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      一種突變的α?淀粉酶及其制備方法和應(yīng)用與流程

      文檔序號:12248845閱讀:366來源:國知局
      一種突變的α?淀粉酶及其制備方法和應(yīng)用與流程
      本發(fā)明屬于生物工程領(lǐng)域,具體涉及一種突變的α-淀粉酶及其制備方法和應(yīng)用。
      背景技術(shù)
      :淀粉是自然界中僅次于纖維素的第二大多糖儲備物質(zhì),是許多食品與非食品行業(yè)的重要組成部分。直到19世紀之前,淀粉水解使用的是稀釋鹽酸的酸水解法,但因該法的糖含量較低且產(chǎn)生一些不必要的化合物,現(xiàn)在幾乎完全被酶水解法取代。α-淀粉酶,即α-1,4-葡聚糖水解酶,普遍分布在動物、植物和微生物中,能隨機作用于淀粉、糖原、寡糖或多聚糖分子內(nèi)部的α-1,4-糖苷鍵,將淀粉水解成糊精、麥芽糖、低聚糖和葡萄糖等一系列小分子物質(zhì)。世界酶市場呈現(xiàn)一種高速增長現(xiàn)象,2005年世界酶市場在30億美元左右,2009年在51億美元,2010年已增長至58億美元,同時預(yù)計2020年將達到100億美元以上,其中淀粉酶產(chǎn)業(yè)約占30%左右。α-淀粉酶是最早實現(xiàn)工業(yè)化生產(chǎn)并且是迄今為止用途最廣、產(chǎn)量最大的酶制劑品種,幾乎占淀粉酶制劑總產(chǎn)量的50%以上。特別是微生物產(chǎn)α-淀粉酶已廣泛應(yīng)用于食品、飲料、制藥、紡織等行業(yè)。耐高溫α-淀粉酶廣泛應(yīng)用于工業(yè)生產(chǎn),如洗滌劑產(chǎn)業(yè)、紡織業(yè)、釀酒與烘焙行業(yè)。這些產(chǎn)業(yè)在淀粉加工時往往需要在較高的溫度下進行,耐高溫α-淀粉酶最直接的效應(yīng)就是減少了冷卻步驟,降低能源消耗和成本。其次,在高溫環(huán)境下許多雜菌的生長受到抑制,降低了生產(chǎn)過程中的污染。耐高溫α-淀粉酶的開發(fā)對淀粉加工行業(yè)有巨大的經(jīng)濟效益。目前使用的α-淀粉酶最適溫度在95℃左右、pH在5.8~6.8之間,而工業(yè)生產(chǎn)過程中自然淀粉漿的pH在3.2~4.5之間,因此α-淀粉酶不能適應(yīng)低pH的生產(chǎn)過程。為了調(diào)整其作用pH,往往需要將淀粉漿的pH從3.2~4.5調(diào)至5.8~6.2,且需添加Ca2+作為穩(wěn)定劑。而下一個糖化步驟的pH在4.2~4.5,同α-淀粉酶的使用,可以使淀粉漿液化糖化的步驟省去調(diào)節(jié)pH與脫去Ca2+的進一步純化,簡化工藝流程,降低生產(chǎn)成本?;谄胀é?淀粉酶往往存在熱穩(wěn)定差與pH不適應(yīng)工業(yè)生產(chǎn)等問題,目前研究者著重研究耐酸耐高溫α-淀粉酶,使更利于工業(yè)生產(chǎn),對于節(jié)約能源、降低成本等有重要意義。古菌激烈火球菌生長環(huán)境特殊,其本身所含的基因蛋白抗逆性極強,其本身攜帶的淀粉酶(PFAMY)耐高溫、強酸。本發(fā)明將激烈火球菌的淀粉酶(PFAMY)進行優(yōu)化合成以及突變,最終獲得突變的、酶活穩(wěn)定性提高的具有更好的工業(yè)應(yīng)用前景的α-淀粉酶。