一種篩選環(huán)孢素a于免疫t細(xì)胞中藥物作用靶位的方法
【專利摘要】本發(fā)明涉及一種利用蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)對環(huán)孢素A于免疫T細(xì)胞中藥物作用靶位進(jìn)行篩選的方法。本篩選環(huán)孢素A于免疫T細(xì)胞中藥物作用靶位的方法利用蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù),對環(huán)孢素A于免疫T細(xì)胞中藥物作用靶位進(jìn)行篩選,方法包括以下步驟:步驟1)建立環(huán)孢素A于免疫T細(xì)胞作用樣品組群、步驟2)制備免疫T細(xì)胞二維電泳蛋白質(zhì)樣品、步驟3)雙向凝膠電泳、步驟4)圖像采集分析得出結(jié)果。本發(fā)明篩選環(huán)孢素A于免疫T細(xì)胞中藥物作用靶位的方法,操作思路明確、結(jié)果真實可靠,克服了常規(guī)篩選手段由于分析數(shù)據(jù)過于龐大和復(fù)雜,造成篩選結(jié)果誤差較大,準(zhǔn)確率低的缺陷,為臨床用藥提供了具有藥理意義和指導(dǎo)作用的檢測結(jié)果。
【專利說明】一種篩選環(huán)孢素A于免疫T細(xì)胞中藥物作用靶位的方法
【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001]本發(fā)明涉及一種利用蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)對環(huán)孢素A于免疫T細(xì)胞中藥物作用靶位進(jìn)行篩選的方法。
【背景技術(shù)】
[0002]環(huán)孢素A(cyclosprine,CsA)是由11個氨基酸組成的環(huán)狀多肽,是土壤中一種真菌的活性代謝物。1978年英國首次將環(huán)孢素A應(yīng)用于臨床腎移植,此后環(huán)孢素A又用于肝、心、肺、胰腺、骨髓等器官的移植,均取得令人滿意的效果,明顯提高病人的生存率。1984年環(huán)孢素A進(jìn)入我國,形成了環(huán)孢素A加硫唑嘌呤加激素的三聯(lián)免疫抑制方案,大大提高了移植存活率,同時也使移植術(shù)后急性排斥反應(yīng)的發(fā)生率大幅下降。環(huán)孢素A作為一種強(qiáng)效免疫抑制劑,近年來人們對它的研宄越來越多,發(fā)現(xiàn)它還可用來治療自身免疫性疾病、血液病及寄生蟲病等。目前,臨床上針對個體病患,環(huán)孢素A于免疫T細(xì)胞中藥物作用靶位一直無法確定,且常規(guī)篩選手段由于分析數(shù)據(jù)過于龐大和復(fù)雜,造成篩選結(jié)果誤差較大,準(zhǔn)確率低,難以在臨床用藥時提供具有藥理意義和指導(dǎo)作用的檢測結(jié)果。
【發(fā)明內(nèi)容】
[0003]本發(fā)明要解決的技術(shù)問題是如何克服現(xiàn)有技術(shù)的上述缺陷,提供一種利用蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)對環(huán)孢素A于免疫T細(xì)胞中藥物作用靶位進(jìn)行篩選的方法。
[0004]為解決上述技術(shù)問題,本篩選環(huán)孢素A于免疫T細(xì)胞中藥物作用靶位的方法利用蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù),對環(huán)孢素A于免疫T細(xì)胞中藥物作用靶位進(jìn)行篩選,其具體方法包括以下步驟:
