專利名稱：在世界范圍內(nèi)篩選人乳頭瘤病毒的方法和設(shè)備的制作方法
技術(shù)領(lǐng)域：
本發(fā)明涉及根據(jù)人乳頭瘤病毒之存在狀況篩選人類女性受試者的體外方法，例如其可作為宮頸上皮癌前病變的標(biāo)志物。具體地，本發(fā)明提供可用于根據(jù)所測(cè)患者的地理位置來過濾與多種HPV類型相關(guān)之患者測(cè)量數(shù)據(jù)組的方法和設(shè)備，使得僅選擇預(yù)先確定與所測(cè)患者所處地理區(qū)域相關(guān)的那些HPV類型測(cè)量數(shù)據(jù)用于輸出/顯示。
背景技術(shù)：
宮頸癌在世界范圍內(nèi)是最常見的惡性疾病之一，是女性主要的發(fā)病與死亡原因之一 (Parkin DM, Pisani P, Ferlay J(1993)Int J Cancer 54 594-606 ；Pisani P, Parkin DM, Ferlay J(1993) Int J Cancer 55:891-903)。據(jù)預(yù)測(cè)，1996 年美國侵襲性宮頸癌的新發(fā)病例數(shù)為15，700例，據(jù)世界衛(wèi)生組織(1990)估計(jì)，世界范圍內(nèi)每年有450，000人發(fā)病。 在世界的不同地區(qū)，年發(fā)病率不盡相同，從西亞的7. 6/100, 000到南非的46. 8/100, 000不等(Parkin等，1993出處同上)?，F(xiàn)今對(duì)宮頸癌的概念是該病為一種多階段的疾病，發(fā)展期常有10-25年。侵襲性宮頸鱗狀細(xì)胞癌表現(xiàn)為它能夠穿透基底層并侵入基質(zhì)或表皮固有層。宮頸癌的臨床過程變異性相當(dāng)大。其預(yù)后與臨床階段、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、原發(fā)腫瘤體積、組織學(xué)類型、侵襲深度和淋巴管滲透有關(guān)(Delgado G等，(1990) Gynecol Oncol 38:352-357)。有些患者的腫瘤特征不太有利，但預(yù)后相對(duì)較好；而另一些患者初始時(shí)僅為限制性疾病，但卻出現(xiàn)致命性結(jié)局。這表明，明確地需要額外的標(biāo)志物來進(jìn)一步表征新診斷出的宮頸癌，以進(jìn)行風(fēng)險(xiǎn)適應(yīng)性的治療(Ikenberg H 等，Int. J. Cancer 59 :322_6· 1994)。將近100項(xiàng)病例-對(duì)照研究檢測(cè)了人乳頭瘤病毒(HPV)與宮頸腫瘤之間的關(guān)系， 幾乎所有的研究都發(fā)現(xiàn)二者之間具有正相關(guān)性(IARC monographs，1995)。這種相關(guān)性強(qiáng)烈而一貫，并且對(duì)有限數(shù)目的病毒類型表現(xiàn)出特異性(MufiOZ N, Bosch FX(1992)HPV and cervical neoplasia :review of case-control and cohort studies. IARC Sci Publ 251-261)。在這些最信息豐富的研究中，觀察到了 HPV16 DNA與侵襲性癌癥和高等級(jí)CIN 病變之間的強(qiáng)烈而一致性顯著的相關(guān)性，從而排除了用偶然、偏見或混雜來解釋這種關(guān)聯(lián)的可能性(IARC monographs，1995)。間接證據(jù)提示，在癌細(xì)胞中檢測(cè)到的HPV DNA是HPV 感染在癌癥發(fā)生較早期中作用的良好標(biāo)志物。已有病毒載量增加與宮頸癌風(fēng)險(xiǎn)之間存在劑量_效應(yīng)關(guān)系的報(bào)道(MufiOZ和Bosch, 1992，出處同上)。