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      基于糖類的生物標記物和治療劑的制作方法

      文檔序號:11528226閱讀:2334來源:國知局
      基于糖類的生物標記物和治療劑的制造方法與工藝
      相關申請的交叉引用本申請要求2014年8月22日提交的國際專利申請系列號pct/cn2014/085027的優(yōu)先權,其全部內容通過引用并入本文。本發(fā)明涉及與由癌細胞或炎癥細胞表達的n-乙酰基葡糖胺或n-乙?;?半乳糖胺特異性結合的抗體,以及與其相關的組合物、多核苷酸、載體、宿主細胞、生產方法、使用方法和試劑盒。
      背景技術
      :由于多種原因,癌癥是現(xiàn)代醫(yī)學中待治療的最具挑戰(zhàn)性的疾病之一。由于癌癥來自于人自身細胞的異常行為,因此很難在患者體內區(qū)分癌細胞與正常細胞。通常身體自身的免疫系統(tǒng)難以識別和消除癌細胞。此外,“癌癥”是指個體疾病的群集,即癌癥的類型和亞型。許多不同的細胞類型可以通過許多不同的機制變成癌癥,導致可能出現(xiàn)的癌細胞類型中極多的表型變體。這種多樣性對癌癥治療造成很大的問題,因為不同類型的癌細胞診斷可能具有不同的識別特性,或者可能具有不同的治療弱點或抗性特性。這一問題使得很難提出通過單一治療方案或試劑找到診斷、治療和/或預防多種類型的癌癥的方式。盡管腫瘤學在過去十年中發(fā)展迅速,仍然需要鑒定新的癌細胞特異性的生物標記物,特別是具有多種類型的癌癥的特征而不具有正常組織的特征的生物標記物。細胞表面分子對于癌細胞非常重要。這些分子在細胞之間的相互作用中起關鍵作用,這對于許多癌細胞行為,包括細胞侵襲、轉移、逃避免疫系統(tǒng)和對治療劑的響應是重要的。已知癌細胞表達與正常細胞不同的許多細胞表面蛋白。然而,許多細胞表面蛋白通過添加糖類(saccharides)(例如n-乙酰基葡糖胺或n-乙?;?半乳糖胺)來進行修飾,這一過程被稱為蛋白質糖基化。如何通過添加糖類修飾特定的細胞表面蛋白(哪些糖類可以在哪些細胞表面蛋白上被發(fā)現(xiàn)),以及在不同類型或階段的癌變中糖基化模式如何變化是剛開始探索的問題(綜述參見moremen,kw等(2012)nat.rev.mol.cellbiol.13(7):448-62)。糖基化的這種多樣性提高了通過表面生物標記物識別癌細胞的復雜性。因此,仍然需要用于診斷、治療和預防癌癥的新的生物標記物和治療劑,特別是用于靶向糖基化癌癥特異性模式的生物標記物和試劑。本文引用的所有參考文獻,包括專利申請文件、專利公開文件和uniprotkb/swiss-prot登錄號通過引用整體并入本文,如同具體和單獨指明每個單獨的參考文獻通過引用并入。技術實現(xiàn)要素:為了滿足對診斷、治療和預防多種類型的癌癥的新的生物標記物和治療劑的需求,本文公開了與癌細胞或炎癥細胞表達的n-乙?;咸前坊騨-乙酰基-半乳糖胺特異性結合的單克隆抗體,以及與其相關的組合物、多核苷酸、載體、宿主細胞、生產方法和試劑盒。進一步公開了通過給藥抗體來治療或預防個體中癌癥的方法,所述抗體與在癌細胞的細胞表面上表達的n-乙?;咸前坊騨-乙?;?半乳糖胺特異性結合,以及使用與n-乙?;咸前坊騨-乙?;?半乳糖胺特異性結合的抗體診斷癌癥的方法。這些組合物和方法部分基于以下預料不到的發(fā)現(xiàn),代表許多不同類型癌癥的人癌細胞比正常人組織表達更高水平的n-乙?;咸前泛?或n-乙酰基-半乳糖胺。此外,本發(fā)明證明了預料不到的結果,即與癌細胞的細胞表面上表達的n-乙?;咸前泛?或n-乙?;?半乳糖胺特異性結合的抗體在降低幾種不同類型的癌癥的生長速率(在體外和體內兩種情況下)中是高效和有效的。另外,本申請描述了預料不到的發(fā)現(xiàn),即與n-乙酰基葡糖胺或n-乙?;?半乳糖胺特異性結合的抗體可用于對胃腸道疾病例如病毒感染、炎癥性腸病和痔瘡的有效預防和治療。一方面,本文提供了能夠與包含n-乙?;咸前泛?或n-乙?;?半乳糖胺的表位特異性結合的抗體,其中所述表位由癌細胞或炎癥細胞表達。還提供了包含這些抗體的組合物,以及與其相關的多核苷酸、載體、宿主細胞和生產中有用的方法。進一步提供了用于治療或預防個體中癌癥的方法和試劑盒,所述方法和試劑盒通過對個體給藥能夠與包含n-乙?;咸前坊騨-乙?;?半乳糖胺的表位特異性結合的抗體,所述抗體可選擇性與另外的抗癌劑組合。進一步提供了通過對個體給藥抗體用于治療或預防個體中的胃腸道疾病的方法和試劑盒,所述抗體能夠與包含n-乙?;咸前坊騨-乙?;?半乳糖胺的表位特異性結合。更進一步提供了用于檢測個體中癌細胞的存在的方法和試劑盒,所述方法通過從個體獲得生物樣品,使生物樣品與抗體接觸,所述抗體能夠與包含n-乙?;咸前泛?或n-乙酰基-半乳糖胺的表位特異性結合,并檢測結合到生物樣品的抗體的量,其中所述抗體結合指示個體中癌細胞的存在。在某些方面,本發(fā)明提供了分離的單克隆抗體,所述抗體能夠與包含n-乙?;咸前坊騨-乙?;?半乳糖胺的表位特異性結合,其中所述表位由癌細胞或炎癥細胞表達。在某些實施方式中,抗體能夠與包含n-乙?;咸前返谋砦缓桶琻-乙酰基-半乳糖胺的表位特異性結合。在可以與任何前述實施方式組合的某些實施方式中,抗體是抗體片段。在某些實施方式中,抗體是fab片段、scfv、微抗體、雙抗體(diabody)、scfv多聚體或雙特異性抗體(bispecificantibody)片段。在某些實施方式中,抗體是人源化抗體。在某些實施方式中,抗體是人抗體。在某些實施方式中,抗體是嵌合抗體。在可以與任何前述實施方式組合的某些實施方式中,表位在癌細胞的細胞表面上表達。在可以與任何前述實施方式組合的某些實施方式中,表位在癌細胞內表達。在可以與任何前述實施方式組合的某些實施方式中,癌細胞選自膠質瘤細胞、肝癌細胞、肺癌細胞、乳腺癌細胞、卵巢癌細胞和宮頸腺癌細胞。在某些實施方式中,肺癌細胞是小細胞肺癌細胞、肺鱗狀細胞癌細胞或肺腺癌細胞。在某些實施方式中,抗體與表位的結合抑制癌細胞的生長。在某些實施方式中,炎癥細胞是結腸炎、炎癥性腸病或胃腸炎的腸炎癥細胞,并且表位在炎癥細胞的細胞表面上表達。在某些實施方式中,抗體包含重鏈可變區(qū)和輕鏈可變區(qū),且所述重鏈可變區(qū)包含來自seqidno:1所示的氨基酸序列的三個hvr,所述輕鏈可變區(qū)包含來自seqidno:2所示的氨基酸序列的三個hvr。在某些實施方式中,抗體包含重鏈可變區(qū)和輕鏈可變區(qū),且所述重鏈可變區(qū)包含seqidno:24所示的hvr-h1序列、seqidno:25所示的hvr-h2序列和seqidno:26所示的hvr-h3序列,所述輕鏈可變區(qū)包含seqidno:27所示的hvr-l1序列、seqidno:28所示的hvr-l2序列和seqidno:29所示的hvr-l3序列。在某些實施方式中,抗體包含具有seqidno:1所示的氨基酸序列的重鏈可變區(qū)和/或含有seqidno:2所示的氨基酸序列的輕鏈可變區(qū)。在某些實施方式中,抗體包含重鏈可變區(qū)和輕鏈可變區(qū),且所述重鏈可變區(qū)包含來自seqidno:3所示的氨基酸序列的三個hvr,所述輕鏈可變區(qū)包含來自seqidno:4所示的氨基酸序列的三個hvr。在某些實施方式中,抗體包含重鏈可變區(qū)和輕鏈可變區(qū),且所述重鏈可變區(qū)包含seqidno:7所示的hvr-h1序列、seqidno:30所示的hvr-h2序列和seqidno:31所示的hvr-h3序列,所述輕鏈可變區(qū)包含seqidno:11所示的hvr-l1序列、seqidno:14所示的hvr-l2所示序列和seqidno:15所示的hvr-l3序列。在某些實施方式中,抗體包含具有seqidno:3所示的氨基酸序列的重鏈可變區(qū)和/或含有seqidno:4所示的氨基酸序列的輕鏈可變區(qū)。在某些實施方式中,抗體包含重鏈可變區(qū)和輕鏈可變區(qū),且所述重鏈可變區(qū)包含來自seqidno:5所示的氨基酸序列的三個hvr,所述輕鏈可變區(qū)包含來自seqidno:6所示的氨基酸序列的三個hvr。在某些實施方式中,抗體包含重鏈可變區(qū)和輕鏈可變區(qū),且所述重鏈可變區(qū)包含seqidno:32所示的hvr-h1序列、seqidno:33所示的hvr-h2序列和seqidno:34所示的hvr-h3序列,所述輕鏈可變區(qū)包含seqidno:35所示的hvr-l1序列、seqidno:36所示的hvr-l2序列和seqidno:37所示的hvr-l3序列。在某些實施方式中,抗體包含具有seqidno:5所示的氨基酸序列的重鏈可變區(qū)和/或含有seqidno:6所示的氨基酸序列的輕鏈可變區(qū)。在某些實施方式中,抗體包含重鏈可變區(qū)和輕鏈可變區(qū),且所述重鏈可變區(qū)包含seqidno:7所示的hvr-h1序列、seqidno:8所示的hvr-h2序列和seqidno:9所示的hvr-h3序列,所述輕鏈可變區(qū)包含seqidno:10所示的hvr-l1序列、seqidno:12所示的hvr-l2序列和seqidno:15所示的hvr-l3序列。在某些實施方式中,抗體包含具有seqidno:16所示的氨基酸序列的重鏈可變區(qū)和/或含有seqidno:18所示的氨基酸序列的輕鏈可變區(qū)。在某些實施方式中,抗體包含重鏈可變區(qū)和輕鏈可變區(qū),且所述重鏈可變區(qū)包含seqidno:7所示的hvr-h1序列、seqidno:8所示的hvr-h2序列和seqidno:9所示的hvr-h3序列,所述輕鏈可變區(qū)包含seqidno:11所示的hvr-l1序列、seqidno:13所示的hvr-l2序列和seqidno:15所示的hvr-l3序列。在某些實施方式中,抗體包含具有seqidno:16所示的氨基酸序列的重鏈可變區(qū)和/或含有seqidno:20所示的氨基酸序列的輕鏈可變區(qū)。在某些實施方式中,抗體包含重鏈可變區(qū)和輕鏈可變區(qū),且所述重鏈可變區(qū)包含seqidno:7所示的hvr-h1序列、seqidno:8所示的hvr-h2序列和seqidno:9所示的hvr-h3序列,所述輕鏈可變區(qū)包含seqidno:11所示的hvr-l1序列、seqidno:14所示的hvr-l2序列和seqidno:15所示的hvr-l3序列。在某些實施方式中,抗體包含具有seqidno:16所示的氨基酸序列的重鏈可變區(qū)和/或含有seqidno:22所示的氨基酸序列的輕鏈可變區(qū)。在其它方面,本發(fā)明提供了包含能夠與包含n-乙酰基葡糖胺或n-乙?;?半乳糖胺的表位特異性結合的抗體和藥學上可接受的載體的組合物。在其它方面,本發(fā)明提供了包含根據(jù)任何上述實施方式的抗體和藥學上可接受的載體的組合物。在其它方面,本發(fā)明提供了包含編碼抗體的核酸序列的分離的多核苷酸,所述抗體能夠與包含n-乙?;咸前坊騨-乙酰基-半乳糖胺的表位特異性結合。在其它方面,本發(fā)明提供了包含編碼根據(jù)任何上述實施方式的抗體的核酸序列的分離的多核苷酸。在另外的方面,本發(fā)明提供了包含編碼抗體的核酸序列的載體,所述抗體能夠與包含n-乙?;咸前坊騨-乙?;?半乳糖胺的表位特異性結合。在另外的方面,本發(fā)明提供了包含編碼根據(jù)任何上述實施方式的抗體的核酸序列的載體。在又一些方面,本發(fā)明提供了包含載體的分離的宿主細胞,所述載體包含編碼能夠與包含n-乙酰基葡糖胺或n-乙?;?半乳糖胺的表位特異性結合的抗體的核酸序列。在又一些方面,本發(fā)明提供了包含載體的分離的宿主細胞,所述載體包含編碼根據(jù)任何上述實施方式的抗體的核酸序列。在又一些方面,本發(fā)明提供了制備抗體的方法,包括培養(yǎng)包含載體的宿主細胞,所述載體包含編碼能夠與包含n-乙?;咸前坊騨-乙酰基-半乳糖胺的表位特異性結合的抗體的核酸序列,所述宿主細胞產生由該核酸編碼的抗體,并從細胞培養(yǎng)物中回收該抗體。在又一些方面,本發(fā)明提供了產生抗體的方法,包括培養(yǎng)包含載體的宿主細胞,所述載體包含編碼根據(jù)任何上述實施方式的抗體的核酸序列,所述宿主細胞產生由該核酸編碼的抗體,并從細胞培養(yǎng)物中回收該抗體。在又一些方面,本發(fā)明提供了通過培養(yǎng)包含載體的宿主細胞制備的抗體,所述載體包含編碼能夠與包含n-乙?;咸前坊騨-乙酰基-半乳糖胺的表位特異性結合的抗體的核酸序列,所述宿主細胞產生由該核酸編碼的抗體,并從細胞培養(yǎng)物中回收該抗體。在又一些方面,本發(fā)明提供了通過培養(yǎng)包含載體的宿主細胞產生的抗體,所述載體包含編碼根據(jù)任何上述實施方式的抗體的核酸序列,所述宿主細胞產生由所述核酸編碼的抗體,并從細胞培養(yǎng)物中回收該抗體。在其它方面,本發(fā)明提供了用于治療或預防個體中癌癥的方法,包括對個體給藥有效量的包含抗體的組合物,所述抗體能夠與包含n-乙酰基葡糖胺或n-乙?;?半乳糖胺的表位特異性結合。在其它方面,本發(fā)明提供了用于治療或預防個體中癌癥的方法,包括對個體給藥有效量的包含根據(jù)任何上述實施方式的抗體的組合物。在某些實施方式中,所述癌癥選自腦癌、肝癌、肺癌、乳腺癌、卵巢癌和宮頸癌。在某些實施方式中,個體是人。在某些實施方式中,個體是非人動物。在其它方面,本發(fā)明提供了用于治療或預防個體中癌癥的方法,包括對個體給藥一定量的能夠與包含n-乙?;咸前坊騨-乙酰基-半乳糖胺的表位特異性結合的抗體,和一定量的另外的抗癌劑,其中所述抗體和抗癌劑聯(lián)合提供個體中癌癥的有效治療或預防。在其它方面,本發(fā)明提供了用于治療或預防個體中癌癥的方法,包括對個體給藥一定量的根據(jù)任何上述實施方式的抗體和一定量的另外的抗癌劑,其中所述抗體和抗癌劑聯(lián)合提供對個體中癌癥的有效治療或預防。在某些實施方式中,所治療的癌癥選自腦癌、肝癌、肺癌、乳腺癌、卵巢癌、宮頸癌、結腸癌、胃癌或胃部癌癥(stomachorgastriccancer)、食管癌和纖維肉瘤。在某些實施方式中,個體是人。在某些實施方式中,個體是非人動物。在可以與任何前述實施方式組合的某些實施方式中,抗癌劑是化療劑。在其它方面,本發(fā)明提供了用于檢測個體中的癌細胞的方法,包括使來自個體的生物樣品與能夠特異性結合包含n-乙?;咸前坊騨-乙?;?半乳糖胺的表位的抗體接觸,并檢測抗體與生物樣品的結合,其中所述抗體與樣品的結合可以指示個體中的癌細胞的存在。在其它方面,本發(fā)明提供了用于檢測個體中的癌細胞的方法,包括使來自個體的生物樣品與根據(jù)任何上述實施方式的抗體接觸,并檢測抗體與生物樣品的結合,其中所述抗體與樣品的結合可以指示個體中的癌細胞的存在。在某些實施方式中,所述方法還包括將檢測到的抗體結合的量與結合到對照樣品的抗體的量進行比較。在可以與任何前述實施方式組合的某些實施方式中,抗體與生物樣品的結合通過選自elisa測定、流式細胞術測定、免疫組織化學測定、免疫熒光測定、血循環(huán)腫瘤細胞測定和免疫膠體金測定的方法檢測。在可以與任何前述實施方式組合的某些實施方式中,生物樣品選自血液、血清、尿液、糞便、乳汁、精液、唾液、胸液(chestfluid)、腹腔液、腦脊液、痰液和任何其它體液或分泌物。在某些實施方式中,個體是人。在某些實施方式中,個體是非人動物。在某些實施方式中,抗體包含具有seqidno:1所示的氨基酸序列的重鏈可變區(qū)和/或含有seqidno:2所示的氨基酸序列的輕鏈可變區(qū)。在某些實施方式中,抗體包含重鏈可變區(qū)和輕鏈可變區(qū),且所述重鏈可變區(qū)包含seqidno:24所示的hvr-h1序列、seqidno:25所示的hvr-h2序列和seqidno:26所示的hvr-h3序列,所述輕鏈可變區(qū)包含seqidno:27所示的hvr-l1序列、seqidno:28所示的hvr-l2序列和seqidno:29所示的hvr-l3序列。在某些實施方式中,抗體包含具有seqidno:3所示的氨基酸序列的重鏈可變區(qū)和/或含有seqidno:4所示的氨基酸序列的輕鏈可變區(qū)。在某些實施方式中,抗體包含重鏈可變區(qū)和輕鏈可變區(qū),且所述重鏈可變區(qū)包含seqidno:7所示的hvr-h1序列、seqidno:30所示的hvr-h2序列和seqidno:31所示的hvr-h3序列,所述輕鏈可變區(qū)包含seqidno:11所示的hvr-l1序列、seqidno:14所示的hvr-l2序列和seqidno:15所示的hvr-l3序列。在某些實施方式中,抗體包含重鏈可變區(qū)和輕鏈可變區(qū),且所述重鏈可變區(qū)包含seqidno:7所示的hvr-h1序列、seqidno:8所示的hvr-h2序列和seqidno:9所示的hvr-h3序列,所述輕鏈可變區(qū)包含seqidno:10所示的hvr-l1序列、seqidno:12所示的hvr-l2序列和seqidno:15所示的hvr-l3序列。