本發(fā)明涉及從單克隆抗體中分離制備N-連接糖肽組分的提取分離制備,具體的說是從單克隆抗體中酶解分離制備得到有9個(gè)氨基酸肽段的N-連接糖肽組分,該組分中的聚糖為5-15個(gè)甘露糖、半乳糖、N-乙酰葡萄糖胺、巖藻糖或唾液酸組成,分子量在2000-4000。
背景技術(shù):
蛋白質(zhì)糖基化是一種重要的蛋白質(zhì)翻譯后修飾,在真核生物,尤其是哺乳動(dòng)物中約有一半以上的蛋白質(zhì)是被糖基化的,膜蛋白則幾乎100%是以糖基化的形式而存在(Apweiler R,Hermjakob H,Sharon N,On the frequency of protein glycosylation,as deduced from analysis of the SWISS-PROT database.Biochim Biophys Acta-Gen Subj,1999,1473,4-8)。糖基化對蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能有著重要影響,如蛋白質(zhì)的折疊、運(yùn)輸以及定位等。糖蛋白的糖鏈在細(xì)胞間的識別、黏附、通信聯(lián)絡(luò)以及免疫應(yīng)答等方面均起著重要作用,除此之外,蛋白質(zhì)糖基化的異常與腫瘤、發(fā)育、免疫異常以及感染等疾病的發(fā)生發(fā)展和診斷治療也有密切關(guān)系。目前,已知腫瘤、類風(fēng)濕等疾病會(huì)引起糖鏈結(jié)構(gòu)的異常改變,因此,糖鏈被認(rèn)為是一種潛在的疾病標(biāo)志物和新疫苗的靶點(diǎn)(Ohtsubo K,Marth JD,Glycosylation in cellular mechanisms of health and disease.Cell 2006,126,855-867;Kim EH,Misek DE,Glycoproteomics based identification of cancer biomarkers.International journal of Proteomics,2011,2011,1-10)。由于糖肽僅占所有酶解后肽段的小部分(2-5%),其質(zhì)譜響應(yīng)很容易被高豐度非糖肽抑制。同時(shí),由于糖鏈的微觀不均一性,一個(gè)糖基化位點(diǎn)上的糖鏈類型可能多達(dá)幾十種,進(jìn)一步降低了糖鏈的相對量而使得它們很難被檢測到,這些使得糖蛋白糖肽的分離制備變得異常艱難。盡管糖鏈不容易得到,但是去除了蛋白質(zhì)中非糖肽、磷酸化肽及其它肽段的影響,在高純度糖肽基礎(chǔ)上,研究糖鏈的結(jié)構(gòu)信息,發(fā)現(xiàn)一些潛在的診斷標(biāo)志物和治療靶點(diǎn)將會(huì)變得更加簡便、直接,更容易獲得準(zhǔn)確的結(jié)果,因此對于糖肽的分離制備,迫切需求一種高效、高通量的分離制備方法。為了得到結(jié)構(gòu)單一的糖肽標(biāo)準(zhǔn)品,將糖肽混合物從酶解液中富集分離出來是首要步驟。
二維液相色譜技術(shù)是一門新興技術(shù),是用兩根性質(zhì)相同或不同的色譜柱對復(fù)雜樣品進(jìn)行分離。作為一種分析復(fù)雜樣品的理想工具,它已被廣泛應(yīng)用于醫(yī)藥衛(wèi)生、食品科學(xué)、環(huán)境和農(nóng)業(yè)科學(xué)等各個(gè)領(lǐng)域。 近年來,隨著二維液相色譜理論及應(yīng)用的發(fā)展,二維制備液相色譜也逐漸發(fā)展起來。與單維制備液相色譜相比,二維制備液相色譜不但具有更高的峰容量,而且兩維具有不同的選擇性。
