專(zhuān)利名稱(chēng):反向蛋白質(zhì)芯片的制作方法
技術(shù)領(lǐng)域:
本發(fā)明涉及反向蛋白質(zhì)芯片及其制備、檢測(cè)。蛋白質(zhì)芯片屬于生命科學(xué)領(lǐng)域。蛋白質(zhì)芯片是一種在固態(tài)基底上有序排布的蛋白質(zhì)或多肽陣列,以實(shí)現(xiàn)對(duì)蛋白質(zhì)進(jìn)行并行檢測(cè)、識(shí)別、鑒定和診斷的器件。廣泛應(yīng)用于生物學(xué)、醫(yī)學(xué)及其相關(guān)領(lǐng)域。
背景技術(shù):
我們以前申請(qǐng)的蛋白質(zhì)芯片專(zhuān)利,用于免疫分析的蛋白質(zhì)芯片(申請(qǐng)?zhí)?1105795.5),主要技術(shù)路線是將待測(cè)蛋白質(zhì)所對(duì)應(yīng)的探針點(diǎn)樣于固態(tài)基底,然后加待測(cè)樣品與探針雜交,并加入熒光標(biāo)記物,最后根據(jù)熒光強(qiáng)度判斷待測(cè)樣品中某種待測(cè)成分的濃度。這種方法用于抗原、抗體或配體、受體的分析、檢測(cè),有非常好的效果,也可用于多樣品多指標(biāo)的檢測(cè)(見(jiàn)多樣品微陣列生物芯片,申請(qǐng)?zhí)?1112783.X)。
但是,第一,這種方法可檢測(cè)的樣本數(shù)有局限,如果用于多樣品微陣列生物芯片,由于每個(gè)腔室只能檢測(cè)一個(gè)樣本,因此上述技術(shù)只適用于幾個(gè)至幾十個(gè)樣本的檢測(cè)。如果腔室過(guò)多,造成的后果,其一為腔室間距很小,操作較困難,容易造成交叉污染;其二為腔室本身空間很小,會(huì)增加點(diǎn)樣的難度,減少可檢測(cè)的項(xiàng)目。因此,目前的技術(shù)尚不適用于大量樣品的檢測(cè)分析。其次,由于通常采用一種熒光標(biāo)記,每一個(gè)點(diǎn)只能檢測(cè)一個(gè)指標(biāo),而生物芯片的目的就是要高度集成,因此,如果能突破一個(gè)點(diǎn)只檢測(cè)一個(gè)樣本、一個(gè)指標(biāo)的現(xiàn)狀,則更能體現(xiàn)生物芯片的有效性。第三,目前的蛋白質(zhì)芯片應(yīng)用過(guò)程中,需要經(jīng)過(guò)兩次雜交,如果能減少雜交次數(shù),必然方便操作使用,減少誤差。
發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明的目的在于提供一種可以將一個(gè)樣品的多種成分的檢測(cè)集成于同一個(gè)點(diǎn)上的反向蛋白質(zhì)芯片。
本發(fā)明的目的通過(guò)下述技術(shù)方案實(shí)現(xiàn)將待測(cè)樣品點(diǎn)陣于固相載體上,樣品中的待測(cè)蛋白質(zhì)或多肽及其他生物分子通過(guò)化學(xué)鍵連接于固相載體上而被固定,固相載體表面經(jīng)過(guò)封閉后,加入標(biāo)記了熒光的探針,與固相生物分子進(jìn)行雜交反應(yīng),洗去未結(jié)合的物質(zhì)后,樣品點(diǎn)的熒光強(qiáng)度與樣品中待測(cè)成分的濃度成正比。
