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      用于糞便菌群植入的組合物及其制備和使用方法以及遞送該組合物的裝置與流程

      文檔序號(hào):11990666閱讀:313來(lái)源:國(guó)知局
      用于糞便菌群植入的組合物及其制備和使用方法以及遞送該組合物的裝置與流程
      本發(fā)明大體涉及內(nèi)科和腸胃病學(xué)、藥理學(xué)以及微生物學(xué)。在可選擇的實(shí)施方案中,本發(fā)明提供了用于植入處理的或分離的糞便菌群的組合物(例如配方或制劑)和裝置,以及制備和使用它們的方法。在可選擇的實(shí)施方案中,本發(fā)明的組合物、裝置和方法可用于任何胃、胃腸和/或結(jié)腸的治療或灌洗。在可選擇的實(shí)施方案中,本發(fā)明的組合物、裝置和方法用于減輕、穩(wěn)定、治療和/或預(yù)防諸如以下的疾病或病癥:便秘,克羅恩病,暴露于毒藥或毒素或感染,例如毒素介導(dǎo)的旅行者腹瀉;或具有腸道功能障礙成分的任何腸病或病癥,例如,炎癥性腸病(IBD),克羅恩病,肝性腦病,小腸炎,腸炎,腸易激綜合征(IBS),纖維肌痛(FM),慢性疲勞綜合征(CFS),注意力缺陷/多動(dòng)癥(ADHD),多發(fā)性硬化癥(MS),系統(tǒng)性紅斑狼瘡(SLE),旅行者腹瀉,小腸細(xì)菌過(guò)度生長(zhǎng),慢性胰腺炎或胰功能不全。在可選擇的實(shí)施方案中,本發(fā)明提供了用于將這些組合物和配方遞送至個(gè)體如人或動(dòng)物的藥物和制品(產(chǎn)品)。本發(fā)明還提供了用于將糞便物遞送至個(gè)體如患者的裝置。背景從治療角度看,最近腸道細(xì)菌菌群已得到重視。目前意識(shí)到,人類菌群,已不僅僅只是由食物消化產(chǎn)生的廢料,而是重要的含有大量活微生物的虛擬機(jī)構(gòu)。在遺傳上不同但線性相關(guān)的微生物家族和子群中安排有超過(guò)十萬(wàn)種不同的亞種或更多。廢“料”組成菌群的一部分。菌群中細(xì)菌內(nèi)容物主動(dòng)分解或代謝細(xì)菌細(xì)胞在其上生長(zhǎng)的不吸收的物質(zhì),主要是纖維。由于細(xì)菌菌群包含于人體內(nèi),并且由活體成分組成,其實(shí)際上構(gòu)成活體機(jī)構(gòu)或虛擬機(jī)構(gòu)。該虛擬的機(jī)構(gòu)可以是健康的,因?yàn)槠洳缓魏沃虏⌒晕⑸?,或者其能夠被寄生蟲、細(xì)菌或病毒感染或寄生。當(dāng)被一些致病性物種感染時(shí),這些感染物種能夠產(chǎn)生影響分泌的分子,這可能會(huì)引起疼痛或可能會(huì)使腸麻痹而導(dǎo)致便秘。腸道菌群或腸道菌群機(jī)構(gòu)的感染可能會(huì)影響個(gè)體的健康。這些感染多數(shù)是急性的,諸如霍亂,但是有一些可能是慢性的,并且可以真正影響攜帶感染菌群的個(gè)體的生活。例如,在抗生素治療后,一些家族的細(xì)菌能夠被抑制或根除,而傳染劑如艱難梭菌(Clostridiumdifficile)和其它病原體能夠寄生,并成為人類菌群的不速之客(passenger)。這些“不速之客”還是致病性的,因?yàn)樗鼈兡軌虍a(chǎn)生毒素,如艱難梭菌的毒素A和毒素B。定義以下是可能有助于理解本發(fā)明說(shuō)明書的一些定義。這些意圖作為一般的定義,并且不應(yīng)以任何方式將本發(fā)明的范圍限制到那些單獨(dú)的術(shù)語(yǔ),而是應(yīng)當(dāng)為更好地理解以下說(shuō)明書而提出。除非上下文規(guī)定并非如此或明確指出相反,在本文作為單數(shù)的整數(shù)、步驟或元件記載的本發(fā)明的整數(shù)、步驟或元件明確包括所記載的整數(shù)、步驟或元件的單數(shù)和復(fù)數(shù)形式。在整篇說(shuō)明書中,詞語(yǔ)“包括(comprise)”或諸如“包括(comprises)”或“包括(comprising)”的變型,應(yīng)當(dāng)理解為暗指包括列舉出的步驟或元件或整數(shù),或步驟或元件或整數(shù)組,但是不排除任何其它的步驟或元件或整數(shù),或元件或整數(shù)組。因此,在本說(shuō)明書的背景下,術(shù)語(yǔ)“包括(comprising)”表示“主要包括,但并不必然唯一包括”。概述按照本發(fā)明的第一方面,提供了包含以下的遞送載體,配方,組合物,藥物制劑,制品,容器或裝置:整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群;處理或未處理的糞便菌群;完整或部分的糞便菌群,基本上或完全不含非糞便菌群糞便物的糞便菌群,或部分、基本上或完全分離或純化的糞便菌群,其通過(guò)包括以下步驟的方法制備:(i)提供整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群,處理或未處理的糞便菌群樣品,完整或部分的糞便菌群樣品,基本上或完全不含非糞便菌群糞便物的糞便菌群,或部分、基本上或完全分離或純化的糞便菌群;以及遞送載體,配方,藥物制劑,組合物,制品,容器或裝置,以及(ii)將所述整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群,所述處理或未處理的糞便菌群樣品,所述完整或部分的糞便菌群樣品,所述基本上或完全不含非糞便菌群糞便物的糞便菌群,或所述部分、基本上或完全分離或純化的糞便菌群放置于所述遞送載體,配方,組合物,藥物制劑,制品,容器或裝置中。按照本發(fā)明的第二方面,提供了包含第一方面的遞送載體,配方,組合物,藥物制劑,容器或裝置的制品(產(chǎn)品)。按照本發(fā)明的第三方面,提供了制備第一或第二方面的遞送載體,配方,組合物,藥物制劑,制品,容器或裝置的方法,所述方法包括:(i)提供:整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群;處理或未處理的糞便樣品;完整或部分的糞便菌群樣品,基本上或完全不含非糞便菌群糞便物的糞便菌群或部分、基本上或完全分離或純化的糞便菌群;以及遞送載體,配方,藥物制劑,組合物制品,容器或裝置,以及(ii)將所述整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群,所述處理或未處理的糞便樣品,所述完整或部分的糞便菌群,所述基本上或完全不含非糞便菌群糞便物的糞便菌群或所述部分、基本上或完全分離或純化的糞便菌群放置于所述遞送載體,配方,藥物制劑,組合物,制品,容器或裝置中,并在所述容器或裝置中產(chǎn)生基本上或完全無(wú)氧的環(huán)境。按照本發(fā)明的第四方面,提供了用于改善,穩(wěn)定,治療和/或預(yù)防感染,疾病,處理,中毒或具有腸功能障礙成分或副作用的病癥的方法,或用于改善,治療和/或預(yù)防便秘的方法,用于治療腹痛,不明確的腹痛或腹瀉,由藥物副作用或心理狀況或克羅恩病,毒藥,毒素或感染引起的腹瀉,毒素介導(dǎo)的旅行者腹瀉或者梭菌或產(chǎn)氣莢膜梭菌或艱難梭菌感染或與梭菌感染相關(guān)的假膜性腸炎的方法,所述方法包括:通過(guò)第一方面的遞送載體,配方,組合物,藥物制劑,制品,容器或裝置或者第二方面的制品(產(chǎn)品)給予有需要的個(gè)體所述整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群,所述處理或未處理的糞便菌群樣品,所述完整或部分的糞便菌群樣品,所述基本上或完全不含非糞便菌群糞便物的糞便菌群或所述部分、基本上或完全分離或純化的糞便菌群。按照本發(fā)明的第五方面,提供了包含以下的遞送載體,配方,組合物,藥物制劑,制品,容器或裝置:整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群;部分、基本上或完全分離或純化的糞便菌群;或包含基本上或完全不含非糞便菌群糞便物的糞便菌群的組合物。按照本發(fā)明的第六方面,提供了用于改善,穩(wěn)定,治療和/或預(yù)防感染,疾病,處理,中毒或具有腸功能障礙成分或副作用的病癥的方法,其包括通過(guò)第五方面的遞送載體,配方,組合物,藥物制劑,制品,容器或裝置給予有需要的個(gè)體所述整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群,所述部分、基本上或完全分離或純化的糞便菌群或所述包含基本上或完全不含非糞便菌群糞便物的糞便菌群的組合物。按照本發(fā)明的第七方面,提供了遞送第一方面的糞便物或組合物的裝置,其包括:(a)圖1B或圖2所示的裝置;或(b)裝置,其包括(i)袋子或容器,其包括可控連接至軟管或等同物近端的出口孔,(ii)在所述軟管或等同物遠(yuǎn)端的開(kāi)關(guān)閥或等同物或閉孔螺帽,以及(iii)泵或手泵,用于通過(guò)所述軟管或等同物將袋子或容器中的材料移出至遠(yuǎn)端或開(kāi)關(guān)閥或等同物;或(c)(a)或(b)的裝置,其還包含第一方面的糞便物或組合物。按照本發(fā)明的第八方面,提供了包含以下的袋子或容器:整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群;處理或未處理的糞便菌群;完整或部分的糞便菌群,基本上或完全不含非糞便菌群糞便物的糞便菌群,或者部分、基本上或完全分離或純化的糞便菌群,或以上的組合物,其中所述袋子或容器在結(jié)構(gòu)上與第七方面的裝置的袋子或容器相同或相似。按照本發(fā)明的第九方面,提供了用于改善,穩(wěn)定,治療和/或預(yù)防感染,疾病,處理,中毒或具有腸功能障礙成分或副作用的病癥或減輕或延緩感染,疾病,處理,中毒或具有腸功能障礙成分或副作用的病癥的癥狀的方法,或用于改善,治療和/或預(yù)防便秘的方法,用于治療腹痛,不明確的腹痛或腹瀉,由藥物副作用或心理狀況或克羅恩病,毒藥,毒素或感染引起的腹瀉,毒素介導(dǎo)的旅行者腹瀉或者梭菌或產(chǎn)氣莢膜梭菌或艱難梭菌感染或與梭菌感染相關(guān)的假膜性腸炎的方法,或者用于預(yù)防或減輕或延緩患有以下疾病的個(gè)體的癥狀或者改善或治療患有以下疾病的個(gè)體的方法:脊椎關(guān)節(jié)病,脊椎關(guān)節(jié)炎或骶髂關(guān)節(jié)炎(一個(gè)或兩個(gè)骶髂關(guān)節(jié)的炎癥);腎炎綜合征;具有消化道或腸成分的炎癥性或自身免疫病癥;狼瘡;腸易激綜合征(IBS或痙攣性結(jié)腸);或腸炎;潰瘍性腸炎或克羅恩腸炎;便秘;孤獨(dú)癥;退行性神經(jīng)疾??;肌肉萎縮性側(cè)索硬化癥(ALS),多發(fā)性硬化癥(MS)或帕金森氏病(PD);肌張力障礙;斯太納特(Steinert’s)?。唤思?qiáng)直性肌??;自身免疫性疾病;風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎(RA)或幼年特發(fā)性關(guān)節(jié)炎(JIA);慢性疲勞綜合征;良性肌痛性腦脊髓炎;慢性疲勞免疫功能障礙綜合征;慢性傳染性單核細(xì)胞增多癥;流行性肌痛性腦脊髓膜炎;肥胖;低血糖癥,糖尿病前期綜合征,I型糖尿病或II型糖尿病;特發(fā)性血小板減少性紫癜(ITP);急性或慢性過(guò)敏反應(yīng);蕁麻疹,皮疹,風(fēng)疹或慢性風(fēng)疹;和/或失眠或慢性失眠,癲癇大發(fā)作或癲癇小發(fā)作,所述方法包括:通過(guò)第一方面的遞送載體,配方,組合物,藥物制劑,制品,容器或裝置或第二方面的制品(產(chǎn)品),以單次、重復(fù)或多次給予、遞送或灌注的方式,給予有需要的個(gè)體所述整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群,所述處理或未處理的糞便菌群樣品,所述完整或部分的糞便菌群樣品,所述基本上或完全不含非糞便菌群糞便物的糞便菌群或者所述部分、基本上或完全分離或純化的糞便菌群,。按照本發(fā)明的第十方面,提供了用于改善,穩(wěn)定,治療和/或預(yù)防感染,疾病,處理,中毒或具有腸功能障礙成分或副作用的病癥;或用于改善,治療和/或預(yù)防便秘;用于治療腹痛,不明確的腹痛或腹瀉,由藥物副作用或心理狀況或克羅恩病,毒藥,毒素或感染引起的腹瀉,毒素介導(dǎo)的旅行者腹瀉或者梭菌或產(chǎn)氣莢膜梭菌或艱難梭菌感染或與梭菌感染相關(guān)的假膜性腸炎腹瀉的整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群,處理或未處理的糞便菌群樣品,完整或部分的糞便菌群樣品,基本上或完全不含非糞便菌群糞便物的糞便菌群,或者部分、基本上或完全分離或純化的糞便菌群。