本發(fā)明涉及基因工程技術(shù)領(lǐng)域,尤其涉及一種煙草akt1基因及其制備方法和應(yīng)用。
背景技術(shù):
鉀離子通道是允許鉀離子特異通透質(zhì)膜的離子通道,而阻礙其他離子通透-特別是鈉離子。這些通道一般由兩部分組成:一部分是通道區(qū),選擇并允許鉀離子通過,而阻礙鈉離子;另一部分是門控開關(guān),根據(jù)環(huán)境中的信號(hào)而開關(guān)通道。
現(xiàn)有技術(shù)對(duì)于鉀離子通道基因的研究在模式植物擬南芥中比較廣泛,例如,研究表明擬南芥鉀通道基因akt1編碼一個(gè)內(nèi)向整流通道,可以形成同源多聚體,主要在擬南芥根的表皮和皮層細(xì)胞中表達(dá)(bassetetal.,1995;lagardeetal.,1996);akt1負(fù)責(zé)介導(dǎo)擬南芥根細(xì)胞從土壤中吸收鉀營養(yǎng),akt1的功能缺失造成akt1突變體植株k+吸收能力降低,從而使得akt1突變體冠部的k+含量顯著降低,導(dǎo)致幼苗在低鉀脅迫下表現(xiàn)出冠部失綠黃化的低鉀敏感表型(lagardeetal.,1996;hirschetal.,1998;spaldingetal.,1999;xuetal.,2006)。
煙草是一種耗鉀量很大的作物,煙葉鉀含量是衡量煙葉品質(zhì)的的重要指標(biāo),目前,對(duì)于煙草中鉀離子通道的研究較少,煙草akt1的功能未知。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:
有鑒于此,本發(fā)明的目的在于提供煙草akt1基因及其制備方法和應(yīng)用。為了實(shí)現(xiàn)上述發(fā)明目的,本發(fā)明提供以下技術(shù)方案:
本發(fā)明提供了一種煙草akt1基因,所述akt1基因的序列如seqidno.1所示。
本發(fā)明提供了上述技術(shù)方案所述akt1基因的制備方法,包括以下步驟:設(shè)計(jì)pcr擴(kuò)增引物,所述的pcr擴(kuò)增引物包括正向引物和反向引物,所述的正向引物的核苷酸序列為:5’-atgccgttgccagagacaccga-3’,所述的反向引物的核苷酸序列為5’-tcaaaagatatacaagcgatc-3’;提取煙草細(xì)胞總rna;合成煙草細(xì)胞的cdna;以所述煙草細(xì)胞cdna為模板進(jìn)行akt1基因的pcr擴(kuò)增,得到目的片段,測(cè)序后得到akt1基因序列。
優(yōu)選的,所述pcr擴(kuò)增引物的設(shè)計(jì)是以ncbireferencesequence:
xm_009802835.1為參考序列,使用軟件primer5設(shè)計(jì)得到的,所述
xm_009802835.1的核苷酸序列如seqidno.2所示。
優(yōu)選的,所述的pcr擴(kuò)增的體系為20μl體系,包括premixextaq10μl,10μm的正向引物0.5μl,10μm的反向引物0.5μl,煙草細(xì)胞cdna1μl,ddh2o8μl。
優(yōu)選的,所述的pcr擴(kuò)增的反應(yīng)程序?yàn)椋?5℃預(yù)變性5min;95℃變性30s;55℃退火30s;72℃延伸2min;35個(gè)循環(huán)。
優(yōu)選的,所述的目的片段在測(cè)序之前還包括,將所述目的片段導(dǎo)入大腸桿菌dh5α感受態(tài)細(xì)胞中進(jìn)行菌落pcr驗(yàn)證,驗(yàn)證為陽性克隆后進(jìn)行測(cè)序。