在某些實施方式中,抗體包含具有seqidno:16所示的氨基酸序列的重鏈可變區(qū)和/或含有seqidno:18所示的氨基酸序列的輕鏈可變區(qū)。在某些實施方式中,抗體包含重鏈可變區(qū)和輕鏈可變區(qū),且所述重鏈可變區(qū)包含seqidno:7所示的hvr-h1序列、seqidno:8所示的hvr-h2序列和seqidno:9所示的hvr-h3序列,所述輕鏈可變區(qū)包含seqidno:11所示的hvr-l1序列、seqidno:13所示的hvr-l2序列和seqidno:15所示的hvr-l3序列。在某些實施方式中,抗體包含具有seqidno:16所示的氨基酸序列的重鏈可變區(qū)和/或包含具有seqidno:20所示的氨基酸序列的輕鏈可變區(qū)。在某些實施方式中,抗體包含重鏈可變區(qū)和輕鏈可變區(qū),且所述重鏈可變區(qū)包含seqidno:7所示的hvr-h1序列、seqidno:8所示的hvr-h2序列和seqidno:9所示的hvr-h3序列,所述輕鏈可變區(qū)包含seqidno:11所示的hvr-l1序列、seqidno:14所示的hvr-l2序列和seqidno:15所示的hvr-l3序列。在某些實施方式中,抗體包含具有seqidno:16所示的氨基酸序列的重鏈可變區(qū)和/或含有seqidno:22所示的氨基酸序列的輕鏈可變區(qū)。在可以與任何前述實施方式組合的某些實施方式中,所述癌細胞選自肺癌細胞、肝癌細胞、乳腺癌細胞、結腸癌或結腸直腸癌細胞、食管癌細胞、胃癌細胞、子宮內膜癌細胞、宮頸癌細胞、甲狀腺癌細胞、腦癌細胞和淋巴瘤細胞。在其它方面,本發(fā)明提供了治療或預防個體中的胃腸道疾病的方法,包括對個體給藥有效量的能夠與包含n-乙酰基葡糖胺或n-乙?;?半乳糖胺的表位特異性結合的抗體。在其它方面,本發(fā)明提供了治療或預防個體中的胃腸道疾病的方法,包括對個體給藥有效量的根據(jù)任何上述實施方式的抗體。在某些實施方式中,個體患有炎癥性腸病。在某些實施方式中,個體患有克羅恩病。在某些實施方式中,個體患有潰瘍性結腸炎。在某些實施方式中,個體患有急性感染性胃腸炎。在某些實施方式中,個體患有痔瘡。在某些實施方式中,個體患有由病毒感染引起的胃腸道疾病。在某些實施方式中,病毒感染是輪狀病毒感染或豬流行性腹瀉病毒感染。在某些實施方式中,個體是人。在某些實施方式中,個體是非人動物。在可以與任何前述實施方式組合的某些實施方式中,抗體通過靜脈內、肌內、皮下、局部、口服、經皮、腹膜內、眶內(intraorbitally)、通過植入、通過吸入、鞘內、心室內或鼻內給藥。在其它方面,本發(fā)明提供了包含藥物組合物的試劑盒,所述藥物組合物包含能夠與包含n-乙?;咸前坊騨-乙酰基-半乳糖胺的表位特異性結合的抗體。在其它方面,本發(fā)明提供了包含藥物組合物的試劑盒,所述藥物組合物包含根據(jù)任何上述實施方式的抗體。在某些方面,所述試劑盒還包括用于對個體給藥有效量的藥物組合物以治療或預防癌癥的說明書。在某些方面,所述試劑盒還包括用于對個體給藥有效量的藥物組合物以治療或預防胃腸道疾病的說明書。在某些方面,所述試劑盒還包括用于檢測個體中的癌細胞的存在的說明書。在某些方面,所述試劑盒還包括用于測定來自患有癌癥的個體的生物樣品中的n-乙?;咸前坊騨-乙酰基-半乳糖胺的水平的說明書。在其它方面,本發(fā)明提供了試劑盒,其包含具有n-乙?;咸前坊騨-乙?;?半乳糖胺的組合物和使用所述組合物檢測患有癌癥或炎癥的個體中自身抗體的存在的說明書或其它試劑。在其它方面,本發(fā)明提供了包含植物凝集素的試劑盒,其中所述植物凝集素特異性結合n-乙酰基葡糖胺或n-乙酰基-半乳糖胺,以及使用所述組合物測定來自患有癌癥的個體的生物樣品中的n-乙?;咸前坊騨-乙酰基-半乳糖胺水平的說明書或其它試劑。在一些實施方式中,植物凝集素是小麥胚芽凝集素(wga)或大豆凝集素(sba)。應當理解的是,本文所述的各種實施方式的一種、一些或所有特性可以組合以形成本發(fā)明的其它實施方式。本發(fā)明的這些和其它方面對于本領域技術人員將變得顯而易見。本發(fā)明的這些和其它實施方式通過以下詳細描述進一步描述。附圖說明圖1顯示了使用特異性識別n-乙酰基-葡糖胺的小麥胚芽凝集素的健康人組織(a)、人癌旁組織(b)和人癌癥組織(c)的免疫組織化學染色。每組樣品使用的組織如標記所示。人皮膚惡性黑素瘤是癌變組織(canceroustissue)(“皮膚-b”)作為陽性對照。組織板由美國fda推薦。圖2顯示了使用小麥胚芽凝集素(wga;a)或大豆凝集素(sba;b)對hep-g2和hek-293細胞系的熒光染色。圖3顯示了篩選單克隆抗體的elisa測定的結果,所述單克隆抗體用于結合n-乙?;咸前?、n-乙酰基-半乳糖胺和來自各種癌細胞系的裂解物,如所示。圖4顯示了用mtt法測定細胞生長的分析,表示用單克隆抗體2f7h4進行處理而抑制各種人癌細胞系的生長速率的結果。每個測定使用的抗體和細胞系的劑量如標記所示。值指的是用抗體處理觀察到的生長抑制的百分比。圖5顯示了用mtt法測定細胞生長的分析,表示用單克隆抗體1c5c9進行處理而抑制各種人癌細胞系的生長速率的結果。每個測定使用的抗體和細胞系的劑量如標記所示。數(shù)值指的是經抗體處理后觀察到的生長抑制的百分比。圖6顯示了用mtt法測定細胞生長的分析,表示用單克隆抗體3c4f12進行處理而抑制各種人癌細胞系的生長速率的結果。每個測定使用的抗體和細胞系的劑量如標記所示。數(shù)值指的是經抗體處理后觀察到的生長抑制的百分比。圖7顯示了各種單克隆抗體(濃度為1.0μg/ml)對mcf-7、skov-3和hela人癌細胞系的生長抑制的影響(圖如a中所示;表如b中所示)。數(shù)值指的是經抗體處理后觀察到的生長抑制的百分比,負值表示對抗體處理的反應為提高的生長速率。圖8顯示了各種單克隆抗體(濃度為2.0μg/ml)對sw11/b、ecap-1090、hutu-80、ht-1080和acc-2人癌細胞系的生長抑制的影響(圖如a中所示;表如b中所示)。數(shù)值指的是經抗體處理后觀察到的生長抑制的百分比。圖9顯示了使用體內腫瘤異種移植模型的抗體3c4f12對腫瘤大小的影響。(a)隨時間繪制的經鹽水、小麥胚凝集素(wga)或3c4f12處理的動物體內腫瘤異種移植物的大小曲線。(b)用鹽水、小麥胚芽凝集素(wga)或3c4f12處理的腫瘤異種移植物的影像圖。圖10表示了一種基于elisa分析法測定的結果;該法使用單克隆抗體1c5c9檢測來自患有各種類型癌癥的患者血清樣品中癌癥相關抗原。在表3中描述了樣品分級的系統(tǒng)。圖11表示了一種基于流式細胞分析法測定的結果;該法使用單克隆抗體2f7h4檢測來自患有各種類型癌癥的患者血液樣品中的循環(huán)癌細胞。圖12表示了一種基于流式細胞分析法測定的結果;該法使用單克隆抗體1c5c9檢測來自患有各種類型癌癥的患者血液樣品中的循環(huán)癌細胞。圖13表示了一種基于流式細胞分析法測定的結果;該法使用單克隆抗體1b3e12檢測來自患有各種類型癌癥的患者的血液樣品中的循環(huán)癌細胞。圖14顯示了一種免疫熒光染色的結果;該法使用單克隆抗體1c5c9對來自患有由輪狀病毒感染誘導的炎癥的小鼠的腸組織切片(b)及來自健康小鼠的腸組織切片(a)進行比較性免疫熒光染色。圖15比較了用mab-1c5c9或恩諾沙星治療的暴露于豬流行性腹瀉病毒(pedv)的仔豬的死亡率(表示為百分比),并與未治療的對照組相比較。圖中顯示了與mab-1c5c9治療相比較,各種治療觀察到的死亡率的統(tǒng)計學顯著性。圖16通過elisa測定顯示了人源化1c5c9抗體與n-乙?;咸前?nag)的結合。測試的抗體包括:嵌合1c5c9(“xhc+xlc”)、人源化1c5-vk1(“vh5+vk1”)、人源化1c5-vk2(“vh5+vk2”)、人源化1c5-vk3、人源化1c5-vk4(“vh5+vk4”)和人源化1c5-vk5(“vh5+vk5”)。圖17顯示了人源化1c5-vk2抗體對tnbs誘導的小鼠ibd模型的腸形態(tài)的作用效果,該效果通過在第7天進行的大體解剖評分判斷。治療組包括g1:未治療(n=4)。g2:5μg1c5-vk2/只動物,腹膜內注射(ip)(n=6);g3:5μg1c5-vk2/只動物,口服(po)(n=6);和g4:2μg1c5-vk2/只動物,腹膜內注射(ip)(n=6)。*表示t檢驗(在治療組g2和未治療對照組g1之間,以及在治療組g2和治療g4組之間比較)中的p<0.05。圖18a顯示了在tnbs誘導的ibd模型的第7天得到的大體影像圖。在ibd造模后48小時進行人源化1c5-vk2抗體的給藥治療。治療組同上文圖17中的描述。治療前的ibd造模后48小時分離的結腸樣品的狀況如圖所示。圖18b顯示了在ibd造模的第7天得到的大體影像圖。在ibd造模后48小時進行人源化1c5-vk1抗體的給藥治療。治療組包括g1:未治療;和g5:5μg1c5-vk1/只動物,腹膜內注射(ip)。治療前的ibd造模后48小時分離的結腸樣品的狀況如圖所示。圖19a顯示了在ibd模型的第7天得到的組織學影像圖。在ibd造模后48小時進行人源化1c5-vk2抗體的給藥治療。治療組如上文圖17中的描述。箭頭表示腸上皮再生。治療前的ibd造模后48小時分離的結腸樣品的狀況如圖所示。圖19b顯示了在ibd模型的第7天得到的組織學影像圖。在ibd造模后48小時給藥人源化1c5-vk1治療。所有樣品來自治療g5組:5μg1c5-vk1/只動物,腹膜內注射(ip)。箭頭表示腸上皮再生。圖20顯示了與對照小鼠相比較,用人源化1c5-vk2抗體治療的小鼠結腸切片的免疫組織化學(ihc)染色結果。從一周齡的ibd模型小鼠獲得組織,并用抗人igg-hrp染色。箭頭指示在結腸炎癥部位檢測出的1c5-vk2抗體。圖21顯示了人源化1c5-vk2抗體的小鼠急性毒性測試結果(體重/時間)。治療組包括g1:1.0mg/kg,靜脈內注射(iv);g2:1.0mg/kg,口服(po);g3:5.0mg/kg,靜脈內注射(iv);和g4:5.0mg/kg,腹膜內注射(ip)。所有組的樣本大小為6只動物。圖22顯示了用elisa測定的、經靜脈內注射人源化1c5-vk2治療的小鼠血清中抗體的水平。y軸表示檢測的抗體的水平(od450nm)。x軸表示治療后樣品收集的時間(以小時計,除了“2w”表示2周)。治療組及樣本大小如上文圖21中所述。圖23顯示了用elisa測定的、口服人源化1c5-vk2治療的小鼠血清中抗體的水平。x軸表示治療后樣品收集的時間(以小時計)。治療組和樣本大小如上文圖21中的描述。圖24顯示了tnbs誘導的炎癥性腸病(ibd)模型中,人源化1c5-vk2抗體對大鼠體重隨時間的影響。治療組包括g1:未治療(n=5);g2:125μg/kg的人igg,腹膜內注射(ip)(n=5);g4:125μg/kg的1c5-vk2,腹膜內注射(ip)(n=5);g5:122μg/kg的1c5-vk2,皮下注射(sc)(n=6);和g6:250μg/kg的1c5-vk2,口服管飼(po)(n=6)。圖25顯示了在ibd模型的第8天得到的大體影像圖。在ibd造模后48小時進行人源化1c5-vk2抗體的給藥治療。治療組如上文圖24中的描述。圖26顯示了在大鼠ibd模型的第8天大鼠結腸大體評價的評分。在誘導ibd模型后48小時進行人源化1c5-vk2抗體的給藥治療。治療組如上文圖24中的描述。*表示在指定的治療組與未治療的對照組(g1)的t檢驗比較中p<0.05。圖27顯示了ibd模型的第8天的大鼠結腸重量。在ibd造模后48小時進行人源化1c5-vk2抗體的給藥治療。治療組如上文圖24中的描述。*表示在指定的治療組與未治療的對照組(g1)的t檢驗比較中p<0.05。具體實施方式本申請的發(fā)明人證明了n-乙酰基葡糖胺和n-乙?;?半乳糖胺更傾向在許多人癌癥和癌細胞系中表達,但在大多數(shù)正常人組織中僅很少的表達或不表達。此外,本發(fā)明人制備了識別n-乙?;咸前泛?或n-乙?;?半乳糖胺的單克隆抗體。本文所述的結果證明了這些抗體能夠結合并抑制各種人癌細胞的生長。本文所述的結果還證明了這些抗體可用于預防或治療各種胃腸道疾病。此外,本文描述的結果進一步顯示了這些抗體可用于檢測在各種癌癥中差異表達并釋放到血液和其它體液或分泌物中的糖類相關的生物標記物。i.一般技術本領域技術人員使用常規(guī)方法學可以很好地理解和采用本文描述或參考的技術,例如,廣泛利用的方法學描述于:sambrook等,molecularcloning:alaboratorymanual3dedition(2001)coldspringharborlaboratorypress,coldspringharbor,ny;currentprotocolsinmolecularbiology(f.m.ausubel等編著,(2003));harlow和lane編著(1988)antibodies,alaboratorymanual,andanimalcellculture(r.i.freshney編著(1987));methodsinmolecularbiology,humanapress;monoclonalantibodies:apracticalapproach(p.shepherd和c.dean編著,oxforduniversitypress,2000);和cancer:principlesandpracticeofoncology(v.t.devita等編著,j.b.lippincottcompany,1993)。ii.定義在詳細描述本發(fā)明之前,應當理解,本發(fā)明不限于特定的組合物或生物體系,其當然可以改變。還應當理解,本文所使用的術語僅用于描述具體實施方式的目的,而不意在限制。如在本說明書和隨附權利要求書中所使用的,單數(shù)形式“一(a)”、“一個(an)”和“該(the)”包括復數(shù)對象,除非上下文另有明確指示。因此,例如,所提到的“分子”任選地包括兩個或以上這樣的分子的組合等。本文使用的術語“約”是指本
      技術領域
      的技術人員容易知道的相應值的通常誤差范圍。本文中對“約”值或參數(shù)的提及包括(并描述)涉及該值或參數(shù)本身的實施方式。應理解,本文所述的本發(fā)明的方面和實施方式包括“包含方面和實施方式”、“由其組成”和“基本上由其組成”。術語“炎癥”是指身體組織對有害刺激(例如病原體、受損細胞或刺激物)的復雜生物反應。急性炎癥的經典體征包括但不限于疼痛、發(fā)熱、發(fā)紅、腫脹和功能喪失。炎癥是一般反應,因此它被認為是先天免疫的機制。炎癥可以分為急性或慢性。急性炎癥是指身體對有害刺激的初始反應,并且通過血漿和白細胞(尤其是粒細胞)從血液到損傷組織中的加速運動來實現(xiàn)。一系列生化事件使炎癥反應擴散并成熟,涉及損傷組織內的局部血管系統(tǒng)、免疫系統(tǒng)和各種細胞。長期的炎癥,稱為慢性炎癥,導致存在于炎癥部位的細胞類型的進行性變化,并且其特征在于來自炎癥過程的組織的同時破壞和愈合。術語“炎癥細胞”是指通常存在于血液中并通過外滲移入發(fā)炎組織而有助于炎癥的白細胞(例如嗜中性粒細胞、巨噬細胞、單核細胞、嗜酸性粒細胞和嗜堿性粒細胞)。一些充當吞噬細胞,攝取細菌、病毒和細胞碎片。其它釋放損傷致病侵入物的酶顆粒。白細胞還釋放產生和維持炎癥反應的炎癥介質。通常,急性炎癥由粒細胞介導,而慢性炎癥由單核細胞例如單核白細胞和淋巴細胞介導。術語“炎癥性腸病(ibd)”是指特征在于消化道的全部或局部的慢性炎癥的病理狀態(tài)。ibd主要包括潰瘍性結腸炎和克羅恩病。兩者通常涉及嚴重的腹瀉、疼痛、疲勞和體重減輕。潰瘍性結腸炎是在大腸(結腸)和直腸中引起持久性炎癥和瘡(潰瘍)的ibd的形式??肆_恩病是引起消化道炎癥的ibd的形式。在克羅恩病中,炎癥通常深入到受影響的組織中。炎癥可涉及消化道的不同區(qū)域,例如大腸、小腸或兩者。膠原性結腸炎和淋巴細胞性結腸炎也被認為是炎癥性腸病,但通常認為與經典炎癥性腸病不同。術語“癌癥”和“癌細胞”是指或描述通常以不受調節(jié)的細胞生長為特征的動物中的生理狀況。癌癥的實例包括但不限于肺癌(包括小細胞肺癌、肺腺癌和肺鱗狀細胞癌)、肝細胞癌、腦癌(包括惡性少突膠質細胞瘤、成膠質細胞瘤或神經膠質瘤)、胃腸癌(包括但不限于:食管癌、胃部癌癥、腸癌、結腸癌和結腸直腸癌)、腎透明細胞癌、皮膚基底細胞癌、皮膚鱗狀細胞癌、喉癌、霍奇金淋巴瘤、甲狀腺髓樣癌、胰腺癌、宮頸癌、卵巢癌、膀胱癌、泌尿道癌、乳腺癌、子宮內膜或子宮癌、唾液腺癌、前列腺癌、黑素瘤、多發(fā)性骨髓瘤和b細胞淋巴瘤、白血病和相關轉移瘤。在一些實施方式中,癌癥的類型選自:腦癌、肝癌、肺癌、乳腺癌、卵巢癌和宮頸癌。