQ ID N0:4)的互補(bǔ)物或其片段的核巧酸序列;含所 述多態(tài)性位置的rs2186437(SEQ ID N0:5)或其片段，或含所述多態(tài)性位置的rs2186437 (SEQ ID N0:5)的互補(bǔ)物或其片段的核巧酸序列;其中，標(biāo)志物rs2491144中存在G等位基因 則鑒定所述對象自殺風(fēng)險增加、標(biāo)志物rs9315639中存在C等位基因則鑒定所述對象自殺風(fēng) 險增加、標(biāo)志物rsl 1082138中存在C等位基因則鑒定所述對象自殺風(fēng)險增加、標(biāo)志物 rsll697517中存在T等位基因則鑒定所述對象自殺風(fēng)險增加、并且標(biāo)志物rs2186437中存在 C等位基因則鑒定所述對象自殺風(fēng)險增加。
[0072] 優(yōu)選所述標(biāo)志物的片段為SEQ ID NO: 1-5中所述標(biāo)志物或其互補(bǔ)物的至少7個連 續(xù)核巧酸，例如7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、 29、30、31、32、33、：34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、或50個連續(xù)核巧 酸。
[0073] 本發(fā)明還提供鑒定具有自殺風(fēng)險的對象的方法，包括，
[0074] 測試含對象的基因組DNA的生物樣品W確定基因組DNA是否包含關(guān)聯(lián)自殺的一種 或多種多態(tài)性標(biāo)志物，所述多態(tài)性標(biāo)志物如下定義:rs2491144(SEQIDN0:l)、rs9315639 (SEQIDN0:2)、rsll082138(SEQIDN0:3)、rsll697517(SEQIDN0:4)、rs2186437(WQIDN0:5) 或其組合，
[00巧]其中，標(biāo)志物rs2491144中存在G等位基因則鑒定所述對象自殺風(fēng)險增加、標(biāo)志物 rs9315639中存在C等位基因則鑒定所述對象自殺風(fēng)險增加、標(biāo)志物rsll082138中存在C等 位基因則鑒定所述對象自殺風(fēng)險增加、標(biāo)志物rsll697517中存在T等位基因則鑒定所述對 象自殺風(fēng)險增加、并且標(biāo)志物rs2186437中存在C等位基因則鑒定所述對象自殺風(fēng)險增加。
[0076] 在優(yōu)選實施方式中，標(biāo)志物是rs2491144。在其他實施方式中，所述一種或多種標(biāo) 志物是 rs2491144W 及下述的至少一種：'39315639，'311082138，^11697517和^2186437。 在另一實施方式中，所述標(biāo)志物是rs2491144并且該標(biāo)志物與一種或多種本領(lǐng)域已知用于 預(yù)測自殺風(fēng)險和/或精神疾病的其他遺傳標(biāo)志物組合使用。
[0077] 在本發(fā)明的其他實施方式中，所述方法可如上實施，但測試生物樣品包括測試生 物樣品中的對象基因組DNAW確定所述基因組DNA是否包含具有多態(tài)性的一種或多種標(biāo)志 物，所述標(biāo)志物具有與所述標(biāo)志物90%-100%的序列相同性，例如但不限于與SEQ ID NO: 1、沈Q ID N0:2、SEQ ID N0:3、SEQ ID N0:4或沈Q ID:N0:5或其片段具有90%、91%、92%、 93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、99.5%、99.9% 或100% 的序列相同性，并且其中 所述序列還包含上述下劃線括號中所示的相應(yīng)的多態(tài)性。本領(lǐng)域技術(shù)人員應(yīng)理解，還可能 確定與所述序列的互補(bǔ)物具有上述范圍的序列相同性的序列。例如，但不W任何方式限制， SEQ ID NO: 1中所示的第一核巧酸是"C"。本發(fā)明意在包括與SEQ ID NO: 1基本相同但(例 如）在位置編號1處包含不同核巧酸例如"護(hù)的序列，由于該變體核巧酸序列顯示與SEQ ID NO: 1有大于90%的序列相同性，并且包含W下劃線括號所示的多態(tài)性。
[0078] 為了確定核酸或DNA是否與本文所示的序列顯示相同性或相同性百分比，可采用 寡核巧酸比對算法，例如但不限于，BLAST(GenBank URL:麗w.ncbi .nlm.nih.gov/cgi-bin/ BLAST/，采用默認(rèn)參數(shù):程序:blastn;數(shù)據(jù)庫:非冗余;期望10;濾器:默認(rèn);對比：成對;查詢 遺傳密碼：標(biāo)準(zhǔn)（1))，BLAST2(EMI3L URL:http: //ww. embl-heidelberg. de/Services/ index.html采用默認(rèn)參數(shù):Mat;rix化OSUM62;濾器：默認(rèn)，回波濾波器:開，期望：10,截止 值:默認(rèn)；鏈:兩條；描述：50,比對：50)，或FASTA，檢索，采用默認(rèn)參數(shù)。也可用多膚比對算 法，例如但不限于，BLAST 2序列（WWW.ncbi .nlm.nih.gov/blast/bl2seq/bl2 .html，采用默 認(rèn)參數(shù)程序:blastp;矩陣:BL0SUM62;開放缺口（ 11)和延伸缺口（ 1)罰分;缺口 xj華低:50; 期望10;字長:3;濾器:默認(rèn)）。