按照本發(fā)明的第十一方面,提供了整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群,處理或未處理的糞便菌群樣品,完整或部分的糞便菌群樣品,基本上或完全不含非糞便菌群糞便物的糞便菌群,或者部分、基本上或完全分離或純化的糞便菌群在制備用于以下的藥物中的用途:改善,穩(wěn)定,治療和/或預(yù)防感染,疾病,處理,中毒或具有腸功能障礙成分或副作用的病癥;或用于改善,治療和/或預(yù)防便秘;用于治療腹痛,不明確的腹痛或腹瀉,由藥物副作用或心理狀況或克羅恩病,毒藥,毒素或感染引起的腹瀉,毒素介導(dǎo)的旅行者腹瀉或者梭菌或產(chǎn)氣莢膜梭菌或艱難梭菌感染或與梭菌感染相關(guān)的假膜性腸炎腹瀉。按照本發(fā)明的第十二方面,提供了第七方面的裝置在以下情況中遞送糞便物或整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群,處理或未處理的糞便菌群樣品,完整或部分的糞便菌群樣品,基本上或完全不含非糞便菌群糞便物的糞便菌群,或者部分、基本上或完全分離或純化的糞便菌群的用途:改善,穩(wěn)定,治療和/或預(yù)防感染,疾病,處理,中毒或具有腸功能障礙成分或副作用的病癥;或用于改善,治療和/或預(yù)防便秘;用于治療腹痛,不明確的腹痛或腹瀉,由藥物副作用或心理狀況或克羅恩病,毒藥,毒素或感染引起的腹瀉,毒素介導(dǎo)的旅行者腹瀉或者梭菌或產(chǎn)氣莢膜梭菌或艱難梭菌感染或與梭菌感染相關(guān)的假膜性腸炎腹瀉。在可選擇的實(shí)施方案中,本發(fā)明提供了組合物(包括配方,藥物組合物,食品,飼料,補(bǔ)充劑,制品等)以及制備和使用它們的方法,所述組合物包括遞送載體,配方,容器或裝置,其包含處理或未處理的糞便菌群,或部分、基本上或完全分離的糞便菌群。在可選擇的實(shí)施方案中,本發(fā)明提供了包含處理或未處理的糞便菌群,整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群和/或部分、基本上或完全分離的糞便菌群的遞送載體,配方,藥物制劑,制品,容器或裝置,其通過(guò)包括以下步驟的方法制備:(a)(i)提供處理或未處理的糞便樣品,或包含整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群的樣品,或包含完整或部分的糞便菌群或部分、基本上或完全分離或純化的糞便菌群的組合物;以及遞送載體,配方,藥物制劑,制品,容器或裝置,以及(ii)將所述處理或未處理的糞便樣品,所述部分、基本上或完全分離或純化的糞便菌群,所述整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群,或包含完整或部分糞便菌群或部分、基本上或完全分離或純化的糞便菌群的組合物放置于所述遞送載體,配方,藥物制劑,制品,容器或裝置中,并且任選地,在所述遞送載體,配方,藥物制劑,制品,容器或裝置中產(chǎn)生基本上或完全無(wú)氧的環(huán)境,以及任選地,所述遞送載體,配方,藥物制劑,制品,容器或裝置在放置所述處理或未處理的糞便樣品或所述部分、基本上或完全分離或純化的糞便菌群之前是無(wú)菌的或不含細(xì)菌的;(b)(a)所述的遞送載體,配方,藥物制劑,制品,容器或裝置,其中所述遞送載體,配方,藥物制劑,制品,容器或裝置通過(guò)以下形成基本上或完全無(wú)氧(例如,至少約90%,91%,92%,93%,94%,95%,96%,97%,98%,99%,99.5%,99.6%,99.7%,99.8%或99.9%無(wú)氧):將內(nèi)置或夾住的氧清除裝置并入所述遞送載體,配方,藥物制劑,制品,容器或裝置;和/或所述遞送載體,配方,藥物制劑,制品,容器或裝置包含氧清除材料或由氧清除材料包被;和/或用氮?dú)夂?或其它惰性非反應(yīng)性氣體完全或基本上置換所述遞送載體,配方,藥物制劑,制品,容器或裝置中的空氣;(c)(a)或(b)所述的遞送載體,配方,藥物制劑,制品,容器或裝置,其中所述遞送載體,配方,藥物制劑,制品,容器或裝置部分、基本上或完全模擬(產(chǎn)生)無(wú)氧的環(huán)境;(d)(a)至(c)中任一項(xiàng)所述的遞送載體,配方,藥物制劑,制品,容器或裝置,其中為了人或動(dòng)物使用而制備、標(biāo)記或配制所述遞送載體,配方,藥物制劑,制品,容器或裝置;(e)(d)所述的遞送載體,配方,藥物制劑,制品,容器或裝置,其中所述動(dòng)物使用是用于獸醫(yī)用途;(f)(a)至(e)中任一項(xiàng)所述的遞送載體,配方,藥物制劑,制品,容器或裝置,其中在儲(chǔ)存或冷凍,噴霧干燥,冷凍干燥或凍干之前,將穩(wěn)定劑或甘油添入或混入所述處理或未處理的糞便樣品,整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群,或部分、基本上或完全分離的糞便菌群;(g)(a)至(f)中任一項(xiàng)所述的遞送載體,配方,藥物制劑,制品,容器或裝置,其中所述遞送載體,配方,藥物制劑,制品,容器或裝置最初被制備成或配制成液體,懸浮液,凝膠,凝膠片(geltab),半固體,片劑,藥袋(sachet),錠劑或膠囊或作為腸道配方,或再次被配制成液體,懸浮液,凝膠,凝膠片,半固體,片劑,藥袋,錠劑或膠囊或者作為腸道配方來(lái)最終遞送;(h)(a)至(g)中任一項(xiàng)所述的遞送載體,配方,藥物制劑,制品,容器或裝置,其中通過(guò)以下處理所述糞便樣品,使得糞便菌群與糞便樣品中的粗顆粒物質(zhì)分離:通過(guò)勻漿,離心和/或過(guò)濾糞便物的粗顆粒物質(zhì)或非糞便物質(zhì),或通過(guò)血漿除去法,離心法,細(xì)胞分離法(celltrifuge),柱層析法(例如,親和層析法),免疫沉淀法(例如,固定于諸如珠子或平板的固體表面的抗體);(i)(a)至(h)中任一項(xiàng)所述的遞送載體,配方,藥物制劑,制品,容器或裝置,其中所述處理或未處理的糞便菌群,整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群,或部分、基本上或完全分離或純化的糞便菌群是凍干的、冷凍干燥的或冷凍的或被加工成粉末;(j)(a)至(i)中任一項(xiàng)所述的遞送載體,配方,藥物制劑,制品,容器或裝置,其中所述糞便菌群(包括例如,所述整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群)最初來(lái)源于篩查或測(cè)試疾病或感染的個(gè)體和/或所述糞便菌群最初來(lái)源于經(jīng)篩查具有正常、健康或野生型糞便菌群的個(gè)體;(k)(a)至(j)中任一項(xiàng)所述的遞送載體,配方,藥物制劑,制品,容器或裝置,其中基本上分離或純化的糞便菌群或整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群是(包含)糞便菌群的分離物,其是至少約90%,91%,92%,93%,94%,95%,96%,97%,98%,99%,99.5%,99.6%,99.7%,99.8%或99.9%分離的或純的,或具有不超過(guò)約0.1%,0.2%,0.3%,0.4%,0.5%,0.6%,0.7%,0.8%,0.9%或1.0%或更多的非糞便菌群物;或者(l)(a)至(j)中任一項(xiàng)所述的遞送載體,配方,藥物制劑,制品,容器或裝置,其中所述處理或未處理的糞便樣品,整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群,或所述部分、基本上或完全分離或純化的糞便菌群的量經(jīng)配制或標(biāo)準(zhǔn)化,用于重復(fù)或多次遞送或灌注,其中,任選地,重復(fù)或多次給予、遞送、灌注或植入方案包括每天進(jìn)行灌注第一次大約10天,第二次每天灌注大約10天,第三次每天灌注,然后是第四次每天灌注可能是每周,然后任選地,維持第二次或更多的每周灌注,直到組織恢復(fù)正常狀態(tài)。在可選擇的實(shí)施方案中,本發(fā)明的遞送載體,配方,藥物制劑,制品,容器或裝置還包含:鹽水,介質(zhì),消泡劑,表面活性劑,潤(rùn)滑劑,酸中和劑,標(biāo)志物,細(xì)胞標(biāo)志物,藥物,抗生素,造影劑,分散劑,緩沖液或緩沖試劑,甜味劑,去苦味劑,調(diào)味劑,pH穩(wěn)定劑,酸化劑,防腐劑,去甜味劑和/或著色劑;至少一種維生素,礦物質(zhì)和/或營(yíng)養(yǎng)補(bǔ)充劑,其中任選地,所述維生素包括硫胺,核黃素,煙酸,泛酸,吡哆醇,生物素,葉酸,維生素B12,硫辛酸,抗壞血酸,維生素A,維生素D,維生素E,維生素K,膽堿,肉毒堿,和/或α、β和/或γ胡蘿卜素;或益生元營(yíng)養(yǎng)素,其中任選地,所述益生元包括刺激糞便菌群或糞便細(xì)菌的穩(wěn)定性、生長(zhǎng)和/或活性的任何成分,或任選地包括多元醇,果寡糖(FOS),低聚寡糖,菊粉,半乳寡糖(GOS),木寡糖(XOS),聚葡萄糖,單糖,塔格糖和/或甘露寡糖。在可選擇的實(shí)施方案中,本發(fā)明提供了包含本發(fā)明的遞送載體,配方,藥物制劑,容器或裝置的制品(產(chǎn)品)。在可選擇的實(shí)施方案中,本發(fā)明提供了制備包含處理或未處理的糞便菌群,整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群,或部分、基本上或完全分離或純化的糞便菌群的遞送載體,配方,藥物制劑,制品,容器或裝置的方法,所述包括:(a)(i)提供處理或未處理的糞便樣品,或包含完整或部分糞便菌群、整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群、或者部分、基本上或完全分離或純化的糞便菌群的組合物;以及遞送載體,配方,藥物制劑,制品,容器或裝置,以及(ii)將所述處理或未處理的糞便樣品,所述部分、基本上或完全分離或純化的糞便菌群,所述整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群,或包含完整或部分的糞便菌群或部分、基本上或完全分離或純化的糞便菌群的組合物放置于所述遞送載體,配方,藥物制劑,制品,容器或裝置中,并在所述容器或裝置中產(chǎn)生基本上或完全無(wú)氧的環(huán)境,(b)(a)所述的方法,其中所述遞送載體,配方,藥物制劑,制品,容器或裝置通過(guò)以下而形成基本上或完全無(wú)氧:將內(nèi)置或夾住的氧清除裝置并入所述遞送載體,配方,容器或裝置;和/或所述遞送載體,配方,藥物制劑,制品,容器或裝置包含氧清除材料或由氧清除材料包被;和/或用氮?dú)夂?