本發(fā)明涉及基因工程領(lǐng)域,具體地,本發(fā)明涉及一種酸性木聚糖酶XYN11A及其基因和應(yīng)用。
背景技術(shù):
纖維素、半纖維素和木質(zhì)素等是植物細(xì)胞壁的主要組成成分。半纖維素包括木聚糖,甘露聚糖,半乳聚糖等等,完全降解半纖維素舉要多種酶的協(xié)同作用,其中木聚糖酶是一種切割β-1,4-糖苷鍵的主要酶類,在食品,飼料和紙漿工業(yè)等方面有廣闊的應(yīng)用前景。
在啤酒釀造過程中,麥芽中的木聚糖造成啤酒過濾困難、堵塞過濾膜,增加了啤酒的生產(chǎn)成本和品質(zhì),采用酸性木聚糖酶和木聚糖酶協(xié)同作用,可以解決以上問題。在飼料制粒時(shí),熱穩(wěn)定性優(yōu)良的木聚糖酶可以較少的損失酶活,并在進(jìn)食過程中輔助消化提高營養(yǎng)。而在紙漿漂白時(shí),木聚糖酶可以替代部分有機(jī)氯化物,從而減少環(huán)境污染。
由于不同工業(yè)對木聚糖酶性質(zhì)需求不同,因此,獲得新型具有優(yōu)良特性木聚糖酶的研究仍具有重大意義。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:
本發(fā)明的目的是提供一種能高效應(yīng)用的酸性木聚糖酶。
本發(fā)明的再一目的是提供編碼上述酸性木聚糖酶的基因。
本發(fā)明的另一目的是提供包含上述基因的重組載體。
本發(fā)明的另一目的是提供包含上述基因的重組菌株。
本發(fā)明的另一目的是提供一種制備上述酸性木聚糖酶的基因工程方法。
本發(fā)明的另一目的提供上述酸性木聚糖酶的應(yīng)用。
本發(fā)明從青霉Penicillium sp.L1中分離得到一種新的酸性木聚糖酶XYN11A。
本發(fā)明提供了一種酸性木聚糖酶XYN11A,其氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示。SEQ ID NO.1:
MSLFKSLFVVSAAILGANALPGDYHKRQTITSSETGTSNGYYYSFWTNGGGTVDYTNGDGGEYSVSWEDCGDFTSGKGWATGSDRDITFSGSFNPSGNAYLSVYGWTTSPLVEYYILENYGDYNPGSSMTYKGTVTSDGSVYEIYEHQQVDQPSVSGTATFNQYWSIRQDTRSSGTVTTANHFDAWASLGMDLGTTFNYQIVSTEGYESSGSSTITVS其中,該酶基因編碼218個(gè)氨基酸,N端19個(gè)氨基酸為其的信號(hào)肽序列“MSLFKSLFVVSAAILGANA”(SEQ ID NO.3)。
因此,成熟的酸性木聚糖酶Xyn11A的理論分子量為21.7kDa,其氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示:
LPGDYHKRQTITSSETGTSNGYYYSFWTNGGGTVDYTNGDGGEYSVSWEDCGDFTSGKGWATGSDRDITFSGSFNPSGNAYLSVYGWTTSPLVEYYILENYGDYNPGSSMTYKGTVTSDGSVYEIYEHQQVDQPSVSGTATFNQYWSIRQDTRSSGTVTTANHFDAWASLGMDLGTTFNYQIVSTEGYESSGSSTITVS
本發(fā)明的木聚糖酶Xyn11A同時(shí)具有好的pH穩(wěn)定性,并且常溫下在pH2.0-5.0酸性范圍內(nèi)均具有高活性,其最適pH值為3.5,在pH1.5~8.0的范圍內(nèi)維持穩(wěn)定;最適溫度為50℃。
本發(fā)明提供了編碼上述酸性木聚糖酶XYN11A。具體地,該基因的基因組序列如SEQ ID NO.4所示:
