圓柱形袋子,從而允許圓柱形袋子在其圓柱軸線的方向上壓縮。然而,可以使用替 代設(shè)置。例如,收集室可以設(shè)置有活塞,該活塞配置為:當(dāng)在提供樣品之后且組裝了過(guò)濾裝 置時(shí),迫使生物流體從收集室通過(guò)過(guò)濾器到達(dá)廢液池中。也可以使用栗系統(tǒng)來(lái)施加壓力。
[0026] 在替代設(shè)置中,可以提供用于生成真空的構(gòu)件,以便拉動(dòng)/抽吸流體使其通過(guò)過(guò)濾 器。這可以通過(guò)使用栗來(lái)實(shí)現(xiàn),該栗設(shè)置為從廢液池中抽出空氣,從而創(chuàng)建真空,或者廢液 池自身可以設(shè)置有處于真空中的室。該室隨后可以向廢液池的其它部分開(kāi)放(例如通過(guò)釋 放閥門(mén)),以便在過(guò)濾期間拉動(dòng)流體通過(guò)過(guò)濾器。
[0027] 如果使用壓力差來(lái)迫使/拉動(dòng)生物流體通過(guò)過(guò)濾器,則期望的是包括一個(gè)或多個(gè) 閥門(mén),這一個(gè)或多個(gè)閥門(mén)配置為允許裝置內(nèi)的壓力在壓力/真空的施加期間及之后保持平 衡。
[0028]然而,應(yīng)理解,本發(fā)明的組件可適用于過(guò)濾如本文所描述的多種生物流體樣品,但 在某些優(yōu)選實(shí)施例中,生物流體是尿液或者膀胱沖洗液,最優(yōu)選地為尿液。在某些其它實(shí)施 例中,流體可以是血液或者血清。廢液池可以包含吸收劑和/或除臭材料,對(duì)于過(guò)濾尿液樣 品而目,這可以是特別有利的。
[0029]過(guò)濾器可以選擇為用于捕獲需要的和如本文所描述的生物材料。優(yōu)選地,過(guò)濾器 選擇為用于捕獲與疾病、病情或者失調(diào)(例如,癌癥)的診斷和/或預(yù)后相關(guān)的生物材料。在 某些優(yōu)選實(shí)施例中,生物材料是懸浮在生物流體中的細(xì)胞,更加優(yōu)選地,是懸浮在尿液中的 細(xì)胞。
[0030] 可以對(duì)生物材料進(jìn)行測(cè)試,以便測(cè)試與疾病、病情或者失調(diào)的診斷和/或預(yù)后相關(guān) 聯(lián)的標(biāo)記的存在。生物材料可以是適用于測(cè)試標(biāo)記的存在的細(xì)胞,該標(biāo)記指示特定疾病、病 情或者失調(diào),例如,與泌尿癌的診斷和/或預(yù)后相關(guān)聯(lián)的標(biāo)記。
[0031] 在另一方面,本發(fā)明可提供使用如本文所描述的組件從生物樣品捕獲生物材料的 方法,該方法包括:
[0032] (i)將生物流體樣品提供到收集室中;
[0033] (i i)將收集室連接至過(guò)濾器支撐平臺(tái)和廢液池;
[0034] (iii)使生物流體樣品從收集室經(jīng)過(guò)過(guò)濾器流入到廢液池中,以捕獲流體中存在 的生物材料;以及
[0035] (iv)從過(guò)濾器支撐平臺(tái)移除濾筒并將該濾筒插入到儲(chǔ)存單元中。
[0036] 該方法可以進(jìn)一步包括如下步驟:例如,如果適當(dāng)?shù)卦O(shè)置了組件,則通過(guò)壓縮收集 室向收集室中的生物流體樣品施加壓力,以迫使生物流體樣品通過(guò)過(guò)濾器從收集室流入到 廢液池中。可替代地,該方法可以進(jìn)一步包括在廢液池中生成真空的步驟,以便抽吸生物流 體樣品使其通過(guò)過(guò)濾器。
[0037] 濾筒和儲(chǔ)存單元組合可以提供便捷的密封單元,用于儲(chǔ)存和/或運(yùn)輸所捕獲的生 物材料。例如,濾筒和儲(chǔ)存單元組合接著可以在測(cè)試之前被儲(chǔ)存,送到恰當(dāng)?shù)淖o(hù)理者(例如, 執(zhí)業(yè)醫(yī)師)那里,或者例如通過(guò)國(guó)家郵遞員或使用國(guó)內(nèi)郵遞系統(tǒng)進(jìn)行運(yùn)輸,兩種情況均很便 捷和衛(wèi)生。
