一種拉曼成像信號提取與后處理方法
【技術領域】
[0001] 本發(fā)明涉及拉曼信號處理領域,特別是一種拉曼成像信號提取與后處理方法。
【背景技術】
[0002] 作為一種分子振動光譜技術,拉曼光譜的指紋圖譜特點使得其成為鑒別物質的一 種重要工具。近年來,因無需標記、非侵入等優(yōu)點,拉曼成像在生物和醫(yī)學診斷領域受到廣 泛關注。借助于拉曼光譜儀器的改進(如多點同時掃描的線聚焦模式等),拉曼成像質量和 成像速度都有了質的改善和提高,能夠在數(shù)分鐘內(nèi)實現(xiàn)成像分析而用于活體成像。
[0003] 通常,獲得高質量拉曼成像圖的前提是提供低噪聲水平的拉曼譜圖。對于大部分 樣品,延長采譜時間,可有效降低儀器的隨機背景噪聲的同時有效保留樣品的拉曼信號。然 而,采譜時間的延長,會降低拉曼成像的實時性,使得對被測目標的在線跟蹤變得十分困 難。即便對于一些能夠在短時間里獲得低噪聲水平的拉曼譜圖,由于需要先對單個譜圖數(shù) 據(jù)進行去噪、背景扣除和譜峰選取及強度測量等步驟,因此,通常情況下,拉曼成像結果的 獲得需要一定的處理時間,很難進行實時在線跟蹤的拉曼成像分析,進而無法對感興趣區(qū) 域進行準確定位以深入研究。
[0004] 目前,在拉曼成像信號處理中普遍采用的算法有Savitzky-Golay(SG)、有限長單 位沖擊響應濾波、小波轉換、因子分析和維納濾波等。這些算法各有優(yōu)缺點和適用范圍,但 一個共同的不足在于,這些方法均需要較多的計算量和計算時間,難以實現(xiàn)拉曼成像的實 時在線分析。
【發(fā)明內(nèi)容】
[0005] 本發(fā)明的主要目的在于克服現(xiàn)有技術中的上述缺陷,提出一種拉曼成像信號的提 取與后處理方法,能夠在有效抑制噪聲并成像的同時,保證計算的速度。
[0006] 本發(fā)明采用如下技術方案:
[0007] -種拉曼成像信號提取與后處理方法,其特征在于,包括如下步驟:
[0008] 1)從拉曼成像儀器中獲得拉曼光譜信號,其包含mXn個光譜譜圖 Iyii』,1彡i彡m, 1彡j彡η組成,i為行數(shù),j為列數(shù),m為成像的行數(shù),η為成像的列數(shù), yi,.j為向量;
[0009] 2)對所有的光譜譜圖求平均譜圖,,并選擇待觀察物質的特征譜峰范圍,從平均 譜圖中截取特定區(qū)域;
[0010] 3)根據(jù)步驟2)選出的特定區(qū)域,從所有拉曼光譜Yii 中截取帶觀察物質的特征譜 峰?Il圍;
[0011] 4)將每個拉曼光譜截取的譜峰數(shù)據(jù)(步驟3)所得)依次與平均譜圖截取的譜峰 數(shù)據(jù)(步驟2)所得)做相關運算,并取相關函數(shù)R1,, ( τ )的最大值ai,
[0012] 5)對所有的ay進行后處理,獲得{b I J ;
[0013] 6)將Ib1J歸一化到0-255之間,并平均分為若干份,每一份采用不同的顏色表 征,根據(jù)Ib1J的坐標畫出拉曼成像色彩圖。
[0014] 優(yōu)選的,在步驟5)中,所述的后處理為采用公式:
式 中,u,V分別代表行數(shù)和列數(shù);i,j分別代表行數(shù)和列數(shù);d[g]為兩點的歐式距離;r[g]為 兩點之間的相對強度,Ω-α,j)表示除(i,j)外所有的成像點的集合。
[0015] 優(yōu)選的,在步驟4)中,所述的相關運算為
,其中,N表示 Y1J(X)肺副勺維數(shù),丁表示延時序號,X為拉曼位移。
[0016] 由上述對本發(fā)明的描述可知,與現(xiàn)有技術相比,本發(fā)明具有如下有益效果:
[0017] 本發(fā)明可用于處理經(jīng)由拉曼成像儀器獲取的拉曼成像信號,可以從中提取有用信 息,并進行后處理以提高成像清晰度,其采用相關法作為有用信息的提取方法,具有一定的 噪聲抑制作用。此外,以歐式距離為依據(jù),考慮成像點之間的相互關系,進行進一步的后處 理,能提高成像清晰度。本方法與拉曼成像的硬件相配合,可以實現(xiàn)快速拉曼成像,具有 較強的噪聲抑制和清晰成像能力,對于采用拉曼成像技術觀察快速變化過程具有重大的意 義。
