本發(fā)明屬于基因工程技術(shù)領(lǐng)域,具體而言,涉及一種可在哺乳動物細胞中穩(wěn)定表達Cas9基因的DNA載體。
背景技術(shù):
CRISPR-Cas9系統(tǒng),被稱為第三代基因編輯技術(shù)。相比于它的兩位前輩ZFN系統(tǒng)和TALEN系統(tǒng),它有著一些無可比擬的優(yōu)點。首先,CRISPR-Cas9系統(tǒng)的可用位置更多。理論上基因組中每8個堿基就能找到一個可以用CRISPR-Cas9進行編輯的位置,可以說這一技術(shù)能對任一基因進行操作,而TALEN和ZFN系統(tǒng)則在數(shù)百甚至上千個堿基中才能找到一個可用位點,這大大限制了使用范圍。此外還可以將Cas9蛋白連接其他功能蛋白,來在特定DNA序列上研究這些蛋白對細胞的影響。第三,更為重要的是,CRISPR-Cas9系統(tǒng)的使用極為方便,只需要簡單的幾步就能完成,幾乎任何實驗室都可以開展工作,而不需要向ZFN和TALEN那樣借助商業(yè)公司的協(xié)助完成。由于以上特點,CRISPR-Cas9被評為2013年生物學(xué)10大突破之一。
(CRISPR)/CRISPR-associated(Cas)是細菌和古細菌一種不斷進化適應(yīng)的免疫防御機制。目前較為常用的是CRISPR/Cas9系統(tǒng),該系統(tǒng)由向?qū)NA和Cas9切割酶組成。CRISPR/Cas9利用一段小RNA來識別并剪切DNA以降解外來核酸分子。Cong等(Multiplex Genome Engineering Using CRISPR/Cas Systems.Science.2013)及Mali等(RNA-guided human genome engineering via Cas9.Science.2013)證明CRISPR/Cas9系統(tǒng)能在293T、K562、iPS等多種細胞中,進行有效的靶向酶切,非同源重組(NHEJ)、同源重組(HR)效率在3-25%之間,與TALENs酶切效果相當(dāng)。他們還證明,多個靶點可以同時進行靶向酶切。但是CRISPR/Cas9的瞬時轉(zhuǎn)染存在效率不穩(wěn)定的問題,而且在功能基因組高通量篩選過程中此問題尤其嚴重,因而迫切需要開發(fā)出一種Cas9的穩(wěn)定表達載體,實現(xiàn)Cas9的穩(wěn)定持續(xù)表達。
技術(shù)實現(xiàn)要素:
本發(fā)明的目的在于提供一種可在哺乳動物細胞中穩(wěn)定表達Cas9基因的質(zhì)粒DNA載體。本發(fā)明使用內(nèi)切酶AgeⅠ、EcoRⅠ、SacⅡ三酶切pX330載體得Cas9編碼區(qū),在兩側(cè)添加合適的酶切位點后,將編碼Cas9的CDS序列構(gòu)建到pUC-EIN載體中,得載體pUC-CIN。使用pUC-CIN載體穩(wěn)定轉(zhuǎn)染豬細胞系,經(jīng)單克隆篩選可以獲得穩(wěn)定表達Cas9基因的細胞株,從而達到在哺乳動物細胞中穩(wěn)定表達Cas9基因的目的。
為實現(xiàn)上述目的,本發(fā)明采用如下技術(shù)方案:
一種Cas9表達載體pUC-CIN,其序列如SEQ ID NO.11所示,由4.3kb的Cas9片段與5.1kb的pUC-EIN載體骨架連接得到,所述pUC-EIN載體的DNA序列如SEQ ID NO.2所示;
所述5.1kb的pUC-EIN載體骨架由BspTⅠ、BamHⅠ雙酶切pUC-EIN載體得到;
所述4.3kb的Cas9片段由BspTⅠ、BamHⅠ雙酶切pUC-Cas9載體得到;
所述pUC-Cas9載體是由AgeⅠ、EcoRⅠ、SacⅡ三酶切pX330載體得4.3kb、2.2kb及2.0kb片段,將4.3kb Cas9片段插入到pUC-GZ載體中得到;
所述pUC-GZ載體由pUC-mIKB載體經(jīng)EcoRⅠ、HindⅢ雙酶切得2.6kb的載體骨架和1.4kb片段,將2.6kb的載體骨架與47bp的GZ短片段連接所得;
所述pUC-mIKB載體的DNA序列如SEQ ID NO.1所示;
所述GZ短片段的制作過程如下:
a)從上海生工生物工程有限公司訂購2條DNA寡核苷酸GZF、GZR,(其序列如SEQ ID NO.3-4所示)如下:
GZF:5'AATTACTTAAGACCGGTGGTACCACTCGTCTCGAGGAATTCGGATCC 3'
GZR:5'AGCTGGATCCGAATTCCTCGAGACGAGTGGTACCACCGGTCTTAAGT 3'
b)將GZF、GZR分別按照10微摩爾/升的濃度稀釋,二者等量混合,取50微升置于薄壁PCR管中,按照下述程序孵育:
95℃5分鐘,72℃10分鐘,置冰上,GZ短片段制作完成。
pUC-CIN載體經(jīng)酶切及測序驗證無誤(AflⅡ、EcoRⅠ雙酶切,獲得4.3kb、3.3kb及1.8kb條帶)。
本發(fā)明提供的一種Cas9表達載體,穩(wěn)定轉(zhuǎn)染哺乳動物細胞系,經(jīng)單克隆篩選可以獲得穩(wěn)定表達Cas9基因的細胞株,可在哺乳動物中穩(wěn)定表達Cas9基因。
附圖說明
圖1是Cas9表達載體pUC-CIN構(gòu)建過程示意圖;
圖2是pUC-CIN載體酶切鑒定示意圖;
圖3是Cas9基因表達檢測引物設(shè)計示意圖;
圖4是3D4/21單克隆細胞Cas9基因mRNA水平表達檢測示意圖;
圖5是PIEC單克隆細胞Cas9基因mRNA水平表達檢測示意圖。
具體實施方式
以下的實施例便于更好地理解本發(fā)明,但并不限定本發(fā)明。下述實施例中的實驗方法,如無特殊說明,均為常規(guī)方法。下述實施例中所用的試驗材料,如無特殊說明,均為自常規(guī)生化試劑商店購買得到的。以下實施例中,如無特殊說明,均采用低糖DMEM培養(yǎng)基培養(yǎng)細胞。
pX330載體購自Addgene公司,貨號42230。內(nèi)切酶均購自NEB公司。DNA寡核苷酸均由上海生工生物工程有限公司合成。
實施例1 Cas9穩(wěn)定表達載體的構(gòu)建及鑒定
1.pUC-CIN載體構(gòu)建
(1)pUC-mIKB載體序列如SEQ ID NO.1所示,EcoRⅠ、HindⅢ雙酶切得2.6kb的載體骨架和1.4kb片段,將2.6kb的載體骨架與47bp的GZ短片段連接,得pUC-GZ。
GZ短片段的制作過程如下:
從上海生工生物工程有限公司訂購2條DNA寡核苷酸GZF、GZR(其序列如SEQ ID NO.3-4所示),序列如下:
GZF:5'AATTACTTAAGACCGGTGGTACCACTCGTCTCGAGGAATTCGGATCC 3'
GZR:5'AGCTGGATCCGAATTCCTCGAGACGAGTGGTACCACCGGTCTTAAGT 3'
將GZF、GZR分別按照10微摩爾/升的濃度稀釋,二者等量混合,取50微升置于薄壁PCR管中,按照下述程序孵育:
95℃5分鐘,72℃10分鐘,置冰上。
GZ短片段制作完成。
(2)AgeⅠ、EcoRⅠ、SacⅡ三酶切pX330載體得4.3kb、2.2kb及2.0kb片段,將4.3kb的Cas9片段插入到pUC-GZ載體(AgeⅠ、EcoRⅠ雙酶切)中,得pUC-Cas9載體;
(3)BspTⅠ、BamHⅠ雙酶切pUC-Cas9載體得4.3kb的Cas9片段,BspTⅠ、BamHⅠ雙酶切pUC-EIN載體(DNA序列如SEQ ID NO.2所示)得5.1kb的載體骨架,將4.3kb的Cas9片段與5.1kb的pUC-EIN載體骨架連接,得pUC-CIN載體,其序列如SEQ ID NO.11所示。pUC-CIN載體經(jīng)酶切及測序驗證無誤(AflⅡ、EcoRⅠ雙酶切,獲得4.3kb、3.3kb及1.8kb條帶)。pUC-CIN載體構(gòu)建示意圖如圖1所示,酶切鑒定結(jié)果如圖2所示。
2、Cas9基因表達檢測引物的設(shè)計與合成