在一些實施方式中,癌細胞選自:膠質瘤細胞、肝癌細胞、肺癌細胞、乳腺癌細胞、卵巢癌細胞和宮頸腺癌細胞。術語“免疫球蛋白”(ig)與本文中的“抗體”可互換使用。本文中的術語“抗體”以最廣泛的含義使用,并且具體涵蓋單克隆抗體、多克隆抗體、由至少兩種完整抗體形成的多特異性抗體(例如雙特異性抗體)、和抗體片段(例如fab片段、scfv、微抗體、雙抗體、scfv多聚體或雙特異性抗體片段),只要它們顯示所需的生物活性即可。如本文所用,術語“特異性結合”或“對……特異性”是指可測量的和可再現(xiàn)的相互作用,例如靶標和抗體之間的結合,其在包括生物分子的分子的異質群體的存在下確定靶標的存在。例如,與靶標特異性結合(其可以是表位)的抗體是以比其結合到其它靶標更大的親和力、親合力、更容易和/或更長的持續(xù)時間結合該靶標的抗體。在某些實施方式中,與靶標特異性結合的抗體具有≤1μm、≤100nm、≤10nm、≤1nm或≤0.1nm的解離常數(shù)(kd)。在另一個實施方式中,特異性結合可以包括但不需要排他性結合??贵w的“可變區(qū)”或“可變域”是指抗體的重鏈或輕鏈的氨基末端結構域。重鏈和輕鏈的可變域可以分別稱為“vh”和“vl”。這些域通常是抗體的最可變部分(相對于相同類別的其它抗體)并且包含抗原結合位點。術語“可變的”是指可變域的某些區(qū)段在抗體之間的序列中廣泛不同的事實。v域介導抗原結合并且限定特定抗體對其特定抗原的特異性。然而,可變性不是均勻分布在可變域的整個跨度上。相反,它集中在輕鏈和重鏈可變域(每個抗體或其抗原結合片段共有6個hvr)中稱為“高變區(qū)(hvr)”的三個區(qū)段中。如本文所用,“高變區(qū)(hvr)”含有賦予抗體特異性抗原結合的高度可變序列??勺冇虻母叨缺J氐牟糠址Q為骨架區(qū)(fr)。每條鏈中的hvr通過fr區(qū)緊密靠近在一起,并且與來自其它鏈的hvr一起,有助于抗體的抗原結合位點的形成(參見kabat等,sequencesofimmunologicalinterest,第五版,nationalinstituteofhealth,bethesda,md(1991))。恒定域不直接參與抗體與抗原的結合,但表現(xiàn)出各種效應子功能,例如抗體參與抗體依賴性細胞毒性。許多hvr描述被使用并且包括在本文中。kabat互補決定區(qū)(cdr)基于序列可變性并且是最常用的(kabat等,sequencesofproteinsofimmunologicalinterest,第5版,publichealthservice,nationalinstitutesofhealth,bethesda,md.(1991))。而chothia指代結構環(huán)的位置(chothia和lesk,j.mol.biol.196:901-917(1987))。abmhvr代表kabathvr和chothia結構環(huán)之間的折衷,并且由oxfordmolecular的abm抗體建模軟件使用。“接觸”hvr基于可獲得的復雜晶體結構的分析。來自這些hvr中的每一個的殘基記錄如下。hvr可以包含如下的“延伸的hvr”:vl中的24-36或24-34(l1)、46-56或50-56(l2)和89-97或89-96(l3)以及vh中的26-35(h1)、50-65或49-65(h2)和93-102、94-102或95-102(h3)。對于這些定義中的每一個,根據(jù)kabat等在上文對可變域殘基進行編號。本文使用的術語“單克隆抗體”是指從基本上同質的抗體群體中獲得的抗體,即包含相同群體(除了可以少量存在的可能的自然存在的突變和/或翻譯后的修飾(例如異構化、酰胺化))的單個抗體。單克隆抗體是高度特異性的,針對單個抗原位點。與通常包括針對不同決定簇(表位)的不同抗體的多克隆抗體制劑相反,每個單克隆抗體針對抗原上的單一決定簇。修飾語“單克隆”表示如從基本上同質的抗體群體獲得的抗體特征,并且不應解釋為需要通過任何特定方法產生抗體。例如,根據(jù)本發(fā)明使用的單克隆抗體可以通過多種技術制備,包括例如雜交瘤法(例如,kohler和milstein,nature,256:495-97(1975);重組dna法(參見例如美國專利號4,816,567);噬菌體展示技術(參見例如clackson等人,nature,352:624-628(1991));以及用于在動物中產生人型或人樣抗體(humanorhuman-likeantibody)的技術,所述人型或人樣抗體具有編碼人免疫球蛋白序列的人免疫球蛋白基因座或基因的部分或全部(參見例如jakobovits等,proc.nat'lacad.sci.usa90:2551(1993);lonberg等,nature368:856-859(1994))?!翱贵w片段”包含完整抗體的一部分,優(yōu)選完整抗體的抗原結合部分和/或可變區(qū)??贵w片段的實例包括fab、fab'、f(ab')2和fv片段;微抗體;雙抗體;scfv;scfv多聚體;線性抗體;單鏈抗體分子;和由抗體片段形成的雙特異性或多特異性抗體?!皢捂渇v”(也縮寫為“sfv”或“scfv”)是包含連接到單個多肽鏈中的vh和vl抗體結構域的抗體片段。優(yōu)選地,scfv多肽還包含在vh和vl結構域之間的多肽接頭,使得scfv能夠形成抗原結合所需的結構。關于scfv的綜述參見pluckthuninthepharmacologyofmonoclonalantibodies,113卷,rosenburg和moore編著,springer-verlag,newyork,第269-315頁(1994)。術語“雙抗體”是指通過構建具有短接頭(約5-10個殘基)的scfv片段(參見前述段落)而制備的小抗體片段,所述短接頭在vh和vl結構域之間,以實現(xiàn)v結構域的鏈間而不是鏈內配對,從而產生二價片段,即具有兩個抗原結合位點的片段。雙抗體更詳細地描述于例如ep404,097;wo93/11161;hollinger等,proc.nat'lacad.sci.usa90:6444-48(1993)。本文的單克隆抗體具體包括“嵌合”抗體(免疫球蛋白)以及這種抗體的片段,只要它們顯示所需的生物活性即可(美國專利號4,816,567;morrison等,proc.nat'lacad.sci.usa,81:6851-55(1984)),嵌合抗體中,重鏈和/或輕鏈的一部分與衍生自特定物種或屬于特定抗體類別或亞類的抗體中的相應序列相同或同源,而鏈的其余部分與衍生自另一物種或屬于另一抗體類別或亞類的抗體中的相應序列相同或同源。非人(例如鼠科動物)抗體的“人源化”形式是包含衍生自非人免疫球蛋白的最小序列的嵌合抗體。在一個實施方式中,人源化抗體是人免疫球蛋白(受體抗體),其中來自受體的hvr的殘基被來自具有所需的特異性、親和力和/或能力的非人物種(供體抗體)例如小鼠、大鼠、兔或非人靈長類動物的hvr的殘基替代。更多細節(jié)參見例如jones等,nature321:522-525(1986)?!叭丝贵w”具有對應于由人產生的抗體和/或使用本文公開的用于制備人抗體的任何技術制備的抗體的氨基酸序列。人抗體可以使用本領域已知的多種技術產生,例如描述于cole等,monoclonalantibodiesandcancertherapy,alanr.liss,第77頁(1985);boerner等,j.immunol.,147(1):86-95(1991)中的方法?!胺蛛x的”抗體是從其生產環(huán)境的組分(例如,天然或重組地)識別、分離和/或回收的抗體。優(yōu)選地,分離的多肽不含通常會干擾抗體使用的污染組分,例如酶、激素和其它蛋白質或非蛋白質溶質。如本文所用,術語“治療”是指設計用于改變在臨床病理學過程期間治療的個體或細胞的自然過程的臨床干預。治療的期望效果包括降低疾病進展的速率、改善或緩解疾病狀態(tài),以及緩解或改進預后。例如,如果減輕或消除與癌癥相關的一種或多種癥狀,則成功地“治療”了個體。如本文所用,術語“預防”包括提供關于個體中疾病的發(fā)生或復發(fā)的預防。個體可能易患某種類型的癌癥,易受某種類型的癌癥影響,或處于發(fā)生某種類型的癌癥的風險中,但尚未被診斷患有該疾病。“有效量”是指在必需的劑量和時間段內有效實現(xiàn)所需治療或預防結果的至少量。有效量可以在一次或多次給藥中提供?!爸委熡行Я俊笔侵辽賹崿F(xiàn)特定病癥(例如癌癥)可測量的改善所需的最小濃度。本文的治療有效量可根據(jù)例如患者的疾病狀態(tài)、年齡、性別和體重以及單克隆抗體在個體中引起所需反應的能力等因素而變化。治療有效量也是單克隆抗體的治療有益效果超過任何毒性或有害作用時的量?!邦A防有效量”是指在該劑量和必需的時間段內有效實現(xiàn)所需預防結果的量。通常但不是必需的,由于在疾病的早期階段之前或在疾病的早期階段在受試者中使用預防劑量,預防有效量可以小于治療有效量。如本文所用,與另外的化合物或組合物“聯(lián)合”給藥包括同時給藥和/或在不同時間給藥。聯(lián)合給藥還包括作為聯(lián)合制劑給藥或作為單獨組合物給藥,包括以不同的給藥頻率或間隔給藥,使用相同的給藥途徑或不同的給藥途徑。用于治療或預防目的的“個體”是指歸類為哺乳動物的任何動物,包括人、家畜和農場動物以及動物園動物、體育運動動物或寵物動物(例如狗、馬、兔、牛、豬、倉鼠、沙鼠、小鼠、雪貂、大鼠、貓等。在一些實施方式中,個體是人。在一些實施方式中,個體是非人動物。如本文所用的“載體”包括對以所采用的劑量和濃度暴露于其中的細胞或哺乳動物無毒的藥學上可接受的載體、賦形劑或穩(wěn)定劑。通常生理學上可接受的載體是ph緩沖水溶液。生理學上可接受的載體的實例包括緩沖劑,例如磷酸鹽、檸檬酸鹽和其它有機酸;低分子量(小于約10個殘基)多肽;蛋白質,例如血清白蛋白、明膠或免疫球蛋白;氨基酸例如甘氨酸、谷氨酰胺、天冬酰胺、精氨酸或賴氨酸;碳水化合物,包括葡萄糖、甘露糖或糊精;和/或非離子表面活性劑,例如tweentm、聚乙二醇(peg)和pluronicstm?!八帉W上可接受的”緩沖劑和鹽包括衍生自上述酸和堿兩者的酸和堿加成鹽的緩沖劑和鹽。特定的緩沖液和/或鹽包括組氨酸、琥珀酸鹽和乙酸鹽。本文可互換使用的“多核苷酸”或“核酸”是指任何長度的核苷酸的聚合物,且包括dna和rna。核苷酸可以是脫氧核糖核苷酸、核糖核苷酸、修飾的核苷酸或堿基,和/或其類似物,或可以通過dna或rna聚合酶或通過合成反應摻入聚合物的任何底物。編碼本文的抗體的“分離的”多核苷酸是從至少一種污染性核酸分子識別和分離的核酸分子,所述核酸分子通常在其產生環(huán)境中與污染性核酸分子結合。編碼本文的多肽和抗體的分離的核酸分子是以其在自然界中發(fā)現(xiàn)的形式或設置以外的形式存在。優(yōu)選地,分離的核酸不與生產環(huán)境相關的所有組分結合。本文所用的術語“載體”意指能夠轉運與其連接的另外的核酸的核酸分子。載體的類型包括質粒(即,其中可連接另外的dna區(qū)段的環(huán)狀雙鏈dna)和病毒載體。某些載體能夠在引入它們的宿主細胞(例如,具有細菌復制起點的細菌載體和附加型哺乳動物載體)中自主復制。其它載體可以整合到宿主細胞的基因組中并與宿主基因組一起復制。此外,某些載體能夠指導它們可操作地連接的基因的表達。這種載體在本文中稱為“重組表達載體”或簡稱為“表達載體”。在本說明書中,“質?!焙汀拜d體”可以互換使用,因為質粒是載體的最常用形式。iii.糖類本發(fā)明的某些方面涉及含有糖類的表位。如本文所用,“糖類”可以指單糖、寡糖或多糖。單糖包括但不限于果糖、葡萄糖、甘露糖、巖藻糖、木糖、半乳糖、乳糖、n-乙酰神經氨酸、n-乙?;?半乳糖胺、n-乙?;咸前泛屯僖核?。寡糖是包含通過組分糖的糖苷鍵連接的多個糖單體的糖類聚合物。糖蛋白或蛋白糖(proteosaccharide)是指與糖連接的蛋白質,并且通??梢园缗c蛋白質中的氨基酸側鏈或脂質部分相容的單糖的o-或n-糖苷鍵。如本文所用,術語“聚糖”和“糖基部分”可互換使用,指的是單獨的糖類或作為糖蛋白的糖類組分的糖。兩種類型的糖基化在本領域中是已知的:與天冬酰胺側鏈的酰胺氮n-連接的糖基化和與絲氨酸和蘇氨酸側鏈的羥基氧o-連接的糖基化。其它糖包括但不限于o-glcnac、gag鏈、糖胺基糖和糖鞘脂。o-和n-連接糖類在真核生物中非常常見,也可以在原核生物中發(fā)現(xiàn),但較不常見。本發(fā)明的某些方面涉及n-乙酰基葡糖胺和n-乙?;?半乳糖胺。n-乙?;咸前房梢灾赴╪-連接有葡糖胺部分的任何氨基糖化合物。如本文所用,n-乙?;咸前房梢灾竼翁潜旧?,或作為較大多糖的組分的單糖。如本文所用,n-乙?;咸前房梢灾柑穷悓嶓w本身,或者作為糖蛋白的聚糖組分或蛋白質被一種或多種基于n-乙?;咸前返慕M分糖基化的糖類(例如含有n-乙酰基葡糖胺的單糖或多糖)。n-乙?;?半乳糖胺可以指包括與乙酸部分n-連接的葡糖胺的任何化合物。n-乙?;?半乳糖胺可以指包括n-連接有半乳糖胺部分的任何氨基糖化合物。如本文所用,n-乙酰基-半乳糖胺可以指單糖本身,或作為較大多糖的組分的單糖。如本文所用,n-乙?;?半乳糖胺可以指糖類實體本身,或作為糖蛋白的聚糖組分或蛋白質被一種或多種n-乙酰基-半乳糖胺部分糖基化的糖類(例如,含有n-乙?;?半乳糖胺的單糖或多糖)。雖然已知許多蛋白質被糖基化,但是糖蛋白通常在細胞的外表面(即,細胞外)上發(fā)現(xiàn)或被分泌。因此,糖蛋白對于外部試劑(例如,給藥至患者的外源化合物)是高度可接近的。例如,特異性識別某些糖蛋白(例如抗體或凝集素)的組分能夠在完整生物體中結合到在其細胞表面上表達這些糖蛋白的細胞。特異性識別某些糖蛋白的組分還能夠結合分泌的糖或糖蛋白,例如可在某些組織樣品(包括但不限于血液或血清)中發(fā)現(xiàn)游離的糖或糖蛋白。凝集素在本領域中已知是能夠以高特異性識別同源糖部分的糖結合蛋白質。這些高度特異性結合相互作用可以用于例如檢測組織中的特定糖(例如,用于檢測被特定糖部分糖基化修飾的細胞表面蛋白)。凝集素可以包括例如動物凝集素、植物凝集素和病原體凝集素。在哺乳動物中,已知凝集素在免疫系統(tǒng)中發(fā)揮重要作用,例如通過識別排他性地在病原體上發(fā)現(xiàn)或在宿主細胞上難見到的碳水化合物。本發(fā)明的某些方面使用植物凝集素來檢測特定糖部分的存在或表達。例如,植物凝集素可包括但不限于對果糖、甘露糖、葡萄糖、巖藻糖、半乳糖、n-乙酰基-半乳糖胺和n-乙?;?葡糖胺特異的凝集素。iv.抗體表位結合本發(fā)明的某些方面涉及能夠與包含n-乙?;咸前坊騨-乙酰基-半乳糖胺的表位特異性結合的抗體。如上所述,這樣的抗體將顯示可測量的和可再現(xiàn)的相互作用,例如結合到含有n-乙酰基葡糖胺或n-乙?;?半乳糖胺的表位。例如,能夠與表位特異性結合的抗體是以比其結合到其它靶標更大親和力、親合力、更容易和/或更長的持續(xù)時間結合該表位的抗體。含有n-乙?;咸前坊騨-乙酰基-半乳糖胺的表位的實例包括含有n-乙?;咸前坊騨-乙酰基-半乳糖胺聚糖的糖蛋白,例如但不限于在癌細胞的表面上表達的帶有n-乙?;咸前坊騨-乙酰基-半乳糖胺部分的細胞表面糖蛋白。特異性結合可以包括但不需要排他性結合。雖然是能夠與包含n-乙?;咸前坊騨-乙酰基-半乳糖胺的表位特異性結合的抗體,但是也發(fā)現(xiàn)它們結合到不含有這些部分的其它表位,例如具有比含有n-乙?;咸前坊騨-乙?;肴樘前返谋砦桓〉慕Y合親和力。在一些實施方式中,抗體能夠與含有n-乙酰基葡糖胺和n-乙?;?半乳糖胺的表位特異性結合。例如,抗體能夠與含有n-乙?;咸前返谋砦缓秃衝-乙酰基-半乳糖胺的表位特異性結合。在一些實施方式中,抗體能夠與同時含有n-乙?;咸前泛蚽-乙?;?半乳糖胺的表位特異性結合。在一些實施方式中,抗體與癌細胞的細胞表面上表達的含有n-乙?;咸前泛?或n-乙酰基-半乳糖胺的表位的結合而抑制癌細胞的生長。如本文所用,抑制細胞生長可以指抑制其增殖速率。不希望受理論束縛,通過結合到細胞表面,抗體可通過多種機制抑制細胞的生長。例如,與細胞表面結合的抗體可能對細胞有毒性,或者以其它方式導致細胞死亡,例如但不限于凋亡或壞死。結合到細胞表面的抗體可以減緩或停止細胞增殖。與細胞表面上的細胞表面糖蛋白結合的抗體可以抑制或增強糖蛋白的功能,例如細胞信號轉導功能,并且在這樣做時,抗體結合可以抑制細胞的生長。與細胞表面結合的抗體可與外源配體競爭,所述外源配體例如生長因子通過結合到細胞表面加速細胞的生長。這種競爭可以是間接的,即抗體不需要競爭性結合到與外源配體相同的糖蛋白上的表位。與細胞表面結合的抗體還可以吸引免疫系統(tǒng)的一種或多種組分,例如自然殺傷或nk細胞,其抑制抗體結合細胞的生長。不同抗體通過結合細胞表面上的表位抑制細胞生長的機制可以根據(jù)細胞環(huán)境或特異性抗體或表位而不同。抗體特征在本發(fā)明中描述和表征了能夠與包含n-乙?;咸前坊騨-乙?;?半乳糖胺的表位特異性結合的某些抗體。在一些實施方式中,抗體是2f7h4。