ATGTCCCTTTTCAAGAGCTTATTCGTGGTTTCTGCTGCCATCCTAGGGGCCAATGCGCTTCCTGGTGATTACCACAAGCGGCAAACTATCACCTCTAGCGAAACCGGGACGAGCAATGGCTACTATTATTCGTTCTGGACCAACGGGGGTGGCACAGTGGATTATACAAACGGCGATGGAGGTGAATACAGCGTCAGCTGGGAAGACTGTGGTGATTTCACATCCGGAAAAGGCTGGGCAACTGGAAGTGACCGGGATATCACCTTTTCCGGGTCTTTCAATCCTTCTGGAAACGCCTATCTTTCCGTCTACGGCTGGACTACGAGCCCACTCGTTGAGTACTATATCCTCGAGAATTATGGCGATTATAACCCTGGCAGCTCGATGACGTACAAGGGAACGGTGACCAGCGACGGATCTGTCTATGAGATCTACGAGCACCAGCAGGTTGATCAGCCCTCTGTGTCTGGCACTGCTACTTTCAACCAATACTGGTCCATTCGACAGGATACCCGCTCAAGCGGTACCGTGACCACTGCTAATCATTTCGATGCTTGGGCTTCCCTTGGAATGGATCTAGGAACCACCTTCAACTATCAGATAGTATCTACTGAGGGATATGAGAGCAGTGGATCCTCAACAATCACAGTTTCATGA
本發(fā)明通過PCR的方法分離克隆了木聚糖酶基因xyn11A,DNA全序列分析結(jié)果表明,木聚糖酶XYN11A結(jié)構(gòu)基因xyn11A全長657bp。其中,信號(hào)肽的堿基序列為:
ATGTCCCTTTTCAAGAGCTTATTCGTGGTTTCTGCTGCCATCCTAGGGGCCAATGCG(SEQ ID NO.6)。
成熟的木聚糖酶XYN11A的基因序列如SEQ ID NO.5所示。
SEQ ID NO.5
CTTCCTGGTGATTACCACAAGCGGCAAACTATCACCTCTAGCGAAACCGGGACGAGCAATGGCTACTATTATTCGTTCTGGACCAACGGGGGTGGCACAGTGGATTATACAAACGGCGATGGAGGTGAATACAGCGTCAGCTGGGAAGACTGTGGTGATTTCACATCCGGAAAAGGCTGGGCAACTGGAAGTGACCGGGATATCACCTTTTCCGGGTCTTTCAATCCTTCTGGAAACGCCTATCTTTCCGTCTACGGCTGGACTACGAGCCCACTCGTTGAGTACTATATCCTCGAGAATTATGGCGATTATAACCCTGGCAGCTCGATGACGTACAAGGGAACGGTGACCAGCGACGGATCTGTCTATGAGATCTACGAGCACCAGCAGGTTGATCAGCCCTCTGTGTCTGGCACTGCTACTTTCAACCAATACTGGTCCATTCGACAGGATACCCGCTCAAGCGGTACCGTGACCACTGCTAATCATTTCGATGCTTGGGCTTCCCTTGGAATGGATCTAGGAACCACCTTCAACTATCAGATAGTATCTACTGAGGGATATGAGAGCAGTGGATCCTCAACAATCACAGTTTCATGA
成熟蛋白理論分子量為21.7kDa,本發(fā)明的木聚糖酶與來源于Penicillium sp.40的木聚糖酶(xylanase A)的性質(zhì)有很大的差異,與Penicillium sp.40來源的的木聚糖酶xylanase A相比較,本發(fā)明的木聚糖酶XYN11A有更好的pH穩(wěn)定性和熱穩(wěn)定性,且其比活性是xylanase A的5倍,XYN11A更適于在飼料、食品等領(lǐng)域應(yīng)用,且成本低廉。
本發(fā)明還提供了包含上述酸性木聚糖酶基因XYN11A的重組載體,優(yōu)選為pPIC-xyn11A。將本發(fā)明的木聚糖酶基因插入到表達(dá)載體合適的限制性酶切位點(diǎn)之間,使其核苷酸序列可操作的與表達(dá)調(diào)控序列相連接。作為本發(fā)明的一個(gè)最優(yōu)選的實(shí)施方案,優(yōu)選為將本發(fā)明的木聚糖酶基因插入到質(zhì)粒pPIC9上的EcoR I和Not I限制性酶切位點(diǎn)之間,使該核苷酸序列位于AOX1啟動(dòng)子的下游并受其調(diào)控,得到重組酵母表達(dá)質(zhì)粒pPIC9-xyn11A。
本發(fā)明還提供了包含上述酸性木聚糖酶基因xyn11A的重組菌株,優(yōu)選所述菌株為酵母菌,優(yōu)選為重組菌株GS115/xyn11A。
