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      用于檢測(cè)JAG2基因SNP位點(diǎn)rs2238286基因型的試劑盒的制作方法

      文檔序號(hào):12056593閱讀:615來(lái)源:國(guó)知局
      用于檢測(cè)JAG2基因SNP位點(diǎn)rs2238286基因型的試劑盒的制作方法與工藝

      本發(fā)明涉及用于檢測(cè)JAG2基因突變的試劑盒,具體涉及用于檢測(cè)JAG2基因SNP位點(diǎn)rs2238286基因型的方法。



      背景技術(shù):

      JAG2基因是NOTCH信號(hào)通路的配體之一,它的主要作用是參與了次級(jí)腭的形成和發(fā)育過(guò)程,被認(rèn)為是唇腭裂的候選基因之一。JAG2基因rs2238286(n.66+11354A>G)位點(diǎn)位于該基因的5’端附近,在研究中該位點(diǎn)AG、GG基因型表現(xiàn)出與非綜合征性唇腭裂有顯著性相關(guān)性。

      作為常見(jiàn)的出生缺陷和顱面發(fā)育缺陷,唇腭裂是一種復(fù)雜的異質(zhì)性疾病,國(guó)際上將其分為綜合征性(syndromic cleft lip or palate,SCLP)和非綜合征性唇腭裂(non-syndromic cleft lip or palate,NSCLP)。全球唇腭裂的發(fā)生率為3-22/10000,而我國(guó)的發(fā)生率約為1.82/1000。NSCLP的發(fā)病原因有很多,其中遺傳和環(huán)境的影響占據(jù)了主要作用。研究發(fā)現(xiàn)許多信號(hào)通路參與了唇腭的發(fā)育,不同染色體區(qū)間在唇腭裂發(fā)病中具有一定作用。目前已知的NSCLP易感區(qū)有Iq32,2p,2q,3q27-28,4q,6p23-p25,8q24,9q21,12p11,14q21-24, 16q24 和 19q13,可能的易感基因有IRF6、SATB2、TP63、FQXE1、PVRL1、MSX1、GABRB3、CRISPLD2、MAFB 和 ABCA4等。

      高分辨率熔解曲線(xiàn)(high resolution melting, HRM)的分析原理是在常規(guī)聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)過(guò)程中飽和熒光染枓與雙鏈DNA結(jié)合,當(dāng)通過(guò)加熱升溫使DNA雙鏈解離時(shí),熒光染料從局部解鏈的DNA分子上釋放,由于突變、SNP位點(diǎn)雙鏈堿基間不匹配會(huì)使雙鏈DNA在此位點(diǎn)首先解開(kāi),通過(guò)實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)升溫過(guò)程中的熒光強(qiáng)度,從熒光強(qiáng)度與時(shí)間軸曲線(xiàn)上便可判斷是否存在突變或SNP,而且不同位點(diǎn)、雜合子與否、GC含量、擴(kuò)增子長(zhǎng)度等都會(huì)影響熔解曲線(xiàn)的峰形。所以,HRM分析能夠有效區(qū)分不同突變位點(diǎn)、SNP位點(diǎn)和擁有不同GC含量的擴(kuò)增片段。



      技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:

      本發(fā)明提供了用于檢測(cè)JAG2基因突變的試劑盒,具體提供了用于檢測(cè)JAG2基因SNP位點(diǎn)rs2238286基因型的試劑盒,該試劑盒可用于非綜合唇腭裂易患性的輔助分析。

      本發(fā)明的第一個(gè)目的是提供用于檢測(cè)JAG2基因SNP位點(diǎn)rs2238286基因型的試劑盒,所述試劑盒包括引物對(duì)和PCR檢測(cè)反應(yīng)試劑;其中,所述引物對(duì)為(1)或(2)中的一種:

      (1)上游引物:JAG2-F 5'- AGGAGCTAGGGGGAGAGAAGAC-3'

      下游引物:JAG2-R 5'- AGGGGTCACCTTGGTGGTTA-3';