[0005]步驟I):將培養(yǎng)至第五日的免疫T細(xì)胞,分為等量的對照組和若干試驗組,向試驗組中分別加入不同濃度的環(huán)孢素A,整體形成環(huán)孢素A對免疫T細(xì)胞模型的藥物作用樣品組群;
[0006]步驟2):將步驟I)所述的環(huán)孢素A對免疫T細(xì)胞模型的藥物作用樣品組群培養(yǎng)至對數(shù)生長期;棄去培養(yǎng)液,刮取細(xì)胞收集細(xì)胞到若干對應(yīng)的離心管;收集完成后用磷酸緩沖液沖洗細(xì)胞5次,經(jīng)沖洗后吸干離心管內(nèi)殘留磷酸緩沖液,然后加入等體積lOmol/L脲、50mmol/L DTT,5%的3-[ (3-膽酰胺丙基)-二乙胺1-丙磺酸、30mmo 1/L三羥甲基氨基甲烷形成的混合溶液,反復(fù)凍融細(xì)胞5?8次;放入冰鹽浴中靜置30min ;然后升溫至10°C的條件下離心2h ;離心完成后取上清液測定蛋白濃度,并根據(jù)測得的蛋白質(zhì)濃度標(biāo)記、分裝,轉(zhuǎn)移至70°C的保溫箱中儲存存儲備用;
[0007]步驟3):將步驟2)中存儲備用的上清液取出兩組,每組各50ug,與等量lOmol/L尿素、5%的3-[ (3-膽酰胺丙基)-二乙胺]-丙磺酸,20mmol/L 二硫蘇糖醇0.5%的IPG緩沖液組成的混合液體混合;混合后加入IPG持膠槽中,IPG干膠條的膠面向下放入槽中,并于其表面涂抹一層有機(jī)礦物油,IPG持膠槽加蓋后置于IPGphor水平電泳儀電極板上進(jìn)行等電聚焦;等電聚焦結(jié)束后,IPG干膠條在平衡液中平衡30min ;平衡完成后將IPG干膠條移至SDS-PAGE分離膠上,并以瓊脂糖封膠,將玻璃板置于電泳槽中以恒流方式進(jìn)行電泳,至電泳槽中溴酚藍(lán)前沿延伸至距凝膠底邊5mm處停止電泳,得到凝膠;
[0008]步驟4):將由步驟3)得到的凝膠染色,并用凝膠掃描儀透射掃描;將得到圖像用PDQUEST軟件進(jìn)行分析,圖像分析過程包括圖譜的剪切,蛋白質(zhì)點(diǎn)的檢測,不同凝膠間的匹配,量的歸一化以及利用內(nèi)標(biāo)2DMARKER的標(biāo)準(zhǔn)分了量和等電點(diǎn)確定膠內(nèi)蛋白點(diǎn)的相對分子量和等電點(diǎn);以正常條件下免疫T細(xì)胞蛋白質(zhì)的雙向電泳圖譜為參考膠,與環(huán)孢素A作用下培養(yǎng)的免疫T細(xì)胞蛋白質(zhì)的雙向電泳圖譜進(jìn)行配比,獲得環(huán)孢素A作用于免疫T細(xì)胞的差異表達(dá)蛋白質(zhì);
[0009]步驟5):將由步驟4)得到的差異表達(dá)蛋白質(zhì)經(jīng)膠內(nèi)酶切后,通過質(zhì)譜,測定差異表達(dá)蛋白質(zhì);與質(zhì)譜庫比較,篩選出差異表達(dá)蛋白質(zhì);明確差異蛋白后,其生物學(xué)功能確定,通過蛋白印跡驗證,即得環(huán)孢素A于免疫T細(xì)胞中藥物作用靶位。
[0010]本發(fā)明篩選環(huán)孢素A于免疫T細(xì)胞中藥物作用靶位的方法,操作思路明確、結(jié)果真實可靠,克服了常規(guī)篩選手段由于分析數(shù)據(jù)過于龐大和復(fù)雜,造成篩選結(jié)果誤差較大,準(zhǔn)確率低的缺陷,為臨床用藥提供了具有藥理意義和指導(dǎo)作用的檢測結(jié)果。
