本發(fā)明涉及分子生物學(xué)技術(shù)領(lǐng)域,更具體地,涉及用于DNA技術(shù)領(lǐng)域,特別是指一種改進(jìn)的離心柱法外周血游離DNA提取試劑及其提取方法。
背景技術(shù):
眾所周知,遺傳物質(zhì)核酸大多位于細(xì)胞中,但不管是健康的人群還是患病人群,都有小部分DNA位于細(xì)胞外,稱為游離核酸(cell-free DNA)。外周血中也存在游離DNA,稱為外周血循環(huán)DNA(Circulating DNA in plasma)。
1987年的一篇論文中,研究人員對(duì)37例惡性腫瘤患者血漿進(jìn)行了研究,其中10例標(biāo)本中都分離出了游離DNA。初步鑒定的血漿游離DNA為雙鏈,大小范圍分布約為40bp-220bp。在隨后的研究中,他們通過一種自己開發(fā)的體外DNA合成試驗(yàn)(In vitro DNA Synthesis Test),對(duì)癌癥患者血漿中的DNA的特性有了基本的判斷,這種測(cè)試的基本原理是當(dāng)測(cè)試反應(yīng)中加入致癌劑時(shí),腫瘤源性的DNA鏈穩(wěn)定性會(huì)下降。到了90年代,研究人員在腫瘤患者血漿游離循環(huán)DNA上相繼檢測(cè)到了K-ras等基因的突變。
由于外周血游離核酸在外周血中含量稀少,上文中所述的研究人員采用的還是傳統(tǒng)的酚氯仿抽提技術(shù),所需要的外周血的量也比較大(需要采集50ml外周血),試驗(yàn)難度可想而知。因此,如何提高提取外周血中的游離核酸的效率,成為了市面上提取試劑盒遇到的一大難題。隨著科技的不斷進(jìn)步,市面上也陸續(xù)涌現(xiàn)了一些針對(duì)外周血游離核酸的提取試劑盒,可以較有效的提高核酸提取率,但都價(jià)格昂貴,成本較傳統(tǒng)的離心柱法而言,高出50-200倍,成本問題成為了很多實(shí)驗(yàn)室在處理外周血游離核酸時(shí)的制約因素,因此改進(jìn)傳統(tǒng)離心柱法,提高核酸提取效率已成為當(dāng)務(wù)之急。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:
本發(fā)明的主要目的就是針對(duì)以上現(xiàn)狀,解決限制傳統(tǒng)離心柱法在提取外周血游離核酸的瓶頸問題,提供一種改進(jìn)的離心柱法外周血游離DNA提取試劑及其提取方法,所用試劑成分簡(jiǎn)單,操作方便,成本低廉,不需特殊設(shè)備,并能顯著降低成本和提高核酸提取率。
為實(shí)現(xiàn)前述發(fā)明目的,本發(fā)明采用的技術(shù)方案包括:
本發(fā)明實(shí)施例提供了一種改進(jìn)的離心柱法外周血游離DNA提取試劑,其包含0.2ug/uL~5ug/uL酵母tRNA,其余部分包含超純水;并且所述DNA提取試劑的pH值為7.3~8.2。
在一些優(yōu)選實(shí)施方案之中,所述改進(jìn)的離心柱法外周血游離DNA提取試劑的pH值為7.5,溶劑為超純水,溶質(zhì)為如下終濃度物質(zhì):酵母tRNA 1ug/uL。
本發(fā)明實(shí)施例還提供了一種試劑盒,其包含前述改進(jìn)的離心柱法外周血游離DNA提取試劑。
本發(fā)明實(shí)施例還提供了一種改進(jìn)的離心柱法外周血游離DNA提取方法,其包括:
將待處理外周血與蛋白酶K混合,再加入第一緩沖液和所述改進(jìn)的離心柱法外周血游離DNA提取試劑或試劑盒,混合均勻形成消化液,然后向所述消化液中加入無水乙醇,形成消化混合液,將所述消化混合液離心得到游離DNA。
其中,所述第一緩沖液為AL緩沖液,德國(guó)Qiagen。
在一些實(shí)施方案之中,所述待處理外周血與蛋白酶K的體積比為5:1~20:1;所述蛋白酶K的酶活濃度范圍為5mg/mL~30mg/mL。
