本發(fā)明涉及基因工程領(lǐng)域，具體地涉及煙粉虱med隱種高溫耐受相關(guān)基因特異性探針及其應(yīng)用。

背景技術(shù)：

煙粉虱(bemisiatabaci(gennadius))屬節(jié)肢動(dòng)物門(mén)，昆蟲(chóng)綱，半翅目，粉虱科，小粉虱屬，又稱(chēng)棉粉虱或甘薯粉虱。

煙粉虱的最適發(fā)育溫度為26～30℃，發(fā)育臨界溫度在10.8～12.5℃之間，致死高溫區(qū)在37～42℃之間。17℃和35℃是煙粉虱正常生長(zhǎng)發(fā)育的最低和最高的溫度極限。較強(qiáng)的溫度逆境適應(yīng)能力是煙粉虱在世界范圍內(nèi)廣泛分布的原因。隨著溫室效應(yīng)的增加，全球氣溫正逐年增高，煙粉虱較強(qiáng)的溫度逆境適應(yīng)能力使其能逐漸擴(kuò)大保護(hù)地面積，這為其抵御溫度逆境、延續(xù)種群提供給了場(chǎng)所。

通過(guò)基因的mrna原位雜交可以解析基因在煙粉虱中定位和表達(dá)模式，有助于更深入了解目的基因的作用機(jī)制。

技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素：

本發(fā)明的目的是提供一種煙粉虱med隱種高溫耐受相關(guān)基因的特異性探針。

本發(fā)明的再一目的是提供上述煙粉虱med隱種高溫耐受相關(guān)基因的特異性探針的應(yīng)用。

根據(jù)本發(fā)明的具體實(shí)施方式，煙粉虱med隱種高溫耐受相關(guān)基因btdnmt3，該基因cdna全長(zhǎng)核苷酸序列如seqidno.1所示，其編碼的氨基酸序列如seqidno.2所示。btdnmt3基因的表達(dá)直接降低了med隱種對(duì)高溫耐受性的能力。

根據(jù)本發(fā)明的具體實(shí)施方式，所述煙粉虱med隱種高溫耐受相關(guān)基因的特異性探針通過(guò)以引物f：tccaaacacatttcgtcaag和r：tcgcaaataagaactactcctc擴(kuò)增煙粉虱med隱種高溫耐受相關(guān)基因btdnmt3的cdna序列而得。

本發(fā)明還提供了上述特異性探針在原位雜交中的應(yīng)用。

根據(jù)本發(fā)明的具體實(shí)施方式，使用上述煙粉虱btdnmt3基因的特異性探針進(jìn)行原位雜交的方法包括以下步驟：

(1)根據(jù)btdnmt3的cdna序列設(shè)計(jì)btdnmt3特異的探針序列，以cdna為模板，設(shè)計(jì)的f和r引物進(jìn)行普通pcr產(chǎn)物擴(kuò)增，f：tccaaacacatttcgtcaag

r：tcgcaaataagaactactcctc；

(2)合成btdnmt3的mrna原位雜交的探針，并將探針標(biāo)記上地高辛；

(3)檢測(cè)btdnmt3的mrna探針的原位雜交。

本發(fā)明的有益效果是：本發(fā)明的mrna探針可以與組織中btdnmt3基因的mrna發(fā)生特異性的結(jié)合，從而方便準(zhǔn)確的觀(guān)察到組織中btdnmt3基因mrna水平的變化。本發(fā)明的btdnmt3的探針序列，對(duì)btdnmt3基因mrna的顯示有明確的特異性，實(shí)現(xiàn)了對(duì)btdnmt3基因mrna水平的顯示作用?？梢詫⒈景l(fā)明的特異性探針直接用于成蟲(chóng)進(jìn)行原位雜交，省去了制作切片步驟，可以降低實(shí)驗(yàn)的復(fù)雜性，減少實(shí)驗(yàn)步驟，且具有較高的敏感度，有利于更方便快捷的檢測(cè)目的基因在蟲(chóng)體的定位表達(dá)。