在一些實施方式中,抗體包含重鏈可變區(qū)和輕鏈可變區(qū),所述重鏈可變區(qū)包含來自seqidno:1所示的氨基酸序列的三個hvr,所述輕鏈可變區(qū)包含來自seqidno:2所示的氨基酸序列的三個hvr。在一些實施方式中,重鏈可變區(qū)包括包含序列ftfsdfyme(seqidno:24)的hvr1、包含序列asrnkandytteysasvkg(seqidno:25)的hvr2和包含序列dawfa(seqidno:26)的hvr3。在一些實施方式中,輕鏈可變區(qū)包括包含序列kssqsllyssnqknyla(seqidno:27)的hvr1、包含序列wastres(seqidno:28)的hvr2和包含序列qqyysypr(seqidno:29)的hvr3。在一些實施方式中,抗體是1c5c9。在一些實施方式中,抗體包含具有來自seqidno:3的氨基酸序列的三個hvr的重鏈可變區(qū)和含有來自seqidno:4的氨基酸序列的三個hvr的輕鏈可變區(qū)。在一些實施方式中,重鏈可變區(qū)包括包含序列ytfpdynih(seqidno:7)的hvr1、包含序列ciypyngntaynqkfkt(seqidno:30)的hvr2和包含序列sdlyyfgsrgfv(seqidno:31)的hvr3。在一些實施方式中,輕鏈可變區(qū)包括包含序列rasqdistyln(seqidno:11)的hvr1、包含序列ftsrlhs(seqidno:14)的hvr2和包含序列qqgntlpw(seqidno:15)hvr3。在一些實施方式中,抗體是抗體1c5c9的人源化形式。在一些實施方式中,抗體是人源化1c5-vk1。在一些實施方式中,抗體包含重鏈可變區(qū),所述重鏈可變區(qū)包含ytfpdynih(seqidno:7)的hvr-h1序列、ciypyngnta(seqidno:8)的hvr-h2序列和sdlyyfgsrgfd(seqidno:9)的hvr-h3序列。在一些實施方式中,抗體包含輕鏈可變區(qū),所述輕鏈可變區(qū)包含qasqdistyln(seqidno:10)的hvr-l1序列、ftsnlet(seqidno:12)的hvr-l2序列和qqgntlpw(seqidno:15)的hvr-l3序列。在一些實施方式中,抗體包含具有以下氨基酸序列的重鏈可變區(qū):qvqlvqsgaevkkpgasvkvsckasgytfpdynihwvrqapgqglewmgciypyngntayaqkfqgrvtmtrdtsistaymelsrlrsddtavyycarsdlyyfgsrgfdywgqgtlvtvssa(seqidno:16),和/或含有以下氨基酸序列的輕鏈可變區(qū):diqmtqspsslsasvgdrvtitcqasqdistylnwyqqkpgkapklliyftsnletgvpsrfsgsgsgtdftltisslqpediatyycqqgntlpwtfgggtkle(seqidno:18)。在一些實施方式中,抗體包含具有以下氨基酸序列的重鏈:qvqlvqsgaevkkpgasvkvsckasgytfpdynihwvrqapgqglewmgciypyngntayaqkfqgrvtmtrdtsistaymelsrlrsddtavyycarsdlyyfgsrgfdywgqgtlvtvssastkgpsvfplapsskstsggtaalgclvkdyfpepvtvswnsgaltsgvhtfpavlqssglyslssvvtvpssslgtqtyicnvnhkpsntkvdkrvepkscdkthtcppcpapellggpsvflfppkpkdtlmisrtpevtcvvvdvshedpevkfnwyvdgvevhnaktkpreeqynstyrvvsvltvlhqdwlngkeykckvsnkalpapiektiskakgqprepqvytlppsrdeltknqvsltclvkgfypsdiavewesngqpennykttppvldsdgsfflyskltvdksrwqqgnvfscsvmhealhnhytqkslslspgk(seqidno:17),和/或含有以下氨基酸序列的輕鏈:diqmtqspsslsasvgdrvtitcqasqdistylnwyqqkpgkapklliyftsnletgvpsrfsgsgsgtdftltisslqpediatyycqqgntlpwtfgggtklertvaapsvfifppsdeqlksgtasvvcllnnfypreakvqwkvdnalqsgnsqesvteqdskdstyslsstltlskadyekhkvyacevthqglsspvtksfnrgec(seqidno:19)。在一些實施方式中,抗體是人源化1c5-vk2。在一些實施方式中,抗體包含重鏈可變區(qū),所述重鏈可變區(qū)包含ytfpdynih(seqidno:7)的hvr-h1序列、ciypyngnta(seqidno:8)的hvr-h2序列和sdlyyfgsrgfd(seqidno:9)的hvr-h3序列。在一些實施方式中,抗體包含輕鏈可變區(qū),所述輕鏈可變區(qū)包含rasqdistyln(seqidno:11)的hvr-l1序列、ftsslqs(seqidno:13)的hvr-l2序列和qqgntlpw(seqidno:15)的hvr-l3序列。在一些實施方式中,抗體包含具有以下氨基酸序列的重鏈可變區(qū):qvqlvqsgaevkkpgasvkvsckasgytfpdynihwvrqapgqglewmgciypyngntayaqkfqgrvtmtrdtsistaymelsrlrsddtavyycarsdlyyfgsrgfdywgqgtlvtvssa(seqidno:16),和/或包含以下氨基酸序列的輕鏈可變區(qū):diqmtqspsslsasvgdrvtitcrasqdistylnwyqqkpgkapklliyftsslqsgvpsrfsgsgsgtdftltisslqpediatyycqqgntlpwtfgggtkle(seqidno:20)。在一些實施方式中,抗體包含具有以下氨基酸序列的重鏈:qvqlvqsgaevkkpgasvkvsckasgytfpdynihwvrqapgqglewmgciypyngntayaqkfqgrvtmtrdtsistaymelsrlrsddtavyycarsdlyyfgsrgfdywgqgtlvtvssastkgpsvfplapsskstsggtaalgclvkdyfpepvtvswnsgaltsgvhtfpavlqssglyslssvvtvpssslgtqtyicnvnhkpsntkvdkrvepkscdkthtcppcpapellggpsvflfppkpkdtlmisrtpevtcvvvdvshedpevkfnwyvdgvevhnaktkpreeqynstyrvvsvltvlhqdwlngkeykckvsnkalpapiektiskakgqprepqvytlppsrdeltknqvsltclvkgfypsdiavewesngqpennykttppvldsdgsfflyskltvdksrwqqgnvfscsvmhealhnhytqkslslspgk(seqidno:17),和/或包含以下氨基酸序列的輕鏈:diqmtqspsslsasvgdrvtitcrasqdistylnwyqqkpgkapklliyftsslqsgvpsrfsgsgsgtdftltisslqpediatyycqqgntlpwtfgggtklertvaapsvfifppsdeqlksgtasvvcllnnfypreakvqwkvdnalqsgnsqesvteqdskdstyslsstltlskadyekhkvyacevthqglsspvtksfnrgec(seqidno:21)。在一些實施方式中,抗體包含重鏈可變區(qū),其包含以下氨基酸序列的重鏈可變區(qū):qvqlvqsgaevkkpgasvkvsckasgytfpdynihwvrqapgqglewmgciypyngntayaqkfqgrvtmtrdtsistaymelsrlrsddtavyycarsdlyyfgsrgfdywgqgtlvtvssa(seqidno:16),和/或包含以下氨基酸序列的輕鏈可變區(qū):diqmtqspsslsasvgdrvtitcrasqdistylnwyqqkpgkapklliyftsrlhsgvpsrfsgsgsgtdftltisslqpediatyycqqgntlpwtfgggtkle(seqidno:22)。在一些實施方式中,抗體包含具有以下氨基酸序列的重鏈:qvqlvqsgaevkkpgasvkvsckasgytfpdynihwvrqapgqglewmgciypyngntayaqkfqgrvtmtrdtsistaymelsrlrsddtavyycarsdlyyfgsrgfdywgqgtlvtvssastkgpsvfplapsskstsggtaalgclvkdyfpepvtvswnsgaltsgvhtfpavlqssglyslssvvtvpssslgtqtyicnvnhkpsntkvdkrvepkscdkthtcppcpapellggpsvflfppkpkdtlmisrtpevtcvvvdvshedpevkfnwyvdgvevhnaktkpreeqynstyrvvsvltvlhqdwlngkeykckvsnkalpapiektiskakgqprepqvytlppsrdeltknqvsltclvkgfypsdiavewesngqpennykttppvldsdgsfflyskltvdksrwqqgnvfscsvmhealhnhytqkslslspgk(seqidno:17),和/或包含以下氨基酸序列的輕鏈:diqmtqspsslsasvgdrvtitcrasqdistylnwyqqkpgkapklliyftsrlhsgvpsrfsgsgsgtdftltisslqpediatyycqqgntlpwtfgggtklertvaapsvfifppsdeqlksgtasvvcllnnfypreakvqwkvdnalqsgnsqesvteqdskdstyslsstltlskadyekhkvyacevthqglsspvtksfnrgec(seqidno:23)。在一些實施方式中,抗體是人源化1c5-vkw。在一些實施方式中,抗體包含重鏈可變區(qū),所述重鏈可變區(qū)包含ytfpdynih(seqidno:7)的hvr-h1序列、ciypyngnta(seqidno:8)的hvr-h2序列和sdlyyfgsrgfd(seqidno:9)的hvr-h3序列。在一些實施方式中,抗體包含輕鏈可變區(qū),所述輕鏈可變區(qū)包含rasqdistyln(seqidno:11)的hvr-l1序列、ftsrlhs(seqidno:14)的hvr-l2序列和qqgntlpw(seqidno:15)的hvr-l3序列。在一些實施方式中,所述抗體是3c4f12。在一些實施方式中,抗體包含具有來自seqidno:5的氨基酸序列的三個hvr的重鏈可變區(qū)和含有來自seqidno:6的氨基酸序列的三個hvr的輕鏈可變區(qū)。在一些實施方式中,所述重鏈可變區(qū)包括包含序列fafssydms(seqidno:32)的hvr1、包含序列yissgggstyypdtvkg(seqidno:33)的hvr2和包含序列ryyygsswamd(seqidno:34)的hvr3。在一些實施方式中,輕鏈可變區(qū)包括包含序列kasqsvsndva(seqidno:35)的hvr1、包含序列yasnryt(seqidno:36)的hvr2和包含序列qqdysspy(seqidno:37)的hvr3。在一些實施方式中,抗體是1b3e12。用于本發(fā)明的抗體可包括單克隆抗體、多克隆抗體、抗體片段(例如fab、fab'-sh、fv、scfv和f(ab')2)、嵌合抗體、雙特異性抗體、多價抗體、異源綴合抗體、包含抗體部分的融合蛋白、人源化抗體和包含所需特異性的抗原識別位點(例如,用于包含n-乙?;咸前坊騨-乙?;?半乳糖胺的表位)的免疫球蛋白分子的任何其它修飾的構型,包括抗體的糖基化變體、抗體的氨基酸序列變體和共價修飾的抗體。抗體可以是鼠科動物、大鼠、人或任何其它來源(包括嵌合或人源化抗體)。在一些實施方式中,能夠與包含n-乙?;咸前坊騨-乙酰基-半乳糖胺的表位特異性結合的抗體是單克隆抗體。例如,單克隆抗體可以使用由kohler等,nature,256:495(1975)首先描述的雜交瘤法制備,或者可以通過重組dna法制備(美國專利號4,816,567)。測定培養(yǎng)雜交瘤細胞的培養(yǎng)基中針對抗原的單克隆抗體(例如含有n-乙?;咸前坊騨-乙酰基-半乳糖胺的表位)的產生。優(yōu)選地,通過免疫沉淀或通過體外結合測定,例如放射免疫測定(ria)或酶聯(lián)免疫吸附測定(elisa),來測定由雜交瘤細胞產生的單克隆抗體的結合特異性。單克隆抗體也可以通過重組dna法制備,例如上述那些。使用常規(guī)程序容易分離和測序編碼單克隆抗體的dna并將其置于表達載體中,并轉染到宿主細胞例如大腸桿菌細胞或cho細胞內以產生重組單克隆抗體。在一些實施方式中,能夠與包含n-乙?;咸前坊騨-乙?;?半乳糖胺的表位特異性結合的抗體是人源化抗體。人源化抗體包括人免疫球蛋白(受體抗體),所述人免疫球蛋白中來自受體的互補決定區(qū)(cdr)的殘基被具有期望的特異性、親和力和能力的來自非人物種(供體抗體)例如小鼠、大鼠或兔的cdr的殘基替換。參見jones等,nature321:522-525(1986);riechmann等,nature332:323-329(1988)和presta,curr.opin.struct.biol.2:593-596(1992)。用于人源化非人抗體的方法是本領域熟知的。通常,人源化抗體具有從非人來源引入其中的一個或多個氨基酸殘基。人源化可以基本上按照jones等,nature321:522-525(1986)的方法進行;或通過用非人cdr序列取代人抗體的相應序列。為了確保人源化抗體保留對抗原的高親和力,可以通過使用親本和人源化序列的三維模型分析親本序列和各種概念性人源化產物的過程來制備人源化抗體。三維免疫球蛋白模型通常是可獲得的并且是本領域技術人員熟悉的。一般來說,cdr殘基直接且最實質地參與影響抗原結合。在一些實施方式中,能夠與包含n-乙酰基葡糖胺或n-乙?;?半乳糖胺的表位特異性結合的抗體是人抗體。用于產生人抗體的本領域已知的方法包括但不限于噬菌體展示技術和使用響應抗原產生人抗體的轉基因動物。在一些實施方式中,能夠與包含n-乙?;咸前坊騨-乙?;?半乳糖胺的表位特異性結合的抗體是嵌合抗體。嵌合抗體可以指來自互補決定區(qū)(cdr)或衍生自一個物種的可變區(qū)的殘基與對應于來自另一物種的恒定區(qū)的序列連接的抗體。用于產生嵌合抗體的方法是本領域已知的(參見例如美國專利號4,816,567)。在一些實施方式中,能夠與含有n-乙?;咸前坊騨-乙酰基-半乳糖胺的表位特異性結合的抗體是抗體片段。在一些實施方式中,能夠與含有n-乙酰基葡糖胺或n-乙?;?半乳糖胺的表位特異性結合的抗體是fab片段、scfv、微抗體、雙抗體、scfv多聚體或雙特異性抗體片段。fab、fv和scfv抗體片段都可以在大腸桿菌中表達和并被其分泌,從而允許直接產生大量的這些片段,或者從噬菌體文庫中分離。這樣的線性抗體片段可以是單特異性或雙特異性的。在一些實施方式中,能夠與含有n-乙?;咸前坊騨-乙?;?半乳糖胺的表位特異性結合的抗體是雙特異性抗體。雙特異性抗體(bsab)是對至少兩種不同表位具有結合特異性的抗體,包括在相同或另外的蛋白質上的表位。用于制備雙特異性抗體的方法是本領域已知的。全長雙特異性抗體的常規(guī)生產基于兩個免疫球蛋白重鏈/輕鏈對的共表達,其中兩條鏈具有不同的特異性。在一些實施方式中,能夠與含有n-乙?;咸前坊騨-乙?;?半乳糖胺的表位特異性結合的抗體是多價抗體。多價抗體可以指具有多于2個抗原結合位點的任何抗體。在一些實施方式中,能夠與含有n-乙?;咸前坊騨-乙酰基-半乳糖胺的表位特異性結合的抗體是異源綴合抗體(heteroconjugateantibody)。異源綴合抗體可以指通過連接具有不同特異性的兩種抗體(例如通過共價連接)產生的任何抗體。根據(jù)不同的方法,將具有所需結合特異性的抗體可變域(抗體-抗原結合位點)與免疫球蛋白恒定域序列融合。將編碼免疫球蛋白重鏈融合體和必要時的免疫球蛋白輕鏈的dna插入不同的表達載體中,并共轉染到合適的宿主生物中。在一些實施方式中,含有能夠與含有n-乙?;咸前坊騨-乙?;?半乳糖胺的表位特異性結合的抗體的組合物可包括藥學上可接受的載體、賦形劑或穩(wěn)定劑,所述載體、賦形劑或穩(wěn)定劑以用作藥物組合物一部分的劑量和濃度對暴露于其中的細胞或哺乳動物是無毒的。通常生理學上可接受的載體是ph緩沖水溶液。