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      一種轉(zhuǎn)基因大豆檢測(cè)用多重PCR試劑盒及檢測(cè)方法與流程

      文檔序號(hào):11626204閱讀:557來源:國知局
      一種轉(zhuǎn)基因大豆檢測(cè)用多重PCR試劑盒及檢測(cè)方法與流程

      本發(fā)明屬于食品/基因檢測(cè)領(lǐng)域,具體涉及轉(zhuǎn)基因大豆檢測(cè)用多重pcr試劑盒及檢測(cè)方法。



      背景技術(shù):

      目前,國內(nèi)外報(bào)道的轉(zhuǎn)基因作物檢測(cè)技術(shù)主要分為三類,一類是基于核酸的檢測(cè)技術(shù);二是基于蛋白質(zhì)的酶學(xué)和免疫學(xué)檢測(cè)技術(shù);第三類是轉(zhuǎn)基因檢測(cè)新技術(shù),包括向自動(dòng)化技術(shù)發(fā)展的生物傳感器與生物芯片、基于現(xiàn)代分析儀器的近紅外光譜和質(zhì)譜分析技術(shù)等。第二類基于蛋白質(zhì)的檢測(cè)技術(shù)是對(duì)轉(zhuǎn)基因植物中外源基因表達(dá)的蛋白進(jìn)行檢測(cè),這些蛋白在加工過程中易受到破壞而失活、分解或消失,檢查結(jié)果易出現(xiàn)假陰性且方法的重復(fù)性差。近些年發(fā)展的轉(zhuǎn)基因檢測(cè)新技術(shù)如生物傳感器、色譜法和近紅外光譜法等,此類技術(shù)目前仍處于研究階段,存在一些暫時(shí)無法有效解決或客觀存在的缺點(diǎn),如色譜法只適用于轉(zhuǎn)基因植物及其產(chǎn)品的成分發(fā)生重大變化時(shí)的定性檢測(cè)分析,該類檢測(cè)技術(shù)短期內(nèi)仍無法有效推廣應(yīng)用。因此,我國農(nóng)業(yè)部發(fā)布的轉(zhuǎn)基因成分檢測(cè)方法標(biāo)準(zhǔn)以核酸檢測(cè)技術(shù)為主,該類檢測(cè)技術(shù)包括pcr技術(shù)、恒溫?cái)U(kuò)增技術(shù)、southern雜交、基因芯片技術(shù)、熒光定量pcr等。

      多重pcr是在普通pcr的基礎(chǔ)上,于同一個(gè)反應(yīng)體系中利用多對(duì)引物同時(shí)擴(kuò)增多段靶序列的pcr技術(shù)。自多重pcr報(bào)道以來,由于其高效性、靈敏性和經(jīng)濟(jì)簡便性,已廣泛應(yīng)用于核酸診斷的多個(gè)領(lǐng)域,如遺傳疾病診斷、突變和多態(tài)性分析、病原體檢測(cè)、轉(zhuǎn)基因鑒定等;多重pcr體系,一般包括以下試劑:pcr緩沖液、taq酶、dntp、mgcl2、多重引物、模板和去離子水。

      我國目前允許進(jìn)口的轉(zhuǎn)基因大豆高達(dá)12種(具體包括gts-40-3-2、mon87701、mon89788、mon87701×mon89788、cv127-9、a2704-12、dp356043、dp305423、a5547、305423×40-3-2、mon87769、mon87708,其中mon87701×mon89788和305423×40-3-2為復(fù)合性狀轉(zhuǎn)基因大豆)。

      轉(zhuǎn)基因作物是利用基因工程技術(shù)將外源目的基因轉(zhuǎn)入植物中培育而出的,它們具有抗蟲、抗除草劑、抗逆和營養(yǎng)改良等優(yōu)良特性。全球轉(zhuǎn)基因作物的種植面積自1996年的0.17億公頃增加到2015年的1.797億公頃。隨著轉(zhuǎn)基因技術(shù)不斷發(fā)展,轉(zhuǎn)基因作物產(chǎn)業(yè)化與商業(yè)化的程度不斷加深,我國陸續(xù)針對(duì)轉(zhuǎn)基因作物制定了相關(guān)法律法規(guī),然而,公眾對(duì)轉(zhuǎn)基因食品安全的擔(dān)憂及對(duì)所食用食品是否含有轉(zhuǎn)基因成分的知情權(quán)仍與日俱增,因此,快速、準(zhǔn)確、敏感的轉(zhuǎn)基因食品檢測(cè)技術(shù)是所有轉(zhuǎn)基因安全性評(píng)價(jià)等法律法規(guī)真正落到實(shí)處的基礎(chǔ)和關(guān)鍵之一。



