本發(fā)明屬于海洋微生物篩選技術(shù)領(lǐng)域,具體涉及一種高產(chǎn)巖藻多糖酶的海洋交替假單胞菌及其應(yīng)用。
背景技術(shù):
巖藻多糖硫酸酯(Fucoidan)是褐藻細(xì)胞壁含有的一種水溶性多糖,主要由L-巖藻糖和不同硫酸酯化的L-巖藻糖組成。此外,還含有一定量的D-半乳糖、D-甘露糖、D-葡萄糖醛酸,少量的D-木糖和L-阿拉伯糖,是一種化學(xué)組成和結(jié)構(gòu)都十分復(fù)雜的高分子量的酸性多糖化合物。研究發(fā)現(xiàn),該類多糖具有抗氧化、降血脂、抗凝血、抗病毒、抗腫瘤、增強(qiáng)機(jī)體免疫力等各種生物學(xué)活性,且其生理活性與多糖分子量、硫酸根的含量及其取代位置有重要關(guān)系。因此,要深入研究該類多糖的構(gòu)效關(guān)系,就需要對(duì)多聚糖進(jìn)行降解,而該類多糖的定向降解有賴于特定降解酶的獲得。利用該多糖降解酶獲得系列寡糖,并從寡糖結(jié)構(gòu)層面闡明其作用靶點(diǎn),這是創(chuàng)新藥物及系列功能寡糖制品開(kāi)發(fā)的重要途徑。
為了實(shí)現(xiàn)上述目標(biāo),巖藻多糖降解酶的獲得至關(guān)重要。但由于該類酶存在活力較低等問(wèn)題,該酶的商業(yè)化生產(chǎn)始終沒(méi)有實(shí)現(xiàn),因此篩選高活力產(chǎn)酶微生物菌株仍是一個(gè)重要的課題。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:
本發(fā)明的目的在于提供一株高產(chǎn)巖藻多糖降解酶菌株,從而推動(dòng)了巖藻寡糖的制備及應(yīng)用,以彌補(bǔ)現(xiàn)有技術(shù)的不足。
本發(fā)明的第一個(gè)目的在于提供一株產(chǎn)巖藻多糖酶的交替假單胞菌(Pseudoalteromonas sp.)OU03株,該微生物菌株保存在位于北京市海淀區(qū)北辰西路1號(hào)院3號(hào)的中國(guó)微生物菌種保藏管理委員會(huì)普通微生物中心,保藏編號(hào)為CGMCC No.13477,保藏日期為2016年12月22日。
本發(fā)明的微生物菌株用于生產(chǎn)巖藻多糖降解酶;
本發(fā)明還提供了一種用于誘導(dǎo)上述海洋微生物表達(dá)產(chǎn)生巖藻多糖降解酶的培養(yǎng)基,培養(yǎng)基的基本碳源為巖藻多糖硫酸酯;該菌株誘導(dǎo)產(chǎn)生的大部分酶活都集中在胞內(nèi),有利于后續(xù)活性酶的富集。
作為實(shí)施例的具體記載,所述的培養(yǎng)基的配方如下:巖藻多糖硫酸酯2g/L,蛋白胨1g/L,用海水配制后調(diào)節(jié)pH為7.6-7.8。
本發(fā)明另一個(gè)方面是提供一種制備巖藻多糖降解酶的方法,是使用篩選的菌株進(jìn)行發(fā)酵制備巖藻多糖降解酶。
本發(fā)明篩選的菌株所產(chǎn)生的巖藻多糖降解酶可以降解巖藻多糖硫酸酯,產(chǎn)生具有潛在生物學(xué)活性的寡聚巖藻糖硫酸酯。該微生物具有發(fā)酵周期短,酶活性高,且多數(shù)活性為胞內(nèi)酶活,有利于后續(xù)樣品的收集及保存,為其工業(yè)化應(yīng)用奠定了基礎(chǔ)。
附圖說(shuō)明
圖1:OU03菌的生長(zhǎng)曲線圖,
圖2:誘導(dǎo)后OU03不同部位巖藻多糖酶降解活性圖(DNS法),
圖3:誘導(dǎo)培養(yǎng)OU03產(chǎn)生的巖藻多糖酶的C-PAGE分析圖,其中A為胞內(nèi)酶;B為發(fā)酵液。
具體實(shí)施方式
本發(fā)明從海洋無(wú)脊椎動(dòng)物消化腺來(lái)源的共生微生物中篩選獲得了一株高產(chǎn)專一性的巖藻多糖酶的菌株,且多數(shù)活性為胞內(nèi)酶活,有利于后續(xù)利用該菌株所產(chǎn)的酶進(jìn)行規(guī)?;苽鋷r藻寡糖硫酸酯。