在一些較為優(yōu)選的實(shí)施方案之中,所述待處理外周血與蛋白酶K的體積比為10:1,所述蛋白酶K的酶活濃度范圍為20mg/mL。
在一些實(shí)施方案之中,所述第一緩沖液與待處理外周血的體積比為0.5:1~2:1;
所述待處理外周血與所述改進(jìn)的離心柱法外周血游離DNA提取試劑的體積比為200:1~5000:1;
所述待處理外周血與無水乙醇的體積比為3:1~10:1。
在一些較為優(yōu)選的實(shí)施方案之中,所述第一緩沖液與待處理外周血的體積比為1:1;
所述待處理外周血與所述改進(jìn)的離心柱法外周血游離DNA提取試劑的體積比為1000:1;
所述待處理外周血與無水乙醇的體積比為2.5:1。
在一些實(shí)施方案之中,所述消化液的溫度為50℃~65℃,消化時(shí)間為0.2h~20h。更為優(yōu)選的,所述消化液的溫度為56℃,消化時(shí)間為6h。
在一些實(shí)施方案之中,所述提取方法還包括:將所述消化混合液分批加入離心柱中離心,先向離心柱中加入第二緩沖液,清洗離心柱,再向離心柱中加入第三緩沖液,清洗離心柱。
其中,所述第二緩沖液為AW1緩沖液,德國(guó)Qiagen;所述第三緩沖液為AW2緩沖液,德國(guó)Qiagen。
進(jìn)一步的,所述提取方法還包括:清洗離心柱后,將空的離心柱放置入離心機(jī)中離心2min,并室溫晾干,然后向離心柱中加入第四緩沖液,洗脫得到的游離DNA。
其中,所述第四緩沖液為AE緩沖液,德國(guó)Qiagen。
在一些實(shí)施方案之中,所述第二緩沖液與所述待處理外周血的體積比為0.5:1~2:1;
所述第三緩沖液與所述待處理外周血的體積比為0.5:1~2:1;
所述待處理外周血與第四緩沖液的體積比為10:1~200:1;
洗脫溫度為20℃~70℃。
更為優(yōu)選的,所述第二緩沖液與所述待處理外周血的體積比為0.7:1;
所述第三緩沖液與所述待處理外周血的體積比為0.7:1;
所述待處理外周血與第四緩沖液的體積比為31.25:1;
洗脫溫度為55℃。
與現(xiàn)有技術(shù)相比,本發(fā)明的優(yōu)點(diǎn)包括:
(1)本發(fā)明提供的一種改進(jìn)的離心柱法外周血游離核酸提取試劑,只需使用市面現(xiàn)有全血提取核酸試劑盒中的試劑,材料來源簡(jiǎn)單,操作難度低,無需專門技術(shù)培訓(xùn)及特殊儀器設(shè)備;
(2)本發(fā)明提供的一種改進(jìn)的離心柱法外周血游離核酸提取方法,在現(xiàn)有普通離心柱法的基礎(chǔ)上進(jìn)行了改良,在提取過程中加入上述提取試劑提高提取效率,將現(xiàn)有普通離心柱法的提取得率提高了3-10倍;
(3)本發(fā)明提供的一種改進(jìn)的離心柱法外周血游離核酸提取試劑及試劑盒,較市面上已有的產(chǎn)品試劑盒而言,可實(shí)現(xiàn)替代價(jià)格昂貴的針對(duì)性提取外周血游離DNA離心柱法試劑盒,可將成本降低50%以上,大大改善科研人員在提取外周血游離核酸中所遭遇的問題,具有實(shí)用性高,推廣性好的優(yōu)點(diǎn)。
附圖說明
圖1是本發(fā)明提供的改進(jìn)的離心柱法外周血游離DNA的提取試劑盒與現(xiàn)有試劑盒的成本消耗對(duì)比示意圖;
圖2是本發(fā)明實(shí)施例1-4及對(duì)照組試驗(yàn)中對(duì)游離DNA提取量的對(duì)比示意圖。
具體實(shí)施方式
下文將對(duì)本發(fā)明的技術(shù)方案作更為詳盡的解釋說明。但是,應(yīng)當(dāng)理解,在本發(fā)明范圍內(nèi),本發(fā)明的上述各技術(shù)特征和在下文(如實(shí)施例)中具體描述的各技術(shù)特征之間都可以互相組合,從而構(gòu)成新的或優(yōu)選的技術(shù)方案。限于篇幅,在此不再一一累述。