在上述技術(shù)方案基礎(chǔ)上,所述點(diǎn)陣于固相載體上的待測(cè)樣品,可以是血清、體液、組織液、組織的細(xì)胞裂解液、也可以取細(xì)胞培養(yǎng)液、組織培養(yǎng)液,或分子生物學(xué)表達(dá)產(chǎn)物等;所述探針為待測(cè)成分相應(yīng)的抗體、受體或配體。這樣的點(diǎn)樣方式,可以同時(shí)測(cè)大量的樣品,密度可以超過(guò)每平方厘米100個(gè)樣品,可以用于大量樣本的檢測(cè)分析,例如大規(guī)模體檢、篩藥、組織分析、不同個(gè)體的比較分析、表達(dá)分析等。
本發(fā)明用一種或多種熒光進(jìn)行標(biāo)記,每一種熒光標(biāo)記一種探針,將多種熒光探針同時(shí)與樣品點(diǎn)進(jìn)行雜交,最后用相應(yīng)于不同熒光標(biāo)記物的不同的激發(fā)波長(zhǎng)和發(fā)射波長(zhǎng)對(duì)芯片進(jìn)行掃描,分別檢測(cè)到幾種熒光的成像??梢詫⒁粋€(gè)樣品的多種成分的檢測(cè)集成于同一個(gè)點(diǎn)上,突破了一個(gè)點(diǎn)檢測(cè)一個(gè)樣品、一種成分的束縛。還可以在這幾個(gè)成分之間進(jìn)行比較分析。所加入的熒光探針,亦可以選擇具有競(jìng)爭(zhēng)性的幾種探針,讓它們競(jìng)爭(zhēng)性地與某種固相分子結(jié)合,以研究該待測(cè)標(biāo)本中某種分子的特性。
其中,固相載體可以是表面帶有活化基團(tuán)的玻璃片,也可以是醋酸纖維薄膜、硝酸纖維薄膜、尼龍膜、硅片、鋼片、陶瓷片等。
如果本發(fā)明與多樣品微陣列生物芯片結(jié)合使用,更可以隨需要增加檢測(cè)指標(biāo),或做重復(fù)性實(shí)驗(yàn)等。
本發(fā)明的優(yōu)越性在于第一,可多樣品同時(shí)檢測(cè)。反向蛋白質(zhì)芯片可以把大量的待測(cè)樣品點(diǎn)陣于固相載體之上,可以同時(shí)測(cè)大量的樣品,密度可以超過(guò)每平方厘米100個(gè)樣品,適用于大量樣本的檢測(cè)分析,例如大規(guī)模體檢、篩藥、比較分析等。第二,采用多種熒光標(biāo)記,突破了一個(gè)點(diǎn)檢測(cè)一個(gè)樣品、一種成分的束縛。而且增加了檢測(cè)結(jié)果的應(yīng)用范圍,可以應(yīng)用于檢測(cè)多種成分,幾種成分的比較,也可以用來(lái)研究某種分子的特性。第三,更節(jié)省待測(cè)樣品的量,每個(gè)點(diǎn)需要樣品量達(dá)到納升級(jí)。第四,大量標(biāo)本的檢測(cè)操作更簡(jiǎn)單,更準(zhǔn)確,更減少交叉污染。
圖1反向蛋白質(zhì)芯片作用原理圖。
圖2用反向蛋白質(zhì)芯片同時(shí)進(jìn)行兩種配體-受體的測(cè)定。
圖3用反向蛋白質(zhì)芯片進(jìn)行腫瘤三項(xiàng)綜合檢查。
具體實(shí)施例方式
如圖1反向蛋白質(zhì)芯片作用原理圖所示,反向蛋白質(zhì)芯片,是將待測(cè)樣品點(diǎn)陣于固相載體上,樣品中的待測(cè)蛋白質(zhì)或多肽及其他生物分子通過(guò)化學(xué)鍵連接于固相載體上而被固定,固相載體表面經(jīng)過(guò)封閉后,加入標(biāo)記了熒光的探針,與固相生物分子進(jìn)行雜交反應(yīng),洗去未結(jié)合的物質(zhì)后,樣品點(diǎn)的熒光強(qiáng)度與樣品中待測(cè)成分的濃度成正比。
其中載體材料的選擇固相載體可以是表面帶有活化基團(tuán)的玻璃片,也可以是醋酸纖維薄膜、硝酸纖維薄膜、尼龍膜、硅片、鋼片、陶瓷片等。