由于Cas9基因編碼區(qū)較大,PCR法檢測其全長cDNA的表達存在一定困難。為了較為準(zhǔn)確的檢測Cas9在mRNA水平的表達,在Cas9編碼區(qū)上、中、下游分別設(shè)計一對引物,Cas9-F1、Cas9-R1;Cas9-F2、Cas9-R2;Cas9-F3、Cas9-R3(其序列如SEQ ID NO.5-10所示)名稱及序列如下:Cas9-F1:5'GCAGCCGACAAGAAGTACAG 3';Cas9-R1:5'TTGGCCATCTCGTTGCTGAA 3';Cas9-F2:5'CTGGACTCCCGGATGAACAC 3';Cas9-R2:5'TTCGCCGTTTGTCTCGATCA 3';Cas9-F3:5'GCAGATTCGCCTGGATGA 3';Cas9-R3:5'GCAGCACCTTCTCGTTGG 3'。其中Cas9-F1與Cas9-R1組成一對引物,檢測上游序列,Cas9-F3與Cas9-R3檢測中游序列,Cas9-F2與Cas9-R2檢測下游序列(如圖3所示)。引物送上海生工生物工程有限公司合成。
實施例2 Cas9穩(wěn)定表達的豬肺泡巨噬細胞單克隆篩選
將Cas9穩(wěn)定表達載體pUC-CIN經(jīng)MluⅠ單酶切線性化,轉(zhuǎn)染所得豬肺泡巨噬細胞系3D4/21,轉(zhuǎn)染48小時后,鋪96孔板5個及10cm培養(yǎng)皿10個,添加900微克/毫升G418進行單克隆篩選,獲得13個狀態(tài)較好的單克隆。提取這些單克隆細胞的總RNA,反轉(zhuǎn)錄為cDNA,使用前文所設(shè)計合成的三對引物(Cas9-F1、Cas9-R1、Cas9-F2、Cas9-R2、Cas9-F3、Cas9-R3)進行PCR檢測,將三對引物都呈陽性的單克隆(5、17、27、42號)判定為穩(wěn)定表達Cas9基因的單克隆細胞株,具體結(jié)果如圖4所示。
實施例3 Cas9穩(wěn)定表達的豬血管內(nèi)皮細胞單克隆篩選
豬血管內(nèi)皮細胞PIEC復(fù)蘇后,傳代兩次,鋪24孔板,在其中6孔中使用脂質(zhì)體(lipo2000)轉(zhuǎn)染pUC-CIN載體(已MluⅠ單酶切線性化);轉(zhuǎn)染48小時后,鋪96孔板4個及10cm培養(yǎng)皿8個,添加800μg/ml G418進行單克隆篩選,獲得7個狀態(tài)較好的單克隆,分別命名為1、2、3、4、5、6、8號。提取這些單克隆細胞的總RNA,反轉(zhuǎn)錄為cDNA,使用前文所設(shè)計合成的三對引物(Cas9-F1、Cas9-R1、Cas9-F2、Cas9-R2、Cas9-F3、Cas9-R3)進行PCR檢測,將三對引物都呈陽性的單克隆(1、2、3、5、6號)判定為穩(wěn)定表達Cas9基因的單克隆細胞株,具體結(jié)果如圖5所示。
SEQUENCE LISTING
<110> 青島市畜牧獸醫(yī)研究所
<120> 一種Cas9表達載體
<160> 11
<170> PatentIn version 3.3
<210> 1
<211> 4034
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 1
tcgcgcgttt cggtgatgac ggtgaaaacc tctgacacat gcagctcccg gagacggtca 60
cagcttgtct gtaagcggat gccgggagca gacaagcccg tcagggcgcg tcagcgggtg 120
ttggcgggtg tcggggctgg cttaactatg cggcatcaga gcagattgta ctgagagtgc 180
accatatgcg gtgtgaaata ccgcacagat gcgtaaggag aaaataccgc atcaggcgcc 240
attcgccatt caggctgcgc aactgttggg aagggcgatc ggtgcgggcc tcttcgctat 300
tacgccagct ggcgaaaggg ggatgtgctg caaggcgatt aagttgggta acgccagggt 360
tttcccagtc acgacgttgt aaaacgacgg ccagtgaatt catcgattcc gcctcagaag 420
ccatagagcc caccgcatcc ccagcatgcc tgctattgtc ttcccaatcc tcccccttgc 480
tgtcctgccc caccccaccc cccagaatag aatgacacct actcagacaa tgcgatgcaa 540
tttcctcatt ttattaggaa aggacagtgg gagtggcacc ttccagggtc aaggaaggca 600
cgggggaggg gcaaacaaca gatggctggc aactagaagg cacagtcgag gctgatcagc 660
gggtttaaac tcttttagac actttccaaa gctcataacg tcaggcgctg gcctccaagc 720
acgcagtcgt catagggcag ctcatcctct gtgaactctg actccgtgtc atagctctcc 780
tcatcctcgc tctctggaag catctggagg ttttctaggg tcagctggcc cagctgctgc 840
tgtatccgag tgcttgggcg gccccaggtg agctggtacg gggagtagcc ctggtaggtg 900
actctgttga catcagcccc acacttcaac aagagcgaca ccaggtcggg attctgcagg 960
tccaccgcaa gatgcagggc ggttcggcca ttgcagggct cctgagcgtt gacatcagca 1020
cccaaagaca ccaacagctc cacaatgccc aggtagccat ggatcgaggc taagtgcaga 1080
catgtgtggc cattgtagtt ggtggcctgc agaatggagt ggaggtgctg ggtcccgcgg 1140
ggctgagtca ggactcccac actggccagg cagccctgct cacaggcaag gtgtagaggg 1200
gtatttcctc gaaagtctcg gagctcagga tcacagccag cttccagaag tgcctcagcg 1260
atttctggct ggttggtgat caccgccaag tggagtggag tctgctgcag gttgttctgg 1320
aagttaagaa aagccagatc tcccttcact tggcggacca cttccatggt cagtgccttc 1380
tcttcatgga tgatggccaa gtgcaggaac gagtctccgt cctcggtgag ctgctgcttc 1440
cagggctcgg cgccgcgggg cgcctcctgc ggctcgaggc ggatctcgcg cagctccttc 1500
accatctgct cgtactcctc gtccttcatg gcgtccaggc cggcgtcgtg gcggtcatcc 1560
agtagccgct ccttcttgag cgcgtcccgg ggcccctcca tggcccactc ctggccgggc 1620
tctgcgggct ggaacatggc gcgatgaggg cttgggcgct gctccctagg tgcgcgggcc 1680
acaggctgcg cggcgcgctg gctgctcgcg gtggctcggg cgggcgggac gatggcctcg 1740
gactgttgga tccgataact tcgtataatg tatgctatac gaagttatgc tagcaagctt 1800
ggcgtaatca tggtcatagc tgtttcctgt gtgaaattgt tatccgctca caattccaca 1860
caacatacga gccggaagca taaagtgtaa agcctggggt gcctaatgag tgagctaact 1920
cacattaatt gcgttgcgct cactgcccgc tttccagtcg ggaaacctgt cgtgccagct 1980