      (2)與(1)中的互補(bǔ)序列。

      作為優(yōu)選,所述PCR檢測(cè)反應(yīng)試劑包括含EvaGreen的Green-2-Go qPCRMastermix。

      作為優(yōu)選,所述PCR擴(kuò)增時(shí)的反應(yīng)體系為:

      Green-2-Go qPCRMastermix(含EvaGreen) 5μl

      引物F(10μM) 0.1μl

      引物R(10μM) 0.1μl

      模板(50ng/μl) 0.5μl

      ddH2O 4.3μl

      總體積 10μl。

      作為進(jìn)一步優(yōu)選,所述試劑盒還包括標(biāo)準(zhǔn)品,所述標(biāo)準(zhǔn)品為重組陰性質(zhì)粒和重組陽(yáng)性質(zhì)粒,所述重組陰性質(zhì)粒的核苷酸序列為序列表SEQ ID No.1,所述重組陽(yáng)性質(zhì)粒的核苷酸序列為序列表中SEQ ID No.2。

      本發(fā)明的第二個(gè)目的是提供一種檢測(cè)JAG2基因SNP位點(diǎn)rs2238286基因型的方法,步驟如下:

      (1)構(gòu)建重組陰性質(zhì)粒和重組陽(yáng)性質(zhì)粒:所述重組陰性質(zhì)粒的核苷酸序列為序列表中SEQ ID No.1,所述重組陽(yáng)性質(zhì)粒的核苷酸序列參見(jiàn)序列表中SEQ ID No.2;

      (2)構(gòu)建PCR擴(kuò)增時(shí)的引物對(duì),所述引物對(duì)為a或b中的一種:

      a、上游引物:JAG2-F 5'- AGGAGCTAGGGGGAGAGAAGAC-3'

      下游引物:JAG2-R 5'- AGGGGTCACCTTGGTGGTTA-3';

      b、與a中的互補(bǔ)序列;

      (3)提取待測(cè)樣本的外周血基因組DNA,對(duì)重組陰性質(zhì)粒、重組陽(yáng)性質(zhì)粒和待測(cè)樣本的DNA均使用步驟(2)所述引物,且在同一條件下進(jìn)行PCR擴(kuò)增和HRM分析,收集數(shù)據(jù);

      作為優(yōu)選,所述HRM分析的條件為:94℃ 90s;60℃ 30s;83-94℃收集數(shù)據(jù),溫度上升速率為0.06℃/s;

      (4)根據(jù)收集數(shù)據(jù)繪制高分辨率熔解曲線(xiàn),根據(jù)重組陰性質(zhì)粒、重組陽(yáng)性質(zhì)粒的熔解曲線(xiàn)判斷待測(cè)樣本JAG2基因SNP位點(diǎn)rs2238286的基因型:

      與重組陰性質(zhì)粒的熔解曲線(xiàn)重合則JAG2基因SNP位點(diǎn)rs2238286的基因型為AA;

      與重組陽(yáng)性質(zhì)粒的熔解曲線(xiàn)重合則JAG2基因SNP位點(diǎn)rs2238286的基因型為GG;

      在重組陰性質(zhì)粒和重組陽(yáng)性質(zhì)粒之間的則JAG2基因SNP位點(diǎn)rs2238286的基因型為AG。

      作為優(yōu)選,所述PCR擴(kuò)增時(shí)的反應(yīng)體系為:

      Green-2-Go qPCRMastermix(含EvaGreen) 5μl

      引物F(10μM) 0.1μl

      引物R(10μM) 0.1μl

      模板(50ng/μl) 0.5μl

      ddH2O 4.3μl

      總體積 10μl。

      作為優(yōu)選,所述PCR擴(kuò)增時(shí)的反應(yīng)條件為:94℃預(yù)變性3min;94℃變性10s;60℃退火/延伸20s;40個(gè)循環(huán)。

      本發(fā)明的第三個(gè)目的是提供上述試劑盒的使用方法,步驟如下:

      (1)提取待測(cè)樣本的外周血基因組DNA,對(duì)重組陰性質(zhì)粒、重組陽(yáng)性質(zhì)粒和待測(cè)樣本的DNA均使用相同引物,且在同一條件下進(jìn)行PCR擴(kuò)增和HRM分析,收集數(shù)據(jù);