反向蛋白質(zhì)芯片的點(diǎn)樣、制作技術(shù)(1)樣品的制備采血清、取組織液,或?qū)⒔M織搗碎、裂解后,取細(xì)胞裂解液,也可以取細(xì)胞培養(yǎng)液、組織培養(yǎng)液,或分子生物學(xué)表達(dá)產(chǎn)物。(2)用高速點(diǎn)樣機(jī)器人,根據(jù)樣品的數(shù)量和種類(lèi)確定點(diǎn)陣的排列方式和點(diǎn)樣位置。(3)點(diǎn)樣針從多孔板取出樣品后直接高密度點(diǎn)陣于固相載體上。(4)室溫過(guò)夜或37℃溫育1小時(shí),以固定樣品。(5)在載體表面加上封閉液,37℃溫育1小時(shí)。(6)用雙蒸水充分洗滌并室溫干燥。
探針的標(biāo)記用不同的熒光染料標(biāo)記不同的探針,除去未結(jié)合成分后,將幾種標(biāo)記探針混合。
雜交反應(yīng)在點(diǎn)好樣的芯片上滴加熒光標(biāo)記探針混合液,37℃避光溫育30分鐘。洗凈并室溫晾干。
結(jié)果的檢測(cè)反應(yīng)結(jié)束后,利用專(zhuān)業(yè)的芯片掃描分析儀進(jìn)行結(jié)果的判讀。具體為針對(duì)每一種熒光染料,采用相應(yīng)的激發(fā)波長(zhǎng)進(jìn)行激發(fā),并在相應(yīng)的發(fā)射波長(zhǎng)進(jìn)行掃描。搜集數(shù)據(jù),進(jìn)行分析。
本發(fā)明應(yīng)用例1如圖2用反向蛋白質(zhì)芯片同時(shí)進(jìn)行兩種配體-受體的測(cè)定,即同時(shí)用不同熒光標(biāo)記的腫瘤壞死因子(TNF)和Fas配體(FasL)檢測(cè)細(xì)胞裂解液中的TNF受體(TNF-R)和Fas。點(diǎn)樣陣列為4×4,其中A1、B1為陽(yáng)性對(duì)照,C1、D1為陰性對(duì)照,其它為待測(cè)標(biāo)本。左圖為檢測(cè)TNF-R結(jié)果,熒光的強(qiáng)弱代表細(xì)胞中TNF-R含量的高低;右圖為檢測(cè)Fas結(jié)果,熒光的強(qiáng)弱代表細(xì)胞中Fas含量的高低。
本發(fā)明應(yīng)用例2如圖3用反向蛋白質(zhì)芯片進(jìn)行腫瘤三項(xiàng)綜合檢查。點(diǎn)樣方式如應(yīng)用例1,待測(cè)樣品為病人血清,探針為相應(yīng)抗體。左、中、右圖分別為甲胎蛋白(AFP)、前列腺特異性抗原(PSA)和癌胚抗原(CEA)指標(biāo)的檢測(cè)掃描結(jié)果。
權(quán)利要求
1,反向蛋白質(zhì)芯片,是將待測(cè)樣品點(diǎn)陣于固相載體上,特征在于樣品中的待測(cè)蛋白質(zhì)或多肽及其他生物分子通過(guò)化學(xué)鍵連接于固相載體上而被固定,固相載體表面經(jīng)過(guò)封閉后,加入標(biāo)記了熒光的探針,與固相生物分子進(jìn)行雜交反應(yīng),洗去未結(jié)合的物質(zhì)后,樣品點(diǎn)的熒光強(qiáng)度與樣品中待測(cè)成分的濃度成正比。
2,根據(jù)權(quán)利要求1所述的反向蛋白質(zhì)芯片,特征在于所述點(diǎn)陣于固相載體上的待測(cè)樣品,可以是血清、體液、組織液、組織的細(xì)胞裂解液、也可以取細(xì)胞培養(yǎng)液、組織培養(yǎng)液,或分子生物學(xué)表達(dá)產(chǎn)物,探針為待測(cè)成分相應(yīng)的抗體、受體或配體。