優(yōu)選的,所述菌落pcr驗(yàn)證使用的正向引物核苷酸序列為:5’-atgccgttgccagagacaccga-3’,菌落pcr驗(yàn)證使用的反向引物核苷酸序列為:5’-tcaaaagatatacaagcgatc-3’。
優(yōu)選的,所述菌落pcr驗(yàn)證的體系為10μl,包括premixextaq5μl,10μm的正向引物0.5μl,10μm的反向引物0.5μl,ddh2o4μl。
本發(fā)明還提供了一種煙草akt1基因在促進(jìn)煙草植株鉀離子吸收和轉(zhuǎn)運(yùn)方面的應(yīng)用。
優(yōu)選的,將所述的煙草akt1基因轉(zhuǎn)入到煙草植株中,使akt1基因超量表達(dá)以提高煙草植株的煙葉中鉀離子的含量。
本發(fā)明的有益效果:本發(fā)明提供的akt1基因,是通過同源克隆的方法制備獲得的,所述的akt1基因全長1908bp,經(jīng)功能驗(yàn)證,本發(fā)明提供的akt1基因轉(zhuǎn)入鉀吸收缺陷型酵母突變株r5421后的重組酵母具有鉀離子吸收,轉(zhuǎn)運(yùn)功能。本發(fā)明實(shí)施例中,3個(gè)akt1基因轉(zhuǎn)基因煙草葉中鉀離子的質(zhì)量含量分別是1.61%,1.63%和1.65%,非轉(zhuǎn)基因的煙草葉中鉀離子的質(zhì)量含量是0.84%,轉(zhuǎn)基因的煙草葉中鉀離子的含量顯著高于非轉(zhuǎn)基因的,可見,煙草植株中超量表達(dá)akt1基因可促進(jìn)煙草對(duì)鉀離子的吸收。因此,本發(fā)明提供的akt1基因具有促進(jìn)鉀離子吸收和轉(zhuǎn)運(yùn)的功能。
附圖說明
圖1為實(shí)施例2中akt1基因轉(zhuǎn)入鉀吸收缺陷型酵母突變株r5421后的重組酵母在鉀離子濃度為0mm和2mm的培養(yǎng)基上的生長情況;其中圖1a為鉀離子濃度為0mm的培養(yǎng)基上的生長情況,圖1b為鉀離子濃度為2mm的培養(yǎng)基上的生長情況;
圖中,1為轉(zhuǎn)入akt1基因的重組酵母,2為陰性對(duì)照p416,3為陽性對(duì)照;從左到右依次為原液、10倍稀釋液、100倍稀釋液在培養(yǎng)基上的生長結(jié)果。
具體實(shí)施方式
本發(fā)明提供了一種煙草akt1基因,所述煙草鉀離子通道基因的序列如seqidno.1所示,本發(fā)明中所述的akt1基因全長1908bp。
本發(fā)明提供了上述技術(shù)方案所述煙草akt1基因的制備方法,包括以下步驟:設(shè)計(jì)pcr擴(kuò)增引物;提取煙草細(xì)胞總rna;合成煙草細(xì)胞cdna;以所述煙草細(xì)胞cdna為模板進(jìn)行akt1基因的pcr擴(kuò)增,得到目的片段,測(cè)序后得到akt1基因序列。
本發(fā)明中,所述的pcr擴(kuò)增引物的設(shè)計(jì),是以ncbireferencesequence:xm_009802835.1為參考序列,使用軟件primer5設(shè)計(jì)得到的,所述xm_009802835.1的序列如seqidno.2所示。
在本發(fā)明中,所述的pcr擴(kuò)增引物優(yōu)選包括正向引物和反向引物,所述的正向引物核苷酸序列為:5’-atgccgttgccagagacaccga-3’,長度為22bp;所述反向引物的核苷酸序列為5’-tcaaaagatatacaagcgatc-3’,長度為21bp。
本發(fā)明在進(jìn)行akt1基因的pcr擴(kuò)增之前,提取煙草細(xì)胞總rna,并將提取得到的總rna反轉(zhuǎn)錄為cdna。在本發(fā)明中,所述的煙草細(xì)胞總rna的提取采用本領(lǐng)域常用的提取細(xì)胞總rna的技術(shù)方案即可,本發(fā)明的實(shí)施例中具體的可采用trizol法。在本發(fā)明中,所述的煙草細(xì)胞總rna提取的原料為煙草的新鮮葉片,所述煙草采用為本領(lǐng)域常規(guī)的煙草品種,本發(fā)明實(shí)施例中,所述煙草品種為k326。