生理學上可接受的載體的實例包括緩沖劑,例如磷酸鹽、檸檬酸鹽和其它有機酸;抗氧化劑包括抗壞血酸;低分子量(小于約10個殘基)多肽;蛋白質,例如血清白蛋白、明膠或免疫球蛋白;親水性聚合物例如聚乙烯吡咯烷酮;氨基酸如甘氨酸、谷氨酰胺、天冬酰胺、精氨酸或賴氨酸;單糖、二糖和其它碳水化合物,包括葡萄糖、甘露糖或糊精;螯合劑例如edta;糖醇如甘露醇或山梨醇;成鹽反荷離子例如鈉;和/或非離子表面活性劑,例如tweentm、聚乙二醇(peg)和pluronicstm。多核苷酸、編碼抗體的載體和宿主細胞本發(fā)明的某些方面涉及能夠與含有n-乙?;咸前坊騨-乙?;?半乳糖胺的表位特異性結合的抗體的產生。具體地,某些方面涉及含有編碼抗體的核酸序列,所述抗體能夠與含有n-乙?;咸前坊騨-乙酰基-半乳糖胺的表位特異性結合。如上所述,多核苷酸可以指脫氧核糖核苷酸、核糖核苷酸、修飾的核苷酸或堿基,和/或其類似物。這些多核苷酸可以于體內在宿主細胞內產生或通過體外轉錄產生。編碼抗體的多核苷酸可以指攜帶編碼抗體序列的多核苷酸,其在產生抗體的細胞(例如,b細胞或雜交瘤)中被識別,或在序列中含有同義突變的多核苷酸,將其與其自然存在的對應物區(qū)分開,但是由于遺傳密碼的固有簡并性,編碼相似的蛋白質??梢酝ㄟ^本領域已知的任何方法分離多核苷酸,包括pcr,隨后進行pcr反應基于沉淀的純化,或含有pcr產物的瓊脂糖凝膠切片,或通過純化含有來自宿主細胞的多核苷酸的載體(例如,來自大腸桿菌的質粒制劑)。本發(fā)明的某些方面涉及含有編碼能夠與含有n-乙?;咸前坊騨-乙?;?半乳糖胺的表位特異性結合的抗體的核酸序列的載體。為了重組生產抗體或其片段,分離編碼所需抗體或抗體片段的核酸,并插入可復制的載體中用于進一步克隆(dna擴增)或用于表達。編碼多克隆或單克隆抗體的dna是容易分離的(例如,使用特異性結合編碼抗體的重鏈和輕鏈的基因的寡核苷酸探針),并使用常規(guī)方法即可測序。許多克隆和/或表達載體是市售可得的。載體組分通常包括但不限于以下的一個或多個:信號序列、復制起點、一個或多個標記基因、含有許多限制性內切核酸酶的識別序列的多克隆位點、增強子元件、啟動子和轉錄終止序列。表達和克隆載體都含有使載體能夠在一種或多種所選宿主細胞內復制的核酸序列。這樣的序列對于多種細菌、酵母和病毒是公知的。表達和克隆載體還可以包含稱為可選擇標記的選擇基因,所述選擇基因的表達賦予對抗生素或其它毒素的抗性,補充營養(yǎng)缺陷型缺陷或提供不能從復合培養(yǎng)基獲得的關鍵營養(yǎng)物。表達和克隆載體通常含有啟動子,所述啟動子被宿主生物識別并與編碼抗體(例如,能夠與含有n-乙?;咸前坊騨-乙?;?半乳糖胺的表位特異性結合的抗體)的核酸或其片段可操作地連接。適合與原核宿主一起使用的啟動子包括phoa啟動子、內酰胺酶和乳糖啟動子系統(tǒng)、堿性磷酸酶啟動子、色氨酸啟動子系統(tǒng)和雜交啟動子例如tac啟動子,盡管其它已知的細菌啟動子也是合適的。用于細菌系統(tǒng)的啟動子還將含有與編碼抗體和抗體片段的dna可操作地連接的夏因-達爾加諾(shine-dalgarno,s.d.)序列。啟動子序列對于真核生物是已知的,包括3-磷酸甘油酸激酶或其它糖酵解酶的酵母啟動子和從病毒基因組獲得的哺乳動物啟動子,所述病毒如多瘤病毒、巨細胞病毒且最優(yōu)選猿猴病毒40(simianvirus40,sv40)。各種異源哺乳動物啟動子,例如肌動蛋白啟動子、免疫球蛋白啟動子和熱休克啟動子也是已知的。用于真核宿主細胞內的表達載體還將含有終止轉錄和穩(wěn)定mrna所必需的序列。本發(fā)明的某些方面涉及具有載體的分離的宿主細胞,所述載體含有編碼抗體的核酸序列,所述抗體能夠與含有n-乙?;咸前坊騨-乙酰基-半乳糖胺的表位特異性結合。用于在載體中克隆或表達編碼抗體(例如,能夠與含有n-乙?;咸前坊騨-乙?;?半乳糖胺的表位特異性結合的抗體)或其片段的dna的合適的宿主細胞在本文描述為原核生物,例如革蘭氏陰性或革蘭氏陽性生物,例如腸桿菌科如大腸桿菌。除原核生物外,真核微生物例如絲狀真菌或酵母也是合適的克隆或表達宿主,例如釀酒酵母(saccharomycescerevisiae)。關于討論酵母和絲狀真菌用于生產治療性蛋白質的用途的綜述,參見例如gerngross,nat.biotech.22:1409-1414(2004)。用于表達糖基化抗體或抗體片段的合適的宿主細胞來自多細胞生物體。無脊椎動物細胞的實例包括植物和昆蟲細胞,例如草地貪夜蛾(spodopterafrugiperda,毛蟲)、埃及伊蚊(aedesaegypti,蚊子)、黑腹果蠅(drosophilamelanogaster,果蠅)或家蠶(bomhyxmori,蛾)細胞??捎玫牟溉閯游锼拗骷毎档膶嵗秊橛蓅v40轉化的猴腎cv1細胞系(cos-7,atcccrl1651);人胚腎細胞系(用于在懸浮培養(yǎng)基中生長的293或293細胞亞克隆,graham等,j.genvirol.36:59(1977));幼倉鼠腎細胞(bhk,atccccl10);中國倉鼠卵巢細胞/-dhfr(cho,urlaub等,proc.nat'lacad.sci.usa77:4216(1980));非洲綠猴腎細胞(vero-76,atcccrl-1587);人宮頸癌細胞(hela,atccccl2);和人肝癌細胞系(hepg2)。對于適合于抗體生產的某些哺乳動物宿主細胞系的綜述,參見例如yazaki和wu,methodsinmolecularbiology,第248卷(b.k.c.lo,ed.,humanapress,totowa,nj,2003),第255-268頁。這些實例是說明性而不是限制性的??贵w生產和純化本發(fā)明的某些方面涉及通過培養(yǎng)具有含有編碼抗體的核酸序列的載體的宿主細胞并從細胞培養(yǎng)物中回收抗體來產生抗體的方法。將宿主細胞用上述表達或克隆載體轉化以進行抗體或抗體片段生產,并在改良為適合誘導啟動子、篩選轉化體或擴增編碼所需序列的基因的常規(guī)營養(yǎng)培養(yǎng)基中進行培養(yǎng)。本文所述的用于產生抗體(例如,能夠與含有n-乙?;咸前坊騨-乙酰基-半乳糖胺的表位特異性結合的抗體)或抗體片段的宿主細胞可以在多種培養(yǎng)基中培養(yǎng)。市售的培養(yǎng)基如ham'sf10(sigma)、最低必需培養(yǎng)基((mem),sigma)、rpmi-1640(sigma)和杜爾貝科氏改良的伊戈爾氏培養(yǎng)基(dulbecco'smodifiedeagle'smedium,dmem),sigma)適合于培養(yǎng)宿主細胞。任何這些培養(yǎng)基可以根據(jù)需要補充激素和/或其它生長因子(例如胰島素、轉鐵蛋白或表皮生長因子)、鹽(例如氯化鈉、鈣、鎂和磷酸鹽)、緩沖液、核苷酸、抗生素、微量元素和葡萄糖或等效能量源。還可以包括本領域技術人員已知的合適濃度的任何其它必需的補充物。培養(yǎng)條件例如溫度、ph等,可沿用先前用于選擇用于表達的宿主細胞的條件,并且對于普通技術人員是顯而易見的。當使用重組技術時,抗體(例如,能夠與含有n-乙?;咸前坊騨-乙?;?半乳糖胺的表位特異性結合的抗體)或抗體片段可以在細胞內、在周質空間中產生,或直接分泌到培養(yǎng)基中。從這樣的細胞制備的抗體可以使用例如羥基磷灰石層析、凝膠電泳、透析和親和層析(例如使用連接到基質(例如瓊脂糖)上的蛋白質a或蛋白質g)來純化。一般來說,純化制備用于研究、測試和臨床應用的抗體的各種方法在本領域是公知的,所述各種方法與上述方法學一致和/或被本領域技術人員認為適合于所關注的特定抗體。v.癌癥本發(fā)明的某些方面涉及通過對個體給藥有效量的含有抗體的組合物來治療或預防個體中癌癥的方法,所述抗體能夠與含有n-乙?;咸前坊騨-乙酰基-半乳糖胺的表位特異性結合,其中,所述表位由癌細胞表達。在一些實施方式中,表位在癌細胞的細胞表面上表達。在一些實施方式中,抗體與癌細胞的細胞表面上表達的表位的結合抑制癌細胞的生長。本文描述的是如下出人意料的結果,即與正常人細胞的細胞表面上很少或沒有表達相比,許多類型的人癌細胞的細胞表面上高表達某些糖蛋白,特別是n-乙酰基葡糖胺和/或n-乙?;肴樘前贰R虼?,這些糖部分可以用作癌癥存在的生物標記物,所述生物標記物也可以用于優(yōu)先將治療劑(例如抗體)靶向到癌細胞。此外,本發(fā)明還描述可以如何方便地將對n-乙?;咸前泛?或n-乙?;?半乳糖胺特異的抗體結合到細胞表面并且能夠抑制表達這些糖部分的癌細胞的生長。本文所述的結果證明,能夠與含有n-乙?;咸前坊騨-乙?;?半乳糖胺的表位特異性結合的抗體在抑制許多不同類型的癌細胞的生長方面廣泛有效。這種特性已通過體外使用人癌細胞系證明。重要的是,使用腫瘤異種移植模型的實驗進一步確立了能夠與含有n-乙?;咸前坊騨-乙?;?半乳糖胺的表位特異性結合的抗體在體內抑制人癌細胞生長的療效。這種腫瘤異種移植模型是本領域中已知用于測試和預測人腫瘤的藥物反應的有力工具(參見例如richmond,a.和su,y.(2008)dis.modelmech.1(2-3):78-82)。本文所述的結果預測能夠與含有n-乙?;咸前坊騨-乙?;?半乳糖胺的表位特異性結合的抗體對多種形式的人癌癥廣泛有效,而在一些實施方式中,生長被所述抗體抑制的癌細胞選自:膠質瘤細胞、肝癌細胞、肺癌細胞、乳腺癌細胞、卵巢癌細胞、宮頸腺癌細胞、結腸癌細胞、胃癌或胃部癌癥細胞、食管癌細胞和纖維肉瘤細胞。在一些實施方式中,癌細胞是膠質瘤細胞。膠質瘤細胞可以指源自膠質細胞的任何惡性細胞,例如腦或脊髓的膠質細胞,包括原發(fā)性腫瘤或已轉移至其它部位的膠質瘤細胞。膠質瘤細胞可以指膠質瘤細胞的均質群體或由不同類型的膠質細胞產生的混合細胞群體。在一些實施方式中,膠質瘤細胞可以是星形細胞瘤細胞。在一些實施方式中,膠質瘤細胞可以是少突膠質瘤細胞、腦干膠質瘤細胞、室管膜瘤細胞或視膠質瘤細胞。在一些實施方式中,癌細胞是肝癌細胞。肝癌細胞可以指源自肝臟的任何癌細胞,包括原發(fā)性腫瘤或已轉移至其它部位的肝癌細胞。在一些實施方式中,癌細胞是肺癌細胞。肺癌細胞可以指源自肺的任何癌細胞,包括原發(fā)性腫瘤或已轉移至其它部位的肺癌細胞。在一些實施方式中,所述肺癌細胞可以是非小細胞肺癌細胞。在一些實施方式中,肺癌細胞可以是肺腺癌細胞。在一些實施方式中,肺癌細胞可以是肺鱗狀細胞癌。在一些實施方式中,肺癌細胞可以是小細胞肺癌細胞。在一些實施方式中,癌細胞是乳腺癌細胞。乳腺癌細胞可以指源自乳腺的任何癌細胞,包括原發(fā)性腫瘤或已轉移到其它部位的乳腺癌細胞。在一些實施方式中,乳腺癌細胞可以是導管原位癌細胞。在一些實施方式中,乳腺癌細胞可以是浸潤性導管癌細胞。在一些實施方式中,乳腺癌細胞可以是浸潤性小葉癌細胞。在一些實施方式中,癌細胞是卵巢癌細胞。卵巢癌細胞可以指源自卵巢的任何癌細胞,包括原發(fā)性腫瘤或已轉移至其它部位的卵巢癌細胞。在一些實施方式中,卵巢癌細胞可以是表面上皮間質腫瘤細胞。在一些實施方式中,卵巢癌細胞可以是性索間質腫瘤細胞。在一些實施方式中,卵巢癌細胞可以是生殖細胞腫瘤細胞。卵巢癌細胞可以指卵巢癌細胞的同質群體或由不同類型的卵巢癌產生的混合細胞群體。在一些實施方式中,癌細胞是宮頸腺癌細胞。宮頸腺癌細胞可指源自子宮頸的任何腺癌細胞,包括原發(fā)性腫瘤或已轉移至其它部位的宮頸腺癌細胞。在一些實施方式中,宮頸腺癌細胞是腺鱗癌細胞。在一些實施方式中,癌細胞是結腸癌細胞。結腸癌細胞可以指源自結腸或直腸的任何癌細胞,包括原發(fā)性腫瘤或已轉移到其它部位的結腸癌細胞。在一些實施方式中,結腸癌細胞是腺癌細胞。在一些實施方式中,結腸癌細胞是腺鱗癌細胞。在一些實施方式中,癌細胞是胃癌或胃部癌癥細胞。胃癌或胃部癌癥細胞可以指來源于胃的任何癌細胞,包括原發(fā)性腫瘤或已轉移至其它部位的胃癌細胞。在一些實施方式中,胃癌或胃部癌癥細胞是腺癌細胞。在一些實施方式中,胃癌或胃部癌癥細胞是彌漫型腺癌(粘液型、膠質、革囊、皮革樣胃)細胞。在一些實施方式中,胃癌或胃部癌癥細胞是淋巴瘤細胞。在一些實施方式中,癌細胞是食管癌細胞。食管癌細胞可以指源自食管的任何癌細胞,包括原發(fā)性腫瘤或已轉移至其它部位的食管癌細胞。在一些實施方式中,食管癌細胞是腺癌細胞。在一些實施方式中,食管癌細胞是鱗狀癌細胞。在一些實施方式中,癌細胞是纖維肉瘤細胞。纖維肉瘤細胞可以指源自纖維結締組織的任何癌細胞,包括原發(fā)性腫瘤或已轉移至其它部位的食管癌細胞。vi.胃腸道疾病本發(fā)明的某些方面涉及通過對個體給藥有效量的含有能夠與含有n-乙酰基葡糖胺或n-乙?;?半乳糖胺的表位特異性結合的抗體的組合物來治療或預防胃腸道疾病的方法,其中所述表位由炎癥細胞表達。在一些實施方式中,所述表位在炎癥細胞的細胞表面上表達。在一些實施方式中,炎癥細胞是結腸炎、炎癥性腸病或胃腸炎的腸炎癥細胞,并且所述表位在炎癥細胞的細胞表面上表達。如本文所述,特異性識別含有n-乙?;咸前坊騨-乙?;?半乳糖胺的表位的抗體可以在結腸中的炎癥部位(例如在以結腸炎癥(例如,結腸炎、ibd或胃腸炎)為特征的疾病中所見的炎癥部位)結合到炎癥細胞(例如,白細胞,例如嗜中性粒細胞、巨噬細胞、單核細胞、嗜酸性粒細胞和/或嗜堿粒細胞)。vii.治療方法癌癥本發(fā)明的某些方面涉及通過對個體給藥有效量的含有能夠與含有n-乙?;咸前坊騨-乙?;?半乳糖胺的表位特異性結合的抗體的組合物來治療或預防個體中癌癥的方法。本文描述的意料不到的發(fā)現(xiàn)是,能夠與在癌細胞的細胞表面上或在癌細胞內表達的含有n-乙?;咸前坊騨-乙?;?半乳糖胺的表位特異性結合的抗體可以用于抑制多種癌癥細胞的生長。在一些實施方式中,抗體與癌細胞的細胞表面上表達的表位的結合抑制癌細胞的生長。在一些實施方式中,癌癥可以包括腦癌、肝癌、肺癌、乳腺癌、卵巢癌、宮頸癌、結腸癌、胃癌、食管癌和纖維肉瘤。由于本發(fā)明證明許多類型的癌組織表達高水平的n-乙?;咸前坊騨-乙?;?半乳糖胺,本文所述的方法可廣泛有效地治療許多類型的癌癥。在一些實施方式中,待治療或預防的癌癥是指以腦癌、肝癌、肺癌、乳腺癌、卵巢癌、宮頸癌、結腸癌、胃癌、食管癌,或纖維肉瘤的原發(fā)性腫瘤為代表的原發(fā)性腫瘤。在一些實施方式中,待治療或預防的癌癥是指最初以腦癌、肝癌、肺癌、乳腺癌、卵巢癌、宮頸癌結腸癌、胃癌、食管癌或纖維肉瘤為代表的轉移性癌癥。在一些實施方式中,待治療或預防的癌癥是腦癌。腦癌可以指源自腦的任何癌癥,包括但不限于由上述細胞產生的癌癥。腦癌的實例可以包括但不限于神經膠質瘤、腦膜瘤、神經鞘瘤和垂體腺瘤。腦癌也可以指源自中樞神經系統(tǒng),例如脊柱的癌癥。在一些實施方式中,待治療或預防的癌癥是肝癌。肝癌可以指源自肝臟的任何癌癥,包括但不限于由上述細胞產生的癌癥。肝癌的實例可包括但不限于肝癌、膽管癌和肝母細胞瘤。在一些實施方式中,待治療或預防的癌癥是肺癌。肺癌可以指源自肺的任何癌癥,包括但不限于由上述細胞產生的癌癥。肺癌的實例可包括但不限于非小細胞肺癌,包括腺癌、鱗狀細胞癌和大細胞癌,以及小細胞肺癌。在一些實施方式中,待治療或預防的癌癥是乳腺癌。乳腺癌可以指源自乳腺的任何癌癥,包括但不限于由上述細胞產生的癌癥。乳腺癌的實例可包括但不限于導管原位癌、浸潤性導管癌、三陰性乳腺癌(例如對孕酮、雌激素和her2/neu受體陰性的細胞產生的癌癥)和炎癥乳腺癌。在一些實施方式中,待治療或預防的癌癥是卵巢癌。卵巢癌可以指源自卵巢的任何癌癥,包括但不限于由上述細胞產生的癌癥。卵巢癌的實例可包括但不限于表面上皮間質腫瘤(包括例如子宮內膜樣腫瘤、粘液性囊腺癌和漿液性腫瘤)、生殖細胞腫瘤、性索間質腫瘤和混合型卵巢腫瘤。在一些實施方式中,待治療或預防的癌癥是宮頸癌。宮頸癌可以指源自宮頸的任何癌癥,包括但不限于由上述細胞產生的癌癥。宮頸癌的實例可包括但不限于鱗狀細胞癌、腺癌、小細胞癌、腺鱗狀癌、神經內分泌腫瘤、絨毛腺型腺癌(villoglandularadenocarcinomas)和玻璃狀細胞癌。在一些實施方式中,待治療或預防的癌癥是結腸癌。結腸癌可以指源自結腸或直腸的任何癌癥,包括但不限于由上述細胞產生的癌癥。結腸癌的實例可包括但不限于腺癌和腺鱗癌。在一些實施方式中,待治療或預防的癌癥是胃癌或胃部癌癥。胃癌或胃部癌癥可以指源自胃的任何癌癥,包括但不限于由上述細胞產生的癌癥。胃癌或胃部癌癥的實例可以包括但不限于腺癌、彌漫型腺癌(粘液性、膠質、革囊、皮革樣胃)和淋巴瘤。在一些實施方式中,待治療或預防的癌癥是食管癌。食管癌可以指源自食管的任何癌癥,包括但不限于由上述細胞產生的癌癥。食管癌的實例可包括但不限于腺癌和鱗狀癌。在一些實施方式中,待治療或預防的癌癥是纖維肉瘤。纖維肉瘤可以指源自纖維結締組織的任何癌,包括但不限于由上述細胞產生的癌。給藥和聯(lián)合治療本領域已知的任意方法可用于給藥有效量的含有能夠與含有n-乙?;咸前坊騨-乙?;?半乳糖胺的表位特異性結合的抗體的組合物,例如靜脈內給藥,推注或在一段時間內連續(xù)灌注,通過肌內、腹膜內、腦脊髓內、皮下,關節(jié)內、滑膜腔內、鞘內、口服、局部或吸入途徑給藥。在一些實施方式中,抗體通過口服給藥。在一些實施方式中,組合物含有能夠與含有n-乙?;咸前坊騨-乙?;?