本發(fā)明還提供了一種制備酸性木聚糖酶XYN11A的方法,包括以下步驟:
1)用上述的重組載體轉(zhuǎn)化宿主細(xì)胞,得重組菌株;
2)培養(yǎng)重組菌株,誘導(dǎo)重組木聚糖酶表達(dá);以及
3)回收并純化所表達(dá)的木聚糖酶XYN11A。
其中,優(yōu)選所述宿主細(xì)胞為畢赤酵母細(xì)胞、啤酒酵母細(xì)胞或多型遜酵母細(xì)胞,優(yōu)選將重組酵母表達(dá)質(zhì)粒轉(zhuǎn)化畢赤酵母細(xì)胞(Pichia pastoris)GS115,得到重組菌株GS115/xyn11A。
本發(fā)明還提供了上述酸性木聚糖酶XYN11A的應(yīng)用。
本發(fā)明首先所要解決的技術(shù)問題是克服現(xiàn)有技術(shù)的不足,提供一種性質(zhì)優(yōu)良的、適合于在飼料、釀酒、食品工業(yè)中應(yīng)用新的木聚糖酶。本發(fā)明的木聚糖酶最適pH為3.5,在pH2.0~5.0都有較高的酶活性;pH穩(wěn)定性好;并且具有較高木聚糖酶活性。本發(fā)明的木聚糖酶可應(yīng)用于飼料工業(yè),有效降低粘度,消除或降低因粘度增加而引起的抗?fàn)I養(yǎng)作用。在釀酒工業(yè)中,可有效降解木聚糖,有效降低麥芽汁的粘度提高過濾效率澄清啤酒。該酶還可以在木質(zhì)纖維材料降解中,輔助纖維素酶進(jìn)行進(jìn)一步地降解。因此,本木聚糖酶在能源工業(yè)中的應(yīng)用也顯示出其巨大的潛力。
附圖說明
圖1重組木聚糖酶的最適pH。
圖2重組木聚糖酶的pH穩(wěn)定性。
圖3重組木聚糖酶的最適溫度。
圖4重組木聚糖酶的熱穩(wěn)定性。
具體實(shí)施方式
試驗(yàn)材料和試劑
1、菌株及載體:本發(fā)明從青霉Penicillium sp.L1中分離得到一種新的酸性木聚糖酶Xyn11A。畢赤酵母表達(dá)載體pPIC9及菌株GS115購自于Invitrogen公司。
2、酶類及其它生化試劑:內(nèi)切酶購自TaKaRa公司,連接酶購自Invitrogen公司。櫸木木聚糖購自Sigma公司,其它都為國產(chǎn)試劑(均可從普通生化試劑公司購買得到)。
3、培養(yǎng)基:
(1)青霉Penicillium sp.L1培養(yǎng)基為馬鈴薯汁培養(yǎng)基:1000mL馬鈴薯汁,10g葡萄糖,25g瓊脂,pH5.0。
(2)大腸桿菌培養(yǎng)基LB(1%蛋白胨、0.5%酵母提取物、1%NaCl,pH7.0)。
(3)BMGY培養(yǎng)基:1%酵母提取物,2%蛋白胨,1.34%YNB,0.00004%Biotin,1%甘油(V/V)。
(4)BMMY培養(yǎng)基:除以0.5%甲醇代替甘油,其余成份均與BMGY相同,pH4.0。
說明:以下實(shí)施例中未作具體說明的分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)方法,均參照《分子克隆實(shí)驗(yàn)指南》(第三版)J.薩姆布魯克一書中所列的具體方法進(jìn)行,或者按照試劑盒和產(chǎn)品說明書進(jìn)行。
實(shí)施例1青霉Penicillium sp.L1木聚糖酶編碼基因XYN11A的克隆
提取青霉Penicillium sp.L1基因組DNA。
設(shè)計(jì)引物P1和P2進(jìn)行PCR擴(kuò)增,
P1:CGGAATTCCTTCCTGGTGATTACCACAAGCGG
P2:ATTTGCGGCCGCTCATGAAACTGTGATTGTTGAGGATCCAC
回收、測序獲得序列如SEQ ID NO.4所示的酸性木聚糖酶XYN11A。
實(shí)施例2重組木聚糖酶的制備
將表達(dá)載體pPIC9進(jìn)行雙酶切(EcoR I+Not I),同時(shí)將編碼木聚糖酶的基因xyn11A雙酶切(EcoR I+Not I),切出編碼成熟木聚糖酶的基因片段與表達(dá)載體pPIC9連接,獲得含有青霉Penicillium sp.L1木聚糖酶基因xyn11A的重組質(zhì)粒pPIC-xyn11A并轉(zhuǎn)化畢赤酵母GS115,獲得重組畢赤酵母菌株GS115/xyn11A。
