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      一種酸性磷酸酯酶基因AP2的克隆表達(dá)及應(yīng)用的制作方法

      文檔序號(hào):11145136閱讀:619來(lái)源:國(guó)知局
      一種酸性磷酸酯酶基因AP2的克隆表達(dá)及應(yīng)用的制造方法與工藝
      本發(fā)明涉及一種酸性磷酸酯酶基因(AP2)的克隆表達(dá),并公開(kāi)了其基因的核苷酸序列、氨基酸序列、其酶學(xué)性質(zhì)及在水解磷礦石粉中的應(yīng)用,屬于生物工程
      技術(shù)領(lǐng)域
      。
      背景技術(shù)
      :酸性磷酸酯酶(Acidphosphatase,EC3.1.3.2,AcPase)是能夠水解磷酸單酯鍵斷裂生成Pi和相應(yīng)脂肪酸的一類酶。酸性磷酸酯酶通過(guò)催化磷蛋白的水解參與生物磷代謝及其調(diào)節(jié),在細(xì)胞中是能量轉(zhuǎn)換和信號(hào)傳導(dǎo)等生命活動(dòng)的重要酶類。1991年,Williamson等發(fā)現(xiàn)抗線蟲(chóng)類番茄的第一個(gè)AcPase基因;LiuJ等發(fā)現(xiàn)了由cDNA編碼運(yùn)輸AcPase的基因;MillerS等報(bào)道了編碼的分泌AcPase基因;T.shinano等也發(fā)現(xiàn)了洋蔥鱗片細(xì)胞中由AcPase編碼的PEP磷酸酯酶基因,ZhangC等提純出三葉草根細(xì)胞壁中的四種AcPase同工酶。近些年國(guó)內(nèi)外己對(duì)一些動(dòng)植物酸性磷酸醋酶也進(jìn)行了研究,如對(duì)蝦,草魚(yú)文昌魚(yú),刺參,背角無(wú)齒蚌,小麥等;微生物中的研究主要是在大腸桿菌和酵母上;在動(dòng)物組織細(xì)胞主要集中在珍珠貝,淡水鍋牛,小鼠,公豬的生殖腺,人類前列腺、肝臟、血漿等。AcPase普遍存在于植物中,如根和根的節(jié)結(jié),塊莖,鱗莖,種子,胚芽鞘,葉子,幼芽和子葉等都有存在,該酶在植物體內(nèi)可以分解有機(jī)磷化合物,促進(jìn)磷的再吸收和利用,體外可以對(duì)土壤中有機(jī)磷進(jìn)行分解以供根系吸收。TurnerWL等在香蕉果實(shí)中測(cè)得的最適pH為5.8,GranjeiroPA等研究蓖麻子AcPase的最適pH是5.5,MiernykJA以玉米胚乳為試材,測(cè)得AcPase最適為5.5,最適溫度為50°;GellatlyKS等測(cè)定馬鈴薯塊莖的AcPase最適pH是5.8,張劍銘等通過(guò)氟化鈉對(duì)大豆AcPase進(jìn)行研究,得到的AcPase最適pH為5.6,最適溫度為37℃。費(fèi)美娟等對(duì)小麥葉片AcPase的生化性質(zhì)研究得到其最適pH是6.8,最適作用溫度為45°;董登峰等研究大豆葉片的得到其最適pH4.8,溫度在60°以下都保持有較高酶活。酸性磷酸酯酶通過(guò)水解底物生成磷酸鹽,這對(duì)大多植物來(lái)說(shuō)是非常必要的,因?yàn)榱资侵参锷L(zhǎng)所必須的元素,是植物花芽分化及形態(tài)形成時(shí)結(jié)構(gòu)物質(zhì)的必要構(gòu)成,農(nóng)業(yè)生產(chǎn)上采用在花芽分化前增施磷肥可促進(jìn)成花,然而磷素在早期就容易缺乏,且植物無(wú)明顯缺素癥狀,使得生產(chǎn)中會(huì)出現(xiàn)植物的營(yíng)養(yǎng)生長(zhǎng)不良等現(xiàn)象。