半乳糖胺的表位特異性結合的抗體和另外的蛋白質,例如不特異性結合含有n-乙酰基葡糖胺或n-乙?;?半乳糖胺的另外的蛋白質??梢酝ㄟ^本領域已知的任何方法確定含有能夠與含有n-乙?;咸前坊騨-乙?;?半乳糖胺的表位特異性結合的抗體的組合物的有效量,并且可以取決于如上所述的個體的許多特征。本發(fā)明的某些方面涉及通過對個體給藥有效量的含有能夠與含有n-乙酰基葡糖胺或n-乙?;?半乳糖胺的表位特異性結合的抗體和一定量的另外的抗癌劑的組合物來治療或預防個體中癌癥的方法,其中所述抗體和抗癌劑聯(lián)合提供個體的癌癥的有效治療或預防。本領域已知的任何合適的抗癌劑可以與本文所述的抗體組合使用??拱﹦┛砂贵w(包括抗體-藥物綴合物)、小分子、免疫治療劑、分化誘導劑、靶向治療劑和激素。在一些實施方式中,抗癌劑是化療劑。許多類型的化療劑是本領域已知的?;焺┑膶嵗梢园ǖ幌抻诳勾x物(例如5-氟尿嘧啶或卡培他濱)、蒽環(huán)類藥物、抗腫瘤抗生素(例如放線菌素d、絲裂霉素c或博來霉素)、有絲分裂抑制劑(例如紫杉烷類,例如或埃坡霉素)、皮質類固醇、拓撲異構酶抑制劑(例如依托泊苷)、烷化劑和鉑藥物(例如順鉑、草丁鉑或卡鉑)。這些藥物作為本領域技術人員的實例提供,并且決不意圖限制化療劑的選擇。胃腸道疾病本發(fā)明的某些方面涉及通過對個體給藥有效量的組合物來治療或預防個體中的胃腸道疾病的方法,所述組合物含有能夠與含有n-乙?;咸前坊騨-乙酰基-半乳糖胺的表位特異性結合的抗體。本文描述的意料不到的發(fā)現(xiàn)是,與在炎癥細胞的細胞表面上表達的含有n-乙?;咸前坊騨-乙酰基-半乳糖胺的表位特異性結合的抗體可用于治療或預防各種胃腸道疾病,包括自身免疫和感染性疾病。如本文所述,本發(fā)明的方法對于個體中的各種胃腸道疾病是有效的。在一些實施方式中,個體患有炎癥性腸病。本發(fā)明的炎癥性腸病可以是慢性或急性的。如本領域已知的,許多胃腸道疾病例如炎癥性腸病可在組織中呈現(xiàn)癥狀,包括但不限于小腸和大腸、口、胃、食管和肛門。在一些實施方式中,炎癥性腸病可包括結腸炎(例如轉移性、淋巴細胞性、膠原性或不確定性結腸炎)或貝切特病(behcet'sdisease)。在一些實施方式中,個體患有克羅恩病。在一些實施方式中,個體患有潰瘍性結腸炎。在一些實施方式中,個體患有急性感染性胃腸炎。在一些實施方式中,個體患有痔瘡。在一些實施方式中,個體患有由病毒感染引起的胃腸道疾病。已知引起胃腸道疾病的病毒可包括但不限于輪狀病毒、諾如病毒(noroviruses)、腺病毒和星狀病毒。在一些實施方式中,病毒感染是輪狀病毒感染。在一些實施方式中,患有胃腸道疾病的個體是人。在一些實施方式中,患有胃腸道疾病的個體是非人動物。適用于給藥用于治療或預防胃腸道疾病的組合物的許多方法是本領域已知的。在一些實施方式中,本發(fā)明的抗體可以經靜脈內、肌內、皮下、局部、口服、經皮、腹膜內、眶內、通過植入、通過吸入、鞘內、心室內或鼻內給藥。viii.檢測方法本發(fā)明的某些方面涉及通過以下步驟檢測個體中的癌細胞的存在的方法:從個體獲得生物樣品,使生物樣品與特異性結合含有n-乙?;咸前坊騨-乙?;?半乳糖胺的表位的抗體接觸,以及檢測與生物樣品結合的抗體的量,其中抗體結合指示個體中的癌細胞的存在。有利地,本發(fā)明描述了特異性結合含有n-乙?;咸前坊騨-乙?;?半乳糖胺的表位的抗體可如何用于檢測個體中癌癥的存在,這是由于血清樣品中的n-乙?;咸前坊騨-乙酰基-半乳糖胺的水平升高和癌癥存在之間的相關性。這些方法可用于檢測許多類型的癌癥,包括但不限于肺癌、肝癌、乳腺癌、結腸癌或結腸直腸癌、食管癌、胃癌、子宮內膜癌、宮頸癌、甲狀腺癌、腦癌和淋巴瘤??贵w與含有n-乙?;咸前坊騨-乙?;?半乳糖胺的表位之間的特異性結合可以通過本領域已知的任意方法進行檢測。用于檢測抗體和表位之間的結合的方法是本領域熟知的,可以包括elisa(酶聯(lián)免疫吸附測定)免疫組織化學(ihc)測定、免疫熒光測定、流式細胞術、ctc(circulatingtumorcell,血循環(huán)腫瘤細胞)測定和免疫膠體金測定。這些示例性測定是本領域技術人員公知的;對于更詳細的描述,參見例如,harlow和lane,eds.(1988)antibodies,alaboratorymanual。elisa的實例可包括直接法、間接法、競爭法和夾心法elisa??梢允褂萌魏伪砻?,包括但不限于板(例如96孔板)或柱子。在一些實施方式中,可以將如上所述檢測到的結合到含有n-乙?;咸前坊騨-乙酰基-半乳糖胺的表位的抗體的量與使用對照樣品檢測到的抗體結合的量進行比較。與結合到對照樣品的抗體的量相比,結合到生物樣品的抗體的量升高可以指示所述個體中的癌細胞的存在。如上所述,對照樣品可以用來自待測個體的生物樣品進行制備。對照樣品的實例可以包括來自未患癌癥的個體的樣品或具有已知量的n-乙?;咸前泛?或n-乙?;?半乳糖胺的樣品。作為非限制性實例,可以使用本文所述的方法測試來自待測個體的血清,并與來自健康(即未患癌癥)的個體的血清進行比較。在這種情況下,與健康個體或具有已知量的n-乙?;咸前泛?或n-乙?;?半乳糖胺的血清相比,來自待測個體的血清中的抗體結合升高可指示待測個體中存在癌細胞。任何體液或切片都可以用作本發(fā)明的生物樣品。生物樣品的實例可包括但不限于血液、血清、尿液、糞便、乳汁、精液、唾液、胸液、腹腔液、腦脊液、痰液和任何其它體液或分泌物。如本文所示,可以使用本文所述的方法在個體中檢測許多類型的癌細胞。可在個體中檢測的癌細胞的實例包括但不限于肺癌細胞、肝癌細胞、乳腺癌細胞、結腸癌或結腸直腸癌細胞、食管癌細胞、胃癌細胞、子宮內膜癌細胞、宮頸癌細胞、甲狀腺癌細胞、腦癌細胞和淋巴瘤細胞。此外,糖類相關的生物標記物本身可用于檢測患有癌癥或其它疾病的受試者中的自身抗體。這些自身抗體可以與糖類結合,所述糖類在癌癥組織或其它患病組織或細胞上或其中差異性表達或釋放到血液、尿液、糞便、乳汁、精液、唾液和體液或分泌物中。體液或分泌物可以包括但不限于胸液、腹腔液、腦脊液、痰和器官涂片。在一些實施方式中,糖類相關的生物標記物可包括但不限于n-乙?;?葡糖胺、n-乙酰基-半乳糖胺或巖藻糖,或攜帶明顯的n-乙?;咸前贰-乙?;?半乳糖胺或巖藻糖的糖綴合物。ix.試劑盒本發(fā)明的某些方面涉及包含藥物組合物的試劑盒,所述藥物組合物含有能夠與含有n-乙酰基葡糖胺或n-乙?;?半乳糖胺的表位特異性結合的抗體。在一些實施方式中,所述試劑盒還可以包括用于對個體給藥有效量的藥物組合物以治療癌癥的說明書。這些說明書可以指通常包括在藥物的商業(yè)包裝中的說明書,所述說明書包含關于通常包括在藥物的商業(yè)包裝中的指示性信息,所述說明書包含關于適應癥、用法、劑量、給藥、禁忌癥、與包裝產品組合的其它藥物和/或關于使用這些藥物的注意事項等信息。用于本發(fā)明的試劑盒的合適的容器包括例如瓶、小瓶(例如雙腔瓶)、注射器(例如單室或雙室注射器)和試管。制造的制品還可包括在容器上或與容器相關聯(lián)的標簽或包裝插件,其可指示沖調和/或使用制劑的指導。標簽或包裝插件可進一步指示所述制劑可用于或預期用于口服或其它給藥方式以治療或預防個體中的癌癥。制造的制品還可包括商業(yè)、治療和用戶角度所需的其它材料,包括其它緩沖液、稀釋劑、過濾器、針頭、注射器和具有使用說明的包裝插件。在一些實施方式中,包含藥物組合物的試劑盒可以進一步包含用于檢測個體中的癌細胞的存在的說明書,所述藥物組合物含有能夠與含有n-乙酰基葡糖胺或n-乙?;?半乳糖胺的表位特異性結合的抗體。這些說明書可以指通常包括在elisa測定試劑盒、免疫組織化學(ihc)測定試劑盒、免疫熒光測定試劑盒、流式細胞術測定試劑盒、ctc(血循環(huán)腫瘤細胞)測定試劑盒和免疫膠體金測定試劑盒的商業(yè)包裝中的說明書。本發(fā)明的試劑盒還可以含有有助于檢測個體中的癌細胞存在的任何其它試劑,例如96孔微孔板、非特異性蛋白例如牛血清白蛋白、結合到本發(fā)明的抗體而不影響其抗原結合的第二抗體和用于檢測例如熒光或發(fā)光標記的試劑,或產生可檢測信號的酶和底物(例如辣根過氧化物酶和tmb)。本發(fā)明的某些方面涉及試劑盒,所述試劑盒包含藥物組合物和使用所述藥物組合物以檢測患有癌癥或炎癥的個體中的自身抗體的存在的說明書或其它試劑,所述藥物組合物含有n-乙?;咸前坊騨-乙?;?半乳糖胺。這些說明書可以指通常包括在elisa測定試劑盒、免疫組織化學(ihc)測定試劑盒、免疫熒光測定試劑盒、流式細胞術測定試劑盒、ctc(血循環(huán)腫瘤細胞)測定試劑盒和免疫膠體金測定試劑盒的商業(yè)包裝中的說明書。本發(fā)明的試劑盒還可以含有有助于檢測個體中的癌細胞存在的任何其它試劑,例如96孔微孔板,非特異性蛋白如牛血清白蛋白、結合到本發(fā)明的抗體而不影響其抗原結合的第二抗體和用于檢測例如熒光或發(fā)光標記的試劑,或產生可檢測信號的酶和底物(例如辣根過氧化物酶和tmb)。本說明書被認為足以使本領域技術人員能夠實施本發(fā)明。除了本文所示和所述的那些之外,根據(jù)前述描述,本發(fā)明的各種修改對本領域技術人員將是顯而易見的,并且落入隨附權利要求書的范圍內。出于所有目的,本文引用的所有出版物、專利文件和專利申請文件通過引用以其整體并入本文。實施例通過參考以下實施例將更充分地理解本發(fā)明。然而,它們不應被解釋為限制本發(fā)明的范圍。應當理解,本文所述的實施例和實施方式僅用于說明目的,并且本領域技術人員將建議根據(jù)其進行各種修改或改變,并且這些修改或改變包括在本申請的精神和范圍內,和隨附權利要求書的范圍內。實施例1:n-乙酰基葡糖胺和n-乙?;?半乳糖胺在癌細胞上的表達更傾向于由癌細胞而不是正常人細胞表達的生物標記物的識別可以允許設計新的檢測和治療途徑以幫助診斷、治療和/或預防癌癥。為了滿足這種需求,本文描述了與n-乙酰基葡糖胺和n-乙?;?半乳糖胺結合的單克隆抗體。這些結果部分基于意料不到的發(fā)現(xiàn),即n-乙?;咸前泛蚽-乙?;?半乳糖胺在許多完全不同的癌細胞的表面上表達,但在正常人組織中微量表達或沒有表達。其結果是,單克隆抗體可能在癌癥的診斷、治療和/或預防中具有極大的潛在用途,所述單克隆抗體與n-乙?;咸前泛蚽-乙酰基-半乳糖胺結合并抑制癌細胞生長。材料和方法組織陣列用組織陣列芯片檢測小麥胚芽凝集素(wga)與人健康和惡性組織的結合。該芯片含有來自fda推薦的正常人器官和來自癌癥患者的惡性組織的表位(imgenex,sandiego;和usbiomax,rockville,md,usa)。對于組織陣列的更詳細的描述,參見wo2009126652。免疫組織化學用植物凝集素的免疫組織化學(ihc)測定用于識別與癌癥和其它疾病相關的與糖類相關的生物靶標或標記物。健康或癌癥人組織用以下植物凝集素染色:生物素化小麥胚芽凝集素(wga),其特異性識別n-乙酰基葡糖胺;生物素化的荊豆凝集素i(biotinylated-ulexeuropaeusagglutinin,ueai),其特異性識別巖藻糖;生物素化大豆凝集素(sba)或雙花扁豆凝集素(dolichosbiflorusagglutinin,dba),其特異性識別n-乙?;?半乳糖胺;生物素化花生凝集素(pna),其特異性識別半乳糖;生物素化蓖麻凝集素(rcai或rac120),其特異性識別半乳糖和n-乙?;?半乳糖胺;和生物素化伴刀豆球蛋白a(cona),其特異性識別甘露糖。所有植物凝集素由vectorlaboratories,burlingame,ca,usa提供。辣根過氧化物酶親和素d(hrpavidind)和vectastainabc試劑盒(vectorlaboratories,burlingame,ca,usa)用作第二試劑和過氧化物酶底物。單克隆抗體的產生用來自代表肺癌(a549)、肝癌(hep-g2)和結腸癌(sw11/b)的人腫瘤細胞系的裂解物的混合物免疫balb/c小鼠。通過將骨髓瘤細胞與已經用人腫瘤抗原免疫的小鼠的脾細胞融合來制備雜交瘤細胞。使用乙酰基-葡糖胺或n-乙?;?半乳糖胺作為篩選抗原通過elisa選出結合n-乙酰基葡糖胺或n-乙?;?半乳糖胺的單克隆抗體。用于小鼠免疫、產生雜交瘤細胞和基于elisa的篩選的方法是本領域已知的。與糖蛋白和腫瘤抗原結合的抗體的elisa測定研發(fā)了elisa測定,用于檢測單克隆抗體與n-乙?;咸前贰-乙?;?半乳糖胺和人腫瘤抗原的結合。簡要地講,用人腫瘤抗原(0.25mg/ml)100μl/孔包被96孔elisa板,一式兩份。陽性對照包括一式兩份的n-乙酰基葡糖胺(0.25mg/ml)和n-乙?;?半乳糖胺(0.25mg/ml),100μl/孔。磷酸鹽緩沖鹽水(pbs)用作陰性對照。辣根過氧化物酶(hrp)標記的抗小鼠igg用作第二試劑,和tmb(3,3',5,5'-四甲基聯(lián)苯胺)過氧化物酶eia底物試劑盒(bio-rad,hercules,ca,usa)用于檢測hrp標記的抗體。在od450下通過elisa檢測儀讀板。腫瘤細胞生長的mtt測定研發(fā)了mtt測定,用于檢測本發(fā)明公開的單克隆抗體對人腫瘤細胞的體外抑制。簡要地講,將鋪有約50%人腫瘤細胞的96孔組織培養(yǎng)板與不同濃度的單克隆抗體共同培育48小時。然后除去每個孔的培養(yǎng)基,并用100μl新鮮培養(yǎng)基替換。向各孔中加入10μl的12mmmtt(3-(4,5-二甲基噻唑-2-基)-2,5-二苯基溴化四唑)儲備液,并將10μl的mtt儲備液加入到100μl單獨的培養(yǎng)基中作為陰性對照。將板在37℃下孵育4小時,然后向每個孔中加入50μldmso并充分混合。然后使用570nm的吸光度讀板。異種移植物簡要地講,將3-4周齡的雌性c.b-17scid大鼠(harlan,madison,wi)隨機分成三組(每組3只小鼠)。每只小鼠通過皮下注射接種5×106個a549細胞;隨后在細胞接種后第10、14、17和21天每天靜脈內(iv)注射鹽水(載體對照)、小麥胚芽凝集素(wga)或單克隆抗體3c4f12一次。一劑量的wga是5μgwga溶于100μl鹽水。一劑量的單克隆抗體3c4f12是50μg抗體溶于100μl鹽水。從細胞植入后第10天每周測量腫瘤生長兩次。使用以下公式計算腫瘤大?。洪L度×(寬度/2)×2π=腫瘤大小基于elisa的血液檢測簡要地講,用來自癌癥患者的人血清以80μl/孔一式兩份地包被96孔elisa板。陽性對照以100μl/孔一式兩份地包被n-乙?;咸前?0.25mg/ml)。pbs用作空白對照。mab-1c5c9(2-5μg/ml,100μl/孔)用作檢測抗體。辣根過氧化物酶(hrp)標記的抗小鼠igg用作第二試劑,并使用tmb(3,3',5,5'-四甲基聯(lián)苯胺)過氧化物酶eia底物試劑盒(bio-rad,hercules,ca,usa)檢測hrp標記的抗體。在od450下通過elisa檢測儀讀板?;趏d450的值確定結果。流式細胞分析法檢測簡要地講,將來自健康個體或癌癥患者的100μl新鮮血液分別用2f7h4、1c5c9和1b3e12單克隆抗體和用熒光標記的山羊抗小鼠igg染色。然后用紅細胞裂解緩沖液破壞紅細胞。用流式細胞儀檢測外周血單核細胞(pbmc)中的熒光陽性細胞。結果使用上述材料和方法中描述的植物凝集素作為探針,使用免疫組織化學檢查正常和癌癥人組織中的各種糖蛋白的表達。特異性檢測n-乙?;咸前返纳锼鼗←溑哐磕厝旧拇韴D顯示在圖1中(分別比較圖1a中的健康組織與圖1b和圖1c中的癌旁組織和癌組織)。這些實驗證明了除骨髓、唾液腺和垂體之外大多數(shù)正常人體器官中微量或沒有n-乙?;咸前返谋磉_。相比之下,發(fā)現(xiàn)以下癌變組織表達n-乙?;咸前罚浩つw惡性黑素瘤、腦惡性少突膠質細胞瘤、腎透明細胞癌、皮膚基底細胞癌、喉癌、霍奇金淋巴瘤、結腸中間級間質瘤、甲狀腺髓樣癌和皮膚鱗狀細胞癌。這些結果的定量如表1所示。表1表1.glcnac*在癌變組織上或癌變組織中的表達*glcnac=n-乙?;咸前窞榱诉M一步檢查各種糖蛋白在癌細胞上的表達,將轉化的細胞系hep-g2和hek-293用生物素化凝集素和熒光標記的鏈霉親和素的免疫熒光檢測中染色。如圖2所示,特異性識別n-乙酰基葡糖胺的小麥胚芽凝集素對hep-g2和hek-293細胞兩者產生強染色(圖2a)。特異性識別n-乙酰基-半乳糖胺的大豆凝集素(sba)給hek-293細胞染色(圖2b)。這些結果表明,與在正常人細胞的細胞表面上微量表達或沒有表達相比,某些糖蛋白,特別是n-乙?;咸前泛蚽-乙酰基-半乳糖胺在許多類型的人癌細胞的細胞表面上高表達。有時n-乙?;咸前泛蚽-乙酰基-半乳糖胺在癌細胞內高表達(例如,圖2a:hep-g2細胞)。因此,n-乙?;咸前泛蚽-乙酰基-半乳糖胺可以用作治療癌癥的生物標記物或潛在的治療靶標。類似地,與癌癥和其它疾病(例如炎癥)相關的其它糖類相關生物靶標或標記物可以通過尋找對其它患病組織特有的其它糖類特異的其它凝集素的結合,并將其與人、動物的健康組織或如上所述的各種腫瘤細胞系比較而容易識別。