以同樣的方法構(gòu)建含有信號(hào)肽序列的木聚糖酶基因的重組表達(dá)載體,并轉(zhuǎn)化畢赤酵母菌株。
取含有重組質(zhì)粒的GS115菌株,接種于300mL BMGY培養(yǎng)液中,30℃250rpm振蕩培養(yǎng)48h后,離心收集菌體。然后于150mL BMMY培養(yǎng)基重懸,30℃250rpm振蕩培養(yǎng)。誘導(dǎo)72h后,離心收集上清。測定木聚糖酶的活力。重組木聚糖酶的表達(dá)量為809.9U/mL。SDS-PAGE結(jié)果表明,重組木聚糖酶在畢赤酵母中得到了表達(dá)。重組木聚糖的比活為4286U/mg。
實(shí)施例4重組木聚糖酶的活性分析
DNS法:具體方法如下:在pH3.5,50℃條件下,1mL的反應(yīng)體系包括100μL適當(dāng)?shù)南♂屆敢海?00μL底物,反應(yīng)10min,加入1.5mL DNS終止反應(yīng),沸水煮5min。冷卻后540nm測定OD值。1個(gè)酶活單位(U)定義為在給定的條件下每分鐘釋放出1μmol還原糖所需要的酶量。
1、重組木聚糖酶XYN11A的最適pH和pH穩(wěn)定性的測定方法如下:
將實(shí)施例3純化的重組木聚糖酶在不同的pH下進(jìn)行酶促反應(yīng)以測定其最適pH。底物木聚糖用不同pH的0.1mol/L檸檬酸-磷酸氫二鈉緩沖液中50℃下進(jìn)行木聚糖酶活力測定。結(jié)果(圖1)表明,重組酶XYN11A的最適pH為3.5,在pH2.0~5.0有60%以上的相對酶活性。木聚糖酶于上述各種不同pH的緩沖液中37℃處理60min,再在pH3.5緩沖液體系中50℃下測定酶活性,以研究酶的pH耐性。結(jié)果(圖2)表明木聚糖酶在pH 1.5-8.0之間均很穩(wěn)定,在此pH范圍內(nèi)處理60min后剩余酶活性在80%左右,這說明此酶在酸性和中性范圍內(nèi)具有較好的pH穩(wěn)定性。雖然與來源于Penicilliumsp.40的木聚糖酶(xylanase A)氨基酸序列一致性為86%,但是兩者的最適pH值不同,xylanase A為2.0,而XYN11A為3.5,XYN11A有更寬的pH作用范圍,XYN11ApH穩(wěn)定性優(yōu)于xylanase A。
2、木聚糖酶的最適溫度及熱穩(wěn)定性測定方法如下:
木聚糖酶的最適溫度的測定為在pH3.5的檸檬酸-磷酸氫二鈉緩沖液緩沖液體系及不同溫度下進(jìn)行酶促反應(yīng)。耐溫性測定為木聚糖酶在不同溫度下處理不同時(shí)間,再在50℃下進(jìn)行酶活性測定。酶反應(yīng)最適溫度測定結(jié)果(圖3)表明其最適溫度為50℃。酶的熱穩(wěn)定性性試驗(yàn)表明(圖4),XYN11A有良好的熱穩(wěn)定性,在40℃下溫育1h,能保持90%以上的酶活。在熱穩(wěn)定性方面,XYN11A也顯著優(yōu)于xylanase A的30℃穩(wěn)定。
3、木聚糖酶的Km值測定方法如下:
用不同濃度的木聚糖為底物,在檸檬酸-磷酸氫二鈉緩沖液(pH3.5)緩沖液體系中,50℃下測定酶活性,計(jì)算出其Km值。經(jīng)測定,以木聚糖為底物時(shí)的Km值為3.3mg/mL,最大反應(yīng)速度Vmax為6000μmol/min·mg。
4、不同金屬離子化學(xué)試劑對XYN11A酶活的影響測定如下:
在酶促反應(yīng)體系中加入不同濃度的不同的金屬離子及化學(xué)試劑,研究其對酶活性的影響,各種物質(zhì)終濃度為5mmol/L。在50℃、pH4.0條件下測定酶活性。結(jié)果表明,部分離子和化學(xué)試劑在濃度為5mmol時(shí)重組木聚糖酶的活力沒有明顯變化。但是Fe3+可以抑制其將近一半活力,而Pb2+、Cu2+、Mn2+可以抑制近20%的活性,而SDS可強(qiáng)烈抑制其活力僅剩余30%。而Na+、Mg2+、Ca2+、Ni2+、EDTA、K+可以部分激活XYN11A酶活力。
5、重組木聚糖酶的底物特異性
該酶可高效降解櫸木木聚糖,燕麥木聚糖,樺木木聚糖和小麥阿拉伯木聚糖。
<110> 北京盛拓達(dá)生物技術(shù)有限公司
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