或其它惰性非反應(yīng)性氣體完全或基本上置換所述遞送載體,配方,藥物制劑,制品,容器或裝置中的空氣;(c)(a)或(b)所述的方法,其中所述遞送載體,配方,藥物制劑,制品,容器或裝置部分、基本上或完全模擬(產(chǎn)生)無(wú)氧環(huán)境;(d)(a)至(c)中任一項(xiàng)所述的方法,其中為了人或動(dòng)物使用而制備、標(biāo)記或配制所述遞送載體,配方,藥物制劑,制品,容器或裝置;(e)(d)所述的方法,其中所述動(dòng)物使用是用于獸醫(yī)用途;(f)(a)至(e)中任一項(xiàng)所述的方法,其中在儲(chǔ)存或冷凍,噴霧干燥,冷凍干燥或凍干之前,將穩(wěn)定劑或甘油添入或混入所述處理或未處理的糞便樣品,或者部分、基本上或完全分離或純化的糞便菌群;(g)(a)至(f)中任一項(xiàng)所述的方法,其中所述遞送載體,配方,藥物制劑,制品,容器或裝置最初被制備成或配制成液體,懸浮液,凝膠,凝膠片,半固體,片劑,藥袋,錠劑或膠囊或腸道配方,或再次被配制成液體,懸浮液,凝膠,凝膠片,半固體,片劑,藥袋,錠劑或膠囊或者作為腸道配方來(lái)最終遞送;(h)(a)至(g)中任一項(xiàng)所述的方法,其中通過(guò)以下處理所述糞便樣品,使得糞便菌群與糞便樣品中的粗顆粒物質(zhì)分離:勻漿,離心和/或過(guò)濾糞便物的粗顆粒物質(zhì)或非糞便物質(zhì),或通過(guò)血漿除去法,離心法,細(xì)胞分離法,柱層析法(例如,親和層析法),免疫沉淀法(例如,固定于諸如珠子或平板的固體表面的抗體);(i)(a)至(h)中任一項(xiàng)所述的方法,其中所述處理或未處理的糞便菌群,或者部分、基本上或完全分離或純化的糞便菌群是凍干的、冷凍干燥的或冷凍的或被加工成粉末;(j)(a)至(i)中任一項(xiàng)所述的方法,其中所述糞便菌群最初來(lái)源于篩查或測(cè)試疾病或感染的個(gè)體和/或所述糞便菌群最初來(lái)源于經(jīng)篩查具有正常、健康或野生型糞便菌群的個(gè)體;或(k)(a)至(j)中任一項(xiàng)所述的方法,其還包括將以下物質(zhì)添加至處理或未處理的糞便菌群或添加至液體或溶液,所述液體或溶液用于分離或純化,儲(chǔ)存,冷凍,冷凍干燥,噴霧干燥,凍干,運(yùn)輸,復(fù)原和/或遞送處理或未處理的糞便菌群(任選地,整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群,部分、基本上或完全分離或純化的糞便菌群,或者包含本發(fā)明基本上或完全不含非糞便菌群糞便物的糞便菌群的組合物):鹽水,介質(zhì),消泡劑,表面活性劑,潤(rùn)滑劑,酸中和劑,標(biāo)志物,細(xì)胞標(biāo)志物,藥物,抗生素,造影劑,分散劑,緩沖液或緩沖試劑,甜味劑,去苦味劑,調(diào)味劑,pH穩(wěn)定劑,酸化劑,防腐劑,去甜味劑和/或著色劑,和/或至少一種維生素,礦物質(zhì)和/或營(yíng)養(yǎng)補(bǔ)充劑,其中任選地,所述維生素包括硫胺,核黃素,煙酸,泛酸,吡哆醇,生物素,葉酸,維生素B12,硫辛酸,抗壞血酸,維生素A,維生素D,維生素E,維生素K,膽堿,肉毒堿和/或α、β和/或γ胡蘿卜素,和/或益生元營(yíng)養(yǎng)素,其中任選地,所述益生元包括刺激糞便菌群或糞便細(xì)菌的穩(wěn)定性、生長(zhǎng)和/或活性的任何成分,或任選地包括多元醇,果寡糖(FOS),低聚寡糖,菊粉,半乳寡糖(GOS),木寡糖(XOS),聚葡萄糖,單糖,塔格糖和/或甘露寡糖;(i)(a)至(k)中任一項(xiàng)所述的方法,其中整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群,基本上分離或純化的糞便菌群是(包含)糞便菌群的分離物,其是至少約90%,91%,92%,93%,94%,95%,96%,97%,98%,99%,99.5%,99.6%,99.7%,99.8%或99.9%分離的或純的,或具有不超過(guò)約0.1%,0.2%,0.3%,0.4%,0.5%,0.6%,0.7%,0.8%,0.9%或1.0%或更多的非糞便菌群物;或(m)(a)至(i)中任一項(xiàng)所述的方法,其中所述整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群,所述處理或未處理的糞便樣品,或者所述部分、基本上或完全分離或純化的糞便菌群的量經(jīng)配制或標(biāo)準(zhǔn)化,用于重復(fù)或多次遞送或灌注,其中任選地,重復(fù)或多次給予、遞送、灌注或植入方案包括每天進(jìn)行灌注第一次大約10天,第二次每天灌注大約10天,第三次每天灌注,然后是第四次每天灌注可能是每周,然后任選地維持第二次或更多的每周灌注,直到組織恢復(fù)正常狀態(tài)。在可選擇的實(shí)施方案中,本發(fā)明提供了用于改善,穩(wěn)定,治療和/或預(yù)防感染,疾病,處理,中毒或具有腸功能障礙成分或副作用的病癥的方法;或用于改善,穩(wěn)定,治療和/或預(yù)防便秘的方法;用于治療腹痛,不明確的腹痛或腹瀉,由藥物副作用或心理狀況或克羅恩病,毒藥,毒素或感染引起的腹瀉,毒素介導(dǎo)的旅行者腹瀉或者梭菌或艱難梭菌感染或與梭菌感染相關(guān)的假膜性腸炎的方法,其包括給予有需要的個(gè)體本發(fā)明的遞送載體,配方,藥物制劑,制品,容器或裝置或本發(fā)明的制品(產(chǎn)品)。在可選擇的實(shí)施方案中,本發(fā)明提供了用于改善,穩(wěn)定,治療和/或預(yù)防感染,疾病,處理,中毒或具有腸功能障礙成分或副作用的病癥的方法,其包括給予有需要的個(gè)體本發(fā)明的遞送載體,配方,藥物制劑,制品,容器或裝置或本發(fā)明的制品(產(chǎn)品),或它們的內(nèi)容物(例如,其中所含的細(xì)菌菌群)。在可選擇的實(shí)施方案中,所述處理或未處理的糞便樣品或所述部分、基本上或完全分離或純化的糞便菌群的量經(jīng)配制或標(biāo)準(zhǔn)化,用于重復(fù)或多次遞送或灌注;或所述部分、基本上或完全分離或純化的糞便菌群以重復(fù)或多次灌注的方式來(lái)遞送,其中任選地,重復(fù)或多次給予、遞送、灌注或植入方案包括每天進(jìn)行灌注第一次大約10天,第二次每天灌注大約10天,第三次每天灌注,然后是第四次每天灌注可能是每周,然后任選地維持第二次或更多的每周灌注,直到組織恢復(fù)正常狀態(tài)。在所述方法可選擇的實(shí)施方案中,感染,疾病,處理,中毒或具有腸功能障礙成分或副作用的病癥包括炎癥性腸病(IBD),克羅恩病,肝性腦病,小腸炎,腸炎,腸易激綜合征(IBS),纖維肌痛(FM),慢性疲勞綜合征(CFS),注意力缺陷/多動(dòng)癥(ADHD),多發(fā)性硬化癥(MS),系統(tǒng)性紅斑狼瘡(SLE),旅行者腹瀉,小腸細(xì)菌過(guò)度生長(zhǎng),慢性胰腺炎,胰功能不全,暴露于毒藥或毒素或感染,毒素介導(dǎo)的旅行者腹瀉,中毒,假膜性腸炎,梭菌感染,產(chǎn)氣莢膜梭菌或艱難梭菌感染,神經(jīng)病癥,帕金森氏病,肌張力障礙,孤獨(dú)癥,肌肉萎縮性側(cè)索硬化癥,多發(fā)性硬化癥,癲癇大發(fā)作或癲癇小發(fā)作。在可選擇的實(shí)施方案中,所述處理或未處理的糞便樣品或者所述部分、基本上或完全分離或純化的糞便菌群的量經(jīng)配制或標(biāo)準(zhǔn)化,用于重復(fù)或多次遞送或灌注;或所述處理或未處理的糞便樣品或者所述部分、基本上或完全分離或純化的糞便菌群以重復(fù)或多次灌注的方式來(lái)遞送,其中任選地,重復(fù)或多次給予、遞送、灌注或植入方案包括每天進(jìn)行灌注第一次大約10天,第二次每天灌注大約10天,第三次每天灌注,然后是第四次每天灌注可能是每周,然后任選地維持第二次或更多的每周灌注,直到組織恢復(fù)正常狀態(tài)。在可選擇的實(shí)施方案中,本發(fā)明提供了遞送載體,配方,藥物制劑,制品,容器或裝置,其包含:(a)整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群,部分、基本上或完全分離或純化的糞便菌群,或者包含基本上或完全不含非糞便菌群糞便物的糞便菌群的組合物,以及任選地,還包含賦形劑或液體,鹽水,緩沖液,緩沖試劑或介質(zhì)或液體-葡萄糖-纖維二糖瓊脂(RGCA)介質(zhì);(b)(a)所述的組合物,容器或裝置,配方或制品,其中所述整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群或所述糞便菌群從人或動(dòng)物糞便物分離或純化;(c)(a)或(b)所述的組合物,容器或裝置,配方或制品,其中所述整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群或所述糞便菌群利用包括使用離心法,細(xì)胞分離法、柱或免疫親和柱的方法或方案來(lái)分離或純化,或者其中所述整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群或所述糞便菌群通過(guò)包括以下的方法來(lái)分離或純化:勻漿,離心和/或過(guò)濾糞便物的粗顆粒物質(zhì)或或非糞便物質(zhì),或者通過(guò)血漿除去法,離心法,細(xì)胞分離法,柱層析法(例如,親和層析法),免疫沉淀法(例如,固定于諸如珠子或平板的固體表面的抗體);(d)(a)至(c)中任一項(xiàng)所述的組合物,容器或裝置,配方或制品,其中所述整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群或所述基本上或完全分離或純化的糞便菌群或所述基本上或完全不含非糞便菌群糞便物的糞便菌群處于所述組合物,容器或裝置,配方或制品基本上或完全無(wú)氧的環(huán)境中;(e)(d)所述的遞送載體,配方,容器或裝置,其中所述組合物,容器或裝置,配方或制品通過(guò)以下形成基本上或完全無(wú)氧:將內(nèi)置或夾住的氧清除裝置并入所述遞送載體,配方,容器或裝置;和/或所述遞送載體,配方,容器或裝置包含氧清除材料或由氧清除材料包被;和/或用氮和/或其它惰性非反應(yīng)性氣體完全或基本上置換所述遞送載體,配方,容器或裝置中的空氣;(f)(a)至(c)中任一項(xiàng)所述的組合物,容器或裝置,配方或制品,其中所述整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群,所述基本上或完全分離或純化的糞便菌群,或者所述基本上或完全不含非糞便菌群糞便物的糞便菌群處于基本上或完全無(wú)氧的環(huán)境中;(g)(a)至(f)中任一項(xiàng)所述的組合物,容器或裝置,配方或制品,其中為了人或動(dòng)物使用而制備、標(biāo)記或配制所述遞送載體,配方,容器或裝置;(h)(g)所述的組合物,容器或裝置,配方或制品,其中所述動(dòng)物使用是用于獸醫(yī)用途;(i)(a)至(h)中任一項(xiàng)所述的組合物,容器或裝置,配方或制品,其中在儲(chǔ)存或冷凍,冷凍干燥,噴霧干燥或凍干之前,將穩(wěn)定劑或甘油添入或混入所述整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群,或所述部分、基本上或完全分離或純化的糞便菌群,或包含基本上或完全不含非糞便菌群糞便物的糞便菌群的組合物;j)(a)至(f)中任一項(xiàng)所述的組合物,容器或裝置,配方或制品,其中所述組合物,容器或裝置,配方或制品最初被制備成或配制成液體,懸浮液,凝膠,凝膠片,半固體,片劑,小袋子,錠劑或膠囊或腸道配方,或者再次被配制成液體,懸浮液,凝膠,凝膠片,半固體,片劑,藥袋,錠劑或膠囊或者腸道配方來(lái)最終遞送;(k)(a)至(j)中任一項(xiàng)所述的組合物,容器或裝置,配方或制品,其中所述整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群,或所述部分、基本上或完全分離或純化的糞便菌群,或所述包含基本上或完全不含非糞便菌群糞便物的糞便菌群的組合物是凍干的、冷凍干燥的、粉末形式或冷凍的;(l)(a)至(k)中任一項(xiàng)所述的組合物,容器或裝置,配方或制品,其中所述整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群或所述糞便菌群最初來(lái)源于篩查或測(cè)試疾病或感染的個(gè)體和/或所述整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群或所述糞便菌群最初來(lái)源于經(jīng)篩查具有正常、健康或野生型糞便菌群的個(gè)體;或(m)(a)至(l)中任一項(xiàng)所述的組合物,容器或裝置,配方或制品,其還包括將以下物質(zhì)添加至所述整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群,所述部分、基本上或完全分離或純化的糞便菌群,或包含基本上或完全不含非糞便菌群糞便物的糞便菌群的組合物,或者將以下物質(zhì)添加至用于分離或純化,儲(chǔ)存,冷凍,冷凍干燥,噴霧干燥,凍干,運(yùn)輸,復(fù)原和/或遞送處理或未處理的糞便菌群的液體或溶液:鹽水,介質(zhì),消泡劑,表面活性劑,潤(rùn)滑劑,酸中和劑,標(biāo)志物,細(xì)胞標(biāo)志物,藥物,抗生素,造影劑,分散劑,緩沖液或緩沖試劑,甜味劑,去苦味劑,調(diào)味劑,pH穩(wěn)定劑,酸化劑,防腐劑,去甜味劑和/或著色劑,和/或至少一種維生素,礦物質(zhì)和/或營(yíng)養(yǎng)補(bǔ)充劑,其中任選地,所述維生素包括硫胺,核黃素,煙酸,泛酸,吡哆醇,生物素,葉酸,維生素B12,硫辛酸,抗壞血酸,維生素A,維生素D,維生素E,維生素K,膽堿,肉毒堿和/或α、β和/或γ胡蘿卜素,和/或益生元營(yíng)養(yǎng)素,其中任選地,所述益生元包括刺激所述整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群或所述糞便菌群或糞便細(xì)菌的穩(wěn)定性、生長(zhǎng)和/或活性的任何成分,或任選地包括多元醇,果寡糖(FOS),低聚寡糖,菊粉,半乳寡糖(GOS),木寡糖(XOS),聚葡萄糖,單糖,塔格糖和/或甘露寡糖。