技術(shù)實現(xiàn)要素:為解決上述技術(shù)問題,本發(fā)明提供一種酶活穩(wěn)定性提高的具有更好的工業(yè)應(yīng)用前景的突變型的α-淀粉酶。為實現(xiàn)上述目的,本發(fā)明所采用的技術(shù)方案是:一種突變的α淀粉酶的耐高溫氨基酸序列,其氨基酸序列與激烈火球菌菌屬α-淀粉酶(PFAMY)SEQIDNO:1具有至少90%以上的同源性。所提供的氨基酸序列在SEQIDNO:1的氨基酸序列基礎(chǔ)上,有下列一個或多個位點的氨基酸被其它氨基酸所替換,被替換的氨基酸位點為:W65、C204、N366。優(yōu)選地,上述淀粉酶突變?yōu)榫哂蠸EQIDNO:2所示的氨基酸序列,即在野生型激烈火球菌菌屬α-淀粉酶(PFAMY)氨基酸序列SEQIDNO:1基礎(chǔ)上,在其氨基酸W65、C204、N366位置有突變。優(yōu)選地,上述突變的α-淀粉酶在SEQIDNO:1氨基酸序列基礎(chǔ)上,有一個或多個位點的氨基酸被所述氨基酸替換見SEQIDNO:2,所述氨基酸為:W65D、C204N、N366C。一種突變的α-淀粉酶,具有如SEQIDNO:3所示DNA序列。該序列具有以下特征:a.該基因序列為根據(jù)SEQIDNO:2氨基酸序列,針對宿主大腸桿菌表達所需的優(yōu)選密碼子和基因高效表達所需的G(鳥嘌呤)、C(胞嘧啶)堿基含量,進行全基因合成的全新DNA序列;b.該基因與野生型激烈火球菌屬α-淀粉酶(PFAMY)基因序列(SEQIDNO:4)相比,稀有密碼子從13個降到0個;同時刪除了原基因SEQIDNO:4內(nèi)部的NdeI、SacI酶切位點。進一步地,含有上述突變的α-淀粉酶氨基酸序列或DNA的重組載體、宿主菌均屬于本發(fā)明的保護范圍。一種含有權(quán)利要求1所述氨基酸序列或權(quán)利要求要求2所述DNA序列的重組載體。一種含有權(quán)利要求1所述氨基酸序列或權(quán)利要求要求2所述DNA序列的宿主菌。本發(fā)明依據(jù)本領(lǐng)域技術(shù)人員熟知的方法,構(gòu)建了含有上述突變的α-淀粉酶基因(SEQIDNO:2)(《精編分子生物學(xué)實驗指南第四版》第8章方法和《分子克隆試驗指南第三版》第15章方案2方法構(gòu)建);選擇誘導(dǎo)型載體如PET系列(Novagen公司購買)或其它誘導(dǎo)型載體,如:一種攜帶上述突變基因的誘導(dǎo)型表達載體PET30-PFAMY(見圖1)。本發(fā)明采用誘導(dǎo)型載體,其所述的的宿主菌優(yōu)選為E.coliBL21(DE3)(Promegea公司)或JM109(DE3)(生工生物工程(上海)有限公司)或其它適宜菌株為受體菌。上述含有PET30-PFAMY的受體構(gòu)建方法,參照本領(lǐng)域技術(shù)人員熟知的氯化鈣或電穿孔轉(zhuǎn)移法(J.薩姆布魯克等,《分子克隆試驗指南第三版》第1章方案25或方案26)。本發(fā)明的工程菌經(jīng)誘導(dǎo)表達后,采用離心、超聲破壁、加熱、pH調(diào)整、鹽析等步驟進行純化,即可用于α-1,4-葡聚糖的水解。