實施例2:識別n-乙酰基葡糖胺和n-乙酰基-半乳糖胺的單克隆抗體的產生上述結果證明如下意料不到的發(fā)現(xiàn),n-乙?;咸前泛?或n-乙?;?半乳糖胺更傾向在人癌變組織和細胞系的范圍內表達,但在大多數(shù)正常人組織微量有或沒有表達。因此,可以通過使用能夠結合懷疑患有癌癥的受試者生物樣品中的n-乙酰基葡糖胺和/或n-乙?;?半乳糖胺的分子來檢測n-乙酰基葡糖胺和/或n-乙?;?半乳糖胺的存在,從而開發(fā)用于診斷癌癥的方法。此外,結合并抑制表達n-乙酰基葡糖胺和/或n-乙?;?半乳糖胺的癌細胞生長的試劑或抑制與n-乙酰基葡糖胺和/或n-乙?;?半乳糖胺的表達相關途徑的試劑可以潛在用于治療和/或預防癌癥。為了實現(xiàn)該目標,本文描述了特異性識別n-乙酰基葡糖胺和/或n-乙?;?半乳糖胺的單克隆抗體。用來自代表肺癌(a549)、肝癌(hep-g2)和結腸癌(sw11/b)的人腫瘤細胞系的裂解物的混合物免疫小鼠。如上所述產生雜交瘤并選擇抗體。獲得的單克隆抗體包括1b3e12、3c4f12、7e6a10、1c5c9、2f7h4、7c10h11、4c8c12、7e6c12、4e1g10、8d9b12、7g1e12和4h6h7。使用上述的elisa檢測法測試那些單克隆抗體對n-乙?;咸前贰-乙?;?半乳糖胺和人腫瘤抗原的特異性。測試抗體對來自各種人腫瘤細胞系(包括smmc-7721(肝癌)、nci-h446(小細胞肺癌)、spc-a-1(肺腺癌)、mcf-7(乳腺癌)、sw11/b(結腸癌)和ecap-1090(食管腺癌))的反應性。基于如表2所述的od450nm值對樣品進行評分。表2elisa結果od450陰性(-)<0.25介于兩者之間(±)0.25-0.30陽性(+)0.31-0.49陽性(2+)0.50-0.75陽性(3+)0.76-0.99陽性(4+)≥1.00基于elisa的篩選的結果顯示在圖3中。這些結果證明單克隆抗體1b3e12、3c4f12、7e6a10、1c5c9、2f7h4、7c10h11、4c8c12、7e6c12、8d9b12和7g1e12與n-乙?;咸前泛蚽-乙?;?半乳糖胺結合。這些單克隆抗體也可能與攜帶明顯的n-乙酰基葡糖胺或n-乙?;?半乳糖胺的糖綴合物結合。此外,一些單克隆抗體能夠結合人腫瘤抗原,如圖3所示。不希望受理論束縛,這些結果可能表明,圖3中列出的腫瘤抗原包括n-乙?;咸前泛?或n-乙?;?半乳糖胺,或者包括攜帶明顯的n-乙?;咸前坊騨-乙?;?半乳糖胺部分的糖綴合物。這些結果表述了識別n-乙?;咸前泛?或n-乙?;咸前返男滦蛦慰寺】贵w的產生。實施例3:識別n-乙酰基-葡糖胺和n-乙?;肴樘前返膯慰寺】贵w在體外抑制癌細胞生長前述的實施例證明了識別n-乙酰基葡糖胺和/或n-乙?;?半乳糖胺的單克隆抗體的產生。隨后測試了這些抗體在體外阻斷各種癌細胞系生長的能力。為了測試選擇的抗體,使用上述mtt生長檢測來檢查用各個抗體處理將如何影響人癌細胞系u251(神經膠質瘤)、smmc-7721(肝癌)、nci-h466(小細胞肺癌)、sk-mes-1(肺鱗狀細胞癌)、spc-a1(肺腺癌)、mcf-7(人乳腺癌)、skov-3(人卵巢癌)、hela(宮頸癌)的增殖(例如生長速率)。在每個實驗中,在一定濃度范圍(即劑量)下測試抗體。圖4顯示單克隆抗體2f7h4對各種人細胞系增殖的影響。在多個濃度下,2f7h4抑制至少50%的u251和spc-a1細胞的細胞生長。因此,單克隆抗體2f7h4具有治療或診斷多種人癌癥的潛力,包括但不限于腦腫瘤,例如神經膠質瘤;和肺癌,例如腺癌。圖5顯示單克隆抗體1c5c9對各種人細胞系增殖的影響。在多個濃度下,1c5c9抑制至少50%的u251、smmc、sk-mes-1和spc-a1細胞的細胞生長。因此,單克隆抗體1c5c9具有治療或診斷多種人癌癥的潛力,包括但不限于腦腫瘤,例如神經膠質瘤;肝癌;和肺癌,例如肺鱗狀細胞癌和腺癌。圖6顯示單克隆抗體3c4f12對各種人細胞系增殖的影響。在多個濃度下,3c4f12抑制至少50%的nci-h446和sk-mes-1細胞的細胞生長。因此,單克隆抗體3c4f12具有治療或診斷多種人癌癥的潛力,包括但不限于肺癌、例如小細胞肺癌和肺鱗狀細胞癌。圖7顯示各種單克隆抗體對mcf-7(乳腺癌)、skov-3(卵巢癌)和hela(宮頸癌)人癌細胞系的生長速度的影響。這些結果表明,當以1.0μg/ml給藥時,單克隆抗體7e6c12、8d9b12、1c5c9、3c4f12、2f7h4和7c10h11抑制超過50%的mcf-7、skov-3和hela細胞的細胞生長。因此,這些單克隆抗體具有治療或診斷人乳腺癌、卵巢癌和宮頸癌的潛力。此外,單克隆抗體1b3e12促進了三種腫瘤細胞系的細胞生長。雖然單克隆抗體1b3e12可能不適合治療這三種癌癥,但它可用于診斷這些癌癥。圖8顯示各種單克隆抗體對sw11/b(結腸癌)、ecap-1090(食管腺癌)、hutu-80(十二指腸腺癌)、ht-1080(纖維肉瘤)和acc-2(唾液腺腺樣囊性癌)人癌細胞系的生長速度的影響。這些結果證明,當以2.0μg/ml給藥時,單克隆抗體2f7h4、1c5c9、3c4f12、7c10h11和8d9b12分別抑制超過50%的sw11/b、ecap-1090、hutu-80、ht-1080和acc-2細胞的細胞生長。因此,這些單克隆抗體具有治療或診斷人食管癌、十二指腸癌、纖維肉瘤和唾液腺癌的潛力。總之,這些結果表明識別含有n-乙?;咸前泛?或n-乙?;?半乳糖胺的表位的多種單克隆抗體能夠結合各種人癌細胞并抑制其生長。實施例4:結合n-乙?;?葡糖胺和n-乙?;肴樘前返膯慰寺】贵w抑制體內癌細胞生長接下來在體內模型中測試識別含有n-乙酰基葡糖胺和/或n-乙?;?半乳糖胺的表位以抑制癌癥生長的單克隆抗體的能力。使用上述人癌細胞異種移植模型來測試本發(fā)明的單克隆抗體對腫瘤細胞生長的抑制療效。結果示于圖9。wga和鹽水具有相似的作用,兩者都不能抑制腫瘤異種移植物的生長。相比之下,單克隆抗體3c4f12能夠顯著抑制腫瘤異種移植物的生長,特別是當異種移植物生長在第17天后加速時(圖9a)。這種生長速率的抑制反映在腫瘤異種移植物的整體大小中,因為用3c4f12治療的異種移植物的尺寸比用鹽水或wga治療的小得多(圖9b)。重要的是,這些結果證明識別n-乙?;咸前泛蚽-乙?;?半乳糖胺的單克隆抗體能夠在體內抑制癌細胞的生長。與使用人細胞系的體外數(shù)據(jù)結合,這些結果表明識別n-乙?;咸前泛?或n-乙?;?半乳糖胺的單克隆抗體可廣泛用于體內治療多種人癌癥類型。實施例5:在基于elisa的血液測試中使用識別n-乙酰基葡糖胺和n-乙?;?半乳糖胺的單克隆抗體的應用前面的實施例描述了識別n-乙酰基葡糖胺和/或n-乙?;?半乳糖胺的單克隆抗體如何可以用于結合人癌細胞,所述人癌細胞的特征在于這些糖高水平的表面表達。因為這些標記物不僅更傾向于在癌細胞上或在癌細胞內表達,而且還被釋放到體液(例如,包括血液或其它分泌物)中,以下實施例證實了這種特性如何不僅可用于預防和/或治療如上所述癌癥,而且可用于診斷患者的癌癥。使用上述基于elisa的分析方法檢測了用單克隆抗體1c5c9檢測患者血液樣品中抗原。這些檢測結果的分級指標提供在表3中。表3分級od450陰性(-)<0.25介于兩者之間(±)0.25-0.30陽性(+)0.31-0.49陽性(2+)0.50-0.75陽性(3+)0.76-0.99陽性(4+)≥1.00如圖10所示,少于3%的健康受試者的血液樣品在他們的血液中具有顯著水平的n-乙?;咸前坊騨-乙?;?半乳糖胺(或帶有n-乙酰基葡糖胺或n-乙?;?半乳糖胺的分子),而79.3%、70.6%、66.7%和50.0%的患有乳腺癌、肺癌、結腸癌和甲狀腺癌的患者的血液樣品分別具有顯著水平的n-乙?;咸前坊騨-乙酰基-半乳糖胺(或帶有n-乙?;咸前坊騨-乙酰基-半乳糖胺的分子)。這些數(shù)據(jù)表明識別本發(fā)明的糖類相關生物標記物的單克隆抗體可以用于檢測在各種癌中差異表達并釋放到血液和其它體液或分泌物的糖類相關生物標記物。因此,本文所述的抗體在診斷檢測(例如基于elisa的那些)中用于診斷組織樣品(例如,血液)中癌細胞的存在是非常有用的。本領域公知的用于與本文所述的抗體共同診斷使用的其它方法可以包括但不限于免疫膠體金檢測。實施例6:特異性結合n-乙?;咸前泛?或n-乙酰基-半乳糖胺的單克隆抗體在基于流式細胞分析的癌癥血液測試中的應用由于諸如n-乙?;咸前泛?或n-乙酰基-半乳糖胺的標記物更傾向在癌細胞上表達,以下實施例說明了該特性如何不僅可用于如上所述預防和/或治療癌癥,而且可用于診斷患者的癌癥。使用上述基于流式細胞分析法測試了用單克隆抗體2f7h4(圖11)、1c5c9(圖12)和1b3e12(圖13)檢測患者血液樣品中的循環(huán)癌細胞。這些檢測結果的分級指標提供在圖11-13中。應當說明,該分析法檢測存在于外周血中的癌細胞。不希望受理論束縛,如果癌細胞不進入外周血液循環(huán),其可能不能被檢測到,因此陰性結果可能不必然指示個體中不存在癌癥。圖11顯示使用單克隆抗體2f7h4的基于流式細胞分析的檢測結果。通過單克隆抗體2f7h4測得:全部來自10個健康個體的pbmc有少于2.2%的細胞具有顯著水平的n-乙?;咸前坊騨-乙?;?半乳糖胺(或帶有n-乙?;咸前坊騨-乙?;?半乳糖胺的分子),而50%-100%來自患有肺癌、肝癌、乳腺癌、結腸癌或結腸直腸癌、食管癌、胃癌、子宮內膜癌、宮頸癌、甲狀腺癌、腦癌、淋巴瘤的患者的pbmc分別有超過2.3%的細胞具有顯著水平的n-乙?;咸前坊騨-乙酰基-半乳糖胺(或帶有n-乙?;咸前坊騨-乙?;?半乳糖胺的分子)。因此,單克隆抗體2f7h4具有診斷多種人癌癥的潛力,如上所述,特別是肺癌、乳腺癌、結腸癌或結腸直腸癌、胃癌和子宮內膜癌。圖12顯示使用單克隆抗體1c5c9的基于流式細胞分析的檢測結果。通過單克隆抗體1c5c9測得:所有來自十個健康個體的pbmc(外周單核細胞)中,有小于3.3%的細胞具有顯著水平的n-乙?;咸前坊騨-乙酰基-半乳糖胺(或帶有n-乙?;咸前坊騨-乙酰基-半乳糖胺的分子),而14%-100%來自患有肺癌、肝癌、乳腺癌、結腸癌或結腸直腸癌、食管癌、宮頸癌、甲狀腺癌、胰腺癌的患者的pbmc分別有超過3.4%的細胞具有顯著水平的n-乙酰基葡糖胺或n-乙?;?半乳糖胺(或帶有n-乙酰基葡糖胺或n-乙?;?半乳糖胺的分子)。因此,單克隆抗體1c5c9具有診斷多種人癌癥的潛力,如上所述,特別是結腸癌或結腸直腸癌和肝癌。圖13顯示使用單克隆抗體1b3e12的基于流式細胞術的檢測的結果。通過單克隆抗體1b3e12測得:所有來自10個健康個體的pbmc(外周單核細胞)有小于3.2%的細胞具有顯著水平的n-乙?;咸前坊騨-乙?;?半乳糖胺(或帶有n-乙酰基葡糖胺或n-乙?;?半乳糖胺的分子),而30%-67%來自患有肝癌、乳腺癌、結腸癌或結腸直腸癌、食管癌、卵巢癌、胰腺癌的患者的pbmc分別有超過3.3%的細胞有顯著水平的n-乙?;咸前坊騨-乙?;?半乳糖胺(或帶有n-乙?;咸前坊騨-乙酰基-半乳糖胺的分子)。因此,單克隆抗體1b3e12具有診斷多種人癌癥的潛力,如上所述,特別是結腸癌或結腸直腸癌和乳腺癌。這些數(shù)據(jù)表明識別本發(fā)明的糖類相關生物標記物的單克隆抗體可以用于檢測患者血液中的循環(huán)癌細胞。循環(huán)癌細胞差異表達糖類相關生物標記物并釋放到血液和其它體液或分泌物中。因此,本文所述的抗體在診斷檢測(例如基于流式細胞分析的那些)中用于診斷組織樣品(例如血液)中癌細胞的存在是非常有用的。應當注意,一些不能抑制癌細胞增殖的抗體仍然可用于檢測方法。例如,本發(fā)明的單克隆抗體1b3e12促進乳腺癌、卵巢癌和宮頸癌的腫瘤細胞系的細胞生長,但是可用在流式細胞術診斷各種癌癥中。實施例7:特異性結合n-乙酰基葡糖胺和/或n-乙?;?半乳糖胺的單克隆抗體在預防和治療胃腸道疾病中的應用已經研究了n-乙酰基葡糖胺作為炎癥的生物標記物(例如,由輪狀病毒感染引起的腸炎;參見pct/us2009/039810)。然而,尚不清楚n-乙?;咸前吩谘装Y中的作用和它是否可能充當胃腸道疾病的潛在治療靶標。因此,測試了特異性結合n-乙?;咸前泛蚽-乙?;?半乳糖胺的抗體用于預防和治療新生仔豬的急性感染性胃腸炎。首先,測試了單克隆抗體1c5c9(mab-1c5c9)和輪狀病毒感染誘導的炎癥腸細胞的結合。在出生后第2天通過口服給與恒河猴輪狀病毒(rrv)(rrv感染組)處理兩組balb/c乳鼠幼崽。這種病毒性疾病的病程通常使得在rrv感染后的第1周內,幼崽患有腹瀉與灰色大便(alcoholicstool),飲食差及不像健康小鼠一樣增重,30-40%的幼崽患有嚴重疾病并出現(xiàn)黃疸。到第2周,所有小鼠通常都患有黃疸,并且不能很好地進食和增重,80%的幼崽患有嚴重疾病死亡。病毒通常在5天內清除,且在第5天檢測不出。在治療后不同天處死幼崽,制備血清樣品、快速冷凍和福爾馬林固定腸和肝組織。在一個免疫熒光檢測中,用rrv感染第5天的小鼠的腸組織切片及抗體1c5c9(mab-1c5c9)染色,并且用熒光標記的抗小鼠igg作為第二試劑。未被rrv感染的健康小鼠的腸組織切片作為對照。圖14顯示mab-1c5c9強烈結合到被輪狀病毒感染的小鼠的組織切片的炎癥細胞(圖14b)。相比之下,mab-1c5c9不結合沒有輪狀病毒感染的健康小鼠的腸組織切片(圖14a)。這些數(shù)據(jù)表明,識別含有n-乙?;咸前泛?或n-乙?;?半乳糖胺的表位的單克隆抗體能夠結合腸中的炎癥細胞。在一次暴發(fā)流行中,1-5日齡的新生仔豬被豬流行性腹瀉病毒(pedv)感染引起急性感染性胃腸炎。100%的新生仔豬被感染,且80-90%的感染仔豬死亡。對于這種感染沒有有效的療法。為了測試mab-1c5c9在預防病毒感染中的療效,當觀察到在一窩中幾只仔豬(1-2只仔豬)感染時,將單劑量的mab-1c5c9(50μg)口服給藥至同一窩所有未感染的仔豬。約500只仔豬用mab-1c5c9治療。用mab-1c5c9治療的未感染的仔豬沒有一只感染或死亡。用mab-1c5c9治療(n=500)的窩死亡率為約28%;用恩諾沙星治療(n=500)的窩死亡率為約81%;而未治療的窩死亡率(n=500)為89%。與抗生素(恩諾沙星)治療或未治療的仔豬相比時,mab-1c5c9在降低死亡率方面的療效顯示具有p值<0.0001的統(tǒng)計學顯著性(圖15)。這些結果表明,mab-1c5c9有效且效果比用于預防由病毒感染(包括但不限于pedv感染和其它腸道病毒)引起的胃腸炎的抗生素更好。還在人中測試了mab-1c5c9在治療胃腸道疾病中的療效。55歲的女性(約58kg)患腸炎癥與腹瀉、血便和腹痛,持續(xù)4周。結腸鏡檢查顯示除痔瘡外無異常。用抗生素(環(huán)丙沙星)治療一周無效。每天一次口服給藥mab-1c5c9(2-3μg/kg,0.13mg/劑量)10天。在2次劑量后,血便減少,5次劑量后停止;7次劑量后腹瀉停止;并且患者在治療10天后康復。在治療后7個月內沒有腸炎癥或痔瘡復發(fā)。這些結果表明mab-1c5c9有效且效果比用于治療炎癥性腸病和痔瘡的抗生素更好??傊?,這些結果表明,特異性結合n-乙?;咸前泛蚽-乙酰基-半乳糖胺的抗體可用于治療各種胃腸道疾病,例如炎癥疾病,包括病毒感染、炎癥性腸病和痔瘡。實施例8:在ibd小鼠模型中測試特異性結合n-乙酰基葡糖胺和/或n-乙?;?半乳糖胺的人源化抗體前述實施例證明了mab-1c5c9在抑制癌細胞生長、檢測循環(huán)癌細胞和治療ibd中的療效。隨后將mab-1c5c9人源化。以下實施例描述具有共同重鏈可變區(qū)(vh)和不同輕鏈可變區(qū)(vk)的人源化1c5c9的變體。在ibd的多個體內動物模型中測試人源化1c5c9抗體的療效、結合和毒性。材料和方法人源化抗體與n-乙?;咸前?nag)的結合將100μlnag以1μg/ml的濃度包被在96孔板的孔中過夜,洗滌并封閉。測試5個人源化抗體克隆并與嵌合1c5c9抗體進行比較。將測試抗體加入板中后,洗板,并通過hrp標記的抗人igg作為第二試劑檢測結合。通過標準顯色檢測hrp,并通過od450nm檢測結合。小鼠ibd模型6-8周齡且體重17-19克的balb/c雌性小鼠用于誘導急性結腸炎;通過肛門給藥0.15ml劑量的溶于50%乙醇的120mg/ml的三硝基苯磺酸(tnbs;sigma-aldrich)。將小鼠分成5個治療組,如下:g1:未治療(n=6);g2:用5μg抗體1c5-vk2/只動物治療,腹膜內注射(ip)(n=6);g3:用5μg抗體1c5-vk2/只動物治療,口服(po)(n=6);g4:用2μg抗體1c5-vk2/只動物治療,腹膜內注射(ip)(n=6);和g5:用5μg抗體1c5-vk1/只動物治療,腹膜內注射(ip)(n=6)。g2-g5小鼠的治療為從tnbs誘導ibd后48小時始,每天給藥一次,持續(xù)4天。在ibd模型過程中每天記錄每組小鼠的體重和臨床體征。