gcattaatga atcggccaac gcgcggggag aggcggtttg cgtattgggc gctcttccgc 2040
ttcctcgctc actgactcgc tgcgctcggt cgttcggctg cggcgagcgg tatcagctca 2100
ctcaaaggcg gtaatacggt tatccacaga atcaggggat aacgcaggaa agaacatgtg 2160
agcaaaaggc cagcaaaagg ccaggaaccg taaaaaggcc gcgttgctgg cgtttttcca 2220
taggctccgc ccccctgacg agcatcacaa aaatcgacgc tcaagtcaga ggtggcgaaa 2280
cccgacagga ctataaagat accaggcgtt tccccctgga agctccctcg tgcgctctcc 2340
tgttccgacc ctgccgctta ccggatacct gtccgccttt ctcccttcgg gaagcgtggc 2400
gctttctcaa tgctcacgct gtaggtatct cagttcggtg taggtcgttc gctccaagct 2460
gggctgtgtg cacgaacccc ccgttcagcc cgaccgctgc gccttatccg gtaactatcg 2520
tcttgagtcc aacccggtaa gacacgactt atcgccactg gcagcagcca ctggtaacag 2580
gattagcaga gcgaggtatg taggcggtgc tacagagttc ttgaagtggt ggcctaacta 2640
cggctacact agaaggacag tatttggtat ctgcgctctg ctgaagccag ttaccttcgg 2700
aaaaagagtt ggtagctctt gatccggcaa acaaaccacc gctggtagcg gtggtttttt 2760
tgtttgcaag cagcagatta cgcgcagaaa aaaaggatct caagaagatc ctttgatctt 2820
ttctacgggg tctgacgctc agtggaacga aaactcacgt taagggattt tggtcatgag 2880
attatcaaaa aggatcttca cctagatcct tttaaattaa aaatgaagtt ttaaatcaat 2940
ctaaagtata tatgagtaaa cttggtctga cagttaccaa tgcttaatca gtgaggcacc 3000
tatctcagcg atctgtctat ttcgttcatc catagttgcc tgactccccg tcgtgtagat 3060
aactacgata cgggagggct taccatctgg ccccagtgct gcaatgatac cgcgagaccc 3120
acgctcaccg gctccagatt tatcagcaat aaaccagcca gccggaaggg ccgagcgcag 3180
aagtggtcct gcaactttat ccgcctccat ccagtctatt aattgttgcc gggaagctag 3240
agtaagtagt tcgccagtta atagtttgcg caacgttgtt gccattgcta caggcatcgt 3300
ggtgtcacgc tcgtcgtttg gtatggcttc attcagctcc ggttcccaac gatcaaggcg 3360
agttacatga tcccccatgt tgtgcaaaaa agcggttagc tccttcggtc ctccgatcgt 3420
tgtcagaagt aagttggccg cagtgttatc actcatggtt atggcagcac tgcataattc 3480
tcttactgtc atgccatccg taagatgctt ttctgtgact ggtgagtact caaccaagtc 3540
attctgagaa tagtgtatgc ggcgaccgag ttgctcttgc ccggcgtcaa tacgggataa 3600
taccgcgcca catagcagaa ctttaaaagt gctcatcatt ggaaaacgtt cttcggggcg 3660
aaaactctca aggatcttac cgctgttgag atccagttcg atgtaaccca ctcgtgcacc 3720
caactgatct tcagcatctt ttactttcac cagcgtttct gggtgagcaa aaacaggaag 3780
gcaaaatgcc gcaaaaaagg gaataagggc gacacggaaa tgttgaatac tcatactctt 3840
cctttttcaa tattattgaa gcatttatca gggttattgt ctcatgagcg gatacatatt 3900
tgaatgtatt tagaaaaata aacaaatagg ggttccgcgc acatttcccc gaaaagtgcc 3960
acctgacgtc taagaaacca ttattatcat gacattaacc tataaaaata ggcgtatcac 4020
gaggcccttt cgtc 4034
<210> 2
<211> 5867
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 2
tcgcgcgttt cggtgatgac ggtgaaaacc tctgacacat gcagctcccg gagacggtca 60
cagcttgtct gtaagcggat gccgggagca gacaagcccg tcagggcgcg tcagcgggtg 120
ttggcgggtg tcggggctgg cttaactatg cggcatcaga gcagattgta ctgagagtgc 180
accatatgcg gtgtgaaata ccgcacagat gcgtaaggag aaaataccgc atcaggcgcc 240
attcgccatt caggctgcgc aactgttggg aagggcgatc ggtgcgggcc tcttcgctat 300
tacgccagct ggcgaaaggg ggatgtgctg caaggcgatt aagttgggta acgccagggt 360
tttcccagtc acgacgttgt aaaacgacgg ccagtgaatt gcggccgcat taccctgtta 420
tccctagaat tcgatgctga agttcctata gtttctagag tataggaact tcggtcataa 480
cttcgtatag catacattat acgaagttat tccggataag atacattgat gagtttggac 540
aaaccacaac tagaatgcag tgaaaaaaat gctttatttg tgaaatttgt gatgctattg 600
ctttatttgt aaccattata agctgcaata aacaagttgg ggtgggcgaa gaactccagc 660
atgagatccc cgcgctggag gatcatccag ccggcgtccc ggaaaacgat tccgaagccc 720
aacctttcat agaaggcggc ggtggaatcg aaatctcgtg atggcaggtt gggcgtcgct 780
tggtcggtca tttcgaaccc cagagtcccg ctcagaagaa ctcgtcaaga aggcgataga 840
aggcgatgcg ctgcgaatcg ggagcggcga taccgtaaag cacgaggaag cggtcagccc 900