【附圖說明】
[0018] 圖1為對某物質進行拉曼成像時,某一個點的拉曼譜圖。
[0019] 圖2為對某物質進行拉曼成像時,所有點拉曼譜圖的平均譜圖。
[0020] 圖3為Saturation函數(shù)圖形。
[0021] 圖4為某物質的拉曼成像圖。
[0022] 圖5為本發(fā)明方法的流程圖。
【具體實施方式】
[0023] 以下通過【具體實施方式】對本發(fā)明作進一步的描述。
[0024] 參照圖5, 一種拉曼成像信號提取與后處理方法,不需要進行消噪和基線校正,直 接獲取實現(xiàn)拉曼成像的方法,包括如下步驟:
[0025] 1)從拉曼成像儀器中獲得拉曼光譜譜圖{yj,1彡i彡m,1彡j彡n,i為行數(shù), j為列數(shù),m為成像的行數(shù),η為成像的列數(shù),^ ,為向量,光譜譜圖由被測物決定,參照圖1 的某種物質的拉曼光譜譜圖。
[0026] 2)對所有的拉曼光譜求平均譜圖y,并選取待觀察物質的特征譜峰范圍,從平均 譜圖中截取,如圖2放大圖內(nèi)的矩形框所示。顯然,平均譜圖j的噪聲水平低于任意一個 光譜yu。
[0027] 3)根據(jù)步驟2選出的區(qū)域,從所有拉曼光譜yii]中截取待觀察物質的特征譜峰范 圍,如圖1放大圖內(nèi)的矩形框所示。
[0028] 4)將每個拉曼光譜截取的譜峰數(shù)據(jù)(步驟3)所得)依次與平均譜圖截取的譜峰 數(shù)據(jù)(步驟2)所得)做相關運算,并取相關函數(shù)U τ)的最大值ai ]。相關函數(shù)基于信 號和噪聲的統(tǒng)計特性,是兩個時域信號相似性的一種度量,被廣泛應用于檢測數(shù)據(jù)處理和 微弱信號檢測等領域。對于幅值在一定范圍內(nèi)的兩個拉曼信號,其相似度越高,則它們的相 關函數(shù)的最大值越大。對于在Iy1J中帶有噪聲的拉曼信號yu(X)和平均譜圖黃相關 運算是一個累加平均的過程,如式(1)所示:
[0030] 式中,N表示yu (X)和yu)的維數(shù),τ表示延時序號,X為拉曼位移,Rii j ( τ )為 L(X)和J7W的相關函數(shù)。
[0031] 將yi,.j(x)和歹(丨)表示為純拉曼信號和噪聲的開多式,即yi,.j(x) = 8?」(χ)+η;」(χ)和 貝λ·)=死?) +可λ·)。這里,Si,』(X)和只λ·)為不帶噪聲的拉曼信號,叫,』(X)和_)為零均值白噪 聲。若用符號E[g]表示相關運算,由于相關運算是線性運算,因此式(1)可以寫為:
[0033] 這里,尺,./,&.分別為 Siij(X)和私\),Siij(X)和 ji(A·),IliJ(X)和Τ(Λ·), Illi j(X)和可t)的相關函數(shù)。顯然,隨機噪聲ni,J(x)和珂Λ-)互不相關,且ni,J(X)和珂為分別 與Sli j(X)和只X)也互不相關,從而式(2)中的7均等于零。因此,相關運算可 以有效的削弱噪聲的影響。取相關函數(shù)R^(T)的最大值作為物質的濃度信息,BP:
[0034] j= maxCR^ j( τ )) (3)
[0035] 式⑶中,max[g]表示取最大值。
[0036] 5)獲得{aij后,可直接以不同顏色表征的大小,獲得拉曼成像圖。如果該成 像圖的清晰度仍不滿足要求,可對Ia1 j利用式(4)進行后處理,以進一步提高成像的清晰 度,后處理的公式如下:
[0038] 式中,u,V和i,j 一樣,分別代表行數(shù)和列數(shù);d[g]為兩點的歐式距離;r[g]為兩 點之間的相對強度,以au-a^為輸入,其函數(shù)圖形為Saturation函數(shù),如圖3所示,其斜線 的傾角可根據(jù)實際情況調(diào)整,一般為60-90度;表示除(i,j)外所有的成像點的 集合經(jīng)過后處理,獲得了 Ib1,,},I < i < m,I < j < η。
