本申請涉及微藻工業(yè)應(yīng)用領(lǐng)域,具體而言,涉及高產(chǎn)蝦青素的雨生血球藻(haematococcuspluvialis)突變株及其應(yīng)用。
發(fā)明背景
血球藻是一種單細(xì)胞的淡水綠藻,隸屬于綠藻門(chlorophata),綠藻綱(chlorophyeeae),團藻目(volvoeales),血球藻科(haematoeoeeaceae),血球藻屬(haematocoeeus)。血球藻是少數(shù)能夠在人工光生物反應(yīng)器中進行大規(guī)模培養(yǎng)的微藻之一。其中雨生血球藻(haematococcuspluvialis),又稱雨生紅球藻,已經(jīng)成功用于商業(yè)規(guī)模的蝦青素生產(chǎn)。
蝦青素已經(jīng)被證實可以提高機體免疫力,防止紫外線(uv-a)對細(xì)胞的損傷,抑制癌細(xì)胞生長,延滯衰老過程,預(yù)防心血管疾病,因此具有巨大的醫(yī)療應(yīng)用前景(hand,liy,huq.astaxanthininmicroalgae:pathways,functionsandbiotechnologicalimplications.algae,2013,28:131-147)。另外,蝦青素也是大馬哈魚(salmon)的色素主要成份。對于人工養(yǎng)殖的大馬哈魚等,需要在飼料中添加蝦青素以保證魚肉的鮮紅色澤。隨著這類經(jīng)濟水產(chǎn)動物養(yǎng)殖業(yè)的迅速發(fā)展,市場對蝦青素的需求量也迅速增長。2013年,蝦青素作為魚飼料添加劑的銷售額已達五億美元。
本領(lǐng)域需要高產(chǎn)蝦青素的雨生血球藻。
發(fā)明簡述
本發(fā)明人以雨生血球藻flotownies144為出發(fā)藻種,對其進行化學(xué)誘變,隨后利用本發(fā)明所建立的創(chuàng)造性的高通量篩選方法進行篩選,獲得了蝦青素含量顯著提高的雨生血球藻突變株。
在一方面,本發(fā)明提供了一種高通量篩選高產(chǎn)蝦青素的微藻突變株的方法,所述方法包括:
a)對微藻的野生株或起始株進行誘變處理;
b)在多孔板中培養(yǎng)經(jīng)誘變處理的野生株或起始株的單克隆藻株;
c)獲取經(jīng)培養(yǎng)的各單克隆藻株的圖像;
d)用圖像分析軟件對各單克隆藻株的顏色進行分析,獲得r、g、b值;
e)根據(jù)下式計算出各單克隆藻株的redindex值:
f)將redindex值高于野生株或起始株的單克隆藻株鑒定為高產(chǎn)蝦青素的突變株。
在另一方面,本發(fā)明提供了通過本發(fā)明的方法篩選得到的高產(chǎn)蝦青素的雨生血球藻突變株。所述高產(chǎn)蝦青素的雨生血球藻(haematococcuspluvialis)包括于2015年12月4日保藏于中國微生物菌種保藏管理委員會普通微生物中心(cgmcc,地址為:北京市朝陽區(qū)北辰西路1號院3號中國科學(xué)院微生物研究所)保藏號為cgmccno.11806的c86,保藏號為cgmccno.11807的d154。
在另一方面,還提供了本發(fā)明的雨生血球藻突變株在制備蝦青素中的應(yīng)用。
在另一方面,還提供了一種組合物,其包含本發(fā)明的雨生血球藻突變株的細(xì)胞和/或本發(fā)明的雨生血球藻突變株的提取物。
附圖簡述
圖1.示出用不同濃度ems處理后雨生血球藻flotownies144的存活百分比。
圖2.示出初篩得到的76個突變株的熱圖及rindex值。