在鱗狀細(xì)胞宮頸癌中最常發(fā)現(xiàn)的HPV類型是HPV 16 (41 % -86 % )和 18(2 % -22 % ) ο 此外還發(fā)現(xiàn)了 HPV 31、33、35、39、45、51、52、54、56、58、59、61、66 和 68 (IARC, monographs，1995)。在巴塞羅那召開的 HPV2000 國際會(huì)議上，HPV 16、18、31 禾口 45被定義為高風(fēng)險(xiǎn)類型，而HPV 33、35、39、51、52、56、58、59、68被定義為中等風(fēng)險(xiǎn)類型 (Keerti V. Shah. P71)。這13種高風(fēng)險(xiǎn)和中等風(fēng)險(xiǎn)類型經(jīng)常被一起稱為癌癥相關(guān)的HPV類型。很多研究都以高風(fēng)險(xiǎn)HPV類型的地理分布為研究主題。Clifford等(Clifford GM等(2003)British Journal of Cancer 88:63-73)整理了相關(guān)的已發(fā)表數(shù)據(jù)，以鑒定世界范圍內(nèi)與宮頸癌相關(guān)的最流行的HPV類型。在宮頸癌中最常見的HPV類型是(以流行程度遞減的順序排序)16、18、45、31、33、58、52、35、59、56、6、51、68、39、82、73、66和 70。當(dāng)按照地理區(qū)域劃分時(shí)，在非洲、亞洲、歐洲、北美/澳大利亞和中/南美洲，兩種最流行的HPV類型是16和18。而更多HPV風(fēng)險(xiǎn)類型的流行程度則隨地區(qū)的不同而不同。在非洲，接下來最流行的類型是(以流行程度遞減的順序排序)45、33和31。在亞洲，接下來最流行的類型是 (以流行程度遞減的順序排序)58、52、45和33。在歐洲接下來最流行的類型是33和31 ；而在北美/澳大利亞，接下來最流行的類型是31和33 (以流行程度遞減的順序排序)。在中 /南美洲，接下來最流行的類型是(以流行程度遞減的順序排序)31和45。該研究的結(jié)論是，在類型16和18之后，最重要的HPV風(fēng)險(xiǎn)類型是45，接下來是31、33、58和52。MufiOZ 等(MufiOZ N 等，(2004) Int. J. Cancer 111 278-285)對(duì)一項(xiàng)宮頸癌中 HPV 類型的國際調(diào)查和一項(xiàng)多中心病例_對(duì)照研究所獲得的數(shù)據(jù)進(jìn)行了匯總分析。該分析包含來自25個(gè)國家的樣本，總結(jié)了與宮頸癌相關(guān)的15種最常見的HPV類型為(以流行程度遞減的順序排序)16、18、45、31、33、52、58、35、59、56、39、51、73、68和66。16 型 HPV—直是最常見的宮頸癌相關(guān)HPV類型，而其它HPV風(fēng)險(xiǎn)類型對(duì)宮頸癌的貢獻(xiàn)程度則報(bào)道不一。據(jù)報(bào)道，北非的 HPV 16、南亞的HPV 18、撒哈拉以南非洲的HPV 45和中/南美洲的HPV 31，其流行程度均高于平均水平。該研究提出，針對(duì)7種最常見HPV類型的疫苗可以在世界范圍內(nèi)預(yù)防大約 87%的宮頸癌病例。參照HPV篩選項(xiàng)目得到結(jié)論，調(diào)整篩選方案中所包含HPV類型的數(shù)目所產(chǎn)生的影響可能很小。