下面結(jié)合實(shí)施例對(duì)本發(fā)明進(jìn)行詳細(xì)的描述
實(shí)施例1:微生物的篩選及鑒定
1、微生物的篩選
在無(wú)菌條件下對(duì)活扇貝、海膽及鮑魚(yú)進(jìn)行解剖,分離出它們的消化腺,在提取的海洋生物消化腺以及爛海帶中加入無(wú)菌生理鹽水,浸提后獲得扇貝、海膽、鮑魚(yú)消化腺以及爛海帶的組織懸濁液。分別取組織懸濁液1-2mL接入巖藻多糖硫酸酯液體選擇培養(yǎng)基A中,并于25℃、150rpm振蕩培養(yǎng)箱中進(jìn)行培養(yǎng)。24h后對(duì)各菌株的產(chǎn)巖藻多糖酶活性進(jìn)行測(cè)定,選擇有酶活性的菌液100-200μL涂布到巖藻多糖硫酸酯固體選擇培養(yǎng)基B上。將培養(yǎng)板置于25℃培養(yǎng)箱中進(jìn)行培養(yǎng)。從平板上挑取生長(zhǎng)狀態(tài)良好的菌落接種于巖藻多糖硫酸酯液體選擇培養(yǎng)基D中,于搖床中振蕩培養(yǎng)。24h后對(duì)各菌株的產(chǎn)巖藻多糖酶活性進(jìn)行測(cè)定,選擇酶活性高的菌株進(jìn)行后續(xù)篩選。
培養(yǎng)基配方如下:
液體選擇培養(yǎng)基A:巖藻多糖2g/L,蛋白胨1g/L,過(guò)膜海水配置,pH 7.6-7.8。
固體選擇培養(yǎng)基B:在液體培養(yǎng)基D的基礎(chǔ)上,補(bǔ)加瓊脂。液體發(fā)酵培養(yǎng)基:巖藻多糖1g/L,蛋白胨5g/L,酵母粉2g/L,K2HPO4 0.2g/L,MgSO4 0.05g/L,過(guò)膜海水配置,pH 7.6-7.8。
對(duì)酶活性高的菌株的降解巖藻多糖硫酸酯的產(chǎn)物進(jìn)行分析,最終篩選出產(chǎn)巖藻多糖酶活性最高,酶解產(chǎn)物單一性高的菌株。
該微生物保存在中國(guó)微生物菌種保藏管理委員會(huì)普通微生物中心,保藏編號(hào)為CGMCC No.13477,保藏日期為2016年12月22日。
2、菌株OU03的16S rRNA基因的擴(kuò)增、序列測(cè)定及分析
采用細(xì)菌基因組提取試劑盒(Tiangen)提取已篩選到的高活性菌株的基因組,以此為模板,擴(kuò)增該菌株的16S rRNA基因。采用以下引物:
27F:5’-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3’
1492R:5’-GGTTACCTTGTTACGACTT-3’
PCR反應(yīng)按照以下條件進(jìn)行:95℃預(yù)變性3min;95℃變性30s,50℃退火30s,68℃延伸90s共進(jìn)行35個(gè)循環(huán),之后68℃延伸10min。獲得的RCR產(chǎn)物經(jīng)膠回收試劑盒(Omega)純化后,與pMD19-T載體(Takara)連接,轉(zhuǎn)化E.coli Top 10感受態(tài)細(xì)胞,挑取陽(yáng)性克隆進(jìn)行DNA測(cè)序。
菌株16S rRNA的進(jìn)化樹(shù)分析顯示其與Pseudoalteromonassp的親緣關(guān)系最近。
實(shí)施例2:微生物的發(fā)酵產(chǎn)酶
1、發(fā)酵培養(yǎng)
將篩選得到的高活性菌株進(jìn)行發(fā)酵培養(yǎng),獲得該微生物在巖藻多糖硫酸酯培養(yǎng)基中的生長(zhǎng)曲線。