圖3.示出野生型和突變株c86、d154在高光脅迫培養(yǎng)不同天數(shù)的形態(tài)學(xué)變化。
圖4.示出野生型和突變株c86、d154在低光條件(第0-4天)和高光脅迫下(第5-8天)的生長曲線。
圖5.示出野生型和突變株c86、d154在高光脅迫培養(yǎng)4天后的蝦青素含量(第8天,mg/mg干重)。
圖6.示出野生型和突變株c86、d154在高光脅迫培養(yǎng)不同天數(shù)的蝦青素產(chǎn)率(mg/l藻液/天)。
發(fā)明詳述
已有通過誘變并篩選高產(chǎn)蝦青素血球藻突變株的報道。然而這些報道是基于類胡蘿卜素生物合成抑制劑(cn101173214a)或顯微觀察(wo2006107736a1)的篩選方法,前者只能篩選出單一代謝途徑的突變株,而且必須在選擇壓力下進行,后者依靠人工篩選,效率不高。
在本發(fā)明中,本發(fā)明人建立了一種高通量篩選高產(chǎn)蝦青素微藻的方法,所述方法能夠在全基因組水平上篩選由誘變造成的突變,進行無選擇壓力下的性狀篩選,并不限于具體的代謝途徑。
因此,在第一方面,本發(fā)明提供了一種高通量篩選高產(chǎn)蝦青素的微藻突變株的方法,所述方法包括:
a)對微藻的野生株或起始株進行誘變處理;
b)在多孔板中培養(yǎng)經(jīng)誘變處理的野生株或起始株的單克隆藻株;
c)獲取經(jīng)培養(yǎng)的各單克隆藻株的圖像;
d)用圖像分析軟件對各單克隆藻株的顏色進行分析,獲得r、g、b值;
e)根據(jù)下式計算出各單克隆藻株的redindex值:
f)將redindex值高于野生株或起始株的單克隆藻株鑒定為高產(chǎn)蝦青素的突變株。
在一個實施方式中,所述微藻是雨生血球藻。在一具體實施方式中,所述雨生血球藻是flotownies144藻株。
雨生血球藻flotownies144是一株廣泛應(yīng)用于基礎(chǔ)、應(yīng)用研究的雨生血球藻株系。flotownies144的特征是在低光、營養(yǎng)充足的條件下,群體中以綠色的游泳細(xì)胞為主,當(dāng)細(xì)胞暴露于強光或營養(yǎng)缺陷條件進行環(huán)境脅迫誘導(dǎo)時,游泳細(xì)胞開始積累蝦青素,形成紅色的游泳細(xì)胞。然而,nies144本身色素含量不高,每單位細(xì)胞干重的蝦青素含量較低,限制了該藻株在生產(chǎn)中的應(yīng)用。在一具體的實施方式中,通過利用本發(fā)明的高通量篩選方法,本發(fā)明人以雨生血球藻flotownies144為出發(fā)藻株,篩選到高產(chǎn)蝦青素的突變株。
在一些實施方式中,所述方法步驟a)中所述誘變是化學(xué)誘變?nèi)鏴ms誘變,或是輻射誘變?nèi)缱贤饩€誘變。本領(lǐng)域技術(shù)人員將理解,其他的誘變方法也可應(yīng)用于本發(fā)明。例如使用mnng、ntg誘變劑進行誘變,或者可以使用根瘤農(nóng)桿菌或基因槍轟擊方法獲得經(jīng)誘變的群體?;蛘?,也可以使用不同誘變方法的組合。
本發(fā)明中,經(jīng)誘變的微藻可以使用自動化高通量挑選儀器例如qpix450(moleculardevice,usa)挑選單克隆藻株。單克隆藻株可以在多孔板中培養(yǎng)。例如,可以在96孔板或384孔板或q-tray板中進行所述單克隆藻株的培養(yǎng)。所述培養(yǎng)可以在液體培養(yǎng)基中或固體培養(yǎng)基上進行,優(yōu)選在固體培養(yǎng)基上進行。