      技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:

      本發(fā)明的目的是提供一種檢測(cè)轉(zhuǎn)基因大豆的多重pcr試劑盒,用于我國目前批準(zhǔn)進(jìn)口(即已頒發(fā)安全證書)的12種轉(zhuǎn)基因大豆的單一或者同時(shí)多重pcr檢測(cè),通過設(shè)計(jì)公共引物及轉(zhuǎn)基因大豆特異性引物,限定多重pcr檢測(cè)體系和條件,可檢測(cè)食品(比如大豆、大豆制品、含有大豆成份的食物等)中是否含有轉(zhuǎn)基因大豆成分。

      為達(dá)到上述發(fā)明目的,本發(fā)明采用的技術(shù)方案是:

      一種轉(zhuǎn)基因大豆檢測(cè)用多重pcr試劑盒,包括公共引物、針對(duì)轉(zhuǎn)基因大豆的嵌合引物;所述公共引物的序列為seqidno.1;所述針對(duì)轉(zhuǎn)基因大豆的嵌合引物為seqidno.2至seqidno.18所示的核苷酸序列中的一種或幾種。

      上述技術(shù)方案中,所述轉(zhuǎn)基因大豆檢測(cè)用多重pcr試劑盒還包括taq聚合酶、dntp、mgcl2、pcr緩沖液、去離子水、陽性對(duì)照引物對(duì);其中所述陽性對(duì)照引物對(duì)的序列優(yōu)選為seqidno.19、seqidno.20;可用來檢測(cè)dna模板質(zhì)量和反應(yīng)體系擴(kuò)增效率;

      seqidno.19:gccctctactccacccccatcc

      seqidno.20:gcccatctgcaagcctttttgtg。

      上述技術(shù)方案中,進(jìn)行pcr反應(yīng)時(shí),采用兩步退火溫度法,前10個(gè)循環(huán)退火溫度為61℃;后30個(gè)循環(huán)退火溫度為54℃。第一步退火溫度高于第二步的退火溫度5~10℃;比如前10個(gè)循環(huán)的退火溫度高于后30個(gè)循環(huán)退火溫度7℃,可有效提高檢測(cè)的特異性;進(jìn)行多重pcr反應(yīng)時(shí),針對(duì)轉(zhuǎn)基因大豆的每條嵌合引物的終濃度在8~80nm之間,公共引物的終濃度為1600nm。

      本發(fā)明還公開了一種檢測(cè)產(chǎn)品中轉(zhuǎn)基因大豆成分的方法,提取待檢測(cè)產(chǎn)品基因組dna作為模板(比如轉(zhuǎn)基因大豆的插入基因與大豆基因組的連接區(qū)為靶標(biāo)序列),在嵌合引物與公共引物存在下采用兩步退火溫度法進(jìn)行pcr反應(yīng),對(duì)pcr產(chǎn)物進(jìn)行電泳分析即完成產(chǎn)品中轉(zhuǎn)基因大豆成分的檢測(cè);最后對(duì)pcr產(chǎn)物擴(kuò)增進(jìn)行電泳分析,即完成產(chǎn)品中轉(zhuǎn)基因大豆成分的檢測(cè);所述公共引物的序列為seqidno.1;所述嵌合引物為seqidno.2至seqidno.18所示的核苷酸序列中的一種或幾種。

      上述技術(shù)方案中,第一步(即前10個(gè)循環(huán))多重pcr擴(kuò)增的退火溫度高于第二步(即后30個(gè)循環(huán))多重pcr擴(kuò)增的退火溫度5~10℃;每條嵌合引物的終濃度在8~80nm之間,公共引物的終濃度為1600nm;所述產(chǎn)品為包含大豆成分的食品。具體可包括以下步驟:95℃預(yù)變性5min;95℃變性30s,61℃退火30s,72℃延伸30s,共10個(gè)循環(huán);72℃延伸2min;95℃變性30s,54℃退火30s,72℃延伸30s,共30個(gè)循環(huán);最后72℃延伸7min。前10個(gè)循環(huán),在高退火溫度下,低濃度的嵌合引物中特異引物擴(kuò)增靶標(biāo)序列,產(chǎn)生帶有公共引物末端的pcr產(chǎn)物;后30個(gè)循環(huán),在低退火溫度下,高濃度的公共引物以早期產(chǎn)生的帶有公共引物末端的pcr產(chǎn)物為模板進(jìn)行大量擴(kuò)增。根據(jù)本發(fā)明的方法可以有效、簡便的檢測(cè)產(chǎn)品中,尤其是食品中是否含有轉(zhuǎn)基因大豆成分,為國民知情權(quán)以及食品安全做出巨大貢獻(xiàn)。