[0079] 兩條核酸序列基本相同的其他指示是運(yùn)兩條序列在中等嚴(yán)謹(jǐn)(或優(yōu)選嚴(yán)謹(jǐn))條件 下彼此雜交。在中等嚴(yán)謹(jǐn)條件下與濾器結(jié)合的序列的雜交可W，例如，在0.5M化HP化、7% 十二烷基橫酸鋼（SDS)、lmM抓TA中于65°C下進(jìn)行，并且在0.2x SSC/0.1%SDS于42°C下清 洗至少1小時（參見Ausubel等（編），1989,《新編分子生物學(xué)方案KCurrent Protocols in Molecular Biology),第1 卷，格林出版聯(lián)合公司（Green Publishing Associates,Inc.)和 約翰威利父子公司(John Wi 1巧&Sons，Inc.)，紐約，第2.10.3頁）。或者，在嚴(yán)謹(jǐn)條件下與濾 器結(jié)合的序列的雜交可W，例如，在0.5M化HP化、7%SDS、lmM抓TA中于65°C下進(jìn)行，并在 O.lx SSC/0.1%SDS中于68°C清洗至少1小時。雜交條件可根據(jù)已知方法，視感興趣的序列 而改變(參見Tijssen，1993,《生物化學(xué)與分子生物學(xué)中的實驗室技術(shù)一一與核酸探針雜 交》（Laboratory Techniques in Biochemistry and Molecular Biology-- Hybridization with Nucleic Acid Probes),部分I，第2章"雜交原理概況與核酸探針試 驗策略"，埃斯維爾出版社化Isevier)，紐約）。通常，但不限于此，嚴(yán)謹(jǐn)條件選擇為比特定序 列在確定離子強(qiáng)度和抑下的熱解鏈點(diǎn)低約5°C。
[0080] 在本發(fā)明的一個實施方式中，不意在W任何方式限制，本文所述的方法可用于鑒 定、治療或預(yù)防性治療有自殺風(fēng)險的對象，其中測試或篩選時對象看起來健康。該信息在測 試/篩選具有自殺或自殺企圖或精神疾病的家族史的對象時可能是重要的，包括但不限于 雙相性疾病、精神分裂或其他精神疾病，盡管在測試/篩選時，該對象可能幾乎不具有或沒 有疾病癥狀或為未顯示與自殺關(guān)聯(lián)的癥狀。知曉對象具有關(guān)聯(lián)自殺高風(fēng)險的一種或多種遺 傳標(biāo)志物可在許多方面有用，例如，采取主動措施W在可能的最早時間降低自殺風(fēng)險，或若 例如對象之后發(fā)展出精神疾病例如但不限于雙相性疾病、精神分裂或其他精神疾病病需要 治療的時候開發(fā)治療方案。
[0081] 本發(fā)明還考慮上述方法，其還包括降低對象自殺風(fēng)險的一個或多個步驟。該步驟 可包括但不限于用藥物治療對象，所述藥物例如一種或多種抗精神病藥(包括典型和非典 型抗精神病藥）、情緒穩(wěn)定劑、抗抑郁藥、抗驚厥藥，或其他類型藥物例如但不限于裡、氯氮 平或氯胺酬。
[0082] 術(shù)語"抗精神病藥"或"抗精神病藥物"表示可用于預(yù)防和/或治療精神病、精神分 裂、情感分裂障礙、破壞行為、思維混亂、狂躁癥或其任何組合的任何藥、藥物、天然產(chǎn)物、組 合物等。抗精神病藥物可包括但不限于影響多己胺信號轉(zhuǎn)導(dǎo)的藥，例如可逆或不可逆結(jié)合 一種或多種多己胺受體的藥、用作競爭性或非競爭性抑制劑W下調(diào)多己胺受體信號傳導(dǎo)的 藥、或阻礙多己胺D2受體的藥(參見例如Seeman等，1976和Seeman等,2005)。不受理論限制， 抗精神病藥包括氯氮平、奧氮平、=氣拉嗦、硫利達(dá)嗦、氣贓晚醇、氣贓晚醇癸酸、氨諷嚷噸、 氯丙嗦、氣奮乃靜、洛沙平、奮乃靜、奮乃靜癸酸、奮乃靜-阿米替林、乙酷奮乃靜、嗎巧酬、美 索達(dá)嗦、氣奮乃靜癸酸、甲氧異下嗦、利培酬、阿立贓挫或其組合。在優(yōu)選實施方式中，抗精 神病藥包括氯氮平或含氯氮平的組合治療。
[0083] 對象還可用一種或多種非醫(yī)藥治療單獨(dú)治療或與藥物治療組合治療。該非醫(yī)藥治 療包括但不限于電驚厥治療或電休克治療、經(jīng)煩磁刺激、認(rèn)知行為治療、辯證行為治療、風(fēng) 險消散組治療、或其組合。
[0084] 還考慮對象可經(jīng)歷監(jiān)控，例如醫(yī)師、臨床醫(yī)生、健康護(hù)理人員或家庭成員提供的更 頻繁或強(qiáng)烈的監(jiān)控?；蛘?，或與上述組合，所述對象可經(jīng)歷醫(yī)師、屯、理學(xué)家、健康護(hù)理人員等 的咨詢。