      所述HRM分析的條件為:94℃ 90s;60℃ 30s;83-94℃收集數(shù)據(jù),溫度上升速率為0.06℃/s;

      (2)根據(jù)收集數(shù)據(jù)繪制高分辨率熔解曲線(xiàn),根據(jù)重組陰性質(zhì)粒、重組陽(yáng)性質(zhì)粒的熔解曲線(xiàn)判斷待測(cè)樣本JAG2基因SNP位點(diǎn)rs2238286的基因型:

      與重組陰性質(zhì)粒的熔解曲線(xiàn)重合則JAG2基因SNP位點(diǎn)rs2238286的基因型為AA;

      與重組陽(yáng)性質(zhì)粒的熔解曲線(xiàn)重合則JAG2基因SNP位點(diǎn)rs2238286的基因型為GG;

      在重組陰性質(zhì)粒和重組陽(yáng)性質(zhì)粒之間的則JAG2基因SNP位點(diǎn)rs2238286的基因型為AG。

      本發(fā)明的第四個(gè)目的是提供上述試劑盒在制備輔助診斷非綜合征唇腭裂的試劑中應(yīng)用。

      本發(fā)明的試劑盒能夠準(zhǔn)確檢測(cè)JAG2基因SNP位點(diǎn)rs2238286的基因型,靈敏度高,特異性好,檢測(cè)迅速;應(yīng)用本發(fā)明的方法對(duì)JAG2基因SNP位點(diǎn)rs2238286基因型的分型與測(cè)序結(jié)果完全一致,能夠用于非綜合征唇腭裂的易患性分析。

      附圖說(shuō)明

      附圖用來(lái)提供對(duì)本發(fā)明的進(jìn)一步理解,并且構(gòu)成說(shuō)明書(shū)的一部分,與本發(fā)明的實(shí)施例一起用于解釋本發(fā)明,并不構(gòu)成對(duì)本發(fā)明的限制。在附圖中:

      圖1為本發(fā)明的HRM方法靈敏度實(shí)驗(yàn)結(jié)果;

      圖2為樣本用本發(fā)明的HRM方法分析結(jié)果;

      圖3為樣本的JAG2 rs2238286(n.66+11354A>G)位點(diǎn)的測(cè)序結(jié)果;其中a代表野生型序列,b代表純合突變型序列,c為雜合突變序列。

      具體實(shí)施方式

      以下的實(shí)施例便于更好地理解本發(fā)明,但并不限定本發(fā)明。下述實(shí)施例中的實(shí)驗(yàn)方法,如無(wú)特殊說(shuō)明,均為常規(guī)方法。下述實(shí)施例中所用的試驗(yàn)材料,如無(wú)特殊說(shuō)明,均為市售。本申請(qǐng)所用引物和所用序列合成及測(cè)序工作均由生工生物工程(上海)股份有限公司完成。

      實(shí)施例1 JAG2 rs2238286標(biāo)準(zhǔn)品的制備

      要建立HRM分析方法,首先必須制備方法所需的外部標(biāo)準(zhǔn)品,標(biāo)準(zhǔn)品應(yīng)包含高度保守和特異性的序列,要保證反應(yīng)的高特異性。本發(fā)明合成包含JAG2 rs2238286(n.66+11354A>G)位點(diǎn)的野生型和純合突變型DNA序列,利用基因重組技術(shù)將其克隆到pMD18-T載體中,構(gòu)建出重組質(zhì)粒pMD18-T-rs2238286的野生型和純合突變型,并進(jìn)行相應(yīng)的PCR鑒定和測(cè)序鑒定,最后經(jīng)定量后作為待建立方法的標(biāo)準(zhǔn)品,野生型重組質(zhì)粒為重組陰性質(zhì)粒,純合突變型重組質(zhì)粒為重組陽(yáng)性質(zhì)粒,為下一步的方法及評(píng)估奠定基礎(chǔ)。