(n)(a)至(m)中任一項(xiàng)所述的組合物,容器或裝置,配方或制品,其中基本上分離或純化的糞便菌群是(包含)所述整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群或糞便菌群的分離物,其是至少約90%,91%,92%,93%,94%,95%,96%,97%,98%,99%,99.5%,99.6%,99.7%,99.8%或99.9%分離的或純的,或具有不超過(guò)約0.1%,0.2%,0.3%,0.4%,0.5%,0.6%,0.7%,0.8%,0.9%或1.0%或更多的非糞便菌群物;或(m)(a)至(l)中任一項(xiàng)所述的組合物,容器或裝置,配方或制品,其中所述所述整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群,或所述處理或未處理的糞便樣品,或所述部分、基本上或完全分離或純化的糞便菌群的量經(jīng)配制或標(biāo)準(zhǔn)化,用于重復(fù)或多次遞送或灌注,其中任選地,重復(fù)或多次給予、遞送、灌注或植入方案包括每天進(jìn)行灌注第一次大約10天,第二次每天灌注大約10天,第三次每天灌注,然后是第四次每天灌注可能是每周,然后任選地維持第二次或更多的每周灌注,直到組織恢復(fù)正常狀態(tài)。在可選擇的實(shí)施方案中,本發(fā)明提供了用于改善,穩(wěn)定,治療和/或預(yù)防感染,疾病,處理,中毒或具有腸功能障礙成分或副作用的病癥的方法,所述方法包括給予有需要的個(gè)體本發(fā)明的組合物,容器或裝置,配方或制品。在所述方法可選擇的實(shí)施方案中,所述感染,疾病,處理,中毒或具有腸功能障礙成分或副作用的病癥包括炎癥性腸病(IED),克羅恩病,肝性腦病,小腸炎,腸炎,腸易激綜合征(IES),纖維肌痛(FM),慢性疲勞綜合征(CFS),注意力缺陷/多動(dòng)癥(ADHD),多發(fā)性硬化癥(MS),系統(tǒng)性紅斑狼瘡(SLE),旅行者腹瀉,小腸細(xì)菌過(guò)度生長(zhǎng),慢性胰腺炎,胰功能不全,暴露于毒藥或毒素或感染,毒素介導(dǎo)的旅行者腹瀉,中毒,假膜性腸炎,梭菌感染,產(chǎn)氣莢膜梭菌或艱難梭菌感染,神經(jīng)病癥,帕金森氏病,肌張力障礙,孤獨(dú)癥,肌肉萎縮性側(cè)索硬化癥,多發(fā)性硬化癥,癲癇大發(fā)作或癲癇小發(fā)作。在可選擇的實(shí)施方案中,本發(fā)明提供了用于改善,穩(wěn)定,治療和/或預(yù)防感染,疾病,處理,中毒或具有腸功能障礙成分或副作用的病癥,或減輕或延緩以上這些情況的癥狀的方法;或用于改善,治療和/或預(yù)防便秘的方法;用于治療腹痛,不明確的腹痛或腹瀉,由藥物副作用或心理狀況或克羅恩病,毒藥,毒素或感染引起的腹瀉,毒素介導(dǎo)的旅行者腹瀉,或者梭菌或產(chǎn)氣莢膜梭菌或艱難梭菌感染或與梭菌感染相關(guān)的假膜性腸炎的方法;或用于預(yù)防、減輕或延緩以下患有以下疾病的個(gè)體(例如,患者或動(dòng)物)的癥狀,改善,穩(wěn)定或治療患有以下疾病的個(gè)體(例如,患者或動(dòng)物)的方法:脊椎關(guān)節(jié)病,脊椎關(guān)節(jié)炎或骶髂關(guān)節(jié)炎(一個(gè)或兩個(gè)骶髂關(guān)節(jié)的炎癥);腎炎綜合征;炎癥性或具有消化道或腸成分的自身免疫疾病狀況如狼瘡,腸易激綜合征(IBS或痙攣性結(jié)腸),或腸炎如潰瘍性腸炎或克羅恩腸炎;便秘,孤獨(dú)癥;退行性神經(jīng)疾病如肌肉萎縮性側(cè)索硬化癥(ALS),多發(fā)性硬化癥(MS)或帕金森氏病(PD);肌張力障礙(例如,斯太納特病或近端肌強(qiáng)直性肌病);自身免疫性疾病如風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎(RA)或幼年特發(fā)性關(guān)節(jié)炎(JIA);慢性疲勞綜合征(包括良性肌痛性腦脊髓炎,慢性疲勞免疫功能障礙綜合征,慢性傳染性單核細(xì)胞增多癥,流行性肌痛性腦脊髓膜炎);肥胖;低血糖癥,糖尿病前期綜合征,I型糖尿病或II型糖尿病;特發(fā)性血小板減少性紫癜(ITP);急性或慢性過(guò)敏反應(yīng),如蕁麻疹,皮疹,風(fēng)疹或慢性風(fēng)疹;和/或失眠或慢性失眠,癲癇大發(fā)作或癲癇小發(fā)作,所述方法包括:以單次、重復(fù)或多次給予、遞送或灌注的方式,給予有需要的個(gè)體本發(fā)明的遞送載體,配方,藥物制劑,制品,容器或裝置或本發(fā)明的制品(產(chǎn)品)。在可選擇的實(shí)施方案中,所述整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群,所述處理或未處理的糞便樣品,或所述部分、基本上或完全分離或純化的糞便菌群的量經(jīng)配制或標(biāo)準(zhǔn)化,用于重復(fù)或多次遞送或灌注;或所述整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群,所述處理或未處理的糞便樣品或所述部分、基本上或完全分離或純化的糞便菌群以重復(fù)或多次灌注的方式給予,其中任選地,重復(fù)或多次給予、遞送、灌注或植入方案包括每天進(jìn)行灌注第一次大約10天,第二次每天灌注大約10天,第三次每天灌注,然后是第四次每天灌注可能是每周,然后任選地維持第二次或更多的每周灌注,直到組織恢復(fù)正常狀態(tài)。在可選擇的實(shí)施方案中,本發(fā)明提供了用于遞送本發(fā)明的(包含細(xì)菌菌群的)組合物或整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群或糞便物的裝置,其包括:(a)圖1或圖2所示的裝置或其等同物;或(b)(1)袋子或容器,其包含與軟管或等同物近端可控連接的出口孔,其中所述袋子或容器任選地由不透氣或不透氧氣的材料制成,以及任選地,所述袋子或容器由柔性材料或包含聚對(duì)苯二甲酸乙二醇酯聚酯膜(或包含MYLARTM)的材料制成,以及任選地,所述袋子或容器是(IV樣)靜脈注射樣袋子,以及任選地,所述袋子或容器具有附屬物,所述附屬物允許袋子懸掛于座上,例如,放置/懸掛在內(nèi)窺鏡上,以及任選地,所述袋子或容器通過(guò)開(kāi)關(guān)閥或等同物可控連接至能夠從袋子排除全部氣體或空氣的負(fù)壓裝置,以及任選地,所述袋子或容器通過(guò)開(kāi)關(guān)閥或等同物可控連接至用于通過(guò)出口孔沖洗袋子的液源或儲(chǔ)存容器,并且任選地,所述液源或儲(chǔ)存容器處于正壓下,以及任選地,所述軟管或等同物包括至少一個(gè)夾子或關(guān)閉閥或止回閥,從而防止材料從管的遠(yuǎn)端回流至近端部分或從管回流至袋子或容器;(2)在所述軟管或等同物遠(yuǎn)端的開(kāi)關(guān)閥或等同物或閉孔螺帽,以及任選地,用于連接至結(jié)腸鏡或內(nèi)窺鏡魯爾鎖接口或等同物的魯爾鎖緊頭,其中任選地,所述魯爾鎖緊頭內(nèi)置于閥中或與閥分離,以及任選地,用于連接至灌腸管或裝置或等同物的灌腸管尖端,其中任選地,所述灌腸管尖端內(nèi)置于閥中或與閥分離,以及任選地,其還包括安全裝置或安全夾,用于在壓力下閥或魯爾鎖緊頭或灌腸管尖端遺失(脫落)的情況下關(guān)閉遠(yuǎn)端孔;以及(3)泵或手泵,用于通過(guò)軟管或等同物將袋子或容器中的物質(zhì)移出至遠(yuǎn)端或開(kāi)關(guān)閥或等同物;或(c)(a)或(b)的裝置,其還包含本發(fā)明的糞便物或組合物。在可選擇的實(shí)施方案中,本發(fā)明提供了袋子或容器,其包含整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群,或處理或未處理的糞便菌群,或部分、基本上或完全分離的糞便菌群或本發(fā)明的組合物(例如,包含整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群,部分、基本上或完全分離或純化的糞便菌群的配方,或包含基本上或完全不含非糞便菌群糞便物的糞便菌群的組合物),以及任選地,其還包含賦形劑,或液體,鹽水,緩沖液,緩沖試劑或介質(zhì),或液體-葡萄糖-纖維二糖瓊脂(RGCA)介質(zhì),其中所述袋子或容器在結(jié)構(gòu)上與本發(fā)明的裝置的袋子或容器(例如,如圖1或圖2所示)相同或相似,其中任選地,所述袋子的內(nèi)部是基本上或完全無(wú)氧的環(huán)境,或所述袋子的內(nèi)部與無(wú)氧環(huán)境基本上或完全相似。在可選擇的實(shí)施方案中,可以將特異性的抗艱難梭菌口服抗體(例如,鳥類的)添加至溶液(例如,鹽水,介質(zhì),緩沖液)中,所述溶液用于分離或純化,儲(chǔ)存,冷凍,冷凍干燥,噴霧干燥,凍干,運(yùn)輸,復(fù)原和/或遞送本發(fā)明的組合物(例如,部分、基本上或完全分離或純化的糞便菌群,或包含基本上或完全不含非糞便菌群糞便物的糞便菌群的組合物)。產(chǎn)品與這些特異性的抗艱難梭菌口服抗體的組合增強(qiáng)了所述產(chǎn)品的根除機(jī)制。在以下的附圖和說(shuō)明書說(shuō)明了本發(fā)明的一個(gè)或多個(gè)實(shí)施方案的細(xì)節(jié)。本發(fā)明的其它特征、目的和優(yōu)勢(shì)通過(guò)說(shuō)明書和附圖以及權(quán)利要求書是顯而易見(jiàn)的。本文所引用的所有出版物、專利、專利申請(qǐng)通過(guò)引用明確并入用于所有目的。附圖詳述本文示出的附圖是為了說(shuō)明本發(fā)明的實(shí)施方案,并非意圖限制由權(quán)利要求書所包括的本發(fā)明的范圍。圖1A示出了本發(fā)明的示例性儲(chǔ)存裝置;以及圖1B示出了下文所述的本發(fā)明的示例性遞送裝置。圖2示出了本發(fā)明的示例性遞送裝置。各幅圖中相似的附圖標(biāo)記指示相似的元件?,F(xiàn)在,將針對(duì)本發(fā)明的多個(gè)示例性實(shí)施方案詳細(xì)地進(jìn)行說(shuō)明,其中的實(shí)例在附圖中說(shuō)明。提供以下的詳述,以使讀者能夠更好地理解本發(fā)明各方面和實(shí)施方案的某些細(xì)節(jié),并不應(yīng)當(dāng)理解為對(duì)本發(fā)明范圍的限制。詳細(xì)描述在可選擇的實(shí)施方案中,本發(fā)明提供了組合物,例如,配方和藥物制劑,制品,容器,遞送載體,裝置以及遞送材料,其包含用于糞便菌群植入的處理和/或分離的糞便(faecal/fecal))物。在一實(shí)施方案中,本發(fā)明的包含糞便菌群(例如細(xì)菌)的處理和/或分離的糞便物可在不同個(gè)體之間植入,例如,人與人之間或動(dòng)物之間。在一實(shí)施方案中,將本發(fā)明的處理的糞便物植入回收集它們的同一個(gè)體中,例如,以在藥物處理(例如,抗生素處理或化療)之后或在直立性灌洗之后重新入駐結(jié)腸,例如,用于引起胃腸(GI)道包括結(jié)腸通便(例如,清潔)。本發(fā)明提供了用于改善,穩(wěn)定或治療腸病或感染的方法,其包括使用本發(fā)明的遞送載體,配方,制品或容器或裝置,例如,作為糞便細(xì)菌療法,糞便灌注,糞便植入,或人體益生菌灌注(HPI)。在可選擇的實(shí)施方案中,本發(fā)明提供了用于改善,穩(wěn)定,治療或預(yù)防任何感染,腸病或具有腸功能障礙成分的病癥的方法,例如,中毒,假膜性腸炎,艱難梭菌感染,炎癥性腸病(IBD),克羅恩病,肝性腦病,小腸炎,腸炎,腸易激綜合征(IBS),纖維肌痛(FM),慢性疲勞綜合征(CFS),抑郁癥,注意力缺陷/多動(dòng)癥(ADHD),多發(fā)性硬化癥(MS),系統(tǒng)性紅斑狼瘡(SLE),旅行者腹瀉,小腸細(xì)菌過(guò)度生長(zhǎng),慢性胰腺炎或胰功能不全。例如,在一實(shí)施方案中,由于抗生素不會(huì)根除艱難梭菌及其孢子,j將本發(fā)明的包含處理和/或分離的糞便菌群的遞送載體,配方,制品,或容器或裝置輸注至感染或患病個(gè)體(例如,患者或動(dòng)物)的結(jié)腸時(shí),能夠改善,穩(wěn)定或根除艱難梭菌(或與該感染相關(guān)的假膜性腸炎)。