attcgccgcc aagctcttca gcaatatcac gggtagccaa cgctatgtcc tgatagcggt 960
ccgccacacc cagccggcca cagtcgatga atccagaaaa gcggccattt tccaccatga 1020
tattcggcaa gcaggcatcg ccatgggtca cgacgagatc ctcgccgtcg ggcatgcgcg 1080
ccttgagcct ggcgaacagt tcggctggcg cgagcccctg atgctcttcg tccagatcat 1140
cctgatcgac aagaccggct tccatccgag tacgtgctcg ctcgatgcga tgtttcgctt 1200
ggtggtcgaa tgggcaggta gccggatcaa gcgtatgcag ccgccgcatt gcatcagcca 1260
tgatggatac tttctcggca ggagcaaggt gagatgacag gagatcctgc cccggcactt 1320
cgcccaatag cagccagtcc cttcccgctt cagtgacaac gtcgagcaca gctgcgcaag 1380
gaacgcccgt cgtggccagc cacgatagcc gcgctgcctc gtcctgcagt tcattcaggg 1440
caccggacag gtcggtcttg acaaaaagaa ccgggcgccc ctgcgctgac agccggaaca 1500
cggcggcatc agagcagccg attgtctgtt gtgcccagtc atagccgaat agcctctcca 1560
cccaagcggc cggagaacct gcgtgcaatc catcttgttc aatcatgcga aacgatcctc 1620
atgctagctt atcatcgtgt ttttcaaagg aaaaccacgt ccccgtggtt cggggggcct 1680
agacgttttt ttaacctcga ctaaacacat gtaaagcatg tgcaccgagg ccccagatca 1740
gatcccatac aatggggtac cttctgggca tccttcagcc ccttgttgaa tacgcttgag 1800
gagagccatt tgactctttc cacaactatc caactcacaa cgtggcactg gggttgtgcc 1860
gcctttgcag gtgtatctta tacacgtggc ttttggccgc agaggcacct gtcgccaggt 1920
ggggggttcc gctgcctgca aagggtcgct acagacgttg tttgtcttca agaagcttcc 1980
agaggaactg cttccttcac gacattcaac agaccttgca ttcctttggc gagaggggaa 2040
agacccctag gaatgctcgt caagaagaca gggccaggtt tccgggccct cacattgcca 2100
aaagacggca atatggtgga aaataacata tagacaaacg cacaccggcc ttattccaag 2160
cggcttcggc cagtaacgtt aggggggggg ggggagaggg gcggaattgg atccgatatc 2220
ttacttgtac agctcgtcca tgccgagagt gatcccggcg gcggtcacga actccagcag 2280
gaccatgtga tcgcgcttct cgttggggtc tttgctcagg gcggactggg tgctcaggta 2340
gtggttgtcg ggcagcagca cggggccgtc gccgatgggg gtgttctgct ggtagtggtc 2400
ggcgagctgc acgctgccgt cctcgatgtt gtggcggatc ttgaagttca ccttgatgcc 2460
gttcttctgc ttgtcggcca tgatatagac gttgtggctg ttgtagttgt actccagctt 2520
gtgccccagg atgttgccgt cctccttgaa gtcgatgccc ttcagctcga tgcggttcac 2580
cagggtgtcg ccctcgaact tcacctcggc gcgggtcttg tagttgccgt cgtccttgaa 2640
gaagatggtg cgctcctgga cgtagccttc gggcatggcg gacttgaaga agtcgtgctg 2700
cttcatgtgg tcggggtagc ggctgaagca ctgcacgccg taggtcaggg tggtcacgag 2760
ggtgggccag ggcacgggca gcttgccggt ggtgcagatg aacttcaggg tcagcttgcc 2820
gtaggtggca tcgccctcgc cctcgccgga cacgctgaac ttgtggccgt ttacgtcgcc 2880
gtccagctcg accaggatgg gcaccacccc ggtgaacagc tcctcgccct tgctcaccat 2940
cttaaggatc tgacggttca ctaaaccagc tctgcttata tagacctccc accgtacacg 3000
cctaccgccc atttgcgtca atggggcgga gttgttacga cattttggaa agtcccgttg 3060
attttggtgc caaaacaaac tcccattgac gtcaatgggg tggagacttg gaaatccccg 3120
tgagtcaaac cgctatccac gcccattgat gtactgccaa aaccgcatca ccatggtaat 3180
agcgatgact aatacgtaga tgtactgcca agtaggaaag tcccataagg tcatgtactg 3240
ggcataatgc caggcgggcc atttaccgtc attgacgtca atagggggcg tacttggcat 3300
atgatacact tgatgtactg ccaagtgggc agtttaccgt aaatactcca cccattgacg 3360
tcaatggaaa gtccctattg gcgttactat gggaacatac gtcattattg acgtcaatgg 3420
gcgggggtcg ttgggcggtc agccaggcgg gccatttacc gtaagttatg taacgcggaa 3480
ctccatatat gggctatgaa ctaatgaccc cgtaattgag atctgaagtt cctatagttt 3540
ctagagtata ggaacttcgg tcataacttc gtatagcata cattatacga agttatacgc 3600
gttttaaacg gccgggccgg ccatgcatag cttggcgtaa tcatggtcat agctgtttcc 3660
tgtgtgaaat tgttatccgc tcacaattcc acacaacata cgagccggaa gcataaagtg 3720
taaagcctgg ggtgcctaat gagtgagcta actcacatta attgcgttgc gctcactgcc 3780
cgctttccag tcgggaaacc tgtcgtgcca gctgcattaa tgaatcggcc aacgcgcggg 3840
gagaggcggt ttgcgtattg ggcgctcttc cgcttcctcg ctcactgact cgctgcgctc 3900
ggtcgttcgg ctgcggcgag cggtatcagc tcactcaaag gcggtaatac ggttatccac 3960