3,根據(jù)權(quán)利要求1、2所述的反向蛋白質(zhì)芯片,特征在于用一種或一種以上熒光染料進(jìn)行標(biāo)記,每一種熒光染料標(biāo)記一種探針,將多種熒光探針同時(shí)與樣品點(diǎn)進(jìn)行雜交,最后用相應(yīng)于不同熒光標(biāo)記物的不同的激發(fā)波長(zhǎng)和發(fā)射波長(zhǎng)對(duì)芯片進(jìn)行掃描,分別檢測(cè)到幾種熒光的成像。
4,根據(jù)權(quán)利要求1、2所述的反向蛋白質(zhì)芯片,特征在于固相載體可以是表面帶有活化基團(tuán)的玻璃片,也可以是醋酸纖維薄膜、硝酸纖維薄膜、尼龍膜、硅片、鋼片、陶瓷片等。
5,一種反向蛋白質(zhì)芯片的制備方法,包括樣品制備及點(diǎn)樣,特征在于樣品的制備采血清、取組織液,或?qū)⒔M織搗碎、裂解后,取細(xì)胞裂解液,也可以取細(xì)胞培養(yǎng)液、組織培養(yǎng)液,或分子生物學(xué)表達(dá)產(chǎn)物;點(diǎn)樣用高速點(diǎn)樣機(jī)器人,根據(jù)樣品的數(shù)量和種類(lèi)確定點(diǎn)陣的排列方式和點(diǎn)樣位置;點(diǎn)樣針從多孔板取出樣品后直接高密度點(diǎn)陣于固相載體上;固定樣品室溫過(guò)夜或37℃溫育1小時(shí);在載體表面加上封閉液,37℃溫育1小時(shí);用雙蒸水充分洗滌并室溫干燥。
6,一種反向蛋白質(zhì)芯片的檢測(cè)方法,利用專(zhuān)業(yè)的芯片掃描分析儀進(jìn)行結(jié)果的判讀,特征在于針對(duì)每一種熒光染料,采用相應(yīng)的激發(fā)波長(zhǎng)進(jìn)行激發(fā),并在相應(yīng)的發(fā)射波長(zhǎng)進(jìn)行掃描、搜集數(shù)據(jù)、結(jié)果分析。
全文摘要
本發(fā)明涉及反向蛋白質(zhì)芯片及其制備、檢測(cè)。蛋白質(zhì)芯片屬于生命科學(xué)領(lǐng)域。廣泛應(yīng)用于生物學(xué)、醫(yī)學(xué)及其相關(guān)領(lǐng)域。反向蛋白質(zhì)芯片,樣品中的待測(cè)蛋白質(zhì)或多肽及其他生物分子通過(guò)化學(xué)鍵連接于固相載體上而被固定,固相載體表面經(jīng)過(guò)封閉后,加入標(biāo)記了熒光的探針,與固相生物分子進(jìn)行雜交反應(yīng),洗去未結(jié)合的物質(zhì)后,樣品點(diǎn)的熒光強(qiáng)度與樣品中待測(cè)成分的濃度成正比。本發(fā)明可以把大量的待測(cè)樣品點(diǎn)陣于固相載體之上;采用了多種熒光標(biāo)記,突破了一個(gè)點(diǎn)檢測(cè)一個(gè)樣品、一種成分的束縛,可以應(yīng)用于檢測(cè)多種成分,幾種成分的比較,研究某種分子特性;節(jié)省待測(cè)樣品量;大量標(biāo)本的檢測(cè)操作更簡(jiǎn)單、準(zhǔn)確,減少交叉污染。
文檔編號(hào)G01N33/50GK1335506SQ0112648
公開(kāi)日2002年2月13日 申請(qǐng)日期2001年8月15日 優(yōu)先權(quán)日2001年8月15日
發(fā)明者張濤, 李賓, 彭永濟(jì), 任一萍 申請(qǐng)人:上海晶泰生物技術(shù)有限公司