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      一種提取弓形蟲卵囊核酸的方法與流程

      文檔序號:11400642閱讀:1064來源:國知局
      本發(fā)明為提取弓形蟲卵囊核酸的方法,可應(yīng)用于糞便、土壤、水體、蔬菜和水果中弓形蟲卵囊的檢測。技術(shù)背景剛地弓形蟲(toxoplasmagondii)是一種細胞內(nèi)寄生蟲,可感染人和多種動物,免疫功能受抑制的動物和人感染弓形蟲可引起死亡,是引起流產(chǎn)的重要原因之一。貓科動物是弓形蟲的終末宿主,可排泄具有抵抗能力的弓形蟲卵囊。多種恒溫動物均是中間宿主,包括草食動物、哺乳動物、鳥類、嚙齒類動物等。含有弓形蟲卵囊的貓科動物糞便排出后,可污染環(huán)境,包括土壤、水體、草坪、蔬菜和水果,鳥類、嚙齒類動物可作為機械性弓形蟲卵囊傳播者繼續(xù)傳播弓形蟲病。卵囊直徑10.0×12.0μm,在外界環(huán)境中通過孢子化形成兩個孢子囊,孢子化卵囊直徑11.0×13.0μm,每個孢子囊含有四個子孢子,直徑6.0×8.0μm。弓形蟲卵囊壁為多層,結(jié)構(gòu)復(fù)雜,最外是一個疏松外膜(1-3層),該膜由大配子成熟時的壁樣形成小體(wallformingbodytype,wfb)融合而成;隨后成熟的大配子分泌壁樣形成小體1形成卵囊壁的外層即第4層,發(fā)生聚合作用形成了一個厚度約30-70nm的電子致密層;最后壁樣形成小體2形成了卵囊壁的電子致密度低的內(nèi)層即第5層。弓形蟲卵囊的內(nèi)層膜與外層膜具有結(jié)構(gòu)性和化學(xué)性的保護作用。外層膜富含蛋白質(zhì)和糖類,內(nèi)層膜含有較多的脂質(zhì)。臨床檢驗上,因弓形蟲卵囊壁的多層結(jié)構(gòu),采用常規(guī)核酸提取方法不能有效提取核酸,影響到弓形蟲病的檢測。技術(shù)實現(xiàn)要素:為了解決弓形蟲卵囊壁多層且堅韌、不易破壞,采用常規(guī)核酸提取方法不能有效提取弓形蟲卵囊核酸的問題,本發(fā)明的目的是提供一種簡便、有效地提取弓形蟲卵囊核酸,提高糞便、土壤、水體、蔬菜和水果等樣品弓形蟲檢測的準(zhǔn)確性的提取弓形蟲卵囊核酸的方法。本發(fā)明技術(shù)方案是以下述方式實現(xiàn)的:1、一種提取弓形蟲卵囊核酸的方法:經(jīng)過下述步聚:a、樣品的凍融;b、裂解樣品;c、提取核酸;d、核酸的檢測:其特征在于:所述a、樣品的凍融是指:將含有弓形蟲卵囊的原料經(jīng)反復(fù)冷凍、解凍至少三次;所述b、裂解樣品的裂解步驟如下:取經(jīng)過凍融的原料樣品剪碎,放入ep管內(nèi),加入緩沖液a振蕩混勻進行裂解;緩沖液a:30mmtriscl,30mmedta,50%tween20,0.5%triton-x-100,800mmguhcl,ph8.0,向ep管內(nèi)加入proteinasek溶解弓形蟲卵囊壁,56℃水浴過夜,待卵囊完全溶解;proteinasek:1.25ug/ml;向步驟的溶解液內(nèi)加入3mol/l乙酸鈉緩沖液溶解蛋白質(zhì)和核酸,振蕩混勻,56℃水浴,溶液變清亮使卵囊裂解較徹底;所述c、提取核酸步驟如下:向盛卵囊裂解溶液ep管內(nèi)加入無水乙醇振蕩使dna析出;將上一步ep管內(nèi)全部液體倒入一個吸附柱中,吸附柱套入收集管內(nèi),離心,倒掉收集管內(nèi)廢液,吸附柱放回收集管內(nèi);向吸附柱中加入緩沖液70%乙醇沉淀核酸,離心,倒掉收集管內(nèi)廢液,吸附柱回收集管內(nèi);向吸附柱中加入100%乙醇緩沖液再次沉淀核酸,倒掉收集管內(nèi)廢液,吸附柱放回收集管內(nèi);重復(fù)操作步驟沉淀核酸;將吸附柱放回收集管內(nèi),離心倒掉收集管內(nèi)廢液,吸附柱放回收集管內(nèi);將吸附柱室溫靜置;將吸附柱轉(zhuǎn)入干凈的ep管內(nèi),向吸附膜的中間部位懸空滴加10mmtris-hcl、ph=7.8的緩沖液溶解核酸,室溫靜置、離心,將溶液收集到ep管內(nèi),得弓形蟲卵囊核酸dna,將ep管內(nèi)液體標(biāo)號冷藏;d、核酸的檢測將所得到的核酸置于微量核酸蛋白檢測儀檢測,od=260nm,280nm;od260nm/od280nm=1.8~2.0。所述反復(fù)冷凍、解凍是:-20℃冰箱冷凍0.5-2小時,然后37℃水浴1分鐘;根據(jù)樣品的體積決定-20℃冰箱冷凍時間見下表,樣品體積(ul)冷凍時間(h)2000.51000120001.540002所述裂解樣品步驟取樣品的量為100mg,加入緩沖液a180μl,加入proteinasek20μl,加入3mol/l乙酸鈉緩沖液200μl,振蕩混勻,56℃水浴25min。所述提取核酸步驟中向ep管內(nèi)加入無水乙醇200μl,振蕩約15sec;將上一步ep管內(nèi)全部液體倒入一個吸附柱中,吸附柱套入收集管內(nèi),12000rpm離心1min,向吸附柱中加入緩沖液70%乙醇,加入量為500μl/管、12000rpm離心1min,向吸附柱中加入100%乙醇緩沖液600μl/管再次沉淀核酸,12000rpm離心1min,將吸附柱放回收集管內(nèi),12000rpm離心2min,倒掉收集管內(nèi)廢液,吸附柱放回收集管內(nèi);將吸附柱室溫靜置5min,將吸附柱轉(zhuǎn)入干凈的ep管內(nèi),向吸附膜的中間部位懸空滴加10mmtris-hcl、ph=7.8的緩沖液,20μl/管溶解核酸,室溫靜置5min,12000rpm離心2min,得弓形蟲卵囊核酸dna;將ep管內(nèi)液體標(biāo)號-20℃冷藏。所述反復(fù)冷凍、解凍是:-20℃冰箱冷凍0.5-2小時,然后37℃水浴1分鐘。所述提取核酸步驟中向ep管內(nèi)加入無水乙醇200μl,振蕩約15sec;將上一步ep管內(nèi)全部液體倒入一個吸附柱中,吸附柱套入收集管內(nèi),12000rpm離心1min,向吸附柱中加入緩沖液70%乙醇,加入量為500μl/管、12000rpm離心1min,向吸附柱中加入100%乙醇緩沖液600μl/管再次沉淀核酸,12000rpm離心1min,將吸附柱放回收集管內(nèi),12000rpm離心2min,倒掉收集管內(nèi)廢液,吸附柱放回收集管內(nèi);將吸附柱室溫靜置5min,將吸附柱轉(zhuǎn)入干凈的ep管內(nèi),向吸附膜的中間部位懸空滴加10mmtris-hcl、ph=7.8的緩沖液,20μl/管溶解核酸,室溫靜置5min,12000rpm離心2min,得弓形蟲卵囊核酸dna;將ep管內(nèi)液體標(biāo)號-20℃下冷藏。將所得到的核酸置于微量核酸蛋白檢測儀檢測,od=260nm,280nm。od260nm/od280nm=1.8~2.0;說明提取的核酸達到標(biāo)準(zhǔn),可以進行進一步的病原擴增反應(yīng)。