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      基于eGFP的GPR120基因表達的檢測方法及應(yīng)用與流程

      文檔序號:11172005閱讀:2847來源:國知局
      基于eGFP的GPR120基因表達的檢測方法及應(yīng)用與流程

      本發(fā)明屬于egfp生物應(yīng)用技術(shù)領(lǐng)域,具體涉及一種基于egfp的gpr120基因表達的檢測方法,本發(fā)明還涉及一種基于egfp在gpr120基因表達檢測中的應(yīng)用。



      背景技術(shù):

      gpr120(g-proteincoupledreceptor120;又名freefattyacidreceptor4,ffar4)是脂肪酸受體家族一員,屬于g蛋白偶聯(lián)受體(gpcr),可被長鏈脂肪酸激活,尤以n-3不飽和脂肪酸激活能力最強。gpr120在腦、垂體、肺、舌、胃腸、脂肪組織等許多組織表達,主要分布于胃腸多種內(nèi)分泌細胞、脂肪細胞、巨噬細胞、成骨和破骨細胞以及味蕾細胞。gpr120激活可刺激glp-1、cck、gip等胃腸激素分泌,影響機體的內(nèi)分泌代謝活動,與肥胖等代謝異常密切相關(guān)。

      gpr120表達水平高低顯著影響其細胞調(diào)節(jié)作用,gpr120表達調(diào)控的研究將促進對gpr120功能的認識和發(fā)現(xiàn)可能的代謝調(diào)節(jié)靶分子,為gpr120靶點藥物的研發(fā)提供一定的依據(jù)。基因表達研究所常用技術(shù)手段目前有反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈式反應(yīng)(rt-pcr)和northern印跡雜交(northernblot),這兩種方法雖然技術(shù)成熟,廣泛應(yīng)用于基因表達水平的檢測,但是也存在一定的缺點:一是實驗過程較為繁瑣,二是不能在活細胞水平監(jiān)測基因表達的變化。



      技術(shù)實現(xiàn)要素:

      本發(fā)明的目的是提供一種基于egfp的gpr120基因表達水平的檢測方法及其應(yīng)用,解決了現(xiàn)有g(shù)pr120基因表達水平的檢測中實驗步驟繁瑣、不能在活細胞水平監(jiān)測基因表達的變化的問題,為gpr120基因表達水平的檢測提供了新思路。

      本發(fā)明所采用的技術(shù)方案是,egfp在gpr120基因表達水平的檢測中的應(yīng)用。

      本發(fā)明的特征在于,

      egfp與gpr120基因表達水平的呈線性關(guān)系,即隨著egfp熒光平均強度值的增加,gpr120基因表達水平增加。

      本發(fā)明所采用的另一個技術(shù)方案是,基于egfp的gpr120基因表達水平的檢測方法:

      步驟1,首先通過crispr/cas9技術(shù)將egfp片段定點插入到gpr120基因的終止密碼子taa處,使egfp隨gpr120表達而表達,獲得egfp標(biāo)記gpr120陽性細胞的轉(zhuǎn)基因模型小鼠;

      步驟2,隨后應(yīng)用熒光分析儀在488nm激光激發(fā)下對小鼠的陽性細胞熒光強度進行測定。

      本發(fā)明的特征在于,

      步驟2的熒光強度通過單細胞平均熒光強度進行表達。

      步驟2的具體步驟:

      步驟2.1,使用沒有被egfp標(biāo)定的小鼠細胞進行熒光分析儀的激光強度指標(biāo)校正;

      步驟2.2,收取步驟1中轉(zhuǎn)基因模型小鼠的不同組織的egfp陽性細胞,通過經(jīng)步驟2.1校正后的熒光分析儀進行熒光強度測定,獲取egfp與gpr120基因表達水平之間的關(guān)系;同時通過rt-pcr方法檢測egfp陽性細胞中g(shù)pr120的基因表達水平,驗證egfp與gpr120基因表達水平之間的關(guān)系。

