本發(fā)明涉及一種新型熒光探針的構(gòu)建及其制備方法和用途,屬于化學(xué)合成、化學(xué)分析和生物分析領(lǐng)域。
背景技術(shù):
G-四鏈體DNA是一種特殊的DNA結(jié)構(gòu),是富含鳥嘌呤堿基的單鏈DNA序列在一定條件下由自身四個(gè)鳥嘌呤環(huán)通過Hoogsteen氫鍵自組裝成G-四分體,兩個(gè)或多個(gè)G-四分體通過π-π堆積作用進(jìn)而形成的一種高級DNA二級結(jié)構(gòu)。近年來生物信息學(xué)的研究表明,在人體內(nèi)大約有37萬組可能形成G-四鏈體結(jié)構(gòu)的富含鳥嘌呤的基因序列,特別是在人體端粒末端和癌基因啟動(dòng)子區(qū)(如c-myc、ckit、bcl-2、Pu27、kRAS、VEGFR、TERT等)較為常見。G-四鏈體結(jié)構(gòu)對于維持染色體穩(wěn)定以及在相關(guān)基因的表達(dá)方面有著重要的作用,且與癌癥的發(fā)生、發(fā)展密切相關(guān)。因此,G-四鏈體DNA結(jié)構(gòu)的發(fā)現(xiàn)及現(xiàn)代分子生物學(xué)和醫(yī)學(xué)對G-四鏈體重要生理功能的揭示,為解決抗腫瘤藥物中靶向性問題提供了一個(gè)新的契機(jī)。尋求特異性靶向這種特殊G-四鏈體DNA結(jié)構(gòu)的分子,就有可能影響到腫瘤基因的轉(zhuǎn)錄以及表達(dá),從而抑制腫瘤細(xì)胞的生長發(fā)展,促使其調(diào)亡。
在自然界中存在著與特定結(jié)構(gòu)核酸結(jié)合的蛋白質(zhì),但是目前這類蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)復(fù)雜不利于修飾改進(jìn),而且與核酸結(jié)合機(jī)制十分復(fù)雜。因此,這類研究還存在諸多困難。有機(jī)小分子具有多種多樣的立體結(jié)構(gòu),自身具有可修飾性及可控性,為發(fā)展G-四鏈體識別分子奠定了基礎(chǔ)。同時(shí)G-四鏈體與雙螺旋DNA在結(jié)構(gòu)上的極大差異性為選擇性識別的小分子設(shè)計(jì)提供了可能。隨著分子生物學(xué)和結(jié)構(gòu)生物學(xué)的發(fā)展,G-四鏈體DNA的結(jié)構(gòu)多樣性和生物功能性得到不斷闡明。以各種構(gòu)型的G-四鏈體為識別靶點(diǎn)的小分子研究引起了研究人員廣泛的興趣和重視(Expert Opinion On Therapeutic Patents,2013,23,11,1495-1509)。
目前,小分子識別G-四鏈體DNA主要是通過非共價(jià)鍵完成,在作用靶點(diǎn)和作用機(jī)制的研究方面上存在一定技術(shù)困難,這就需要借助某種信號媒介才能被快速檢測。常用的儀器手段有圓二色譜,核磁共振,表面等離子共振等。這些方法對儀器要求較高,而且價(jià)格昂貴,難以普及。熒光分子能夠?qū)⑦@種結(jié)合信息轉(zhuǎn)換成易檢測的信號響應(yīng),而且可在單分子水平上實(shí)現(xiàn)原位實(shí)時(shí)檢測,同時(shí)還具有檢測限低,靈敏度高等優(yōu)點(diǎn)。因此,以熒光為輸出信號的識別分子受到了極大的關(guān)注,廣泛應(yīng)用于生物學(xué)、醫(yī)學(xué)、化學(xué)等學(xué)科。另外,目前識別G-四鏈體DNA的小分子化合物還有待于進(jìn)一步解決的問題是如何提高小分子對G-四鏈體的選擇性。很多識別G-四鏈體的小分子與雙螺旋DNA都有一定的結(jié)合能力,因此小分子與G-四鏈體結(jié)構(gòu)的作用選擇性有待提高。