酶法釋放糖蛋白糖鏈因方法簡單、條件溫和、能夠提供有關(guān)糖鏈殘基組成、排列順序和糖苷鍵的構(gòu)型等信息,目前應(yīng)用較廣,其中胰蛋白酶(Trypsin)應(yīng)用更為廣泛。到目前為止,雖然對血清中免疫球蛋白、單克隆抗體的Trypsin酶解糖鏈釋放、結(jié)構(gòu)表征的研究很多,但大多數(shù)研究仍集中在用質(zhì)譜方法檢測酶解液中的糖肽。同時(shí),隨著對糖肽結(jié)構(gòu)的不斷認(rèn)識,對其功能的研究越來越引起人們的興趣,這使得對于糖肽樣品的獲取迫在眉睫。然而,到目前為止,從單克隆抗體酶解液中將糖肽富集分離出來,并通過二維液相色譜分離制備得到純度較高的糖肽組分,還未見報(bào)道。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:
為了深入研究糖蛋白、糖肽的結(jié)構(gòu)及功能,糖肽樣品的獲取是最基礎(chǔ)也是最重要的。但是,從蛋白質(zhì)中去除占有量為95%-98%的非糖肽,從而獲得糖肽樣品是非常困難的。到目前為止,未見采用色譜方法從單克隆抗體酶解液中將糖肽富集分離出來的報(bào)導(dǎo)。本發(fā)明提供了一種利用二維色譜分離技術(shù),從單克隆抗體中制備N-連接糖肽組分的高效分離制備方法。
為實(shí)現(xiàn)上述目的,本發(fā)明采用的技術(shù)方案為:
1)蛋白變性:單克隆抗體樣品中加入尿素的緩沖溶液進(jìn)行反應(yīng),反應(yīng)產(chǎn)物中加入二硫蘇糖醇進(jìn)行反應(yīng),產(chǎn)物中加入碘代乙酸,避光反應(yīng)得到變性蛋白溶液;
2)酶解:向步驟(1)得到的變性蛋白溶液中加入酶,進(jìn)行酶解反應(yīng)得到酶解反應(yīng)產(chǎn)物;
3)對步驟(2)得到的酶解反應(yīng)產(chǎn)物進(jìn)行二維液相色譜分離制備,收集的組分干燥后即為N-連接糖肽組分。
步驟(1)中單克隆抗體樣品在尿素的緩沖溶液中進(jìn)行反應(yīng)的條件為20-30℃溫育,緩沖溶液pH值為7-9,反應(yīng)時(shí)間為1-5小時(shí);加入二硫蘇糖醇后反應(yīng)條件為35-40℃溫育,反應(yīng)時(shí)間為1-5小時(shí);加入碘代乙酸后的反應(yīng)條件為避光20-30℃溫育,反應(yīng)時(shí)間為10-60分鐘。
步驟(1)緩沖溶液中尿素的濃度為4-10M;所使用的緩沖溶液為碳酸氫銨緩沖溶液,濃度為30-80mM;緩沖溶液中加入的單克隆抗體與尿素的質(zhì)量比為1:1-1:40。
所述二硫蘇糖醇,加入后其在體系中的終濃度為30-100mM,初始單克隆抗體質(zhì)量與二硫蘇糖醇的質(zhì)量比為14:1-140:1;
所述碘代乙酸,加入后其在體系中的終濃度為30-100mM,初 始單克隆抗體質(zhì)量與碘代乙酸的質(zhì)量比為18:1-180:1。
步驟(2)酶解反應(yīng)之前,變性蛋白溶液用碳酸氫銨緩沖溶液稀釋5-10倍后再加入酶,上述碳酸氫銨緩沖溶液,濃度為30-80mM;酶解反應(yīng)pH值為7-9,溫度為35-40℃,反應(yīng)時(shí)間為10-24小時(shí);酶解后得到的酶解液在沸水中煮5-10分鐘使酶失活得到酶解反應(yīng)產(chǎn)物。