      本發(fā)明有益效果是:

      a)本發(fā)明通過實時監(jiān)測gpr120基因表達,做到自身前后對照,控制組內(nèi)誤差,減少組間誤差,保證測定結(jié)果更為可靠,從而彌補和克服了rt-pcr和northernblot等方法對不同組織細胞進行組間比較而產(chǎn)生的變異性、不能在活細胞水平監(jiān)測基因表達的變化的問題;

      b)本發(fā)明收取細胞后即刻確定gpr120基因表達水平,省去了rna提取、rna反轉(zhuǎn)錄和pcr等操作和反應(yīng)過程,使gpr120基因表達檢測更加簡便快捷。

      附圖說明

      圖1是gpr120-ires-egfp轉(zhuǎn)基因小鼠的組織細胞中egfp熒光陽性細胞,其中,圖1a為gpr120-ires-egfp轉(zhuǎn)基因小鼠組織在488nm激光激發(fā)下egfp熒光陽性細胞圖,圖1b為圖1a的組織的普通光鏡圖,圖1c為野生型小鼠組織在488nm激光激發(fā)下細胞圖,圖1d為圖1c的組織的普通光鏡圖;

      圖2是小鼠組織中的擴增曲線圖,其中,圖2a為gpr120-ires-egfp轉(zhuǎn)基因小鼠的組織中g(shù)pr120的rt-pcr小擴增曲線,圖2b為gpr120-ires-egfp轉(zhuǎn)基因小鼠的組織中egfp的rt-pcr小擴增曲線,圖2c為野生型小鼠組織中g(shù)pr120的rt-pcr小擴增曲線,圖2d為野生型小鼠組織中egfp的rt-pcr小擴增曲線;

      圖3是gpr120-ires-egfp轉(zhuǎn)基因小鼠不同組織細胞中egfp熒光強度和gpr120基因表達水平之間的關(guān)系;

      圖4是gpr120-ires-egfp轉(zhuǎn)基因小鼠腹腔巨噬細胞在體外經(jīng)脂多糖處理后egfp熒光強度和gpr120基因表達水平之間的關(guān)系圖,其中,圖4a是gpr120基因表達水平在對照組和經(jīng)脂多糖處理組的關(guān)系圖,圖4b是egfp熒光強度均值在對照組和經(jīng)脂多糖處理組的關(guān)系圖,圖4c是gpr120基因表達水平與細胞egfp熒光強度均值的關(guān)系圖。

      具體實施方式

      下面結(jié)合附圖和具體實施方式對本發(fā)明進行詳細說明。

      本發(fā)明以egfp標(biāo)記gpr120陽性細胞的模型小鼠為對象,利用熒光顯微鏡技術(shù)測定小鼠egfp陽性細胞的熒光強度,與egfp陽性細胞的gpr120基因表達水平進行相關(guān)性分析,確定egfp陽性細胞的熒光強度與gpr120基因表達水平之間的線性關(guān)系,使egfp熒光強度作為gpr120基因表達水平的一個可靠的檢測指標(biāo)提供了依據(jù)。

      基于egfp的gpr120基因表達水平的檢測方法:

      步驟1,首先通過crispr/cas9技術(shù)將egfp片段定點插入到gpr120基因的終止密碼子taa處,使egfp隨gpr120表達而表達,獲得egfp標(biāo)記gpr120陽性細胞的轉(zhuǎn)基因模型小鼠,這樣egfp隨gpr120表達而表達,并且在mrna水平,egfp和gpr120相互分離,保證了gpr120蛋白的功能和代謝過程不受影響;

      步驟2,隨后應(yīng)用熒光分析儀在488nm激光激發(fā)下對小鼠的陽性細胞熒光強度進行測定,并通過單細胞平均熒光強度表達,

      步驟2.1,使用沒有被egfp標(biāo)定的小鼠細胞進行熒光分析儀的激光強度指標(biāo)校正;