Clifford 等(Clifford GM 等，(2005)Cancer Epidemiology, Biomarkers and Prevention 14(5) :1157_1164)整理了關(guān)于在低級(jí)鱗狀上皮內(nèi)病變(LSIL)中HPV類型分布相關(guān)的信息并將其與宮頸癌中HPV類型的流行程度相比較。在所有研究的地理區(qū)域中， 發(fā)現(xiàn)最常見HPV類型是HPV 16。與上邊提到的其它研究一樣，在接下來最流行HPV類型上存在著因地域不同而不同的顯著差異。在中/南美洲，接下來最流行的HPV類型是33和6 ； 而在北美洲，則發(fā)現(xiàn)是HPV類型51和56。在亞洲，接下來最流行的類型是18和58 ；在非洲接下來最流行的類型則是53和58，而在歐洲接下來最流行的類型是31和51。最近Clifford 等(Clifford GM 等，(2005)The Lancet 366:991-998)進(jìn)行了一項(xiàng)世界范圍內(nèi)HPV流行性的匯總分析。該研究表明，在11個(gè)國家中，HPV風(fēng)險(xiǎn)類型的流行程度有顯著不同。在樣本接受檢測(cè)的所有國家的HPV陽性女性中，HPV16仍然是最常見的類型。同時(shí)也觀察到了其它高風(fēng)險(xiǎn)HPV類型如18、45、31、33、52、58等流行程度的差異。在歐洲人群中，HPV陽性女性中最常發(fā)現(xiàn)的高風(fēng)險(xiǎn)HPV類型是(以分布遞減的順序排序)16、 31和18 ；而在本區(qū)域有相等數(shù)目的HPV陽性女性中發(fā)現(xiàn)類型58、56、45和35。相比之下， 在撒哈拉以南非洲的HPV陽性女性人群中，研究發(fā)現(xiàn)HPV 16和35的流行程度相同，而HPV 45、52、56和58都比歐洲更為常見。在亞洲人群中觀察到的分布情況更加混雜。發(fā)明概述高風(fēng)險(xiǎn)的癌癥相關(guān)HPV類型流行性的地理差異提出了這樣一個(gè)問題，即如何設(shè)計(jì)一種適于在全世界范圍內(nèi)使用的基于HPV的診斷工具。一種解決方案是設(shè)計(jì)一種測(cè)試來檢測(cè)所有已知的“高風(fēng)險(xiǎn)"HPV類型。然而，本發(fā)明人和其他人的臨床研究已經(jīng)證明，在基于HPV DNA和/或mRNA作為宮頸癌癌前病變標(biāo)志物(或作為宮頸癌的風(fēng)險(xiǎn)因子)的檢測(cè)中，盡管增加所檢測(cè)HPV類型的數(shù)目可以提高測(cè)定的靈敏度，但檢測(cè)的總體特異性也許會(huì)降低本發(fā)明人通過開發(fā)一種方法和設(shè)備解決了這一問題，該方法和設(shè)備允許使用者依據(jù)患者地理位置來過濾患者HPV測(cè)量數(shù)據(jù)集，并輸出/顯示與患者所處地理區(qū)域相適應(yīng)之 HPV類型的亞組相關(guān)的HPV測(cè)量數(shù)據(jù)的亞組。因此，本發(fā)明的第一個(gè)方面提供了一種自動(dòng)提供在由人類女性所提供之細(xì)胞樣品中是否存在多種HPV類型之選定類型的指征的方法。本方法可以包括存儲(chǔ)區(qū)域HPV亞組數(shù)據(jù)，該數(shù)據(jù)為多個(gè)地理區(qū)域中每個(gè)區(qū)域定義所述HPV類型的亞組；接收指示至少一個(gè)所述地理區(qū)域的區(qū)域標(biāo)識(shí)器；接收多個(gè)HPV類型測(cè)量數(shù)據(jù)，并為由區(qū)域標(biāo)識(shí)器所指示之至少一個(gè)地理區(qū)域選擇由所述區(qū)域HPV亞組數(shù)據(jù)所定義的所述測(cè)量數(shù)據(jù)的亞組。該方法還可以包括僅輸出或顯示所測(cè)量HPV類型之選定亞組的HPV測(cè)量數(shù)據(jù)的步馬聚ο在一個(gè)實(shí)施方案中，本發(fā)明的方法可以包括產(chǎn)生來自人類女性受試者獲取之細(xì)胞樣品的HPV測(cè)量數(shù)據(jù)集(即所測(cè)量HPV類型的多個(gè)指征)的步驟。