      本發(fā)明公開的轉(zhuǎn)基因大豆成分核酸檢測(cè)方法準(zhǔn)確,可同時(shí)檢測(cè)12中目標(biāo)基因,而且檢測(cè)結(jié)果準(zhǔn)確,可解決公眾對(duì)轉(zhuǎn)基因食品安全的擔(dān)憂及對(duì)所食用食品是否含有轉(zhuǎn)基因成分的知情權(quán)。

      本發(fā)明進(jìn)一步公開了一種轉(zhuǎn)基因大豆檢測(cè)用引物,包括公共引物、針對(duì)轉(zhuǎn)基因大豆的嵌合引物;所述公共引物的序列為seqidno.1;所述針對(duì)轉(zhuǎn)基因大豆的嵌合引物為seqidno.2至seqidno.18所示的核苷酸序列中的一種或幾種。

      本發(fā)明還公開了上述轉(zhuǎn)基因大豆檢測(cè)用引物在制備檢測(cè)轉(zhuǎn)基因大豆的多重pcr試劑盒中的應(yīng)用或者權(quán)利要求8所述轉(zhuǎn)基因大豆檢測(cè)用引物在檢測(cè)轉(zhuǎn)基因大豆中的應(yīng)用。

      本發(fā)明中,所述公共引物的序列seqidno.1及所述嵌合引物的核苷酸序列如下所示:

      所述嵌合引物為針對(duì)12種轉(zhuǎn)基因大豆的嵌合引物;a2704與a5547共用上游引物seqidno.11,mon89788、mon87769和mon87708共用下游引物seqidno.18。305423×40-3-2、mon87701×mon89788是兩種基因堆疊的轉(zhuǎn)基因大豆,若樣品中同時(shí)檢測(cè)出轉(zhuǎn)基因大豆dp305423和gts40-3-2,則樣品中有可能含有轉(zhuǎn)基因大豆305423×40-3-2;若樣品中同時(shí)檢測(cè)出轉(zhuǎn)基因大豆mon87701和mon89788,則樣品中有可能含有轉(zhuǎn)基因大豆mon87701×mon89788。

      上述技術(shù)方案中,公共引物與轉(zhuǎn)基因大豆相關(guān)基因組無同源性,當(dāng)以轉(zhuǎn)基因大豆基因組為模板進(jìn)行擴(kuò)增時(shí),不論條件如何,均應(yīng)沒有特異性產(chǎn)物;當(dāng)以嵌合引物的擴(kuò)增產(chǎn)物為模板時(shí),公共引物可以擴(kuò)增出特異性產(chǎn)物;并且公共引物的tm比轉(zhuǎn)基因大豆靶特異性引物的tm值低5~10℃。

      上述技術(shù)方案中,進(jìn)行pcr反應(yīng)時(shí),公共引物的終濃度為1600nm,針對(duì)轉(zhuǎn)基因大豆的嵌合引物的終濃度為8~80nm,用于擴(kuò)增12種轉(zhuǎn)基因大豆mon87701、gts40-3-2、mon89788、cv127、a2704、a5547、dp356043、dp305423、mon87769、mon87708、305423×40-3-2、mon87701×mon89788,比如seqidno.2/3:80nm,seqidno.4/5:60nm,seqidno.6/7:64nm,seqidno.8/9:8nm,seqidno.10:32nm,seqidno.11:48nm,seqidno.12:16nm,seqidno.13/14:24nm,seqidno.15/16:8nm,seqidno.17:16nm,seqidno.18:32nm;進(jìn)行pcr反應(yīng)時(shí),采用兩步退火溫度法,第一步退火溫度比第二步退火溫度高5~10℃。