      步驟2.2,收取步驟1中轉(zhuǎn)基因模型小鼠的不同組織的egfp陽性細胞,通過經(jīng)步驟2.1校正后的熒光分析儀進行熒光強度測定,獲取egfp與gpr120基因表達水平之間的關(guān)系;同時通過rt-pcr方法檢測egfp陽性細胞中g(shù)pr120的基因表達水平,驗證egfp與gpr120基因表達水平之間的關(guān)系。

      1.實驗對象

      制備的egfp標(biāo)記gpr120的模型小鼠,細胞組織中能見egfp陽性細胞,在488nm激光激發(fā)下發(fā)出綠色熒光,具體如圖1所示:圖1a為gpr120-ires-egfp轉(zhuǎn)基因小鼠組織的熒光陽性細胞圖,可見陽性細胞,圖1b為圖1a的組織的普通光鏡圖,圖1c為野生型小鼠組織的細胞圖,未見熒光陽性細胞,圖1d為圖1c的組織的普通光鏡圖。

      2.細胞內(nèi)rna提取和反轉(zhuǎn)錄

      在egfp標(biāo)記gpr120的模型小鼠和野生型小鼠,分別提取小鼠的胃粘膜、十二指腸粘膜、空腸粘膜、結(jié)腸粘膜、脂肪組織、垂體、肺臟等組織器官的rna提取并進行反轉(zhuǎn)錄,具體如下:取上述組織各1-2mg,每樣加入350μl裂解液rl,使用組織破裂儀破裂組織,再將所有溶液轉(zhuǎn)移至過濾柱cs中以12000rpm速度離心2min,收集濾液;再向濾液中加入350μl70%的乙醇溶液,混勻后轉(zhuǎn)入吸附柱cr3中以12000rpm速度離心1min,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱cr3放回收集管中;向吸附柱cr3中加入350μl去蛋白液rw1,以12000rpm速度離心1min,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱cr3放回收集管中;向吸附柱cr3中加入80μldnasei工作液,室溫放置15min;向吸附柱cr3中加入350μl去蛋白液rw1,以12000rpm速度離心1min,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱cr3放回收集管中;向吸附柱cr3中加入500μl漂洗液rw,室溫靜置2min,以12000rpm速度離心1min,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱cr3放回收集管中;重復(fù)向吸附柱cr3中加入500μl漂洗液rw,室溫靜置2min,以12000rpm速度離心2min,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱cr3置于室溫放置5min以徹底晾干殘余的漂洗液;將吸附柱cr3轉(zhuǎn)入rnase-free離心管中,加入50μlrnase-freeddh2o,室溫放置2min,以12000rpm速度離心2min,得到rna溶液。

      酶標(biāo)儀檢測rna濃度與純度,瓊脂糖凝膠電泳檢測rna質(zhì)量。在八連管中依次加入2μl5xgdnaeraserbuffer,再分別加入1μlgdnaeraser,再分別加入1μgtotalrna,最后用rnasefreedh2o補足至10μl,混勻,室溫反應(yīng)5min。在各管中分別加入以下試劑,4μl5xprimescriptbuffer2、4μlrnasefreedh2o、1μlprimescriptrtenzymemixi和1μlrtprimermix,總反應(yīng)體系為20μl,混勻。反應(yīng)條件為37℃、15min,85℃、5s。反應(yīng)完成后將cdna存于4℃?zhèn)溆茫L期保存時轉(zhuǎn)入-20℃。

      3.gpr120和egfp基因表達水平的檢測

      采用定量pcr方法對gpr120和egfp的基因表達進行檢測。在八連管中依次加入6μldh2o,2μl模板cdna,2μlfas引物,10μlsybrpremixextaqii(2x),總反應(yīng)體系為20μl,混勻。

      反應(yīng)條件是:第一步是94℃、5min,第二步是94℃、30s,56℃、30s,72℃、1min循環(huán)進行40次,第三步是加溫溶解擴增產(chǎn)物,獲得溶解曲線。

      其中,總反應(yīng)體系中小鼠gpr120引物序列是:

      上游引物:5’-gtgccgggactggtcattgtg-3’;

      下游引物:5’-ttgttgggacactcggatctgg-3’。

      總反應(yīng)體系中egfp引物序列是:

      上游引物:5’-tcttcttcaaggacgacggcaact-3’;

      下游引物:5’-ccttgatgccgttcttctgcttgt-3’。

      以beta-actin基因表達為內(nèi)對照,總反應(yīng)體系中beta-actin引物序列是:

      上游引物:5’-cgttggcatccacgaaacta-3’;

      下游引物:5’-ggtgctgggaggtacaggg-3’。

      對實驗結(jié)果表達水平分析得到如圖2所示的擴增曲線。如圖2a表示轉(zhuǎn)基因小鼠的組織中g(shù)pr120的rt-pcr小擴增曲線,如圖2b表示轉(zhuǎn)基因小鼠的組織中egfp的rt-pcr小擴增曲線,在一定階段內(nèi)兩者均隨著擴增循環(huán)次數(shù)的增大而升高。如圖2c表示野生型小鼠組織中g(shù)pr120的rt-pcr小擴增曲線,在一定階段內(nèi)兩者均隨著擴增循環(huán)次數(shù)的增大而升高,如圖2d表示野生型小鼠組織中egfp的rt-pcr小擴增曲線,曲線結(jié)果無表達。

      以beta-actin基因表達為內(nèi)對照,對各個不同組織中的gpr120基因表達水平進行分析,并應(yīng)用熒光顯微鏡對各個組織中egfp標(biāo)記的細胞的綠色熒光強度進行測量。結(jié)果表明,組織中g(shù)pr120表達水平與組織中綠色熒光細胞的熒光強度之間呈顯著正相關(guān),結(jié)果如圖3所示。

      實施例

      培養(yǎng)egfp標(biāo)記的gpr120的模型小鼠的肺泡巨噬細胞,具體方法如下:體外培養(yǎng)采用頸部脫臼法處死egfp標(biāo)記gpr120的模型小鼠,用75%的酒精對小鼠進行消毒處理;用10ml注射器吸取pbs緩沖液6ml左右,除去氣泡備用;用眼科剪剪開頸部至胸腔外表皮,分離頸部氣管穿線備用,剪開胸腔使肺部暴露,用鑷子夾住氣管前端,剪短氣管將注射器針尖插入氣管并用線扎緊;緩慢注入pbs緩沖液2-3ml使肺部充滿,吸出肺內(nèi)溶液再緩慢注入,循環(huán)3-5次,吸取肺內(nèi)pbs緩沖液注入離心管,所得為含肺巨噬細胞的溶液;將離心管配平于低溫水平離心機離心6min,轉(zhuǎn)速為1200rpm;吸去上清液,底物即為肺巨噬細胞。

      向肺巨噬細胞中加入細胞培養(yǎng)液,充分混勻,種于培養(yǎng)皿,使每組培養(yǎng)皿內(nèi)細胞數(shù)均勻,標(biāo)上日期及名稱,置37℃的co2培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。培養(yǎng)8小時后,細胞分組,一組加入200ng/ml的脂多糖(lps)處理24小時,另外一組為對照組。

      隨后,應(yīng)用熒光顯微鏡對各個組織中egfp標(biāo)記的細胞的熒光強度進行測量,測量熒光強度之后,收集細胞的rna,反轉(zhuǎn)錄之后應(yīng)用定量pcr方法觀察gpr120基因表達水平。結(jié)果顯示,如圖4a所示,肺泡巨噬細胞的gpr120基因表達與lps處理組比較,對照組顯著升高;如圖4b所示,同時肺泡巨噬細胞的egfp熒光強度均值與lps處理組比較,對照組也顯著升高;如圖4c所示,gpr120基因表達與細胞egfp熒光強度均值之間存在顯著正相關(guān)關(guān)系,隨著egfp熒光強度均值的增大,gpr120基因表達水平升高。

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