附圖說(shuō)明

圖1顯示根據(jù)本發(fā)明實(shí)施例的煙粉虱btdnmt3基因在雄蟲(chóng)中的mrna原位表達(dá)的示意圖，箭頭所指位置是生殖部位。

圖2顯示根據(jù)本發(fā)明實(shí)施例的煙粉虱btdnmt3基因在雌蟲(chóng)中的mrna原位表達(dá)的示意圖，箭頭所指位置是生殖部位。

具體實(shí)施方式

實(shí)施例1：煙粉虱med隱種btdnmt3基因全長(zhǎng)cdna序列克隆

分別取不同溫度脅迫條件下煙粉虱成蟲(chóng)200頭放入1.5ml的離心管，液氮冷凍后利用研磨棒將其研成粉末，然后提取rna，-80℃保存以備用。以cdna為模板，利用以下引物，pcr擴(kuò)增煙粉虱med隱種btdnmt3基因的中間片段。

btdnmt3-f：ctactgctaaactccattcgc

btdnmt3-r：ctctgaaacacggtagtccc

根據(jù)所獲得的煙粉虱med隱種btdnmt3基因的中間片段序列，設(shè)計(jì)5’race和3’race特異性引物，pcr擴(kuò)增btdnmt3基因的5’和3’端序列：

5’raceinnerprimer:ggaacctctgaaacacggtagtccccaa

5’raceouterprimer:ttgtgacacgcagtgacttcagtgataggt

3’raceinnerprimer:taaccaccaatccaaattccttgcggc

3’raceouterprimer:tggtttggggactaccgtgtttcagagg

獲得btdnmt3基因的cdna序列全長(zhǎng),得到btdnmt3基因4512bp序列，所得的基因具有如seqidno.1所示的核苷酸序列，包含653個(gè)核苷酸，該基因所編碼的酶具有如seqidno.2所示的氨基酸序列。

實(shí)施例2：btdnmt3基因的表達(dá)特性分析

對(duì)btdnmt3進(jìn)行不同組織的表達(dá)譜分析，實(shí)時(shí)熒光定量pcr結(jié)果表明，btdnmt3在頭部、胸部和腹部中均有表達(dá)，且在腹部顯著高表達(dá)。

對(duì)btdnmt3進(jìn)行不同發(fā)育階段的表達(dá)譜分析，實(shí)時(shí)熒光定量pcr結(jié)果表明，btdnmt3在卵期、一齡、二齡、三齡、四齡、偽蛹、成蟲(chóng)中具有表達(dá)。成蟲(chóng)之前，在卵期高表達(dá)，后表達(dá)量逐漸降低，到成蟲(chóng)再次高表達(dá)。

飼喂btdnmt3基因dsrna的煙粉虱med隱種的擊倒時(shí)間顯著低于飼喂dsegfp組和蔗糖組的擊倒時(shí)間(p<0.05)；同時(shí)在ncbi(http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/)blast顯示，所飼喂的靶序列片度為btdnmt3基因特有的序列，由此確保了干擾效果為煙粉虱med隱種的目的btdnmt3基因所產(chǎn)生，因此，說(shuō)明btdnmt3基因在煙粉虱med隱種高溫耐受性中起著關(guān)鍵作用。

實(shí)施例3原位雜交

1、煙粉虱btdnmt3基因的特異性mrna原位雜交探針

(a)以cdna為模板，設(shè)計(jì)的f和r引物進(jìn)行普通pcr產(chǎn)物擴(kuò)增，f：tccaaacacatttcgtcaag；r：tcgcaaataagaactactcctc，

并對(duì)產(chǎn)物進(jìn)行切膠回收與純化，用pgem-teasy感受態(tài)細(xì)胞，對(duì)純化后的pcr產(chǎn)物進(jìn)行克隆并測(cè)序。將測(cè)序序列進(jìn)行比對(duì)分析，所得克隆片段為目的基因的片段；

(b)挑取經(jīng)測(cè)序驗(yàn)證的陽(yáng)性克隆，按照axyprep質(zhì)粒dna小量試劑盒中的說(shuō)明進(jìn)行操作，提取重組質(zhì)粒；

(c)對(duì)重組質(zhì)粒進(jìn)行酶切，采用的酶是sacⅱ。取酶切產(chǎn)物加入苯酚：氯仿：異丙醇混合物(25:24:1)，劇烈震蕩1min后，4℃條件下12000rpm離心10min；轉(zhuǎn)移上清至無(wú)核酸酶的離心管中，加1/10體積的3m醋酸鈉，加2倍體積的冰無(wú)水乙醇輕輕混勻，-20℃靜置2.5小時(shí)后，4℃條件下14000rpm離心30min；棄上清液，用1ml80％的乙醇洗滌沉淀，反復(fù)顛倒洗滌沉淀，4℃條件下14000rpm離心10min；棄乙醇，風(fēng)干沉淀，加入depc-h2o，溶解沉淀，獲得線(xiàn)性化質(zhì)粒。