      本發(fā)明公開的試劑盒可用于產(chǎn)品尤其是食品中轉(zhuǎn)基因大豆成分的檢測(cè),本發(fā)明公開的多重pcr是公共引物介導(dǎo)的多重pcr結(jié)合兩步退火溫度法。具體比如采用兩步退火溫度法,以轉(zhuǎn)基因大豆插入基因序列與大豆基因連接區(qū)序列為靶標(biāo)序列,用嵌合引物先擴(kuò)增10個(gè)循環(huán),退火溫度為61℃,進(jìn)行第一步多重pcr擴(kuò)增,可產(chǎn)生公共引物末端的pcr產(chǎn)物;公共引物以第一步擴(kuò)增的帶有公共引物末端的pcr產(chǎn)物為模板,進(jìn)行后30個(gè)循環(huán)的第二步多重pcr擴(kuò)增,退火溫度為54℃;即完成轉(zhuǎn)基因大豆的多重pcr擴(kuò)增;前10個(gè)循環(huán)的多重pcr擴(kuò)增退火溫度比后面30個(gè)循環(huán)的多重pcr擴(kuò)增退火溫度高5~10℃。循環(huán)早期,在高退火溫度下,低濃度的嵌合引物擴(kuò)增靶標(biāo)序列,產(chǎn)生帶有公共引物末端的pcr產(chǎn)物;循環(huán)后期,在低退火溫度下,高濃度的公共引物以早期產(chǎn)生的pcr產(chǎn)物為模板進(jìn)行大量擴(kuò)增。多重pcr采用的25μl反應(yīng)體系包括:10μm的公共引物4μl,不同濃度的嵌合引物混合物2μl,2×dreamtaqgreenmix12.5μl,dna模板1μl,滅菌ddh2o4.5μl;pcr反應(yīng)條件為:95℃預(yù)變性5min;95℃變性30s,61℃退火30s,72℃延伸30s,共10個(gè)循環(huán);72℃延伸2min;95℃變性30s,54℃退火30s,72℃延伸30s,共30個(gè)循環(huán);最后72℃延伸7min。最后進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳分析,結(jié)果表明本發(fā)明的檢測(cè)轉(zhuǎn)基因大豆的多重pcr試劑盒可同時(shí)或者獨(dú)立特異性檢測(cè)10種轉(zhuǎn)基因大豆的基因組;利用構(gòu)建的質(zhì)粒模板,本發(fā)明的檢測(cè)轉(zhuǎn)基因大豆的多重pcr試劑盒的敏感性最高可達(dá)0.1%(w/w)轉(zhuǎn)基因大豆成分含量,即0.1ng/100ngdna樣品。

      由于上述技術(shù)方案運(yùn)用,本發(fā)明與現(xiàn)有技術(shù)相比具有以下優(yōu)點(diǎn):

      (1)本發(fā)明公開的檢測(cè)轉(zhuǎn)基因大豆的多重pcr試劑盒,可同時(shí)也可單獨(dú)檢測(cè)我國批準(zhǔn)進(jìn)口的的12種轉(zhuǎn)基因大豆,即mon87701、gts40-3-2、mon89788、cv127、a2704、a5547、dp356043、dp305423、mon87769、mon87708、305423×40-3-2、mon87701×mon89788,不僅可以節(jié)約試劑使用量和降低檢測(cè)成本,同時(shí)提高了檢測(cè)效率,具有靈敏度高,經(jīng)濟(jì)、快速、操作簡單等優(yōu)點(diǎn);

      (2)本發(fā)明公開的試劑盒進(jìn)行檢測(cè)時(shí),降低嵌合引物濃度,最低至8nm/每條,公共引物濃度為1600nm;降低嵌合引物的濃度有利于加入更多對(duì)嵌合引物,提高多重pcr檢測(cè)通量;采用單條公共引物,有利于減少二聚體的形成,高濃度有利于擴(kuò)增特異性產(chǎn)物的量,進(jìn)而提高檢測(cè)敏感性;

      (3)本發(fā)明公開的試劑盒采用一個(gè)pcr反應(yīng)中的兩步退火溫度法,前10個(gè)循環(huán)擴(kuò)增采用高退火溫度(61℃)有利于嵌合引物的特異性結(jié)合,減少非特異性產(chǎn)物;后30個(gè)循環(huán)擴(kuò)增低退火溫度(54℃)使公共引物發(fā)揮放大作用;中間額外增加72℃延伸2min,有利于為公共引物獲得足夠的模板;