優(yōu)選地，所測(cè)量HPV類型的所述多個(gè)指征包括選自HPV類型6、53、5、8、16、18、45、 31、33、52、58、35、59、56、39、51、66、68、73、82和70中至少6種HPV類型的測(cè)量數(shù)據(jù)的指征。 在一些實(shí)施方案中，所測(cè)量HPV類型的多個(gè)指征包括前一句中列出的所有HPV類型的測(cè)量數(shù)據(jù)。在一個(gè)具體實(shí)施方案中，區(qū)域HPV亞組數(shù)據(jù)中定義的HPV類型亞組可以包括3種或更多種HPV類型。在本發(fā)明的第二個(gè)方面，提供了一種設(shè)備，用于自動(dòng)提供在由人類女性所提供之細(xì)胞樣品中所檢測(cè)多種HPV類型之選定類型的指征，其包含為多個(gè)地理區(qū)域中每個(gè)區(qū)域定義所述多個(gè)HPV類型之亞組的區(qū)域HPV數(shù)據(jù)；適于存儲(chǔ)指示多個(gè)地理區(qū)域之值的區(qū)域標(biāo)識(shí)器；以及適于指導(dǎo)僅僅輸出所檢測(cè)HPV類型之亞組的指征的處理器，該亞組是由依據(jù)由區(qū)域標(biāo)識(shí)器所存儲(chǔ)之值的區(qū)域HPV亞組數(shù)據(jù)所定義的。在一個(gè)具體實(shí)施方案中，該設(shè)備可以適于接收由人類女性所提供的細(xì)胞樣品并向處理器提供所測(cè)量HPV類型的指征。所述處理器一方面可以控制適于向處理器提供所測(cè)量HPV類型之指征的設(shè)備，使得僅有特定指征被提供給處理器；另一方面，所述處理器可以接收所測(cè)量HPV類型的所有指征，并棄去那些不與依據(jù)區(qū)域標(biāo)識(shí)器所存儲(chǔ)之值的區(qū)域HPV亞組數(shù)據(jù)所定義的所檢測(cè) HPV類型之亞組相對(duì)應(yīng)的指征。發(fā)明詳述本發(fā)明的方法允許使用者在來自人類女性受試者的細(xì)胞樣品中測(cè)試是否存在一組廣泛的個(gè)體HPV類型，然后過濾其結(jié)果，使得僅有所測(cè)試HPV類型之亞組的結(jié)果被實(shí)際輸出或顯示。所輸出和顯示之結(jié)果亞組是依據(jù)受試者所處地理區(qū)域而選定的。由此可以設(shè)計(jì)一種真正適于全世界范圍內(nèi)HPV測(cè)試的測(cè)定系統(tǒng)。所有受試者接受測(cè)試的這組廣泛的HPV 類型(不考慮地理位置)可以足夠廣泛，以覆蓋基本上所有的已知“高風(fēng)險(xiǎn)” HPV類型。在這一廣泛組內(nèi)，所有受試者均接受針對(duì)該廣泛組內(nèi)所有HPV類型的測(cè)試，但是對(duì)結(jié)果進(jìn)行過濾使得實(shí)際上僅僅報(bào)告針對(duì)所測(cè)試HPV類型之選定亞組的結(jié)果。因此，作為代替基于適當(dāng)HPV類型組合而針對(duì)每個(gè)地理區(qū)域設(shè)計(jì)分開的測(cè)定試劑盒或系統(tǒng)，可以制備適于全世界應(yīng)用的單一測(cè)定試劑盒或系統(tǒng)，其中對(duì)所有受試者進(jìn)行所有HPV類型的測(cè)試。作為代替針對(duì)所有受試者無論其位置報(bào)告所有測(cè)定HPV類型的結(jié)果 (這有可能導(dǎo)致喪失特異性)，可以選擇性地僅僅報(bào)告被視為與受試者地理位置相關(guān)的結(jié)果的亞組。與不考慮地理位置為每個(gè)受試者報(bào)告所有高風(fēng)險(xiǎn)HPV類型的結(jié)果相比，這將會(huì)提高測(cè)試的特異性。測(cè)量HPV類型的指征本發(fā)明的方法有賴于關(guān)于“所測(cè)量HPV類型的多個(gè)指征”的輸入數(shù)據(jù)?！八鶞y(cè)量 HPV類型的指征”可以是標(biāo)識(shí)HPV存在的任何分子標(biāo)志物的測(cè)量數(shù)據(jù)。