對(duì)于磷酸鹽吸收受限,細(xì)胞就會(huì)通過(guò)磷酸酯酶將核酸、磷酸化糖、有機(jī)磷化合物及蛋白質(zhì)等水解,從而使有機(jī)體滿足磷酸鹽的需要。因此,大多植物受到磷營(yíng)養(yǎng)脅迫時(shí),磷酸酯酶活性增強(qiáng),作為磷酸酯酶的競(jìng)爭(zhēng)性抑制在體內(nèi)調(diào)節(jié)磷酸水平至關(guān)重要。磷酸酯酶可水解已代謝的磷酸酯類物質(zhì),釋放的又可以轉(zhuǎn)移到胞質(zhì)再次參與細(xì)胞代謝。本發(fā)明從貴州磷礦上生長(zhǎng)的植物根際篩選產(chǎn)磷酸酯酶的細(xì)菌,并對(duì)其基因組序列進(jìn)行對(duì)比分析。并利用大腸桿菌工程菌異源表達(dá)酸性磷酸酯酶基因以驗(yàn)證其活性,分離純化重組酸性磷酸酯酶酶并對(duì)其酶學(xué)性質(zhì)進(jìn)行研究。技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:本發(fā)明目的在于提供一種高活性的酸性磷酸酯酶(AP2),并利用大腸桿菌工程菌對(duì)其進(jìn)行異源表達(dá),公開(kāi)了相關(guān)的酶學(xué)性質(zhì),并對(duì)其進(jìn)行了部分應(yīng)用。1菌株本發(fā)明從貴州磷礦上生長(zhǎng)的植物根際篩選產(chǎn)磷酸酯酶的細(xì)菌BacillusamyloliquefaciensYP6(YP6,Accession:KP326355.1)。2酸性磷酸酯酶基因(AP2)的克隆表達(dá)提取BacillusamyloliquefaciensYP6的全基因組DNA,設(shè)計(jì)酸性磷酸酯酶基因的特異性引物,擴(kuò)增出酸性磷酸酯酶全長(zhǎng)編碼框序列,并構(gòu)建重組序列。3酸性磷酸酯酶基因的表達(dá)及純化將重組質(zhì)粒導(dǎo)入大腸桿菌BL21(DE3)中,誘導(dǎo)表達(dá),菌體破碎后得到粗酶液經(jīng)Ni柱純化后備用。4磷酸酯酶酶學(xué)性質(zhì)以磷酸苯二鈉為底物研究pH對(duì)酸性磷酸酯酶活性的影響。以磷酸苯二鈉為底物研究溫度對(duì)酸性磷酸酯酶活性的影響。以磷酸苯二鈉為底物研究金屬離子Mg2+,Ca2+,Ba2+,Mn2+,Cu2+,F(xiàn)e2+,F(xiàn)e3+,Zn2+,Ni2+,Co2+對(duì)酸性磷酸酯酶活性的影響。底物動(dòng)力學(xué)參數(shù),所用底物為磷酸苯二鈉及對(duì)硝基磷酸苯二鈉(pNPP)。1)以磷酸苯二鈉為底物酶活測(cè)定方法為:檸檬酸-檸檬酸鈉緩沖液,pH=5.5。0.02mol/L磷酸苯二鈉溶液稱取磷酸苯二鈉2.18g,加入煮沸的400mL蒸餾水中,使其溶解,冷卻后用煮過(guò)的冷蒸餾水定容至500mL,再加氯仿2mL,置冰箱保存。鐵氰化鉀溶液稱取鐵氰化鉀2.5g,硼酸17.0g,分別溶于400mL蒸餾水中,二液混合后,加蒸餾水定容至1000mL,置棕色瓶中避光保存。將100μL純化后的酶液加入1mL檸檬酸-檸檬酸鈉緩沖液中40℃保溫5min,再加入已預(yù)熱的磷酸苯二鈉溶液1mL,在40℃下反應(yīng)15min,然后加入鐵氰化鉀溶液3mL,顯色并終止反應(yīng),在分光光度計(jì)510nm下測(cè)定,重復(fù)3次。酶活定義:最適條件下,每分鐘催化磷酸苯二鈉轉(zhuǎn)化1μmol產(chǎn)物為一個(gè)酶活單位。