(2)將純化后的產(chǎn)物標(biāo)記上非放射性標(biāo)記物-地高辛。

(3)將探針純化。

加2uldnasei，37℃反應(yīng)15min，去除未反應(yīng)完全的dna模板；再加0.8ul0.5medta(ph＝8.0)終止反應(yīng)；加1/10體積的3m醋酸鈉，加2.5倍體積(125ul)冰冷的無(wú)水乙醇，-70℃冰箱放置過(guò)夜，取出后，4℃條件下14000rpm離心10min；棄上清液，用1ml75％的乙醇洗滌沉淀，反復(fù)顛倒洗滌沉淀，4℃條件下14000rpm離心10min；棄上清液，風(fēng)干沉淀，加入depc-h2o，溶解沉淀，獲得純化后的目的探針。

(4)檢測(cè)btdnmt3的mrna探針的原位雜交

(4-1)樣本搜集：在顯微鏡下分別挑取煙粉虱雌雄成蟲(chóng)置于事先加入200ul1×pbs緩沖液的1.5ml無(wú)核酶的離心管中，用槍頭輕輕地反復(fù)吸打沖洗，然后吸出1×pbs緩沖液，將蟲(chóng)體留于管中；

(4-2)取材后蟲(chóng)體的固定：加入1ml卡諾氏固定液，在4℃條件下固定12h；

(4-3)蟲(chóng)體的漂洗：移走上一步驟中的液體，保留蟲(chóng)體于離心管中。加入200ul的50％乙醇進(jìn)行搖洗，洗三次，每次5min；

(4-4)移走上一步驟中的液體，加入200ul的1×pbs-1％tritonx-100溶液，30℃搖洗30min；

(4-5)蟲(chóng)體的褪色：移走上一步驟中的液體，加入1ml的6％h2o2的乙醇溶液，室溫下褪色2h；隨后，移走上一步驟中的液體，加入200ul的50％乙醇進(jìn)行搖洗，洗三次，每次5min；

4-(6)蟲(chóng)體的透化：移走上一步驟中的液體，加入200ul蛋白酶k，在56℃水浴條件下透化30min；隨后，移走上一步驟中的液體，加入200ul的50％乙醇進(jìn)行搖洗，洗三次，每次5min；

(4-7)蟲(chóng)體的再固定：移走上一步驟中的液體，加入1ml的4％多聚甲醛固定液固定液，在4℃條件下固定30min；隨后，移走上一步驟中的液體，加入200ul的50％乙醇進(jìn)行搖洗，洗三次，每次5min；

(4-8)蟲(chóng)體的預(yù)雜交：移走上一步驟中的液體，加入200ul的預(yù)雜交緩沖液，在55℃條件下預(yù)雜交15min；

(4-9)蟲(chóng)體的雜交：移走上一步驟中的液體，加入300ul事先預(yù)熱的雜交液(探針濃度為5ng/ul),55℃℃避光孵育過(guò)夜。

(4-10)雜交后清洗：移走上一步驟中的液體，將蟲(chóng)體置于一系列用2×ssc溶液配制的不同濃度的預(yù)雜交液進(jìn)行處理，且在雜交溫度下進(jìn)行。具體過(guò)程如下：分別于預(yù)雜交液：2×ssc＝2:1、1:1、1:2的濃度配比下的溶液中各處理15min；后于2×ssc溶液中處理10min；

(4-11)蟲(chóng)體的封閉：移走上一步驟中的液體，加入200ul按照1:5000的比例用anti-dig-ap于1×blockingreagent中的封閉液，在4℃條件下封閉過(guò)夜；

(4-12)移走上一步驟中的液體，加入200ul的1×pbs進(jìn)行搖洗，洗三次，每次30min；隨后，移走上一步驟中的液體，加入200ul的ap緩沖液，靜置2次，每次10min；

(4-13)蟲(chóng)體的顯色：移走上一步驟中的液體，在黑暗條件下，加入300ul的hnpp/fastred：ap＝1:1：100顯色液，室溫顯色30min；