[0038] -旦分析師接收到濾筒和儲(chǔ)存單元組合,就可以從過(guò)濾器和/或任何周?chē)后w得 到所捕獲的生物材料,并且如本文所描述的那樣進(jìn)行測(cè)試。該測(cè)試可以有助于如本文所描 述的病情的診斷和/或預(yù)后。相應(yīng)地,在另一方面中,本發(fā)明提供一種方法,其中,該方法已 經(jīng)通過(guò)使用如本文描述的組件和/或方法過(guò)濾了生物流體,該方法包括如下步驟:
[0039] (i)從在過(guò)濾器上捕獲的生物材料分離出核酸、蛋白質(zhì)或者細(xì)胞和/或如果存在的 話從溶液中的生物材料分離出核酸、蛋白質(zhì)或者細(xì)胞;以及
[0040] (ii)測(cè)試分離出的材料,以便尋找與特定疾病、病情或者失調(diào)相關(guān)的已知標(biāo)記。
[0041] 應(yīng)理解,本文所描述的組件通常將以成套工具的形式提供給用戶,用戶可以是患 者本人或者合適的護(hù)理者,諸如執(zhí)業(yè)醫(yī)師。相應(yīng)地,在本發(fā)明的另一方面中,提供一種成套 工具,其包括如本文所描述的任一實(shí)施例中的收集室、過(guò)濾器支撐平臺(tái)、廢液池、以及儲(chǔ)存 單元,以及可選地,包括如本文所描述的方法的說(shuō)明。
[0042]應(yīng)理解,在某些情況下,組件的單個(gè)元件可以單獨(dú)地提供,并且本發(fā)明還提供如本 文描述的濾筒和如本文描述的儲(chǔ)存單元,該濾筒和儲(chǔ)存單元可以單獨(dú)地提供到組件的其它 部分。
[0043]本發(fā)明包括本文描述的各方面和優(yōu)選特征的任意組合,除了很顯然不被允許或者 明確避免的組合之外。
【附圖說(shuō)明】
[0044]現(xiàn)在將參照附圖通過(guò)示例的方式對(duì)本發(fā)明的實(shí)施例和方法進(jìn)行描述,其中:
[0045]圖1示出了技術(shù)圖,其示出了根據(jù)本發(fā)明的過(guò)濾組件的分解圖。
[0046]圖2示出了收集室(左)和過(guò)濾單元(右)的透視圖。
[0047]圖3示出了本發(fā)明的組合裝置的側(cè)視圖。
[0048]圖4示出了根據(jù)本發(fā)明的替代儲(chǔ)存單元和其組件。
[0049]圖5示出了 HRAS外顯子2的變性梯度凝膠電泳(DGGE)分析。人細(xì)胞系T24對(duì)于G12V 突變是同型結(jié)合的。
[0050]圖6示出了 BCL2啟動(dòng)子中的6個(gè)CpG位點(diǎn)的焦磷酸測(cè)序分析。A)已過(guò)濾的樣品,B)未 過(guò)濾的樣品。
[0051 ]圖7示出了來(lái)自pt. X(診斷為高等級(jí)Ta腫瘤)的尿液樣品中的BCL2啟動(dòng)子的熒光法 (MethyLight)分析。只有過(guò)濾器樣品才獲得陽(yáng)性信號(hào);A表示"過(guò)濾器",B表示"沉淀"。
[0052]圖8示出了 BCL2啟動(dòng)子的焦磷酸測(cè)序分析。A)來(lái)自pt.Y的已過(guò)濾的樣品,B)來(lái)自 pt.Y的沉淀。
[0053]圖9示出了通過(guò)使用裝置進(jìn)行過(guò)濾而從流體捕獲腫瘤細(xì)胞,該裝置安裝有8微米孔 徑的聚碳酸酯膜過(guò)濾器。一個(gè)實(shí)驗(yàn)的三重測(cè)量數(shù)據(jù)(分別對(duì)4%的總DNA進(jìn)行測(cè)量)表示為均 數(shù)± SD。條形上的百分?jǐn)?shù)表示相對(duì)于輸入細(xì)胞數(shù)量的回收細(xì)胞數(shù)量。
[0054]圖10示出了在正常淋巴細(xì)胞的背景中,基于過(guò)濾得到的膀胱癌細(xì)胞的富集。A) FGFR3 R248C-FAM探針熒光信號(hào)的微滴數(shù)字聚合酶鏈反應(yīng)(ddPCR)熒光幅度圖(上面)和 FGFR3 WT-HEX探針熒光信號(hào)(下面)的ddPCR熒光幅度圖。B)條形圖,示出了相對(duì)于輸入腫瘤 細(xì)胞數(shù)量的突變體和野生型(WT)FGFR分子的數(shù)量。FGFR分子的總數(shù)量是基于三個(gè)獨(dú)立的 ddPCR測(cè)試來(lái)計(jì)算的,三個(gè)獨(dú)立的ddPCR測(cè)試分別使用4%的總DNA作為樣板,并且表示為均 數(shù)± SD。條形上的百分?jǐn)?shù)表示相對(duì)于輸入細(xì)胞數(shù)量的回收細(xì)胞數(shù)量。