2)以對(duì)硝基磷酸苯二鈉為底物酶活測(cè)定方法為:0.25mL檸檬酸-檸檬酸鈉緩沖液(pH=5.5)補(bǔ)足蒸餾水至0.8mL,加入0.03mL酶液,40℃預(yù)熱5min,加入0.2mL底物反應(yīng)30min,加入0.5mL1MNaOH終止反應(yīng),在405nm處測(cè)吸光值。酶活定義:最適條件下,每分鐘催化pNPP轉(zhuǎn)化1μmolp-NP為一個(gè)酶活單位。5酸性磷酸酯酶在水解磷礦石粉中的應(yīng)用利用重組菌株發(fā)酵磷礦石粉,測(cè)定其解磷能力。具體實(shí)施方式下面結(jié)合具體的制備實(shí)施例和應(yīng)用實(shí)施例,并參照數(shù)據(jù)進(jìn)一步詳細(xì)地描述本發(fā)明。應(yīng)理解,這些實(shí)施例只是為了舉例說(shuō)明本發(fā)明,而非以任何方式限制本發(fā)明的范圍。在以下的實(shí)施例中,未詳細(xì)描述的各種過(guò)程和方法是本領(lǐng)域中公知的常規(guī)方法。一般性說(shuō)明:實(shí)施例所涉及的酶均購(gòu)自TaKaRa公司,質(zhì)粒試劑盒和瓊脂糖凝膠回收試劑盒購(gòu)自上海生物工程有限公司,操作完全按照相應(yīng)說(shuō)明進(jìn)行。引物合成與質(zhì)粒測(cè)序由上海桑尼公司完成。實(shí)施例1本實(shí)施例為本發(fā)明所述的酸性磷酸酯酶基因的克隆及大腸桿菌工程菌的構(gòu)建1BacillusamyloliquefaciensYP6全基因組抽提將BacillusamyloliquefaciensYP6菌株接種于3mLLB培養(yǎng)基培養(yǎng)12h,12000r/min離心10min得到菌體,利用細(xì)菌基因組DNA抽提試劑盒按步驟得到全基因組備用。2大腸桿菌感受態(tài)制備從LB平板上分別挑取DH5α和BL21(DE3)單菌落,接種于3mLLB液體培養(yǎng)基中,37℃振蕩培養(yǎng)過(guò)夜至對(duì)數(shù)生長(zhǎng)中后期。將該菌懸液以1:100的比例接種于50mLLB液體培養(yǎng)基中,37℃振蕩培養(yǎng)2.5小時(shí)至OD600=0.5。細(xì)菌培養(yǎng)液冰浴5分鐘后,4℃5000r/min離心5min。用預(yù)冷的去離子水洗滌沉淀,4℃5000r/min離心5min。沉淀加入2ml預(yù)冷的0.05mol/LCaCl2-15%甘油混合溶液,輕吹散,冰浴5分鐘,4℃5000r/min離心min。沉淀加入2mL預(yù)冷的0.05mol/LCaCl2-15%甘油混合溶液,輕吹散,即成為感受態(tài)細(xì)胞懸液。分裝成50μL的小份,貯存于-70℃可保存半年。3PCR擴(kuò)增酸性磷酸酯酶基因1)引物設(shè)計(jì)根據(jù)BacillusamyloliquefaciensYP6的16SrDNA,與NCBI中已知的酸性磷酸酯酶基因的對(duì)比,設(shè)計(jì)引物為:S:5’-GCCGGGATCCATGACACATGACGGCCGTTTAGATG-3’;A:5’-GCCGTCTAGATTATTGTGAGATTTTGGCCCGTTTC-3’2)PCR擴(kuò)增擴(kuò)增體系為:PCR反應(yīng)液組成(25μl)PremixTaq(ExTaqVersion2.0)25μlDNA模板1μlPrimerF1μlPrimerR1μl滅菌蒸餾水22μlPCR反應(yīng)條件98℃10s,55℃30s,72℃2min,30個(gè)循環(huán),最后保存于10℃中。PCR產(chǎn)物送華大基因測(cè)序后得到該酸性磷酸酯酶基因如SEQIDNO.1所示。