在對(duì)實(shí)例描述前,有必要提供一些備注說明:
采用不同廠家、不同批次的試劑會(huì)造成實(shí)驗(yàn)結(jié)果的差異,屬于正?,F(xiàn)象。在進(jìn)行小規(guī)模實(shí)驗(yàn)時(shí),為保證平行實(shí)驗(yàn)間的重復(fù)性,建議配置試劑后,充分混勻并分裝,以保證每次實(shí)驗(yàn)試劑的均一性。
本發(fā)明實(shí)施例提供了一種改進(jìn)的離心柱法外周血游離DNA提取試劑,其包含0.2ug/uL~5ug/uL酵母tRNA,其余部分包含超純水;并且所述DNA提取試劑的pH值為7.3~8.2。
在一些優(yōu)選實(shí)施方案之中,所述改進(jìn)的離心柱法外周血游離DNA提取試劑的pH值為7.5,溶劑為超純水,溶質(zhì)為如下終濃度物質(zhì):酵母tRNA 1ug/uL。
本發(fā)明實(shí)施例還提供了一種試劑盒,其包含前述改進(jìn)的離心柱法外周血游離DNA提取試劑。
本發(fā)明實(shí)施例還提供了一種改進(jìn)的離心柱法外周血游離DNA提取方法,其包括:
將待處理外周血與蛋白酶K混合,再加入第一緩沖液和所述改進(jìn)的離心柱法外周血游離DNA提取試劑或試劑盒,混合均勻形成消化液,然后向所述消化液中加入無水乙醇,形成消化混合液,將所述消化混合液離心得到游離DNA。
其中,所述第一緩沖液為AL緩沖液,德國(guó)Qiagen。
在一些實(shí)施方案之中,所述待處理外周血與蛋白酶K的體積比為5:1~20:1,優(yōu)選為10:1。
在一些實(shí)施方案之中,所述蛋白酶K的酶活濃度范圍為5mg/mL~30mg/mL,優(yōu)選為20mg/mL。
在一些實(shí)施方案之中,所述第一緩沖液與待處理外周血的體積比為0.5:1~2:1,優(yōu)選為1:1;
所述待處理外周血與所述改進(jìn)的離心柱法外周血游離DNA提取試劑的體積比為200:1~5000:1,優(yōu)選為1000:1;
所述待處理外周血與無水乙醇的體積比為3:1~10:1,優(yōu)選為2.5:1。
在一些實(shí)施方案之中,所述消化液的溫度為50℃~65℃,消化時(shí)間為0.2h~20h。更為優(yōu)選的,所述消化液的溫度為56℃,消化時(shí)間為6h。
在一些實(shí)施方案之中,所述提取方法還包括:將所述消化混合液分批加入離心柱中離心,先向離心柱中加入第二緩沖液,清洗離心柱,再向離心柱中加入第三緩沖液,清洗離心柱。
其中,所述第二緩沖液為AW1緩沖液,德國(guó)Qiagen,所述第三緩沖液為AW2緩沖液,德國(guó)Qiagen。
進(jìn)一步的,所述提取方法還包括:清洗離心柱后,將空的離心柱放置入離心機(jī)中離心2min,并室溫晾干,然后向離心柱中加入第四緩沖液,洗脫得到的游離DNA。
其中,所述第四緩沖液為AE緩沖液,德國(guó)Qiagen。
在一些實(shí)施方案之中,所述第二緩沖液與所述待處理外周血的體積比為0.5:1~2:1;
所述第三緩沖液與所述待處理外周血的體積比為0.5:1~2:1;
所述待處理外周血與第四緩沖液的體積比為10:1~200:1;
洗脫溫度為20℃~70℃。
更為優(yōu)選的,所述第二緩沖液與所述待處理外周血的體積比為0.7:1;
所述第三緩沖液與所述待處理外周血的體積比為0.7:1;
所述待處理外周血與第四緩沖液的體積比為31.25:1;
洗脫溫度為55℃。
在一些較為具體的實(shí)施方案之中,所述提取方法具體包括以下步驟:
(1)將1mL血漿從-80℃中取出,置于冰水混合物中融化;
(2)在15mL離心管底部加入蛋白酶K;
(3)將1mL血漿加入15mL離心管中,并加入第一緩沖液和前述提取試劑;
(4)充分混勻后放置水浴鍋中消化;
(5)向消化液中添加無水乙醇;
(6)將消化混合液分批加入離心柱中離心;
(7)向離心柱中加入第二緩沖液,清洗離心柱;