在一些實施方式中,所述方法步驟b)中所述培養(yǎng)包括將所述單克隆藻株置于脅迫條件下培養(yǎng)以誘導(dǎo)蝦青素的積累。能夠誘導(dǎo)蝦青素積累的脅迫條件包括例如高光照、高鹽、高溫或營養(yǎng)缺乏。
在一具體實施方式中,使用高光照脅迫條件誘導(dǎo)藻株的蝦青素積累。所述高光照脅迫條件例如是100-200μmolm-2s-1,優(yōu)選150μmolm-2s-1的光照強度。
在一些實施方式中,在非脅迫條件下培養(yǎng)所述菌株一段時間,例如0、1、2、3、4、5天后,使得藻株充分生長后再進行脅迫培養(yǎng)。所述非脅迫條件例如是5、10、15、20、25μmolm-2s-1的光照強度。所述脅迫培養(yǎng)進行例如1、2、3、4、5、6、7、8、9、10天。
在一些實施方式中,單克隆藻株的圖像使用例如chemidoctmmp成像系統(tǒng)(biorad,usa)獲得。本領(lǐng)域技術(shù)人員將理解,可以使用任何能夠獲得電子圖像如熱圖的系統(tǒng)。對圖像進行顏色分析獲得r、g、b值的軟件也是本領(lǐng)域可獲得的,例如getrgb軟件。通過圖像顏色分析使得可以容易地進行高通量篩選。
在一些實施方式中,本發(fā)明的所述方法還包括,
g)確定所述突變株的蝦青素含量。
測定蝦青素的方法是本領(lǐng)域已知的,例如通過hplc進行所述測定。蝦青素含量高于野生株或起始株的突變株最終確定為高產(chǎn)蝦青素突變株。
在另一方面,本發(fā)明提供了通過本發(fā)明上述方法獲得的高產(chǎn)蝦青素的雨生血球藻突變株。
在一些實施方式中,根據(jù)本發(fā)明的方法獲得的高產(chǎn)蝦青素的雨生血球藻突變株,其蝦青素含量相對于野生型提高50-100%。
在一些實施方式中,本發(fā)明的高產(chǎn)蝦青素的雨生血球藻突變株衍生自雨生血球藻flotownies144。
在具體的實施方式中,根據(jù)本發(fā)明的方法篩選到2個高產(chǎn)蝦青素雨生血球藻突變株,其中藻株c86以保藏號cgmccno.11806,d154以保藏號cgmccno.11807,于2015年12月4日保藏于中國微生物菌種保藏管理委員會普通微生物中心(cgmcc,地址為:北京市朝陽區(qū)北辰西路1號院3號中國科學(xué)院微生物研究所)。
在另一個方面,本發(fā)明還涵蓋本發(fā)明的雨生血球藻突變株在制備蝦青素中的應(yīng)用。
在另一個方面,本發(fā)明還涵蓋一種組合物,其包含本發(fā)明的雨生血球藻突變株的細(xì)胞和/或本發(fā)明的雨生血球藻突變株的提取物。在一些實施方式中,所述雨生血球藻突變株的提取物包含蝦青素。在一些實施方式中,所述組合物是藥物組合物、食品組合物、營養(yǎng)補充劑或飼料。
實施例
下面將通過實施例的方式進一步說明本發(fā)明,但并不因此將本發(fā)明限制在所描述的實施例范圍中。
實施例1.血球藻的化學(xué)誘變
雨生血球藻flotownies144(購自日本國立環(huán)境研究所)培養(yǎng)方法如下:將生長在固體basal培養(yǎng)基上的單克隆藻落挑入裝有10ml培養(yǎng)基的50ml三角瓶中培養(yǎng)10天,當(dāng)細(xì)胞數(shù)達到3×105/ml時,轉(zhuǎn)接至裝有100ml培養(yǎng)基的250ml三角瓶中,接種量為3×104/ml,待細(xì)胞數(shù)生長到3×105/ml時(大約3-4天)達到對數(shù)生長期,培養(yǎng)溫度為21℃,連續(xù)光照強度為15μmolm-2s-1。