在步驟(2)中所述酶是胰蛋白酶;酶和初始單克隆抗體的質(zhì)量比為1:10-1:50。
步驟(3)以硅膠為基質(zhì)的鍵合材料為色譜柱填料,Unitary C18或XAqua(華譜新創(chuàng)有限公司)為一維反相填料,XAmide或XIon(華譜新創(chuàng)有限公司)為二維親水填料。
步驟(3)所述的二維液相色譜分離制備中一維制備采用的硅膠基質(zhì)鍵合材料的粒度為2-20微米,一維液相色譜制備采用的流動(dòng)相為甲醇或乙腈中的一種或二種與水混合,其中甲醇或乙腈為有機(jī)相,不含或含有0.1v%甲酸,水相中不含或含有0.1v%甲酸;洗脫條件按照有機(jī)相體積分?jǐn)?shù)5-30%等度或5-50分鐘有機(jī)相體積分?jǐn)?shù)由5%提高到40%梯度進(jìn)行;柱溫為25-40℃,洗脫液總流速為0.2-1.0mL/min,收集保留時(shí)間為10-30min的組分;二維制備采用的硅膠基質(zhì)鍵合材料的粒度為2-20微米,采用的流動(dòng)相為乙腈作為有機(jī)相與水作為水相混合,洗脫條件按水相體積分?jǐn)?shù)10-50%等度或經(jīng)5-30分鐘水相體積分?jǐn)?shù)由10-15%提高到30-60%梯度進(jìn)行,柱溫為25-40℃,洗脫液總流速為0.2-1.0mL/min,收集保留時(shí)間為10-30的組分。
所述一維制備,最佳流動(dòng)相為含有或不含有0.1v%甲酸的乙腈與含有或不含有0.1v%甲酸的水混合,采用等度方式,乙腈體積比例為8%-15%;二維制備最佳流動(dòng)相為含有或不含有0.1v%甲酸的乙腈與含有或不含有0.1v%甲酸的水混合,采用梯度條件,含有或不含有0.1v%甲酸的水體積濃度為15%,保持5分鐘,再經(jīng)15-20分鐘增加到35%-45%。
按照上述方法制備的N-連接糖肽其主要成分是9個(gè)氨基酸肽段的N-連接糖肽組分,其肽段序列為EEQYNSTYRN,N-連接聚糖是以兩個(gè)N-乙酰葡萄糖胺和3個(gè)甘露糖組成的五糖核心基礎(chǔ)上,再連接總數(shù)為0-10個(gè)的甘露糖、半乳糖、N-乙酰葡萄糖胺、巖藻糖或唾液酸中的一種或二種以上,N-連接糖肽分子量為2000-4000。
本發(fā)明的優(yōu)點(diǎn)
1.采用二維液相色譜分離技術(shù),通過選用合適的色譜柱和色譜分離制備條件,去除了雜質(zhì)蛋白、多肽、非糖肽,從單克隆抗體中得到了N-連接糖肽組分。
2.得到的N-連接糖肽組分純度高,可以達(dá)到80%以上。
3.本發(fā)明所涉及的從單克隆抗體中制備高純度N-連接糖肽的方法,儀器自動(dòng)化程度高,操作方便、簡單,常溫常壓下就可進(jìn)行,適合大規(guī)模制備的需要。
具體實(shí)施方式
下面結(jié)合實(shí)例,對本發(fā)明做進(jìn)一步說明。實(shí)例僅限于說明本發(fā)明,而非對本發(fā)明的限定。
實(shí)施例1:
稱取單克隆抗體蛋白(Sigma-Aldrich,貨號527858)1mg,加入167μL的4M尿素的30mM碳酸氫銨緩沖溶液中,20℃溫育1小時(shí),緩沖溶液的pH為7。變性后的單克隆抗體蛋白加入15μL的30mM二硫蘇糖醇水溶液,35℃溫育1小時(shí),還原變性后單克隆抗體蛋白的二硫鍵,然后加入10μL的30mM的碘代乙酸水溶液,避光條件下30℃溫育10分鐘,將還原后的二硫鍵進(jìn)行烷基化。