這一定義包括，例如，測(cè)量/檢測(cè)HPV基因組DNA以及測(cè)量/檢測(cè)合適的HPV mRNA標(biāo)志物。優(yōu)選的方法可以基于檢測(cè)/測(cè)量HPVmRNA表達(dá)，尤其是E6/E7mRNA轉(zhuǎn)錄本的表達(dá)，作為HPV類型指標(biāo)。所測(cè) HPV類型的指征當(dāng)然必須是HPV類型特異性的。因此，基于檢測(cè)HPV基因組DNA和/或HPV mRNA (尤其是E6/E7mRNA)的測(cè)試，必須允許區(qū)分何種個(gè)體HPV類型存在于受試者的細(xì)胞樣品中。這種HPV類型特異性的輸入數(shù)據(jù)必須能夠基于為特定地理位置區(qū)域的預(yù)定HPV類型選擇來過濾結(jié)果。來自受試者的“細(xì)胞樣品”可以是含有預(yù)期存在HPV感染之細(xì)胞類型的任何樣品。適合的樣品包括包含宮頸細(xì)胞的測(cè)試樣品，例如，宮頸涂片、宮頸刮片、活檢和基于液體的細(xì)胞學(xué)樣品。在一些具體實(shí)施方案中，本發(fā)明的方法可以包括始于來自受試者之細(xì)胞樣品的生成輸入數(shù)據(jù)(即所測(cè)HPV類型的多種指征)的步驟。該步驟可包括，例如，基于對(duì)所述“輸入”HPV類型之廣泛組中每一種的HPV基因組DNA檢測(cè)進(jìn)行HPV分型；或者可以基于對(duì)所述“輸入” HPV類型之廣泛組中每一種的HPV mRNA標(biāo)志物檢測(cè)進(jìn)行HPV分型。在一些優(yōu)選的實(shí)施方案中，HPV類型的測(cè)量可以通過針對(duì)輸入HPV類型之廣泛組檢測(cè)是否存在HPV E6/ E7mRNA轉(zhuǎn)錄本來實(shí)現(xiàn)。可以采用任何合適的分子技術(shù)來實(shí)現(xiàn)對(duì)選定組中每種“輸入” HPV 類型的E6/E7 mRNA轉(zhuǎn)錄本的測(cè)量/檢測(cè)?，F(xiàn)有技術(shù)中已報(bào)道了類型特異性檢測(cè)HPV E6/ E7 mRNA的多種方法。在一些優(yōu)選的實(shí)施方案中，E6/E7 mRNA可以采用擴(kuò)增技術(shù)來檢測(cè)，例如NASBA、TMA, RT-PCR等。對(duì)于廣泛的個(gè)體HPV類型，適于類型特異性擴(kuò)增和檢測(cè)mRNA轉(zhuǎn)錄本(尤其是E6/E7 mRNA轉(zhuǎn)錄本)的引物和探針可以依據(jù)引物和探針設(shè)計(jì)的標(biāo)準(zhǔn)原則來設(shè)計(jì)，這是本領(lǐng)域普通技術(shù)人員公知的技術(shù)。在申請(qǐng)人自己的公開W003/057927中描述了很多組適于檢測(cè)E6/E7 mRNA的類型特異性的引物和探針，其公開內(nèi)容通過引用在此并入本文。輸入HPV類型的選擇HPV類型的“輸入”組可根據(jù)需要盡可能的廣泛，或者必須能夠提供“全世界范圍” 覆蓋。例如，可以包括基本上所有已知的“高風(fēng)險(xiǎn)”或癌癥相關(guān)HPV類型。本發(fā)明方法的形式允許包括模糊或稀有的HPV類型，包括那些僅與特定地理區(qū)域相關(guān)的類型，而不會(huì)對(duì)測(cè)試的總體特異性產(chǎn)生不良影響，因?yàn)橹粫?huì)輸出或顯示認(rèn)定與所調(diào)查之特定受試者的地理位置相關(guān)的結(jié)果。 在一些非限制性的具體實(shí)施方案中，所述“輸入”HPV類型可以選自如下列表6、 53、5、8、16、18、45、31、33、52、58、35、59、56、39、51、66、68、73、82 和 70。具體的實(shí)施方案可以基于該列表上至少6個(gè)、至少10個(gè)、至少14個(gè)或全部HPV類型的輸入數(shù)據(jù)。如果有需要還可以包括更多的“高風(fēng)險(xiǎn)” HPV類型。