basal培養(yǎng)基配方為14.6mm醋酸鈉、2.7mml-天冬酰胺、2g/l酵母提取物、0.985mmmgcl2、0.135mmcacl2、0.036mmfeso4,ph6.8(kobayashi,m.,kakizono,t.&nagai,s.(1991).astaxanthinproductionbyagreenalga,haematococcuspluvialisaccompaniedwithmorphologicalchangesinacetatemedia.j.ferment.bioeng.,71:335–339)。
取一定量對數(shù)期的雨生血球藻flotownies144藻液,通過離心收集藻體,得到的藻細(xì)胞沉淀用不同濃度的甲磺酸乙酯(ems)溶液處理,ems濃度為:0.1%,0.2%,0.3%,0.4%,0.5%,0.6%,0.7%,0.8%,0.9%,1.0%,1.2%,1.4%,1.6%,1.8%,2.0%(w/v),處理時間為一個小時。ems溶液的配制需用0.2m的磷酸緩沖液進行逐級稀釋配制。反應(yīng)結(jié)束后加入10%na2s2o3終止反應(yīng),再用新鮮培養(yǎng)基將殘留的na2s2o3洗去。處理完成后,加入一定量的新鮮培養(yǎng)基避光培養(yǎng)24小時后涂布于固體培養(yǎng)基上,接種量為1×105/平板。待克隆長出計算每個ems濃度下藻細(xì)胞的萌發(fā)率。萌發(fā)率結(jié)果如圖1所示。通過以上結(jié)果得知在不同濃度ems處理下雨生紅球藻flotownies144的萌發(fā)率并沒有明顯規(guī)律,最終將ems濃度定為1%(w/v),處理時間為1小時。
實施例2.高產(chǎn)蝦青素突變株的篩選
2.1.基于rindex的高通量篩選
取一定量實施例1中用1%(w/v)ems處理1小時的雨生血球藻藻液涂布于固體培養(yǎng)基上,接種量為1×105/平板。待兩周后,將長出的單克隆用高通量挑選儀器qpix450(moleculardevice,usa)挑出到96孔板中,培養(yǎng)溫度為21℃,連續(xù)光照強度為15μmolm-2s-1。
將上述96孔板中長出的藻液點陣到裝有固體basal培養(yǎng)基的q-tray板上,點樣體積為2μl,放入培養(yǎng)溫度為21℃,連續(xù)光照強度為15μmolm-2s-1的培養(yǎng)架上培養(yǎng)兩天后,將光照強度調(diào)為150μmolm-2s-1,脅迫五天。通過chemidoctmmpimagingsystem(biorad,usa)得到每個藻落的熱圖;用getrgb軟件對每個藻落的顏色進行分析;根據(jù)下式計算出每個藻落的redindex值:
初步篩選出76個突變株。76個突變株熱圖及rindex值(如圖2所示)。
2.2.基于分光光度法的篩選
將以上的到的76株突變體以相同的細(xì)胞數(shù)接種于250ml三角瓶中進行培養(yǎng),先于低光條件下培養(yǎng)四天,培養(yǎng)溫度為21℃,連續(xù)光照強度為15μmolm-2s-1,再于光照強度為150μmolm-2s-1的高光條件下脅迫培養(yǎng)三天,從第四天起,每天通過分光光度計法測定其色素含量。
分光光度計法測色素:每天取樣1ml,離心收集后加入1mldmso混勻,靜置30min后離心收集上清。反復(fù)4-5次直至沉淀變?yōu)槿榘咨?,通過分光光度計測定上清在665nm、649nm以及480nm處的吸光度。