將變性后的單克隆抗體蛋白加入960μL濃度為0.1M的碳酸氫銨緩沖溶液;加入0.1mg的Trypsin,酶解緩沖溶液的pH值為7,酶解反應(yīng)溫度為35℃,酶解時(shí)間為10小時(shí),酶解之后,酶解液在沸水中煮5分鐘使酶失活。LabConco離心濃縮儀上將酶解液離心濃縮3倍(程序溫度15℃),得到酶解濃縮液。用粒徑2微米的Unitary(華譜新創(chuàng)有限公司)填料裝柱,柱徑3mm,柱長250mm,流動(dòng)相選擇乙腈為有機(jī)相,水為水相,采用5%有機(jī)相等度洗脫,柱溫25℃,流動(dòng)相流速為0.2mL/min,280nm紫外檢測,收集20-30分鐘的洗脫組分,按上述離心濃縮條件離心濃縮5倍,得到一維組分。用粒徑2微米的XAmide(華譜新創(chuàng)有限公司)填料裝柱,柱徑3mm,柱長150mm作為二維分離色譜柱,流動(dòng)相采用乙腈(含0.1v%甲酸)為有機(jī)相,水(含0.1%v甲酸)為水相,采用10%水相等度洗脫,柱溫35℃,流動(dòng)相流速為0.2mL/min,280nm紫外檢測,收集20-30分鐘洗脫組分,按上述離心濃縮條件離心濃縮至干,即為含9個(gè)氨基酸的N-連接糖肽組分,經(jīng)質(zhì)譜分析鑒定,糖肽個(gè)數(shù)為6條,純度85%。實(shí)施例2:
稱取單克隆抗體(Sigma-Aldrich,貨號527858)10mg,加入100μL的8M尿素的50mM碳酸氫銨緩沖溶液中,30℃溫育5小時(shí),緩沖溶液的pH為9。變性后的單克隆抗體加入15μL的30mM二硫蘇糖醇水溶液,40℃溫育5小時(shí),還原變性后單克隆抗體的二硫鍵,然后加入6μL的50mM的碘代乙酸水溶液,避光條件下20℃溫育60分鐘,將還原后的二硫鍵進(jìn)行烷基化。
將變性后的單克隆抗體加入1210μL的碳酸氫銨緩沖溶液,濃度為0.5M,加入0.2mg的Trypsin,酶解緩沖溶液的pH值為9,酶解 反應(yīng)溫度為40℃,酶解時(shí)間為24小時(shí),酶解之后,酶解液在沸水中煮10分鐘使酶失活。LabConco離心濃縮儀上將酶解液離心濃縮5倍(程序溫度15℃),得到酶解濃縮液。
用粒徑20微米的XAqua(華譜新創(chuàng)有限公司)填料裝柱,柱徑4.6mm,柱長150mm,流動(dòng)相選擇甲醇(含0.1%v甲酸)為有機(jī)相,水(含0.1%v甲酸)為水相,采用梯度洗脫方式:有機(jī)相體積濃度由5%經(jīng)50分鐘提高到40%,柱溫40℃,流動(dòng)相流速為1.0mL/min,280nm紫外檢測,收集15-20分鐘的洗脫組分,按上述離心濃縮條件離心濃縮5倍,得到一維組分。用粒徑20微米的XAmide(華譜新創(chuàng)有限公司)填料裝柱,柱徑4.6mm,柱長150mm作為二維分離色譜柱,流動(dòng)相選擇乙腈(含0.1%v甲酸)為有機(jī)相,水(含0.1%v甲酸)為水相,采用50%有機(jī)相等度洗脫,柱溫40℃,流動(dòng)相流速為0.7mL/min,280nm紫外檢測,收集10-15分鐘洗脫組分,按上述離心濃縮條件離心濃縮至干,即為含9個(gè)氨基酸的N-連接糖肽組分,經(jīng)質(zhì)譜分析鑒定,糖肽個(gè)數(shù)為6條,純度70%。
實(shí)施例3:
稱取單克隆抗體(Sigma-Aldrich,貨號527858)30mg,加入100μL的10M尿素的50mM碳酸氫銨緩沖溶液中,25℃溫育2小時(shí),緩沖溶液的pH為7。變性后的單克隆抗體加入10μL的100mM二硫蘇糖醇水溶液,37℃溫育5小時(shí),還原變性后單克隆抗體的二硫鍵,然后加入25μL的100mM的碘代乙酸水溶液,避光條件下30℃溫育20分鐘,將還原后的二硫鍵進(jìn)行烷基化。