[0039] 6)將Ib1,』歸一化到0-255之間(最小值為0,最大值為255),并平均分為若干份 或區(qū)間(平分的分數(shù)越多,則圖像越細致),每一份或每一區(qū)間采用不同的顏色表征(比如 等分為五個區(qū)間,則每個區(qū)間內(nèi)的點分別用紅、橙、黃、綠、藍色表示),最后按照Ib1J的坐 標,即坐標(i,j)的位置畫出拉曼成像彩色圖,如圖4所示。
[0040] 本發(fā)明所提出的方法,僅涉及簡單的加乘運算,計算速度較快,適合用于快速拉曼 成像信號處理上。
[0041] 上述僅為本發(fā)明的【具體實施方式】,但本發(fā)明的設計構思并不局限于此,凡利用此 構思對本發(fā)明進行非實質性的改動,均應屬于侵犯本發(fā)明保護范圍的行為。
【主權項】
1. 一種拉曼成像信號提取與后處理方法,其特征在于,包括如下步驟: 1) 從拉曼成像儀器中獲得拉曼光譜信號,其包含mXn個光譜譜圖 Iyii』,1彡i彡m, 1彡j彡η組成,i為行數(shù),j為列數(shù),m為成像的行數(shù),η為成像的列數(shù), yi,.j為向量; 2) 對所有的光譜譜圖求平均譜圖y,并選擇待觀察物質的特征譜峰范圍,從平均譜圖 中截取特定區(qū)域; 3) 根據(jù)步驟2)選出的特定區(qū)域,從所有拉曼光譜Yii 中截取待觀察物質的特征譜峰范 圍; 4) 將每個拉曼光譜截取的譜峰數(shù)據(jù)(步驟3)所得)依次與平均譜圖截取的譜峰數(shù)據(jù) (步驟2)所得)做相關運算,并取相關函數(shù)R 1, j ( τ )的最大值ai, j; 5) 對所有的進行后處理,獲得Ib1J ; 6) 將Ib1J歸一化到0-255之間,并平均分為若干份,每一份采用不同的顏色表征,根 據(jù)Ib1J的坐標畫出拉曼成像色彩圖。2. 如權利要求1所述的一種拉曼成像信號提取與后處理方法,其特征在于,在步驟 5)中,所述的后處理為采用公式:< 式中,u,v分別代表行數(shù)和 列數(shù);i,j分別代表行數(shù)和列數(shù);d[g]為兩點的歐式距離,;r[g]為兩點之間的相對強度, Ω_(:?,j)表示除(i,j)外所有的成像點的集合。3. 如權利要求1所述的一種拉曼成像信號提取與后處理方法,其特征在于:在步驟4) 中,所述的相關運算為,其中,N表示yii](x)和7(.τ)的維數(shù),τ表 示延時序號,X為拉曼位移。
【專利摘要】一種拉曼成像信號提取與后處理方法,包括如下步驟:1)從拉曼成像儀器中獲得拉曼光譜信號;2)對所有的光譜譜圖求平均譜圖,并選擇待觀察物質的特征譜峰范圍,從平均譜圖中截取特定區(qū)域;3)根據(jù)步驟2)選出的特定區(qū)域,從所有拉曼光譜yi,j中截取待觀察物質的特征譜峰范圍;4)將每個拉曼光譜截取的譜峰數(shù)據(jù)(步驟3)所得)依次與平均譜圖截取的譜峰數(shù)據(jù)(步驟2)所得)做相關運算,并取相關函數(shù)Ri,j(τ)的最大值ai,j;5)對所有的ai,j進行后處理,獲得{bi,j};6)將{bi,j}歸一化到0-255之間,并平均分為若干份,每一份采用不同的顏色表征,根據(jù){bi,j}的坐標畫出拉曼成像色彩圖。本發(fā)明所提出的方法,僅涉及簡單的加乘運算,計算速度較快,適合用于快速拉曼成像信號處理上。
【IPC分類】G06K9/00
【公開號】CN105184223
【申請?zhí)枴緾N201510486300
【發(fā)明人】王昕 , 劉國坤, 范賢光, 許英杰, 何浩, 王秀芬
【申請人】廈門大學
【公開日】2015年12月23日
【申請日】2015年8月10日