      一、pMD18-T-rs2238286重組陰性質(zhì)粒和重組陽(yáng)性質(zhì)粒的構(gòu)建和轉(zhuǎn)化

      1.合成JAG2 rs2238286(n.66+11354A>G)野生型和純合突變型DNA序列,本發(fā)明合成的序列長(zhǎng)250bp,序列如下:

      (1)野生型序列

      ACCCAGCTCCGGGCACAGGGCAAATTTGCGAGAGGAGCTAGGGGGAGAGAAGACAGCTCAGTTATCATGGGGATGGGTTGAGGACCCCTCTGGACCATATGGGGATCTTTAACCACCAAGGTGACCCCTAGCTCTGGAAAGGACCGTGCTCACTGGAGGAGAGGAAGGTGCCATTGGTTTTGACCCTGTGGAGGAGCTGCGAGGTCACCCAGGGAGAGGGCAAGGAGGTGACCGCAGAGGATGGGGTGTG

      (2)純合突變型序列

      ACCCAGCTCCGGGCACAGGGCAAATTTGCGAGAGGAGCTAGGGGGAGAGAAGACAGCTCAGTTATCATGGGGATGGGTTGAGGACCCCTCTGGACCATGTGGGGATCTTTAACCACCAAGGTGACCCCTAGCTCTGGAAAGGACCGTGCTCACTGGAGGAGAGGAAGGTGCCATTGGTTTTGACCCTGTGGAGGAGCTGCGAGGTCACCCAGGGAGAGGGCAAGGAGGTGACCGCAGAGGATGGGGTGTG

      其中標(biāo)有下劃線(xiàn)的堿基為基因突變位點(diǎn)。

      2.連接反應(yīng):將上述合成的DNA片段與pMD18-T進(jìn)行連接,采用如下連接體系進(jìn)行配制:

      pMD18-T 1μL

      DNA 2μL

      SolutionI 5μL

      ddH2O 2μL

      總體積 10μL。

      配制完成后置于16℃進(jìn)行過(guò)夜連接反應(yīng)。

      3. pMD18-T-rs2238286質(zhì)粒的轉(zhuǎn)化以及PCR鑒定

      (1)從-80℃的超低溫冰箱中取出凍存的DH5α感受態(tài)細(xì)胞,置于冰盒上使其解凍;

      (2)取步驟2得到的連接產(chǎn)物10μL加入50μL的DH5α感受態(tài)細(xì)胞中,輕輕搖勻后置冰浴30分鐘;

      (3)42℃水浴熱激90秒,熱激后立即置冰上冷卻2min;

      (4)于1.5ml EP管中加入預(yù)冷的1ml的不含抗性的LB液體培養(yǎng)基吹打混勻后,37℃ 120轉(zhuǎn)/分輕搖培養(yǎng)90min;

      (5)將上述培養(yǎng)液短暫離心吸去900μl后取剩余的100μl涂布于含Amp抗生素的LB平板上,正面向上放置30min,待菌液完全被培養(yǎng)基吸收后,倒置培養(yǎng)皿37℃恒溫箱培養(yǎng)過(guò)夜;

      (6)從平板上挑取單克隆菌落于500μL Amp抗性L(fǎng)B液體培養(yǎng)基的1.5ml EP管中,37℃ 220rpm振蕩培養(yǎng)5-6小時(shí);

      (7)取1μL作為模板進(jìn)行菌液PCR鑒定。將鑒定為陽(yáng)性的菌液加入到20ml的LB液體培養(yǎng)基中進(jìn)行擴(kuò)搖;

      (8)用引物JAG2-F和JAG2-R擴(kuò)增上述稀釋菌液,PCR產(chǎn)物采用2%瓊脂糖凝膠電泳,通過(guò)檢測(cè)PCR產(chǎn)物鑒定陽(yáng)性轉(zhuǎn)化子。

      引物序列為HRM分析所用引物,序列如下:

      上游引物:JAG2-F 5'- AGGAGCTAGGGGGAGAGAAGAC-3'

      下游引物:JAG2-R 5'- AGGGGTCACCTTGGTGGTTA-3'

      體系如下:

      10×PCR buffer 2μL

      dNTP(2.5μM) 2μL

      引物F(5μM) 1.5μL

      引物R(5μM) 1.5μL

      模板 2μL

      Taq酶(5U) 0.5μL

      ddH2O 10.5μL

      總體積 20μL。

      擴(kuò)增程序/反應(yīng)條件:94℃預(yù)變性5min;94℃ 30s、60℃ 30s、72℃ 30sec,35個(gè)循環(huán);72℃ 10min。

      提取重組陰性質(zhì)粒和重組陽(yáng)性質(zhì)粒采用北京百泰克公司生產(chǎn)的質(zhì)粒制備試劑盒提取重組質(zhì)粒,測(cè)定濃度和純度,同時(shí)吸取一部分純化質(zhì)粒送至上海生物工程有限公司進(jìn)行測(cè)序,確定插入片段的基因序列與目的序列一致。

      二、標(biāo)準(zhǔn)品的獲取和定量

      (1)將步驟一得到的凍存的含有重組質(zhì)粒pMD18-T-rs2238286的大腸桿菌DH5a 100μl接種于15ml氨芐抗性的LB液體培養(yǎng)基中,37℃ 220rpm培養(yǎng)14-16h;

      (2)采用北京百泰克生物科技有限公司生產(chǎn)的質(zhì)粒制備試劑盒提取重組質(zhì)粒;

      (3)利用北京百泰克生物科技有限公司的超微量紫外可見(jiàn)分光光度計(jì)(ND5000)對(duì)提取的質(zhì)粒測(cè)定濃度,根據(jù)A260/A280判斷質(zhì)粒的純度。A260/A280=1.78。

      實(shí)施例2 HRM-PCR檢測(cè)JAG2 rs2238286方法的建立

      一、待測(cè)樣本DNA的制備

      提取30例樣本的外周血基因組DNA,用作JAG2基因PCR擴(kuò)增的模板。具體提取方法如下:

      (1)取1ml全血,加入3ml TE,顛倒混勻后靜置10min,8000rpm離心5分鐘,棄上清液;

      (2)重復(fù)上述步驟2-3次至沉淀為白色;

      (3)加入900μl 10%SDS和10μl 10mg/ml蛋白酶K,55℃水浴1h;

      (4)將離心管冷卻至室溫,加入等體積的酚/氯仿/異戊醇(25:24:1)混勻,12000rpm離心10min;

      (5)小心吸取上清后再加入等體積的酚/氯仿/異戊醇(25:24:1)混勻,12000rpm離心10min;

      (6)取上清,加入兩倍體積的無(wú)水乙醇,上下顛倒混勻,12000rpm離心10min,棄上清;

      (7)加500μl 70%的乙醇洗滌沉淀,短暫離心后棄上清,開(kāi)蓋干燥至乙醇完全揮發(fā);

      (8)加50μl雙蒸水或TE溶解DNA中,-20℃保存。

      二、特異性引物的設(shè)計(jì)與合成

      本發(fā)明通過(guò)對(duì)NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中JAG2rs2238286基因序列進(jìn)行檢索,選取適合設(shè)計(jì)引物的片段序列為靶目標(biāo),設(shè)計(jì)了一組HRM-PCR引物。

      本發(fā)明選取的擴(kuò)增序列如下:

      其中標(biāo)有下劃線(xiàn)的堿基為基因突變位點(diǎn)。

      設(shè)計(jì)的引物序列如下:

      上游引物:JAG2-F 5'- AGGAGCTAGGGGGAGAGAAGAC-3'

      下游引物:JAG2-R 5'- AGGGGTCACCTTGGTGGTTA-3'

      擴(kuò)增片段大小為:97bp。擴(kuò)增的核苷酸序列為:

      三、HRM-PCR反應(yīng)體系和反應(yīng)條件

      分別以待測(cè)樣本DNA、重組陰性質(zhì)粒和重組陽(yáng)性質(zhì)粒為模板,以上述引物JAG2-F和JAG2-R為擴(kuò)增引物,采用下述體系和反應(yīng)條件進(jìn)行PCR擴(kuò)增和HRM分析。

      PCR體系:

