1.一種rna假結的loop區(qū)域和stem區(qū)域的模擬方法，其特征在于，包括如下步驟：
2.根據權利要求1所述的模擬方法，其特征在于，所述s2中的h型rna假結的晶體結構為pdb?id：1hvu；
3.根據權利要求2所述的模擬方法，其特征在于，所述loop1區(qū)域處在所述stem2區(qū)域形成的大溝中，所述loop2區(qū)域穿過所述stem1區(qū)域形成的小溝。
4.根據權利要求1所述的模擬方法，其特征在于，所述s3中的平衡模擬系統電荷為在系統中添加na+使模擬系統處于電荷中性；
5.根據權利要求1所述的模擬方法，其特征在于，所述s3中的水盒子利用周期性邊界條件，確保所述水盒子每個方向有三個或四個溶劑層。
6.根據權利要求1所述的模擬方法，其特征在于，所述s4中的靜電相互作用的截斷距離為
7.根據權利要求1所述的模擬方法，其特征在于，所述s4中的溶質的鍵長使用相鄰的網格搜索方法，每十步更新一次；
8.根據權利要求2所述的模擬方法，其特征在于，所述模擬系統在290k時的構象為初始結構。
9.一種rna假結的loop區(qū)域和stem區(qū)域的模擬方法在預測rna假結結構中的應用。
10.根據權利要求9所述的應用，其特征在于，所述預測rna假結結構包括開放stem區(qū)域末端的一對核苷酸以及l(fā)oop區(qū)域的核苷酸，統計stem區(qū)域堿基對的打開閉合幾率以及打開態(tài)與閉合態(tài)熵變和焓變。