本發(fā)明具有的優(yōu)點和積極效果是:(1)突變后的PFAMY基因在大腸桿菌中表達量達到了10000u/l,比之前的野生型的酶活有了大幅的提高,簡化該酶工業(yè)化后期處理,降低成本;(2)突變后的PFAMY熱穩(wěn)定性增加,由原來的最適溫度90℃變?yōu)?00℃,熱穩(wěn)定性更強,酶活更穩(wěn)定;(3)該酶在90℃高溫條件下,在實驗設(shè)計的4個小時內(nèi),野生型與突變的的PFAMY酶活都沒有變低,高溫穩(wěn)定性強;在100℃時隨時間的延長野生型PFAMY酶活下降,而突變的PFAMY酶活穩(wěn)定,證明在100℃下,突變的PFAMY半衰期延長,熱穩(wěn)定性強,增強了其工業(yè)應(yīng)用潛力。附圖說明圖1質(zhì)粒PET30-PFAMY的圖譜。圖2溫度對野生型與突變的PFAMY的影響。圖3長時間高溫對野生型與突變的PFAMY的影響。具體實施方式為了更好的理解本發(fā)明,下面通過實施例對本發(fā)明進行具體描述和說明。實施例1基因設(shè)計及合成(1)基因設(shè)計:根據(jù)Genebank中古生菌PyrococcusfuriosusDSM3638蛋白序列(SEQIDNO:1,Genebank:AAL80601.1),在其W65、C204、N366位點引入突變位點,及得到如SEQIDNO:2所示氨基酸序列;利用在線設(shè)計工具Jcat(http://www.jcat.de/)反向設(shè)計基因序列。針對宿主大腸桿菌表達所需的優(yōu)選密碼子和基因高效表達所需的G+C堿基含量,優(yōu)化上述設(shè)計的基因序列為SEQIDNO:3序列,該序列與野生型基因序列SEQIDNO:4相比:大腸桿菌稀有密碼子從野生型(SEQIDNO:4)的13個降低到了0個,同時在設(shè)計過程中去除NdeI、SacI酶切位點,有利后期基因操作。通過上述系列設(shè)計有利于宿主菌大腸桿菌高效表達該基因(SEQIDNO:3)。(2)基因合成:根據(jù)SEQIDNO:3所示基因序列,即PFAMY片段交由生工生物工程(上海)有限公司進行全基因合成。2表達載體PET30-PFAMY及轉(zhuǎn)化體BL21(DE3)/PET30-PFAMY的構(gòu)建(1)質(zhì)粒PET30-PFAMY的構(gòu)建:對步驟1獲得的基因片段PFAMY使用BamHI、HindIII雙酶切。酶切體系如下:酶切體系50μL,ASPGA片段5μL(2μg),BamHI、HindIII酶各1μL,緩沖液5μL,滅菌雙蒸水補足50μL。37℃保溫4小時。采用相同的體系酶切質(zhì)粒PET30(Novagen公司)。通過酶切得到線性片段,采用DNA凝膠回收試劑盒(生工生物工程(上海)有限公司)純化得到目的片段。使用T4連接酶對所得片段進行連接反應(yīng),體系如下:T4DNA連接酶1μL,PFAMY酶切片段3μL,PET30酶切片段2μL,連接緩沖液1μL,滅菌雙蒸水補足10μL。16℃保溫4小時。將保溫后的產(chǎn)物,通過熱激方法(J.薩姆布魯克等,《分子克隆試驗指南第三版》第1章方案25或方案26)轉(zhuǎn)化到宿主菌E.coliDH5α中,涂布到LB培養(yǎng)抗性平板(配方見《分子克隆試驗指南第三版》第一章),37℃保溫過夜。隨機挑取陽性克隆,進行LB液體培養(yǎng)基(配方見《分子克隆試驗指南第三版》第一章)37℃,220rpm培養(yǎng)過夜。采用質(zhì)??焖偬崛≡噭┖校ㄉど锕こ蹋ㄉ虾#┯邢薰荆┨崛≠|(zhì)粒,即得到所構(gòu)建的質(zhì)粒PET30-PFAMY(見圖1)。(2)轉(zhuǎn)化體BL21(DE3)/PET30-PFAMY的構(gòu)建(參照J.