將變性后的單克隆抗體加入1500μL的碳酸氫銨緩沖溶液,濃度為5M,加入1mg的Trypsin,酶解緩沖溶液的pH值為8,酶解反應(yīng)溫度為37℃,酶解時(shí)間為24小時(shí),酶解之后,酶解液在沸水中煮5分鐘使酶失活。LabConco離心濃縮儀上將酶解液離心濃縮7倍(程序溫度15℃),得到酶解濃縮液。
用粒徑5微米的XAqua(華譜新創(chuàng)有限公司)填料裝柱,柱徑4.6mm,柱長250mm,流動(dòng)相選擇乙腈為有機(jī)相,水為水相,采用30%有機(jī)相等度洗脫,柱溫25℃,流動(dòng)相流速為0.8mL/min,280nm紫外檢測,收集10-15分鐘的洗脫組分,按上述離心濃縮條件離心濃縮5倍,得到一維組分。用粒徑5微米的XIon(華譜新創(chuàng)有限公司)填料裝柱,柱徑4.6mm,柱長250mm作為二維分離色譜柱,流動(dòng)相選擇乙腈為有機(jī)相,水為水相,采用梯度洗脫方式:水相濃度由10%經(jīng)30分鐘提高到60%,柱溫30℃,流動(dòng)相流速為1.0mL/min,280nm紫外檢測,收集15-20分鐘洗脫組分,按上述離心濃縮條件離心濃縮至干,即含9個(gè)氨基酸的N-連接糖肽組分,經(jīng)質(zhì)譜分析鑒定,糖肽個(gè)數(shù)為10條,純度90%。
實(shí)施例4:
稱取單克隆抗體(Sigma-Aldrich,貨號527858)10mg,加入200μL的8M尿素的50mM碳酸氫銨緩沖溶液中,25℃溫育2小時(shí),緩沖溶液的pH為8。變性后的單克隆抗體加入40μL的400mM二硫蘇糖醇50mM碳酸氫銨緩沖溶液,35℃溫育1小時(shí),還原變性后單克隆抗體的二硫鍵,然后加入10μL的100mM的碘代乙酸50mM碳酸氫銨緩沖溶液,避光條件下25℃溫浴10分鐘,將還原后的二硫鍵進(jìn)行烷基化。
將變性后的單克隆抗體加入9000μL的碳酸氫銨緩沖溶液,濃度為0.05M,加入0.25mg的Trypsin,酶解緩沖溶液的pH值為8,酶解反應(yīng)溫度為37℃,酶解時(shí)間為20小時(shí),酶解之后,酶解液在沸水中煮5分鐘使酶失活。LabConco離心濃縮儀上將酶解液離心濃縮10倍(程序溫度15℃),得到酶解濃縮液。
用粒徑5微米的Unitary(華譜新創(chuàng)有限公司)填料裝柱,柱徑3.0mm,柱長150mm,流動(dòng)相選擇乙腈(含0.1%v甲酸)為有機(jī)相,水(含0.1%v甲酸)為水相,采用10%有機(jī)相等度洗脫,柱溫30℃,流動(dòng)相流速為0.4mL/min,280nm紫外檢測,收集12-15分鐘的洗脫組分,按上述離心濃縮條件離心濃縮5倍,得到一維組分。用粒徑3微米的Xion(華譜新創(chuàng)有限公司)填料裝柱,柱徑2.1mm,柱長150mm作為二維分離色譜柱,流動(dòng)相選擇乙腈(含0.1%v甲酸)為有機(jī)相,水(含0.1%v甲酸)為水相,采用梯度洗脫方式:水相濃度由15%經(jīng)30分鐘提高到40%,柱溫30℃,流動(dòng)相流速為0.2mL/min,280nm紫外檢測,收集17-24分鐘洗脫組分,按上述離心濃縮條件離心濃縮至干,即含9個(gè)氨基酸的N-連接糖肽組分,經(jīng)質(zhì)譜分析鑒定,糖肽個(gè)數(shù)為8條,純度95%。