[0055] 圖11示出了在成對(duì)尿液樣品中腫瘤派生(tumor-derived)DNA的檢測(cè),通過(guò)裝置過(guò) 濾和沉積來(lái)制備上述尿液樣品。通過(guò)使用ddPCR,針對(duì)FGFR3突變,對(duì)來(lái)自過(guò)濾器和沉淀的等 摩爾量的DNA進(jìn)行測(cè)試。
【具體實(shí)施方式】
[0056]本發(fā)明的如下應(yīng)用以示例的方式提供,并且沒(méi)有限制作用。
[0057]
[0058]圖1示出了根據(jù)本發(fā)明的、組裝的生物流體過(guò)濾組件的部件分解圖。所組裝的裝置 及其使用在圖3中示出,同時(shí),圖2示出了通過(guò)連接以提供所組裝的裝置之前的收集室(左) 和由過(guò)濾器支撐平臺(tái)和廢液池組裝而成的過(guò)濾單元(右)。
[0059] 收集室1是頂部開(kāi)口的,以便便于提供樣品。收集室由不透水材料的圓柱形袋子3 制成,其長(zhǎng)度大約為100mm并且直徑大約為95mm,并且適合用于容置大約500mL的容量,以便 便于當(dāng)分析尿液樣品時(shí)提供樣品和最大量DNA。應(yīng)理解,其它尺寸和容量也可以適用于收集 尿液和其它生物流體樣品。例如,對(duì)于某些用途,用于容置20mL至250mL的容量的尺寸可能 是合適的。相應(yīng)地,在某些實(shí)施例中,收集室適合用于容置高達(dá)400mL、300mL、250mL、100mL、 50mL、或者直到20mL的容量。盡管對(duì)于尿液收集,較大容量可能是合適的,但對(duì)于例如唾液 的過(guò)濾,可優(yōu)選較小容量。
[0060] 圓柱形袋子容納在彈簧5內(nèi),彈簧向收集室的圓柱形袋子傳遞一定剛度。蓋子7位 于圓柱形袋子的密封端部處并且環(huán)形彈簧附接部分9位于圓柱形袋子的開(kāi)口端部處,環(huán)形 彈簧附接部分環(huán)繞圓柱形袋子的開(kāi)口端部,而實(shí)質(zhì)上沒(méi)有封閉開(kāi)口部分。彈簧5-端連接或 鄰接蓋子7并且另一端連接或鄰接環(huán)形附接部分9。蓋子7和環(huán)形彈簧附接部分9是剛性的并 且由塑料材料制成,盡管也可以使用其它適合的剛性材料,例如,諸如不銹鋼的金屬。蓋子7 是圓形的且無(wú)孔的,其直徑略大于圓柱形袋子的直徑。蓋子以如下方式成形:當(dāng)組裝時(shí),其 突出到圓柱形袋子的空間中,盡管也可以使用平面蓋子或者穿孔蓋子。彈簧(其由蓋子保 持)和環(huán)形彈簧附接部分的使用允許收集室在收集室的圓柱軸線的方向上收縮。也可以使 用其它有相同功能的合適構(gòu)件,例如,一系列圍繞圓柱形袋子的彈簧或者一系列伸縮桿。在 這些情況下,可以使用圓柱形之外的其它形狀的袋子。收集室具有鎖環(huán)附接件11,環(huán)形彈簧 附接部分9可以通過(guò)扣合作用而固定至鎖環(huán)附接件。也可以使用其它固定構(gòu)件,包括互補(bǔ)螺 紋和可旋轉(zhuǎn)的接合凸耳。
[0061] 收集室可經(jīng)由鎖環(huán)附接件11連接至過(guò)濾單元13,從而組裝完整的過(guò)濾裝置。該連 接需要基本上不透水,以便允許在使用如本文描述的裝置時(shí),在過(guò)濾之前不會(huì)損失流體,通 過(guò)使用保持在過(guò)濾單元頂部周?chē)沫h(huán)形槽中的〇形環(huán)14來(lái)改進(jìn)密封性。過(guò)濾單元13具有過(guò) 濾器支撐平臺(tái)15。位于過(guò)濾器支撐平臺(tái)15上的小突起與環(huán)形附接部分9中的互補(bǔ)凹痕接合。 應(yīng)理解,可替代地,可以提供其它附接構(gòu)件。