      Green-2-Go qPCRMastermix(含EvaGreen) 5μl

      引物F(10μM) 0.1μl

      引物R(10μM) 0.1μl

      模板(50ng/μl) 0.5μl

      ddH2O 4.3μl

      總體積 10μl。

      其中引物采用JAG2-F和JAG2-R,HRM-PCR采用生工生物(上海),Green-2-Go qPCRMastermix試劑盒。HRM分析儀為百源基因ASA-9600實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀。

      PCR擴(kuò)增程序:

      94℃預(yù)變性3min;94℃變性10s;60℃退火/延伸20s;40個(gè)循環(huán);

      HRM分析:

      94℃ 90s

      60℃ 30sec

      83-94℃收集數(shù)據(jù),溫度上升速率為0.06℃/s。

      四、結(jié)果分析

      根據(jù)收集數(shù)據(jù)繪制高分辨率熔解曲線(xiàn),根據(jù)重組陰性質(zhì)粒、重組陽(yáng)性質(zhì)粒的熔解曲線(xiàn)判斷待測(cè)樣本JAG2基因SNP位點(diǎn)rs2238286的基因型:

      與重組陰性質(zhì)粒的熔解曲線(xiàn)重合則JAG2基因SNP位點(diǎn)rs2238286的基因型為AA;

      與重組陽(yáng)性質(zhì)粒的熔解曲線(xiàn)重合則JAG2基因SNP位點(diǎn)rs2238286的基因型為GG;

      在重組陰性質(zhì)粒和重組陽(yáng)性質(zhì)粒之間的則JAG2基因SNP位點(diǎn)rs2238286的基因型為AG。

      五、靈敏度實(shí)驗(yàn)

      將重組陽(yáng)性質(zhì)粒和重組陰性質(zhì)粒均稀釋至50ng/μl后,將二者混合進(jìn)行梯度稀釋?zhuān)亟M陽(yáng)性質(zhì)粒比例依次為50%、25%、12.5%、5%、2%和1%,按照上述HRM-PCR反應(yīng)體系和參數(shù)進(jìn)行擴(kuò)增,分析突變檢出范圍,即靈敏度。

      反應(yīng)體系如下:

      Green-2-Go qPCRMastermix(含EvaGreen) 5μl

      引物F(10μM) 0.1μl

      引物R(10μM) 0.1μl

      模板(50ng/μl) 0.5μl

      ddH2O 4.3μl

      總體積 10μl。

      PCR擴(kuò)增程序:

      94℃預(yù)變性3min;94℃變性10s;60℃退火/延伸20s

      HRM分析:

      94℃ 90s

      60℃ 30sec

      83-94℃收集數(shù)據(jù),溫度上升速率為0.06℃/s。

      結(jié)果參見(jiàn)圖1,實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)顯示,當(dāng)重組陽(yáng)性質(zhì)粒與重組陰性質(zhì)粒體積比分別為1:1、1:3、1:7、1:19、1:49、1:99時(shí),均能檢測(cè)出重組陽(yáng)性質(zhì)粒,所以本發(fā)明的HRM檢測(cè)方法的靈敏度為1%。

      實(shí)施例3 應(yīng)用本發(fā)明的檢測(cè)試劑盒檢測(cè)樣本基因突變

      以實(shí)施例2步驟中的檢測(cè)試劑盒和檢測(cè)方法,對(duì)30例樣本進(jìn)行HRM分析,與重組陽(yáng)性質(zhì)粒和重組陰性質(zhì)粒的熔解曲線(xiàn)對(duì)照比較,依此確定樣本中的突變類(lèi)型,并根據(jù)HRM分析結(jié)果針對(duì)每種基因型隨機(jī)挑選1個(gè)樣本在生工生物(上海)進(jìn)行Sanger測(cè)序驗(yàn)證。

      HRM分析結(jié)果參見(jiàn)表1和圖2,數(shù)據(jù)顯示30例樣本中JAG2基因SNP位點(diǎn)rs2238286野生型有21例,A>G雜合突變型有6例,A>G純合突變型3例。

      Sanger測(cè)序結(jié)果參見(jiàn)圖3:其中a為樣本編號(hào)5的測(cè)序結(jié)果,b為樣本編號(hào)9的測(cè)序結(jié)果,c為樣本編號(hào)20的測(cè)序結(jié)果;與本發(fā)明方法檢測(cè)的結(jié)果完全一致。