[0085] 所述方法還考慮就一種或多種精神疾病或與精神疾病或自殺關(guān)聯(lián)的一種或多種 癥狀對所述對象進(jìn)行測試或篩選的實施方式。該精神疾病可包括但不限于抑郁、精神分裂 癥、情感分裂病癥、雙相型障礙、強(qiáng)迫癥、人格障礙、季節(jié)性情感障礙、情緒障礙、創(chuàng)傷后應(yīng)激 障礙、成癒、濫用藥物、酒精中毒、賭博成癒等。與精神疾病關(guān)聯(lián)的癥狀本領(lǐng)域已知且可獲自 本領(lǐng)域已知的精神診斷手冊，例如精神障礙的診斷和統(tǒng)計手冊(DSM IV)等。可與自殺關(guān)聯(lián) 的癥狀包括焦慮增加、感覺無用、精神癥狀、妄想、幻覺、憂慮、不安、易怒、侵略性或憤怒。
[0086] 如上所述，但不W任何方式進(jìn)行限制，經(jīng)測試的患者可包括診斷為精神疾病的個 體或表現(xiàn)精神疾病的一種或多種癥狀的個體，所述癥狀例如但不限于抑郁、雙相性癥狀、精 神癥狀、精神分裂癥狀、情感分裂癥狀或其組合，例如但不限于DSM-IV所述，其通過引用納 入本文。精神病癥狀可包括陽性癥狀，例如但不限于推理思維（即妄想）、知覺（即幻覺）、語 言與溝通（雜亂的言辭）和行為（嚴(yán)重素亂或緊張癥行為）的扭曲或夸張或其任何組合。此 夕h陽性癥狀可包括不同程度，例如，精神病程度包括但不限于妄想和幻覺，而分裂程度包 括但不限于雜亂的言辭和行為。如上所述，還考慮所述癥狀可包含一種或多種陰性癥狀，例 如但不限于，反映減少或喪失正常功能的癥狀。此外，所述對象可顯示陽性和陰性癥狀的組 合。在本發(fā)明的一個優(yōu)選實施方式中，經(jīng)測試的對象已被診斷或疑似患有雙相性癥狀、精神 分裂癥或情感分裂病癥。
[0087] 上述方法還考慮就一種或多種其他遺傳標(biāo)志物、核巧酸序列、蛋白質(zhì)、代謝物或其 任何組合測試獲自所述對象的含有DNA的生物樣品或第二生物樣品。例如但不W任何方式 限制，可就本領(lǐng)域已知的關(guān)聯(lián)自殺想法或精神疾病(包括但不限于雙相性疾病、精神分裂、 情感分裂等）的其他遺傳標(biāo)志物測試對象的相同或不同生物樣品。還可就預(yù)測藥物治療結(jié) 果的標(biāo)志物或有助于確定藥物治療的標(biāo)志物測試對象。相似地，對象可經(jīng)測試W確定血液 中是否存在酒精或藥物，或確定血液中酒精或藥物的水平，因已知酒精和藥物使用可能是 自殺趨勢的導(dǎo)致因素，且還可與藥物治療方案相互作用。
[008引本文所述方法還考慮移除或減少與可能增加自殺風(fēng)險的化合物、組合物、制品或 提示例如酒精、藥物等的接觸。
[0089] 本發(fā)明還提供在測試生物樣品之前診斷對象具有精神疾病或表現(xiàn)精神疾病的一 種或多種癥狀的方法。例如，本發(fā)明提供：
[0090] 鑒定對象的自殺風(fēng)險的方法，所述對象被診斷患有精神疾病或表現(xiàn)出精神疾病的 一種或多種癥狀，所述方法包括，
[0091] 測試含對象的基因組DNA的生物樣品W確定基因組DNA是否包含一種或多種標(biāo)志 物，所述標(biāo)志物如下定義：rs2491144(SEQIDN0:l)、rs9315639(SEQIDN0:2)、rsll082138 (56910^:3)^311697517(56910^:4)^32186437(沈910^:5)或其組合，其中
[0092] 標(biāo)志物rs2491144中存在G等位基因則鑒定所述對象的自殺風(fēng)險增加，
[0093] 標(biāo)志物rs9315639中存在C等位基因則鑒定所述對象的自殺風(fēng)險增加，
[0094] 標(biāo)志物rsl 1082138中存在C等位基因則鑒定所述對象的自殺風(fēng)險增加，
[00M] 標(biāo)志物rsll697517中存在T等位基因則鑒定所述對象的自殺風(fēng)險增加，和
[0096] 標(biāo)志物rs2186437中存在C等位基因則鑒定所述對象的自殺風(fēng)險增加。
[0097] 因此，根據(jù)本發(fā)明，本文所述方法還可包括選擇被診斷患有精神疾病或表現(xiàn)出關(guān) 聯(lián)自殺或精神疾病的一種或多種癥狀的對象并從該對象獲取生物樣品。
[0098] 任意組織樣品可用于對SEQ ID NO: 1-5中的多態(tài)性進(jìn)行基因分型，包括但不限于 血液、唾液、脊髓液、腦活檢物、獲自對象的培養(yǎng)細(xì)胞、糞便、尿液、尸檢樣品，或獲取用于組 織學(xué)目的的冷凍切片。在優(yōu)選實施方式中，血液獲自對象用于針對上述多態(tài)性進(jìn)行分析。例 如，但不W任何方式限制，采用標(biāo)準(zhǔn)靜脈穿刺技術(shù)從對象獲取靜脈血液。
[0099] 多態(tài)性可W采用常規(guī)技術(shù)來基因分型。例如，采用納入巧光探針的引物的PCR是一 項合適的技術(shù)。此外，但不意在限制，可采用具有所述多態(tài)性位點(diǎn)上游和下游的合適的序列 的引物來擴(kuò)增包含所述多態(tài)性的核巧酸區(qū)域。