本發(fā)明在提取得到煙草細(xì)胞總rna后,將所述煙草細(xì)胞總rna反轉(zhuǎn)錄合成cdna。本發(fā)明中,所述的cdna的合成,采用本領(lǐng)域常規(guī)的cdna的合成方法即可,無其他特殊要求;具體的本發(fā)明實(shí)施例中采用takara公司的cdna合成試劑盒完成cdna的合成。
本發(fā)明在得到cdna之后,進(jìn)行akt1基因pcr擴(kuò)增,得到目的片段。在本發(fā)明中,所述akt1基因pcr擴(kuò)增的體系優(yōu)選為20μl體系,包括premixextaq10μl,10μm的正向引物0.5μl,10μm的反向引物0.5μl,煙草細(xì)胞cdna1μl,ddh2o8μl。在本發(fā)明中,所述akt1基因的pcr擴(kuò)增的反應(yīng)程序優(yōu)選為:95℃預(yù)變性5min;95℃變性30s;55℃退火30s;72℃延伸2min;35個(gè)循環(huán)。
本發(fā)明在akt1基因pcr擴(kuò)增得到目的片段后,將所述目的片段進(jìn)行測(cè)序,得到akt1基因。本發(fā)明在所述的pcr擴(kuò)增后優(yōu)選的對(duì)目的片段進(jìn)行純化,本發(fā)明對(duì)所述純化的方法沒有特殊的限定,采用本領(lǐng)域技術(shù)人員熟知的dna純化試劑盒進(jìn)行即可。
本發(fā)明在所述純化完成后,優(yōu)選將所述純化后的目的片段導(dǎo)入大腸桿菌dh5α感受態(tài)細(xì)胞中進(jìn)行菌落pcr驗(yàn)證,驗(yàn)證為陽性克隆后進(jìn)行測(cè)序。本發(fā)明在得到陽性克隆后,優(yōu)選的采用菌落pcr的方法來驗(yàn)證陽性克隆。在本發(fā)明中,所述菌落pcr的正向引物核苷酸序列為:5’-atgccgttgccagagacaccga-3’,反向引物核苷酸序列為:5’-tcaaaagatatacaagcgatc-3’;所述菌落pcr的體系為10μl,包括premixextaq5μl,10μm的正向引物0.5μl,10μm的反向引物0.5μl,ddh2o4μl。在本發(fā)明中,所述的將純化后的目的片段導(dǎo)入大腸桿菌dh5α感受態(tài)細(xì)胞所采用的方法為本領(lǐng)域常規(guī)的轉(zhuǎn)化大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞的方法,具體的在本發(fā)明實(shí)施例中采用以下方法:將所述目的片段與pmd19-t載體在16℃的條件下連接10~14h,得到連接產(chǎn)物;將所述連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化大腸桿菌dh5α感受態(tài)細(xì)胞,得到轉(zhuǎn)化后的大腸桿菌dh5α;將所述的轉(zhuǎn)化后的大腸桿菌dh5α接種于涂有氨芐青霉素的lb平板上進(jìn)行篩選培養(yǎng),得到陽性克隆。
本發(fā)明在菌落pcr驗(yàn)證陽性克隆后,優(yōu)選的,從已驗(yàn)證的陽性克隆中隨機(jī)選取2~4個(gè)獨(dú)立的陽性克隆進(jìn)行測(cè)序,得到所述的akt1基因的序列?;赼kt1基因的鉀離子吸收和轉(zhuǎn)運(yùn)性能,本發(fā)明還提供了一種煙草akt1基因在促進(jìn)煙草植株鉀離子吸收和轉(zhuǎn)運(yùn)方面的應(yīng)用。本發(fā)明將所述的煙草akt1基因轉(zhuǎn)入到煙草植株中,使akt1基因超量表達(dá)以提高煙草植株的煙葉中鉀離子的含量。在本發(fā)明中,將所述的煙草akt1基因轉(zhuǎn)入到煙草植株的方法優(yōu)選的為農(nóng)桿菌介導(dǎo)法。