agaatcaggg gataacgcag gaaagaacat gtgagcaaaa ggccagcaaa aggccaggaa 4020
ccgtaaaaag gccgcgttgc tggcgttttt ccataggctc cgcccccctg acgagcatca 4080
caaaaatcga cgctcaagtc agaggtggcg aaacccgaca ggactataaa gataccaggc 4140
gtttccccct ggaagctccc tcgtgcgctc tcctgttccg accctgccgc ttaccggata 4200
cctgtccgcc tttctccctt cgggaagcgt ggcgctttct caatgctcac gctgtaggta 4260
tctcagttcg gtgtaggtcg ttcgctccaa gctgggctgt gtgcacgaac cccccgttca 4320
gcccgaccgc tgcgccttat ccggtaacta tcgtcttgag tccaacccgg taagacacga 4380
cttatcgcca ctggcagcag ccactggtaa caggattagc agagcgaggt atgtaggcgg 4440
tgctacagag ttcttgaagt ggtggcctaa ctacggctac actagaagga cagtatttgg 4500
tatctgcgct ctgctgaagc cagttacctt cggaaaaaga gttggtagct cttgatccgg 4560
caaacaaacc accgctggta gcggtggttt ttttgtttgc aagcagcaga ttacgcgcag 4620
aaaaaaagga tctcaagaag atcctttgat cttttctacg gggtctgacg ctcagtggaa 4680
cgaaaactca cgttaaggga ttttggtcat gagattatca aaaaggatct tcacctagat 4740
ccttttaaat taaaaatgaa gttttaaatc aatctaaagt atatatgagt aaacttggtc 4800
tgacagttac caatgcttaa tcagtgaggc acctatctca gcgatctgtc tatttcgttc 4860
atccatagtt gcctgactcc ccgtcgtgta gataactacg atacgggagg gcttaccatc 4920
tggccccagt gctgcaatga taccgcgaga cccacgctca ccggctccag atttatcagc 4980
aataaaccag ccagccggaa gggccgagcg cagaagtggt cctgcaactt tatccgcctc 5040
catccagtct attaattgtt gccgggaagc tagagtaagt agttcgccag ttaatagttt 5100
gcgcaacgtt gttgccattg ctacaggcat cgtggtgtca cgctcgtcgt ttggtatggc 5160
ttcattcagc tccggttccc aacgatcaag gcgagttaca tgatccccca tgttgtgcaa 5220
aaaagcggtt agctccttcg gtcctccgat cgttgtcaga agtaagttgg ccgcagtgtt 5280
atcactcatg gttatggcag cactgcataa ttctcttact gtcatgccat ccgtaagatg 5340
cttttctgtg actggtgagt actcaaccaa gtcattctga gaatagtgta tgcggcgacc 5400
gagttgctct tgcccggcgt caatacggga taataccgcg ccacatagca gaactttaaa 5460
agtgctcatc attggaaaac gttcttcggg gcgaaaactc tcaaggatct taccgctgtt 5520
gagatccagt tcgatgtaac ccactcgtgc acccaactga tcttcagcat cttttacttt 5580
caccagcgtt tctgggtgag caaaaacagg aaggcaaaat gccgcaaaaa agggaataag 5640
ggcgacacgg aaatgttgaa tactcatact cttccttttt caatattatt gaagcattta 5700
tcagggttat tgtctcatga gcggatacat atttgaatgt atttagaaaa ataaacaaat 5760
aggggttccg cgcacatttc cccgaaaagt gccacctgac gtctaagaaa ccattattat 5820
catgacatta acctataaaa ataggcgtat cacgaggccc tttcgtc 5867
<210> 3
<211> 47
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 3
aattacttaa gaccggtggt accactcgtc tcgaggaatt cggatcc 47
<210> 4
<211> 47
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 4
agctggatcc gaattcctcg agacgagtgg taccaccggt cttaagt 47
<210> 5
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 5
gcagccgaca agaagtacag 20
<210> 6
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 6
ttggccatct cgttgctgaa 20
<210> 7
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 7
ctggactccc ggatgaacac 20
<210> 8
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 8
ttcgccgttt gtctcgatca 20
<210> 9
<211> 18
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 9
gcagattcgc ctggatga 18
<210> 10
<211> 18
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 10
gcagcacctt ctcgttgg 18
<210> 11
<211> 9431
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 11
tcgcgcgttt cggtgatgac ggtgaaaacc tctgacacat gcagctcccg gagacggtca 60
cagcttgtct gtaagcggat gccgggagca gacaagcccg tcagggcgcg tcagcgggtg 120
ttggcgggtg tcggggctgg cttaactatg cggcatcaga gcagattgta ctgagagtgc 180
accatatgcg gtgtgaaata ccgcacagat gcgtaaggag aaaataccgc atcaggcgcc 240
attcgccatt caggctgcgc aactgttggg aagggcgatc ggtgcgggcc tcttcgctat 300
tacgccagct ggcgaaaggg ggatgtgctg caaggcgatt aagttgggta acgccagggt 360