在可選擇的實(shí)施方案中,獲自供體的糞便菌群(在可選擇的實(shí)施方案中,其以處理或分離的形式處于本發(fā)明的遞送載體,配方,制品,或容器或裝置中)包含感染或患病接受者缺失或不充足的(例如,在數(shù)量或功能上)一部分,基本上全部或全部糞便菌群,例如,細(xì)菌。盡管本發(fā)明不受限于任何具體的作用機(jī)制,但在一些實(shí)施方案中,從供體向接受者轉(zhuǎn)移(例如,從人到人)受感染個(gè)體的一部分,基本上全部或全部糞便菌群的等同物改善或根除了感染或與該感染相關(guān)的假膜性腸炎。在可選擇的實(shí)施方案中,本發(fā)明的組合物,例如,配方和藥物制劑,以及裝置,遞送材料,遞送載體,制品,容器和裝置允許糞便菌群(例如,人類菌群)成分安全植入至有需要的個(gè)體,例如,受感染的、患病的和垂死的患者,從而提供始終安全還有功能的菌群遞送給接受者或患者。在可選擇的實(shí)施方案中,本發(fā)明提供了用于產(chǎn)生可長(zhǎng)期保存的標(biāo)準(zhǔn)化新鮮糞便菌群的可靠方法。例如,在一實(shí)施方案中,包含糞便菌群的遞送載體,配方,藥物制劑,制品,容器或裝置包含基本上或完全無(wú)氧的環(huán)境。在另一實(shí)施方案種,營(yíng)養(yǎng)素如“益生元營(yíng)養(yǎng)素”可以被添加(例如,以干形式或液體形式)至溶液(例如,鹽水,介質(zhì),緩沖液)中,所述溶液用于分離或純化,儲(chǔ)存,冷凍,冷凍干燥,噴霧干燥,凍干,運(yùn)輸,復(fù)原和/或遞送本發(fā)明的組合物(例如,部分、基本上或完全分離或純化的糞便菌群,或包含基本上或完全不含非糞便菌群糞便物的糞便菌群的組合物)。益生元營(yíng)養(yǎng)素可以是刺激糞便菌群如細(xì)菌的穩(wěn)定性、生長(zhǎng)和/或活性的任何成分;例如,在可選擇的實(shí)施方案中,多元醇,果寡糖(FOS),低聚寡糖,菊粉,半乳寡糖(GOS),木寡糖(XOS),聚葡萄糖,單糖如塔格糖和/或甘露寡糖被用作實(shí)施本發(fā)明的益生元。在一實(shí)施方案中,添加益生元以防止糞便菌群在分離或純化,冷凍,冷凍干燥,噴霧干燥,溶液中復(fù)原等之后“休克”。在可選擇的實(shí)施方案中,本發(fā)明的組合物,例如,遞送載體,配方和藥物制劑,制品或容器或裝置的成分包括整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群,或大量的類桿菌屬(Bacteroides)和/或硬壁菌門(Firmicutes)(例如,存在較大量的類桿菌屬和/或硬壁菌門,通常在原位被發(fā)現(xiàn)),例如,以便能夠改善和/或根除艱難梭菌感染和/或與該感染相關(guān)的假膜性腸炎。在可選擇的實(shí)施方案中,本發(fā)明的組合物,例如遞送載體,配方和藥物制劑,制品,或容器或裝置,可用于(例如,經(jīng)配制和/或按劑量用于)個(gè)體,例如,諸如患有諸如腸炎(例如,艱難梭菌感染的假膜性腸炎)和便秘的難治病癥的患者或動(dòng)物中反復(fù)使用。在可選擇的實(shí)施方案中,本發(fā)明的組合物,例如,遞送載體,配方和藥物制劑,制品或容器或裝置的成分包括選擇的細(xì)菌種類,例如類桿菌屬,硬壁菌門,蘇云金桿菌(Bacillusthuringiensis)(能夠產(chǎn)生針對(duì)艱難梭菌的肽抗生素的細(xì)菌)。所述細(xì)菌種類可以通過(guò)離心法或血漿除去法來(lái)分離。在可選擇的實(shí)施方案中,可以將選擇的細(xì)菌種類,例如類桿菌屬,硬壁菌門,蘇云金桿菌作為含有細(xì)菌種類的濃度配方以含有野生型細(xì)菌添加至所述組合物如遞送載體,配方和藥物制劑,制品,或容器或裝置的成分中。在可選擇的實(shí)施方案中,本發(fā)明的組合物可被配制成糞便漿,鹽水或緩沖懸浮液(例如,對(duì)于灌腸劑,懸浮在緩沖液或鹽水中),用于口服遞送的飲料(例如,乳,酸奶,奶昔,調(diào)味飲料或等同物)等。在可選擇的實(shí)施方案中,本發(fā)明的組合物可被配制成灌腸產(chǎn)品,噴霧干燥產(chǎn)品,復(fù)原灌腸劑,小膠囊產(chǎn)品,適于給予兒童的小膠囊產(chǎn)品,球形注射器,適于用鹽水添加在家灌腸的球形注射器,粉末產(chǎn)品,處于去氧小袋中的粉末產(chǎn)品,處于去氧小袋中的粉末產(chǎn)品(其可被添加至例如,球形注射器或灌腸劑或裝置中的噴霧干燥產(chǎn)品,所述裝置可被連接至具有合適的載體媒介如酸奶或乳的容器,并且其可被直接并入作為例如兒童的劑量給予)。在一實(shí)施方案中,可以通過(guò)擰上蓋將本發(fā)明的組合物直接在載體介質(zhì)中遞送,其中所述糞便物懸浮于所述蓋中并在所述蓋直接旋入載體介質(zhì)中時(shí)得到釋放。在可選擇的實(shí)施方案中,遞送本發(fā)明組合物的方法包括通過(guò)懸浮在鹽水或緩沖液中的灌腸劑,通過(guò)口服飲料(例如,乳,酸奶,調(diào)味飲料等),通過(guò)小腸灌注,通過(guò)經(jīng)鼻十二指腸管,通過(guò)胃造口術(shù)或通過(guò)利用結(jié)腸鏡將糞便漿送入腸中。在一些實(shí)施方案中,通過(guò)結(jié)腸鏡遞送以盡可能近地灌注并檢查任何結(jié)腸病理可能是有利的。在可選擇的實(shí)施方案中,用于本發(fā)明組合物和方法中的糞便菌群最初來(lái)源于(全部或部分)篩查或測(cè)試疾病或感染的個(gè)體,和/或所述糞便菌群最初來(lái)源于經(jīng)篩查具有正常、健康或正常的代表性“野生型”糞便菌群的個(gè)體;例如,類桿菌屬和/或硬壁菌門,和/或其它糞便菌群如蘇云金桿菌的正常補(bǔ)充物。在一實(shí)施方案中,取決于供體糞便物中缺乏的菌群(例如,細(xì)菌)種類,或?yàn)閷?shí)現(xiàn)期望的效應(yīng),最初制備產(chǎn)品或遞送產(chǎn)品時(shí),將一種或多種其它(或“補(bǔ)充性”)種類,例如,類桿菌屬,硬壁菌門和/或蘇云金桿菌,添加至遞送產(chǎn)品(與其一起給予),例如,在應(yīng)用于個(gè)體(例如,患者或動(dòng)物)之前混入其它種類,例如,為遞送而復(fù)原粉末,凍干物或凍干組合物時(shí);或一種或多種其它(或“補(bǔ)充性”)種類可以共給予。這些其它的菌群種類可以直接從供體分離或純化,或可以在添加之前在體外擴(kuò)增(培養(yǎng))一段時(shí)間,或可以來(lái)自(源自)純培養(yǎng)物,例如,來(lái)自ATTC保藏庫(kù)。例如,在一些應(yīng)用中,例如,為實(shí)現(xiàn)期望的效應(yīng)或治療結(jié)果,使用遞送增加量的一種或多種糞便菌群(例如,細(xì)菌)種類,例如,遞送的產(chǎn)品(例如,整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群,或包含完整或部分糞便菌群的組合物,或部分、基本上或完全分離或純化的糞便菌群)用一種或多種其它(或“補(bǔ)充性”)種類,例如,類桿菌屬,硬壁菌門和/或蘇云金桿菌來(lái)增加(“摻入”),上述其它種類可從供體直接分離,或可以來(lái)自純培養(yǎng)物等。在一些實(shí)施方案中,供體的選擇至關(guān)重要,例如,以避免使接受者感染單獨(dú)的感染或疾病。在可選擇的實(shí)施方案中,取決于供體和接受者例如,人或動(dòng)物的種類,供體至少進(jìn)行以下測(cè)試(篩查):例如,逆轉(zhuǎn)錄病毒(例如,人類免疫缺陷病毒,HIV);甲型肝炎,乙型肝炎和/或丙型肝炎;巨細(xì)胞病毒;埃-巴二氏病毒,可檢測(cè)到的寄生蟲和/或細(xì)菌病原體。在可選擇的實(shí)施方案中,本發(fā)明提供了制備用于植入的糞便菌群(例如,整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群)的方法,首先包括從一個(gè)或多個(gè)健康的(例如,篩查的)供體收集。在可選擇的實(shí)施方案中,通過(guò)本發(fā)明的糞便收集裝置運(yùn)輸新鮮的糞便,在一實(shí)施方案中,所述裝置包括適于無(wú)氧的(或基本上無(wú)氧的)合適容器。示例性的合適的糞便收集裝置1如圖1A所示。圖1A示出了本發(fā)明的示例性容器,其包含糞便且包括用于接收糞便的槽2。然后,可以將容器放置于袋子3中,所述袋子3是相配的一次性密封自封袋/密封袋。在可選擇的實(shí)施方案中,通過(guò)例如并入容器的內(nèi)置或夾住的氧清除裝置,例如如美國(guó)專利號(hào)7,541,091中所描述的氧清除顆粒使容器無(wú)氧。在另一實(shí)施方案中,容器本身由氧清除材料制成,例如,氧清除鐵,例如,如02BLOCKTM中所述的或等同物,其利用純化和改良的分層粘土作為氧清除鐵性能增強(qiáng)載體;活性鐵被直接分散在聚合物中。在一實(shí)施方案中,將氧清除聚合物用于制備容器本身或用于包被容器或作為待添加的顆粒;例如,如美國(guó)專利申請(qǐng)公開(kāi)號(hào)20110045222中所描述的具有一種或多種不飽和烯烴的均聚物或共聚物的聚合物混合物;一種或多種聚酰胺均聚物或共聚物;一種或多種聚對(duì)苯二甲酸乙二醇酯均聚物或共聚物;其表現(xiàn)出氧清除活性。在一實(shí)施方案中,將氧清除聚合物用于制備容器本身或用于包被容器或作為待添加的顆粒;例如,如美國(guó)專利申請(qǐng)公開(kāi)號(hào)20110008554中所描述的包含聚酯、共聚酯醚和氧化催化劑的組合物,其中所述共聚酯醚包括含有聚(四亞甲基-共-亞烴醚)的聚酯片段。在一實(shí)施方案中,將氧清除聚合物用于制備容器本身或用于包被容器或作為待添加的顆粒;例如,如美國(guó)專利申請(qǐng)公開(kāi)號(hào)201000255231中所描述的聚合物基質(zhì)中的鐵/鹽顆粒,和具有氧清除微粒的氧清除膜??蛇x擇地,除了氧清除裝置之外或?yàn)樘娲跚宄b置,用氮?dú)夂?或其它惰性非反應(yīng)性氣體(完全或基本上)置換容器中的空氣。在可選擇的實(shí)施方案中,容器部分、基本上或完全模擬(產(chǎn)生)無(wú)氧環(huán)境。在可選擇的實(shí)施方案中,將糞便(例如,糞便樣品)保存在視覺(jué)上可接受的容器中,所述容器既不滲漏也不會(huì)發(fā)出氣味且保持無(wú)氧環(huán)境。在可選擇的實(shí)施方案中,容器在接受糞便菌群之前是無(wú)菌的。在可選擇的實(shí)施方案中,將容器維持在室溫以下,例如,在例如,“糞庫(kù)”或進(jìn)行植入的地方制備,運(yùn)輸和/或儲(chǔ)存過(guò)程中的大多數(shù)步驟或全部時(shí),是冷凍的。例如,一旦運(yùn)送至“加工糞庫(kù)”,其就被儲(chǔ)存在涼爽的房間,冷容器或冰箱中,從而使菌群代謝降至最低。在可選擇的實(shí)施方案中,其不被冷凍以防止破壞糞便中的細(xì)菌細(xì)胞。在可選擇的實(shí)施方案中,將穩(wěn)定劑如甘油添加至收獲和/或儲(chǔ)存的材料中。在一實(shí)施方案中,糞便被立即在液氮或任何相似的冷凍劑中冷凍,使得例如,其在等待加工時(shí)能被儲(chǔ)存更長(zhǎng)的時(shí)間。在可選擇的實(shí)施方案中,如上文所指出的,測(cè)試糞便的各種病原體。在可選擇的實(shí)施方案中,一旦清除感染性因子,其就被勻漿并過(guò)濾,以去除大的顆粒物質(zhì)。在可選擇的實(shí)施方案中,其被細(xì)分成所需的體積,例如,可以為5cc至3升或更多升。例如,在一實(shí)施方案中,容器包含50克(g)糞便,其可以被保存在合適的耐氧塑料中,例如,金屬化聚對(duì)苯二甲酸乙二醇酯聚酯膜或金屬化MYLARTM。在可選擇的實(shí)施方案中,如圖1B所述,示例性的治療工具(遞送系統(tǒng))10和其中容納糞便物的器具是靜脈注射-樣(IV-樣)給予裝置11,例如,具有手動(dòng)泵12與所述裝置相連。適宜地,袋子11是不透氣的金屬化MYLARTM。當(dāng)整個(gè)器具管道通過(guò)魯爾鎖定機(jī)構(gòu)13而與結(jié)腸鏡活檢通道相連時(shí),手動(dòng)泵12可以使存于塑料裝置上部的液化糞便內(nèi)容物易于向前泵出。以這種方式,結(jié)腸鏡或甚至是腸鏡將變成遞送機(jī)構(gòu)。對(duì)于該實(shí)施方案,其通??梢匀魏尉嚯x進(jìn)入結(jié)腸,并且可選擇地可進(jìn)入盲腸。在可選擇的實(shí)施方案中,按需要,材料進(jìn)入末端回腸或甚至更高。