[0062] 過(guò)濾器支撐平臺(tái)15具有可移除的濾筒17,可移除的濾筒具有膜過(guò)濾器19,并且過(guò) 濾器支撐平臺(tái)可連接至廢液池21。應(yīng)理解,也可以使用如本文描述的其它過(guò)濾材料。廢液池 21是由塑料材料制成的剛性圓柱形容器,能夠容置至少500mL的容量(即,在過(guò)濾之前容納 在收集室中的液體的總?cè)萘浚?。可以使用其它適合用于接收流體的合適的剛性材料來(lái)代替 塑料材料。廢液池21和過(guò)濾器支撐平臺(tái)15可連接為與濾筒17-起形成過(guò)濾單元13。該連接 需要基本上不透水,以便允許在使用如本文描述的裝置時(shí),在過(guò)濾期間不會(huì)損失流體。在該 實(shí)施例中,廢液池21和過(guò)濾器支撐平臺(tái)15可通過(guò)如下方式連接:通過(guò)廢液池21外部上的突 起與過(guò)濾器支撐平臺(tái)15內(nèi)部上的環(huán)形槽之間的扣合連接。在某些實(shí)施例中,廢液池21包含 吸濕材料和/或除臭劑。適合的吸濕材料可包括吸收性材料,諸如紙張、原棉或海綿、或者硅 膠和/或本領(lǐng)域中已知的其它吸水聚合物。包含吸濕材料改善了在使用之后對(duì)廢液池的處 理。適合的除臭劑可包括諸如碳酸鉀的碳酸鹽。
[0063] 圖1所示的分解圖示出了過(guò)濾器支撐平臺(tái)15的組成部件。一般來(lái)說(shuō),過(guò)濾器支撐平 臺(tái)可連接至收集室的開(kāi)口端部和廢液池,并且當(dāng)裝置完全組裝時(shí),使收集室和廢液池隔開(kāi)。 過(guò)濾器支撐平臺(tái)具有開(kāi)口23,以允許收集室與廢液池和過(guò)濾器支撐部分的過(guò)濾器19流體連 通,在這種情況下,濾筒17封閉該開(kāi)口,從而使任何從收集室流到廢液池的流體均通過(guò)過(guò)濾 器。過(guò)濾器支撐平臺(tái)具有槽形凹部25,該槽形凹部適用于接收濾筒17,從而使濾筒的過(guò)濾器 如所描述的那樣封閉開(kāi)口。濾筒可以以滑動(dòng)移動(dòng)方式插入槽形凹部中以及從槽形凹部中移 除。
[0064] 如在圖1中示出的,過(guò)濾器支撐平臺(tái)由頂部部分27和底部部分29組裝,頂部部分和 底部部分通過(guò)頂部部分上的突起和底部部分上的互補(bǔ)凹槽之間的扣合連接而夾在一起。也 可以設(shè)想其它連接方式,包括其它扣合作用和互補(bǔ)螺紋。圖1中示出的實(shí)施例具有兩個(gè)手柄 31和32,以便于使用。應(yīng)理解,手柄不是必須的,并且也可以使用其它手柄布置,例如,單個(gè) 手柄、連續(xù)環(huán)形手柄、或者一個(gè)或多個(gè)D形手柄。
[0065]當(dāng)緊固在一起時(shí),頂部部分27和底部部分29限定出凹槽25,凹槽25適用于接收所 描述的濾筒17。提供0形環(huán)33以防止使用期間的泄漏。過(guò)濾器支撐平臺(tái)進(jìn)一步包括回流膜35 和泄壓閥37。泄壓閥配置為在特定壓力下致動(dòng),以便當(dāng)過(guò)濾器飽和時(shí)允許液體穿過(guò)到廢液 池中?;亓髂?5適用于:在間歇性地施加壓力期間,允許空氣從廢液池21穿過(guò)到收集室1中, 間歇性地施加壓力是為了防止過(guò)濾內(nèi)容由于湍流而變得混亂。在29中還具有小孔(未示 出),該小孔允許空氣完全從該單元排出。在該實(shí)施例中,泄壓閥是傘型閥,其在10-12kg壓 力下打開(kāi),但也可以使用其它合適的閥門(mén)。
[0066]濾筒17具有主體,主體的寬度與凹槽的寬度互補(bǔ),并且其長(zhǎng)度足夠長(zhǎng)以便使得主 體的一部分在使用期間從槽形凹部上突出(如圖2所示),從而便于從裝置上移除濾筒。濾筒 殼體可具有一個(gè)或多個(gè)缺口或者孔眼41,以改善夾固性并且有助于移除。過(guò)濾器19容置于 濾筒殼體中的開(kāi)口內(nèi)的壁架(ledge)上并且由穿孔的上部支撐