tttcccagtc acgacgttgt aaaacgacgg ccagtgaatt gcggccgcat taccctgtta 420
tccctagaat tcgatgctga agttcctata gtttctagag tataggaact tcggtcataa 480
cttcgtatag catacattat acgaagttat tccggataag atacattgat gagtttggac 540
aaaccacaac tagaatgcag tgaaaaaaat gctttatttg tgaaatttgt gatgctattg 600
ctttatttgt aaccattata agctgcaata aacaagttgg ggtgggcgaa gaactccagc 660
atgagatccc cgcgctggag gatcatccag ccggcgtccc ggaaaacgat tccgaagccc 720
aacctttcat agaaggcggc ggtggaatcg aaatctcgtg atggcaggtt gggcgtcgct 780
tggtcggtca tttcgaaccc cagagtcccg ctcagaagaa ctcgtcaaga aggcgataga 840
aggcgatgcg ctgcgaatcg ggagcggcga taccgtaaag cacgaggaag cggtcagccc 900
attcgccgcc aagctcttca gcaatatcac gggtagccaa cgctatgtcc tgatagcggt 960
ccgccacacc cagccggcca cagtcgatga atccagaaaa gcggccattt tccaccatga 1020
tattcggcaa gcaggcatcg ccatgggtca cgacgagatc ctcgccgtcg ggcatgcgcg 1080
ccttgagcct ggcgaacagt tcggctggcg cgagcccctg atgctcttcg tccagatcat 1140
cctgatcgac aagaccggct tccatccgag tacgtgctcg ctcgatgcga tgtttcgctt 1200
ggtggtcgaa tgggcaggta gccggatcaa gcgtatgcag ccgccgcatt gcatcagcca 1260
tgatggatac tttctcggca ggagcaaggt gagatgacag gagatcctgc cccggcactt 1320
cgcccaatag cagccagtcc cttcccgctt cagtgacaac gtcgagcaca gctgcgcaag 1380
gaacgcccgt cgtggccagc cacgatagcc gcgctgcctc gtcctgcagt tcattcaggg 1440
caccggacag gtcggtcttg acaaaaagaa ccgggcgccc ctgcgctgac agccggaaca 1500
cggcggcatc agagcagccg attgtctgtt gtgcccagtc atagccgaat agcctctcca 1560
cccaagcggc cggagaacct gcgtgcaatc catcttgttc aatcatgcga aacgatcctc 1620
atgctagctt atcatcgtgt ttttcaaagg aaaaccacgt ccccgtggtt cggggggcct 1680
agacgttttt ttaacctcga ctaaacacat gtaaagcatg tgcaccgagg ccccagatca 1740
gatcccatac aatggggtac cttctgggca tccttcagcc ccttgttgaa tacgcttgag 1800
gagagccatt tgactctttc cacaactatc caactcacaa cgtggcactg gggttgtgcc 1860
gcctttgcag gtgtatctta tacacgtggc ttttggccgc agaggcacct gtcgccaggt 1920
ggggggttcc gctgcctgca aagggtcgct acagacgttg tttgtcttca agaagcttcc 1980
agaggaactg cttccttcac gacattcaac agaccttgca ttcctttggc gagaggggaa 2040
agacccctag gaatgctcgt caagaagaca gggccaggtt tccgggccct cacattgcca 2100
aaagacggca atatggtgga aaataacata tagacaaacg cacaccggcc ttattccaag 2160
cggcttcggc cagtaacgtt aggggggggg ggggagaggg gcggaattgg atccgaattc 2220
ttactttttc ttttttgcct ggccggcctt tttcgtggcc gccggccttt tgtcgcctcc 2280
cagctgagac aggtcgatcc gtgtctcgta caggccggtg atgctctggt ggatcagggt 2340
ggcgtccagc acctctttgg tgctggtgta cctcttccgg tcgatggtgg tgtcaaagta 2400
cttgaaggcg gcaggggctc ccagattggt cagggtaaac aggtggatga tattctcggc 2460
ctgctctctg atgggcttat cccggtgctt gttgtaggcg gacagcactt tgtccagatt 2520
agcgtcggcc aggatcactc tcttggagaa ctcgctgatc tgctcgatga tctcgtccag 2580
gtagtgcttg tgctgttcca caaacagctg tttctgctca ttatcctcgg gggagccctt 2640
cagcttctca tagtggctgg ccaggtacag gaagttcaca tatttggagg gcagggccag 2700
ttcgtttccc ttctgcagtt cgccggcaga ggccagcatt ctcttccggc cgttttccag 2760
ctcgaacagg gagtacttag gcagcttgat gatcaggtcc tttttcactt ctttgtagcc 2820
cttggcttcc agaaagtcga tgggattctt ctcgaagctg cttctttcca tgatggtgat 2880
ccccagcagc tctttcacac tcttcagttt cttggacttg cccttttcca ctttggccac 2940
caccagcaca gaataggcca cggtggggct gtcgaagccg ccgtacttct tagggtccca 3000
gtccttcttt ctggcgatca gcttatcgct gttcctcttg ggcaggatag actctttgct 3060
gaagccgcct gtctgcacct cggtcttttt cacgatattc acttggggca tgctcagcac 3120
tttccgcacg gtggcaaaat cccggccctt atcccacacg atctccccgg tttcgccgtt 3180
tgtctcgatc agaggccgct tccggatctc gccgttggcc agggtaatct cggtcttgaa 3240
aaagttcatg atgttgctgt agaagaagta cttggcggta gccttgccga tttcctgctc 3300
gctcttggcg atcatcttcc gcacgtcgta caccttgtag tcgccgtaca cgaactcgct 3360