近年來,三苯胺由于其較好的給電子能力和穩(wěn)定特性,使得三苯胺類結(jié)構(gòu)成為熒光探針分子設(shè)計(jì)的重要骨架之一,廣泛用于生物,醫(yī)藥,材料,染料等領(lǐng)域。申請人前期合成了一系列芳基乙烯類化合物,其對G-四鏈體具有較好的結(jié)合能力。申請人將三苯胺骨架結(jié)合到芳基乙烯結(jié)構(gòu)中,得到了一種具有分子內(nèi)電荷轉(zhuǎn)移性質(zhì)的新型三苯胺類熒光探針。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:
本發(fā)明的目的在于針對現(xiàn)有技術(shù)的不足,提供一種具有分子內(nèi)電荷轉(zhuǎn)移特性的熒光探針及其合成方法和在G-四鏈體結(jié)構(gòu)檢測中的應(yīng)用。
本發(fā)明提供了一種具有電荷轉(zhuǎn)移特性的熒光探針,所述探針結(jié)構(gòu)如下:
本發(fā)明同時(shí)提供了上述探針的制備和純化方法,反應(yīng)方程式表示如下:
上述一種具有電荷轉(zhuǎn)移特性的熒光探針的制備方法,按照下述步驟進(jìn)行:以正丁醇為溶劑,加入4-甲?;桨?、4-氯-1,2-二甲基喹啉碘鎓和N,N-二甲基乙二胺,110-120℃加熱反應(yīng)12-15小時(shí);反應(yīng)后自然冷卻至室溫,減壓蒸餾除去溶劑,加入50mL二氯甲烷攪拌10分鐘,過濾得固體產(chǎn)物,再用20mL二氯甲烷洗滌固體兩次,得到具有電荷轉(zhuǎn)移特性的熒光探針。
其中所述的4-甲?;桨贰?-氯-1,2-二甲基喹啉碘鎓和N,N-二甲基乙二胺的摩爾比為1:1.2:1.3。
本發(fā)明還提供上述一種具有電荷轉(zhuǎn)移特性的熒光探針在溶液中的穩(wěn)定性以及在檢測G-四鏈體結(jié)構(gòu)中的應(yīng)用,按照下述步驟進(jìn)行:
1)將探針用二甲基亞砜溶解,再用pH 7.4的10mM Tris-HCl緩沖溶液(含60mM氯化鉀)稀釋得到溶液B;將待測DNA樣品用上述緩沖溶液溶解得到溶液A。
2)用紫外分光光度計(jì)測定探針溶液B在0-24小時(shí)內(nèi)的吸收曲線,以此來判定探針的穩(wěn)定性。如若在0-24小時(shí)內(nèi)吸收曲線沒有明顯的變化或出現(xiàn)新的吸收峰則判定探針在此條件下能穩(wěn)定存在。
3)將溶液B和溶液A混合,混合后對混合液進(jìn)行熒光光譜分析,若混合液熒光發(fā)射強(qiáng)度明顯增強(qiáng),則可判斷該DNA結(jié)構(gòu)為G-四鏈體,若混合液熒光發(fā)射強(qiáng)度沒有明顯增強(qiáng),則可以判定該DNA結(jié)構(gòu)為非G-四鏈體。
與現(xiàn)有技術(shù)相比,本發(fā)明具有以下優(yōu)點(diǎn):
(1)該探針制合成路線可操作性強(qiáng),純化方法簡單,總體制備成本低廉,具有較大的市場競爭力。
(2)該探針結(jié)構(gòu)穩(wěn)定,易于存儲。
(3)本發(fā)明提供的探針發(fā)射波長長,而且熒光背景低,使得該探針具有廣闊的應(yīng)用前景。
(4)本發(fā)明的探針可以通過熒光光譜特異性檢測和識別G-四鏈體結(jié)構(gòu)的DNA,實(shí)現(xiàn)G-四鏈體結(jié)構(gòu)與其他單、雙鏈DNA的區(qū)分。操作簡單,便捷。
(5)在研究抗癌先導(dǎo)化合物方面具有潛在的參考價(jià)值。
附圖說明
圖1為10μM的熒光探針在0-24小時(shí)內(nèi)的紫外吸收曲線。
圖2為1μM的熒光探針與反平行G-四鏈體Ckit3滴定的熒光光譜(ckit3濃度為0.04、0.08、0.12、0.16、0.2、0.24、0.28、0.32、0.36、0.4μM)。