在tnbs誘導ibd模型后48小時處死來自對照組(g1)的兩只小鼠,并收集全部結腸組織。最后一次給藥后一天(24小時),對所有動物結束該操作(操作期間的第7天)。根據(jù)圖18所示的提示(key),收集全結腸組織用于大體病理學(結腸重量、潰瘍)和組織學評價(結腸組織切片的標準he染色),并且得到代表性圖。使用如圖20a所示的標準組織學方法評價結腸組織病理學性狀。還使用結腸組織切片以及hrp標記的抗人igg作為檢測試劑的標準免疫組織化學方法(he染色)評價抗體1c5-vk2在被治療的小鼠中的定位。將組g2小鼠的代表性圖與對照小鼠進行比較,如圖20所示。結果檢測5個人源化1c5c9克隆與nag的結合并與嵌合1c5c9抗體(即,連接到人fc區(qū)的親本小鼠可變域)進行比較。圖16顯示所有抗體顯示對nag的劑量依賴性結合。選擇人源化抗體1c5-vk1和1c5-vk2用于進一步定性。如上所述在小鼠中誘導急性結腸炎,并測試人源化1c5-vk2給藥對體重、臨床體征例如腹瀉和結腸狀況的影響。通過根據(jù)圖17中提供的提示,用大體評分結腸狀況來檢測抗體治療的效果。來自治療組g1-g4中的小鼠的結腸評價為結腸炎存在,如下表4所示。表4.與未治療的對照相比,抗體治療的小鼠結腸炎的發(fā)生率。組患有結腸炎的動物數(shù)未患結腸炎的動物數(shù)g160g224g360g460圖17顯示,與未治療的對照相比,用1c5-vk2治療導致得分顯著降低,表明抗體治療導致潰瘍和炎癥的顯著緩解。從這些結腸樣品獲取的代表性大體影像圖顯示在圖18a。對照組(g1)的所有未治療的小鼠顯示嚴重的結腸炎與嚴重的潰瘍、炎癥和組織壞死。在g2組中,一例樣品(#1)顯示腸壁增厚,沒有潰瘍和炎癥,而3例樣品(#2、3和6)沒有顯示潰瘍和炎癥。剩下的兩例顯示潰瘍和炎癥。在g3組中,3例(#1、2和4)顯示腸壁增厚,沒有潰瘍和輕微炎癥。這些結果說明1c5-vk2治療導致潰瘍和炎癥的顯著緩解。還測試了1c5-vk1抗體治療在該小鼠ibd模型中的作用。如圖18b所示,代表性大體影像圖顯示,與未治療的g1對照相比,g5治療組中的6只動物中有5只顯示結腸炎的改善。這些結果說明,1c5-vk1治療也導致緩解潰瘍和炎癥。接下來,通過如上所述的結腸組織切片的組織化學制備(he染色)獲得代表性病理圖。圖19a顯示用來自組g1-g4中的1c5-vk2治療的小鼠的代表性圖。所有未治療的對照組(g1)的小鼠顯示嚴重的潰瘍和炎癥,沒有上皮再生。在g2組中,兩例樣品(#1和2)顯示上皮再生和潰瘍覆蓋(coveringoftheulcer),且一例樣品(#5)顯示部分上皮再生(由箭頭所示)。樣品3和6沒有顯示潰瘍和炎癥,只有1例樣品(#4)顯示潰瘍和炎癥。在g3組中,四例樣品(#1-4)顯示上皮再生和潰瘍覆蓋(箭頭)。這些圖表明用1c5-vk2治療緩解了ibd病狀,其中通過ip注射治療的5/6(83%)小鼠和通過口服給藥(po)治療4/6(67%)的小鼠顯示潰瘍和炎癥的顯著緩解。圖19b顯示來自用g5組中的1c5-vk1治療的小鼠的代表性組織化學圖。在g5組中,三例樣品顯示康復(#1)或上皮再生(#3和5,如箭頭突出顯示)。兩例樣品(#2和4)也顯示炎癥減少。這些圖證明了用1c5-vk1治療的小鼠中的5/6(83%)也顯示緩解的ibd病狀。另外,圖19a和19b中的組織學數(shù)據(jù)表明抗體1c5-vk1和1c5-vk2可以促進腸上皮再生。也使用上述免疫組織化學方法檢測1c5-vk2抗體第7天在治療的小鼠中的定位。圖20顯示在患有結腸炎的小鼠的炎癥細胞(箭頭表示代表性染色)和再生的結腸上皮細胞上檢測到了1c5-vk2。這證明了1c5-vk2在給藥時定位于炎癥部位。實施例9:特異性結合n-乙酰基葡糖胺和/或n-乙?;?半乳糖胺的人源化抗體對小鼠的毒性和藥代動力學(pk)檢測材料和方法毒性研究balb/c小鼠,8周齡,體重22-24克,隨機分為4個治療組。每組包括3只雄性和3只雌性小鼠。各組按如下治療:g1:1.0mg/kg(20μg總劑量)1c5-vk2,靜脈內(iv)給藥一次g2:1.0mg/kg(20μg總劑量)1c5-vk2,口服(po)給藥一次g3:5.0mg/kg(100μg總劑量)1c5-vk2,靜脈內(iv)給藥一次g4:5.0mg/kg(100μg總劑量)1c5-vk2,口服(po)給藥一次在治療后14天中觀察小鼠的體重。在第14天,通過如上所述的大體解剖評分和組織化學制備來檢測結腸樣品。藥代動力學(pk)研究balb/c小鼠,8周齡,體重22-24克,隨機分為4個治療組。每組包含3只雄性和3只雌性小鼠。各組按如下治療:g1:1.0mg/kg(20μg總劑量)1c5-vk2,靜脈內(iv)給藥一次g2:1.0mg/kg(20μg總劑量)1c5-vk2,口服(po)給藥一次g3:5.0mg/kg(100μg總劑量)1c5-vk2,靜脈內(iv)給藥一次g4:5.0mg/kg(100μg總劑量)1c5-vk2,口服(po)給藥一次在治療后的以下時間點從小鼠收集血液:5分鐘,0.5小時,1小時,2小時,4小時,8小時,24小時和2周。從血液中分離血清,并將10μl血清加上90μlpbs(共100μl)包被在96孔板的孔中過夜。通過使用hrp標記的抗人igg作為檢測試劑的直接elisa檢測血清中的1c5-vk2水平。每隔一天記錄每個治療組的小鼠的體重和臨床體征。在第14天對所有動物結束該過程。收集以下器官用于組織學評價:結腸、小腸、胃、肝、胰腺、心臟、肺、腎、脾和腦。結果1c5-vk2治療的毒性如上所述。圖21顯示,與未治療的對照相比,通過2種不同途徑(iv和po)用2種不同劑量(1.0mg/kg和5.0mg/kg)治療對小鼠體重沒有顯著影響。此外,組織學評價顯示,與未治療的對照(未顯示數(shù)據(jù))相比,通過2種不同途徑(iv和po)用2種不同劑量(1.0mg/kg和5.0mg/kg)治療對小鼠器官組織學沒有顯著副作用??傊?,在1c5-vk2治療時,在小鼠的最低有效劑量(0.1mg/kg)的10-50倍劑量下沒有觀察到顯著的不良反應。人的等效最低有效劑量為約0.005mg/kg至0.01mg/kg。如上所述給藥1c5-vk2的血清pk也通過elisa檢測。來自iv和po給藥的結果分別提供在圖22和圖23中。實施例10:在ibd大鼠模型中測試特異性結合n-乙?;咸前泛?或n-乙?;?半乳糖胺的人源化抗體材料和方法按照0.25ml的劑量,通過肛門給藥120mg/ml的溶于50%乙醇的三硝基苯磺酸(tnbs;sigma-aldrich),在9周齡且體重140-160克的sd雌性大鼠中誘導急性結腸炎。將大鼠分為5個治療組,如下:g1:未治療;g2:用125μg/kg的人igg治療,腹膜內注射(ip);g4:用125μg/kg的1c5-vk2治療,腹膜內注射(ip);g5:用122μg/kg的1c5-vk2治療,皮下注射(sc);g6:用250μg/kg的1c5-vk2治療,口服管飼(po)。g2-g6大鼠的治療為從tnbs誘導ibd后48小時起,每天給藥一次,共4天。使用的測試用品在下表5中提供。表5.大鼠ibd實驗的測試用品。組動物數(shù)測試品原始濃度給藥途徑劑量g15對照n/an/an/ag25人igg10mg/mlip125μg/kgg451c5-vk21.44mg/mlip125μg/kgg561c5-vk21.44mg/mlsc125μg/kgg661c5-vk21.44mg/mlpo250μg/kg每天記錄每個治療組的大鼠的體重和臨床體征。最后一次給藥后兩天(48小時),對所有動物(該過程的第8天)結束該過程。收集結腸組織(自肛門10cm長)用于大體病理學(結腸重量、潰瘍)和組織學評價,并得到代表性圖。結果圖24顯示抗體治療對大鼠體重的影響。從治療的第一天(整個過程的第4天),與未治療的對照相比,所有治療組顯示體重增加。圖25提供結腸組織樣品的代表性總圖。對照組(g1)的未治療大鼠的4/5(80%)顯示嚴重的結腸炎與嚴重潰瘍、炎癥和組織壞死??傮w上,用1c5-vk2(g4、g5和g6)治療的大多數(shù)大鼠顯示康復的跡象,例如炎癥減少(更少的炎癥細胞和更少的充血)、組織壞死減少、潰瘍覆蓋(coveredulceration)(全部或部分)和更好的形態(tài)(更平滑的腸壁)。在g4組中,兩只大鼠(g4-4和g4-5)沒有顯示潰瘍和炎癥;一只大鼠(g4-3)顯示腸壁增厚、炎癥減輕和潰瘍覆蓋(康復中);一只大鼠(g4-1)顯示腸壁增厚和炎癥,沒有潰瘍。剩余的大鼠(g4-2)顯示減少的炎癥和潰瘍部分覆蓋。類似地,4/6(67%)的g5大鼠(g5-1、g5-4、g5-5和g5-6)顯示康復的跡象,并且5/6(83%)的g6大鼠(g6-1、g6-2、g6-3、g6-4和g6-5)與對照大鼠相比顯示康復的跡象。這些結果說明通過注射(g4組或g5組)或口服給藥(g6組)的1c5-vk2治療導致結腸炎潰瘍和炎癥顯著減輕。根據(jù)圖26中所示的提示,在這些組織樣品中大體評價結腸形態(tài)學和結腸炎病理學癥狀。評分表明,抗體治療導致結腸炎病狀的嚴重性降低,與未治療的對照相比,g4組表現(xiàn)出評分的統(tǒng)計學顯著降低。接下來,將來自每個治療組的結腸稱重作為其長度的功能。如圖27所示,未治療的大鼠的結腸重量由于炎癥和潰瘍而顯著提高,而用1c5-vk2經由sc(g5)或po(g6)途徑治療的大鼠的結腸重量沒有顯著提高。這些數(shù)據(jù)表明,與未治療的對照大鼠相比,g5組和g6組大鼠的結腸處于更接近正常大鼠的狀況??傊瑢嵤├?-10的結果證明了用針對n-乙?;咸前泛蚽-乙?;?半乳糖胺的人源化抗體治療在兩個ibd動物模型中顯示效果。兩種抗體在ibd小鼠模型中顯示效果。通過治療緩解ibd的病理體征如潰瘍和炎癥,并且在治療后觀察到上皮再生。序列除非另有說明,所有多肽序列均以n-端至c-端的方式示出。2f7h4重鏈可變區(qū):evklqqsggglvqpggslrlscatsgftfsdfymewvrqppgkrlewiaasrnkandytteysasvkgrfivsrdtsqsilylqmnalraedtaiyycardawfaywgqgtivtvss(seqidno:1)2f7h4輕鏈可變區(qū):divitqtpsslavsvgekvtmsckssqsllyssnqknylawyqqkpgqspklliywastrgsgvpdrftgsgsgtdgtltissvkaedlavyycqqyysyprtfgggtkfeik(seqidno:2)1c5c9重鏈可變區(qū):evqleesgpelvkpgasvkisckasgytfpdynihwvkqshgkslewigciypyngntaynqkfktkatltvdtssstaymdlrsltsedsavyycarsdlyyfgsrgfvywgqgttvtvss(seqidno:3)1c5c9輕鏈可變區(qū):divltqspsslsaslgdrvtiscrasqdistylnwyqqkpdgtvkllvyftsrlhsgvpsrfsgtgsgtdfsltinnldqediatyfcqqgntlpwtfgggtkleik(seqidno:4)3c4f12重鏈可變區(qū):evqleesggglvkpggslklscaasgfafssydmswvrqtpekrlewvayissgggstyypdtvkgrftisrdnakntlylqmsslksedtamyycarryyygsswamdywgqgtmvtvss(seqidno:5)3c4f12輕鏈可變區(qū):divmtqstkfllvsagdrvtitckasqsvsndvawyqqkpgqspklliyyasnrytgvpdrftgsgygtdftftistvqaedlavyfcqqdysspytfgggtkleik(seqidno:6)人源化1c5c9和親本-1c5c9hvr-h1:ytfpdynih(seqidno:7)人源化1c5c9hvr-h2:ciypyngnta(seqidno:8)人源化1c5c9hvr-h3:sdlyyfgsrgfd(seqidno:9)人源化1c5-vk1hvr-l1:qasqdistyln(seqidno:10)人源化1c5-vk2/親本-1c5c9hvr-l1:rasqdistyln(seqidno:11)人源化1c5-vk1hvr-l2:ftsnlet(seqidno:12)人源化1c5-vk2hvr-l2:ftsslqs(seqidno:13)人源化親本-1c5c9hvr-l2:ftsrlhs(seqidno:14)人源化1c5-vk1/vk2/親本-1c5c9hvr-l3:qqgntlpw(seqidno:15)人源化1c5c9重鏈可變區(qū):qvqlvqsgaevkkpgasvkvsckasgytfpdynihwvrqapgqglewmgciypyngntayaqkfqgrvtmtrdtsistaymelsrlrsddtavyycarsdlyyfgsrgfdywgqgtlvtvssa(seqidno:16)人源化1c5c9重鏈:qvqlvqsgaevkkpgasvkvsckasgytfpdynihwvrqapgqglewmgciypyngntayaqkfqgrvtmtrdtsistaymelsrlrsddtavyycarsdlyyfgsrgfdywgqgtlvtvssastkgpsvfplapsskstsggtaalgclvkdyepepvtvswnsgaltsgvhtfpavlqssglyslssvvtvpssslgtqtyicnvnhkpsntkvdkrvepkscdkthtcppcpapellggpsvflfppkpkdtlmisrtpevtcvvvdvshedpevkfnwyvdgvevhnaktkpreeqynstyrvvsvltvlhqdwlngkeykckvsnkalpapiektiskakgqprepqvytlppsrdeltknqvsltclvkgfypsdiavewesngqpennykttppvldsdgsfflyskltvdksrwqqgnvfscsvmhealhnhytqkslslspgk(seqidno:17)人源化1c5-vk1輕鏈可變區(qū):diqmtqspsslsasvgdrvtitcqasqdistylnwyqqkpgkapklliyftsnletgvpsrfsgsgsgtdftltisslqpediatyycqqgntlpwtfgggtkle(seqidno:18)人源化1c5-vk1輕鏈:diqmtqspsslsasvgdrvtitcqasqdistylnwyqqkpgkapklliyftsnletgvpsrfsgsgsgtdftltisslqpediatyycqqgntlpwtfgggtklertvaapsvfifppsdeqlksgtasvvcllnnfypreakvqwkvdnalqsgnsqesvteqdskdstyslsstltlskadyekhkvyacevthqglsspvtksfnrgec(seqidno:19)人源化1c5-vk2輕鏈可變區(qū):diqmtqspsslsasvgdrvtitcrasqdistylnwyqqkpgkapklliyftsslqsgvpsrfsgsgsgtdftltisslqpediatyycqqgntlpwtfgggtkle(seqidno:20)人源化1c5-vk2輕鏈:diqmtqspsslsasvgdrvtitcrasqdistylnwyqqkpgkapklliyftsslqsgvpsrfsgsgsgtdftltisslqpediatyycqqgntlpwtfgggtklertvaapsvfifppsdeqlksgtasvvcllnnfypreakvqwkvdnalqsgnsqesvteqdskdstyslsstltlskadyekhkvyacevthqglsspvtksfnrgec(seqidno:21)人源化親本-1c5c9輕鏈可變區(qū):diqmtqspsslsasvgdrvtitcrasqdistylnwyqqkpgkapklliyftsrlhsgvpsrfsgsgsgtdftltisslqpediatyycqqgntlpwtfgggtkle(seqidno:22)人源化親本-1c5c9輕鏈:diqmtqspsslsasvgdrvtitcrasqdistylnwyqqkpgkapklliyftsrlhsgvpsrfsgsgsgtdftltisslqpediatyycqqgntlpwtfgggtklertvaapsvfifppsdeqlksgtasvvcllnnfypreakvqwkvdnalqsgnsqesvteqdskdstyslsstltlskadyekhkvyacevthqglsspvtksfnrgec(seqidno:23)2f7h4hvr-h1:ftfsdfyme(seqidno:24)2f7h4hvr-h2:asrnkandytteysasvkg(seqidno: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