【具體實施方式】
[0011]本將培養(yǎng)至第五日的免疫T細(xì)胞,分為等量的對照組和若干試驗組,向試驗組中分別加入不同濃度的環(huán)孢素A,整體形成環(huán)孢素A對免疫T細(xì)胞模型的藥物作用樣品組群;
[0012]步驟2):將步驟I)所述的環(huán)孢素A對免疫T細(xì)胞模型的藥物作用樣品組群培養(yǎng)至對數(shù)生長期;棄去培養(yǎng)液,刮取細(xì)胞收集細(xì)胞到若干對應(yīng)的離心管;收集完成后用磷酸緩沖液沖洗細(xì)胞5次,經(jīng)沖洗后吸干離心管內(nèi)殘留磷酸緩沖液,然后加入等體積lOmol/L脲、50mmol/L DTT,5%的3-[ (3-膽酰胺丙基)-二乙胺1-丙磺酸、30mmo 1/L三羥甲基氨基甲烷形成的混合溶液,反復(fù)凍融細(xì)胞5?8次;放入冰鹽浴中靜置30min ;然后升溫至10°C的條件下離心2h ;離心完成后取上清液測定蛋白濃度,并根據(jù)測得的蛋白質(zhì)濃度標(biāo)記、分裝,轉(zhuǎn)移至70°C的保溫箱中儲存存儲備用;
[0013]步驟3):將步驟2)中存儲備用的上清液取出兩組,每組各50ug,與等量lOmol/L尿素、5%的3-[ (3-膽酰胺丙基)-二乙胺]-丙磺酸,20mmol/L 二硫蘇糖醇0.5%的IPG緩沖液組成的混合液體混合;混合后加入IPG持膠槽中,IPG干膠條的膠面向下放入槽中,并于其表面涂抹一層有機(jī)礦物油,IPG持膠槽加蓋后置于IPGphor水平電泳儀電極板上進(jìn)行等電聚焦;等電聚焦結(jié)束后,IPG干膠條在平衡液中平衡30min ;平衡完成后將IPG干膠條移至SDS-PAGE分離膠上,并以瓊脂糖封膠,將玻璃板置于電泳槽中以恒流方式進(jìn)行電泳,至電泳槽中溴酚藍(lán)前沿延伸至距凝膠底邊5mm處停止電泳,得到凝膠;
[0014]步驟4):將由步驟3)得到的凝膠染色,并用凝膠掃描儀透射掃描;將得到圖像用PDQUEST軟件進(jìn)行分析,圖像分析過程包括圖譜的剪切,蛋白質(zhì)點(diǎn)的檢測,不同凝膠間的匹配,量的歸一化以及利用內(nèi)標(biāo)2DMARKER的標(biāo)準(zhǔn)分了量和等電點(diǎn)確定膠內(nèi)蛋白點(diǎn)的相對分子量和等電點(diǎn);以正常條件下免疫T細(xì)胞蛋白質(zhì)的雙向電泳圖譜為參考膠,與環(huán)孢素A作用下培養(yǎng)的免疫T細(xì)胞蛋白質(zhì)的雙向電泳圖譜進(jìn)行配比,獲得環(huán)孢素A作用于免疫T細(xì)胞的差異表達(dá)蛋白質(zhì);
[0015]步驟5):將由步驟4)得到的差異表達(dá)蛋白質(zhì)經(jīng)膠內(nèi)酶切后,通過質(zhì)譜,測定差異表達(dá)蛋白質(zhì);與質(zhì)譜庫比較,篩選出差異表達(dá)蛋白質(zhì);明確差異蛋白后,其生物學(xué)功能確定,通過蛋白印跡驗證,即得環(huán)孢素A于免疫T細(xì)胞中藥物作用靶位。
[0016]本發(fā)明包括但不限于上述實施方式,任何符合本權(quán)利要求書描述的產(chǎn)品,均落入本發(fā)明的保護(hù)范圍之內(nèi)。
【權(quán)利要求】