ttccagctta gggtactttt tgatcagggc ggttcccacg acggcgttca ggtaggcgtc 3420
gtgggcgtgg tggtagttgt tgatctcgcg cactttgtaa aactggaaat ccttccggaa 3480
atcggacacc agcttggact tcagggtgat cactttcact tcccggatca gcttgtcatt 3540
ctcgtcgtac ttagtgttca tccgggagtc caggatctgt gccacgtgct ttgtgatctg 3600
ccgggtttcc accagctgtc tcttgatgaa gccggcctta tccagttcgc tcaggccgcc 3660
tctctcggcc ttggtcagat tgtcgaactt tctctgggta atcagcttgg cgttcagcag 3720
ctgccgccag tagttcttca tcttcttcac gacctcttcg gagggcacgt tgtcgctctt 3780
gccccggttc ttgtcgcttc tggtcagcac cttgttgtcg atggagtcgt ccttcagaaa 3840
gctctgaggc acgatatggt ccacatcgta gtcggacagc cggttgatgt ccagttcctg 3900
gtccacgtac atatcccgcc cattctgcag gtagtacagg tacagcttct cgttctgcag 3960
ctgggtgttt tccacggggt gttctttcag gatctggctg cccagctctt tgatgccctc 4020
ttcgatccgc ttcattctct cgcggctgtt cttctgtccc ttctgggtgg tctggttctc 4080
tctggccatt tcgatcacga tgttctcggg cttgtgccgg cccatcactt tcacgagctc 4140
gtccaccacc ttcactgtct gcaggatgcc cttcttaatg gcggggctgc cggccagatt 4200
ggcaatgtgc tcgtgcaggc tatcgccctg gccggacacc tgggctttct ggatgtcctc 4260
tttaaaggtc aggctgtcgt cgtggatcag ctgcatgaag tttctgttgg cgaagccgtc 4320
ggacttcagg aaatccagga ttgtcttgcc ggactgcttg tcccggatgc cgttgatcag 4380
cttccggctc agcctgcccc agccggtgta tctccgccgc ttcagctgct tcatcacttt 4440
gtcgtcgaac aggtgggcat aggttttcag ccgttcctcg atcatctctc tgtcctcaaa 4500
cagtgtcagg gtcagcacga tatcttccag aatgtcctcg ttttcctcat tgtccaggaa 4560
gtccttgtcc ttgataattt tcagcagatc gtggtatgtg cccagggagg cgttgaaccg 4620
atcttccacg ccggagattt ccacggagtc gaagcactcg attttcttga agtagtcctc 4680
tttcagctgc ttcacggtca ctttccggtt ggtcttgaac agcaggtcca cgatggcctt 4740
tttctgctcg ccgctcagga aggcgggctt tctcattccc tcggtcacgt atttcacttt 4800
ggtcagctcg ttatacacgg tgaagtactc gtacagcagg ctgtgcttgg gcagcacctt 4860
ctcgttgggc aggttcttat cgaagttggt catccgctcg atgaagctct gggcggaagc 4920
gcccttgtcc accacttcct cgaagttcca gggggtgatg gtttcctcgc tctttctggt 4980
catccaggcg aatctgctgt ttcccctggc cagagggccc acgtagtagg ggatgcggaa 5040
ggtcaggatc ttctcgatct tttcccggtt gtccttcagg aatgggtaaa aatcttcctg 5100
ccgccgcaga atggcgtgca gctctcccag gtggatctgg tgggggatgc tgccgttgtc 5160
gaaggtccgc tgcttccgca gcaggtcctc tctgttcagc ttcacgagca gttcctcggt 5220
gccgtccatc ttttccagga tgggcttgat gaacttgtag aactcttcct ggctggctcc 5280
gccgtcaatg tagccggcgt agccgttctt gctctggtcg aagaaaatct ctttgtactt 5340
ctcaggcagc tgctgccgca cgagagcttt cagcagggtc aggtcctggt ggtgctcgtc 5400
gtatctcttg atcatagagg cgctcagggg ggccttggtg atctcggtgt tcactctcag 5460
gatgtcgctc agcaggatgg cgtcggacag gttcttggcg gccagaaaca ggtcggcgta 5520
ctggtcgccg atctgggcca gcaggttgtc caggtcgtcg tcgtaggtgt ccttgctcag 5580
ctgcagtttg gcatcctcgg ccaggtcgaa gttgctcttg aagttggggg tcaggcccag 5640
gctcagggca atcaggtttc cgaacaggcc attcttcttc tcgccgggca gctgggcgat 5700
cagattttcc agccgtctgc tcttgctcag tctggcagac aggatggcct tggcgtccac 5760
gccgctggcg ttgatggggt tttcctcgaa cagctggttg taggtctgca ccagctggat 5820
gaacagcttg tccacgtcgc tgttgtcggg gttcaggtcg ccctcgatca ggaagtggcc 5880
ccggaacttg atcatgtggg ccagggccag atagatcagc cgcaggtcgg ccttgtcggt 5940
gctgtccacc agtttctttc tcaggtggta gatggtgggg tacttctcgt ggtaggccac 6000
ctcgtccacg atgttgccga agatggggtg ccgctcgtgc ttcttatcct cttccaccag 6060
gaaggactct tccagtctgt ggaagaagct gtcgtccacc ttggccatct cgttgctgaa 6120
gatctcttgc agatagcaga tccggttctt ccgtctggtg tatcttcttc tggcggttct 6180
cttcagccgg gtggcctcgg ctgtttcgcc gctgtcgaac agcagggctc cgatcaggtt 6240
cttcttgatg ctgtgccggt cggtgttgcc cagcaccttg aatttcttgc tgggcacctt 6300
gtactcgtcg gtgatcacgg cccagcccac agagttggtg ccgatgtcca ggccgatgct 6360
gtacttcttg tcggctgctg ggactccgtg gataccgacc ttccgcttct tctttggggc 6420