      表1應(yīng)用本發(fā)明的方法對(duì)樣本的分析結(jié)果

      實(shí)施例4 用于檢測(cè)JAG2基因SNP位點(diǎn)rs2238286基因型的試劑盒

      本發(fā)明的用于檢測(cè)JAG2基因SNP位點(diǎn)rs2238286基因型的試劑盒包括以下組分:

      (1)JAG2 rs2238286標(biāo)準(zhǔn)品:重組陰性質(zhì)粒和重組陽(yáng)性質(zhì)粒,按照實(shí)施例1中的方法制備;

      (2)引物:該引物序列為:

      上游引物:JAG2-F 5'- AGGAGCTAGGGGGAGAGAAGAC-3'

      下游引物:JAG2-R 5'- AGGGGTCACCTTGGTGGTTA-3'

      (3)含有飽和熒光染料Eva Green的PCR擴(kuò)增試劑。

      應(yīng)用該試劑盒檢測(cè)JAG2基因SNP位點(diǎn)rs2238286基因型的方法與實(shí)施例2相同。

      最后應(yīng)說(shuō)明的是:以上所述僅為本發(fā)明的優(yōu)選實(shí)施例而已,并不用于限制本發(fā)明,盡管參照前述實(shí)施例對(duì)本發(fā)明進(jìn)行了詳細(xì)的說(shuō)明,對(duì)于本領(lǐng)域的技術(shù)人員來(lái)說(shuō),其依然可以對(duì)前述各實(shí)施例所記載的技術(shù)方案進(jìn)行修改,或者對(duì)其中部分技術(shù)特征進(jìn)行等同替換。凡在本發(fā)明的精神和原則之內(nèi),所作的任何修改、等同替換、改進(jìn)等,均應(yīng)包含在本發(fā)明的保護(hù)范圍之內(nèi)。

      序列表

      <110> 蘇州百源基因技術(shù)有限公司

      <120> 用于檢測(cè)JAG2基因SNP位點(diǎn)rs2238286基因型的試劑盒

      <170> PatentIn version 3.5

      <210> 1

      <211> 250

      <212> DNA

      <213> 人工序列

      <400> 1

      acccagctcc gggcacaggg caaatttgcg agaggagcta gggggagaga agacagctca 60

      gttatcatgg ggatgggttg aggacccctc tggaccatat ggggatcttt aaccaccaag 120

      gtgaccccta gctctggaaa ggaccgtgct cactggagga gaggaaggtg ccattggttt 180

      tgaccctgtg gaggagctgc gaggtcaccc agggagaggg caaggaggtg accgcagagg 240

      atggggtgtg 250

      <210> 2

      <211> 250

      <212> DNA

      <213> 人工序列

      <400> 2

      acccagctcc gggcacaggg caaatttgcg agaggagcta gggggagaga agacagctca 60

      gttatcatgg ggatgggttg aggacccctc tggaccatgt ggggatcttt aaccaccaag 120

      gtgaccccta gctctggaaa ggaccgtgct cactggagga gaggaaggtg ccattggttt 180

      tgaccctgtg gaggagctgc gaggtcaccc agggagaggg caaggaggtg accgcagagg 240

      atggggtgtg 250

      <210> 3

      <211> 200

      <212> DNA

      <213> 人工序列

      <400> 3

      gctccgggca cagggcaaat ttgcgagagg agctaggggg agagaagaca gctcagttat 60

      catggggatg ggttgaggac ccctctggac catatgggga tctttaacca ccaaggtgac 120

      ccctagctct ggaaaggacc gtgctcactg gaggagagga aggtgccatt ggttttgacc 180

      ctgtggagga gctgcgaggt 200

      <210> 4

      <211> 97

      <212> DNA

      <213> 人工序列

      <400> 4

      aggagctagg gggagagaag acagctcagt tatcatgggg atgggttgag gacccctctg 60

      gaccatatgg ggatctttaa ccaccaaggt gacccct 97

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