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      一種混樣測序文庫索引管理方法和系統(tǒng)

      文檔序號:40275481發(fā)布日期:2024-12-11 13:09閱讀:來源:國知局

      技術特征:

      1.一種混樣測序文庫索引管理方法,其特征在于,包括如下步驟:

      2.按照權(quán)利要求1所述的混樣測序文庫索引管理方法,其特征在于,步驟1中,所述信息包括:文庫名稱、文庫類型、文庫濃度、index序列和測序需求。

      3.按照權(quán)利要求2所述的混樣測序文庫索引管理方法,其特征在于,步驟1中,對所述信息進行處理后,將處理所得數(shù)據(jù)與所述信息一起進行存儲,所述處理包括:對文庫進行編號,計算index序列的堿基位數(shù),測序數(shù)據(jù)量單位換算。

      4.按照權(quán)利要求1所述的混樣測序文庫索引管理方法,其特征在于,步驟2中,包括如下步驟:

      5.按照權(quán)利要求4所述的混樣測序文庫索引管理方法,其特征在于,步驟2.2中,所述index核對和查重包括如下兩項:

      6.按照權(quán)利要求1所述的混樣測序文庫索引管理方法,其特征在于,步驟3中,包括如下步驟:

      7.按照權(quán)利要求1所述的混樣測序文庫索引管理方法,其特征在于,步驟5中,所述測序數(shù)據(jù)的拆分包括如下步驟:

      8.按照權(quán)利要求7所述的混樣測序文庫索引管理方法,其特征在于,步驟5中,所述測序數(shù)據(jù)的拆分還包括如下步驟:獲取fastq目錄下

      9.一種用于實現(xiàn)權(quán)利要求1-8任一項所述混樣測序文庫索引管理方法的系統(tǒng),其特征在于,包括:

      10.一種計算機可讀存儲介質(zhì),其特征在于,其上存儲有:用于實現(xiàn)權(quán)利要求1-8任一項所述的混樣測序文庫索引管理方法的計算機程序。


      技術總結(jié)
      本發(fā)明屬于混樣測序技術領域,具體涉及一種混樣測序文庫索引管理方法和系統(tǒng)。包括如下步驟:樣本信息收集和管理:收集和存儲測序樣本的信息;index核對與查重:系統(tǒng)生成測序排單表,執(zhí)行index核對和查重;樣本定量與標準化計算:根據(jù)文庫濃度和統(tǒng)一稀釋的濃度計算稀釋所需文庫體積、溶劑體積,換算摩爾濃度;Pooling方案生成:根據(jù)樣本的預計數(shù)據(jù)產(chǎn)出和稀釋情況,自動生成Pooling表;測序拆分數(shù)據(jù)管理:進行測序數(shù)據(jù)的拆分,生成拆分報告。本發(fā)明還進一步提供了實現(xiàn)上述方法的系統(tǒng)。本發(fā)明的方法和系統(tǒng)具有自動化程度高、運行高效、操作簡單的優(yōu)點,在諸多生物學研究和檢測場景中具有很好的應用前景。

      技術研發(fā)人員:晁寧寧,毛盛強,張立
      受保護的技術使用者:四川大學華西醫(yī)院
      技術研發(fā)日:
      技術公布日:2024/12/10
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