(8)向離心柱中加入第三緩沖液,清洗離心柱。
(9)空離離心柱,并室溫晾干;
(10)向離心柱中加入第四緩沖液,洗脫DNA。
其它未提及的步驟,均按照QiaAmp Blood Mini Kit操作手冊(cè)進(jìn)行(Qiagen)。
以下結(jié)合附圖和若干實(shí)施例對(duì)本發(fā)明的技術(shù)方案作進(jìn)一步的解釋說明。
實(shí)施例1
1.試劑準(zhǔn)備:
蛋白酶K(天根),QIAamp Mini spin column(Qiagen),緩沖液AL(Qiagen),緩沖液AW1(Qiagen),無水乙醇(國(guó)藥),緩沖液AW2(Qiagen),緩沖液AE(Qiagen),Qubit dsDNA HS Assay(Life Technologies)。
試劑I:pH為7.5,溶劑為超純水,溶質(zhì)包含以下終濃度物質(zhì),酵母tRNA(Perkin Elmer)1ug/uL。
2.實(shí)驗(yàn)操作過程:
(1)將融化后的血漿樣本放置在預(yù)冷至4℃的離心機(jī)Sigma(3K-15)中,以16000×g的轉(zhuǎn)速,4℃離心10min。
(2)吸取100ul蛋白酶K至15ml離心管底部。
(3)用移液器小心吸取離心后血漿樣本上清液1mL至加有蛋白酶K的15ml離心管中。
(4)吸取1mL緩沖液AL溶液和1uL試劑I,加入樣本中,立即渦旋振蕩混勻15秒。
(5)將混合液放入56℃水浴鍋孵育4h。
(6)從水浴鍋中取出15ml離心管,短暫離心5秒,使離心管蓋和管壁上的液體聚集至管底。
(7)加入1mL無水乙醇到樣本中,渦旋振蕩混勻15秒后短暫離心。
(8)小心吸取以上混合物700ul到QIAamp Mini spin column中,蓋上蓋子,使用離心機(jī)Thermo(Micro CL17),6000×g常溫離心1min,丟棄收集管中的廢液,重復(fù)加入樣本直至全部離心完畢。
(9)小心將QIAamp Mini spin column轉(zhuǎn)移至新的收集管中,加入700ul緩沖液AW1,蓋上蓋子,使用離心機(jī)Thermo(Micro CL17),6000×g常溫離心1min。
(10)小心將QIAamp Mini spin column轉(zhuǎn)移至新的收集管中,加入700ul緩沖液AW2,蓋上蓋子,使用離心機(jī)Thermo(Micro CL17),14000×g常溫離心2min。
(11)將QIAamp Mini spin column轉(zhuǎn)移至新的收集管中,管蓋反向,全速離心4min。
(12)將QIAamp Mini spin column轉(zhuǎn)移至新的收集管中,打開蓋子,至于55℃下晾干10min。
(13)將QIAamp Mini spin column轉(zhuǎn)移至干凈的1.5ml Eppendorf離心管中,向膜中央加入32ul預(yù)熱過的緩沖液AE,蓋上蓋子,55℃孵育5min。
(14)使用離心機(jī)Thermo(Micro CL17),6000×g常溫離心2min。
(15)丟棄掉QIAamp Mini spin column,小心蓋好蓋子,在EP管上做好標(biāo)記。
(16)使用Qubit dsDNA HS Assay對(duì)提取的DNA進(jìn)行定量操作。
3.檢測(cè)結(jié)果:
最后測(cè)得終產(chǎn)物濃度為:0.32ng/ul。
實(shí)施例2
1.試劑準(zhǔn)備:
蛋白酶K(天根),QIAamp Mini spin column(Qiagen),緩沖液AL(Qiagen),緩沖液AW1(Qiagen),無水乙醇(國(guó)藥),緩沖液AW2(Qiagen),緩沖液AE(Qiagen),Qubit dsDNA HS Assay(Life Technologies)。