本發(fā)明的積極效果是:本發(fā)明主要是依據(jù)弓形蟲卵囊的生物學(xué)特性,考慮到了檢測樣品的可操作性,其方法簡便易行、有效地提取弓形蟲卵囊核酸,提高糞便、土壤、水體、蔬菜和水果等樣品弓形蟲檢測的準(zhǔn)確性。具體實施方式下面結(jié)合實施例對本發(fā)明作進一步說明:實施例一本發(fā)明的實施需要以下試劑和器材:冰箱、離心機、微量移液槍、ep管、標(biāo)簽紙、記號筆、消毒藥:5%來蘇兒、工作服、瓷盆、肥皂、擦手紙、垃圾袋;具作操作步驟如下:a、樣品的凍融:含有弓形蟲卵囊的糞便、土壤、水體、蔬菜和水果樣品200ul,首先-20℃冰箱冷凍0.5-2小時,然后37℃水浴1分鐘;這個凍融程序反復(fù)3次。根據(jù)樣品的體積決定-20℃冰箱冷凍時間見下表樣品體積(ul)冷凍時間(h)2000.51000120001.540002b、裂解樣品:取取凍融過的樣品約100mg,剪碎,放入ep管內(nèi),加入緩沖液a180μl,振蕩混勻。緩沖液a:30mmtriscl,30mmedta,50%tween20,0.5%triton-x-100,800mmguhcl,ph8.0。加入proteinasek20μl,56℃水浴過夜,一般不少于12h,中間需振蕩,待弓形蟲卵囊完全溶解即消化完畢。proteinasek:1.25ug/ml。加入緩沖液b200μl,振蕩混勻,56℃水浴25min,再次振蕩混勻。一般溶液變清亮及說明細胞裂解較徹底。緩沖液b為:3mol/l乙酸鈉。c、提取核酸:加入無水乙醇200μl,振蕩約15sec使dna析出。將上一步ep管內(nèi)全部液體倒入一個吸附柱中,吸附柱套入收集管內(nèi),12000rpm離心1min,倒掉收集管內(nèi)廢液,吸附柱放回收集管內(nèi)。向吸附柱中加入緩沖液d,加入量:500μl/管沉淀核酸。12000rpm離心1min,倒掉收集管內(nèi)廢液,吸附柱回收集管內(nèi)。緩沖液d:70%乙醇。向吸附柱中加入緩沖液w600μl/管再次沉淀核酸,12000rpm離心1min,倒掉收集管內(nèi)廢液,吸附柱放回收集管內(nèi)。緩沖液w:100%乙醇。重復(fù)操作步驟。將吸附柱放回收集管內(nèi)。12000rpm離心2min,倒掉收集管內(nèi)廢液,吸附柱放回收集管內(nèi)。將吸附柱室溫靜置5min。將吸附柱轉(zhuǎn)入干凈的ep管內(nèi)。向吸附膜的中間部位懸空滴加緩沖液e20μl/管溶解核酸,室溫靜置5min。12000rpm離心2min,將溶液收集到ep管內(nèi)。緩沖液e:10mmtris-hcl(ph7.8);1mmedta,ph8.0。將步驟ep管內(nèi)液體所得dna標(biāo)號至少-20℃冷藏。d、核酸的檢測將所得到的核酸置于微量核酸蛋白檢測儀檢測,od=260nm,280nm。od260nm/od280nm=1.8~2.0;說明提取的卵囊核酸達到擴病原的要求,可以進行進一步的病原擴增反應(yīng)。本發(fā)明技術(shù)順利實施的注意事項:弓形蟲卵囊感染性較強,操作人員需要佩戴防護面罩,試驗操作結(jié)束后,所有的工作服、臺面、實驗用具要清洗干凈,消毒干燥后保存。操作人員用肥皂洗手、洗臉,再用消毒液沖洗,最后用清水洗凈。當(dāng)前第1頁12
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