在可選擇的實(shí)施方案中,利用腸鏡,其可被灌注至十二指腸或以下。在可選擇的實(shí)施方案中,艱難梭菌(或與該感染相關(guān)的假膜性腸炎)被所灌注的糞便樣品或處理糞便改善或根除。另一可選擇的實(shí)施方案如圖1所示。在該實(shí)施方案中,治療工具/遞送系統(tǒng)20包括含有鹽水(NaCl)22的IV-樣袋子21和本發(fā)明的糞便/細(xì)胞23。除了手動(dòng)泵24和魯爾鎖25之外,遞送系統(tǒng)還配備有沖洗孔26(用于沖洗出袋子),夾子27(以防止回流)和具有魯爾鎖連接的灌腸尖端28。在可選擇的實(shí)施方案中,將植入材料進(jìn)行勻漿和濾除。在可選擇的實(shí)施方案中,將這種處理的材料放置于容器,例如,袋子中,所述容器可以連接至鼻胃管或鼻十二指腸管,從而使內(nèi)容物灌注至例如胃,十二指腸管或遠(yuǎn)端空腸中??蛇x擇地,將其保存于容器如袋子中,所述容器連接至灌腸尖端,以便作為灌腸劑給予。在可選擇的實(shí)施方案中,為了分離非細(xì)菌成分并產(chǎn)生可被冷凍或凍干且可長(zhǎng)期保存的穩(wěn)定產(chǎn)品,可將糞便勻漿并從粗顆粒物質(zhì)過(guò)濾。在可選擇的實(shí)施方案中,接著從細(xì)菌分離微觀纖維/非活體物質(zhì)??梢允褂脦追N方法,包括例如用不同濾膜尺寸反復(fù)過(guò)濾,例如,下降到細(xì)菌的大小的濾膜尺寸。在一實(shí)施方案中,可以使用不同的濾膜來(lái)分離細(xì)菌種類。這與例如WO2011/033310A1中Williams使用的利用紗布的粗過(guò)濾的技術(shù)不同,這比本發(fā)明利用不同尺寸的濾膜來(lái)獲得純化細(xì)菌的技術(shù)差。在一實(shí)施方案中,用于過(guò)濾整個(gè)糞便的過(guò)濾方案適用于達(dá)到幾乎100%的細(xì)菌最高濃度。在一實(shí)施方案中,過(guò)濾方案是兩步方案,其適于利用玻璃纖維深度濾膜進(jìn)行初步凈化。在一實(shí)施方案中,糞便在正壓下過(guò)濾。在一實(shí)施方案中,這將利用30微米PVDF濾膜的組合或三明治結(jié)構(gòu)。在一實(shí)施方案中,該三明治方案將在正壓下過(guò)濾產(chǎn)品。隨后,在一實(shí)施方案中,將膜濃縮用作另一步,以減小濾液的體積。在一實(shí)施方案中,可以在氮?dú)獗Wo(hù)下冷凍干燥或噴霧干燥之前進(jìn)行該步驟??捎糜谶^(guò)濾的可選擇的膜包括但不限于,尼龍濾膜,硝酸纖維素濾膜,PES濾膜,Teflon濾膜,混合纖維素酯濾膜,聚碳酸酯濾膜,聚丙烯濾膜,PVC濾膜或石英濾膜??梢允褂眠@些濾膜的多種組合來(lái)得到更高純度的細(xì)菌,去除為冷凍,噴霧干燥或凍干作準(zhǔn)備的固體和液體。為了冷凍,在可選擇的實(shí)施方案中,將細(xì)菌保存在防止解凍時(shí)細(xì)胞爆裂的液體中。這可以包括多種穩(wěn)定劑,例如,甘油和合適的緩沖液,和/或乙二醇。在可選擇的實(shí)施方案中,冷凍保護(hù)使用終濃度為約20%至60%的穩(wěn)定劑,這取決于所用的穩(wěn)定劑;這通過(guò)防止冰晶形成而幫助穩(wěn)定蛋白,否則所述冰晶會(huì)破壞蛋白結(jié)構(gòu)。在可選擇的實(shí)施方案中,幫助降低活細(xì)菌破壞的穩(wěn)定劑包括脫脂乳,赤蘚糖醇,阿糖醇,山梨醇,葡萄糖,果糖和其它多元醇。聚合物如葡聚糖和聚乙二醇也可以用于穩(wěn)定糞便細(xì)菌細(xì)胞。將合適量的細(xì)菌菌群與穩(wěn)定劑混合,從而使其在容器中被快速冷凍并保持冷凍,所述容器將用于將其運(yùn)輸至合適的設(shè)施,在那里將其解凍之后灌注給患者。在可選擇的實(shí)施方案中,整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群,或分離和/或處理的(例如,純化或分離的)糞便物和/或菌群可被凍干或冷凍干燥,或產(chǎn)品可被冷凍。在可選擇的實(shí)施方案中,冷凍干燥使大多數(shù)細(xì)胞保持存活,并產(chǎn)生可被輕輕壓成粉末的粉末化形式的產(chǎn)品。然后,可以將粉末或凍干或冷凍干燥的菌群或分離物封裝入載體,例如,片劑,凝膠片,丸劑或膠囊(例如,腸衣膠囊)中,或放置到用于攝取的充油膠囊中??蛇x擇地,在遞送給個(gè)體之前,將冷凍干燥或凍干的產(chǎn)品或粉末在例如,液體如無(wú)菌液體,如鹽水,緩沖液或介質(zhì)如液體-葡萄糖-纖維二糖瓊脂(RGCA)介質(zhì)中復(fù)原。在可選擇的實(shí)施方案中,整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群,或分離和/或處理的(例如,純化或分離的)糞便物和/或菌群可被噴霧干燥。在一實(shí)施方案中,噴霧干燥優(yōu)于冷凍干燥或凍干。在可選擇的實(shí)施方案中,整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群,或分離和/或處理的糞便物和/或菌群用野生型細(xì)菌補(bǔ)充,所述野生型細(xì)菌來(lái)源于正常動(dòng)物(例如人)菌群和/或重組處理的細(xì)菌,例如,可合成具有自我保護(hù)或改善效應(yīng)的蛋白,小分子或碳水化合物的重組微生物;或當(dāng)與合適的信號(hào)(例如,通過(guò)攝取來(lái)遞送的化學(xué)品)一起提供時(shí),能自我破壞的重組微生物。在可選擇的實(shí)施方案中,植入產(chǎn)品(例如,本發(fā)明的包含分離或純化的糞便菌群或整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群的組合物)通過(guò)灌注,例如,通過(guò)直腸,氣孔或下到上胃腸(GI)道遞送,或者,其可以用于栓丸,片劑或膠囊形式中,例如,腸衣分級(jí)釋放的膠囊或片劑,例如,添加賦形劑。在可選擇的實(shí)施方案中,植入產(chǎn)品作為栓劑給予,以便在直腸中給予最高濃度。在一實(shí)施方案中,植入產(chǎn)品(例如,本發(fā)明的包含分離或純化的糞便菌群或整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群的組合物)在遞送給個(gè)體之前、期間和/或之后,或用于遞送時(shí)或遞送期間,儲(chǔ)存在液體,例如,無(wú)菌液體如鹽水,緩沖液或介質(zhì)如液體-葡萄糖-纖維二糖瓊脂(RGCA)介質(zhì)中。在可選擇的實(shí)施方案中,本發(fā)明的組合物和方法用于改善,穩(wěn)定,預(yù)防和/或治療多種胃腸病癥,例如艱難梭菌感染,產(chǎn)氣莢膜梭菌以及其它梭菌感染,腸道易激綜合征,便秘,結(jié)腸袋炎,克羅恩病和顯微腸炎;神經(jīng)病癥如帕金森氏病,肌張力障礙,孤獨(dú)癥,肌肉萎縮性側(cè)索硬化癥和多發(fā)性硬化癥,癲癇大發(fā)作或癲癇小發(fā)作。在一實(shí)施方案中,神經(jīng)病癥通過(guò)封裝或冷凍的材料治療。在可選擇的實(shí)施方案中,對(duì)于腸炎患者,需要周期性給予,以抑制并逆轉(zhuǎn)炎癥性腸病和腸道易激綜合征。在可選擇的實(shí)施方案中,過(guò)濾和/或勻漿粗收集的糞便,然后通過(guò)血漿除去法,離心法,細(xì)胞分離法,柱層析(例如,親和層析),免疫沉淀法(例如,固定于諸如珠子或平板的固體表面的抗體)(例如,從含有纖維的“渣滓”)分離細(xì)菌細(xì)胞。離心,包括使用“細(xì)胞分離機(jī)”(例如,BaxtermodelEDIFUGE1215TM)是一種涉及利用離心力分離混合物的方法。對(duì)于“細(xì)胞分離”,最濃密的成分飛濺到轉(zhuǎn)盤的外部,同時(shí)殘余的成分將移動(dòng)到軸線處。通過(guò)在快速移動(dòng)的玻璃板間旋轉(zhuǎn)平整的產(chǎn)品,重力的作用得到加強(qiáng)。可以設(shè)置離心機(jī)或細(xì)胞分離機(jī),使得糞便足夠稀釋并固定在旋轉(zhuǎn)周期,并且收集將僅發(fā)生在離心機(jī)的邊緣處。在可選擇的實(shí)施方案中,利用冷凍保護(hù)劑冷凍例如,通過(guò)離心法,細(xì)胞分離法,血漿除去法等分離或純化的野生型細(xì)菌細(xì)胞(包括例如,整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群)。在可選擇的實(shí)施方案中,將該材料冷凍在容器如袋子中,然后其可以用于通過(guò)結(jié)腸鏡,鼻十二指腸管或鼻胃管灌注。在可選擇的實(shí)施方案中,其可被送交至某機(jī)構(gòu)(例如,醫(yī)院藥房),以便在例如-20°C或以下保持冷凍。可選擇地,可以將經(jīng)過(guò)離心的材料凍干;并且可以將其用于溶液,凝膠,凝膠片,丸劑,膠囊或片劑或栓劑中,例如,以便在隨后復(fù)原作為灌腸劑或通過(guò)結(jié)腸鏡灌注。在一實(shí)施方案中,冷凍保護(hù)劑是海藻糖。海藻糖在噴霧干燥或冷凍干燥之前還可以充當(dāng)還原時(shí)的成分或充當(dāng)其它試劑。在可選擇的實(shí)施方案中,可以長(zhǎng)期服用包含本發(fā)明組合物(例如,分離或純化的糞便菌群或整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群)的溶液,凝膠,凝膠片,丸劑,膠囊或片劑,例如,以天為基礎(chǔ)長(zhǎng)期,例如,一周,兩周,三周或四周或數(shù)個(gè)月或更久,以便治療,穩(wěn)定,改善或預(yù)防慢性和/或免疫病癥諸如,例如持續(xù)性感染,類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎,系統(tǒng)性紅斑狼瘡,自身免疫性腎病,例如腎炎,重度阻塞,炎癥性腸病(IBD),腸易激綜合征(IBS),以及本文所列的其它疾病狀況。整個(gè)微生物群的制劑或培養(yǎng)物在可選擇的實(shí)施方案中,本發(fā)明的組合物(例如,制品或配方),包括含有個(gè)體或物種(例如,人或其它哺乳動(dòng)物)的整個(gè)或基本上整個(gè)微生物群的制劑,配方,培養(yǎng)物或培養(yǎng)物提取物或分離物。在可選擇的實(shí)施方案中,本發(fā)明提供了用于預(yù)防多種感染,疾病或病癥,減輕多種感染,疾病或病癥的癥狀,改善,穩(wěn)定或治療多種感染,疾病或病癥的組合物和方法,其包括給予這些“整個(gè)或基本上整個(gè)微生物群”制劑(例如,培養(yǎng)物或培養(yǎng)物分離物);例如,給予用于預(yù)防以下疾病,減輕以下疾病的癥狀,改善,穩(wěn)定或治療以下疾病的“整個(gè)或基本上整個(gè)微生物群”制劑:脊椎關(guān)節(jié)病,脊椎關(guān)節(jié)炎或骶髂關(guān)節(jié)炎(一個(gè)或兩個(gè)骶髂關(guān)節(jié)的炎癥);腎炎綜合征;具有消化道或腸成分的炎癥性或自身免疫疾病狀況,如狼瘡,腸易激綜合征(IBS或痙攣性結(jié)腸)或腸炎如潰瘍性腸炎或克羅恩腸炎;便秘,孤獨(dú)癥;退行性神經(jīng)疾病如肌肉萎縮性側(cè)索硬化癥(ALS),多發(fā)性硬化癥(MS)或帕金森氏病(PD);肌張力障礙(例如,斯太納特病或近端肌強(qiáng)直性肌病);自身免疫性疾病如風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎(RA)或幼年特發(fā)性關(guān)節(jié)炎(JIA);慢性疲勞綜合征(包括良性肌痛性腦脊髓炎,慢性疲勞免疫功能障礙綜合征,慢性傳染性單核細(xì)胞增多癥,流行性肌痛性腦脊髓膜炎);肥胖;低血糖癥,糖尿病前期綜合征,I型糖尿病或II型糖尿??;特發(fā)性血小板減少性紫癜(ITP);急性或慢性過(guò)敏反應(yīng)如蕁麻疹,皮疹,風(fēng)疹或慢性風(fēng)疹;和/或失眠或慢性失眠,癲癇大發(fā)作或癲癇小發(fā)作。在可選擇的實(shí)施方案中,本發(fā)明提供了組合物和方法,其給予這些“整個(gè)或基本上整個(gè)微生物群”制劑以預(yù)防多種感染,疾病或病癥,減輕多種感染,疾病或病癥的癥狀,改善或治療多種感染,疾病或病癥,所述多種感染,疾病或病癥包括例如,便秘,炎癥性腸病(IBD),克羅恩病,肝性腦病,小腸炎,腸炎,腸易激綜合征(IBS),纖維肌痛(FM),慢性疲勞綜合征(CFS),注意力缺陷/多動(dòng)癥(ADHD),多發(fā)性硬化癥(MS),系統(tǒng)性紅斑狼瘡(SLE),旅行者腹瀉,小腸細(xì)菌過(guò)度生長(zhǎng),慢性胰腺炎,胰功能不全,暴露于毒藥或毒素或感染,毒素介導(dǎo)的旅行者腹瀉,中毒,假膜性腸炎,梭菌感染,產(chǎn)氣莢膜梭菌或艱難梭菌感染,神經(jīng)病癥,帕金森氏病,肌張力障礙,孤獨(dú)癥,肌肉萎縮性側(cè)索硬化癥或多發(fā)性硬化癥,癲癇大發(fā)作或癲癇小發(fā)作。