試劑I:pH為7.5,溶劑為超純水,溶質(zhì)包含以下終濃度物質(zhì),酵母tRNA(Perkin Elmer)1ug/uL。
2.實(shí)驗(yàn)操作過程:
(1)將融化后的血漿樣本放置在預(yù)冷至4℃的離心機(jī)Sigma(3K-15)中,以16000×g的轉(zhuǎn)速,4℃離心10min。
(2)吸取100ul蛋白酶K至15ml離心管底部。
(3)用移液器小心吸取離心后血漿樣本上清液1mL至加有蛋白酶K的15ml離心管中。
(4)吸取1mL緩沖液AL溶液和1uL試劑I,加入樣本中,立即渦旋振蕩混勻15秒。
(5)將混合液放入56℃水浴鍋孵育4h。
(6)從水浴鍋中取出15ml離心管,短暫離心5秒,使離心管蓋和管壁上的液體聚集至管底。
(7)加入1mL無水乙醇到樣本中,渦旋振蕩混勻15秒后短暫離心。
(8)小心吸取以上混合物700ul到QIAamp Mini spin column中,蓋上蓋子,使用離心機(jī)Thermo(Micro CL17),6000×g常溫離心1min,丟棄收集管中的廢液,重復(fù)加入樣本直至全部離心完畢。
(9)小心將QIAamp Mini spin column轉(zhuǎn)移至新的收集管中,加入700ul緩沖液AW1,蓋上蓋子,使用離心機(jī)Thermo(Micro CL17),6000×g常溫離心1min。
(10)小心將QIAamp Mini spin column轉(zhuǎn)移至新的收集管中,加入700ul緩沖液AW2,蓋上蓋子,使用離心機(jī)Thermo(Micro CL17),14000×g常溫離心2min。
(11)將QIAamp Mini spin column轉(zhuǎn)移至新的收集管中,管蓋反向,全速離心4min。
(12)將QIAamp Mini spin column轉(zhuǎn)移至新的收集管中,打開蓋子,至于55℃下晾干10min。
(13)將QIAamp Mini spin column轉(zhuǎn)移至干凈的1.5ml Eppendorf離心管中,向膜中央加入32ul預(yù)熱過的緩沖液AE,蓋上蓋子,55℃孵育5min。
(14)使用離心機(jī)Thermo(Micro CL17),6000×g常溫離心2min。
(15)丟棄掉QIAamp Mini spin column,小心蓋好蓋子,在EP管上做好標(biāo)記。
(16)使用Qubit dsDNA HS Assay對(duì)提取的DNA進(jìn)行定量操作。
3.檢測(cè)結(jié)果:
最后測(cè)得終產(chǎn)物濃度為:0.29ng/ul。
實(shí)施例3
1.試劑準(zhǔn)備:
蛋白酶K(天根),QIAamp Mini spin column(Qiagen),緩沖液AL(Qiagen),緩沖液AW1(Qiagen),無水乙醇(國(guó)藥),緩沖液AW2(Qiagen),緩沖液AE(Qiagen),Qubit dsDNA HS Assay(Life Technologies)。
試劑I:pH為7.5,溶劑為超純水,溶質(zhì)包含以下終濃度物質(zhì),酵母tRNA(Perkin Elmer)1ug/uL。
2.實(shí)驗(yàn)操作過程:
(1)將融化后的血漿樣本放置在預(yù)冷至4℃的離心機(jī)Sigma(3K-15)中,以16000×g的轉(zhuǎn)速,4℃離心10min。
(2)吸取100ul蛋白酶K至15ml離心管底部。
(3)用移液器小心吸取離心后血漿樣本上清液1mL至加有蛋白酶K的15ml離心管中。
(4)吸取1mL緩沖液AL溶液和1uL試劑I,加入樣本中,立即渦旋振蕩混勻15秒。
(5)將混合液放入56℃水浴鍋孵育4h。
(6)從水浴鍋中取出15ml離心管,短暫離心5秒,使離心管蓋和管壁上的液體聚集至管底。
(7)加入1mL無水乙醇到樣本中,渦旋振蕩混勻15秒后短暫離心。