(4-14)封片：待顯色后，移走顯色液，終止反應(yīng)，加入200ul的1×pbs進(jìn)行搖洗，洗三次，每次5min；

(4-15)固定拍照：將蟲(chóng)體用80％甘油固定，于digitalmicroscopevhx-2000下進(jìn)行觀(guān)察并拍照。

由圖1、圖2可見(jiàn)btdnmt3在煙粉虱胸部和腹部均有表達(dá)，且在腹部靠近生殖部位表達(dá)量較強(qiáng)。

<110>中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護(hù)研究所

<120>煙粉虱med隱種高溫耐受相關(guān)基因特異性探針及其應(yīng)用

<160>2

<210>1

<211>4512

<212>dna

<213>煙粉虱

<400>1

ttgggtgacactatagaatactcaagctatgcatccaacgcgttgggagctctcccatat60

ggtcgacctgcaggcggccgcgaattcactagtgattgggatcgcccttaagcagtggta120

tcaacgcagagtacatgggattgttgatgttgcacttttcagtctttagtgtgaaaaggt180

gaggtttctgaacgatttgcccttaattaatgtgtttaaaattagtttttacgcaattat240

gaagtattagaatcactcttgagtccgttattttaccctttttcctttttatccttccgt300

tttctgaaatttactcttcaagtatggccatctggctaatttgagaagctgcacagtggc360

agccatagtgagatttgcacagtgaacgttctattgtatgaaccgatcccagtgtaagta420

caatgaggcatacagatctagacttatcgttagacagccgttcatggaagattttgattg480

tatgaaccgctcccagtgtaagtacaatgaggcatacagatctagacttatcgttagaca540

gctgttcatggaagatttttaacaaaatccgtctgaatttgcaggcagctactgctaaac600

tccattcgcagctgcgaagctcatcaaatcaatcaatcaacaacgatgtcttttgtatat660

acctatcactgaagtcactgcgtgtcgcaatgtcaataccatcaaagaccttaatcgcca720

gtagtctcatacctgtcaaatgggacaaaaagattattgacagtttgttattgtgcagga780

aaatctccaattcactctggttgccagggatcattaaaccaatacaatgtgaataatgga840

aggatagcaactgttggacttaaggtgaacaaactaggaggtagattccaacgcacaaac900

gtagacaggacaaaaaagatggctgaaaatgaaaaacagtgttgctgcataggcgcacca960

caaagaagcgtaatgatctccaccttgctgtccatcaaccaccttctggtctggtccgcc1020

tcggcatccctcagcctcccctattgtaaccctggaccaatctggcgggtgttacatctt1080

tagttagcctggcaacgctgtatccaagtagggcctctggaacgccgtgttccggaaaat1140

tgaagaatgagccctcagacgttgccaaatttccttcgacaaatcacgaattttcgggaa1200

agccctgtaccacaatggggagaaaagcaagaacaataacaactagcagcaatcccaagg1260

ctttgaaatggggaagtaatgttcctcttggcttattagtgtggggaaaagtctcatcct1320

caccatggtggccaggcattgttgtgaatcatgaagactgtggagtaaaccctcctgcag1380

tatcatccgtttgggttttttggtttggggactaccgtgtttcagaggttcctctttctc1440

ggctccagcctttcgcagagagttttgtgaaattttttgacaagaacaacaaaggtgtca1500

gactcaaaaatggtgtactagaagctattaagattcatgcagcacgcagtggagaaactg1560

acagtgaactttggaacttctcagatgctgtttcttggatatctagtattcctttgcaca1620

tgttgaagtccaaacacatttcgtcaagcgattcgtttgatgatgacctccctgaatttg1680

tcaacagtaaaattttgaaaattaaattgaccaacttagaacttacacgcgcagaaaaca1740

aacgcaagagtgaggaaagtgatgatgatgatgagatatgcaagttcaacaaaaagttga1800

aggcaagtcaagataatgttgatgcaagcagagaagttgcgtttaaatcttcagttatcg1860

aaaaagtgaagggcaagaagttaaagctagaaaatatatgcctttgctgtgtaagagaaa1920

aaagcaatctaaatcatgagcatccattttttgaaggaagagtctgcgatcaatgttttg1980

aagaaatcaaggatacggcttttgtaataggagatgacaatgtctattaccactgtgttg2040

tatgtgcgcaaagaggagtagttcttatttgcgacaatccatcctgcaaaaaggtttatt2100

gcaacacttgtattgaagttctgtgtccaaaaaaagctagagaaaggatcgctgaaatga2160

atccatggctctgctttttgtgctcaggttatgacaaacaactcaatgggttcttgaaga2220

aacgtgaaaacttctctgctcatgttgccaaaatgtacattgagcatccaaaaccagaga2280

taattcctaaatttgaaagacatcccttacgtgttctatccttattcgatggaattggga2340

caggattgtgtgttttgaagaagctgaaattaaaagtagaggtgtactatgcaagtgaga2400

tcgaagatgatgccatcaatgtgactacaatgaatcacggctcggatgtgattcatctgg2460