下面結(jié)合實(shí)施例對(duì)本發(fā)明提供的akt1基因及其功能驗(yàn)證方法進(jìn)行詳細(xì)的說明,但是不能把它們理解為對(duì)本發(fā)明保護(hù)范圍的限定。
實(shí)施例1
取0.5g煙草新鮮葉片,采用trizol法提取煙草細(xì)胞的總rna,然后采用takara公司的cdna合成試劑盒合成cdna,進(jìn)一步采用primer5.0軟件設(shè)計(jì)并經(jīng)過人工優(yōu)化得到引物,所述引物包括正向引物和反向引物,所述的正向引物的序列為:5’-atgccgttgccagagacaccga-3’,所述的反向引物的序列為5’-tcaaaagatatacaagcgatc-3’,以合成的cdna為模板,進(jìn)行pcr擴(kuò)增,pcr擴(kuò)增體系為為20μl體系,包括premixextaq10μl,10μm的正向引物0.5μl,10μm的反向引物0.5μl,煙草細(xì)胞cdna1μl,ddh2o8μl;所述的pcr擴(kuò)增的反應(yīng)程序?yàn)椋?5℃預(yù)變性5min;95℃變性30s;55℃退火30s;72℃延伸2min;35個(gè)循環(huán)。
pcr擴(kuò)增完成后,使用dna純化試劑盒進(jìn)行目的片段的純化,將純化后的目的片段與pmd19-t載體16℃連接12h得到連接產(chǎn)物,將所述得到的連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化大腸桿菌dh5α感受態(tài)細(xì)胞得到轉(zhuǎn)化后的大腸桿菌dh5α,將所述的轉(zhuǎn)化后的大腸桿菌dh5α接種于涂有氨芐青霉素的lb平板上進(jìn)行篩選培養(yǎng)得到陽性克隆。在得到陽性克隆后,采用菌落pcr的方法來驗(yàn)證陽性克隆,所述菌落pcr的正向引物為:5’-atgccgttgccagagacaccga-3’,反向引物為:5’-tcaaaagatatacaagcgatc-3’;所述菌落pcr的體系為10μl,包括premixextaq5μl,10μm的正向引物0.5μl,10μm的反向引物0.5μl,ddh2o4μl。然后從已驗(yàn)證的陽性克隆中隨機(jī)選取3個(gè)獨(dú)立的陽性克隆送到生物技術(shù)公司進(jìn)行測(cè)序,本發(fā)明在測(cè)序后得到所述的akt1基因的序列,如seqidno.1所示。
實(shí)施例2
將連接有實(shí)施例1中所述的akt1基因的t-載體與表達(dá)載體p416分別進(jìn)行雙酶切(酶切位點(diǎn)為:xbaⅰ和smaⅰ),回收目的基因和表達(dá)載體p416,然后用連接酶連接,將連接后的重組酵母表達(dá)載體轉(zhuǎn)入大腸桿菌dh5α的感受態(tài)細(xì)胞,對(duì)轉(zhuǎn)化后的大腸桿菌單菌落進(jìn)行pcr擴(kuò)增、酶切來驗(yàn)證是否構(gòu)建成功,將構(gòu)建成功的重組酵母表達(dá)載體轉(zhuǎn)入到r5421中具體步驟如下:用接菌環(huán)取保存的r5421酵母菌劃線于固體培養(yǎng)基ypda上,28℃培養(yǎng)12h;挑取r5421酵母單菌落于ep管中,加1mlypda培養(yǎng)液渦旋;將上述菌液全部轉(zhuǎn)入裝有ypda培養(yǎng)液的三角瓶中,于30℃,250rpm搖菌至od600=1.2,16h;按1:10轉(zhuǎn)接,搖至od600=1.0~1.2;于28℃,1000rpm離心5min集菌,用1/2體積的滅菌超純水重懸;于28℃,1000rpm離心5min集菌,吸干上清;依次加入下列成分(每5ml原始菌液):