      (4)本發(fā)明公開的試劑盒中,公共引物與每條多重pcr特異引物的5'末端連接,一起構(gòu)成了嵌合引物;公共引物介導(dǎo)的多重pcr可以降低引物對(duì)的濃度,減少二聚體的形成,從而提高多重pcr的檢測(cè)通量;通過創(chuàng)造性的設(shè)計(jì)克服了現(xiàn)有多重pcr體系存在的非特異性擴(kuò)增、易存在二聚體的缺陷;

      (5)本發(fā)明的多重pcr檢測(cè)體系特異性高,敏感性高達(dá)0.1%(w/w)(轉(zhuǎn)基因大豆成分含量),即0.1ng/100ngdna樣品;單管進(jìn)行,操作簡單,且具有靈敏度高、經(jīng)濟(jì)、快速等優(yōu)點(diǎn),具有實(shí)際應(yīng)用價(jià)值;

      (6)本發(fā)明公開的多重pcr(mutiplexpcr)在一個(gè)pcr管中同時(shí)檢測(cè)多個(gè)靶標(biāo)分子,比southern雜交、基因芯片方法更加簡便快捷,比熒光定量pcr更經(jīng)濟(jì),與恒溫?cái)U(kuò)增技術(shù)(包括環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增法)相比不易污染及高通量。由于該技術(shù)所具有的高效性、敏感性和經(jīng)濟(jì)簡便性等優(yōu)點(diǎn),可以在核酸檢測(cè)技術(shù)中受到廣泛關(guān)注。

      附圖說明

      圖1是本發(fā)明公共引物的特異性檢測(cè)電泳圖;

      圖2是本發(fā)明公共引物敏感性結(jié)果圖;

      圖3是本發(fā)明多重體系的特異性檢測(cè)的電泳結(jié)果圖;

      圖4是本發(fā)明檢測(cè)轉(zhuǎn)基因大豆測(cè)序結(jié)果圖;

      圖5是本發(fā)明多重檢測(cè)體系的敏感性結(jié)果圖。

      具體實(shí)施方式

      下面結(jié)合實(shí)施例與附圖對(duì)本發(fā)明作進(jìn)一步的描述

      實(shí)施例

      1.公共引物的篩選及其檢測(cè)的敏感性

      公共引物作為整個(gè)技術(shù)體系中的核心技術(shù),其質(zhì)量好壞直接影響著技術(shù)的成敗。本發(fā)明所采用的公共引物seqidno.1與轉(zhuǎn)基因大豆和非轉(zhuǎn)基因大豆基因組dna進(jìn)行pcr擴(kuò)增,在退火溫度梯度45℃--65℃范圍內(nèi)均不能擴(kuò)增特異產(chǎn)物,如圖1,a-k為公共引物與轉(zhuǎn)基因大豆和非轉(zhuǎn)基因大豆基因組dna擴(kuò)增結(jié)果,結(jié)果顯示,公共引物均不能擴(kuò)增特異產(chǎn)物,其中,泳道0為空白對(duì)照,泳道m(xù)為100bpdnamarker,泳道1-8為退火溫度梯度45℃--65℃;a模板為非轉(zhuǎn)基因大豆基因組dna,b模板為gts40-3-2基因組dna,c模板為a2704-12基因組dna,d模板為mon89788基因組dna,e模板為dp356043基因組dna,f模板為dp305423基因組dna,g模板為cv127-9基因組dna,h模板為mon87701基因組dna,i模板為a5547-127基因組dna,j模板為mon87708基因組dna,k模板為mon87769基因組dna。

      通過構(gòu)建的重組質(zhì)粒模板,進(jìn)一步檢測(cè)公共引物seqidno.1檢測(cè)的敏感性,其檢測(cè)敏感性達(dá)到100個(gè)拷貝,如圖2,泳道m(xù)為100bpdnamarker,泳道0為空白對(duì)照,泳道1-8模板對(duì)應(yīng)的質(zhì)??截悢?shù)依次為101、102、103、104、105、106、107、108。

      本發(fā)明中,當(dāng)以轉(zhuǎn)基因大豆和非轉(zhuǎn)基因大豆基因組dna為模板進(jìn)行擴(kuò)增時(shí),不論擴(kuò)增條件如何優(yōu)化,均應(yīng)沒有擴(kuò)增產(chǎn)物;當(dāng)帶有公共引物的多重嵌合引物有擴(kuò)增產(chǎn)物時(shí),通過公共引物一定可以擴(kuò)增出特異性產(chǎn)物。