3)雙酶切和連接將pColdⅡ質(zhì)粒與PCR產(chǎn)物進(jìn)行雙酶切,酶切體系為上述反應(yīng)液在37℃反應(yīng)1h后,經(jīng)過(guò)核酸膠驗(yàn)證后進(jìn)行割膠回收,回收產(chǎn)物再次進(jìn)行核酸膠驗(yàn)證正確后進(jìn)行pColdⅡ質(zhì)粒片段與目的基因的連接。連接體系為:反應(yīng)液在16℃過(guò)夜連接12h后,轉(zhuǎn)入感受態(tài)。4)轉(zhuǎn)化1.取DH5α感受態(tài)一管100μl,加入20μl上述連接反應(yīng)液。2.冰浴30min。3.在42℃下反應(yīng)90s,冰浴1min。4.加入LB培養(yǎng)基890ml,37℃下培養(yǎng)1h復(fù)壁。5.在12,000×g離心1min,取出900ml上清倒掉,剩余菌體和培養(yǎng)液混合均勻,涂布含Amp抗性的平板。6.挑選10個(gè)單菌落37℃倒置培養(yǎng),進(jìn)行菌落PCR驗(yàn)證并送去華大基因進(jìn)行測(cè)序。菌落PCR方法如上所述,引物采用pColdⅡ上通用引物pCold-Fprimer和pCold-Rprimer。陽(yáng)性重組子提取質(zhì)粒導(dǎo)入BL21(DE3)感受態(tài)備用。實(shí)施例2本實(shí)施例為本發(fā)明所述的重組菌株的誘導(dǎo)表達(dá)1.將10μl重組菌株加入3mlLB培養(yǎng)基,加入3μl氨芐溶液,以空菌(原始菌BL21(DE3))和空載(轉(zhuǎn)入pColdⅡ質(zhì)粒)作對(duì)照,37℃,200rpm,培養(yǎng)12h。2.取上述種子液加入含50mlLB的三角瓶,加50μl氨芐溶液,培養(yǎng)2-2.5h,至OD600=0.4-0.6,搖床調(diào)至15℃,靜置30min。3.每瓶加入50μl0.5mol/L的IPTG20μl,以不加IPTG誘導(dǎo)作對(duì)照15℃培養(yǎng)24h。4.將菌液收集,4℃,8000rpm離心10min,棄上清,加入5ml磷酸緩沖液(pH=7.0)重懸菌體,超聲波破碎,破2s,停3s,30%功率,10min。5.離心取上清,4℃,8000rpm離心10min。6.測(cè)酶活及跑膠驗(yàn)證。將上述得到的粗酶液采用AKTAavant150蛋白純化系統(tǒng)進(jìn)行鎳柱純化,洗脫方法為將A1、A2、B1、B2、四根管路都放到水里,設(shè)置systemflow20ml/min進(jìn)行排氣。然后設(shè)置systemflow1ml/min、flowpath(columnposition3)、deltapressure0.5、Gradient0、insetA1,待水滴均勻流出后裝鎳柱,平衡10min后將A1放入結(jié)合液中,B1放入洗脫液中,再排氣一次,平衡20min,然后上樣粗酶液,用500mM的高濃度咪唑緩沖液B1梯度洗脫目的蛋白,將吸附在柱子上的蛋白洗脫下來(lái)手機(jī)有酶活的洗脫液備用。實(shí)施例3本實(shí)施例為本發(fā)明所述的酸性磷酸酯酶的最適pH及pH穩(wěn)定性。以磷酸苯二鈉為底物,在37℃的條件下,分別測(cè)定不同pH(3.0,4.0,4.5,5.0,5.5,6.0,7.0,8.0,9.0,10.0)以及在各個(gè)pH下保存1h后的酶活,分別如圖1,圖2所示,可知該酸性磷酸酯酶的最適pH為5.5。實(shí)施例4本實(shí)施例為本發(fā)明所述的酸性磷酸酯酶的最適溫度及溫度穩(wěn)定性。以磷酸苯二鈉為底物,在pH=5.5的條件下,分別測(cè)定不同溫度(4,20,25,30,35,40,45,50,55,60,70,80℃.)