薩姆布魯克等,《分子克隆試驗指南第三版》方法)挑取大腸桿菌BL21(DE3)單菌落到LB試管接種后在37℃振蕩過夜培養(yǎng);在含50mlLB的三角瓶中加入0.5ml的過夜培養(yǎng)液,37℃劇烈振蕩培養(yǎng)約2小時使菌體長到對數(shù)前期;.無菌條件下將細菌轉(zhuǎn)移到用冰預(yù)冷的50ml聚丙烯管中,冰上放置10分鐘;4℃,4000rpm離心,倒出上清,將管倒置,使殘余液盡量流出;加入6ml用冰預(yù)冷的0.1mol/LCaCl2重懸沉淀,放置冰上30分鐘;4℃,3000rpm離心,倒出上清,將管倒置,使殘余液盡量流出;加入1.2ml用冰預(yù)冷的0.1mol/LCaCl2重懸沉淀(若要制備于-70°C保存?zhèn)溆玫母惺軕B(tài)細胞,則加入含有20%甘油的0.1mol/LCaCl2懸浮菌體),4℃放置5~24小時后轉(zhuǎn)化;吸200μl感受態(tài)細胞懸液,加DNA(體積<10μl,DNA<50ng)輕輕混勻,冰上放置30分鐘;42℃水浴靜止熱激90秒,立即放入冰上冷卻;加入500μl液體LB培養(yǎng)液,混勻,放入37℃搖床低速搖動復(fù)蘇45分鐘(也可加LB后直接放入37℃水浴復(fù)蘇1小時,中間振蕩管子使細胞懸?。晃∞D(zhuǎn)化的細胞涂布加有抗生素的平板上,放于37℃培養(yǎng)箱中倒置培養(yǎng),生長出的菌落即為轉(zhuǎn)化體PET30-PFAMY/BL21(DE3)。3轉(zhuǎn)化體BL21(DE3)/PET30-PFAMY的誘導(dǎo)表達挑取單菌落于含50μg/mLKan的LB液體培養(yǎng)基中,37℃250r/min培養(yǎng)過夜后成為活化種子,再以2%的接種量接種到M9培養(yǎng)基(裝液量為50mL/250mL,23℃250r/min培養(yǎng)14小時,加入終濃度為0.05mMIPTG(異丙基-β-D-硫代半乳糖苷)中,進行誘導(dǎo)表達,繼續(xù)培養(yǎng)12小時,離心收集菌體。其中,M9培養(yǎng)基的配置方法為:(1)配制1M的MgSO4:MgSO4·7H2O2.46g加雙蒸水10mL溶解,高壓滅菌備用;(2)配制1M的Cacl2:Cacl2·6H2O2.191g加雙蒸水10mL溶解,高壓滅菌備用;(3)配制5×M9鹽溶液:Na2PO4·7H2O12.8g;KH2PO43.0g;Nacl0.5g;NH4cl1.0g;加雙蒸水200mL溶解,121度滅菌15分鐘;(4)配制20%的葡萄糖溶液:4g葡萄糖加雙蒸水20mL溶解,0.22微米濾器過濾除菌;(5)無菌操作配制M9培養(yǎng)基:5×M9鹽溶液200mL;1M的MgSO42mL;20%的葡萄糖溶液20mL;1M的Cacl20.1mL;加滅菌雙蒸水至1000m。4PFAMY淀粉水解酶酶活測定離心收集使用步驟3方法得到的菌體,加入等體積的0.02M,pH8.0的磷酸鹽緩沖液,使用超聲波細胞破壁儀進行破壁20分鐘;離心得到上清為粗制酶液。試劑和溶液1)碘。2)碘化鉀。3)原碘液:稱取11.0g碘和22.0g碘化鉀,用少量水使碘完全溶解,定容至500mL,貯存于棕色瓶中。4)稀碘液:吸取原碘液2.00mL,加20.0g碘化鉀用水溶解并定容至500mL,貯存于棕色瓶中。5)可溶性淀粉溶液(20g/L):稱取2.000g(精確至0.001g)可溶性淀粉(以絕干計)于燒杯中,用少量水調(diào)成漿狀物,邊攪拌邊緩緩加入70mL沸水中,然后用水分次沖洗裝淀粉的燒杯,洗液倒入其中,攪拌加熱至完全透明,冷卻定容至100mL。