按區(qū)域選擇HPV亞組 本發(fā)明的方法的一個(gè)標(biāo)志性特征是為所有的選定輸入HPV類型(不考慮受試者的地理位置)產(chǎn)生/輸入分型數(shù)據(jù)，但僅僅輸出或顯示HPV類型之選定亞組的數(shù)據(jù)，這一亞組是根據(jù)受試者所處地理區(qū)域而選擇的。針對(duì)每個(gè)目標(biāo)地理區(qū)域，其HPV類型的輸出亞組是預(yù)先確定的。每個(gè)區(qū)域特異性輸出亞組中包括的HPV類型總數(shù)會(huì)少于HPV類型之廣輸入組的HPV類型總數(shù)。然而，HPV類型的精確數(shù)目和這些類型的身份會(huì)隨每個(gè)地理區(qū)域而變化。 每個(gè)區(qū)域特異性輸出組中HPV類型的數(shù)目一般至少3個(gè)，而在任何給定亞組中的類型總數(shù)可以是3、4、5、6、7、8或9種。特定地理區(qū)域的適宜HPV類型輸出組可以基于該地理區(qū)域中HPV流行性數(shù)據(jù)來設(shè)計(jì)，或者可以基于臨床研究結(jié)果來確定。作為非限制性舉例，位于歐洲的受試者的輸出亞組可以包括HPV類型16、18、31、33和45或由其構(gòu)成；而亞洲受試者的輸出亞組可以包括HPV 類型16、18和52或由其構(gòu)成。北非、撒哈拉以南非洲或亞洲的輸出亞組可以包括HPV類型 16、18、31和33或由其構(gòu)成。美國/北美的輸出亞組可以包括HPV類型16、31或33 ；或類型16、18和35 ；或類型16、18和58 ；或類型16、33和58 ；或者由它們構(gòu)成。本發(fā)明的設(shè)備本發(fā)明的設(shè)備可以配置成使用關(guān)于遠(yuǎn)程測(cè)定之“所測(cè)量HPV類型的指征”的輸入數(shù)據(jù)。作為替代，本發(fā)明的設(shè)備，或并入本發(fā)明設(shè)備作為其組件的系統(tǒng)，本身可以包括設(shè)計(jì)用于產(chǎn)生所述輸入HPV類型之測(cè)量數(shù)據(jù)的組件。據(jù)此，本發(fā)明提出了這樣一種設(shè)備或系統(tǒng)，其包括用于針對(duì)輸入HPV類型之預(yù)定組來檢測(cè)/測(cè)量HPV類型之分子標(biāo)志物的工具，例如HPV基因組DNA和/或HPV mRNA ；此外還包括處理HPV分型結(jié)果并且僅僅輸出根據(jù)區(qū)域標(biāo)識(shí)器之存儲(chǔ)值由區(qū)域HPV亞組數(shù)據(jù)所定義的測(cè)量HPV類型之亞組的那些結(jié)果的工具。這種設(shè)備/系統(tǒng)的具體實(shí)施方案可以包括用于為HPV類型輸入組進(jìn)行進(jìn)行類型特異性檢測(cè)E6/E7mRNA表達(dá)的工具。檢測(cè)/測(cè)量HPV類型之分子標(biāo)志物的工具可以采用任何合適的形式。例如，檢測(cè) HPV DNA或HPV E6/E7 mRNA的工具可以包括在標(biāo)準(zhǔn)PCR反應(yīng)管中進(jìn)行的核酸擴(kuò)增測(cè)定，或者可以以微滴定板形式進(jìn)行，或者甚至可以以微陣列形式進(jìn)行。一種特別方便的形式可以基于微流體反應(yīng)室系統(tǒng)，該系統(tǒng)可以實(shí)現(xiàn)在同一患者樣品的不同小份試樣上平行地進(jìn)行各種HPV類型的獨(dú)立反應(yīng)。適合的系統(tǒng)包括在申請(qǐng)人自己的公開W002/22265中描述的那些， 其公開內(nèi)容通過引用在此并入本文。還可以考慮采用可進(jìn)行集成樣品處理的微加工/微流體系統(tǒng)，如申請(qǐng)人自己在公開W02005/073691和WO 2008/149111中描述的那些，其公開內(nèi)容通過引用在此并入本文。
