本發(fā)明涉及分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)中植物基因組DNA分離提取技術(shù),尤其涉及一種中藥植物葉片基因組DNA的提取方法。
背景技術(shù):
:基因組DNA提取是分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)中的重要環(huán)節(jié)之一?;蚪MDNA的質(zhì)量和產(chǎn)量,直接影響分子生物實(shí)驗(yàn)中與DNA有關(guān)的后續(xù)實(shí)驗(yàn)的進(jìn)行。中藥植物中含有大量的次生代謝產(chǎn)物,特別是淀粉、多酚和多糖等物質(zhì)嚴(yán)重影響了提取DNA的質(zhì)量。這類植物中的次生代謝產(chǎn)物種類復(fù)雜,而且不同物種間,甚至同一物種間不同季節(jié)的次生代謝產(chǎn)物的異質(zhì)性程度都很高。因此,一種中藥植物的基因組提取方法往往不能很好地應(yīng)用于另一種中藥基因組DNA的提取。技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:本發(fā)明的目的就在于克服現(xiàn)有技術(shù)存在的缺點(diǎn)和不足,針對(duì)中藥材植物的次生代謝產(chǎn)物,如淀粉、多酚和多糖等存在于細(xì)胞核外的細(xì)胞質(zhì)的特點(diǎn),提供一種中藥植物葉片基因組DNA的提取方法。本方法的目的是這樣實(shí)現(xiàn)的:先提取純凈無(wú)雜質(zhì)的細(xì)胞核,然后再提取基因組DNA。具體地說(shuō),本方法包括下列步驟:①將0.1-0.5克組織樣品放在冰冷細(xì)胞核提取緩沖液中,用鋒利的手術(shù)刀將組織切碎至極小的勻漿狀混合液;②將勻漿混合液用18-50μm孔徑的尼龍膜過(guò)濾到離心管中;③6000-15000rpm高速離心10-100秒,去除上清液,沉淀物為細(xì)胞核,再次加入冰冷細(xì)胞核提取緩沖液重懸沉淀;④重復(fù)步驟③1-5次;⑤將清洗干凈的細(xì)胞核重懸于3mL細(xì)胞核裂解液中,振蕩至勻,加入25μL20mg/mL蛋白酶K,振蕩至勻,加入300μL20%SDS(sodiumdodecylsulfate,sodiumsalt,十二烷基硫酸鈉),搖勻,至出現(xiàn)粘稠狀,37℃消化過(guò)夜;⑥加入6mL飽和酚于15mL離心管中,將過(guò)夜的消化液加入此離心管,輕搖混勻,4℃,3000rpm離心10分鐘;⑦加等體積酚/氯仿各3mL至另一15mL離心管,小心移取步驟⑥的上清至此離心管,混勻,4℃,3000rpm離心10分鐘;⑧加6mL氯仿于15mL離心管中,小心移取步驟⑦的上清至此離心管,混勻,4℃,3000rpm離心10分鐘;⑨加10mL無(wú)水乙醇于另一15mL離心管,小心移取步驟⑧的上清至此離心管,混勻,見(jiàn)白色絮狀DNA;⑩13000rpm離心3分鐘后,去上清,用500μL70%乙醇清洗,13000rpm離心5分鐘,再室溫干燥DNA沉淀5分鐘,將DNA溶解即可;所述的的細(xì)胞核提取緩沖液:0.01MMgSO4,0.005MKCl,0.0005MHEPES,1mg/mLdithiothreitol,0.25%TritonX-100;所述的細(xì)胞核裂解液:2MTris-HCl,pH8.2,0.5mL;4MNaCl10mL;2mMEDTA0.4mL;加dH2O至100mL高壓滅菌,4℃保存。