[0100] 單核巧酸多態(tài)性（SNP)分析可用于檢測基因或核巧酸序列的等位基因之間的差 異。如上所述，本領(lǐng)域中現(xiàn)有的用于核巧酸序列的基因分型的多種方法包括但不限于5'外 切核酸酶分析、核巧酸測序、探針雜交等。本文意在涵蓋所有此類方法。此外，可用于檢測 SNP的多種實時PCR方法，包括例如，基于化qman或分子信標(biāo)的分析(美國專利號5，210，015; 5，487，972;和PCT W0 95/13399)，可用于監(jiān)測是否存在SNP。而其他SNP檢測方法是本領(lǐng)域 已知的，包括但不限于，DNA測序、通過雜交的測序、點(diǎn)印跡、和寡核巧酸陣列(DNA忍片）雜交 分析。
[0101] 應(yīng)用生物系統(tǒng)公司（Applied Biosystems，Inc)(加利福尼亞福斯特城）已經(jīng)開發(fā) 了數(shù)個方面的SNP基因分型技術(shù)。在一個成熟使用的方案中，采用祀向引物對所需的SNP區(qū) 域進(jìn)行PCR擴(kuò)增，包括兩個等位基因-特異性巧光探針，其各自由不同的巧光報告染料和巧 光澤滅劑組成。在PCR之前，澤滅劑與巧光團(tuán)的接近造成巧光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET),減少了 來自報告染料的巧光。在PCR過程中，Taq的5'核酸酶活性消化了結(jié)合至SNP區(qū)域的等位基 因-特異性探針，從澤滅劑釋放巧光染料并允許生成巧光信號。
[0102] 在一個優(yōu)選實施方式中，相對于多態(tài)性位點(diǎn)（例如SEQ ID NO: 1-5提供）的上游或 下游附近核巧酸序列，確定所述多態(tài)性位點(diǎn)處特定等位基因的存在，例如但不限于，所述多 態(tài)性位點(diǎn)上游約3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14或15個核巧酸和/或下游約3、4、5、6、7、8、 9、10、11、12、13、14或15個核巧酸。然而，本發(fā)明還考慮，可相對于包含由沈9 10^:1-5分 別確定的多態(tài)性位點(diǎn)的上游約20、25、30、50或更多（或其間任何數(shù)字)核巧酸和下游約20、 25、30、50和/或更多（或其間任何數(shù)字)核巧酸的核巧酸序列來確定特定等位基因的存在。 術(shù)語"和/或"用于特別指示連續(xù)上游和下游核巧酸的數(shù)量不必相同。本發(fā)明實踐中可采用 本領(lǐng)域技術(shù)人員已知的比較核巧酸序列W確定對象中是否存在特定多態(tài)性或多態(tài)性的組 的其他手段和方法。
[0103] 獲取并分析其核巧酸序列或DNA的方法并非本發(fā)明的關(guān)鍵，并且可采用任何方法 (例如Ausubel等（編），1989,《新編分子生物學(xué)方案KCurrent Protocols in Molecular Biology),格林出版社聯(lián)合公司和約翰威利父子公司，紐約，第2.10.3頁，或Maniatis等，刊 于《分子克隆（實驗室手冊）》(Molecular Cloning(A Laboratoiy Manual))，冷泉港實驗室 出版社（Cold Spring Harbor Laboratory) ,1982,第387 389頁）。例如，不W任何方式限 制，DNA可采用無酶高鹽方法提取?；蛘撸珼NA可經(jīng)原位分析。還可采用本領(lǐng)域技術(shù)人員已知 的其他DNA分析方法。對于存在于基因序列的外顯子內(nèi)并表達(dá)的核巧酸序列，其產(chǎn)生的RNA 可經(jīng)分離并通過本領(lǐng)域已知的方法進(jìn)行分析，其包括在本發(fā)明所述方法內(nèi)。
[0104] 本發(fā)明還提供試劑盒，其包含，
[0105] a)用于擴(kuò)增包含下述多態(tài)性的核巧酸序列的一種或多種引物:rs2491144(SEQ ID ^:1)或其包含所述多態(tài)性位置的片段;'39315639(569 10^:2)或其包含所述多態(tài)性位 置的片段;rsll082138(SEQ ID N0:3)或其包含所述多態(tài)性位置的片段;rsll697517(SEQ ID N0:4)或其包含所述多態(tài)性位置的片段;rs2186437(SEQ ID N0:5)或其包含所述多態(tài)性 位置的片段，或其任意組合。本領(lǐng)域技術(shù)人員應(yīng)理解，還可使用含上述序列的互補(bǔ)核巧酸的 引物或由其組成的引物，其為與上述序列或與之互補(bǔ)的序列具有約90-100%序列相同性， 例如但不限于 90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、99.5%、99.9%或 100%序列相同性的序列；
[0106] b)在含所述多態(tài)性位置的核巧酸區(qū)域上與SEQ ID N0:l、2、3、4、5、其含所述多態(tài) 性位置的片段或其互補(bǔ)序列雜交的一種或多種探針，其中所述探針在所述多態(tài)性位置與多 態(tài)性的特定變體雜交。不W任何方式限制，所述探針可用合適基團(tuán)標(biāo)記，例如，巧光標(biāo)簽、巧 光團(tuán)、放射性標(biāo)記物等。此外，一種或多種探針可共價連接或物理聯(lián)接至支持物，例如但不 限于，生物忍片、陣列、載玻片、多孔板、珠等。在一個實施方式中，但不W任何方式限制，所 述探針可包含核酸的陣列；