(8)小心吸取以上混合物700ul到QIAamp Mini spin column中,蓋上蓋子,使用離心機(jī)Thermo(Micro CL17),6000×g常溫離心1min,丟棄收集管中的廢液,重復(fù)加入樣本直至全部離心完畢。
(9)小心將QIAamp Mini spin column轉(zhuǎn)移至新的收集管中,加入700ul緩沖液AW1,蓋上蓋子,使用離心機(jī)Thermo(Micro CL17),6000×g常溫離心1min。
(10)小心將QIAamp Mini spin column轉(zhuǎn)移至新的收集管中,加入700ul緩沖液AW2,蓋上蓋子,使用離心機(jī)Thermo(Micro CL17),14000×g常溫離心2min。
(11)將QIAamp Mini spin column轉(zhuǎn)移至新的收集管中,管蓋反向,全速離心4min。
(12)將QIAamp Mini spin column轉(zhuǎn)移至新的收集管中,打開蓋子,至于55℃下晾干10min。
(13)將QIAamp Mini spin column轉(zhuǎn)移至干凈的1.5ml Eppendorf離心管中,向膜中央加入32ul預(yù)熱過的緩沖液AE,蓋上蓋子,55℃孵育5min。
(14)使用離心機(jī)Thermo(Micro CL17),6000×g常溫離心2min。
(15)丟棄掉QIAamp Mini spin column,小心蓋好蓋子,在EP管上做好標(biāo)記。
(16)使用Qubit dsDNA HS Assay對(duì)提取的DNA進(jìn)行定量操作。
3.檢測(cè)結(jié)果:
最后測(cè)得終產(chǎn)物濃度為:0.37ng/ul。
實(shí)施例4
1.試劑準(zhǔn)備:
蛋白酶K(天根),QIAamp Mini spin column(Qiagen),緩沖液AL(Qiagen),緩沖液AW1(Qiagen),無水乙醇(國(guó)藥),緩沖液AW2(Qiagen),緩沖液AE(Qiagen),Qubit dsDNA HS Assay(Life Technologies)。
試劑I:pH為7.5,溶劑為超純水,溶質(zhì)包含以下終濃度物質(zhì),酵母tRNA(Perkin Elmer)1ug/uL。
2.實(shí)驗(yàn)操作過程:
(1)將融化后的血漿樣本放置在預(yù)冷至4℃的離心機(jī)Sigma(3K-15)中,以16000×g的轉(zhuǎn)速,4℃離心10min。
(2)吸取100ul蛋白酶K至15ml離心管底部。
(3)用移液器小心吸取離心后血漿樣本上清液1mL至加有蛋白酶K的15ml離心管中。
(4)吸取1mL緩沖液AL溶液和1uL試劑I,加入樣本中,立即渦旋振蕩混勻15秒。
(5)將混合液放入56℃水浴鍋孵育4h。
(6)從水浴鍋中取出15ml離心管,短暫離心5秒,使離心管蓋和管壁上的液體聚集至管底。
(7)加入1mL無水乙醇到樣本中,渦旋振蕩混勻15秒后短暫離心。
(8)小心吸取以上混合物700ul到QIAamp Mini spin column中,蓋上蓋子,使用離心機(jī)Thermo(Micro CL17),6000×g常溫離心1min,丟棄收集管中的廢液,重復(fù)加入樣本直至全部離心完畢。
(9)小心將QIAamp Mini spin column轉(zhuǎn)移至新的收集管中,加入700ul緩沖液AW1,蓋上蓋子,使用離心機(jī)Thermo(Micro CL17),6000×g常溫離心1min。
(10)小心將QIAamp Mini spin column轉(zhuǎn)移至新的收集管中,加入700ul緩沖液AW2,蓋上蓋子,使用離心機(jī)Thermo(Micro CL17),14000×g常溫離心2min。
(11)將QIAamp Mini spin column轉(zhuǎn)移至新的收集管中,管蓋反向,全速離心4min。