盡管本發(fā)明不受任何具體的作用機(jī)制限制,但本發(fā)明的處理或未處理的糞便樣品,或本發(fā)明的包含完整或部分的糞便菌群樣品(例如,整個(gè)或基本上整個(gè)微生物群)的組合物,或本發(fā)明的部分、基本上或完全分離或純化的糞便菌群,當(dāng)灌注入接受者(例如,人或哺乳動(dòng)物)時(shí),在腸道中大量繁殖。在一實(shí)施方案中,通過(guò)過(guò)濾人類菌群,和/或通過(guò)旋轉(zhuǎn)或離心法,血漿除去法,細(xì)胞分離法,柱層析(例如,親和層析)或免疫沉淀法等制備(例如,分離)這些糞便菌群制劑,從而提取幾乎純的或基本上純的或純的糞便菌群(例如,“細(xì)菌團(tuán)”)。在可選擇的實(shí)施方案中,通過(guò)培養(yǎng)同時(shí)培養(yǎng)的整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群(例如,全都在一起,沒(méi)有任何預(yù)分離出任何特定的細(xì)菌種類)來(lái)制備本發(fā)明的組合物。在一實(shí)施方案中,將“整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群培養(yǎng)物”樣品配制成,例如,液體或冷凍干燥的或冷凍的產(chǎn)品。在一實(shí)施方案中,這些制劑不含任何(或基本上不含)非菌群物質(zhì),例如,糞便樣品中通常存在的不吸收的成分,例如,未處理的人糞便。在一實(shí)施方案中,未處理的(例如,人)糞便被制成治療劑或制劑。在一實(shí)施方案中,本發(fā)明提供了通過(guò)從合適的供體采集糞便樣品來(lái)培養(yǎng)整個(gè)哺乳動(dòng)物如人菌群的方法。在一實(shí)施方案中,合適的供體是不含病原體的個(gè)體;例如,在一方面,樣品從被分類為正常且沒(méi)有任何病原體的供體收集。在一實(shí)施方案中,作為單獨(dú)的療法或結(jié)合其它療法,來(lái)自瘦供體的細(xì)菌可以用于治療肥胖患者的肥胖。在可選擇的實(shí)施方案中,在完全或基本上完全無(wú)氧的條件下,培養(yǎng)進(jìn)行大約2,3,4,5,6,7或8或更多天??梢岳脴?biāo)準(zhǔn)培養(yǎng)方案,利用例如,非選擇性腸微生物群培養(yǎng)基(GMM),并且在一實(shí)施方案中,在大約36.8°C的(人)體溫下孵育??梢岳萌狈?或基本上缺乏)氧氣但含氮?dú)?、二氧化碳和氫氣的環(huán)境。隨著GMM組合物濃度的變化,可以使用不同的GMM。然后通過(guò)例如,用無(wú)菌刮刀刮擦來(lái)收獲集落或培養(yǎng)的菌群。可以利用例如,冷沉淀物諸如例如,甘油,半胱氨酸或乳,將收獲的集落或培養(yǎng)的菌群冷凍在例如,約-80°或以下(例如,在冷藏室中)。然后,這樣的培養(yǎng)物可被等分成僅用一次(因?yàn)樵倥囵B(yǎng)可能導(dǎo)致附著性喪失)。在一實(shí)施方案中,方法可以包括在例如類似于GMM的脂質(zhì)培養(yǎng)基中再培養(yǎng)。該整個(gè)培養(yǎng)基可以利用例如,具有半胱氨酸的甘油再次冷凍;并且在一實(shí)施方案中,可以保持冷凍或冷凍干燥。這能產(chǎn)生約108至約1010CFU。在可選擇的實(shí)施方案中,可配制成粉末,干燥,冷凍,冷凍干燥或液體或其它形式的培養(yǎng)的(例如,人)細(xì)菌(例如,整個(gè)或基本上整個(gè)微生物群),和/或其可以用作灌腸劑,食品或食品添加劑或配方(例如,添加至酸奶,乳,飲料,調(diào)味飲料或食品),或作為膠囊,片劑,凝膠片等(例如,作為腸衣膠囊)來(lái)遞送以再次大量繁殖或可選擇地或治療性地“大量繁殖”腸道菌群。在可選擇的實(shí)施方案中,將培養(yǎng)的細(xì)菌添加至“整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群”的培養(yǎng)物或樣品或配方。例如,在一實(shí)施方案中,第一次給予或最初的日配方僅包含“整個(gè)微生物群”配方;而在其它實(shí)施方案中,第一次給予或最初的日配方既包含“整個(gè)微生物群”又包含其它培養(yǎng)的細(xì)菌,例如,培養(yǎng)的益生菌。在可選擇的實(shí)施方案中,較不頻繁的配方或劑量(其可以是在較小或較大的間隔,或周期性間隔或由醫(yī)師或獸醫(yī)根據(jù)改善的速率確定的間隔等逐步的)僅包含“整個(gè)微生物群”;而在其它實(shí)施方案中,既包含“整個(gè)微生物群”又包含其它培養(yǎng)的細(xì)菌,例如,培養(yǎng)的益生菌。在可選擇的實(shí)施方案中,為了實(shí)現(xiàn)期望的效應(yīng)或治療結(jié)果,其它培養(yǎng)的細(xì)菌(例如,添加至“整個(gè)微生物群”中)是類桿菌屬,硬壁菌門和/或蘇云金桿菌,其從供體直接分離,或可以來(lái)自純培養(yǎng)物等。在可選擇的實(shí)施方案中,使用遞送增加量的一種或多種糞便菌群(例如,細(xì)菌)種類,例如,遞送的“整個(gè)微生物群”產(chǎn)品由一種或多種其它物種,例如,類桿菌屬,硬壁菌門和/或蘇云金桿菌種類來(lái)增加(“摻入”)。多次或重復(fù)灌注或給予在可選擇的實(shí)施方案中,本發(fā)明的組合物(例如,制品或配方),包括處理或未處理的糞便樣品,或部分、基本上或完全分離或純化的糞便菌群,或本發(fā)明的“整個(gè)人微生物群培養(yǎng)物”,或整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群或以上的組合,經(jīng)配制或標(biāo)準(zhǔn)化用于重復(fù)或多次遞送或灌注。在本發(fā)明方法的可選擇實(shí)施方案中,例如,整個(gè)人微生物群的部分、基本上或完全分離或純化的糞便菌群,或整個(gè)(或基本上整個(gè))微生物群,或以上的組合,通過(guò)重復(fù)或多次遞送或灌注來(lái)遞送或給予。因而,本發(fā)明提供了組合物和方法,其用于治療,穩(wěn)定或改善腸道菌群感染或難以持久逆轉(zhuǎn)的病癥,或用于治療或改善特征為難以持久逆轉(zhuǎn)的腸道菌群感染的病癥。已經(jīng)發(fā)現(xiàn),多次,重復(fù)灌注能夠克制腸道菌群感染或難以持久逆轉(zhuǎn)的病癥。在可選擇的實(shí)施方案中,在實(shí)施本發(fā)明的方法和/或組合物(例如,制品或配方)的過(guò)程中,多次或重復(fù)的糞便菌群植入(給予,灌注)能夠克制具有例如,病原性和/或外來(lái)細(xì)菌菌株或慢性病癥的個(gè)體(例如,人或患者)進(jìn)行中的菌群感染的潛在頑疾。在沒(méi)有充分消除感染性(例如,病原性的和/或外來(lái)的)細(xì)菌的情況下,可能返回到進(jìn)行中的原癥狀。已知細(xì)菌有時(shí)不分裂,且可以在物體的很多潮濕(例如,內(nèi)部)表面的生物膜中存活。其次,細(xì)菌有孢子,所述孢子在間斷的孢子形成時(shí)期很難根除。還有休眠形式的細(xì)菌,可以在細(xì)胞內(nèi)或細(xì)胞外,它們更難根除——除非休眠形式正在分裂。最后,細(xì)胞內(nèi)的細(xì)菌可以等待,直到它們寄居的腸壁細(xì)胞流入腸腔,再次感染菌群。在可選擇的實(shí)施方案中,本發(fā)明方法的多次或重復(fù)腸道菌群灌注能夠,并且可以被要求來(lái)殺死或以其它方式失活存活(例如,感染性的,病原性的和/或外來(lái)的)細(xì)菌,所述細(xì)菌被保護(hù)于細(xì)胞、生物膜等之內(nèi)。在可選擇的實(shí)施方案中,本發(fā)明方法的多次或重復(fù)腸道菌群灌注能夠,并且可以被要求來(lái)殺死或以其它方式失活移動(dòng)到更接近腸腔的隱窩的細(xì)菌細(xì)胞,在那里,它們流入糞便流,并再次感染個(gè)體或患者。此外,在可選擇的實(shí)施方案中,本發(fā)明方法和/或組合物(例如,制品或配方)的多次(周期性)或重復(fù)的糞便菌群植入(給予,灌注)可有效預(yù)防,穩(wěn)定患有以下疾病的個(gè)體(例如,患者),減輕患有以下疾病的個(gè)體(例如,患者)的癥狀,改善或治療患有以下疾病的個(gè)體(例如,患者):脊椎關(guān)節(jié)病,脊椎關(guān)節(jié)炎或骶髂關(guān)節(jié)炎(一個(gè)或兩個(gè)骶髂關(guān)節(jié)的炎癥);腎炎綜合征;具有消化道或腸成分的炎癥性或自身免疫疾病狀況如狼瘡,腸易激綜合征(IBS或痙攣性結(jié)腸)或腸炎如潰瘍性腸炎或克羅恩腸炎;便秘,孤獨(dú)癥;退行性神經(jīng)疾病如肌肉萎縮性側(cè)索硬化癥(ALS),多發(fā)性硬化癥(MS)或帕金森氏病(PD);肌張力障礙(例如,斯太納特病或近端肌強(qiáng)直性肌病);自身免疫性疾病如風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎(RA)或幼年特發(fā)性關(guān)節(jié)炎(JIA);慢性疲勞綜合征(包括良性肌痛性腦脊髓炎,慢性疲勞免疫功能障礙綜合征,慢性傳染性單核細(xì)胞增多癥,流行性肌痛性腦脊髓膜炎);肥胖;低血糖癥,糖尿病前期綜合征,I型糖尿病或II型糖尿??;特發(fā)性血小板減少性紫癜(ITP);急性或慢性過(guò)敏反應(yīng)如蕁麻疹,皮疹,風(fēng)疹或慢性風(fēng)疹;和/或失眠或慢性失眠,癲癇大發(fā)作或癲癇小發(fā)作。在可選擇的實(shí)施方案中,通過(guò)使用本發(fā)明的方法或組合物,包括過(guò)濾的人糞便的周期性灌腸劑,通過(guò)鼻十二指腸(ND)管或鼻胃(NG)管周期性灌注來(lái)實(shí)施(進(jìn)行)本發(fā)明。在可選擇的實(shí)施方案中,本發(fā)明的方法或組合物配制或使用多種配方,例如,冷凍的提取的糞便細(xì)菌物可以懸浮成調(diào)味飲料或放下ND或NG管或作為灌腸劑插入。在可選擇的實(shí)施方案中,提取的細(xì)菌——“野生型”是冷凍干燥的(任選地,在部分、基本上或完全純化和分離之后)并形成粉末;然后,它們可以作為例如,腸衣膠囊,片劑,溶液等進(jìn)行攝取。在可選擇的實(shí)施方案中,最初,每天服用、灌注或給予本發(fā)明的這些“產(chǎn)品”,然后頻率越來(lái)越低,并且在一些實(shí)施方案中,最終幾周或幾個(gè)月一次。在可選擇的實(shí)施方案中,培養(yǎng)的細(xì)菌可以添加至部分、基本上或完全純化或分離的糞便菌群。例如,在一實(shí)施方案中,第一次給予或最初的日配方僅包含部分、基本上或完全純化或分離的糞便菌群;而在其它實(shí)施方案中,第一次給予或最初的日配方既包含部分、基本上或完全純化或分離的糞便菌群又包含培養(yǎng)的細(xì)菌,例如,培養(yǎng)的益生菌。在可選擇的實(shí)施方案中,較不頻繁的配方或劑量(其可以是在較小或較大的間隔,或周期性間隔或由醫(yī)師或獸醫(yī)根據(jù)改善的速率確定的間隔等逐步的)僅包含部分、基本上或完全純化或分離的糞便菌群;而在其它實(shí)施方案中,既包含部分、基本上或完全純化或分離的糞便菌群又包含培養(yǎng)的細(xì)菌,例如,培養(yǎng)的益生菌。在可選擇的實(shí)施方案中,為了實(shí)現(xiàn)期望的效應(yīng)或治療結(jié)果,培養(yǎng)的細(xì)菌是類桿菌屬和/或硬壁菌門和/或蘇云金桿菌,其可從供體直接分離,或可以來(lái)自純培養(yǎng)物等。在可選擇的實(shí)施方案中,使用遞送增加量的一種或多種糞便菌群(例如,細(xì)菌),例如,遞送的產(chǎn)品由一種或多種其它物種,例如,類桿菌屬和/或硬壁菌門和/或蘇云金桿菌來(lái)增加(“摻入”)。在可選擇的實(shí)施方案中,對(duì)于由本領(lǐng)域技術(shù)人員確定的適當(dāng)效力,每天引入配方,或不是每天而是周期性地,例如,以更高的劑量,持續(xù)延長(zhǎng)的一段時(shí)間。