[0107] C)含緩沖液、核巧酸、DNA擴(kuò)增酶或其任意組合的一種或多種試劑和/或產(chǎn)品；
[010引 d)對SEQ ID ^:1、2、3、4、5、或它們的組合的多態(tài)性進(jìn)行基因分型的一種或多種 試劑、組分和/或產(chǎn)品，
[0109] e)進(jìn)行用于確定SEQ ID N0:l、2、3、4、5、或它們的組合的序列的DNA測序反應(yīng)的一 種或多種試劑、組分和/或產(chǎn)品，
[0110] f)含一種或多種核巧酸序列的基因忍片或核巧酸序列陣列，所述核巧酸序列包含 SEQ ID NO: 1-5、其片段、或它們的互補(bǔ)物，或由上述物質(zhì)組成；
[0111] g)使用本文所述組分、實踐本文所述方法、解釋獲自實踐所述方法的數(shù)據(jù)、或它們 的任意組合的一個或多個說明書；
[0112] h)可用于測試、診斷、監(jiān)控或確定對象癥狀的標(biāo)尺、參照等；
[0113] 或a)-h)的任何組合或亞組合。
[0114] 本領(lǐng)域技術(shù)人員知曉，本文的主題完全可按所述的概況實踐，也可通過對本文所 述的核巧酸序列的互補(bǔ)物進(jìn)行應(yīng)用/確定/分析來實踐。
[0115] 本發(fā)明結(jié)合W下實施例做出進(jìn)一步說明。 實施例
[0116] 方法
[0117] 我們在加拿大多倫多的成癒與精神健康中屯、招募了 334名雙相性障礙患者(樣品 GBP)的樣品。GBP樣品的細(xì)節(jié)可參考前述（13)。參與者在登記時至少為18歲，自訴為歐洲血 統(tǒng)。通過在家族醫(yī)生辦公室、診所、醫(yī)院和患者支持組織處發(fā)廣告來進(jìn)行招募。他們根據(jù) DSM-IV和ICD-10標(biāo)準(zhǔn)的雙相性障礙診斷使用神經(jīng)精神臨床評估方案(SCAN)進(jìn)行確認(rèn)。排除 標(biāo)準(zhǔn)包括診斷為靜脈內(nèi)藥物依賴、報告有靜脈藥物使用、存在情緒不相合的精神癥狀、僅與 酒精、難戒癒、物質(zhì)依賴、醫(yī)藥疾病或藥物有關(guān)或由其導(dǎo)致的狂燥發(fā)作。
[0118] 基因分型。樣品GBP大部分在Illumina公司（美國加利福尼亞州圣迭戈）用 Illumina Sentrix Human Hap550Beadchip(Illumina公司）進(jìn)行基因分型，290個對象在基 因組魅北克中屯、(Montreal公司，加拿大魅北克省)進(jìn)行基因分型。
[0119] 質(zhì)量控制和統(tǒng)計分析。我們應(yīng)用與化INK( 14)和R(R開發(fā)核屯、小組（2008)，R:統(tǒng)計 學(xué)計算機(jī)處理的語言和環(huán)境。奧地利維也納：統(tǒng)計學(xué)計算的R基礎(chǔ)，ISBN3-900051-07-0，U化 ]11：化://\￥**.1?-口1'0^'6(31：.0巧)所用相同的質(zhì)量控制量度。簡而言之，將具有低于95%的基因 分型標(biāo)志物的個體移除，并且排除具有低于95%基因分型的標(biāo)志物或最小等位基因頻率低 于5%的標(biāo)志物。分析隱秘關(guān)聯(lián)性并基于缺失的表型或基因型信息的量移除各對相關(guān)個體 (PrHAT〉0.05)中的一個個體。確定平均雜合性，并移除與該平均值相差四個標(biāo)準(zhǔn)偏差的個 體。從后續(xù)分析排除基因型與哈迪-溫伯格平衡顯著偏離(p<〇.001)的標(biāo)志物。通過多維標(biāo) 準(zhǔn)化運(yùn)行基因型多維標(biāo)準(zhǔn)化(MDS)分析W確認(rèn)樣品的種族，并且移除對應(yīng)于自訴猶太人祖 先(所有四個祖父母)的離散簇。樣品精選并更新圖位置至b37后，得到308個GBP病理的438， 625個標(biāo)志物。針對所有S個樣品，在細(xì)APEIT2(16)中預(yù)移相（prephasing)后用IMPUTE2 (15)在5-Mb區(qū)段中進(jìn)行全基因組歸屬計算，使用1000基因組計劃（17)b37基因型作為參照。 然后用GT00L(遺傳軟件套(Genetics Software Suite),猶2007,牛津大學(xué)）W基因型判定 闊值0.則尋格式轉(zhuǎn)變?yōu)镻LINK。然后，在PLINK中就GBP樣品的自殺嚴(yán)重度進(jìn)行線性回歸分析。 將年齡、性別、酒精使用后障礙、抑郁發(fā)作次數(shù)、和MDS分析的前4組分作為協(xié)變量。
[0120] 發(fā)現(xiàn)染色體1上的rs2491144與GBP樣品中的自殺嚴(yán)重度關(guān)聯(lián)(p<0.05;表1)。還在 GBP樣品中發(fā)現(xiàn)許多其他標(biāo)志物的陽性結(jié)果：染色體13上的rs9315639、染色體18上的 rsll082138、染色體 20 上的 rsll697517、和染色體 21 上的 rs2186437。