      2.檢測(cè)轉(zhuǎn)基因大豆的多重pcr試劑盒,包括常規(guī)多重pcr組件,還包括針對(duì)這10種轉(zhuǎn)基因大豆的嵌合引物和公共引物;嵌合引物和公共引物序列見表1,常規(guī)多重pcr組件包括taq聚合酶、dntp、mgcl2、pcr緩沖液、去離子水、陽性對(duì)照引物對(duì);陽性對(duì)照引物對(duì)可用來檢測(cè)dna模板質(zhì)量和反應(yīng)體系擴(kuò)增效率,具體序列為:seqidno.19:gccctctactccacccccatcc、

      seqidno.20:gcccatctgcaagcctttttgtg。

      表1針對(duì)我國進(jìn)口的12種轉(zhuǎn)基因大豆嵌合引物和公共引物

      3.多重體系的特異性檢測(cè)

      采用多引物+公共引物+單模板的pcr方法,擴(kuò)增各種檢測(cè)轉(zhuǎn)基因大豆的基因組或靶標(biāo)基因,dna模板均采用提取的相對(duì)應(yīng)的10種轉(zhuǎn)基因大豆基因組dna,濃度約為25ng/μl。多重pcr采用的25μl反應(yīng)體系包括:10μm的公共引物4μl,不同終濃度(seqidno.2/3:80nm,seqidno.4/5:60nm,seqidno.6/7:64nm,seqidno.8/9:8nm,seqidno.10:32nm,seqidno.11:48nm,seqidno.12:16nm,seqidno.13/14:24nm,seqidno.15/16:8nm,seqidno.17:16nm,seqidno.18:32nm)的嵌合引物混合物2μl,2×dreamtaqgreenmix12.5μl,dna模板1μl,滅菌ddh2o5.5μl;pcr反應(yīng)條件為:95℃預(yù)變性5min;95℃變性30s,61℃退火30s,72℃延伸30s,共10個(gè)循環(huán);72℃延伸2min;95℃變性30s,54℃退火30s,72℃延伸30s,共30個(gè)循環(huán);最后72℃延伸7min。圖3為多重體系的特異性檢測(cè)的電泳結(jié)果圖,其中0為空白對(duì)照,n為陰性對(duì)照,1-10泳道是pcr產(chǎn)物的瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果,依次為mon87701、dp356043、dp305423、cv127、mon87769、a2704、gts40-3-2、mon87708、mon89788、a5547,n為陰性對(duì)照,m為dna標(biāo)準(zhǔn)分子量(從下到上目的帶大小依次為100、200、300、400、500、600、700、800、900和1000bp),pm為產(chǎn)物marker,條帶大小見圖3上標(biāo)示;結(jié)果顯示,運(yùn)用本發(fā)明的多重體系檢測(cè)靶標(biāo)dna,可以從相應(yīng)模板中擴(kuò)增出預(yù)期大小的特異性pcr產(chǎn)物,且條帶清晰。擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)進(jìn)一步測(cè)序,證明為相對(duì)應(yīng)的轉(zhuǎn)基因大豆檢測(cè)序列(圖4)。本部分的實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,本發(fā)明的多重體系具有高特異性。

      4.多重檢測(cè)體系的敏感性檢測(cè)