在可選擇的實(shí)施方案中,重復(fù)或多次灌注,給予或植入方案包括每日進(jìn)行灌注,第一次持續(xù)大約10天,隨后,第二次每日灌注不同的劑量或配方持續(xù)大約10天,以及任選地,隨后第三次每日灌注不同的;然后,任選地,第四次每日,每周或每月灌注不同的劑量或配方,然后,任選地,維持每日,每周或每月遞送或灌注不同的劑量或配方,直到實(shí)現(xiàn)組織向正?;蚱渌委焻?shù)或目的逆轉(zhuǎn);例如,用于治療腸道易激綜合征,腸炎如潰瘍性腸炎或克羅恩腸炎,便秘,孤獨(dú)癥,退行性神經(jīng)疾病如多發(fā)性硬化癥(MS),帕金森氏病(PD),肌張力障礙,類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎,慢性疲勞綜合征,肥胖,糖尿病,II型糖尿病,特發(fā)性血小板減少性紫癜(ITP),自身免疫性疾病,慢性風(fēng)疹和/或失眠或慢性失眠,癲癇大發(fā)作或癲癇小發(fā)作。在可選擇的實(shí)施方案中,用以下進(jìn)行重復(fù)或多次灌注,給予或植入:每日第一配方,第一次1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14或15天;每日第二劑量或配方,持續(xù)接下來(lái)的1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14或15天或更多天;然后,任選地,接下來(lái)每日第三劑量或配方(例如,持續(xù)接下來(lái)的1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14或15天或更多天);然后,任選地,每日或每周第四劑量或配方(例如,持續(xù)接下來(lái)的1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14或15天,周,月或更久);然后,任選地,維持每周或每月灌注,直到例如,組織向正?;蛑委熁蚧謴?fù)的其它合適的參數(shù)逆轉(zhuǎn);例如,用于治療腸道易激綜合征,腸炎如潰瘍性腸炎或克羅恩腸炎,便秘,孤獨(dú)癥,退行性神經(jīng)疾病如多發(fā)性硬化癥(MS),帕金森氏病(PD),肌張力障礙,類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎,慢性疲勞綜合征,肥胖,糖尿病,II型糖尿病,特發(fā)性血小板減少性紫癜(ITP),自身免疫性疾病,慢性風(fēng)疹和/或失眠或慢性失眠,癲癇大發(fā)作或癲癇小發(fā)作。在本發(fā)明的這種“重復(fù)給予”實(shí)施方案中,本領(lǐng)域技術(shù)人員,例如醫(yī)師或獸醫(yī),能夠評(píng)估個(gè)體的改善并確定精確適當(dāng)?shù)慕o予劑量或頻率。在可選擇的實(shí)施方案中,這些示例性的方案還能夠用于灌注或攝取培養(yǎng)的益生菌,其將成波浪形被沖進(jìn)腸道,以便解決生物膜孢子,休眠形式及細(xì)胞內(nèi)細(xì)菌的問(wèn)題??傊?,在可選擇的實(shí)施方案中,本發(fā)明提供了組合物和方法,其通過(guò)多次,重復(fù)灌注本文所述的糞便菌群,用于治療,穩(wěn)定或改善難以持久逆轉(zhuǎn)的腸道菌群感染,或用于治療或改善特征為難以持久逆轉(zhuǎn)或控制的腸道菌群感染或與難以持久逆轉(zhuǎn)或控制的腸道菌群感染相關(guān)的病癥。在可選擇的實(shí)施方案中,本發(fā)明的糞便微生物群植入組合物和方法在除了其中梭菌如艱難梭菌是感染劑的疾病狀況之外的上文所列出的更疑難的病癥中是有效的。在可選擇的實(shí)施方案中,重復(fù)或周期性灌注是獲得治愈,穩(wěn)定或持續(xù)緩解的關(guān)鍵。用于遞送本發(fā)明組合物的裝置本發(fā)明還提供了用于遞送本發(fā)明組合物的裝置,例如,示例性的遞送裝置入圖1B所示。在可選擇的實(shí)施方案中,本發(fā)明的裝置還可以包括以下或由以下組成:(b)(1)袋子或容器,其包含與軟管或等同物近端可控連接的出口孔,其中所述袋子或容器任選地由不透氣或不透氧氣的材料制成,以及任選地,所述袋子或容器由柔性材料或包含聚對(duì)苯二甲酸乙二醇酯聚酯膜(或包含MYLARTM)的材料制成,以及任選地,所述袋子或容器是靜脈注射樣(IV樣)袋子,以及任選地,所述袋子或容器具有附屬物,所述附屬物允許袋子懸掛于座上,例如,放置/懸掛在內(nèi)窺鏡上,以及任選地,所述袋子或容器通過(guò)開(kāi)關(guān)閥或等同物可控連接至能夠從袋子排除氣體或空氣的負(fù)壓裝置,以及任選地,所述袋子或容器通過(guò)開(kāi)關(guān)閥或等同物可控連接至用于通過(guò)出口孔沖洗袋子的液源或儲(chǔ)存容器,并且任選地,所述液源或儲(chǔ)存容器處于正壓下,以及任選地,所述軟管或等同物包括至少一個(gè)夾子或關(guān)閉閥25或止回閥,從而防止材料從管的遠(yuǎn)端回流至近端部分或從管回流至袋子或容器;(2)在所述軟管或等同物遠(yuǎn)端的開(kāi)關(guān)閥或等同物或閉孔螺帽,以及任選地,用于連接至結(jié)腸鏡或內(nèi)窺鏡魯爾鎖口或等同物的魯爾鎖緊頭,其中任選地,所述魯爾鎖緊頭內(nèi)置入閥中或與閥分離,以及任選地,用于連接至灌腸劑管或裝置或等同物的灌腸劑管尖端,其中任選地,所述灌腸劑管尖端植入閥中或與閥分離,以及任選地,其還包括安全裝置或安全夾,用于在壓力下閥或魯爾鎖末端或灌腸劑末端遺失(脫落)的情況下關(guān)閉遠(yuǎn)端孔5;以及(3)泵或手泵,用于通過(guò)軟管或等同物將袋子或容器中的材料移出至遠(yuǎn)端或開(kāi)關(guān)閥或等同物。在可選擇的實(shí)施方案中,本發(fā)明的裝置還包含處理或未處理的糞便菌群,或部分、基本上或完全分離的糞便菌群或本發(fā)明的組合物,例如,部分、基本上或完全分離或純化的糞便菌群或包含基本上或完全不含非糞便菌群糞便物的糞便菌群的組合物,以及任選地,還包含賦形劑,或液體,鹽水,緩沖液,緩沖試劑或介質(zhì)或液體-葡萄糖-纖維二糖瓊脂(RGCA)介質(zhì)。在一實(shí)施方案中,本發(fā)明提供了袋子或容器,其包含處理或未處理的糞便菌群,或部分、基本上或完全分離的糞便菌群,或本發(fā)明的組合物,例如,部分、基本上或完全分離或純化的糞便菌群,或包含基本上或完全不含非糞便菌群糞便物的糞便菌群的組合物,以及任選地還包含賦形劑,或液體,鹽水,緩沖液,緩沖試劑或介質(zhì),或液體-葡萄糖-纖維二糖瓊脂(RGCA)介質(zhì),其中所述袋子或容器在結(jié)構(gòu)上與本發(fā)明的袋子或容器基本上相同或相似,例如,如本文所述的袋子或容器,其包括可控連接至軟管或等同物等近端的出水孔。將結(jié)合以下實(shí)施例進(jìn)一步描述本發(fā)明,然而,應(yīng)當(dāng)理解的是本發(fā)明并不限于這些實(shí)施例。實(shí)施例實(shí)施例1:本發(fā)明的示例性方法本發(fā)明的一個(gè)示例性方案涉及用包含本發(fā)明的處理的或分離的糞便細(xì)菌菌群(其最初來(lái)源于健康供體)的灌腸劑治療5至10天??蛇x擇地,患者僅在一次治療之后就能恢復(fù)。在一實(shí)施方案中,供體的最佳選擇是已經(jīng)測(cè)試過(guò)大量細(xì)菌和寄生蟲劑的近親。在醫(yī)院環(huán)境下制備和給予灌腸劑,以確保所有必需的預(yù)防措施。本發(fā)明的示例性益生元灌注還可以通過(guò)鼻胃管給予,將細(xì)菌直接遞送至小腸??梢月?lián)合這兩種方法來(lái)實(shí)現(xiàn)期望的結(jié)果。在該程序后長(zhǎng)達(dá)一年內(nèi)應(yīng)當(dāng)要求進(jìn)行常規(guī)檢查。在一實(shí)施方案中,由治療之前的患者提供自體糞便樣品,并將其儲(chǔ)存在冰箱中,凍干或冷凍干燥或等同。如果患者以后發(fā)展成感染,例如,艱難梭菌感染,用鹽水制備(提取)樣品并過(guò)濾。可以將濾出物冷凍干燥,并將得到的固體封裝在膠囊,例如,腸衣膠囊中。膠囊的給予能夠恢復(fù)患者自身的結(jié)腸菌群并戰(zhàn)勝諸如艱難梭菌的感染。在一實(shí)施方案中,將樣品通過(guò)鼻探針遞送至十二指腸。在一實(shí)施方案中,本發(fā)明的方法包括從健康供體收集新鮮的人菌群(糞便),將其帶至中心機(jī)構(gòu),以這樣的方式處理它,使得它被賦予延長(zhǎng)的生命,檢查病原體,維持溫度控制以降低細(xì)菌的代謝活性并控制氧休克,形成均質(zhì)的,標(biāo)準(zhǔn)化的菌群的儲(chǔ)存設(shè)施,并將菌群運(yùn)輸至遠(yuǎn)處的醫(yī)院,以治療患有例如急性假膜性腸炎,重度艱難梭菌感染,敗血癥或其它類似病癥的患者。在一實(shí)施方案中,本發(fā)明的產(chǎn)品是改良的糞便組合物。需要收集糞便,并迅速放置于無(wú)氧容器中,所述容器可能用吸收且吸收氧氣的物質(zhì)排除空氣或可以用氮?dú)饣蚱渌栊曰虿粫?huì)損害厭氧菌群的氣體排空或填充。其必須被保存在視覺(jué)上可接受的容器中,所述容器既不滲漏糞便也不會(huì)滲漏產(chǎn)生無(wú)氧環(huán)境的氣體。一旦被運(yùn)送至中心“庫(kù)”,糞便就被儲(chǔ)存在涼爽的房間中,從而減慢代謝,但并不冷凍,以防止水膨脹破壞了糞便內(nèi)所含的細(xì)菌細(xì)胞。在一實(shí)施方案中,添加抗氧化劑和/或諸如甘油的物質(zhì),以在冷環(huán)境中幫助穩(wěn)定細(xì)菌,并防止它們?cè)趦?chǔ)存和運(yùn)輸過(guò)程中被破壞。在一實(shí)施方案中,產(chǎn)品作為(以)約10cc至3升糞便的體積被儲(chǔ)存/包含。在一實(shí)施方案中,其以(作為)300cc容器(或量)被儲(chǔ)存,并保存在合適的耐氧材料,例如,塑料,耐氧或不透氣的聚對(duì)苯二甲酸乙二醇酯聚酯膜(例如,金屬化形式),或金屬化MYLARTM或鋁化MYLARTM中,其可通過(guò)給予裝置連接至泵,所述給予裝置連接至結(jié)腸鏡并通過(guò)結(jié)腸鏡給予至遠(yuǎn)端的小腸或上結(jié)腸/末端回腸,以克制艱難梭菌感染。中心菌群供應(yīng)機(jī)構(gòu)或“庫(kù)”在一實(shí)施方案中,一個(gè)機(jī)構(gòu)以以下方式供應(yīng)人菌群:1.將糞便收集在特定的容器中,并在無(wú)氧條件下保持涼爽,直到其到達(dá)中心菌群處理單元。2.在處理單元中,添加特定的添加劑,包括甘油,可能是抗氧化劑和其它特定的防腐劑,并且保持涼爽,勻漿并分配入合適的靜脈注射樣袋子,但是用稍微厚點(diǎn)的產(chǎn)品如不透氣的聚對(duì)苯二甲酸乙二醇酯聚酯膜或鋁化MYLARTM。這將防止氧氣轉(zhuǎn)移,氮?dú)庑孤┖凸芾砣藛T察覺(jué)出氣味。然后,將袋子在不允許細(xì)菌冷凍的溫度下儲(chǔ)存,并準(zhǔn)備在冷卻器中運(yùn)輸至將進(jìn)行糞便植入的醫(yī)院。3.袋子配備了附屬的給予裝置,使得它不用必須由醫(yī)護(hù)人員操縱。將它連接至具有止回閥的“血型”泵。在靜脈注射樣(IV樣)袋子上,有能夠允許袋子懸掛在IV液體座上并放置/懸掛在內(nèi)窺鏡上的附屬物。然后,內(nèi)窺鏡人員摘掉閉孔螺帽,并將魯爾鎖緊頭連接至內(nèi)窺鏡魯爾鎖口,從而通過(guò)結(jié)腸鏡或內(nèi)窺鏡尖端的活檢鉗子管道灌注。如果壓力下尖端脫落時(shí),連接安全裝置。然后,當(dāng)用沿著給予裝置的壓力作用使產(chǎn)品往下流至“給予裝置”時(shí),空氣從管中流出,隨著空氣流出,然后利用給予泵僅將糞便給予患者的結(jié)腸并例如用一些鹽水沖洗。4.然后內(nèi)窺鏡人員收回結(jié)腸鏡,轉(zhuǎn)動(dòng)患者“頭朝下/腿朝上”,從而允許空氣和液體被吸收,并防止患者太早進(jìn)行排便。這將允許細(xì)菌重獲溫度,開(kāi)始將其自身附著于腸壁,如例如Grehanetal:JofClinicalGastroenterology,Sept.2010所述。已經(jīng)描述了本發(fā)明的多個(gè)實(shí)施方案。然而,在不脫離本發(fā)明的實(shí)質(zhì)和范圍的情況下,可以進(jìn)行多種修改。因此,其它實(shí)施方案處于以下權(quán)利要求書的范圍內(nèi)。
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