[0121] 表1.GBP雙相性障礙樣品中自殺嚴(yán)重度評分的遺傳分析的發(fā)現(xiàn)概述。包含表示標(biāo) 志物效應(yīng)方向的BETA。
[0122]
[0123]表1的結(jié)果表明：
[0124] 對于rs2491144,由于肥TA為負(fù)，每個額外拷貝的測試等位基因（A)相比G等位基 因，較高的自殺嚴(yán)重度風(fēng)險得到降低。因此GG是較高風(fēng)險基因型。
[01巧]對于rs9315639,由于肥TA為負(fù)，每個額外拷貝的測試等位基因（T)相比C等位基 因，較高的自殺嚴(yán)重度風(fēng)險得到降低。因此CC是較高風(fēng)險基因型。
[01%] 對于rsll082138,由于邸TA為正，每個額外拷貝的測試等位基因（C)相比T等位基 因，較高的自殺嚴(yán)重度風(fēng)險得到提高。因此CC是較高風(fēng)險基因型。
[0127] 對于rsll697517,由于邸TA為正，每個額外拷貝的測試等位基因（T)相比C等位基 因，較高的自殺嚴(yán)重度風(fēng)險得到提高。因此TT是較高風(fēng)險基因型。
[0128] 對于rs2186437,由于肥TA為負(fù)，每個額外拷貝的測試等位基因（A)相比C等位基 因，較高的自殺嚴(yán)重度風(fēng)險得到降低。因此CC是較高風(fēng)險基因型。
[0129] 測試的一個有趣的標(biāo)志物(rs2491144)映射至編碼多配聚糖3蛋白質(zhì)的SDC3的3' 區(qū)域，其在神經(jīng)細(xì)胞中高表達(dá)（18)，并且可能在腦發(fā)育中重要（19)"sdc3缺陷型小鼠上的研 究表明該蛋白在長期增強(qiáng)和海馬記憶中的作用（20)Drs9315639標(biāo)記物映射至ST0ML3紅細(xì) 胞膜整合蛋白化PB72)-樣3基因，其似乎對感覺神經(jīng)元中機(jī)械性刺激感受器介導(dǎo)的信號轉(zhuǎn) 導(dǎo)很重要（2lKrs2186437標(biāo)志物位于0-淀粉樣蛋白（A4)前體蛋白編碼基因APP的3'端約 1.4Mb，其設(shè)及阿爾茲海默癥。
[0130] rsll082138標(biāo)志物位于稱為LINC00669(未表征的L0C647946)的非蛋白編碼RNA基 因中，其內(nèi)具有=個微RNA基因：MIR5583-5p、MIR5583-：3p和MIR924。在MIR5583-5P的預(yù)測祀 標(biāo)中，NR3C1 基因（DIANA Lab:排名#8，miTG分?jǐn)?shù)= 0.9828;mirDB:排名#25,祀標(biāo)分?jǐn)?shù)= 87) 編碼糖皮質(zhì)激素受體。顯示^3(：1啟動子甲基化受到童年創(chuàng)傷的改變(22,23)。在^1?5583- 5p的預(yù)測祀標(biāo)中，NR3C2基因化IANA Lab:排名#5，miTG分?jǐn)?shù)=0.9872;mirDB:排名#17，祀標(biāo) 分?jǐn)?shù)= 86)編碼鹽皮質(zhì)激素受體;ADRB1基因（DIANA Lab:排名#24，miTG分?jǐn)?shù)= 0.9542; mirDB:排名#35,祀標(biāo)分?jǐn)?shù)= 80)編碼m腎上腺素受體;PGR基因（DIANA Lab:排名#38，miTG 分?jǐn)?shù)= 0.9382;mirDB:排名#2,祀標(biāo)分?jǐn)?shù)= 98)編碼孕酬受體，其與F邸P5相互作用（24)并調(diào) 控F邸P5表達(dá)（25);和FMR1 基因（DIANA Lab:排名#3，miTG分?jǐn)?shù)= 0.9909;mirDB:排名#21，祀 標(biāo)分?jǐn)?shù)= 83)編碼脆性X智力低下1蛋白，其中5'非翻譯區(qū)中的（CGG)nS核巧酸的擴(kuò)增導(dǎo)致 脆性X綜合征。近期，F(xiàn)MR1中的標(biāo)志物與睡眠障礙患者的抑郁情緒關(guān)聯(lián)起來(26)，并且FMR1 前突變與下丘腦-垂體-腎上腺軸活性的改變關(guān)聯(lián)起來(27)。
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[0159] 所有文獻(xiàn)通過引用納入本文。
[0160] 本發(fā)明W關(guān)于一個或多個實施方式進(jìn)行描述。然而，本領(lǐng)域技術(shù)人員應(yīng)明了，可在 不偏離本發(fā)明權(quán)利要求限定的范圍的情況下做出多種變化形式和修改。
【主權(quán)項】