渦旋1min,使轉(zhuǎn)化體系完全混勻;放于30℃的水浴中溫育30min;再放入42℃的水浴中熱擊28min,冰上冷卻10min;7000rpm離心15s,棄上清;用1ml的無菌水輕輕重懸沉淀;取200μl轉(zhuǎn)化混合物鋪于營養(yǎng)缺陷型平板上;30℃培養(yǎng)3天。提取酵母質(zhì)粒并鑒定結(jié)果
挑取酵母單克隆于加kcl的液體培養(yǎng)基中,培養(yǎng)至飽和;
收集菌液1.5ml,離心,棄上清,用200μl酵母提取液重懸沉淀;
加入0.45mm的無菌玻璃珠(promega)剛好低于液面,渦旋1min,加入200μl的酚/氯仿,再渦旋1min,離心取上清至另一新離心管中,再加入200μl的酚/氯仿,離心取上清;用60μl3m的naac和400μl無水乙醇,于-20℃沉淀dna,30min。離心,干燥,將質(zhì)粒溶于15μl無菌水,進(jìn)行pcr鑒定。
挑取鑒定過的酵母單菌落在營養(yǎng)缺陷平板上劃線,30℃培養(yǎng)3天;用牙簽在營養(yǎng)缺陷平板上蘸取少量菌體于2ml營養(yǎng)缺陷液中培養(yǎng)12h;8000rpm離心1min收集菌體;棄上清,用1ml雙蒸水懸浮菌體,8000rpm離心1min;棄上清,用1ml雙蒸水重懸浮,調(diào)od600為0.8;將未稀釋菌液及分別稀釋10倍、100倍后的菌液,分別取5ul在鉀離子濃度為0,2mm的培養(yǎng)基上,30℃培養(yǎng)3天觀察結(jié)果。
結(jié)果如圖1b所示,在鉀離子濃度為0mm培養(yǎng)基上,陰性對(duì)照p416幾乎不生長,本發(fā)明鉀轉(zhuǎn)運(yùn)體和陽性對(duì)照akt1均可以生長,且生長明顯比p416好。隨著稀釋倍數(shù)的增加,鉀轉(zhuǎn)運(yùn)體及陽性對(duì)照akt1仍然可以生長。
上述結(jié)果證明,本發(fā)明所述的akt1基因具有鉀吸收和轉(zhuǎn)運(yùn)功能。
實(shí)施例3
使用農(nóng)桿菌介導(dǎo)法將akt1基因轉(zhuǎn)入到煙草中使其超量表達(dá)得到轉(zhuǎn)基因煙草t1代,在得到轉(zhuǎn)基因煙草t1代后,使轉(zhuǎn)基因煙草t1自然繁殖得到轉(zhuǎn)基因煙草t2代,使用火焰光度計(jì)法對(duì)3個(gè)株系超量表達(dá)該基因的t2代轉(zhuǎn)基因煙草葉片進(jìn)行鉀含量測(cè)定,結(jié)果表明3個(gè)轉(zhuǎn)基因株系鉀質(zhì)量含量分別是1.61%.1.63%,1.65%,而同一條件下非轉(zhuǎn)基因煙草葉片中鉀離子的質(zhì)量含量是0.84%,3個(gè)株系轉(zhuǎn)基因材料的鉀含量明顯高于非轉(zhuǎn)基因材料,說明該基因超量表達(dá)后能夠促進(jìn)煙草對(duì)鉀的吸收。
由以上實(shí)施例可知,本發(fā)明所述的akt1基因具有促進(jìn)鉀吸收和轉(zhuǎn)運(yùn)功能。
以上所述僅是本發(fā)明的優(yōu)選實(shí)施方式,應(yīng)當(dāng)指出,對(duì)于本技術(shù)領(lǐng)域的普通技術(shù)人員來說,在不脫離本發(fā)明原理的前提下,還可以做出若干改進(jìn)和潤飾,這些改進(jìn)和潤飾也應(yīng)視為本發(fā)明的保護(hù)范圍。