以及在各個(gè)溫度下保存1h后的酶活,分別如圖3,圖4所示??芍撍嵝粤姿狨ッ傅淖钸m溫度為30℃。實(shí)施例5本實(shí)施例為不同金屬離子(Mg2+,Ca2+,Ba2+,Mn2+,Cu2+,F(xiàn)e2+,F(xiàn)e3+,Zn2+,Ni2+,Co2+)在不同濃度下對(duì)該酸性磷酸酯酶的影響,結(jié)果如圖5所示,可知,Mg2+、Mn2+和Ba2+對(duì)該酶有明顯的促進(jìn)作用,F(xiàn)e2+和Fe3+有明顯的抑制作用。實(shí)施例6本實(shí)施例為以磷酸苯二鈉和pNPP為底物的動(dòng)力學(xué)參數(shù)的測(cè)定在最適反應(yīng)pH和反應(yīng)溫度下測(cè)定該酸性磷酸酯酶催化不同濃度的磷酸苯二鈉和pNPP的反應(yīng)速率,反應(yīng)體系中含10mMMgSO4,參照Linewear-Burk雙倒數(shù)作圖法,計(jì)算Vmax和Km值,進(jìn)而算出Kcat/Km值。如圖6所示,可知在以磷酸苯二鈉和pNPP為底物的條件下,該酸性磷酸酯酶均表現(xiàn)出較高活性。實(shí)施例7本實(shí)施例為酸性磷酸酯酶AP2水解磷礦石粉的應(yīng)用重組菌株制成種子液以3%的比例加入含1%磷礦石粉的LB培養(yǎng)基中,30℃,200r/min,發(fā)酵培養(yǎng)3d,取發(fā)酵液離心后上清用鉬酸銨比色法測(cè)定其水解能力為61ug/mL。附圖說(shuō)明圖1:最適pH(摘要附圖)圖2:pH穩(wěn)定性圖3:最適溫度圖4:溫度穩(wěn)定性圖5:不同金屬離子對(duì)堿性磷酸酯酶活性的影響圖6:以磷酸苯二鈉和pNPP為底物動(dòng)力學(xué)參數(shù)。SEQIDNO.1ATGACACATGACGGCCGTTTAGATGAATGGATCAAGGAATTGGAGAACAAAAGCTTTCAGAACAATACGTTTGACCGCCGCGCATTTATACAGGGTGCGGGGAAAATCGCCGGTCTTTCCCTCGGGTTAGCGATCGCCCAATCCATCGGCGCGTTTGAAGTGAATGCCGCTCCGAAATTTTCTAACTATCCGTTCACCCTCGGCGTAGCTTCCGGCGACCCGCTGTCTGACAGCGTCATTCTCTGGACGCGTCTTGCCCCGGACCCGCTGAATGGGGGCGGCATGCCGAAGCAGGCTGTGCCGGTAAATTGGGAAATCGCCACTGATGAACATTTCCGCCATATCGTCAAACGCGGAACGGAGATGGCCAAGCCGAATCTCGGGCACTCCGTCCATGTCGAAGCGGACGGGCTCAAGCCCAATAAAGTGTACTATTACCGGTTTAAAAGCGGGCATGAACTCAGCCCCGTCGGCCGGACGAAAACGCTGCCCGCCCCCGGTGCTGACGTGTCCGCCATGACGTTTGCATTTGCCTCATGCCAGCAATATGAACACGGCTATTATACGGCGTATAAGCATATGGCGAAGGAAAAGCTTGATCTCGTCTTCCATCTCGGAGATTACATTTATGAATACGGACCGAATGAATATGTGTCAAAAACGGGAAATGTCAGGACGCACAGCAGCGCCGAAGTGTATACACTGGCAGATTACCGTAACCGTCACGCCCAATACCGCTCTGATGCCAATCTGAAAGCCGCCCACGCCGCATTTCCGTGGGTCGTGACATGGGACGATCATGAGGTGGAAAACAATTATGCCAATGTCATCCCCGAAAAAGGCCAATCGGTTGAAGCGTTTGTGCTCAGACGGGCCGCGGCTTATCAGGCATATTATGAACACATGCCGCTCAGGCGCATGTCACTGCCGAACGGTCCTGATATGCGGCTGTACAGGCAATTCTCATATGGCAATTTAGCCTCGTTTAATGTGCTTGACACAAGACAGTACAGAGATGACCAGGCCAACGGAGACGGGAATAAGCCCCCTTCTGATGAGTGGAGAGACCCAAAACGCACACTGATGGGGACAGAGCAGGAGCAATGGCTGTTCGAAAATTTAGCCGCCTCAAAAGCGAAGTGGAATGTGCTGGCGCAGCAAATCTTTTTCGCGCAATGGAATTTCGGAACAACCGCCAATCCGATATTCAGCATGGATTCATGGGACGGCTACCCGGCTCAGCGGGAGCGGGTCATCAATTTTATAAAAAGCAAAAATCTGAACAATGTCATCGTGCTGACGGGTGATGTTCATGCAAGCTGGGCGTCAAACCTGCATACCGATTTTAATCAAACGAATTCAAAAATCTTCGGCGCCGAATTCGTCGGGACTTCCATTACATCTGGAGGAAACGGGGCGGATAAACGGGCCGATACGGATCAGATCTTAAAACAAAACCCGCACATCAAGTTTTTCAACGATTATCGCGGCTATGTCCGCTGTACGGTTACGCCGGCCCAATGGAGAGCGGATTACAGAGTGGTGCCGTATGTGACGGAGCCGGGGGCTGAGGTATCCACACGGGCTTCCTTCATTTATCAGAAAGACCAGACGGGGATTCGGAAGGTCTCTCAAAACGCGGTTGCGGGAGGCTTGAAGCAGTCAAACGAAGTGGAAGAGGATCGATTCTTCGCCCATAACAATGCGCACGAAAAGCAAATGAGAAAGAAACGGGCCAAAATCTCACAATAASEQIDNO.2MTHDGRLDEWIKELENKSFQNNTFDRRAFIQGAGKIAGLSLGLAIAQSIGAFEVNAAPKFSNYPFTLGVASGDPLSDSVILWTRLAPDPLNGGGMPKQAVPVNWEIATDEHFRHIVKRGTEMAKPNLGHSVHVEADGLKPNKVYYYRFKSGHELSPVGRTKTLPAPGADVSAMTFAFASCQQYEHGYYTAYKHMAKEKLDLVFHLGDYIYEYGPNEYVSKTGNVRTHSSAEVYTLADYRNRHAQYRSDANLKAAHAAFPWVVTWDDHEVENNYANVIPEKGQSVEAFVLRRAAAYQAYYEHMPLRRMSLPNGPDMRLYRQFSYGNLASFNVLDTRQYRDDQANGDGNKPPSDEWRDPKRTLMGTEQEQWLFENLAASKAKWNVLAQQIFFAQWNFGTTANPIFSMDSWDGYPAQRERVINFIKSKNLNNVIVLTGDVHASWASNLHTDFNQTNSKIFGAEFVGTSITSGGNGADKRADTDQILKQNPHIKFFNDYRGYVRCTVTPAQWRADYRVVPYVTEPGAEVSTRASFIYQKDQTGIRKVSQNAVAGGLKQSNEVEEDRFFAHNNAHEKQMRKKRAKISQ當(dāng)前第1頁(yè)1 2 3 
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