1. 鑒定自殺風(fēng)險對象的方法，包括鑒定對象的生物樣品中與自殺關(guān)聯(lián)的一種或多種遺 傳標(biāo)志物，其中至少一種標(biāo)志物由rs2491144(SEQ ID NO: 1)限定，其中標(biāo)志物rs2491144上 存在G等位基因則鑒定所述對象自殺風(fēng)險增加。2. 如權(quán)利要求1所述的方法，其還包含鑒定對象的生物樣品中與自殺關(guān)聯(lián)的一種或多 種其他遺傳標(biāo)志物，所述一種或多種其他遺傳標(biāo)志物通過由rs9315639(SEQ ID N0:2)、 rsll082138(SEQ ID N0:3)、rsll697517(SEQ ID N0:4)、和rs2186437(SEQ ID N0:5)組成 的組限定，其中標(biāo)志物rs9315639上存在C等位基因、標(biāo)志物rsll082138上存在C等位基因、 標(biāo)志物rsll697517上存在T等位基因和標(biāo)志物rs2186437上存在C等位基因中任一則鑒定所 述對象自殺風(fēng)險增加。3. 如權(quán)利要求1或2所述的方法，其還包括從所述對象獲取生物樣品的步驟。4. 如權(quán)利要求1-3中任一項所述的方法，其中所述生物樣品是來自血液、唾液、脊髓液、 腦活檢物的樣品、獲自對象的培養(yǎng)細(xì)胞、糞便、尿液、尸檢樣品，或獲取用于組織學(xué)目的的冷 凍切片。5. 如權(quán)利要求4所述的方法，其中從所述對象的生物樣品鑒定與自殺有關(guān)的一種或多 種遺傳標(biāo)志物的步驟包括PCR分析、測序、5'外切核酸酶熒光分析、探針雜交或其組合。6. 如權(quán)利要求1-5中任一項所述的方法，其中所述對象是診斷為患有精神疾病的對象。7. 如權(quán)利要求6所述的方法，其中所述精神疾病選自抑郁、精神分裂癥、情感分裂病癥、 雙相型障礙、人格障礙、季節(jié)性情感障礙、焦慮性障礙和創(chuàng)傷后應(yīng)激障礙。8. 如權(quán)利要求1-5中任一項所述的方法，其中所述對象表現(xiàn)出精神疾病的一種或多種 臨床癥狀。9. 如權(quán)利要求8所述的方法，其中所述對象表現(xiàn)出選自抑郁、精神分裂癥、情感分裂病 癥、雙相型障礙、人格障礙、季節(jié)性情感障礙、焦慮性障礙和創(chuàng)傷后應(yīng)激障礙的精神疾病的 一種或多種癥狀。10. 如權(quán)利要求1-9中任一項所述的方法，其還包括在電腦系統(tǒng)中接收對象的與自殺關(guān) 聯(lián)的一種或多種遺傳標(biāo)志物的基因型，并且鑒定步驟通過所述電腦系統(tǒng)進(jìn)行。11. 如權(quán)利要求10所述的方法，其特征在于，所述對象的基因型直接接收自用于測定患 者基因型的設(shè)備。12. 如權(quán)利要求10或11所述的方法，其還包括在計算機(jī)系統(tǒng)中接收患者診斷。13. 如權(quán)利要求10-12中任一項所述的方法，其還包括輸出對象是否具有增加的自殺風(fēng) 險的指示的步驟。14. 如權(quán)利要求13所述的方法，其中對象是否具有增加的自殺風(fēng)險的指示體現(xiàn)在患者 具體報告中。15. -種含可執(zhí)行指令的計算機(jī)可讀介質(zhì)，執(zhí)行所述指令引起一個或多個處理器進(jìn)行 如下操作： 接受對象的與自殺關(guān)聯(lián)的一種或多種遺傳標(biāo)志物的基因型，所述遺傳標(biāo)志物選自 rs2491144(SEQ ID N0:l)、rs9315639(SEQ ID N0:2)、rsll082138(SEQ ID N0:3)、 rsll697517(SEQ ID N0:4)和rs2186437(SEQ ID N0:5); 鑒定是否存在下述之一：標(biāo)志物rs2491144(SEQ ID N0:1)中的G等位基因、標(biāo)志物 rs9315639(SEQ ID N0:2)中的C等位基因、標(biāo)志物rsll082138(SEQ ID N0:3)中的C等位基 因、標(biāo)志物rsll697517(SEQ ID N0:4)中的T等位基因、和標(biāo)志物rs2186437(SEQ ID N0:5) 中的C等位基因，和 若至少存在標(biāo)志物rs2491144(SEQ ID N0:1)中的G等位基因則輸出對象的自殺風(fēng)險增 加的指示，若標(biāo)志物rs2491144(SEQ ID N0:1)中沒有G等位基因則輸出零結(jié)果。16. -種降低對象自殺風(fēng)險的方法，所述方法包括下述一個或多個步驟，所述對象通過 權(quán)利要求1-14中任一項所述的方法被鑒定為自殺風(fēng)險增加： a) 通過藥物、非醫(yī)藥治療或其組合治療所述患者； b) 監(jiān)控所述患者； c) 勸導(dǎo)所述患者； d) 就精神疾病或與精神疾病或自殺關(guān)聯(lián)的一種或多種癥狀對所述對象進(jìn)行測試或篩 選； e) 就一種或多種其他遺傳標(biāo)志物、核苷酸序列、蛋白質(zhì)、代謝物或其任何組合測試獲自 所述對象的含有基因組DNA的生物樣品或第二生物樣品； f) 移除或減少與增加自殺風(fēng)險的化合物、組合物、制品或提示的接觸，或 它們的任意組合。17. 