2、中藥植物葉片基因組DNA的鑒定本方法提取的基因組DNA樣品,經(jīng)0.8%的瓊脂糖凝膠電泳和Nanodrop檢測(cè)其濃度和質(zhì)量。工作機(jī)理:中藥植物葉片中富含大量的次生代謝產(chǎn)物如淀粉、多酚和多糖等,而且這些次生代謝產(chǎn)物是存在于細(xì)胞核外的細(xì)胞質(zhì)中,首先用刀切的方法從細(xì)胞壁中釋放出細(xì)胞核,然后洗脫出次生代謝產(chǎn)物,得到純凈的細(xì)胞核,最后從細(xì)胞核中提取基因組DNA。本發(fā)明的優(yōu)點(diǎn)和積極效果。①用刀切的方法從細(xì)胞壁中釋放出的細(xì)胞核,然后洗脫出次生代謝產(chǎn)物,得到純凈的細(xì)胞核,最后從細(xì)胞核中提取基因組DNA;②刀切的方法提取細(xì)胞核可以不使用液氮;③反復(fù)的洗脫細(xì)胞質(zhì)中的雜質(zhì),可以有效得到純凈細(xì)胞核;④能從長(zhǎng)期低溫(-70℃)存儲(chǔ)的樣品和新鮮葉片中都得到樣品;⑤適用于所有中藥植物葉片DNA的提取。附圖說(shuō)明圖1是兩個(gè)燈盞花樣品經(jīng)0.8%的瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)到的電泳條帶圖片,左:-70℃燈盞花樣品;中:新鮮燈盞花樣品;右:DNAmarker。具體實(shí)施方式:下面結(jié)合附圖和實(shí)施例詳細(xì)說(shuō)明:以下實(shí)施例用于說(shuō)明本發(fā)明,但不用來(lái)限制本發(fā)明的范圍。若未特別指明,實(shí)施例中所用技術(shù)手段為本領(lǐng)域技術(shù)人員所熟知的常規(guī)手段,所用原料均為市售商品。實(shí)施例11、提取方法選取-70℃存儲(chǔ)一年和新鮮的燈盞花葉片各0.3克;1)將0.3克樣品分別放在冰冷細(xì)胞核提取緩沖液中,用鋒利的手術(shù)刀將組織切碎至極小的勻漿狀混合液;2)將勻漿混合液用18-50μm孔徑的尼龍膜過(guò)濾到離心管中;3)6000-15000rpm高速離心10-100秒,去除上清液,沉淀物為細(xì)胞核,再次加入冰冷細(xì)胞核提取緩沖液重懸沉淀。4)重復(fù)步驟3),1-5次;5)將清洗干凈的細(xì)胞核重懸于3mL細(xì)胞核裂解液中,振蕩至勻,加入25μL20mg/mL蛋白酶K,振蕩至勻,加入300μL20%SDS,搖勻,至出現(xiàn)粘稠裝,37℃消化過(guò)夜;6)加入6mL飽和酚于15mL離心管中,將過(guò)夜的消化液加入此離心管,輕搖混勻,4℃,3000rpm離心10分鐘;7)加等體積酚/氯仿(各3mL)至另一15mL離心管,小心移取步驟6)的上清至此離心管,混勻,4℃,3000rpm離心10分鐘;8)加6mL氯仿于15mL離心管中,小心移取步驟7)的上清至此離心管,混勻,4℃,3000rpm離心10分鐘;9)加10mL無(wú)水乙醇于另一15mL離心管,小心移取步驟8)的上清至此離心管,混勻,見(jiàn)白色絮狀DNA;10)13000rpm離心3分鐘后,去上清,用500μL70%乙醇清洗,13000rpm離心5分鐘。2、如圖1所示,兩個(gè)燈盞花樣品經(jīng)0.8%的瓊脂糖凝膠電泳均可檢測(cè)到清晰而且明亮的電泳條帶。3、Nanodrop檢測(cè)兩個(gè)燈盞花樣品的質(zhì)量見(jiàn)表格一。結(jié)果顯示,兩種樣品的DNA純度很高。表格一Nanodrop檢測(cè)DNA質(zhì)量A260/A280A260/A230-70℃樣品1.802.10新鮮樣品1.812.12當(dāng)前第1頁(yè)1 2 3