圖3為1μM的熒光探針與平行G-四鏈體CM22滴定的熒光光譜(cm22濃度為0.04、0.08、0.12、0.16、0.2、0.24、0.28、0.32、0.36、0.4、0.44μM)。
圖4為1μM的熒光探針與反平行G-四鏈體HRAS滴定的熒光光譜(HRAS濃度為0.04、0.08、0.12、0.16、0.2、0.24、0.28、0.32、0.36、0.4、0.44、0.48μM)。
圖5為1μM的熒光探針與平行G-四鏈體c-myc滴定的熒光光譜(c-myc濃度為0.04、0.08、0.12、0.16、0.2、0.24、0.28、0.32、0.36、0.4μM)。
圖6為1μM的熒光探針與平行G-四鏈體22AG滴定的熒光光譜(22AG濃度為0.04、0.08、0.12、0.16、0.2、0.24、0.28、0.32、0.36、0.4、0.44、0.48μM)。
圖7為1μM的熒光探針與反平行G-四鏈體G3T3滴定的熒光光譜(G3T3濃度為0.04、0.08、0.12、0.16、0.2、0.24、0.28、0.32、0.36、0.4、0.44、0.48、0.52、0.56、0.6、0.64μM)。
圖8為1μM的熒光探針與混合構(gòu)型G-四鏈體htg-21滴定的熒光光譜(htg-21濃度為0.04、0.08、0.12、0.16、0.2、0.24、0.28、0.32、0.36、0.4、0.44、0.48、0.52μM)。
圖9為1μM的熒光探針與平行構(gòu)型G-四鏈體Ckit1滴定的熒光光譜(ckit1濃度為0.04、0.08、0.12、0.16、0.2、0.24、0.28、0.32、0.36、0.4、044、0.48μM)。
圖10為1μM的熒光探針與雙鏈DNA ds26滴定的熒光光譜(ds26濃度為0.2、0.4、0.6、0.8、1.0、1.2、1.4、1.6μM)。
圖11為1μM的熒光探針與雙鏈DNA polyd(A-T)9滴定的熒光光譜(polyd(A-T)9濃度為0.2、0.4、0.6、0.8、1.0、1.2、1.4、1.6、1.8μM)。
圖12為1μM的熒光探針與雙鏈DNA polyd(G-C)9滴定的熒光光譜(polyd(G-C)9濃度為0.2、0.4、0.6、0.8、1.0、1.2、1.4、1.6、1.8μM)。
圖13為1μM的熒光探針與雙鏈DNA ct-DNA滴定的熒光光譜(ct-DNA濃度為0.2、0.4、0.6、0.8、1.0、1.2、1.4、1.6、1.8、2μM)。
圖14為1μM的熒光探針與單鏈DNA ss26滴定的熒光光譜(ss26濃度為0.2、0.4、0.6、0.8、1.0、1.2μM)。
圖15為熒光探針與13種DNA作用后的熒光增強(qiáng)倍數(shù)柱狀圖。
具體實(shí)施方式
下面結(jié)合具體實(shí)施方式和附圖對本發(fā)明作進(jìn)一步的說明,以使本領(lǐng)域技術(shù)人員更好的理解本發(fā)明的技術(shù)方案。
實(shí)施例一:熒光探針的合成
將0.27g的4-甲酰基三苯胺溶于20mL的正丁醇中,加入0.38g的4-氯-1,2-二甲基喹啉碘鎓和0.11g的N,N-二甲基乙二胺,120℃反應(yīng)15h。反應(yīng)完自然冷卻至室溫,蒸出溶劑。加入50mL二氯甲烷攪拌10分鐘,過濾得固體產(chǎn)物,再用20mL二氯甲烷洗滌固體兩次,得到0.21g純品。產(chǎn)率為34.4%。核磁氫譜1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ:9.45(s,1H),8.86(s,1H),8.49(d,J=8.12Hz,1H),8.26(d,J=8.84Hz,1H),8.07(t,J=7.52Hz,1H),7.84-7.78(m,4H),7.56(d,J=15.76Hz,1H),7.40-7.36(m,4H),7.17-7.10(m,6H),6.99(d,J=8.12Hz,2H),4.16(s,3H),4.03(s,2H),3.46(s,2H),2.90(s,6H).