權(quán)利要求
1.自動(dòng)提供在人類女性所提供細(xì)胞樣品中多種HPV類型之選定類型的存在狀況的指征的方法，其包括存儲(chǔ)定義多個(gè)地理區(qū)域中每個(gè)區(qū)域的所述HPV類型之亞組的區(qū)域HPV亞組數(shù)據(jù)； 接收指示至少一個(gè)所述地理區(qū)域的區(qū)域標(biāo)識(shí)器； 接收HPV類型的多個(gè)測(cè)量數(shù)據(jù)；和選擇由針對(duì)區(qū)域標(biāo)識(shí)器所指示之所述至少一個(gè)地理區(qū)域的HPV亞組數(shù)據(jù)所定義的所述測(cè)量數(shù)據(jù)的亞組。
2.權(quán)利要求1的方法，其還包括僅輸出或顯示選定HPV類型亞組的存在狀況的步驟。
3.權(quán)利要求1或權(quán)利要求2的方法，其中所述多個(gè)HPV類型測(cè)量數(shù)據(jù)包括HPV類型6、 53、5、8、16、18、45、31、33、52、58、35、59、56、39、51、66、68、73、82 和 70 中至少 6 種 HPV 類型的測(cè)量數(shù)據(jù)。
4.權(quán)利要求1至3中任一項(xiàng)的方法，其中在所述區(qū)域HPV亞組數(shù)據(jù)中定義的HPV類型亞組包含3種或更多種HPV類型。
5.權(quán)利要求1至4中任一項(xiàng)的方法，其還包括產(chǎn)生多個(gè)HPV類型測(cè)量數(shù)據(jù)的額外步驟。
6.自動(dòng)提供在人類女性所供細(xì)胞樣品中多個(gè)HPV類型之選定類型的指征的設(shè)備，其包括為多個(gè)地理區(qū)域中每個(gè)區(qū)域定義所述多個(gè)HPV類型之亞組的區(qū)域HPV數(shù)據(jù)； 適于存儲(chǔ)指示多個(gè)地理區(qū)域之值的區(qū)域標(biāo)識(shí)器；和處理器，適于指導(dǎo)僅僅輸出根據(jù)由區(qū)域標(biāo)識(shí)器之存儲(chǔ)值的區(qū)域HPV亞組數(shù)據(jù)所定義的測(cè)量HPV類型之亞組的指征。
7.權(quán)利要求6的設(shè)備，其還包括適于接收人類女性提供之細(xì)胞樣品并向所述處理器提供所檢測(cè)HPV類型之指征的設(shè)備。
8.權(quán)利要求7的設(shè)備，其中所述處理器控制適于向處理器提供所檢測(cè)HPV類型之指征的設(shè)備，以便僅將特定指征提供給所述處理器。
9.權(quán)利要求8的設(shè)備，其中所述處理器接收所測(cè)量HPV類型的所有指征，并棄去那些不與根據(jù)所述區(qū)域標(biāo)識(shí)器存儲(chǔ)值由區(qū)域HPV亞組數(shù)據(jù)所定義的測(cè)量HPV類型之亞組相對(duì)應(yīng)的指征。
全文摘要
本發(fā)明涉及根據(jù)人乳頭瘤病毒之存在狀況篩選人類女性受試者的體外方法，例如其可作為宮頸上皮癌前病變的標(biāo)志物。具體地，本發(fā)明提供可用于根據(jù)所測(cè)患者的地理位置來過濾與多種HPV類型相關(guān)之患者測(cè)量數(shù)據(jù)組的方法和設(shè)備，使得僅選擇預(yù)先確定與所測(cè)患者所處地理區(qū)域相關(guān)的那些HPV類型測(cè)量數(shù)據(jù)用于輸出/顯示。
文檔編號(hào)G06F19/00GK102292729SQ200980150067
公開日2011年12月21日 申請(qǐng)日期2009年11月12日 優(yōu)先權(quán)日2008年11月12日
發(fā)明者弗蘭克·卡爾森, 漢內(nèi)·西科梅達(dá)爾 申請(qǐng)人:諾奇普公司