如權(quán)利要求16所述的方法，其中用藥物治療所述患者包括給予一種或多種抗精神 病藥、情緒穩(wěn)定劑、抗抑郁藥、抗驚厥藥、抗焦慮藥或其任意組合。18. 如權(quán)利要求16所述的方法，其中所述藥物包括氯氮平、鋰或氯胺酮。19. 如權(quán)利要求16所述的方法，其中所述非醫(yī)藥治療包括電驚厥、或電休克治療、磁癲 癇治療、經(jīng)顏磁刺激、認(rèn)知行為治療、辯證行為治療、風(fēng)險消散組治療、深度腦刺激、或其組 合。20. 如權(quán)利要求16所述的方法，其中就精神疾病或與精神疾病或自殺關(guān)聯(lián)的一種或多 種癥狀對所述對象進(jìn)行測試或篩選包括就抑郁、精神分裂癥、情感分裂病癥、雙相型障礙、 強(qiáng)迫癥、人格障礙、季節(jié)性情感障礙、成癮、濫用藥物、酒精中毒、賭博成癮、焦慮增加、焦慮 性障礙、感覺無用、精神癥狀、妄想、幻覺、憂慮、不安、易怒、侵略性或憤怒對所述對象進(jìn)行 測試或篩選。21. -種試劑盒，所述試劑盒包含： a)-種或多種引物，用以擴(kuò)增含下述定義的多態(tài)性的核苷酸序列： 含所述多態(tài)性位置的rs2491144(SEQ ID ΝΟ:1)或其片段，或含所述多態(tài)性位置的SEQ ID NO: 1的互補(bǔ)物或其片段； 含所述多態(tài)性位置的rs9315639(SEQ ID N0:2)或其片段，或含所述多態(tài)性位置的SEQ ID NO :2的互補(bǔ)物或其片段； 含所述多態(tài)性位置的rsll082138(SEQ ID N0:3)或其片段，或含所述多態(tài)性位置的SEQ ID NO:3的互補(bǔ)物或其片段； 含所述多態(tài)性位置的rsll697517(SEQ ID N0:4)或其片段，或含所述多態(tài)性位置的SEQ ID NO:4的互補(bǔ)物或其片段； 含所述多態(tài)性位置的rs2186437(SEQ ID N0:5)或其片段，或含所述多態(tài)性位置的SEQ ID NO :5的互補(bǔ)物或其片段； 或它們的任意組合； b) 在含所述多態(tài)性位置的核苷酸區(qū)域上與SEQ ID N0:l、2、3、4或5或其互補(bǔ)物雜交的 一種或多種探針，其中所述探針在所述多態(tài)性位置與多態(tài)性的特定變體雜交； c) 含緩沖液、核苷酸、DNA擴(kuò)增酶或其任意組合的一種或多種試劑和/或產(chǎn)品； d) 對SEQ ID NO: 1、2、3、4、5、其互補(bǔ)物、或它們的任何組合的多態(tài)性進(jìn)行基因分型的一 種或多種試劑、組分和/或產(chǎn)品， e) 進(jìn)行用于確定SEQ ID N0:l、2、3、4、5、其互補(bǔ)物、或它們的任何組合的序列的DNA測 序反應(yīng)的一種或多種試劑、組分和/或產(chǎn)品， f) 含多種核苷酸序列的基因芯片或核苷酸序列陣列，所述核苷酸序列包含SEQ ID NO: 1-5、其含所述多態(tài)性位置的片段、或它們的互補(bǔ)物中的任一或組合，或由這些物質(zhì)組成； g) 使用本文所述組分、實踐本文所述方法、解釋獲自實踐所述方法的數(shù)據(jù)、或它們的任 意組合的一個或多個說明書； h) 可用于測試、診斷、監(jiān)控或確定對象癥狀的標(biāo)尺、參照等； 或a) _h)的任何組合或亞組合。22.如權(quán)利要求21所述的試劑盒，其包含： a) -種或多種引物，用以擴(kuò)增含rs2491144(SEQ ID N0:l)、rs9315639(SEQ ID N0:2)、 rsll082138(SEQ ID N0:3)、rsll697517(SEQ ID N0:4)、rs2186437(SEQ ID N0:5)或其任 意組合所定義的多態(tài)性的核苷酸序列； b) 在含所述多態(tài)性位置的核苷酸區(qū)域上與SEQ ID N0:l、2、3、4或5雜交的一種或多種 探針，其中所述探針在所述多態(tài)性位置與多態(tài)性的特定變體雜交； c) 含緩沖液、核苷酸、DNA擴(kuò)增酶或其任意組合的一種或多種試劑和/或產(chǎn)品； d) 對SEQ ID NO: 1、2、3、4、5、或它們的組合的多態(tài)性進(jìn)行基因分型的一種或多種試劑、 組分和/或產(chǎn)品， e) 進(jìn)行用于確定SEQ ID勵：1、2、3、4、5、或它們的組合的序列的0嫩測序反應(yīng)的一種或 多種試劑、組分和/或產(chǎn)品， f) 含多種核苷酸序列的基因芯片或核苷酸序列陣列，所述核苷酸序列包含SEQ ID NO: 1-5或由其組成;和 g) 使用本文所述組分、實踐本文所述方法、解釋獲自實踐所述方法的數(shù)據(jù)、或它們的任 意組合的一個或多個說明書； h) 可用于測試、診斷、監(jiān)控或確定對象癥狀的標(biāo)尺、參照等； 或a) _h)的任何組合或亞組合。
【文檔編號】G06F19/18GK106062213SQ201480076117
【公開日】2016年10月26日
【申請日】2014年12月23日
【發(fā)明人】C·C·載, J·L·肯尼迪
【申請人】戒毒及精神衛(wèi)生中心