核磁碳譜1C NMR(100MHz,DMSO-d6)δ:155.45,154.19,149.84,146.91,142.77,139.96,134.56,130.54,130.43,128.90,126.85,125.74,124.92,121.56,119.57,118.32,118.08,97.98,55.08,43.47,38.79,38.41.高分辨質(zhì)譜HRMS(ESI):理論值:(M-I)+(C34H35N4+)499.2856,實(shí)驗(yàn)值:499.2859。
實(shí)施例二:熒光探針的穩(wěn)定性
1.將熒光探針用DMSO溶劑配制成5mM的儲存液,再用10mM的Tris-HCl的緩沖溶液(pH 7.4,含60mM KCl)稀釋成10μM濃度的探針溶液用于測試。
2.紫外吸收光譜的測定。用紫外分光光度計(jì)在時(shí)間為0,0.1,0.5,1,2,5,7,11,20,24小時(shí)測試上述探針溶液在360-600nm的吸收光譜,以此來判定該熒光探針的穩(wěn)定性。結(jié)果如圖1所示,探針在0-24小時(shí)內(nèi)的紫外吸收并沒有發(fā)生明顯的變化,沒有新的吸收峰出現(xiàn),表明在實(shí)驗(yàn)條件下,探針能夠穩(wěn)定存在于溶液中。
實(shí)施例三:DNA樣品的檢測
1.DNA樣品的制備。DNA樣品購于上海生工股份有限公司。將DNA樣品溶于適量的緩沖溶液(10mM Tris-HCl,pH 7.4,60mM KCl)中,根據(jù)樣品溶液在260nm處的紫外吸收值和摩爾吸光系數(shù)計(jì)算其濃度。
其中,所用的DNA序列為:
Ckit3:GGCGAGGAGGGGCGTGGCCGGC
CM22:TGAGGGTGGGTAGGGTGGGTAA
HRAS:TCGGGTTGCGGGCGCAGGGCACGGGCG
c-myc:TTGAGGGTGGGTAGGGTGGGTAAA
22AG:AGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGG
G3T3:GGGTTTGGGTTTGGGTTTGGG
htg-21:GGGTTAGGGTTAGGGTTAGGG
Ckit1:AGGGAGGGCGCTGGGAGGAGGG
ds26:CAATCGGATCGAATTCGATCCGATTG
polyd(A-T)9:ATATATATATATATATAT
polyd(G-C)9:GCGCGCGCGCGCGCGCGC
ct-DNA:小牛胸腺DNA
ss26:CCGCGAACGCCTAAGCTGCTAACCGC
2.探針溶液的制備。將熒光探針用DMSO溶劑配制成5mM的儲存液,再用10mM的Tris-HCl的緩沖溶液(pH 7.4,含60mM KCl)稀釋成1μM濃度的探針溶液用于測試。
3.熒光光譜檢測。固定熒光探針溶液的濃度為1μM,往探針溶液中分別滴加不同的DNA樣品,均勻后穩(wěn)定1分鐘,用熒光光譜測定體系的熒光發(fā)射,設(shè)定470nm為激發(fā)波長。如果體系的熒光強(qiáng)度增強(qiáng)100倍以上,則可判定待測DNA樣品為G-四鏈體結(jié)構(gòu),如果體系只有微弱的熒光增強(qiáng),則可判定待測DNA樣品為非G-四鏈體結(jié)構(gòu)。如圖中2-10所示,htg-21,Ckit1,Ckit3,G3T3,CM22,22AG,c-myc,HRAS為G-四鏈體結(jié)構(gòu),而ct-DNA,ss26,ds26,polyd(A-T)9,polyd(G-C)9為非G-四鏈體結(jié)構(gòu)。