按1-3%的接種量,將種子液接入巖藻多糖硫酸酯液體發(fā)酵培養(yǎng)基中,25-37℃,150rpm搖床中培養(yǎng),在不同時(shí)間收集發(fā)酵液,以未接菌的培養(yǎng)基作為空白對(duì)照,測(cè)定菌液600nm處吸光值,繪制該菌的生長(zhǎng)曲線(圖1)。結(jié)果發(fā)現(xiàn)該菌在巖藻多糖硫酸酯培養(yǎng)基中,大約在18-24小時(shí)內(nèi)達(dá)到生長(zhǎng)的平臺(tái)期,此時(shí)OD600=5.3左右。這作為將來(lái)菌體收集的最佳時(shí)間。
2、不同部位酶的提取及活性測(cè)定(以下操作均在4℃條件下進(jìn)行)
①胞外酶:將發(fā)酵液在20,000g條件下離心30min。將離心后的上清透析到50mMTris-HClpH7.5,200mMNaCl緩沖液中。
②胞內(nèi)酶:上一步中發(fā)酵液離心后的菌體用50mMTris-HClpH7.5,200mMNaCl緩沖液重懸,之后進(jìn)行超聲破碎(超聲3s,間隔5s,總時(shí)間15min),超聲破碎后的液體在20,000g條件下離心20min,收集離心后的上清即為提取的胞內(nèi)酶。
采用DNS檢測(cè)還原糖的方法對(duì)提取的酶組份進(jìn)行活性測(cè)定。分別以葡萄糖和巖藻多糖硫酸酯為碳源誘導(dǎo)OU03菌株產(chǎn)酶,將提取的胞內(nèi)酶和胞外酶(發(fā)酵液凍干粉)各100μL分別加入200μL 0.2%的巖藻多糖硫酸酯溶液中,25℃反應(yīng)12h左右,酶解反應(yīng)的緩沖液為50mMTris-HCl pH7.5 200mMNaCl。反應(yīng)結(jié)束后,取200μL反應(yīng)液加入等體積DNS,100℃加熱5min顯色,12000rpm離心5min,取上清200μL檢測(cè)520nm處的吸光值,結(jié)果如圖2所示。測(cè)定結(jié)果表明,該菌的巖藻多糖酶是由巖藻多糖硫酸酯的誘導(dǎo)產(chǎn)生的,且?guī)r藻多糖酶多位于細(xì)胞內(nèi)。
3、酶解產(chǎn)物的電泳分析
用提取的胞內(nèi)和胞外的粗酶對(duì)巖藻多糖硫酸酯進(jìn)行降解,以加入同體積滅活酶作為對(duì)照,反應(yīng)結(jié)束后采用PAGE法對(duì)降解產(chǎn)物進(jìn)行分析。降解后樣品和上樣緩沖液(10%蔗糖,0.01%酚紅)混合,選用6%濃縮膠和27%分離膠,電極緩沖液為50mMTris-HCl 2mM EDTA pH8.7,200V電泳2小時(shí),電泳結(jié)束后用阿利新藍(lán)染料結(jié)合銀染進(jìn)行染色。
結(jié)果如圖3所示,酶解產(chǎn)物在電泳圖中有明顯的條帶出現(xiàn),說(shuō)明有低聚糖產(chǎn)生,表明在該菌的細(xì)胞內(nèi)提取物中有明顯的巖藻多糖酶活性。
4、酶解產(chǎn)物的質(zhì)譜分析
酶解產(chǎn)物的制備
酶解反應(yīng)的緩沖液為50mMTris-HCl(pH7.5200mMNaCl),將提取的胞內(nèi)酶15mL和胞外酶20mL(發(fā)酵液凍干粉)分別加入35mL0.2%的巖藻多糖硫酸酯水溶液中,25℃反應(yīng)48h。反應(yīng)結(jié)束后,100℃加熱10min對(duì)酶進(jìn)行滅活,12000rpm室溫離心20min,收集上清液即為酶解產(chǎn)物。
酶解混合液經(jīng)過(guò)G10凝膠柱脫鹽,收集糖組分,洗脫液濃縮后冷凍干燥,用適量乙腈/水溶解后進(jìn)行質(zhì)譜分析。然后利用質(zhì)譜測(cè)試測(cè)定樣品分子量。測(cè)定結(jié)果證明酶解產(chǎn)物中含有分子量為324Da,550Da,696Da和776Da的組分,經(jīng)過(guò)計(jì)算后表明其對(duì)應(yīng)的分別是1個(gè)Fuc2S,2個(gè)Fuc3S,3個(gè)Fuc3S和3個(gè)Fuc4S,這進(jìn)一步證明了該微生物分泌的酶具有降解巖藻多糖硫酸酯的活性。