      體系敏感性檢測(cè)采用10種轉(zhuǎn)基因大豆a2704-12、mon89788、cv127、mon87701、a5547-127、mon87708、mon87769、dp356043、dp305423、gts40-3-2基因組dna溶液等體積混合(其中dp356043、dp305423和gts40-3-2初始濃度為2.5ng/μl,其余7種初始濃度為25ng/μl),然后將此混合基因組dna溶液采用te緩沖液進(jìn)行10倍梯度稀釋,依次獲得10、100、1000及10000倍基因組dna稀釋混合液,每種稀釋液取4μl作為模板(每種轉(zhuǎn)基因大豆基因組dna模板濃度分別為10ng、1ng、0.1ng、0.01ng,而dp356043、dp305423、gts40-3-2這3種相對(duì)應(yīng)濃度分別為1ng、0.1ng、0.01ng、0.001ng),分別對(duì)10個(gè)靶標(biāo)基因進(jìn)行模板梯度pcr反應(yīng),ddh2o為模板作為陰性對(duì)照。多重pcr采用25μl反應(yīng)體系包括:10μm的公共引物4μl,1μm針對(duì)相應(yīng)品種轉(zhuǎn)基因大豆的嵌合引物對(duì)混合物2μl,2×dreamtaqgreenmix12.5μl,dna模板4μl,滅菌ddh2o2.5μl;pcr反應(yīng)條件為:95℃預(yù)變性5min;95℃變性30s,61℃退火30s,72℃延伸30s,共10個(gè)循環(huán);72℃延伸2min;95℃變性30s,54℃退火30s,72℃延伸30s,共30個(gè)循環(huán);最后72℃延伸7min。pcr反應(yīng)產(chǎn)物通過2%瓊脂糖凝膠進(jìn)行電泳,凝膠成像系統(tǒng)分析結(jié)果如圖5,泳道m(xù)為100bpdnaladder,泳道0為去離子水為模板的空白陰性對(duì)照,1~4分別為基因組dna模板分別為稀釋10000、1000、100及10倍10種轉(zhuǎn)基因大豆基因組dna稀釋混合液。結(jié)果顯示,本發(fā)明建立的公共引物介導(dǎo)的多重pcr的敏感性可檢測(cè)稀釋1000倍10種轉(zhuǎn)基因大豆基因組dna稀釋混合液,體系敏感性超過0.1%,優(yōu)于國家對(duì)于轉(zhuǎn)基因食品檢測(cè)標(biāo)準(zhǔn)要求。

      sequencelisting

      <110>蘇州大學(xué)

      <120>一種轉(zhuǎn)基因大豆檢測(cè)用多重pcr試劑盒及檢測(cè)方法

      <160>20

      <210>1

      <211>17

      <212>dna

      <213>人工合成

      <400>1

      ctcgtcaactccgcaag17

      <210>2

      <211>42

      <212>dna

      <213>人工合成

      <400>2

      ctcgtcaactccgcaagatattgaccatcatactcattgctg42

      <210>3

      <211>40

      <212>dna

      <213>人工合成

      <400>3

      ctcgtcaactccgcaagtcactttcttgaattagcttgct40

      <210>4

      <211>37

      <212>dna

      <213>人工合成

      <400>4

      ctcgtcaactccgcaagcttttgcccgaggtcgttag37

      <210>5

      <211>39

      <212>dna

      <213>人工合成

      <400>5

      ctcgtcaactccgcaaggccctttggtcttctgagactg39

      <210>6

      <211>42

      <212>dna

      <213>人工合成

      <400>6

      ctcgtcaactccgcaagcgtcaggaataaaggaagtacagta42

      <210>7

      <211>42

      <212>dna

      <213>人工合成

      <400>7

      ctcgtcaactccgcaagatttctaacctggctgctatagtta42

      <210>8

      <211>41

      <212>dna

      <213>人工合成

      <400>8

      ctcgtcaactccgcaagtgtataggaaagcgcaaactgatg41

      <210>9

      <211>39

      <212>dna

      <213>人工合成

      <400>9

      ctcgtcaactccgcaagattagggtttcagcaggttcgt39

      <210>10

      <211>43

      <212>dna

      <213>人工合成

      <400>10

      ctcgtcaactccgcaagaaaatacaaatttaacacttcattgg43

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      <213>人工合成

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      <210>12

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      <212>dna

      <213>人工合成

      <400>12

      ctcgtcaactccgcaaggaatgcaacacactgtaacaatttg42

      <210>13

      <211>39

      <212>dna

      <213>人工合成

      <400>13

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      <210>14

      <211>39

      <212>dna

      <213>人工合成

      <400>14

      ctcgtcaactccgcaagttgcgaaggatagtgggattgt39

      <210>15

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      <212>dna

      <213>人工合成

      <400>15

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      <210>16

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      <212>dna

      <213>人工合成

      <400>16

      ctcgtcaactccgcaagatgagaagatggttttttccaaggt42

      <210>17

      <211>43

      <212>dna

      <213>人工合成

      <400>17

      ctcgtcaactccgcaagggtaatctaaacatgcatgagaaatg43

      <210>18

      <211>36

      <212>dna

      <213>人工合成

      <400>18

      ctcgtcaactccgcaagtgtcgtttcccgccttcag36

      <210>19

      <211>22

      <212>dna

      <213>人工合成

      <400>19

      gccctctactccacccccatcc22

      <210>20

      <211>23

      <212>dna

      <213>人工合成

      <400>20

      gcccatctgcaagcctttttgtg23

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