溶液現(xiàn)配現(xiàn)用。(注:可溶性淀粉應(yīng)采用湖州展望化學(xué)藥業(yè)有限公司生產(chǎn)的酶制劑專用可溶性淀粉。)6)磷酸緩沖液(pH-5.0):稱取36.88g磷酸氫二鈉(Na2HP04·12H20)和9.32g檸檬酸(C6H807.H2O),用水溶解并定容至1000mL。用pH計校正后使用。7)鹽酸溶液[c(HCI)=0.1mol/L]:按GB/T601配制。儀器1)分光光度計。2)恒溫水?。嚎販鼐韧?.1℃。3)自動移液器。4)試管:25mm×200mm。5)秒表。分析步驟待測酶液的制備準確吸取酶液1.00mL,用少量磷酸緩沖液充分溶解,將上清液小心傾入100mL的容量瓶中,若有剩余殘渣,再加少量磷酸緩沖液充分研磨,最終樣品全部移入容量瓶中,用磷酸緩沖液定容至刻度,搖勻。用四層紗布過濾,濾液待用。測定吸取20.0mL可溶性淀粉溶液于試管中,加入磷酸緩沖液5.00mL,搖勻后,置于95℃土0.2℃恒溫水浴中預(yù)熱8min;加入1.00mL稀釋好的待測酶液,立即計時,搖勻,準確反應(yīng)5min;立即用自動移液器吸取1.00mL反應(yīng)液,加到預(yù)先盛有0.5mL鹽酸溶液和5.00mL稀碘液的試管中,搖勻,并以0.5mL鹽酸溶液和5.00mL稀碘液為空白,于660nm波長下,用10mm比色皿迅速測定其吸光度(A)。根據(jù)吸光度查國標GB/T601,求得測試酶液的濃度。耐高溫淀粉酶制劑的酶活力按下式計算:X=C×N×16.67式中:X:樣品的酶活力,u/mL或u/g;C:測試酶樣的濃度,u/mL或u/g;N:樣品的稀釋倍數(shù);16.67:根據(jù)酶活力定義計算的換算系數(shù)。所得結(jié)果表示至整數(shù)。6突變的PFAMY在淀粉水解中的應(yīng)用。經(jīng)過突變的PFAMY在本發(fā)明所提供的培養(yǎng)基中進行發(fā)酵,誘導(dǎo)后48小時發(fā)酵單位達到10000u/l,與野生型的PFAMY2500u/l相比較,提高了3倍,突變位點顯著地提高了發(fā)酵單位,為后期處理提供了方便。表1突變的PFAMY與野生型的PFAMY發(fā)酵后的酶活發(fā)酵時間誘導(dǎo)后24小時誘導(dǎo)后48小時突變的PFAMY3500u/l10000u/l無突變的PFAMY1500u/l2500u/l突變后的PFAMY熱穩(wěn)定性有所增加,由原來的最適溫度90℃變?yōu)?00℃,熱穩(wěn)定性更強,酶活更穩(wěn)定,見圖2;將野生型PFAMY以及突變后的PFAMY的反應(yīng)體系分別置于60℃、70℃、80℃、90℃、100℃、110℃進行反應(yīng),它們在90-100攝氏度時酶活達到最高點,然后隨溫度的上升酶活急速下降(見圖2.將最高值設(shè)定成為100,其余酶活按100進行折算);該酶在90℃高溫條件下,在實驗設(shè)計的4個小時內(nèi),野生型與突變的的PFAMY酶活幾乎沒有變化,穩(wěn)定性強;在100℃時隨時間的延長野生型PFAMY酶活下降,而突變的PFAMY酶活穩(wěn)定,證明在100℃下,突變的PFAMY半衰期延長,熱穩(wěn)定性強,增強了其工業(yè)應(yīng)用潛力(見圖3.將最高值設(shè)定成為100,其余酶活按100進行折算)。當(dāng)前第1頁1 2 3 
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