(12)將QIAamp Mini spin column轉(zhuǎn)移至新的收集管中,打開蓋子,至于55℃下晾干10min。
(13)將QIAamp Mini spin column轉(zhuǎn)移至干凈的1.5ml Eppendorf離心管中,向膜中央加入32ul預(yù)熱過的緩沖液AE,蓋上蓋子,55℃孵育5min。
(14)使用離心機(jī)Thermo(Micro CL17),6000×g常溫離心2min。
(15)丟棄掉QIAamp Mini spin column,小心蓋好蓋子,在EP管上做好標(biāo)記。
(16)使用Qubit dsDNA HS Assay對(duì)提取的DNA進(jìn)行定量操作。
3.檢測(cè)結(jié)果:
最后測(cè)得終產(chǎn)物濃度為:0.41ng/ul。
對(duì)照組實(shí)施例
1.試劑準(zhǔn)備:
蛋白酶K(天根),緩沖液ACL(Qiagen),緩沖液ACB(Qiagen),Circulating Column(Qiagen),緩沖液ACW1(Qiagen),緩沖液ACW2(Qiagen),無水乙醇(國(guó)藥),緩沖液AVE(Qiagen)。
2.實(shí)驗(yàn)操作過程:
(1)向每管中加入100ul蛋白酶K,再向其中加入0.8ml緩沖液ACL,渦旋振蕩30s,56℃水浴鍋孵育30min后取出,加入1.8ml緩沖液ACB,渦旋振蕩30s,置于冰上5min。
(2)使用抽濾設(shè)備,將以上混合溶液加入至Circulating column中,抽干后,分別用600ul緩沖液ACW1,緩沖液750ul ACW2,緩沖液750ul 100%乙醇洗柱,抽干后取下。
(3)置于新的收集管中,最大轉(zhuǎn)速離心5min,取出,棄收集管。
(4)將Circulating column置于新的收集管中,56℃烘箱10min,緩沖液AVE同時(shí)預(yù)熱。
(5)取出,將Circulating column置于新收集管中,向膜中央緩緩加入30ul洗脫液AVE。
(6)蓋上蓋子,56℃孵育5min后,最大轉(zhuǎn)速離心2min。
(7)使用Qubit dsDNA HS Assay對(duì)提取的DNA進(jìn)行定量操作。
3.檢測(cè)結(jié)果:
最后測(cè)得終產(chǎn)物濃度為:0.35ng/ul。
圖1是本發(fā)明提供的基于離心柱法的外周血游離DNA的提取試劑盒與現(xiàn)有試劑盒的成本消耗對(duì)比示意圖。其中,現(xiàn)有試劑盒中試劑盒A為:MagMAX Cell-Free DNA Isolation Kit(Thermo),試劑盒B為:NextPrep-MagTM cfDNA Isolation Kit(Bioo Scientific),試劑盒C為:QIAamp Circulating Nucleic Acid Kit(Qiagen)。
從圖1和圖2可以看出,本發(fā)明使用的改進(jìn)的離心柱法外周血游離核酸高質(zhì)量提取方法,與對(duì)照組的提取方法相比,所用試劑成分簡(jiǎn)單,操作方便,成本低廉,不需特殊設(shè)備,并能顯著降低成本和提高核酸提取率,在同等血漿量的情況下提取外周血游離核酸的得率已達(dá)到市面高價(jià)試劑盒的要求。
綜上所述,本發(fā)明可有效提高外周血游離核酸的提取得率,有效的降低成本,大大改善科研人員在提取外周血游離核酸中所遭遇的問題。
應(yīng)當(dāng)理解,上述實(shí)施例僅為說明本發(fā)明的技術(shù)構(gòu)思及特點(diǎn),其目的在于讓熟悉此項(xiàng)技術(shù)的人士能夠了解本發(fā)明的內(nèi)容并據(jù)以實(shí)施,并不能以此限制本發(fā)明的保護(hù)范圍。凡根據(jù)本發(fā)明精神實(shí)質(zhì)所作的等效變化或修飾,都應(yīng)涵蓋在本發(fā)明的保護(hù)范圍之內(nèi)。