catcttatcg tcatcgtctt tgtaatcaat atcatgatcc ttgtagtctc cgtcgtggtc 6480
cttatagtcc atggtggcac cggtcttaag gatctgacgg ttcactaaac cagctctgct 6540
tatatagacc tcccaccgta cacgcctacc gcccatttgc gtcaatgggg cggagttgtt 6600
acgacatttt ggaaagtccc gttgattttg gtgccaaaac aaactcccat tgacgtcaat 6660
ggggtggaga cttggaaatc cccgtgagtc aaaccgctat ccacgcccat tgatgtactg 6720
ccaaaaccgc atcaccatgg taatagcgat gactaatacg tagatgtact gccaagtagg 6780
aaagtcccat aaggtcatgt actgggcata atgccaggcg ggccatttac cgtcattgac 6840
gtcaataggg ggcgtacttg gcatatgata cacttgatgt actgccaagt gggcagttta 6900
ccgtaaatac tccacccatt gacgtcaatg gaaagtccct attggcgtta ctatgggaac 6960
atacgtcatt attgacgtca atgggcgggg gtcgttgggc ggtcagccag gcgggccatt 7020
taccgtaagt tatgtaacgc ggaactccat atatgggcta tgaactaatg accccgtaat 7080
tgagatctga agttcctata gtttctagag tataggaact tcggtcataa cttcgtatag 7140
catacattat acgaagttat acgcgtttta aacggccggg ccggccatgc atagcttggc 7200
gtaatcatgg tcatagctgt ttcctgtgtg aaattgttat ccgctcacaa ttccacacaa 7260
catacgagcc ggaagcataa agtgtaaagc ctggggtgcc taatgagtga gctaactcac 7320
attaattgcg ttgcgctcac tgcccgcttt ccagtcggga aacctgtcgt gccagctgca 7380
ttaatgaatc ggccaacgcg cggggagagg cggtttgcgt attgggcgct cttccgcttc 7440
ctcgctcact gactcgctgc gctcggtcgt tcggctgcgg cgagcggtat cagctcactc 7500
aaaggcggta atacggttat ccacagaatc aggggataac gcaggaaaga acatgtgagc 7560
aaaaggccag caaaaggcca ggaaccgtaa aaaggccgcg ttgctggcgt ttttccatag 7620
gctccgcccc cctgacgagc atcacaaaaa tcgacgctca agtcagaggt ggcgaaaccc 7680
gacaggacta taaagatacc aggcgtttcc ccctggaagc tccctcgtgc gctctcctgt 7740
tccgaccctg ccgcttaccg gatacctgtc cgcctttctc ccttcgggaa gcgtggcgct 7800
ttctcaatgc tcacgctgta ggtatctcag ttcggtgtag gtcgttcgct ccaagctggg 7860
ctgtgtgcac gaaccccccg ttcagcccga ccgctgcgcc ttatccggta actatcgtct 7920
tgagtccaac ccggtaagac acgacttatc gccactggca gcagccactg gtaacaggat 7980
tagcagagcg aggtatgtag gcggtgctac agagttcttg aagtggtggc ctaactacgg 8040
ctacactaga aggacagtat ttggtatctg cgctctgctg aagccagtta ccttcggaaa 8100
aagagttggt agctcttgat ccggcaaaca aaccaccgct ggtagcggtg gtttttttgt 8160
ttgcaagcag cagattacgc gcagaaaaaa aggatctcaa gaagatcctt tgatcttttc 8220
tacggggtct gacgctcagt ggaacgaaaa ctcacgttaa gggattttgg tcatgagatt 8280
atcaaaaagg atcttcacct agatcctttt aaattaaaaa tgaagtttta aatcaatcta 8340
aagtatatat gagtaaactt ggtctgacag ttaccaatgc ttaatcagtg aggcacctat 8400
ctcagcgatc tgtctatttc gttcatccat agttgcctga ctccccgtcg tgtagataac 8460
tacgatacgg gagggcttac catctggccc cagtgctgca atgataccgc gagacccacg 8520
ctcaccggct ccagatttat cagcaataaa ccagccagcc ggaagggccg agcgcagaag 8580
tggtcctgca actttatccg cctccatcca gtctattaat tgttgccggg aagctagagt 8640
aagtagttcg ccagttaata gtttgcgcaa cgttgttgcc attgctacag gcatcgtggt 8700
gtcacgctcg tcgtttggta tggcttcatt cagctccggt tcccaacgat caaggcgagt 8760
tacatgatcc cccatgttgt gcaaaaaagc ggttagctcc ttcggtcctc cgatcgttgt 8820
cagaagtaag ttggccgcag tgttatcact catggttatg gcagcactgc ataattctct 8880
tactgtcatg ccatccgtaa gatgcttttc tgtgactggt gagtactcaa ccaagtcatt 8940
ctgagaatag tgtatgcggc gaccgagttg ctcttgcccg gcgtcaatac gggataatac 9000
cgcgccacat agcagaactt taaaagtgct catcattgga aaacgttctt cggggcgaaa 9060
actctcaagg atcttaccgc tgttgagatc cagttcgatg taacccactc gtgcacccaa 9120
ctgatcttca gcatctttta ctttcaccag cgtttctggg tgagcaaaaa caggaaggca 9180
aaatgccgca aaaaagggaa taagggcgac acggaaatgt tgaatactca tactcttcct 9240
ttttcaatat tattgaagca tttatcaggg ttattgtctc atgagcggat acatatttga 9300
atgtatttag aaaaataaac aaataggggt tccgcgcaca tttccccgaa aagtgccacc 9360
tgacgtctaa gaaaccatta ttatcatgac attaacctat aaaaataggc gtatcacgag 9420
gccctttcgt c 9431