1.一種篩選環(huán)孢素A于免疫T細(xì)胞中藥物作用靶位的方法,其特征是:本方法利用蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù),對環(huán)孢素A于免疫T細(xì)胞中藥物作用靶位進(jìn)行篩選,其具體方法包括以下步驟: 步驟I):將培養(yǎng)至第五日的免疫T細(xì)胞,分為等量的對照組和若干試驗組,向試驗組中分別加入不同濃度的環(huán)孢素A,整體形成環(huán)孢素A對免疫T細(xì)胞模型的藥物作用樣品組群;步驟2):將步驟I)所述的環(huán)孢素A對免疫T細(xì)胞模型的藥物作用樣品組群培養(yǎng)至對數(shù)生長期;棄去培養(yǎng)液,刮取細(xì)胞收集細(xì)胞到若干對應(yīng)的離心管;收集完成后用磷酸緩沖液沖洗細(xì)胞5次,經(jīng)沖洗后吸干離心管內(nèi)殘留磷酸緩沖液,然后加入等體積lOmol/L脲、50mmol/L DTT,5%的3-[ (3-膽酰胺丙基)-二乙胺1-丙磺酸、30mmo 1/L三羥甲基氨基甲烷形成的混合溶液,反復(fù)凍融細(xì)胞5?8次;放入冰鹽浴中靜置30min ;然后升溫至10°C的條件下離心2h ;離心完成后取上清液測定蛋白濃度,并根據(jù)測得的蛋白質(zhì)濃度標(biāo)記、分裝,轉(zhuǎn)移至70°C的保溫箱中儲存存儲備用; 步驟3):將步驟2)中存儲備用的上清液取出兩組,每組各50ug,與等量lOmol/L尿素、5%的3-[(3_膽酰胺丙基)-二乙胺]-丙磺酸,20mmol/L 二硫蘇糖醇0.5%的IPG緩沖液組成的混合液體混合;混合后加入IPG持膠槽中,IPG干膠條的膠面向下放入槽中,并于其表面涂抹一層有機(jī)礦物油,IPG持膠槽加蓋后置于IPGphor水平電泳儀電極板上進(jìn)行等電聚焦;等電聚焦結(jié)束后,IPG干膠條在平衡液中平衡30min ;平衡完成后將IPG干膠條移至SDS-PAGE分離膠上,并以瓊脂糖封膠,將玻璃板置于電泳槽中以恒流方式進(jìn)行電泳,至電泳槽中溴酚藍(lán)前沿延伸至距凝膠底邊5mm處停止電泳,得到凝膠; 步驟4):將由步驟3)得到的凝膠染色,并用凝膠掃描儀透射掃描;將得到圖像用PDQUEST軟件進(jìn)行分析,圖像分析過程包括圖譜的剪切,蛋白質(zhì)點(diǎn)的檢測,不同凝膠間的匹配,量的歸一化以及利用內(nèi)標(biāo)2DMARKER的標(biāo)準(zhǔn)分了量和等電點(diǎn)確定膠內(nèi)蛋白點(diǎn)的相對分子量和等電點(diǎn);以正常條件下免疫T細(xì)胞蛋白質(zhì)的雙向電泳圖譜為參考膠,與環(huán)孢素A作用下培養(yǎng)的免疫T細(xì)胞蛋白質(zhì)的雙向電泳圖譜進(jìn)行配比,獲得環(huán)孢素A作用于免疫T細(xì)胞的差異表達(dá)蛋白質(zhì); 步驟5):將由步驟4)得到的差異表達(dá)蛋白質(zhì)經(jīng)膠內(nèi)酶切后,通過質(zhì)譜,測定差異表達(dá)蛋白質(zhì);與質(zhì)譜庫比較,篩選出差異表達(dá)蛋白質(zhì);明確差異蛋白后,其生物學(xué)功能確定,通過蛋白印跡驗證,即得環(huán)孢素A于免疫T細(xì)胞中藥物作用靶位。
【文檔編號】G01N27/447GK104483376SQ201410843729
【公開日】2015年4月1日 申請日期:2014年12月30日 優(yōu)先權(quán)日:2014年12月30日
【發(fā)明者】李化會, 莫曉媚, 劉豐海, 趙龍 申請人:青島市市立醫(yī)院