用以上得到的吸光度計算出每突變株的單細(xì)胞總類胡蘿卜素含量,計算方法為:ca=12.19a665-3.45a649,cb=21.99a649-5.32a665,cx+c=(1000a480-2.14ca-70.16cb)/220(μg/ml);單細(xì)胞總類胡蘿卜素含量為cx+c/細(xì)胞數(shù)(ca:葉綠素a;cb:葉綠素b;cx+c:總類胡蘿卜素)。以此方法篩選出2株單細(xì)胞色素含量明顯高于野生型的突變株:c86、d154。
所篩選到的雨生血球藻藻株c86以保藏號cgmccno.11806,d154以保藏號cgmccno.11807于2015年12月4日保藏于中國微生物菌種保藏管理委員會普通微生物中心(cgmcc,地址為:北京市朝陽區(qū)北辰西路1號院3號中國科學(xué)院微生物研究所)。
本發(fā)明的上述方法可用于高通量篩選高產(chǎn)蝦青素的微藻突變株。
實施例3.高產(chǎn)蝦青素突變株的培養(yǎng)及蝦青素含量測定
將實施例2得到的2個突變株以相同的細(xì)胞數(shù)接種于250ml三角瓶中進行培養(yǎng)。先于低光條件下培養(yǎng)4天,培養(yǎng)溫度為21℃,連續(xù)光照強度為15μmolm-2s-1,再于光照強度為150μmolm-2s-1的高光條件下脅迫培養(yǎng)4天。每天取10ml藻液進行真空膜過濾(glassmicrofibrefilter,696,vwr),再用相同體積的碳酸氫銨(0.5moll-1)溶液沖洗膜兩次。隨后把膜放入烘箱100℃烘干至恒重,濾膜的增量即為細(xì)胞干重。從第四天起每天觀察細(xì)胞形態(tài)。再將第4天、第6天及第8天的藻樣,通過hplc進行蝦青素含量測定。色素提取的具體方法如下:
1.取60ml藻液用磷酸緩沖液離心去鹽,收集細(xì)胞沉淀,用液氮速凍后放入冷凍干燥機中過夜干燥成藻粉。
2.稱取5mg上述得到的藻粉,在預(yù)冷的研缽中用液氮研磨,加入提取液甲醇:二氯甲烷(3:1)將研缽中的色素溶出,離心收集上清,反復(fù)數(shù)次直至沉淀變?yōu)槿榘咨?/p>
3.將上述得到的色素上清通過氮氣吹干后,復(fù)溶到相同體積的提取液中,用hplc進行蝦青素的測定。hplc測定條件如下:
alliancetm高效液相色譜儀,配光電二極管陣列檢測器(hplc-pda,waters公司)。色譜柱:symmetryc18(4.6mm×150mm,5μm)。流動相:a相為二氯甲烷:甲醇:乙腈:水(5:85:5.5:4.5,v/v),b相為二氯甲烷:甲醇:乙腈:水(25:28:42.5:4.5,v/v)。梯度洗脫程序:0.0-8.0min,0%b;8.0-14.0min,0%–100%b;14.0-28.0min,100%b;28.0-30.0min,100%-0b;30.0-35.0min,0%b。流速:1.0ml/min。進樣量:10μl。柱溫:35℃。檢測波長:250-700nm,以480nm為類胡蘿卜素的檢測波長。
兩個突變株c86、d154及野生型在第4、6和第8天的形態(tài)圖像見圖3。從圖中可見兩個突變體c86、d154在第6天(高光脅迫后的第2天)即全部轉(zhuǎn)化為紅色厚壁孢子(呈圓形),而野生型大多數(shù)細(xì)胞仍然為游動細(xì)胞。
兩個突變體c86、d154及野生型干重增長曲線見圖4。圖中可見突變體d154的生長速率與野生型基本相同。
兩個突變株c86、d154的蝦青素含量參見圖5,產(chǎn)率參見圖6。從圖中可見,本發(fā)明所獲得的2個雨生血球藻突變株的蝦青素含量顯著高于野生型。