ggaaagtagaagacctaaccaatgctgaacttgcaaaactgggcccaattgatcttctga2520

ttggaggatcaccttgcaatgaattaagtggagtcaatcatgccagaaagggaatctatg2580

atgcaactggtactggagtcctgttttttgacttcttccgcatactgcaattcctgaaga2640

caaacaatgatggtcgtcatttgttttggttgttcgagaatgttacatccatgccaaaag2700

attacagaaaagtgattacacgattttttgagtgtgaccctattgttgtggatgcaaaat2760

atttttctgctcaaaatagatccagatttttctggggaaacatcccaagtctaagaaagg2820

ctcaagaaagcgctatggatatagaaaattgccctgagttaaacagtgtcttgacaaaaa2880

attgcagccgaaaagctgtagtcaaaaaagtgtgcaccataaccaccaatccaaattcct2940

tgcggcaagggaaggaagcatcaatgccagtactcatgaatggcaaaggtgacactttgt3000

gggctacagagatggaagagctttttggttttccgcggcactacacagatgctggaaacc3060

ttcagccatccagaagactccgtttactcggcaaatcctggtcaattcctgttttgtgcc3120

acattctcaaacctttgactatgttgtacccatccactgaagcagaaattgattgagttt3180

atttaatttttgtcaatgtatgatctcaaatgtttgataatgatgtttgttgttttttgt3240

ttgtatgttctttttcttaagtttaaatttgtgagcatgcaacttgtaaatcttaaaatt3300

atatttagttctaagtgaagaaagctatcaaactatgtttgctccttcagcatatggagt3360

gttaagtcatttactctcaagtcatttttttcgtgtctaattgtaaaatatttttgtaga3420

caatactgtgttcccaagtagtgttagtcctttccagttaacttctattttttctggaac3480

cagttgcatgaaggtttaattctcgtgcctttttaattggtgaacatttttatagatcag3540

ctcagtttgagtaagacttaatttttttaccgagaactaagatttttaggataaacaaat3600

agaatggaagtagacgctctgcaggataaacgttttagcatttttgttaaataattatta3660

aagctaaatataattatagccaccagcgttttgagtctagcatgaggataaattaatatt3720

caatgcattctcataattaaattgaatctgttcgttcacctaaacttttacggtatttgt3780

gcaagcattttcatcctgaaattgcattttctttctcactaaaattttttactgattata3840

tgaatgacactgatctgttattgcatgagaaatgtattattatttctttgaatctgtcat3900

tttttagtaatggtgctcttctctctttagatatttttactggtctcagtaaagatcacc3960

acacccttccacatattgagaattgtgcctatttcagcaaatgaacaataatgttcttgt4020

tccctgagcaggccaaattttgttctctaaaacgagataagtatatcaatggaagtatca4080

aagaattctgtggctcttttgtactgcctcagataatatatctctgttaaatgtttttta4140

actttatattgttgacaagtaatagaattatgtgccttaaatgccatgctctctatgtta4200

cttcataatttttactcattcacgaatgtcatgattatcttgatcatatttactgcatat4260

agaatggttggagccattcttgatccaaaagggaagcattaattgttacacatgaaaaat4320

gattgcattattatcataatgcaatcatatgaaaggtctgattaattaattataattaag4380

ttttcgcagtatggtattaccactcattctattgcagtttacacgtataataaattacaa4440

ttatttttactgctttaacagtttcaaatttctctaacttaggtagaaaaaaaaaaaaaa4500

aaaaaaaaaaaa4512

<210>2

<211>653

<212>prt

<213>煙粉虱

<400>2

mgrkartittssnpkalkwgsnvplgllvwgkvssspwwpgivvnhedcgvnppavssvw60

vfwfgdyrvsevplsrlqpfaesfvkffdknnkgvrlkngvleaikihaarsgetdselw120

nfsdavswissiplhmlkskhisssdsfdddlpefvnskilkikltnleltraenkrkse180

esddddeickfnkklkasqdnvdasrevafkssviekvkgkklkleniclccvreksnln240

hehpffegrvcdqcfeeikdtafvigddnvyyhcvvcaqrgvvlicdnpsckkvycntci300

evlcpkkareriaemnpwlcflcsgydkqlngflkkrenfsahvakmyiehpkpeiipkf360

erhplrvlslfdgigtglcvlkklklkvevyyaseieddainvttmnhgsdvihlgkved420

ltnaelaklgpidlliggspcnelsgvnharkgiydatgtgvlffdffrilqflktnndg480

rhlfwlfenvtsmpkdyrkvitrffecdpivvdakyfsaqnrsrffwgnipslrkaqesa540

mdiencpelnsvltkncsrkavvkkvctittnpnslrqgkeasmpvlmngkgdtlwatem600

eelfgfprhytdagnlqpsrrlrllgkswsipvlchilkpltmlypsteaeid653